单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 543 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
Unique challenges and best practices for single cell transcriptomic analysis in toxicology
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100475
PMID:38645720
|
综述 | 探讨毒理学中单细胞转录组学应用的独特挑战及最佳分析实践 | 系统阐述毒理学领域单细胞转录组分析的特有挑战并提出针对性解决方案 | NA | 提升单细胞转录组学在毒理学研究中的应用效果 | 毒理学研究中的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
Endothelial Cell Flow-Mediated Quiescence Is Temporally Regulated and Utilizes the Cell Cycle Inhibitor p27
2024-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320671
PMID:38602102
|
研究论文 | 本研究揭示了血流介导的内皮细胞静息状态具有时间调节特性，并发现细胞周期抑制剂p27在此过程中起关键作用 | 首次发现内皮细胞静息深度具有时间动态调节特性，并阐明p27通过HES1和ID3转录调控介导不同静息状态转换的机制 | 研究主要基于体外流动模型和模式生物，在人类生理环境中的验证仍需进一步研究 | 探究血流介导的内皮细胞静息状态的建立和维持机制 | 人原代内皮细胞、小鼠和斑马鱼内皮细胞 | 细胞生物学 | 血管功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因表达调控、体内细胞行为分析 | NA | 基因表达数据、细胞行为数据 | 原代内皮细胞、小鼠和斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
Performing Suction Blister Skin Biopsies
2024-Jun, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.1073
PMID:38924322
|
研究论文 | 介绍一种替代传统皮肤活检的微创无疤痕皮肤采样方法——吸疱皮肤活检技术 | 提出使用负压和温和加热诱导吸疱的微创皮肤采样方法，无需麻醉且不留永久疤痕 | NA | 开发改进的皮肤组织采样技术 | 人体皮肤组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞培养 | NA | 细胞,蛋白质,代谢物 | 每个活检部位最多产生5个直径10mm的水疱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice
2024-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320800
PMID:38695167
|
研究论文 | 本研究探讨IL-1β抑制对饮食诱导动脉粥样硬化消退的负面影响 | 首次揭示IL-1β在维持动脉粥样硬化斑块稳定性中的关键保护作用 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中进行验证 | 探究降脂治疗中IL-1β对晚期动脉粥样硬化斑块组成和稳定性的调控机制 | Apoe-/-基因敲除小鼠的动脉粥样硬化病变 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,飞行时间细胞术,免疫染色,共聚焦显微镜 | 小鼠动脉粥样硬化模型 | 基因表达数据,图像数据 | Apoe-/-小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-06 |
Cellular-resolution gene expression mapping reveals organization in the head ganglia of the gastropod, Berghia stephanieae
2024-06, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25628
PMID:38852042
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和原位杂交链式反应技术，揭示了裸鳃类动物Berghia stephanieae头部神经节的细胞类型分子标记和空间组织 | 首次在裸鳃类动物中结合高通量单细胞RNA测序和原位杂交技术，识别并可视化神经元和胶质细胞的分子标记，揭示了神经节内和神经节间新的离散区域 | 研究仅针对特定物种Berghia stephanieae，结果可能无法直接推广到其他腹足类动物 | 建立腹足类动物神经系统的基本细胞组织结构与功能关系 | 裸鳃类动物Berghia stephanieae的头部神经节细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交链式反应 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-10-06 |
Knocking down of Xkr8 enhances chemotherapy efficacy through modulating tumor immune microenvironment
2024-Jun, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.04.041
PMID:38685385
|
研究论文 | 本研究通过敲低Xkr8基因增强化疗效果并调节肿瘤免疫微环境 | 首次在临床相关原位模型中评估Xkr8敲低联合化疗策略，并通过单细胞RNA测序阐明其作用机制 | 研究仅使用胰腺肿瘤模型，尚未在其他癌症类型中验证 | 评估Xkr8敲低联合化疗的抗肿瘤免疫反应增强效果 | 胰腺肿瘤模型中的肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低技术 | 原位肿瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-10-06 |
Neutrophil-derived PAD4 induces citrullination of CKMT1 exacerbates mucosal inflammation in inflammatory bowel disease
2024-Jun, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01158-6
PMID:38720063
|
研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞来源的PAD4通过瓜氨酸化CKMT1加剧炎症性肠病黏膜炎症的分子机制 | 首次发现PAD4通过细胞外囊泡进入肠上皮细胞并瓜氨酸化CKMT1，破坏线粒体稳态和肠道屏障功能 | 研究主要基于DSS诱导的小鼠结肠炎模型，临床样本验证有限 | 阐明PAD4在炎症性肠病中的具体作用机制 | 小鼠结肠炎模型和IBD患者样本 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，底物瓜氨酸化定位分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据 | DSS诱导结肠炎小鼠模型和IBD患者临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-06 |
Esm-1 mediates transcriptional polarization associated with diabetic kidney disease
2024-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00419.2023
PMID:38601985
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了Esm-1在糖尿病肾病中作为肾小球转录极化的标志物 | 首次在单细胞水平系统表征Esm-1在糖尿病肾病中的表达模式及其与肾小球转录极化的关联 | 主要依赖公共数据库数据，样本量有限，需要进一步实验验证机制 | 探究Esm-1在糖尿病肾病发病机制中的作用 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序，RNAscope，批量转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 27,786个肾脏内皮细胞（来自3个小鼠和4个人类数据库），20名健康受试者和41名糖尿病肾病患者 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-06 |
Inter- and trans-generational impacts of environmental exposures on the germline resolved at the single-cell level
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100465
PMID:38586548
|
综述 | 探讨单细胞技术如何促进生殖毒理学研究，解析环境暴露对生殖细胞的跨代影响 | 整合单细胞多组学技术研究环境暴露对生殖细胞的跨代影响，提供细胞类型特异性响应分析 | 主要基于模式生物研究，人类生殖细胞研究存在技术挑战 | 推进生殖毒理学研究，解析环境因素对生殖细胞功能的影响机制 | 生殖细胞、模式生物（斑马鱼和小鼠） | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序、ATAC测序、多组学分析 | NA | 单细胞转录组、表观基因组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-06 |
Network-based prioritization and validation of regulators of vascular smooth muscle cell proliferation in disease
2024-06, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00474-4
PMID:39215134
|
研究论文 | 通过构建基因调控网络识别并验证血管平滑肌细胞增殖的关键调控因子 | 首次结合单细胞转录组和表观遗传分析揭示VSMC增殖的调控机制，发现RUNX1和TIMP1-CD74轴等新调控因子 | 研究主要基于计算分析和体外验证，需要进一步体内实验确认临床转化潜力 | 阐明血管疾病中血管平滑肌细胞增殖的分子调控机制 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,表观遗传分析 | 基因调控网络,计算机扰动分析 | 单细胞RNA测序数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
Multiscale topology classifies cells in subcellular spatial transcriptomics
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07563-1
PMID:38898271
|
研究论文 | 提出一种多尺度拓扑方法，在亚细胞空间转录组学中自动分类细胞类型 | 首次开发直接利用亚细胞分辨率空间转录组数据进行细胞类型识别的方法，无需依赖图像数据 | 方法在新平台上的泛化能力需要进一步验证 | 开发空间转录组学中的细胞类型自动分类方法 | 人类肾脏组织和狼疮肾炎小鼠模型的免疫细胞 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学，多参数持续同调 | 多尺度拓扑方法 | 空间转录组数据 | 人类肾脏组织和小鼠模型样本 | NA | 靶向和全转录组空间转录组学 | NA | 亚细胞分辨率空间转录组平台 |
| 112 | 2025-10-06 |
Apolipoprotein E controls Dectin-1-dependent development of monocyte-derived alveolar macrophages upon pulmonary β-glucan-induced inflammatory adaptation
2024-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01830-z
PMID:38671323
|
研究论文 | 本研究揭示了载脂蛋白E通过调控Dectin-1信号通路在肺部β-葡聚糖诱导炎症适应过程中促进单核细胞源性肺泡巨噬细胞发育的新机制 | 首次发现ApoE信号调控单核细胞向肺泡巨噬细胞分化的新机制，并鉴定出具有独特表型和功能的ApoECD11b肺泡巨噬细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证；机制研究仍存在未明确的信号通路细节 | 探究肺部巨噬细胞在环境刺激下的功能与发育适应性机制 | 小鼠肺部巨噬细胞，特别是单核细胞源性肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 肺部感染，肺纤维化 | 单细胞转录组测序，高维成像，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，图像数据，细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
Bacterial single-cell RNA sequencing captures biofilm transcriptional heterogeneity and differential responses to immune pressure
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601229
PMID:38979200
|
研究论文 | 开发了一种优化的细菌单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，用于研究生物膜生长过程中的转录异质性及免疫细胞暴露后的转录适应性 | 首次开发了适用于细菌的单细胞RNA测序方法BaSSSh-seq，能够捕获生物膜内广泛的转录异质性并分析不同免疫细胞群的特异性反应 | 方法验证主要集中于生物膜与浮游生长的比较，尚未在其他细菌系统或更复杂环境中广泛测试 | 研究细菌生物膜的转录异质性及其对免疫压力的差异反应 | 细菌生物膜中的亚群细胞 | 单细胞测序技术 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | BaSSSh-seq | 优化的细菌单细胞RNA测序平台 |
| 114 | 2025-10-06 |
Identification and Analysis of Biomarkers Associated with Lipophagy and Therapeutic Agents for COVID-19
2024-06-07, Viruses
DOI:10.3390/v16060923
PMID:38932215
|
研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定与脂噬相关的COVID-19生物标志物和潜在治疗药物 | 首次系统研究脂噬相关基因在COVID-19中的作用，并发现7个脂噬相关基因作为生物标志物和药物靶点 | 基于生物信息学分析的预测结果需要实验验证 | 研究脂噬相关生物标志物和基于脂噬的COVID-19治疗药物 | COVID-19患者基因表达数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，机器学习 | 随机森林，支持向量机，广义线性模型，极限梯度提升 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集（GSE145926，GSE183533，GSE190496） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression
2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England)
DOI:10.1186/s13014-024-02472-z
PMID:38926892
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了辐射后皮肤中成纤维细胞亚群的变化和小窝蛋白表达变异 | 首次在辐射诱导纤维化中识别出成纤维细胞亚群的转录特征差异，并发现Cav1和Cav2的拮抗表达模式 | 样本量较小（仅6例患者），且仅针对女性乳腺癌患者 | 探索辐射诱导皮肤纤维化的细胞机制 | 接受放射治疗的乳腺癌患者的配对辐照和非辐照皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，生物力学测试 | Seurat聚类分析，SingleR分类器 | 单细胞转录组数据，组织学图像，生物力学数据 | 6例女性患者的配对皮肤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞平台 |
| 116 | 2025-10-06 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (Class, Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2024-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.29.596006
PMID:38854132
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组测序技术，通过265个蛋白质编码基因进行系统基因组分析，揭示了该属中至少存在9个隐存种 | 样本仅来自韩国和美国地区，可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫的25个物种群体（代表6个形态种） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 多物种溯祖模型 | 转录组数据 | 25个物种群体，37个种群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-07 |
Transcriptional control of the Cryptosporidium life cycle
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07466-1
PMID:38811723
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示隐孢子虫完整生命周期的基因表达程序 | 推翻现有模型，仅识别出三种细胞内阶段；发现Myb-M转录因子是雄性命运的最早决定因素 | 研究主要基于体外培养和感染动物模型，人类直接应用需进一步验证 | 解析隐孢子虫生命周期分子机制以推动疫苗和治疗开发 | 微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum) | 单细胞生物学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 体外培养和感染动物样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-05-08 |
Senescence of human pancreatic beta cells enhances functional maturation through chromatin reorganization and promotes interferon responsiveness
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae313
PMID:38682582
|
研究论文 | 研究人类胰腺β细胞的衰老如何通过染色质重组增强功能成熟并促进干扰素反应性 | 揭示了p16阳性β细胞的衰老状态如何通过染色质重组激活功能成熟基因的增强子，从而增强胰岛素分泌能力，并首次发现这些细胞中干扰素刺激基因的升高 | 研究主要基于体外培养的β样细胞和单细胞转录组数据，未在体内模型中验证这些发现 | 探究人类胰腺β细胞衰老对其功能成熟和干扰素反应性的影响 | 人类胰腺β细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 成人人类胰腺β细胞的单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2025-05-08 |
Cabergoline targets multiple pathways to inhibit PRL secretion and increases stromal fibrosis
2024-Jun-05, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvae055
PMID:38781434
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析卡麦角林治疗和未治疗的泌乳素瘤的细胞组成和转录景观，揭示卡麦角林抑制PRL分泌及增加间质纤维化的多途径机制 | 首次描述了卡麦角林治疗后CD8+ T细胞的未知激活，这可能在其抗肿瘤作用中发挥作用 | 样本量较小（仅5例手术切除的泌乳素瘤） | 揭示多巴胺激动剂治疗在人类泌乳素瘤肿瘤及邻近间质和免疫细胞中的潜在机制 | 3例卡麦角林治疗患者和2例未治疗患者的5例手术切除泌乳素瘤 | 单细胞转录组学 | 泌乳素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 5例手术切除的泌乳素瘤（3例治疗，2例未治疗） | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2025-10-07 |
The predictive value of E2F7 in immunotherapy efficacy for lung adenocarcinoma: An observational study
2024-Jun-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000038574
PMID:38905387
|
研究论文 | 本研究探讨E2F7在肺腺癌免疫治疗疗效中的预测价值 | 首次系统评估E2F7表达与肺腺癌免疫治疗反应的关系，并揭示其通过影响髓系细胞功能发挥免疫抑制作用的机制 | 观察性研究设计，需要进一步实验验证机制 | 探索E2F7作为肺腺癌免疫治疗反应生物标志物的潜力 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据，临床数据 | 基于癌症基因组图谱和基因表达综合数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |