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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-07 |
Hofbauer cells and fetal brain microglia share transcriptional profiles and responses to maternal diet-induced obesity
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114326
PMID:38848212
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了母体饮食诱导肥胖模型中胎儿脑小胶质细胞与胎盘霍夫bauer细胞具有共同的转录特征 | 首次证实胎儿脑小胶质细胞与胎盘霍夫bauer细胞具有共同起源和相似的转录程序,并提出霍夫bauer细胞可作为胎儿脑小胶质细胞编程的非侵入性生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型,虽然与人类数据集比较显示保守性,但需要进一步临床验证 | 探索母体肥胖对胎儿免疫细胞编程的影响及其与神经发育障碍的关联 | 小鼠模型中的胎儿脑小胶质细胞和胎盘霍夫bauer细胞 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-10-07 |
The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.026
PMID:38776918
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研究论文 | 本研究揭示了外周CD8+ T细胞耐受检查点触发了一种由蛋白质翻译缺陷定义的独特分化状态 | 首次证明外周耐受触发与耗竭、记忆和功能效应细胞完全不同的分化状态,并发现该状态由蛋白质翻译缺陷维持 | 研究主要关注早期分化阶段(60小时内),长期耐受状态的维持机制需要进一步探索 | 阐明外周CD8 T细胞耐受检查点的分子机制和细胞状态特征 | 外周CD8+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-omics analysis reveals cooperative transcription factors for gene regulation in oligodendrocytes
2024-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.19.599799
PMID:38948852
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学数据识别少突胶质细胞中协同转录因子对基因表达的调控机制 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq数据系统识别少突胶质细胞中协同转录因子,并开发深度学习模型量化TF-TF相互作用对靶基因表达的贡献 | 研究主要基于计算预测,实验验证仅限于部分TF对的共富集分析 | 解析少突胶质细胞中转录因子协同调控基因表达的分子机制 | 少突胶质细胞及其基因调控网络 | 生物信息学 | 脑部疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq, ChIP-seq, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 164 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the altered innate immunity in immune checkpoint inhibitor-related myocarditis
2024-06, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13770
PMID:38425094
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示免疫检查点抑制剂相关心肌炎中先天免疫系统的改变 | 首次构建了ICI相关心肌炎外周血单核细胞的细胞图谱,并发现S100A蛋白家族作为潜在血清标志物 | 样本量较小,仅包含肺鳞状细胞癌患者 | 探究免疫检查点抑制剂相关心肌炎的转录组特征和发病机制 | 肺鳞状细胞癌患者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 4组患者(具体人数未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2025-10-07 |
Early life vaccination reprograms the metabolism and function of myeloid cells in neonates
2024-06, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13772
PMID:38424694
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研究论文 | 本研究揭示早期接种卡介苗通过mTOR/HIF1a信号通路和糖酵解重编程新生儿髓系细胞功能 | 首次发现BCG疫苗接种通过代谢重编程改变新生儿髓系细胞的免疫抑制功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类新生儿中验证 | 探究疫苗接种对新生儿免疫系统发育的影响机制 | 新生小鼠的髓系来源抑制细胞 | 免疫学 | 免疫相关疾病 | 单细胞转录组测序,代谢物分析,功能分析 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | 新生小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2025-10-07 |
Characteristics of splenic PD-1+ γδT cells in Plasmodium yoelii nigeriensis infection
2024-06, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-023-09441-w
PMID:38265549
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研究论文 | 本研究探讨了约氏疟原虫感染小鼠脾脏中表达PD-1的γδT细胞的表型和功能特征及其分子机制 | 首次揭示了RORα通过调控NF-κB信号通路在PD-1+ γδT细胞功能调节中的作用机制 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人体中验证 | 探究PD-1在γδT细胞功能调节中的作用机制 | 约氏疟原虫感染的C57BL/6小鼠脾脏γδT细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 感染约氏疟原虫的小鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-07 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
|
研究论文 | 开发了基于单细胞转录组学的精准医学计算流程PERCEPTION,用于预测患者对治疗的反应和耐药性 | 首次利用匹配的批量和单细胞表达谱构建治疗反应模型,在多个临床队列中优于现有预测方法 | NA | 开发精准医学工具以优化癌症患者的个性化治疗方案 | 癌症患者肿瘤单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤,乳腺癌,肺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算预测模型 | 单细胞转录组数据 | 多个临床队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 168 | 2025-10-07 |
