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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-12 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 评估Element Biosciences的亲和测序技术在单细胞RNA-seq中对同聚物序列的测序能力,并分析其对比对及多聚腺苷酸化位点定量的影响 | 首次系统评估亲和测序化学技术通过胸腺嘧啶同聚物序列的能力,展示了无需传统方法复杂性的配对末端直接分配读段至多聚腺苷酸化位点的方法 | 配对末端比对在读段映射率上未持续优于单端比对,且未排除其他新兴平台可能具有类似性能 | 评估亲和测序在单细胞RNA-seq中跨越同聚物序列的准确性及其对数据分析的影响 | 基于poly(dT)引物的3'单细胞RNA-seq文库中的cDNA片段 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq测序 | NA | 测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序仪 | Element Aviti仪器进行亲和测序,Illumina平台用于对比 |
| 2 | 2026-05-10 |
GZMK+CD8+ T cells Target A Specific Acinar Cell Type in Sjögren's Disease
2024-Jul-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3601404/v2
PMID:38196575
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research paper | 利用单细胞和空间转录组学技术,构建了健康与干燥综合征(SjD)患者唾液腺的细胞图谱,发现GZMK+CD8+ T细胞靶向特定的浆液黏液腺泡细胞亚群,揭示了SjD的病理机制 | 首次鉴定出新的浆液黏液腺泡细胞类型,并发现GZMK+CD8+ T细胞在SjD中特异性靶向该细胞群体,展示了免疫反应对高分泌腺泡细胞的影响 | NA | 阐明Sjögren病中免疫反应对唾液腺细胞类型的影响及具体细胞亚群的病理学作用 | 人类小唾液腺组织中的细胞类型,包括腺泡细胞和免疫细胞 | machine learning, digital pathology | Sjögren病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类小唾液腺组织样本(健康与SjD患者) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 3 | 2026-05-07 |
Accurate estimation of pathway activity in single cells for clustering and differential analysis
2024-07-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278431.123
PMID:38981682
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研究论文 | 提出SiPSiC方法,用于推断单细胞中通路活性,并进行聚类和差异分析 | 提出SiPSiC方法,可在每个单细胞水平推断通路活性,实现更敏感的差异分析和聚类,并能克服患者特异性伪影 | 未明确提及局限性 | 开发准确估计单细胞中通路活性的方法,用于聚类和差异分析 | COVID-19、肺腺癌和胶质瘤数据集中的单细胞 | 机器学习 | COVID-19, 肺腺癌, 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | COVID-19、肺腺癌和胶质瘤数据集(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-05-06 |
West Nile Virus-Induced Expression of Senescent Gene Lgals3bp Regulates Microglial Phenotype within Cerebral Cortex
2024-07-08, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070808
PMID:39062523
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研究论文 | 研究西尼罗病毒感染后大脑皮层内衰老基因Lgals3bp的表达如何调控小胶质细胞表型 | 首次揭示西尼罗病毒感染激活的小胶质细胞与衰老小胶质细胞共享转录特征,并发现LGALS3BP在调节神经炎症和小胶质细胞活化中的新作用 | NA | 研究西尼罗病毒感染与小胶质细胞衰老之间的关系,重点关注LGALS3BP的作用 | 成年和老年小鼠的西尼罗病毒脑炎恢复期大脑皮层及Lgals3bp基因敲除小鼠 | 数字病理学 | 西尼罗病毒脑炎 | 空间转录组学、RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 成年和老年小鼠及Lgals3bp基因敲除小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-04 |
Osteostaticytes: A novel osteoclast subset couples bone resorption and bone formation
2024-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.06.010
PMID:39027343
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人皮质骨细胞图谱,发现一种新型破骨细胞亚群——骨静细胞(OSCs),其具有高趋化活性,可招募间充质干细胞,参与骨重塑中的逆转阶段 | 首次鉴定出IDO1高表达/CCL3高表达/CCL4高表达的破骨细胞前体亚群(骨静细胞),并证明其在骨重塑逆转期具有最强的间充质干细胞趋化能力,揭示了破骨细胞系早期阶段与骨形成偶联的新机制 | 该研究主要基于单细胞转录组数据和体外共培养实验,骨静细胞在体内骨重塑中的具体功能及其作为治疗靶点的可行性仍需进一步验证 | 阐明骨髓炎后骨重塑失败的细胞和分子机制,探索破骨细胞系在骨形成与骨吸收偶联中的作用 | 人皮质骨(正常、感染和重建状态)样本,以及正常小鼠胫骨骨折模型和骨髓炎相关胫骨骨折模型 | 数字病理学, 机器学习 | 骨髓炎, 骨延迟愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞转录组)、图像(免疫荧光、生物发光成像) | 人皮质骨样本(具体数量未提及,包含正常、感染和重建三种状态),小鼠模型样本(正常骨折和骨髓炎骨折模型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the transcriptional landscape of lacrimal gland in GVHD mouse model
