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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals VEGFR as a potential target for CAR-T cell therapy in chordoma
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02635-5
PMID:38605247
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研究论文 | 通过单细胞测序鉴定VEGFR作为脊索瘤CAR-T细胞治疗的潜在靶点 | 首次在脊索瘤中通过单细胞测序鉴定VEGFR作为CAR-T治疗靶点,并开发了同时靶向VEGFR和TGF-β的双功能CAR-T细胞 | 样本量较小(14例),仅进行了体外实验验证 | 寻找脊索瘤免疫治疗新靶点并开发有效CAR-T疗法 | 脊索瘤患者肿瘤样本和CAR-T细胞 | 单细胞测序 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例脊索瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies PLK1 as a driver of immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2024-Jun, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011309
PMID:38885192
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现PLK1是肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境的关键驱动因子 | 首次揭示PLK1通过调控CXCL2细胞因子分泌促进肿瘤相关巨噬细胞M2极化和抑制抗原呈递过程的新机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分 | 探究PLK1在肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌小鼠模型和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing analysis of chronic subdural hematoma cell subpopulations and their potential therapeutic mechanisms
2024-06-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞测序分析慢性硬膜下血肿患者外周血和血肿中的细胞亚群及其潜在治疗机制 | 首次通过单细胞测序对慢性硬膜下血肿手术切除血肿中的细胞进行全面分类,并发现cDC2和M2巨噬细胞在病灶部位的富集与脑损伤相关 | 样本量有限,需要更大规模研究验证细胞亚群比例与疾病复发的相关性 | 分析慢性硬膜下血肿细胞亚群组成及其与疾病发生发展的关系 | 慢性硬膜下血肿患者的外周血和手术切除的血肿组织 | 单细胞测序分析 | 慢性硬膜下血肿 | 单细胞测序 | UMAP降维聚类分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2025-10-07 |
TNFR1-mediated senescence and lack of TNFR2-signaling limit human intervertebral disc cell repair in back pain conditions
2024-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.22.581620
PMID:38948728
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研究论文 | 本研究揭示了TNFα受体在椎间盘退变疼痛中限制修复的不同作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现促炎细胞因子主要由小群巨噬细胞表达,并阐明TNFR1介导的衰老和TNFR2信号缺失共同限制椎间盘细胞修复 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 | 探究椎间盘退变疼痛中修复受限的分子机制 | 人类椎间盘退变组织及人纤维环细胞 | 单细胞生物学 | 椎间盘退变疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类椎间盘退变组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-07 |
Hierarchically Assembled Nanofiber Scaffold Guides Long Bone Regeneration by Promoting Osteogenic/Chondrogenic Differentiation of Endogenous Mesenchymal Stem Cells
2024-06, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202309868
PMID:38259052
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研究论文 | 开发三维垂直排列纳米纤维支架促进内源性间充质干细胞成骨/成软骨分化以引导长骨再生 | 首创具有长通道和大孔径的三维垂直排列纳米纤维支架,能够从骨髓腔招募BMSCs并促进其向软骨细胞和成骨细胞分化 | 未明确说明样本数量和研究持续时间,缺乏与其他先进支架材料的直接对比 | 开发新型纳米纤维支架促进临界尺寸节段性长骨缺损的再生修复 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)和长骨缺损模型 | 组织工程 | 骨缺损 | 单细胞测序,免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据,组织染色图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-07 |
iIMPACT: integrating image and molecular profiles for spatial transcriptomics analysis
2024-06-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03289-5
PMID:38844966
|
研究论文 | 开发了一种整合组织图像和分子谱的多阶段统计方法iIMPACT,用于空间转录组学数据分析 | 首次将AI重建的组织图像与基因表达空间背景相结合定义空间区域,克服了现有方法仅依赖分子信息的局限 | NA | 提高空间转录组学数据聚类分析的准确性和可解释性 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | 多阶段统计方法 | 组织图像、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 147 | 2025-10-07 |
FGF receptors mediate cellular senescence in the cystic fibrosis airway epithelium
2024-Jun-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174888
PMID:38916962
|
研究论文 | 本研究揭示了FGF受体通过MAPK p38信号通路介导囊性纤维化气道上皮细胞衰老的机制 | 首次发现FGFR4和FGFR1在CF气道上皮细胞衰老中的关键作用,并证明抑制FGFR可改善黏液纤毛清除功能 | 研究主要基于体外和动物模型,需要进一步临床验证 | 探究囊性纤维化气道上皮细胞衰老的分子机制及潜在治疗策略 | 非CF和CF供体的人原代支气管上皮细胞、CF支气管上皮细胞系、Cftr基因敲除大鼠 | 单细胞测序 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 非CF和CF供体的人原代支气管上皮细胞、CF细胞系、Cftr-/-大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2025-10-07 |
Conditional deletion of miR-204 and miR-211 in murine retinal pigment epithelium results in retinal degeneration
2024-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107344
PMID:38705389
|
研究论文 | 通过条件性敲除小鼠视网膜色素上皮中的miR-204和miR-211,研究其对视网膜结构和功能的影响 | 首次在成年小鼠中实现视网膜色素上皮特异性条件性敲除miR-204/211家族,并揭示其在维持视网膜功能中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 评估miR-204和miR-211在成熟小鼠眼睛中的功能作用 | 条件性敲除miR-204/211的小鼠视网膜色素上皮和视网膜组织 | 分子生物学 | 视网膜变性 | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序,光学相干断层扫描,免疫染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,成像数据,组织学数据 | 两组条件性KO小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-07 |
Emerging measurements for tumor-infiltrating lymphocytes in breast cancer
2024-Jun-01, Japanese journal of clinical oncology
IF:1.9Q3
DOI:10.1093/jjco/hyae033
PMID:38521965
|
综述 | 本文概述了乳腺癌中肿瘤浸润淋巴细胞的评估方法及其临床意义 | 系统总结了从传统病理学方法到人工智能、单细胞分析等新兴技术在肿瘤浸润淋巴细胞评估中的应用 | 作为综述文章,未涉及原始研究数据和分析 | 探讨乳腺癌肿瘤浸润淋巴细胞的评估方法和技术进展 | 乳腺癌肿瘤微环境中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学、流式细胞术、多组学分析、单细胞分析、空间转录组学 | 人工智能 | 组织图像、分子数据 | NA | NA | 单细胞分析、空间转录组学、多组学分析 | NA | NA |
| 150 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics unravels palmitoylation and zonation-dependent gene regulation by AEG-1 in mouse liver
2024-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107322
PMID:38677511
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示AEG-1蛋白棕榈酰化修饰及肝脏分区对基因调控的影响 | 首次结合空间转录组学技术解析AEG-1棕榈酰化修饰在肝脏分区特异性基因调控中的作用机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明棕榈酰化如何影响AEG-1介导的基因调控与肝脏分区的关系 | AEG-1-WT和AEG-1-C75S基因敲入小鼠的肝脏组织 | 空间转录组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和肝细胞癌 | 空间转录组学 | 基因敲入小鼠模型 | 空间转录组数据 | AEG-1-WT和AEG-1-C75S同窝小鼠肝脏样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 151 | 2025-03-20 |
Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in the Study of Central Nervous System Diseases
2024-Jun, Cell biochemistry and biophysics
IF:1.8Q4
DOI:10.1007/s12013-023-01207-3
PMID:38133792
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术及其在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 单细胞测序技术能够对混合细胞群体中的单个细胞进行精确分析,并从中枢神经系统的不同空间位置、时间阶段和细胞类型中收集细胞,从而发现与特定疾病相关的细胞亚群及其相关基因 | NA | 探索单细胞测序技术在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 中枢神经系统中的细胞,包括神经元和胶质细胞(如星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞) | 生物信息学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-07 |
Prediction of cell-cell communication patterns of dorsal root ganglion cells: single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.384067
PMID:37905887
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2025-10-07 |
Loss of cell junctional components and matrix alterations drive cell desquamation and fibrotic changes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.17.599411
PMID:38948715
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析,揭示了特发性肺纤维化中上皮细胞脱落与细胞连接成分丢失及基底膜基质失调的关联机制 | 首次在IPF中发现上皮细胞脱落现象,并通过空间多组学技术揭示了细胞连接成分下调与基质失调导致上皮脱落的分子机制 | 研究样本量有限,主要关注远端细支气管,未全面评估其他肺区域的变化 | 探究特发性肺纤维化中远端细支气管上皮细胞脱落的分子机制 | 特发性肺纤维化患者和无肺病史患者的远端细支气管上皮细胞及基底膜 | 空间生物学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 功能实验 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | IPF患者和无肺病史患者(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-07 |
Human inherited PD-L1 deficiency is clinically and immunologically less severe than PD-1 deficiency
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231704
PMID:38634869
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研究论文 | 比较遗传性PD-L1缺陷与PD-1缺陷在临床和免疫学表现上的差异 | 首次发现人类遗传性PD-L1缺陷的临床表现比PD-1缺陷更轻微 | 仅研究两个家系病例,样本量有限 | 探究PD-1/PD-L1通路在自身免疫疾病中的作用机制 | 遗传性PD-L1缺陷的兄弟姐妹患者 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫表型分析 | NA | 基因测序数据, 转录组数据, 免疫表型数据 | 2例PD-L1缺陷患者,与先前报道的2例PD-1缺陷患者对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-07 |
[Explorations about the correlation between biological changes of meninges in periodontitis mice and cognitive impairment via single-cell RNA sequencing]
2024-Jun-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牙周炎小鼠脑膜的生物学变化,探讨其与认知障碍的潜在关联 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统分析牙周炎小鼠脑膜的细胞组成和基因表达变化,揭示脑膜免疫与屏障功能在牙周炎相关认知障碍中的作用 | 样本量有限(30只小鼠),仅使用C57BL/6小鼠品系,未涉及其他动物模型或人类样本验证 | 阐明牙周炎小鼠脑膜生物学变化与认知障碍之间的相关性 | C57BL/6小鼠(实验组15只,对照组15只) | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,实时荧光定量PCR,免疫组织化学,基因本体富集分析,KEGG通路分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,行为学数据,分子生物学数据 | 30只C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 156 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine
2024-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601271
PMID:38979337
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析预测了缺血损伤肠道中急性上皮修复的新型潜在调节因子 | 首次在猪模型中识别出表达细胞迁移转录途径的修复性肠细胞亚群,并预测CSF-1作为年龄依赖性修复反应的上游调节因子 | 研究基于猪模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探索年龄依赖性肠道屏障修复的分子机制,寻找改善新生儿肠道损伤预后的潜在治疗靶点 | 幼猪和新生猪的肠道黏膜上皮细胞,猪肠道上皮细胞系IPEC-J2 | 单细胞转录组学 | 肠道缺血损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 猪肠道黏膜上皮细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 157 | 2025-10-07 |
Elevated phagocytic capacity directs innate spinal cord repair
2024-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.11.598515
PMID:38915507
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研究论文 | 本研究通过比较斑马鱼和哺乳动物脊髓损伤后的免疫反应,揭示了高吞噬能力在脊髓先天修复中的核心作用 | 发现斑马鱼巨噬细胞具有高吞噬能力并促进脊髓再生,鉴定出关键基因,并证明人类同源基因可加速损伤修复 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的直接应用效果需进一步验证 | 探究脊髓损伤后免疫细胞在组织修复中的作用机制 | 斑马鱼和哺乳动物的巨噬细胞 | 发育生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序,基因敲除,细胞移植 | NA | 基因表达数据,功能实验数据 | 斑马鱼脊髓损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-07 |
Defining the Regulatory Logic of Breast Cancer Using Single-Cell Epigenetic and Transcriptome Profiling
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598858
PMID:38948758
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研究论文 | 通过单细胞表观遗传和转录组分析揭示乳腺癌的调控逻辑 | 开发了使用线性混合效应模型系统量化染色质可及性区域与基因表达关联的新方法,并发现正常细胞中基因表达沉默子转变为癌细胞中增强子的调控元件 | 研究样本仅限于手术切除后立即处理的人类乳腺肿瘤和健康乳腺组织 | 解析乳腺癌细胞的转录失调调控机制 | 人类乳腺肿瘤、健康乳腺组织和乳腺癌细胞系 | 单细胞多组学 | 乳腺癌 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 线性混合效应模型 | 表观遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 159 | 2025-10-07 |
Unveiling inflammatory and prehypertrophic cell populations as key contributors to knee cartilage degeneration in osteoarthritis using multi-omics data integration
2024-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224420
PMID:38325908
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学整合分析揭示膝关节骨关节炎中炎症和前肥大细胞群对软骨退变的关键作用 | 发现两个新的软骨细胞群体(preInfC和InfC),揭示MIF-CD74信号通路激活,并确定preHTC和HTC为OA关键细胞群 | 样本量相对有限(8例OA供体和3例非OA对照),需要更大规模研究验证 | 解析人类膝关节软骨细胞异质性并识别骨关节炎关键细胞群体 | 人类膝关节软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学染色, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 全基因组关联研究数据 | 11名供体(8例OA,3例对照)共19个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2025-10-07 |
Disease activity drives divergent epigenetic and transcriptomic reprogramming of monocyte subpopulations in systemic lupus erythematosus
2024-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225433
PMID:38413168
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研究论文 | 本研究探讨系统性红斑狼疮中疾病活动度对单核细胞亚群表观遗传和转录组重编程的影响 | 首次整合DNA甲基化组、转录组和单细胞转录组学数据,揭示SLE疾病活动度驱动单核细胞亚群特异性表观遗传和转录组重编程 | 样本量相对有限,仅包含SLE患者和健康供体的单核细胞分析 | 研究系统性红斑狼疮中单核细胞亚群的表观遗传和转录组特征与疾病活动度和进展的关系 | 系统性红斑狼疮患者和健康供体的经典、中间和非经典单核细胞亚群 | 表观遗传学 | 系统性红斑狼疮 | DNA甲基化组测序,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 表观遗传数据,转录组数据,单细胞转录组数据 | SLE患者(首次和随访访视)和健康供体的单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,DNA甲基化测序 | NA | NA |