单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 498 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-10-24 |
Transcriptional, developmental, and functional parallels of lymphatic and venous smooth muscle
2024-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.18.604042
PMID:39091770
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪和成像技术，探讨了淋巴肌肉细胞（LMCs）和静脉平滑肌细胞（SMCs）的转录组和发育基础 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了LMCs和静脉SMCs的转录组相似性，并发现它们可能源自相关的间充质祖细胞 | 研究仅限于小鼠后肢的淋巴和静脉血管，未涵盖其他物种或组织 | 探讨淋巴肌肉细胞和静脉平滑肌细胞的转录组和发育基础，以理解其独特的收缩特性 | 淋巴肌肉细胞（LMCs）和静脉平滑肌细胞（SMCs） | 生物医学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 小鼠后肢的LMCs和SMCs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-10-24 |
A Single Trophoblast Layer Acts as the Gatekeeper at the Endothelial-Hematopoietic Crossroad in the Placenta
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603303
PMID:39071312
|
研究论文 | 研究探讨了胎盘中滋养层巨细胞在调节血管内皮与造血细胞过渡中的作用 | 通过单细胞RNA测序和受体-配体对分析，揭示了滋养层巨细胞分泌的旁分泌因子在维持胎盘造血-血管生成平衡中的新机制 | 研究基于特定敲除小鼠模型，结果可能不适用于所有物种 | 阐明胎盘中滋养层巨细胞在调节造血微环境中的分子机制 | 胎盘中的滋养层巨细胞及其分泌的旁分泌因子 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 特定敲除小鼠模型的胎盘样本 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-10-13 |
Tubular insulin-induced gene 1 deficiency promotes NAD+ consumption and exacerbates kidney fibrosis
2024-Jul, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-024-00081-7
PMID:38806641
|
研究论文 | 研究探讨了胰岛素诱导基因1（Insig1）在肾纤维化中的作用及其机制 | 首次发现管状Insig1缺乏会促进NAD+消耗并加剧肾纤维化 | NA | 探究Insig1在肾纤维化中的作用及其潜在治疗价值 | 肾纤维化中的近端小管细胞（PTCs） | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-10-12 |
An oncolytic HSV-1 armed with Visfatin enhances antitumor effects by remodeling tumor microenvironment against murine pancreatic cancer
2024-07-23, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.149931
PMID:38723415
|
研究论文 | 研究通过改造溶瘤病毒HSV-1携带Visfatin，增强其对小鼠胰腺癌的抗肿瘤效果 | 首次揭示Visfatin通过重塑肿瘤微环境增强溶瘤病毒的抗肿瘤效果 | NA | 研究溶瘤病毒治疗胰腺导管腺癌的抗性机制并开发新型治疗策略 | 小鼠胰腺癌 | NA | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-10-12 |
Eomes expression identifies the early bone marrow precursor to classical NK cells
2024-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01861-6
PMID:38871999
|
研究论文 | 本文研究了Eomes表达在早期骨髓前体细胞中对经典NK细胞的识别 | 首次识别出EomesNK细胞作为经典NK细胞的骨髓前体，并证明了NK和ILC1谱系在发育早期就发生了分化 | NA | 探讨NK细胞和ILC1细胞是否属于不同谱系或同一细胞类型的不同状态 | NK细胞和ILC1细胞的骨髓前体 | NA | NA | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-10-10 |
CCR1 and CCR2 Coexpression on Monocytes Is Nonredundant and Delineates a Distinct Monocyte Subpopulation
2024-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400007
PMID:38829123
|
研究论文 | 研究探讨了单核细胞上CCR1和CCR2的共表达及其在炎症中的作用 | 提出CCR1和CCR2的共表达并非冗余，而是标记了一个独特的单核细胞亚群 | NA | 验证CCR1和CCR2在单核细胞上的共表达是否冗余，并探讨其在炎症中的作用 | CCR1、CCR2、CCR3和CCR5受体及其在单核细胞上的表达 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠单核细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-10-06 |
A fibroblast-dependent TGF-β1/sFRP2 noncanonical Wnt signaling axis promotes epithelial metaplasia in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-Jul-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174598
PMID:38980870
|
研究论文 | 研究了纤维母细胞依赖的TGF-β1/sFRP2非经典Wnt信号轴在特发性肺纤维化中促进上皮化生的机制 | 发现了TGF-β1信号通过sFRP2激活非经典Wnt信号轴，促进特发性肺纤维化中的上皮化生 | 研究仅限于细胞和组织水平，未涉及临床试验 | 探讨特发性肺纤维化中纤维母细胞与上皮细胞相互作用的机制 | 特发性肺纤维化患者的肺组织和纤维母细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自特发性肺纤维化患者和非疾病捐赠者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-10-05 |