2024-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.04.006
PMID:38703817
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示GVHD小鼠模型泪腺的转录景观 | 首次构建GVHD小鼠泪腺细胞图谱,发现Lrg1高表达上皮细胞新亚群,并描绘细胞间通信网络 | 仅基于小鼠模型,需在人类样本中验证;部分转录结果通过免疫荧光验证,缺乏功能实验 | 研究GVHD小鼠模型中泪腺细胞群的全局转录表达谱,揭示眼表GVHD的发病机制 | GVHD小鼠模型的泪腺细胞 | 转录组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | GVHD小鼠模型泪腺细胞(具体样本量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-04-23 |
Trem2 Agonist Reprograms Foamy Macrophages to Promote Atherosclerotic Plaque Stability-Brief Report
2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320797
PMID:38695172
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研究论文 | 本研究探讨了Trem2激动剂抗体AL002a在动脉粥样硬化小鼠模型中如何通过重编程泡沫巨噬细胞来促进斑块稳定性 | 首次在动脉粥样硬化模型中测试Trem2激动剂抗体的治疗潜力,并揭示其通过调节泡沫巨噬细胞转录组改善斑块稳定性的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类临床试验,且长期安全性和疗效未知 | 验证Trem2激动剂能否通过增强巨噬细胞存活和功能来改善动脉粥样硬化斑块稳定性 | 动脉粥样硬化易感小鼠(Ldlr-/-)及其主动脉斑块中的泡沫巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、体外细胞功能验证 | 动物疾病模型(小鼠) | 基因表达数据、组织病理学图像 | 未明确说明具体数量,但涉及治疗组和对照组小鼠的主动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-18 |
Differential role of glucocorticoid receptor based on its cell type specific expression on tumor cells and infiltrating lymphocytes
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101957
PMID:38643748
|
研究论文 | 本研究探讨了糖皮质激素受体在乳腺癌中基于细胞类型特异性表达的差异作用,并开发了一个独立于雌激素受体状态的GR特征 | 开发了一个独立于ER状态的GR特征,并揭示了GR在肿瘤细胞和浸润淋巴细胞中的细胞类型特异性作用,特别是在三阴性乳腺癌中的预后意义 | NA | 解决关于GR在乳腺癌中预后作用的矛盾报告,并探索其治疗潜力 | 乳腺癌细胞系、公共数据集中的肿瘤样本、独立乳腺癌队列中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-04-17 |
Differences in microenvironment of lung cancer and pleural effusions by single-cell RNA sequencing
2024-07, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2024.107847
PMID:38889499
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序比较了匹配的肺癌组织活检与胸腔积液微环境的差异 | 首次对同一患者的匹配肺癌活检组织和胸腔积液进行单细胞RNA测序直接比较 | 样本量较小(10例患者),未明确说明使用的具体单细胞测序平台 | 理解肺癌肿瘤微环境在组织与胸腔积液中的生物学差异 | 肺癌患者匹配的肿瘤组织活检和胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例患者的匹配肺癌活检和胸腔积液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-04-14 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immunomodulatory Effects of Stem Cell Factor and Granulocyte Colony-Stimulating Factor Treatment in the Brains of Aged APP/PS1 Mice
2024-07-10, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070827
PMID:39062541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了干细胞因子和粒细胞集落刺激因子联合治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中的免疫调节作用 | 首次在单细胞水平上揭示了SCF+G-CSF治疗如何调节小胶质细胞和外周髓系细胞以减轻阿尔茨海默病病理 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本量较小(仅使用APP/PS1小鼠) | 探究SCF+G-CSF治疗在老年阿尔茨海默病大脑中的修复机制 | 28月龄APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 28月龄APP/PS1小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-11 |
Elucidating the Transcriptional States of Spermatogenesis-Joint Analysis of Germline and Supporting Cell, Mice and Human, Normal and Perturbed, Bulk and Single-Cell RNA-Seq
2024-07-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070840
PMID:39062554
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综述 | 本文综述了精子发生研究的分子基础,强调通过整合分析(包括正常与病理状态、小鼠与人类数据、表型与分子谱、生殖细胞与支持细胞)来推进对男性不育精准医学的理解 | 提出了精子发生研究的四个整合轴,结合单细胞RNA测序等先进技术,揭示生殖细胞发育新阶段和睾丸微环境中的未知细胞亚型 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且依赖于现有研究的整合,可能受限于当前技术和方法的不完全覆盖 | 阐明精子发生的转录状态,以促进对男性不育的精准医学诊断和治疗策略的开发 | 生殖细胞(如精原细胞)和支持细胞(如Sertoli细胞和Leydig细胞),涉及小鼠和人类样本 | 自然语言处理 | 男性不育 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-04-11 |
Targeting Microglia in Alzheimer's Disease: Pathogenesis and Potential Therapeutic Strategies
2024-07-11, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070833
PMID:39062547
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综述 | 本文综述了小胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用,并探讨了以该细胞为靶点的潜在治疗策略 | 系统总结了基于单细胞测序技术揭示的小胶质细胞在AD病程中的动态表型变化,并提出了针对小胶质细胞功能增强与神经炎症抑制的双重治疗策略框架 | NA | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用机制并探索相关治疗策略 | 小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-04-11 |
Pan-cancer analysis of super-enhancer-induced LINC00862 and validation as a SIRT1-promoting factor in cervical cancer and gastric cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101982
PMID:38718436
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研究论文 | 本文通过泛癌分析探讨了LINC00862的生物学意义,并验证了其在宫颈癌和胃癌中作为SIRT1促进因子的作用 | 揭示了LINC00862作为超级增强子诱导的基因,通过竞争性结合miR-29c-3p释放SIRT1的促癌功能,并验证了其作为免疫治疗疗效预测生物标志物的潜力 | NA | 探索LINC00862在泛癌中的生物学意义及其作为免疫治疗生物标志物的潜力 | LINC00862基因在多种癌症中的表达及其调控机制 | 生物信息学 | 宫颈癌,胃癌 | 生物信息学分析,染色质免疫沉淀,RNA免疫沉淀,虚拟筛选,体外和体内实验 | NA | TCGA数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-04-09 |
Integrating single-cell RNA-seq to identify fibroblast-based molecular subtypes for predicting prognosis and therapeutic response in bladder cancer
2024-07-18, Aging
DOI:10.18632/aging.206021
PMID:39033778
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,识别基于成纤维细胞的分子亚型,以预测膀胱癌患者的预后和治疗反应 | 建立了一个基于成纤维细胞标记基因的新型预后特征,用于预测膀胱癌患者的生存和免疫治疗反应 | NA | 预测膀胱癌患者的预后和治疗反应 | 膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-04-09 |
Inflammatory risk contributes to post-COVID endothelial dysfunction through anti-ACKR1 autoantibody
2024-07, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402598
PMID:38740432
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19康复者体内抗ACKR1自身抗体与血管功能障碍的关联及其机制 | 首次揭示了COVID-19后抗ACKR1自身抗体与内皮功能障碍的关联,并发现其通过抗体依赖性细胞毒性机制而非直接细胞毒性作用,同时识别了ACKR1的N端胞外域关键表位 | 研究主要基于观察性队列和体外实验,需要进一步在体实验验证;样本来源和规模可能限制普遍性结论 | 探究COVID-19后持续炎症状态下自身抗体导致血管功能障碍的机制 | COVID-19康复者、小鼠组织内皮细胞、人静脉内皮细胞、患者外周血单个核细胞 | NA | COVID-19后遗症、血管疾病 | 单细胞转录组测序、抗体纯化、细胞毒性实验、蛋白质重组技术 | NA | 转录组数据、临床数据、体外实验数据 | 健康COVID-19康复者队列(具体数量未明确)、独立随访队列(中位随访6.7年)、小鼠多种组织内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-04-09 |
Frataxin deficiency shifts metabolism to promote reactive microglia via glucose catabolism
2024-07, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402609
PMID:38631900
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研究论文 | 本研究探讨了弗里德赖希共济失调(FRDA)中frataxin(FXN)缺乏如何通过葡萄糖分解代谢促进反应性小胶质细胞,并揭示了丁酸盐通过调节免疫代谢途径改善神经功能的潜力 | 首次在单细胞水平上揭示了FXN缺乏导致小胶质细胞稳态丧失并转向糖酵解和衣康酸生成,并发现丁酸盐通过衣康酸-Nrf2-GSH通路和Hcar2介导恢复小胶质细胞稳态 | 研究基于小鼠模型,结果在人类FRDA患者中的适用性需进一步验证 | 探究FRDA中FXN缺乏对小胶质细胞免疫代谢的影响及丁酸盐的治疗潜力 | FRDA小鼠模型的小脑组织和小胶质细胞 | 免疫代谢学 | 弗里德赖希共济失调 | 单细胞RNA测序,代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,代谢组学数据 | FRDA小鼠模型的小脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-04-08 |
A multidimensional analysis reveals distinct immune phenotypes and the composition of immune aggregates in pediatric acute myeloid leukemia
2024-Jul-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.03.03.23286485
PMID:37961528
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研究论文 | 本研究通过多维分析揭示了儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的组成、表型和空间结构,特别是免疫浸润特征和T/B细胞聚集体的细胞构成 | 首次在儿童AML中发现约三分之一病例存在免疫浸润的骨髓微环境,并识别出大型T细胞网络及富含T/B细胞的免疫聚集热点 | 研究样本量有限,且主要基于观察性分析,未深入验证免疫聚集体的功能机制 | 解析儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的组成与空间结构,为免疫治疗提供新见解 | 儿童急性髓系白血病患者及非白血病对照的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、免疫表型数据 | 儿童AML病例及非白血病对照(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-04-03 |
Similarity Network Analysis of the Adaptive Immune Response in the Proximal Airway
2024-07, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.31376
PMID:38450771
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体相似性网络分析,探讨了健康个体和特发性声门下狭窄患者近端气道黏膜中适应性免疫应答的特征 | 首次在特发性声门下狭窄患者中,结合单细胞RNA测序与GLIPH2算法,分析了气道黏膜中T细胞克隆的分布、结构差异及共享抗原靶点,揭示了病毒靶点在疾病瘢痕中的适应性免疫作用 | 样本量相对有限(iSGS患者32例,健康对照10例),且研究聚焦于特发性声门下狭窄,可能不适用于其他气道疾病 | 探究近端气道黏膜中适应性免疫应答的分布、结构及抗原靶点,以理解特发性声门下狭窄的发病机制并寻找新的治疗策略 | 特发性声门下狭窄患者的瘢痕和未受影响黏膜组织,以及健康对照的气道黏膜组织 | 数字病理学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,相似性网络分析 | GLIPH2算法 | 单细胞RNA测序数据,T细胞受体序列数据 | 特发性声门下狭窄患者32例,健康对照10例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-03-21 |
Single-cell sequencing reveals the correlation of aggrephagy signaling and multiple myeloma immune microenvironment composition
2024-07, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3712
PMID:38949072
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了聚集自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境组成的相关性 | 首次探讨了聚集自噬信号在多发性骨髓瘤免疫微环境中的作用及其与疾病预后的关联 | 研究样本量相对较小,且主要依赖公共数据库数据进行验证 | 探究聚集自噬信号在多发性骨髓瘤免疫微环境中的角色及其预后价值 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本及健康对照样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 非负矩阵分解 | RNA表达谱数据 | 7个多发性骨髓瘤骨髓样本和7个健康骨髓样本,共12,187个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-03-21 |
Single-cell analysis of Crohn's disease: Unveiling heterogeneity and evaluating ustekinumab outcomes
2024-07, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3715
PMID:38962887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析克罗恩病的细胞异质性,并评估乌司奴单抗的治疗效果 | 利用单细胞RNA测序技术揭示克罗恩病中成纤维细胞和T细胞的关键相互作用及转录特征,为疾病机制和治疗靶点提供新见解 | NA | 解析克罗恩病的细胞复杂性,识别关键细胞群及其转录特征 | 克罗恩病患者与健康对照的炎症组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | Seurat | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |