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当前共找到 493 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-05 |
Overexpressed Trophoblast Glycoprotein Contributes to Preeclampsia Development by Inducing Abnormal Trophoblast Migration and Invasion Toward the Uterine Spiral Artery
2024-07, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究揭示了TPBG过表达如何通过影响子宫螺旋动脉重塑，促进子痫前症的发展 | 首次表明TPBG过表达与子痫前症发展之间的因果关系 | 研究重点在于TPBG的作用，未深入探讨其他可能的影响因素 | 探讨TPBG在子痫前症发展中的作用及其潜在机制 | 健康个体和子痫前症患者的胎盘组织及妊娠小鼠模型 | 数字病理学 | 子痫前症 | RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 收集了妊娠妇女的胎盘和血浆样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2026-07-24 |
Tumor necrosis factor receptor 2 promotes endothelial cell-mediated suppression of CD8+ T cells through tuning glycolysis in chemoresistance of breast cancer
2024-07-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05472-5
PMID:39033271
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研究论文 | 揭示肿瘤坏死因子受体2通过调节糖酵解促进内皮细胞介导的CD8+ T细胞抑制，在乳腺癌化疗耐药中发挥作用 | 首次识别出TNFR2+内皮细胞亚型在非响应患者中增强表达，并阐明其通过NF-κB信号调控糖酵解活性进而增强PD-L1依赖性抑制CD8+ T细胞的新机制 | 主要基于单细胞测序数据和动物模型，缺乏大样本临床验证，且体外实验的生理相关性需进一步确认 | 探究内皮细胞在三阴性乳腺癌化疗耐药中如何调控T细胞活性以及TNFR2在其中扮演的关键角色 | 三阴性乳腺癌患者的内皮细胞、CD8+ T细胞，以及TNFR2+内皮细胞亚型 | 数字病理学, 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、细胞糖酵解实验、蛋白质印迹 | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据、图像数据 | 利用公开的单细胞RNA测序数据集，具体样本数量未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组（具体配置未明确） |
| 3 | 2026-07-24 |
Computing cell state discriminates the aberrant hematopoiesis and activated microenvironment in Myelodysplastic syndrome (MDS) through a single cell genomic study
2024-07-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05496-x
PMID:39033303
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研究论文 | 通过单细胞基因组研究，计算细胞状态区分骨髓增生异常综合征中的异常造血和活化微环境 | 使用未分选的骨髓细胞进行单细胞RNA测序，而非仅关注CD34+造血祖细胞，并开发了MarcoPolo管道将MDS和AML细胞投射到骨髓细胞参考图谱上 | 该研究样本量较小，仅涉及5名MDS患者和4名健康供者，且未发现突变负荷显著增加 | 从单细胞水平系统描述MDS患者的造血发育异常、风险异质性及T细胞微环境 | 5名MDS患者和4名健康供者的骨髓穿刺未分选细胞 | 单细胞基因组学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录因子分析、CellOracle扰动分析、MarcoPolo管道 | NA | 单细胞转录组数据 | 9例样本，包括5名MDS患者和4名健康供者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-24 |
Endoplasmic reticulum stress promotes hepatocellular carcinoma by modulating immunity: a study based on artificial neural networks and single-cell sequencing
2024-07-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05460-9
PMID:39010084
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研究论文 | 基于人工神经网络和单细胞测序，研究内质网应激通过调节免疫促进肝细胞癌的机制 | 结合多种机器学习算法和人工神经网络构建了与内质网应激相关的肝癌诊断预测模型 | NA | 探究内质网应激在肝细胞癌发展中的分子机制，并建立诊断预测模型 | 肝细胞癌相关的内质网应激差异表达基因及其免疫微环境 | 机器学习, 数字病理学 | 肝细胞癌 | 基因表达数据整合, 单细胞测序 | 人工神经网络, 随机森林, 支持向量机 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集（GSE25097, GSE62232, GSE65372） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-07-24 |
Non-canonical Wnt pathway expression in the developing mouse and human retina
2024-07, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109947
PMID:38815793
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研究论文 | 分析非经典Wnt通路在小鼠和人类视网膜发育中的表达模式 | 首次系统比较非经典Wnt通路在小鼠和人类视网膜发育过程中的表达差异，并发现新的物种特异性表达基因 | 主要依赖公开的scRNAseq数据集，缺乏功能验证实验 | 探究非经典Wnt通路在视网膜发育和突触形成中的作用 | 小鼠视网膜、人类视网膜和人类视网膜类器官 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个发育时间点的公开数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 6 | 2026-07-23 |
Metastasis and basement membrane-related signature enhances hepatocellular carcinoma prognosis and diagnosis by integrating single-cell RNA sequencing analysis and immune microenvironment assessment
2024-07-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05493-0
PMID:39085893
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和免疫微环境评估，构建了一种基于转移和基底膜相关基因的预后模型，用于增强肝细胞癌的预后和诊断能力 | 首次将转移与基底膜相关基因结合起来构建预后模型，并结合单细胞RNA测序和多种免疫算法全面评估免疫微环境，揭示了ITGA3在肿瘤转移中的作用 | 研究主要依赖公共数据库（TCGA和ICGC）的数据，缺乏独立外部验证队列；生物学机制验证仅限于体外细胞实验，未进行体内模型验证 | 探索和评估潜在生物标志物以改善肝细胞癌患者的生存结果和治疗效果 | 肝细胞癌患者（来自TCGA的424例和ICGC的240例）以及HepG2细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据, 临床数据, 突变数据 | 424例TCGA患者和240例ICGC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-07-23 |
Single-cell hdWGCNA reveals metastatic protective macrophages and development of deep learning model in uveal melanoma
2024-07-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05421-2
PMID:39075441
|
研究论文 | 通过单细胞RNA-seq和hdWGCNA分析揭示葡萄膜黑色素瘤中转移保护性巨噬细胞，并开发深度学习模型用于区分原发与转移患者及预后预测 | 首次利用高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）在单细胞水平鉴定转移保护性巨噬细胞及其关键基因模块，并结合深度学习卷积神经网络模型实现原发与转移患者的精准区分 | 研究数据来源有限，未提及外部独立验证队列的多样性；转移保护的巨噬细胞亚群功能机制仍需进一步实验验证 | 探索葡萄膜黑色素瘤转移的免疫微环境机制，并基于关键基因开发预后预测模型 | 葡萄膜黑色素瘤患者的原发和转移样本中的巨噬细胞亚群及相关基因 | digital pathology, machine learning | uveal melanoma | 单细胞RNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析 | 卷积神经网络, 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA（未明确样本量） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-07-23 |
Spatial transcriptome and single-cell reveal the role of nucleotide metabolism in colorectal cancer progression and tumor microenvironment
2024-07-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05495-y
PMID:39075485
|
研究论文 | 整合单细胞与空间转录组学，揭示核苷酸代谢在结直肠癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次通过整合多种单细胞富集评分方法和空间转录组分析，识别出核苷酸代谢高表达的肿瘤细胞亚群（NUhighepi），并阐明其与成纤维细胞的互作机制，同时发现关键基因NME1在抑制转移中的作用 | 未说明具体局限性 | 深入理解核苷酸代谢在结直肠癌肿瘤细胞和肿瘤微环境中的功能 | 结直肠癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的成纤维细胞及免疫细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 核苷酸代谢分析 | RCTD, stlearn, MISTy, 多种机器学习算法 | 单细胞数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 多个单细胞队列和多批量转录组队列（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-07-23 |
Communication between alveolar macrophages and fibroblasts via the TNFSF12-TNFRSF12A pathway promotes pulmonary fibrosis in severe COVID-19 patients
2024-07-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05381-7
PMID:39075394
|
研究论文 | 研究严重COVID-19患者肺泡巨噬细胞与成纤维细胞通过TNFSF12-TNFRSF12A通路促进肺纤维化的机制 | 首次揭示了TNFSF12-TNFRSF12A通路在严重COVID-19相关肺纤维化中介导肺泡巨噬细胞-成纤维细胞通信的关键作用，并发现沉默TNFRSF12A可逆转纤维化效应 | NA | 探究TNFSF12-TNFRSF12A通路在严重COVID-19肺纤维化中肺泡巨噬细胞与成纤维细胞间通信的作用 | 严重COVID-19患者的肺泡巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 新型冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 严重COVID-19患者和健康对照者的肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 10 | 2026-07-19 |
Interneuron diversity in the human dorsal striatum
2024-07-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50414-w
PMID:39039043
|
研究论文 | 利用单细胞核RNA测序和空间转录组学解析人类背侧纹状体中间神经元多样性 | 提出包含8个主要类别和14个亚类的纹状体中间神经元全面分类体系，整合转录组身份、空间表达谱及跨物种比较 | 未明确说明局限性 | 阐明人类背侧纹状体中间神经元的多样性及其转录组结构 | 死后人类尾状核和壳核样本 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | snRNA-seq, 空间转录组学, 定量荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间表达数据 | 死后人类尸检样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 与10x Chromium单细胞核RNA测序和10x Visium空间转录组学兼容 |
| 11 | 2026-07-10 |
Whole brain alignment of spatial transcriptomics between humans and mice with BrainAlign
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50608-2
PMID:39080277
|
研究论文 | 开发了一种名为BrainAlign的自监督学习方法，用于人类和小鼠全脑空间转录组学比对 | 提出了一种自监督学习方法，通过异构图形神经网络同时编码空间转录组学中的点和基因，实现跨物种全脑比对，并揭示了保守脑区和同源基因表达模式 | NA | 推动人类和啮齿动物全脑空间转录组学研究方法的跨物种比对 | 人类和小鼠的全脑空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 异构图形神经网络 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-07-10 |
CRISPR-CasRx-mediated disruption of Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2 genes reduces intraocular pressure and retinal ganglion cell damage in mice
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50050-4
PMID:39080269
|
研究论文 | 利用CRISPR-CasRx技术靶向Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2基因，降低小鼠眼内压并保护视网膜神经节细胞 | 首次利用CasRx RNA干扰工具结合shH10腺相关病毒，靶向调控房水循环相关基因，实现眼内压降低和视网膜神经节细胞保护，并通过单细胞测序阐明作用机制 | 研究仅限于雌性小鼠，未涉及其他性别或人类模型，且基因敲降效果的长期安全性未评估 | 探索基因治疗降低眼内压和延缓青光眼进展的新方法 | 雌性小鼠 | 基因治疗 | 青光眼 | CRISPR-CasRx, 腺相关病毒载体, 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 雌性小鼠，具体数量未指定 | 未指定 | 单细胞测序 | 未指定 | 未指定 |
| 13 | 2026-07-10 |
Mapping the molecular landscape of Lotus japonicus nodule organogenesis through spatiotemporal transcriptomics
2024-07-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50737-8
PMID:39080318
|
研究论文 | 通过时空转录组学绘制百脉根根瘤器官发生的分子图谱 | 首次利用空间转录组学技术全面解析模式豆科植物百脉根根瘤发育过程中感染区和外围组织的发育轨迹，揭示了共生和物质交换的基因调控网络，并鉴定了转录因子LjNLP3在根瘤从分化到成熟转化中的关键作用 | 未提及具体限制 | 利用空间转录组学揭示百脉根根瘤器官发生的分子机制，为开发共生固氮作物提供数据支持 | 模式豆科植物百脉根（Lotus japonicus）的根瘤 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-07-05 |
TWIST1+FAP+ fibroblasts in the pathogenesis of intestinal fibrosis in Crohn's disease
2024-Jul-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179472
PMID:39024569
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示克罗恩病肠道纤维化发病机制中TWIST1+FAP+成纤维细胞的作用 | 首次鉴定出FAP+成纤维细胞是纤维化肠道中ECM产生最多的关键亚型，并发现TWIST1作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 阐明克罗恩病肠道纤维化的细胞和分子机制 | 克罗恩病伴肠梗阻患者的纤维化和非纤维化回肠组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 15 | 2026-07-04 |
Impact of different tissue dissociation protocols on endothelial cell recovery from developing mouse lungs
2024-07, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24843
PMID:38668123
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研究论文 | 评估不同组织解离方案对从发育中小鼠肺中回收内皮细胞的影响 | 首次系统比较胶原酶A和分散酶两种酶解方法对幼年和成年小鼠肺内皮细胞回收效率及亚型组成的影响，并利用单细胞RNA-Seq揭示不同方法导致的细胞亚型偏差 | 仅限于小鼠肺组织，未涉及其他组织或物种；未深入探讨酶解对细胞功能的影响 | 比较不同组织解离方案对内皮细胞回收效率及亚型组成的影响 | 幼年和成年小鼠肺组织中的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肺组织样本（幼年和成年） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 16 | 2026-07-04 |
Advances in preclinical assessment of therapeutic targets for bladder cancer precision medicine
2024-07-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001177
PMID:38602053
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综述 | 综述膀胱癌精准医学治疗靶点的临床前评估进展 | 重点介绍了抗体-药物偶联物（ADC）联合免疫疗法、单细胞RNA测序技术及功能精准医学等新策略在膀胱癌靶向治疗中的应用 | 未提及具体临床验证数据及治疗方案的长期效果评估 | 旨在改善膀胱癌患者个体化治疗和疗效 | 膀胱癌患者 | 机器学学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-07-04 |
Recent contributions of single-cell and spatial profiling to the understanding of bladder cancer
2024-07-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001183
PMID:38650456
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综述 | 总结了单细胞和空间组学方法在理解膀胱癌生物学方面的最新进展及其对开发新型治疗策略的潜在影响 | 整合单细胞RNA测序与空间组学技术，以前所未有的分辨率揭示膀胱癌肿瘤微环境、异质性、癌症干细胞性和细胞可塑性 | 将研究成果转化为临床实践和实施个性化治疗策略仍面临挑战 | 探讨单细胞和空间组学技术对膀胱癌生物学理解的贡献及对治疗方案的影响 | 膀胱癌肿瘤微环境中的恶性细胞亚群、免疫细胞、癌症相关成纤维细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 18 | 2026-07-01 |
Compound models and Pearson residuals for single-cell RNA-seq data without UMIs
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551637
PMID:37577688
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研究论文 | 提出一种适用于无UMI单细胞RNA-seq数据的复合模型与皮尔逊残差归一化方法 | 通过复合分布（负二项分布与扩增分布结合）建模非UMI数据的额外扩增步骤，并利用碎幂律描述不同测序方案的扩增分布 | 未详细讨论模型在不同测序平台和数据集上的泛化性能及计算效率 | 将基于皮尔逊残差的归一化方法从UMI数据扩展到非UMI单细胞RNA-seq数据 | 无UMI的单细胞RNA-seq数据（如Smart-seq2数据集） | 自然语言处理 | NA | RNA-seq, Smart-seq2 | 复合模型（负二项分布与扩增分布） | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | NA |
| 19 | 2026-07-01 |
Increased prevalence of hybrid epithelial/mesenchymal state and enhanced phenotypic heterogeneity in basal breast cancer
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110116
PMID:38974967
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研究论文 | 利用多模态转录组数据（批量、单细胞、空间转录组）分析乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本中上皮-间充质转化（EMT）与腔-基底可塑性之间的关联 | 整合多模态转录组数据（批量、单细胞和空间转录组）并结合数学建模，系统揭示基底乳腺癌中混合上皮/间充质表型增多及表型异质性增强的分子机制 | NA | 探究乳腺癌中上皮-间充质转化（EMT）与腔-基底可塑性之间的相互作用，以及其对肿瘤内表型异质性的影响 | 乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 数学建模, 基因调控网络 | 转录组数据（批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学） | 乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-07-01 |
γδ T cell profiling in a cohort of preterm infants reveals elevated frequencies of CD83+ γδ T cells in sepsis
2024-07-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231987
PMID:38753245
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研究论文 | 对早产儿γδ T细胞进行纵向单细胞分析，发现脓毒症患儿中CD83+ γδ T细胞频率升高 | 首次系统描绘早产儿出生后γδ T细胞的发育轨迹，并发现新生儿特有的CD83+ γδ T细胞亚群在脓毒症中的作用，区别于成人的CD86表达机制 | 研究未明确胎儿来源Vγ9Vδ2 T细胞在脓毒症中的精确功能机制，且样本量可能有限 | 探究早产儿γδ T细胞的发育特征及其在新生儿败血症中的作用 | 早产儿外周血γδ T细胞 | 单细胞转录组学 | 新生儿败血症 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、功能实验 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 纵向队列早产儿多个时间点样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |