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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-06 |
Identification and Analysis of Biomarkers Associated with Lipophagy and Therapeutic Agents for COVID-19
2024-06-07, Viruses
DOI:10.3390/v16060923
PMID:38932215
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定与脂噬相关的COVID-19生物标志物和潜在治疗药物 | 首次系统研究脂噬相关基因在COVID-19中的作用,并发现7个脂噬相关基因作为生物标志物和药物靶点 | 基于生物信息学分析的预测结果需要实验验证 | 研究脂噬相关生物标志物和基于脂噬的COVID-19治疗药物 | COVID-19患者基因表达数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习 | 随机森林,支持向量机,广义线性模型,极限梯度提升 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE145926,GSE183533,GSE190496) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression
2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England)
DOI:10.1186/s13014-024-02472-z
PMID:38926892
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了辐射后皮肤中成纤维细胞亚群的变化和小窝蛋白表达变异 | 首次在辐射诱导纤维化中识别出成纤维细胞亚群的转录特征差异,并发现Cav1和Cav2的拮抗表达模式 | 样本量较小(仅6例患者),且仅针对女性乳腺癌患者 | 探索辐射诱导皮肤纤维化的细胞机制 | 接受放射治疗的乳腺癌患者的配对辐照和非辐照皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,生物力学测试 | Seurat聚类分析,SingleR分类器 | 单细胞转录组数据,组织学图像,生物力学数据 | 6例女性患者的配对皮肤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞平台 |
| 143 | 2025-10-06 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (Class, Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2024-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.29.596006
PMID:38854132
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组测序技术,通过265个蛋白质编码基因进行系统基因组分析,揭示了该属中至少存在9个隐存种 | 样本仅来自韩国和美国地区,可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫的25个物种群体(代表6个形态种) | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 多物种溯祖模型 | 转录组数据 | 25个物种群体,37个种群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2025-10-07 |
Transcriptional control of the Cryptosporidium life cycle
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07466-1
PMID:38811723
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示隐孢子虫完整生命周期的基因表达程序 | 推翻现有模型,仅识别出三种细胞内阶段;发现Myb-M转录因子是雄性命运的最早决定因素 | 研究主要基于体外培养和感染动物模型,人类直接应用需进一步验证 | 解析隐孢子虫生命周期分子机制以推动疫苗和治疗开发 | 微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum) | 单细胞生物学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 体外培养和感染动物样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-05-08 |
Senescence of human pancreatic beta cells enhances functional maturation through chromatin reorganization and promotes interferon responsiveness
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae313
PMID:38682582
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研究论文 | 研究人类胰腺β细胞的衰老如何通过染色质重组增强功能成熟并促进干扰素反应性 | 揭示了p16阳性β细胞的衰老状态如何通过染色质重组激活功能成熟基因的增强子,从而增强胰岛素分泌能力,并首次发现这些细胞中干扰素刺激基因的升高 | 研究主要基于体外培养的β样细胞和单细胞转录组数据,未在体内模型中验证这些发现 | 探究人类胰腺β细胞衰老对其功能成熟和干扰素反应性的影响 | 人类胰腺β细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 成人人类胰腺β细胞的单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2025-05-08 |
Cabergoline targets multiple pathways to inhibit PRL secretion and increases stromal fibrosis
2024-Jun-05, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvae055
PMID:38781434
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析卡麦角林治疗和未治疗的泌乳素瘤的细胞组成和转录景观,揭示卡麦角林抑制PRL分泌及增加间质纤维化的多途径机制 | 首次描述了卡麦角林治疗后CD8+ T细胞的未知激活,这可能在其抗肿瘤作用中发挥作用 | 样本量较小(仅5例手术切除的泌乳素瘤) | 揭示多巴胺激动剂治疗在人类泌乳素瘤肿瘤及邻近间质和免疫细胞中的潜在机制 | 3例卡麦角林治疗患者和2例未治疗患者的5例手术切除泌乳素瘤 | 单细胞转录组学 | 泌乳素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 5例手术切除的泌乳素瘤(3例治疗,2例未治疗) | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2025-10-07 |
The predictive value of E2F7 in immunotherapy efficacy for lung adenocarcinoma: An observational study
2024-Jun-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000038574
PMID:38905387
|
研究论文 | 本研究探讨E2F7在肺腺癌免疫治疗疗效中的预测价值 | 首次系统评估E2F7表达与肺腺癌免疫治疗反应的关系,并揭示其通过影响髓系细胞功能发挥免疫抑制作用的机制 | 观察性研究设计,需要进一步实验验证机制 | 探索E2F7作为肺腺癌免疫治疗反应生物标志物的潜力 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,临床数据 | 基于癌症基因组图谱和基因表达综合数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-07 |
A Regularized Bayesian Dirichlet-multinomial Regression Model for Integrating Single-cell-level Omics and Patient-level Clinical Study Data
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597391
PMID:38895417
|
研究论文 | 提出一种正则化贝叶斯狄利克雷-多项回归框架,用于整合单细胞RNA测序数据与患者临床数据 | 采用新型分层树结构在不同细胞类型水平识别关联关系 | NA | 研究单细胞水平组学数据与患者水平临床数据之间的关系 | 肺纤维化、COVID-19和非小细胞肺癌患者 | 生物信息学 | 肺纤维化,COVID-19,非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | 正则化贝叶斯狄利克雷-多项回归模型 | 单细胞组学数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2025-10-07 |
Large-scale neurophysiology and single-cell profiling in human neuroscience
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07405-0
PMID:38898291
|
观点文章 | 本文探讨了大规模神经生理学和单细胞分析技术在人类神经科学研究中的整合应用与发展前景 | 提出了将功能映射的人类脑组织样本进行体外培养并进行多模态细胞和功能分析的工作流程 | NA | 为人类神经科学研究提供统一框架,探索大脑网络水平活动的细胞基础 | 人类脑组织样本 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,神经电生理记录 | NA | 神经电生理数据,基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,神经电生理记录 | Neuropixels | NA |
| 150 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatially resolved interactomics of tooth-associated keratinocytes in periodontitis
2024-Jun-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49037-y
PMID:38876998
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研究论文 | 通过单细胞和空间分辨率互作组学研究牙周炎中牙齿相关角质形成细胞的作用 | 构建了人类牙周组织的综合单细胞RNA测序图谱,揭示了牙周炎中沟内和结合上皮角质形成细胞的差异化状态及与细菌的细胞特异性趋向性 | 需要进一步研究以支持慢性炎症状态下的精准牙周干预 | 研究牙周炎中牙周微环境细胞类型与微生物的关系 | 人类牙周组织中的沟内和结合上皮角质形成细胞(SK/JKs) | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞宏基因组学, 荧光原位杂交, 多重免疫荧光 | 细胞-细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 34个样本, 105,918个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-07 |
SUB1 promotes colorectal cancer metastasis by activating NF-κB signaling via UBR5-mediated ubiquitination of UBXN1
2024-06, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2429-5
PMID:38240906
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研究论文 | 本研究揭示转录共激活因子SUB1通过UBR5介导的UBXN1泛素化激活NF-κB信号通路,从而促进结直肠癌转移的分子机制 | 首次发现SUB1通过调控UBR5介导的Lys11连接多聚泛素化降解NF-κB负调控因子UBXN1,激活NF-κB信号通路驱动结直肠癌转移 | NA | 探究SUB1在结直肠癌转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-07 |
Highly Multiplexed Spatial Transcriptomics in Bacteria
2024-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.27.601034
PMID:38979245
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研究论文 | 开发了一种名为bacterial-MERFISH的空间转录组学方法,用于在细菌中实现高通量、空间分辨的转录组分析 | 将1000倍体积膨胀与MERFISH技术结合,克服了细菌mRNA密度高的技术障碍 | NA | 研究细菌在复杂环境中的单细胞决策行为 | 细菌 | 空间转录组学 | NA | 多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | bacterial-MERFISH(结合体积膨胀和MERFISH技术) |
| 153 | 2025-10-07 |
TNBC response to paclitaxel phenocopies interferon response which reveals cell cycle-associated resistance mechanisms
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.596911
PMID:38895265
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研究论文 | 本研究通过实验与计算相结合的方法揭示了三阴性乳腺癌细胞对紫杉醇的响应机制,发现其表型复制干扰素响应并识别出ELF3作为潜在的紫杉醇耐药生物标志物 | 首次发现紫杉醇治疗诱导的转录程序与干扰素响应高度相似,并通过单细胞RNA测序结合活细胞成像技术鉴定出ELF3等转录因子在细胞周期调控和紫杉醇耐药中的关键作用 | 研究主要基于体外细胞模型,临床样本验证有限,需要进一步体内实验和临床试验确认ELF3作为生物标志物的可靠性 | 探索三阴性乳腺癌细胞对紫杉醇治疗的分子响应机制,识别耐药相关因子 | 三阴性乳腺癌细胞系 | 计算生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,siRNA敲低,活细胞成像,转录因子富集分析 | NA | 单细胞转录组数据,公共患者数据,活细胞成像数据 | 未明确样本数量,使用TNBC细胞系和公共乳腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 154 | 2025-10-07 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveals heterogeneity of serine-glycine-one-carbon metabolism with distinct prognoses and therapeutic vulnerabilities in HNSCC
2024-06-17, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00310-2
PMID:38886346
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析揭示头颈鳞状细胞癌中丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢异质性及其与预后和治疗脆弱性的关联 | 首次在HNSCC中系统揭示SGOC代谢异质性,构建4-SGOC基因预后特征,并鉴定IMPDH1作为潜在代谢治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步实验验证代谢通路的直接功能 | 解析HNSCC代谢异质性以推进精准肿瘤治疗 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,批量转录组分析,LASSO-COX回归分析 | 预后特征模型 | RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals VEGFR as a potential target for CAR-T cell therapy in chordoma
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02635-5
PMID:38605247
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研究论文 | 通过单细胞测序鉴定VEGFR作为脊索瘤CAR-T细胞治疗的潜在靶点 | 首次在脊索瘤中通过单细胞测序鉴定VEGFR作为CAR-T治疗靶点,并开发了同时靶向VEGFR和TGF-β的双功能CAR-T细胞 | 样本量较小(14例),仅进行了体外实验验证 | 寻找脊索瘤免疫治疗新靶点并开发有效CAR-T疗法 | 脊索瘤患者肿瘤样本和CAR-T细胞 | 单细胞测序 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例脊索瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies PLK1 as a driver of immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2024-Jun, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011309
PMID:38885192
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现PLK1是肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境的关键驱动因子 | 首次揭示PLK1通过调控CXCL2细胞因子分泌促进肿瘤相关巨噬细胞M2极化和抑制抗原呈递过程的新机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分 | 探究PLK1在肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌小鼠模型和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing analysis of chronic subdural hematoma cell subpopulations and their potential therapeutic mechanisms
2024-06-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析慢性硬膜下血肿患者外周血和血肿中的细胞亚群及其潜在治疗机制 | 首次通过单细胞测序对慢性硬膜下血肿手术切除血肿中的细胞进行全面分类,并发现cDC2和M2巨噬细胞在病灶部位的富集与脑损伤相关 | 样本量有限,需要更大规模研究验证细胞亚群比例与疾病复发的相关性 | 分析慢性硬膜下血肿细胞亚群组成及其与疾病发生发展的关系 | 慢性硬膜下血肿患者的外周血和手术切除的血肿组织 | 单细胞测序分析 | 慢性硬膜下血肿 | 单细胞测序 | UMAP降维聚类分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-07 |
TNFR1-mediated senescence and lack of TNFR2-signaling limit human intervertebral disc cell repair in back pain conditions
2024-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.22.581620
PMID:38948728
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研究论文 | 本研究揭示了TNFα受体在椎间盘退变疼痛中限制修复的不同作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现促炎细胞因子主要由小群巨噬细胞表达,并阐明TNFR1介导的衰老和TNFR2信号缺失共同限制椎间盘细胞修复 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 | 探究椎间盘退变疼痛中修复受限的分子机制 | 人类椎间盘退变组织及人纤维环细胞 | 单细胞生物学 | 椎间盘退变疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类椎间盘退变组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 159 | 2025-10-07 |
Hierarchically Assembled Nanofiber Scaffold Guides Long Bone Regeneration by Promoting Osteogenic/Chondrogenic Differentiation of Endogenous Mesenchymal Stem Cells
2024-06, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202309868
PMID:38259052
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研究论文 | 开发三维垂直排列纳米纤维支架促进内源性间充质干细胞成骨/成软骨分化以引导长骨再生 | 首创具有长通道和大孔径的三维垂直排列纳米纤维支架,能够从骨髓腔招募BMSCs并促进其向软骨细胞和成骨细胞分化 | 未明确说明样本数量和研究持续时间,缺乏与其他先进支架材料的直接对比 | 开发新型纳米纤维支架促进临界尺寸节段性长骨缺损的再生修复 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)和长骨缺损模型 | 组织工程 | 骨缺损 | 单细胞测序,免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据,组织染色图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-07 |
Conditional deletion of miR-204 and miR-211 in murine retinal pigment epithelium results in retinal degeneration
2024-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107344
PMID:38705389
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研究论文 | 通过条件性敲除小鼠视网膜色素上皮中的miR-204和miR-211,研究其对视网膜结构和功能的影响 | 首次在成年小鼠中实现视网膜色素上皮特异性条件性敲除miR-204/211家族,并揭示其在维持视网膜功能中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 评估miR-204和miR-211在成熟小鼠眼睛中的功能作用 | 条件性敲除miR-204/211的小鼠视网膜色素上皮和视网膜组织 | 分子生物学 | 视网膜变性 | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序,光学相干断层扫描,免疫染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,成像数据,组织学数据 | 两组条件性KO小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |