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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2025-10-06
Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1
2024-06-21, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究验证了CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴成像生物标志物的潜力 首次将CMKLR1确定为单核细胞源性巨噬细胞的瞬时标志物,并开发了CMKLR1靶向PET成像技术用于肺部炎症和纤维化的无创评估 研究主要基于小鼠模型,临床验证仍需进一步开展 开发用于纤维化肺疾病风险分层和治疗监测的可靠生物标志物 特发性肺纤维化患者和小鼠肺纤维化模型 数字病理 肺纤维化 单细胞RNA测序,正电子发射断层扫描 NA 基因表达数据,影像数据 特发性肺纤维化患者队列和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
82 2025-10-06
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2024-06-21, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 构建了跨物种三叉神经节和背根神经节的统一细胞图谱,促进不同物种和研究间的细胞类型比较 创建了首个涵盖6个物种、31个数据集的统一感觉神经节细胞图谱,改进了稀疏神经元亚型的注释 研究主要基于转录组数据,可能未完全捕捉蛋白质水平和功能特性的差异 比较不同物种感觉神经节的细胞类型多样性并建立统一注释标准 三叉神经节和背根神经节的感觉神经元和非神经元细胞 单细胞转录组学 神经系统疾病 单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA RNA测序数据 6个物种、31个数据集 NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA NA
83 2025-10-06
Integration mapping of cardiac fibroblast single-cell transcriptomes elucidates cellular principles of fibrosis in diverse pathologies
2024-06-21, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过整合单细胞转录组数据构建心脏纤维化的综合参考图谱 建立了首个全面的心脏纤维化单细胞转录组整合图谱,揭示了不同病理模型中成纤维细胞的相似性动态变化 NA 阐明不同病理条件下心脏纤维化的细胞学原理 心脏成纤维细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠和人类健康及患病心脏样本 NA single-cell RNA-seq NA NA
84 2025-10-06
APOE Christchurch enhances a disease-associated microglial response to plaque but suppresses response to tau pathology
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨APOE Christchurch突变在不同阿尔茨海默病小鼠模型中对小胶质细胞反应的调节作用 首次系统研究APOE Christchurch突变在淀粉样斑块和tau蛋白病变两种不同病理模型中的差异性调节作用 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;样本量相对有限 阐明APOE Christchurch突变对阿尔茨海默病病理发展的保护机制 携带ApoeCh突变的5xFAD淀粉样病变小鼠模型和PS19 tau病变小鼠模型 神经科学 阿尔茨海默病 免疫组织化学分析、生化分析、单细胞空间转录组学、蛋白质组学 小鼠疾病模型 图像数据、转录组数据、蛋白质组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞空间转录组学、蛋白质组学 NA NA
85 2025-10-06
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
综述 本文总结了2023年EMBO研讨会关于发育代谢领域的关键讨论,重点探讨了该领域面临的挑战与新兴机遇 强调了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等技术革命为发育代谢研究带来的全新探索维度 NA 探讨发育代谢领域的历史障碍和新兴机遇 细胞特异性代谢网络、组织间代谢通讯、基因-代谢物时空相互作用 发育生物学 NA 代谢组学, 小分子传感器, 单细胞RNA测序, 计算建模 计算模型 代谢数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
86 2025-10-06
Somatic mutations associate with clonal expansion of CD8+ T cells
2024-06-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过分析90名血液和免疫疾病患者的CD4和CD8 T细胞,揭示了体细胞突变与CD8+T细胞克隆扩增的关联 首次在非恶性T细胞中系统研究体细胞突变谱,发现CD8+T细胞突变负荷更高且非同义突变具有非随机性特征 样本仅来自血液和免疫疾病患者,未包含健康对照组 探究体细胞突变在T细胞中的分布特征及其与克隆扩增的关系 90名血液和免疫疾病患者的CD4和CD8 T细胞 免疫基因组学 血液和免疫疾病 T细胞受体测序, 单细胞测序 NA 基因组测序数据, 单细胞测序数据 90名患者 NA 单细胞测序 NA NA
87 2025-10-06
Gene regulatory landscape of cerebral cortex folding
2024-06-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究揭示了大脑皮层折叠的基因调控机制,通过表征雪貂大脑发育过程中的基因表达和表观遗传动态 首次揭示了H3K27ac表观遗传景观在定义大脑皮层折叠模式中的关键作用,并证明通过操纵转录因子表达可改变皮层折叠模式 研究仅限于雪貂模型,未在其他哺乳动物中进行验证 探索大脑皮层折叠模式的基因调控机制 雪貂大脑皮层发育过程中的基因表达和表观遗传变化 发育神经生物学 神经系统发育障碍 单细胞RNA测序,H3K27ac染色质免疫沉淀 NA 基因表达数据,表观遗传数据 雪貂胚胎发育不同阶段的脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2025-10-06