The dynamic behavior of chromatophores marks the transition from bands to spots in leopard geckos
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2400486121
PMID:38976731
|
研究论文 | 研究豹纹守宫皮肤颜色从带状到斑点的转变过程 | 首次揭示了豹纹守宫皮肤颜色从带状到斑点的转变机制，并通过遗传分析和单细胞转录组学分析确定了关键基因的作用 | 研究主要集中在豹纹守宫的特定基因型，可能不适用于其他物种或基因型 | 探讨爬行动物皮肤颜色形成的发育过程和分子信号通路 | 豹纹守宫的带状和斑点皮肤模式 | NA | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 基因序列 | 豹纹守宫的胚胎皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-10-04 |
Circadian control of tumor immunosuppression affects efficacy of immune checkpoint blockade
2024-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01859-0
PMID:38806707
|
研究论文 | 研究昼夜节律对肿瘤免疫抑制的影响及其对免疫检查点阻断疗法效果的影响 | 首次揭示了昼夜节律对免疫抑制细胞丰度的调控作用，并展示了时间依赖的免疫检查点阻断疗法效果 | NA | 探讨昼夜节律对肿瘤免疫抑制的影响及其对免疫检查点阻断疗法效果的影响 | 结直肠癌模型中的免疫抑制细胞和细胞毒性CD8 T细胞 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-09-28 |
Benchmarking Algorithms for Gene Set Scoring of Single-cell ATAC-seq Data
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae014
PMID:39049508
|
研究论文 | 本文系统地评估了十种基因集评分（GSS）工具在单细胞ATAC-seq数据上的适用性和性能 | 首次系统地比较了多种GSS工具在单细胞ATAC-seq数据上的表现，并提供了实用的选择指南 | 研究主要集中在GSS工具的性能评估，未深入探讨其生物学意义 | 评估现有GSS工具在单细胞ATAC-seq数据上的适用性和性能 | 单细胞ATAC-seq数据和GSS工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 基因集评分数据 | 多达十个单细胞ATAC-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-09-28 |
Opportunities and Challenges in Advancing Plant Research with Single-cell Omics
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae026
PMID:38996445
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在植物研究中的应用及其面临的挑战 | 介绍了单细胞转录组学、表观组学、蛋白质组学、代谢组学和空间转录组学等技术在植物科学中的应用 | 单细胞技术在植物中的应用受到细胞结构的限制 | 探讨单细胞组学技术在植物系统中的进展、未来研究应用及其面临的挑战 | 植物细胞类型及其发育过程 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-09-27 |
Early-stage lung cancer is driven by a transitional cell state dependent on a KRAS-ITGA3-SRC axis
2024-Jul, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00113-5
PMID:38755258
|
研究论文 | 研究探讨了KRAS突变在肺腺癌早期发展中的作用及其与ITGA3-SRC轴的关系 | 通过单细胞RNA测序揭示了AT2细胞在早期肺腺癌中的过渡状态，并发现KRAS突变通过ITGA3-SRC轴影响这一状态 | 研究主要基于AT2-间充质器官共培养、小鼠和早期肺腺癌患者的样本，可能需要更多临床样本验证 | 探讨KRAS突变在肺腺癌早期发展中的作用及其与ITGA3-SRC轴的关系 | AT2细胞、小鼠、早期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | AT2-间充质器官共培养、小鼠和早期肺腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-09-23 |
Compound models and Pearson residuals for single-cell RNA-seq data without UMIs
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551637
PMID:37577688
|
研究论文 | 本文提出了一种扩展非UMI单细胞RNA-seq数据标准化方法的复合模型，使用复合Pearson残差进行基因选择和数据嵌入 | 本文创新性地将复合分布应用于非UMI数据的建模，提出了复合Pearson残差方法，并发现放大分布可以用破幂律描述 | NA | 扩展Pearson残差方法至非UMI单细胞RNA-seq数据标准化 | 非UMI单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 复合模型 | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-09-23 |
Pan-cancer mapping of single CD8+ T cell profiles reveals a TCF1:CXCR6 axis regulating CD28 co-stimulation and anti-tumor immunity
2024-Jul-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101640
PMID:38959885
