单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 543 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-07 |
ScRNA-Seq Analyses Define the Role of GATA3 in iNKT Cell Effector Lineage Differentiation
2024-06-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13121073
PMID:38920701
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了转录因子GATA-3在调控iNKT细胞效应谱系分化中的关键作用 | 首次系统阐明GATA-3缺失导致iNKT2和iNKT17细胞亚群缺失，并发现Icos表达恢复可挽救iNKT细胞发育 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人类iNKT细胞中验证 | 探究GATA-3转录因子对iNKT细胞效应谱系分化的调控机制 | 小鼠胸腺iNKT细胞及其亚群(iNKT1、iNKT2、iNKT17) | 免疫学 | NA | 流式细胞术, 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | GATA-3缺陷型小鼠胸腺iNKT细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-10-07 |
Preliminary Single-Cell RNA-Sequencing Analysis Uncovers Adipocyte Heterogeneity in Lipedema
2024-06-13, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13121028
PMID:38920656
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示脂水肿中脂肪细胞的异质性 | 首次在脂水肿组织中鉴定出三种不同的脂肪细胞亚群 | 初步研究，样本量有限，需要进一步验证 | 探索脂水肿疾病中脂肪细胞的异质性 | 脂水肿患者和健康参与者的脂肪组织样本 | 单细胞组学 | 脂水肿 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 脂水肿患者和健康参与者的脂肪组织样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序技术，使用条形码磁珠进行单细胞捕获 |
| 163 | 2025-10-07 |
Identifying gene expression programs in single-cell RNA-seq data using linear correlation explanation
2024-06, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2024.104644
PMID:38631462
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于线性相关解释的方法，用于从单细胞RNA测序数据中识别与细胞表型和活性程序相关的基因表达程序 | 采用总相关优化函数和迁移学习方法，能够同时识别细胞类型特异性基因表达程序和与生物过程及刺激响应相关的程序 | 方法在模拟数据和有限真实数据集上验证，需要更广泛的应用验证 | 从单细胞RNA测序数据中推断具有生物学意义的基因表达程序 | 小鼠齿状回和胚胎结肠发育的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性CorEx（相关解释） | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2025-10-07 |
Patterns of Unwanted Biological and Technical Expression Variation Among 49 Human Tissues
2024-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102069
PMID:38670317
|
研究论文 | 本研究利用GTEx数据集分析49种人体组织中基因表达变异的模式和原因 | 对17,282个样本进行大规模表达变异分析，识别出522个变异转录本簇并系统分类其生物学和技术原因 | 仅评估了最可变的前2%转录本，部分变异簇(14%)未能明确归因 | 探究人体组织基因表达中非期望变异的模式和原因 | 49种人体组织的17,282个基因表达样本 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 17,282个样本来自49种人体组织 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2025-10-07 |
Plasmodium infection induces phenotypic, clonal, and spatial diversity among differentiating CD4+ T cells
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114317
PMID:38848213
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了疟原虫感染期间CD4+ T细胞的分化多样性、克隆分布和空间相互作用 | 首次在近单细胞分辨率下绘制了脾脏微环境中CD4+ T细胞的空间分布和细胞间相互作用网络，并发现CCR5在克隆扩增和Th1分化中的新功能 | 研究主要聚焦于脾脏组织，未涉及其他免疫器官；TCR转基因对照模型可能无法完全模拟多克隆T细胞的真实反应 | 阐明疟原虫感染过程中CD4+ T细胞的分化表型、克隆特性和空间定位机制 | 小鼠脾脏中的CD4+ T细胞、单核细胞和基质细胞 | 空间转录组学 | 疟疾 | 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 近单细胞分辨率空间转录组分析 |
| 166 | 2025-10-07 |
Molecular cascade reveals sequential milestones underlying hippocampal neural stem cell development into an adult state
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114339
PMID:38852158
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠海马神经干细胞从发育状态向成年状态转变的分子级联过程 | 首次发现神经干细胞成熟需要经历两个连续步骤：首先进入静息状态，然后进一步成熟，每个步骤都涉及独特的代谢基因表达变化 | 研究仅限于小鼠早期出生后发育阶段，人类或其他物种的适用性尚需验证 | 探索发育期神经干细胞向成年神经干细胞状态转变的过程、里程碑和机制 | 小鼠齿状回神经干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2025-10-07 |
Microglia-astrocyte crosstalk in the amyloid plaque niche of an Alzheimer's disease mouse model, as revealed by spatial transcriptomics
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114216
PMID:38819990
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中淀粉样斑块微环境内小胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用 | 首次使用CosMx和Stereo-seq两种高分辨率空间转录组学平台同时分析淀粉样斑块微环境的转录组特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明阿尔茨海默病淀粉样斑块微环境中神经胶质细胞的相互作用机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织样本 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | CosMx, Stereo-seq | 空间转录组学 | CosMx, Stereo-seq | 高分辨率空间转录组学平台 |
