单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 563 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-10-20 |
Circulating KLRG1+ long-lived effector memory T cells retain the flexibility to become tissue resident
2024-Jun-28, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adj8356
PMID:38941479
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研究论文 | 研究了KLRG1+长寿命效应记忆T细胞在病毒感染后进入非淋巴组织并建立驻留的能力 | 发现KLRG1+长寿命效应记忆T细胞虽然不能分化为其他循环记忆细胞，但仍能进入组织并建立驻留 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 探讨KLRG1+长寿命效应记忆T细胞在病毒感染后的行为和功能 | KLRG1+长寿命效应记忆T细胞及其在病毒感染后的组织驻留能力 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 82 | 2024-10-17 |
KRT17high/CXCL8+ Tumor Cells Display Both Classical and Basal Features and Regulate Myeloid Infiltration in the Pancreatic Cancer Microenvironment
2024-Jun-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-1421
PMID:37851080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析胰腺导管腺癌样本，发现并表征了一种具有中间特征的KRT17high/CXCL8+癌细胞亚型，该亚型在肿瘤微环境和系统性免疫中影响髓系细胞 | 本文首次发现并表征了KRT17high/CXCL8+癌细胞亚型，该亚型兼具经典和基底特征，并能影响肿瘤微环境和系统性免疫中的髓系细胞 | 本文主要基于单细胞RNA测序数据和患者来源的胰腺癌类器官进行研究，未来需要更多临床数据验证其发现 | 表征胰腺导管腺癌中一种新的中间癌细胞亚型，并研究其在肿瘤微环境和系统性免疫中的作用 | 胰腺导管腺癌中的KRT17high/CXCL8+癌细胞亚型及其对髓系细胞的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 18例人类胰腺导管腺癌样本 |
| 83 | 2024-10-16 |
The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects
2024-Jun-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.026
PMID:38776918
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研究论文 | 研究探讨了外周CD8+ T细胞耐受与其它分化状态之间的关系，发现耐受状态与耗竭、记忆和功能效应细胞有根本性区别 | 首次揭示了外周耐受状态与其它CD8+ T细胞分化状态的本质区别，并阐明了耐受状态的转录和表观遗传特征 | 研究主要集中在体外实验和模型系统，需要进一步验证在人体内的适用性 | 探讨外周CD8+ T细胞耐受状态与其他分化状态的关系 | CD8+ T细胞的耐受状态 | 免疫学 | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序、染色质可及性分析 | NA | RNA | NA |
| 84 | 2024-10-16 |
Patterns of Unwanted Biological and Technical Expression Variation Among 49 Human Tissues
2024-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102069
PMID:38670317
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研究论文 | 研究分析了49种人体组织中基因表达的生物和技术变异模式 | 首次大规模分析了Genotype-Tissue Expression数据集中17,282个样本的表达变异模式，并结合组织学和元数据进行了详细分类 | 研究主要集中在基因表达变异的识别和分类，未深入探讨这些变异对生物学结论的具体影响 | 探讨和分类基因表达研究中的生物和技术变异来源，以提高数据分析的准确性 | 49种人体组织的基因表达变异模式 | 基因表达分析 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 17,282个样本 |
| 85 | 2024-10-14 |
Olfactory neuroblastoma mimics molecular heterogeneity and lineage trajectories of small-cell lung cancer
2024-Jun-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.05.003
PMID:38788720
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研究论文 | 研究嗅神经母细胞瘤（ONB）的分子异质性和谱系轨迹，发现其与小细胞肺癌（SCLC）有相似之处 | 建立了Rb1/Trp53/Myc（RPM）基因工程小鼠模型，揭示了嗅神经母细胞瘤的细胞起源和谱系异质性 | NA | 探讨嗅神经母细胞瘤的分子特征及其与小细胞肺癌的相似性 | 嗅神经母细胞瘤和小细胞肺癌的分子异质性和谱系轨迹 | 数字病理学 | 嗅神经母细胞瘤 | 基因工程小鼠模型、单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | 小鼠和人类样本 |