Interstitial macrophages are a focus of viral takeover and inflammation in COVID-19 initiation in human lung
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20232192
PMID:38597954
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析SARS-CoV-2在人类肺组织中的细胞嗜性和转录组效应 | 首次在人类肺组织中重建SARS-CoV-2感染的'感染伪时间'转录程序,发现间质巨噬细胞是病毒主要感染靶点 | 研究基于体外感染的健康人类肺组织,可能与实际体内感染情况存在差异 | 阐明COVID-19肺炎早期发病机制和病毒-宿主相互作用 | 人类肺组织细胞,特别是间质巨噬细胞和肺泡巨噬细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 健康人类肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-07 |
Invasive growth of brain metastases is linked to CHI3L1 release from pSTAT3-positive astrocytes
2024-06-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae013
PMID:38271182
|
研究论文 | 本研究揭示了pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过释放CHI3L1促进脑转移瘤侵袭性生长的机制 | 首次发现pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞通过分泌CHI3L1驱动脑转移瘤的侵袭性生长,并证实STAT3和CHI3L1可作为治疗靶点 | NA | 探究脑转移瘤侵袭模式与pSTAT3阳性反应性星形胶质细胞的关系及其作为STAT3抑制预测生物标志物的潜力 | 人类脑转移瘤样本、患者来源异种移植模型、小鼠模型、脑切片-肿瘤共培养体系 | 肿瘤学 | 脑转移瘤 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、脑切片-肿瘤共培养实验 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-07 |
DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility
2024-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49565-7
PMID:38898078
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制模式的建立机制及其与基因组不稳定性的关联 | 首次证明晚期复制区域在受精后第一个细胞周期就与B区室和核纤层共同建立,且这种模式先于胚胎基因组激活 | 研究主要基于牛和小鼠胚胎,在人类胚胎中的直接证据有限 | 探索哺乳动物发育过程中DNA复制程序的建立时机和机制 | 牛和小鼠的早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | 牛和小鼠早期胚胎单细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 171 | 2025-10-07 |
LMNA -Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-derived iPSC Differentiation Support Cell type and Lineage-specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.12.598335
PMID:38915555
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC进行单细胞转录组测序,探索LMNA相关扩张型心肌病在心肌细胞和心外膜来源细胞中的基因表达和发育失调机制 | 首次在LMNA单倍体不足背景下,通过单细胞转录组测序分析iPSC分化过程中多种细胞类型的基因表达失调,揭示了细胞类型和谱系特异性的发育异常 | 研究方法需要改进以进一步研究iPSC衍生模型中表观遗传和分化机制 | 探索LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 携带LMNA剪接位点突变的患者来源iPSC及其分化细胞 | 单细胞转录组学 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | iPSC分化模型 | 单细胞转录组数据 | 12个样本(4个患者样本,8个对照样本),包含110,521个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2025-10-07 |
ScRNA-Seq Analyses Define the Role of GATA3 in iNKT Cell Effector Lineage Differentiation
2024-06-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13121073
PMID:38920701
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了转录因子GATA-3在调控iNKT细胞效应谱系分化中的关键作用 | 首次系统阐明GATA-3缺失导致iNKT2和iNKT17细胞亚群缺失,并发现Icos表达恢复可挽救iNKT细胞发育 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类iNKT细胞中验证 | 探究GATA-3转录因子对iNKT细胞效应谱系分化的调控机制 | 小鼠胸腺iNKT细胞及其亚群(iNKT1、iNKT2、iNKT17) | 免疫学 | NA | 流式细胞术, 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | GATA-3缺陷型小鼠胸腺iNKT细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-10-07 |
Preliminary Single-Cell RNA-Sequencing Analysis Uncovers Adipocyte Heterogeneity in Lipedema
2024-06-13, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13121028
PMID:38920656
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示脂水肿中脂肪细胞的异质性 | 首次在脂水肿组织中鉴定出三种不同的脂肪细胞亚群 | 初步研究,样本量有限,需要进一步验证 | 探索脂水肿疾病中脂肪细胞的异质性 | 脂水肿患者和健康参与者的脂肪组织样本 | 单细胞组学 | 脂水肿 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 脂水肿患者和健康参与者的脂肪组织样本(具体数量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序技术,使用条形码磁珠进行单细胞捕获 |
| 174 | 2025-10-07 |
Identifying gene expression programs in single-cell RNA-seq data using linear correlation explanation
2024-06, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2024.104644
PMID:38631462
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研究论文 | 本研究开发了一种基于线性相关解释的方法,用于从单细胞RNA测序数据中识别与细胞表型和活性程序相关的基因表达程序 | 采用总相关优化函数和迁移学习方法,能够同时识别细胞类型特异性基因表达程序和与生物过程及刺激响应相关的程序 | 方法在模拟数据和有限真实数据集上验证,需要更广泛的应用验证 | 从单细胞RNA测序数据中推断具有生物学意义的基因表达程序 | 小鼠齿状回和胚胎结肠发育的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性CorEx(相关解释) | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2025-10-07 |
Patterns of Unwanted Biological and Technical Expression Variation Among 49 Human Tissues
2024-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102069
PMID:38670317
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研究论文 | 本研究利用GTEx数据集分析49种人体组织中基因表达变异的模式和原因 | 对17,282个样本进行大规模表达变异分析,识别出522个变异转录本簇并系统分类其生物学和技术原因 | 仅评估了最可变的前2%转录本,部分变异簇(14%)未能明确归因 | 探究人体组织基因表达中非期望变异的模式和原因 | 49种人体组织的17,282个基因表达样本 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 17,282个样本来自49种人体组织 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2025-10-07 |
Plasmodium infection induces phenotypic, clonal, and spatial diversity among differentiating CD4+ T cells
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114317
PMID:38848213
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了疟原虫感染期间CD4+ T细胞的分化多样性、克隆分布和空间相互作用 | 首次在近单细胞分辨率下绘制了脾脏微环境中CD4+ T细胞的空间分布和细胞间相互作用网络,并发现CCR5在克隆扩增和Th1分化中的新功能 | 研究主要聚焦于脾脏组织,未涉及其他免疫器官;TCR转基因对照模型可能无法完全模拟多克隆T细胞的真实反应 | 阐明疟原虫感染过程中CD4+ T细胞的分化表型、克隆特性和空间定位机制 | 小鼠脾脏中的CD4+ T细胞、单核细胞和基质细胞 | 空间转录组学 | 疟疾 | 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 近单细胞分辨率空间转录组分析 |
| 177 | 2025-10-07 |
Molecular cascade reveals sequential milestones underlying hippocampal neural stem cell development into an adult state
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114339
PMID:38852158
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠海马神经干细胞从发育状态向成年状态转变的分子级联过程 | 首次发现神经干细胞成熟需要经历两个连续步骤:首先进入静息状态,然后进一步成熟,每个步骤都涉及独特的代谢基因表达变化 | 研究仅限于小鼠早期出生后发育阶段,人类或其他物种的适用性尚需验证 | 探索发育期神经干细胞向成年神经干细胞状态转变的过程、里程碑和机制 | 小鼠齿状回神经干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 178 | 2025-10-07 |
Microglia-astrocyte crosstalk in the amyloid plaque niche of an Alzheimer's disease mouse model, as revealed by spatial transcriptomics
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114216
PMID:38819990
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研究论文 | 通过空间转录组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中淀粉样斑块微环境内小胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用 | 首次使用CosMx和Stereo-seq两种高分辨率空间转录组学平台同时分析淀粉样斑块微环境的转录组特征 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明阿尔茨海默病淀粉样斑块微环境中神经胶质细胞的相互作用机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织样本 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | CosMx, Stereo-seq | 空间转录组学 | CosMx, Stereo-seq | 高分辨率空间转录组学平台 |
| 179 | 2025-10-07 |
Interferon-γ induces combined pyroptotic angiopathy and APOL1 expression in human kidney disease
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114310
PMID:38838223
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研究论文 | 本研究揭示了干扰素-γ通过诱导焦亡性血管病变和APOL1表达在人类肾脏疾病中的致病机制 | 首次证明IFN-γ同时诱导内皮细胞损伤和肾脏细胞焦亡,揭示了APOL1介导的塌陷性肾小球病的组合机制 | 研究主要基于体外模型,需要更多体内实验验证 | 探究干扰素信号在肾脏疾病中的直接致病作用 | 人类肾脏类器官、原代内皮细胞和患者样本 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,免疫印迹,定量荧光分析,多组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 人类肾脏类器官、原代内皮细胞和COVID-19、蛋白尿性肾病、塌陷性肾小球病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 180 | 2025-10-07 |
Immunotherapeutic targeting of surfaceome heterogeneity in AML
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114260
PMID:38838225
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研究论文 | 本研究通过分析100例急性髓系白血病样本的表面蛋白质组和单细胞转录组,识别了原始AML细胞优先表达的抗原和标志物 | 首次在100例遗传多样性AML样本中系统分析表面蛋白质组异质性,并在亚群水平评估抗原表达 | 样本量相对有限,需要进一步功能验证 | 识别AML免疫治疗的潜在靶点 | 100例遗传多样性原发性人类AML样本 | 癌症免疫学 | 急性髓系白血病 | 表面蛋白质组分析, 单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 100例原发性人类AML样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 表面蛋白质组学 | NA | NA |