| 168 | 2025-10-07 |
Interferon-γ induces combined pyroptotic angiopathy and APOL1 expression in human kidney disease
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114310
PMID:38838223
|
研究论文 | 本研究揭示了干扰素-γ通过诱导焦亡性血管病变和APOL1表达在人类肾脏疾病中的致病机制 | 首次证明IFN-γ同时诱导内皮细胞损伤和肾脏细胞焦亡，揭示了APOL1介导的塌陷性肾小球病的组合机制 | 研究主要基于体外模型，需要更多体内实验验证 | 探究干扰素信号在肾脏疾病中的直接致病作用 | 人类肾脏类器官、原代内皮细胞和患者样本 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,免疫印迹,定量荧光分析,多组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 人类肾脏类器官、原代内皮细胞和COVID-19、蛋白尿性肾病、塌陷性肾小球病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-07 |
Immunotherapeutic targeting of surfaceome heterogeneity in AML
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114260
PMID:38838225
|
研究论文 | 本研究通过分析100例急性髓系白血病样本的表面蛋白质组和单细胞转录组，识别了原始AML细胞优先表达的抗原和标志物 | 首次在100例遗传多样性AML样本中系统分析表面蛋白质组异质性，并在亚群水平评估抗原表达 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证 | 识别AML免疫治疗的潜在靶点 | 100例遗传多样性原发性人类AML样本 | 癌症免疫学 | 急性髓系白血病 | 表面蛋白质组分析, 单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 100例原发性人类AML样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 表面蛋白质组学 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-07 |
Single-cell-resolved interspecies comparison shows a shared inflammatory axis and a dominant neutrophil-endothelial program in severe COVID-19
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114328
PMID:38861386
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较COVID-19感染过程中仓鼠与人类的分子反应特征 | 首次在仓鼠模型中解析COVID-19疾病进展的单细胞转录组动态，并建立与人类数据的跨物种比较框架 | 缺乏患者感染初期的活检样本，依赖动物模型推演人类疾病机制 | 揭示严重COVID-19的炎症反应机制和疾病进展路径 | 叙利亚仓鼠和罗伯罗夫斯基仓鼠的肺组织，以及人类COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液、鼻拭子和尸检肺组织 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康与SARS-CoV-2感染的仓鼠肺组织，配合多个人类COVID-19数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2025-01-15 |
Single-cell transcriptomics reveals antigen-presenting capacity and therapeutic resistance potential of immunomodulatory endothelial cells in colorectal cancer
2024-06, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.1311
PMID:38874280
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了结直肠癌中免疫调节内皮细胞的抗原呈递能力和治疗耐药潜力 | 首次聚焦于免疫调节内皮细胞（IMECs）在肿瘤免疫平衡调节中的作用及其对抗血管生成疗法（AATs）的影响 | 研究主要基于公开数据库的单细胞转录组数据，缺乏实验验证 | 探讨结直肠癌中免疫调节内皮细胞的功能及其对抗血管生成疗法的影响 | 结直肠癌中的免疫调节内皮细胞（IMECs） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于公开数据库的结直肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109916
PMID:38812536
|
研究论文 | 构建了迄今为止最全面的小鼠视网膜单细胞图谱，整合了约33万个细胞的数据 | 创建了最大的小鼠视网膜单细胞RNA测序数据集，首次整合多个数据集构建综合细胞图谱，识别了138种细胞类型 | 仅使用C57BL/6J野生型小鼠，可能不适用于其他品系或疾病模型 | 构建全面的小鼠视网膜单细胞图谱以解决现有数据集的局限性 | C57BL/6J小鼠视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，抗体磁珠分选 | NA | 单细胞基因表达数据 | 约190,000个单细胞（本研究），整合后超过330,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2025-10-07 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-06-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
|
研究论文 | 本研究探讨SOS1和MEK抑制剂联合治疗对KRASG12D胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及免疫治疗响应改善机制 | 首次揭示SOS1i+MEKi联合治疗通过调节iCAF和髓系细胞导致免疫抑制微环境，并提出CD40激动剂联合检查点阻断的新策略 | 研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索KRAS靶向治疗对肿瘤微环境的影响及改善免疫治疗响应的组合策略 | KRASG12D/p53突变小鼠胰腺导管腺癌细胞系(KPCY)及荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KPCY细胞系及荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2025-10-07 |
Flow Cytometry Analysis of Microglial Phenotypes in the Murine Brain During Aging and Disease
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5018
PMID:38948260
|
研究论文 | 开发了一种优化的流式细胞术方案，用于区分小鼠脑组织中四种不同的小胶质细胞表型 | 建立了无需细胞分选、成像或单细胞RNA测序就能区分四种小胶质细胞表型的流式细胞术方案，具有成本低、通量高的优势 | 该方法依赖于前期单细胞RNA测序研究确定的基因标记，可能需要特定多色检测能力的细胞分析仪 | 开发一种区分小胶质细胞表型的标准化流程 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞 | 免疫学 | 神经退行性疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据 | NA | Cytek | 流式细胞术 | Cytek Aurora | Cytek Aurora 5激光光谱流式细胞仪 |
| 175 | 2024-12-21 |
Proteomic, single-cell and bulk transcriptomic analysis of plasma and tumor tissues unveil core proteins in response to anti-PD-L1 immunotherapy in triple negative breast cancer
2024-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108537
PMID:38744008
|
研究论文 | 本文通过蛋白质组学、单细胞和批量转录组学分析，揭示了三阴性乳腺癌患者在接受抗PD-L1免疫治疗后核心蛋白质的变化 | 构建了一个有效的血浆蛋白质组模型，用于预测免疫治疗的反应，并发现FAP+和COMP+成纤维细胞可能是逆转免疫治疗抵抗的潜在靶点 | 需要进一步验证和扩展样本量以确认研究结果的普遍性和可靠性 | 揭示三阴性乳腺癌患者对免疫治疗的反应机制，并开发预测模型 | 三阴性乳腺癌患者的血浆和肿瘤组织样本 | 蛋白质组学 | 乳腺癌 | TMT质谱分析、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 随机森林模型 | 蛋白质组数据、转录组数据 | 来自三阴性乳腺癌患者的预处理和后处理血浆样本，以及公开的肺癌和黑色素瘤的蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-12-21 |
K-nearest-neighbors induced topological PCA for single cell RNA-sequence data analysis
2024-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108497
PMID:38678944
|
研究论文 | 本文提出了一种基于k近邻拓扑的PCA方法，用于单细胞RNA测序数据分析 | 本文创新性地结合了持久拉普拉斯技术和L范数正则化，提出了一种拓扑主成分分析（tPCA）方法，并通过引入k近邻持久拉普拉斯技术（kNN-PL）进一步提升了方法的鲁棒性 | 本文未提及具体的局限性 | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的多尺度多类别异质性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | PCA | 基因表达数据 | 11个不同的单细胞RNA测序基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-12-21 |
ISMI-VAE: A deep learning model for classifying disease cells using gene expression and SNV data
2024-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108485
PMID:38653063
|
研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器（VAE）的深度学习模型ISMI-VAE，用于整合和分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核苷酸变异（SNV）数据，以分类疾病细胞 | ISMI-VAE通过引入注意力机制来反映特征重要性，并分析潜在的致病基因特征，同时利用深度学习技术整合多模态数据并映射到低维空间 | NA | 开发一种能够有效整合和分析单细胞RNA测序和单核苷酸变异数据的方法，以提高疾病细胞分类的准确性和可解释性 | 单细胞RNA测序和单核苷酸变异数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 基因表达数据和SNV数据 | 三个癌症数据集和一个COVID-19数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-12-19 |
A single-cell sequence analysis of mouse subcutaneous white adipose tissue reveals dynamic changes during weaning
2024-06-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06448-3
PMID:38951550
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和其他分子及组织学检测方法，全面比较了小鼠皮下白色脂肪组织在出生后7天到断奶后7天的动态变化 | 首次详细描述了断奶期间小鼠皮下白色脂肪组织中前脂肪细胞的发育轨迹，并揭示了具有米色潜能的前脂肪细胞的转化过程，同时发现了断奶期特有的免疫细胞及其对前脂肪细胞的潜在调控作用 | 研究仅限于小鼠皮下白色脂肪组织，且样本量较小，可能无法完全代表所有脂肪组织的发育变化 | 探讨断奶期间小鼠皮下白色脂肪组织的发育重塑过程及其潜在调控机制 | 小鼠皮下白色脂肪组织在出生后7天到断奶后7天的动态变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮下白色脂肪组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-12-19 |
Single-cell transcriptional profiling of clear cell renal cell carcinoma reveals a tumor-associated endothelial tip cell phenotype
2024-06-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06478-x
PMID:38942917
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境，揭示了肿瘤相关内皮尖端细胞表型 | 发现了与上皮-间质转化相关的未被描述的血管亚群，并揭示了肿瘤血管与基质细胞在肿瘤微环境中对免疫细胞的抑制性相互作用 | 研究主要集中在单细胞RNA测序数据的分析，未涉及实验验证 | 探讨透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境特征及其与疾病进展和治疗反应的关系 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境，包括血管和免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 50,236个来自配对肿瘤和健康邻近肾组织的转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-12-19 |
Regulation of endocrine cell alternative splicing revealed by single-cell RNA sequencing in type 2 diabetes pathogenesis
2024-06-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06475-0
PMID:38937540
|
研究论文 | 本研究通过重新分析已存档的全长单细胞RNA测序数据，探讨了在非糖尿病（ND）和2型糖尿病（T2D）个体中，人类胰腺内分泌细胞类型的可变剪接（AS）调控机制 | 首次揭示了在糖尿病进展过程中，胰腺胰岛细胞的可变剪接对β细胞功能障碍的影响，并提出了通过调控可变剪接来调节β细胞功能的机制 | 研究依赖于已存档的数据，可能无法涵盖所有可能的变异和情况 | 探讨在2型糖尿病病理过程中，胰腺内分泌细胞的可变剪接调控机制 | 人类胰腺内分泌细胞在非糖尿病和2型糖尿病个体中的可变剪接调控 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 非糖尿病和2型糖尿病个体的胰腺内分泌细胞 | NA | NA | NA | NA |