| 86 | 2024-10-14 |
Self-regulating CAR-T cells modulate cytokine release syndrome in adoptive T-cell therapy
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221988
PMID:38607370
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研究论文 | 本文报道了一种自我调节的CAR-T细胞，通过分泌与CRS相关的细胞因子抑制剂来减轻细胞因子释放综合征的严重程度 | 开发了一种自我调节的CAR-T细胞，通过分泌tocilizumab衍生的单链可变片段（Toci）来减少CRS相关毒性，并显示出比传统CAR-T细胞更好的体内抗肿瘤疗效 | NA | 研究如何通过工程化T细胞来自我调节炎症细胞因子的产生，以同时增强CAR-T细胞疗法的安全性和疗效 | 自我调节的CAR-T细胞及其在减轻细胞因子释放综合征和提高抗肿瘤疗效中的作用 | 生物医学工程 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用人源化NSG-SGM3小鼠模型进行研究 |
| 87 | 2024-08-07 |
Prediction of cell-cell communication patterns of dorsal root ganglion cells: single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.384067
PMID:37905887
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-10-12 |
Myelin-associated oligodendrocytic basic protein-dependent myelin repair confers the long-lasting antidepressant effect of ketamine
2024-Jun, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02288-5
PMID:37848708
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研究论文 | 研究探讨了氯胺酮的长期抗抑郁效果与其对髓鞘修复的影响之间的关系 | 首次揭示了髓鞘相关蛋白（Mobp）在氯胺酮长期抗抑郁效果中的关键作用，并发现(R)-氯胺酮比(S)-氯胺酮在髓鞘修复中具有更强的效果 | 研究仅在慢性社会挫败应激的小鼠模型中进行，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨氯胺酮长期抗抑郁效果的机制及其与髓鞘修复的关系 | 小鼠的脑部髓鞘修复及氯胺酮的抗抑郁效果 | NA | NA | 空间转录组学（ST） | NA | 基因表达数据 | 慢性社会挫败应激的小鼠 |
| 89 | 2024-10-12 |
Nature of epigenetic aging from a single-cell perspective
2024-Jun, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00616-0
PMID:38724733
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研究论文 | 本文从单细胞角度研究了表观遗传衰老的本质 | 本文通过对比小鼠组织和单细胞DNA甲基化在早期发育和成年衰老过程中的变化，揭示了表观遗传衰老的协同调控和随机成分，并提出了一个用于识别协同调控和随机CpG簇的单细胞算法 | NA | 阐明表观遗传衰老的本质 | 小鼠的组织和单细胞DNA甲基化 | 表观遗传学 | NA | DNA甲基化分析，单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据，RNA测序数据 | 小鼠样本 |
| 90 | 2024-10-12 |
Analyses of the autism-associated neuroligin-3 R451C mutation in human neurons reveal a gain-of-function synaptic mechanism
2024-Jun, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01834-x
PMID:36280753
|
研究论文 | 研究了与自闭症相关的neuroligin-3 R451C突变在人类神经元中的功能获得性突触机制 | 首次研究了NLGN3 R451C突变对人类神经元的影响，并揭示了其在兴奋性突触传递中的功能获得性增强 | 研究主要集中在体外和移植到小鼠脑内的神经元，缺乏直接的人体研究 | 探讨NLGN3 R451C突变在人类神经元中的突触功能及其对自闭症谱系障碍（ASD）病理生理的影响 | NLGN3 R451C突变和NLGN3敲除的人类神经元 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及NLGN3 R451C突变和NLGN3敲除的人类神经元样本 |
| 91 | 2024-10-10 |
Single-cell dissection of the multicellular ecosystem and molecular features underlying microvascular invasion in HCC
2024-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000673
PMID:37972953
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了肝细胞癌中微血管侵犯的多细胞生态系统和分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了肝细胞癌中微血管侵犯相关的复杂多细胞生态系统和分子特征 | 研究仅限于10个样本，可能无法完全代表所有肝细胞癌病例 | 深入理解肝细胞癌中微血管侵犯的机制，并为临床诊断和治疗策略提供新见解 | 肝细胞癌患者的微血管侵犯（MVI）及其相关的多细胞生态系统和分子特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 46,789个单细胞来自10个样本 |
| 92 | 2024-10-09 |
Spatial transcriptomics unravels palmitoylation and zonation-dependent gene regulation by AEG-1 in mouse liver
2024-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107322
PMID:38677511
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研究论文 | 研究探讨了AEG-1在肥胖诱导的非酒精性脂肪性肝炎（MASH）和肝细胞癌（HCC）中的作用及其通过空间转录组学揭示的区域特异性基因调控机制 | 首次通过空间转录组学技术揭示了AEG-1的棕榈酰化修饰及其在肝脏区域特异性基因调控中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 阐明AEG-1的棕榈酰化修饰如何影响其在肝脏区域特异性基因调控中的作用 | AEG-1-WT和AEG-1-C75S小鼠肝脏 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | AEG-1-WT和AEG-1-C75S小鼠肝脏样本 |
| 93 | 2024-10-09 |
IL-17 signaling in primary sclerosing cholangitis patient-derived organoids
2024-06-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000454
PMID:38829197
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研究论文 | 研究了IL-17信号在原发性硬化性胆管炎患者来源的类器官中的作用 | 首次直接评估了IL-17信号在原发性硬化性胆管炎胆管细胞中的作用 | 未发现调控IL-17通路的罕见变异基因 | 探讨和表征原发性硬化性胆管炎外周胆管细胞类器官对IL-17A刺激的反应 | 原发性硬化性胆管炎患者和非患者来源的胆管细胞类器官 | NA | 原发性硬化性胆管炎 | 转录组学、分泌组分析和基因组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自原发性硬化性胆管炎患者和非患者的胆管细胞类器官 |
| 94 | 2024-10-08 |
Single-cell transcriptomic-informed deconvolution of bulk data identifies immune checkpoint blockade resistance in urothelial cancer
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109928
PMID:38812546
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ProM的方法，通过单细胞转录组数据和批量RNA测序数据的计算反卷积，揭示了尿路上皮癌中免疫检查点抑制剂抵抗的细胞特征 | 提出了ProM方法，通过结合单细胞和批量RNA测序数据，能够更好地分析肿瘤微环境中的细胞类型，并揭示了与免疫检查点抑制剂抵抗相关的预处理细胞特征 | NA | 研究肿瘤微环境中的细胞相互作用及其对治疗反应的影响，特别是免疫检查点抑制剂抵抗的机制 | 尿路上皮癌样本中的单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类尿路上皮癌样本 |
| 95 | 2024-10-08 |
UPK3A+ umbrella cell damage mediated by TLR3-NR2F6 triggers programmed destruction of urothelium in Hunner-type interstitial cystitis/painful bladder syndrome
2024-06, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6275
PMID:38551071
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了Hunner型间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中尿路上皮细胞的异质性和发育轨迹，并提出了针对UPK3A伞细胞损伤的关键信号通路的治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Hunner型间质性膀胱炎中尿路上皮细胞的异质性和发育轨迹，并确定了TLR3-NR2F6轴作为潜在的治疗靶点 | 治疗效果有限，缺乏对特定细胞类型和分子靶点的充分理解 | 揭示Hunner型间质性膀胱炎中尿路上皮细胞的异质性和发育轨迹，并寻找潜在的治疗靶点 | Hunner型间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中的尿路上皮细胞 | NA | 膀胱疼痛综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | HIC膀胱中的尿路上皮细胞 |
| 96 | 2024-10-07 |
Inferring single-cell spatial gene expression with tissue morphology via explainable deep learning
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.12.598686
PMID:38915550
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研究论文 | 开发了一种基于视觉变换器（ViT）的框架SPiRiT，用于推断单细胞空间基因表达，并结合组织形态学信息 | 提出了SPiRiT框架，通过整合交叉验证和模型解释在超参数调优中，显著提高了预测准确性，并揭示了ViT模型用于预测基因表达的高分辨率高关注区域（HAR） | NA | 探索利用组织形态学信息推断单细胞空间基因表达的可行性 | 人类乳腺癌和小鼠幼崽的组织切片 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 视觉变换器（ViT） | 视觉变换器（ViT） | 图像 | 人类乳腺癌和小鼠幼崽的组织切片，评估数据来自Xenium（10x Genomics）数据集 |
| 97 | 2024-10-04 |
Antitumor efficacy and potential mechanism of FAP-targeted radioligand therapy combined with immune checkpoint blockade
2024-Jun-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01853-w
PMID:38825657
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研究论文 | 研究了FAP靶向放射配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及其潜在机制 | 首次展示了Lu-LNC1004与抗PD-L1免疫疗法联合使用在MC38/NIH3T3-FAP肿瘤小鼠模型中的完全肿瘤消除效果，并通过单细胞RNA测序和TCR测序揭示了联合疗法对肿瘤微环境的重新编程 | 初步临床研究样本量较小，需要进一步的大规模临床试验验证 | 探讨FAP靶向放射配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及其机制 | MC38/NIH3T3-FAP和CT26/NIH3T3-FAP肿瘤异种移植小鼠模型及难治性癌症患者 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), TCR测序 | NA | 单细胞RNA, T细胞受体 | MC38/NIH3T3-FAP和CT26/NIH3T3-FAP肿瘤异种移植小鼠模型，以及难治性癌症患者 |
| 98 | 2024-10-04 |
Large-scale neurophysiology and single-cell profiling in human neuroscience
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07405-0
PMID:38898291
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研究论文 | 本文探讨了大规模单单位人类神经生理学、单细胞RNA测序、空间转录组学和长期体外组织培养等技术在人类神经科学中的应用 | 介绍了Neuropixels和近期脑细胞图谱工作的发展，并讨论了这些技术的融合如何进一步研究人类大脑网络级活动的细胞基础 | NA | 旨在为人类神经科学领域提供一个统一的框架，以理解人类大脑的功能细胞结构 | 人类大脑的细胞基础和网络级活动 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、Neuropixels | NA | 单细胞RNA数据、空间转录组数据 | NA |
| 99 | 2024-10-04 |
Integrated analyses reveal the diagnostic and predictive values of COL5A2 and association with immune environment in Crohn's disease
2024-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00276-5
PMID:38789829
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研究论文 | 研究通过综合分析揭示了COL5A2在克罗恩病中的诊断和预测价值及其与免疫环境的关联 | 首次揭示了COL5A2在克罗恩病中的诊断和预测价值，并探讨了其与免疫环境的关联 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探讨克罗恩病中免疫细胞异常及其与COL5A2的关联，以寻找潜在的诊断和预测标志物 | 克罗恩病患者的单细胞和批量RNA测序数据，以及COL5A2的表达和功能 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq），免疫组化（IHC） | NA | RNA | 克罗恩病患者和对照组的RNA测序数据，具体样本数量未明确提及 |
| 100 | 2024-10-02 |
Arrestin beta-2 deficiency exacerbates periodontal inflammation by mediating activating transcription factor 6 activation and abnormal remodelling of the extracellular matrix
2024-06, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13952
PMID:38267365
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研究论文 | 研究了arrestin beta-2 (ARRB2)在牙周炎进展中的具体作用及其机制 | 揭示了ARRB2通过抑制ATF6信号通路介导的细胞外基质重塑对牙周组织的保护作用 | NA | 探讨ARRB2在牙周炎进展中的作用及其机制 | 牙周炎患者和健康对照者的牙周组织 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、实时定量聚合酶链反应、Western blotting、免疫组织化学染色 | NA | RNA | NA |