Gene representation bias in spatial transcriptomics
2024-06, Journal of bioinformatics and computational biology IF:0.9Q4
研究论文 本研究通过比较Visium空间转录组和bulk RNA-seq数据,识别在Visium中频繁低检测的基因并探索其潜在机制 首次系统性地发现空间转录组数据中存在基因表示偏倚,并揭示poly(T)基序可能通过形成发夹结构影响mRNA捕获效率 样本量相对有限(28个人类样本和19个小鼠样本),需要更多实验验证poly(T)基序形成发夹结构的假设 识别空间转录组数据中频繁低检测的基因并探究其潜在分子机制 人类和小鼠组织样本 空间转录组学 NA 空间转录组测序,bulk RNA-seq,基序分析 NA 基因-点计数矩阵,序列数据 28个人类样本和19个小鼠样本,涵盖多种组织来源 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium空间转录组技术
89 2025-10-06
NDMNN: A novel deep residual network based MNN method to remove batch effects from scRNA-seq data
2024-06, Journal of bioinformatics and computational biology IF:0.9Q4
研究论文 提出一种基于深度残差网络的NDMNN方法,用于消除单细胞RNA测序数据中的批次效应 将密集深度残差网络(NDnetwork)与MNN方法相结合,设计出新的批次效应校正方法 NA 开发更有效的单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度残差网络 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
90 2025-10-06
Circulating KLRG1+ long-lived effector memory T cells retain the flexibility to become tissue resident
2024-06-28, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究揭示KLRG1+长效效应记忆T细胞在继发感染时能进入非淋巴组织并建立组织驻留记忆 发现长效效应细胞虽不能分化为其他循环记忆亚群,但仍保留进入组织建立驻留记忆的灵活性 研究主要基于小鼠病毒感染模型,人类相关性需进一步验证 探究KLRG1+记忆T细胞在继发感染中的分化潜力和组织驻留能力 小鼠感染模型中的KLRG1+ CD8 T细胞 免疫学 病毒感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
91 2025-10-06
Glutamatergic neuronal activity regulates angiogenesis and blood-retinal barrier maturation via Norrin/β-catenin signaling
2024-Jun-19, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了谷氨酸能神经元活动通过调节内皮细胞Norrin/β-catenin信号通路调控视网膜血管生成和血-视网膜屏障成熟的新机制 首次发现谷氨酸能神经元活动通过Norrin/β-catenin信号通路调控视网膜深层血管丛生成和血-视网膜屏障成熟 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类视网膜中验证 探究谷氨酸能神经元活动如何调控视网膜血管生成和血-视网膜屏障成熟 小鼠视网膜的神经元-血管相互作用 神经血管生物学 视网膜血管疾病 单细胞RNA测序, 体内遗传学研究, 功能验证 基因修饰小鼠模型(Vglut1和Gnat1) 基因表达数据, 功能表型数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
92 2025-10-06
3D reconstruction of the mouse cochlea from scRNA-seq data suggests morphogen-based principles in apex-to-base specification
2024-06-17, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过分析小鼠耳蜗单细胞RNA测序数据,重建了耳蜗三维结构并揭示了形态发生素在耳蜗顶-基轴特异性形成中的机制 首次从单细胞RNA测序数据重建小鼠耳蜗三维结构,发现视黄酸和hedgehog通路形成相反的顶-基轴梯度并共同调控耳蜗纵向轴特化 研究仅基于E12.5和E14.5两个时间点的数据,未覆盖耳蜗发育全过程 探索小鼠耳蜗顶-基轴特异性基因表达的分子调控机制 小鼠耳蜗发育过程中的细胞 单细胞转录组学 听觉系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 E12.5和E14.5两个发育时间点的小鼠耳蜗细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
93 2025-10-06
Target-Oriented Reference Construction for supervised cell-type identification in scRNA-seq
2024-Jun-26, Research square
研究论文 开发了一种用于单细胞RNA测序监督细胞类型识别的目标导向参考构建方法 首次提出针对目标数据集选择和构建参考数据的方法,缓解参考数据与目标数据之间数据分布和细胞类型组成的差异 NA 提高单细胞RNA测序数据中监督细胞类型识别的准确性 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 模拟数据和真实数据分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
94 2025-10-06
Single-Cell Analysis Uncovers Striking Cellular Heterogeneity of Lung-Infiltrating Regulatory T Cells during Eosinophilic versus Neutrophilic Allergic Airway Inflammation
2024-Jun-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了嗜酸性粒细胞与中性粒细胞过敏性气道炎症中肺部浸润调节性T细胞的显著异质性 首次发现不同类型过敏性气道炎症会塑造表型不同的肺部常驻调节性T细胞,揭示了炎症信号通过组织适应机制塑造浸润Treg组成的新机制 Treg特异性ST2缺陷不影响嗜酸性过敏性炎症的发展或肺部常驻Treg的生成,具体调控机制仍需进一步研究 探究不同类型过敏性气道炎症对肺部浸润调节性T细胞异质性和组织驻留特性的影响 小鼠肺部浸润的Foxp3+调节性T细胞 单细胞生物学 过敏性气道炎症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 嗜酸性和中性粒细胞过敏性气道炎症模型中的肺部浸润Treg细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
95 2025-10-06
An inducible genetic tool to track and manipulate specific microglial states reveals their plasticity and roles in remyelination
2024-06-11, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 开发了一种可诱导的遗传工具Clec7a-CreER,用于追踪和操纵特定小胶质细胞状态,揭示其可塑性及在髓鞘再生中的作用 创建了首个特异性靶向PAMs和DAMs小胶质细胞状态的可诱导Cre驱动工具,首次直接证明了小胶质细胞状态的可塑性及其在疾病恢复中的功能 未明确说明样本规模和技术重复次数,疾病模型范围有限 研究小胶质细胞状态的可塑性及其在神经系统发育和疾病中的功能 大脑实质中的增殖区域相关小胶质细胞(PAMs)和疾病相关小胶质细胞(DAMs) 神经科学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序,遗传谱系追踪,细胞特异性消融 遗传工程小鼠模型 基因表达数据,细胞追踪数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2025-10-06
Olfactory neuroblastoma mimics molecular heterogeneity and lineage trajectories of small-cell lung cancer
2024-Jun-10, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究通过建立遗传工程小鼠模型,揭示了嗅觉神经母细胞瘤与正常嗅觉上皮发育轨迹相似的细胞命运异质性,及其与小细胞肺癌在分子特征上的保守相似性 首次建立高级别转移性嗅觉神经母细胞瘤小鼠模型,发现其细胞命运异质性模拟正常球状基底细胞发育轨迹,并揭示与小细胞肺癌相似的分子异质性特征 研究基于小鼠模型,人类肿瘤的验证仍需进一步临床研究 探究嗅觉神经母细胞瘤的细胞起源和分子异质性特征 嗅觉神经母细胞瘤小鼠模型和人类肿瘤样本 癌症生物学 嗅觉神经母细胞瘤 单细胞转录组测序,基于条形码的谱系追踪 遗传工程小鼠模型 转录组数据 小鼠模型和人类肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
97 2025-10-06
Sample collection protocol for single-cell RNA sequencing of functionally identified neuronal populations in vivo
2024-06-21, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 介绍一种在体功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序样本收集协议 结合病毒传递的活性依赖性标记工具(CaMPARI2)和虚拟现实环境,实现在体功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序 NA 开发功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序样本收集方法 小鼠神经元群体 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选(FACS) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
98 2025-10-06
Protocol to detect immune levels, abnormal metabolism, and signaling pathways in tumor tissue based on scRNA-seq obtained from patient databases
2024-06-21, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 基于GEO数据库的单细胞测序数据开发检测肿瘤组织中免疫水平、异常代谢和信号通路的分析流程 整合肿瘤免疫微环境评估、肿瘤纯度分析和异常信号通路识别的一体化分析方案 依赖公开数据库数据,缺乏实验验证 建立肿瘤组织免疫状态和代谢异常的检测方法 肿瘤组织单细胞测序数据 生物信息学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2025-10-06
Protocol for high-quality single-cell RNA-seq from tissue sections with DRaqL
2024-06-21, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 介绍一种从组织切片中获取高质量单细胞RNA测序的DRaqL协议 将DRaqL与Smart-seq2结合,实现从酒精固定小鼠卵巢切片中获取高质量单细胞RNA测序数据,并提供福尔马林固定切片的可选方案 NA 开发高质量单细胞RNA测序实验方案 小鼠卵巢组织切片 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序,激光捕获显微切割 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA DRaqL-Smart-seq2,DRaqL-Protease-Smart-seq2
100 2025-10-06
Protocol for preparing formalin-fixed paraffin-embedded musculoskeletal tissue samples from mice for spatial transcriptomics
2024-06-21, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文提供了一种用于小鼠骨组织和多组织肌肉骨骼FFPE样本的空间转录组学实验方案 开发了专门针对矿化组织脱钙的FFPE样本空间转录组学完整流程 实验周期较长(约18天),其中超过50%时间用于矿化组织脱钙 建立肌肉骨骼FFPE样本的空间转录组学标准化实验流程 小鼠股骨及相邻肌肉组织的FFPE样本 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 测序数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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