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了TCF1与CXCR6轴在调节CD28共刺激信号和抗肿瘤免疫中的作用 | 本文首次揭示了TCF1与CXCR6轴在调节CD8+ T细胞功能和抗肿瘤免疫中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 揭示CD8+ T细胞在不同肿瘤微环境中的表达程序，为下一代免疫疗法提供依据 | CD8+ T细胞在七种人类癌症中的表达模式 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 矩阵分解算法 | 基因表达数据 | 33,161个CD8+ T细胞样本，来自132名患有七种癌症的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-09-20 |
The role of the fibroblast in Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma
2024-Jul-01, Current opinion in gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/MOG.0000000000001032
PMID:38626060
|
综述 | 本文综述了间质和癌症相关成纤维细胞在Barrett食管和食管腺癌中的作用，并探讨了针对这些细胞的转化前景 | 通过单细胞RNA测序研究揭示了间质在发育信号传导和癌症启动中的新兴作用，并提出了针对癌症相关成纤维细胞的潜在治疗策略 | NA | 探讨间质和癌症相关成纤维细胞在Barrett食管和食管腺癌中的作用 | Barrett食管和食管腺癌中的间质和癌症相关成纤维细胞 | NA | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-09-19 |
LncRNAs in the Dlk1-Dio3 Domain Are Essential for Mid-Embryonic Heart Development
2024-Jul-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25158184
PMID:39125754
|
研究论文 | 研究了Dlk1-Dio3域中的长非编码RNA（lncRNA）在胚胎中期心脏发育中的关键作用 | 构建了转录终止模型，并通过插入终止序列阐明了Dlk1-Dio3域中lncRNA表达缺失导致母系插入突变体（MKI）和纯合突变体（HOMO）小鼠从E13.5开始死亡 | 未详细描述研究中使用的具体lncRNA种类及其在心脏发育中的具体机制 | 探讨Dlk1-Dio3域中的lncRNA在胚胎中期心脏发育中的作用 | Dlk1-Dio3域中的lncRNA及其在心脏发育中的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）、原位杂交（IHC） | NA | RNA | 母系插入突变体（MKI）、纯合突变体（HOMO）和亲本插入突变体（PKI）小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-09-17 |
Deep learning approaches for non-coding genetic variant effect prediction: current progress and future prospects
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae446
PMID:39276327
|
综述 | 本文综述了基于批量和单细胞测序数据的非编码变异模型的发展及其模型解释和下游任务 | 本文提供了对非编码变异效应预测的深度学习方法的全面概述，并指出了改进的机会 | 当前方法在变异效应预测研究中存在局限性 | 探讨基因变异影响和调控机制，提供对非编码变异效应预测的深度学习方法的全面概述 | 非编码变异及其对基因调控的影响 | 机器学习 | NA | 测序技术 | 深度学习模型 | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-09-17 |
scHyper: reconstructing cell-cell communication through hypergraph neural networks
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae436
PMID:39276328
|
研究论文 | 提出了一种名为scHyper的新方法，通过超图神经网络从全局网络视角推断细胞间通信 | scHyper通过超图表示学习，能够重建细胞间通信得分，并识别所有细胞、配体和受体表达对通信得分的影响 | NA | 推断细胞间通信并识别其潜在影响 | 细胞间通信网络 | 机器学习 | NA | 超图神经网络 | 超图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 人类肿瘤微环境和免疫细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-09-17 |
Cancer-Associated Endocrine Cells Participate in Pancreatic Carcinogenesis
2024-Jul-22, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.016
PMID:39048054
|
研究论文 | 研究探讨了胰腺内分泌细胞在胰腺导管腺癌（PDAC）癌变过程中的作用及其与外分泌部分的相互作用 | 首次系统地描绘了PDAC中胰腺内分泌细胞的改变，并阐明了内分泌-外分泌相互作用的潜在机制 | NA | 探讨胰腺内分泌细胞在胰腺导管腺癌癌变过程中的作用及其机制 | 胰腺内分泌细胞及其在胰腺导管腺癌中的变化 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、多重免疫组化 | NA | 转录组数据 | 涉及正位移植小鼠、KrasLSL-G12DPdx1-Cre小鼠和KrasLSL-G12Dp53LoxPPdx1-CreER小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-09-14 |
Generation of novel lipid metabolism-based signatures to predict prognosis and immunotherapy response for colorectal adenocarcinoma
2024-07-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-67549-x
PMID:39060344
|
研究论文 | 本研究旨在生成基于脂质代谢的特征，以预测结直肠腺癌（COAD）的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次生成了基于脂质代谢的特征，用于预测COAD的预后和免疫治疗反应，并提供了潜在的治疗靶点 | 本研究仅基于TCGA数据库的数据，样本量有限，未来需要更多验证性研究 | 生成基于脂质代谢的特征，预测结直肠腺癌的预后和免疫治疗反应 | 结直肠腺癌（COAD）患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自TCGA数据库的COAD患者数据，以及来自GSE132465数据集的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |