单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 543 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Uncovers Striking Cellular Heterogeneity of Lung-Infiltrating Regulatory T Cells during Eosinophilic versus Neutrophilic Allergic Airway Inflammation
2024-Jun-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300646
PMID:38647384
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了嗜酸性粒细胞与中性粒细胞过敏性气道炎症中肺部浸润调节性T细胞的显著异质性 | 首次发现不同类型过敏性气道炎症会塑造表型不同的肺部常驻调节性T细胞，揭示了炎症信号通过组织适应机制塑造浸润Treg组成的新机制 | Treg特异性ST2缺陷不影响嗜酸性过敏性炎症的发展或肺部常驻Treg的生成，具体调控机制仍需进一步研究 | 探究不同类型过敏性气道炎症对肺部浸润调节性T细胞异质性和组织驻留特性的影响 | 小鼠肺部浸润的Foxp3+调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 过敏性气道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 嗜酸性和中性粒细胞过敏性气道炎症模型中的肺部浸润Treg细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
An inducible genetic tool to track and manipulate specific microglial states reveals their plasticity and roles in remyelination
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.05.005
PMID:38821054
|
研究论文 | 开发了一种可诱导的遗传工具Clec7a-CreER，用于追踪和操纵特定小胶质细胞状态，揭示其可塑性及在髓鞘再生中的作用 | 创建了首个特异性靶向PAMs和DAMs小胶质细胞状态的可诱导Cre驱动工具，首次直接证明了小胶质细胞状态的可塑性及其在疾病恢复中的功能 | 未明确说明样本规模和技术重复次数，疾病模型范围有限 | 研究小胶质细胞状态的可塑性及其在神经系统发育和疾病中的功能 | 大脑实质中的增殖区域相关小胶质细胞(PAMs)和疾病相关小胶质细胞(DAMs) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，遗传谱系追踪，细胞特异性消融 | 遗传工程小鼠模型 | 基因表达数据，细胞追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Olfactory neuroblastoma mimics molecular heterogeneity and lineage trajectories of small-cell lung cancer
2024-Jun-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.05.003
PMID:38788720
|
研究论文 | 本研究通过建立遗传工程小鼠模型，揭示了嗅觉神经母细胞瘤与正常嗅觉上皮发育轨迹相似的细胞命运异质性，及其与小细胞肺癌在分子特征上的保守相似性 | 首次建立高级别转移性嗅觉神经母细胞瘤小鼠模型，发现其细胞命运异质性模拟正常球状基底细胞发育轨迹，并揭示与小细胞肺癌相似的分子异质性特征 | 研究基于小鼠模型，人类肿瘤的验证仍需进一步临床研究 | 探究嗅觉神经母细胞瘤的细胞起源和分子异质性特征 | 嗅觉神经母细胞瘤小鼠模型和人类肿瘤样本 | 癌症生物学 | 嗅觉神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序,基于条形码的谱系追踪 | 遗传工程小鼠模型 | 转录组数据 | 小鼠模型和人类肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Sample collection protocol for single-cell RNA sequencing of functionally identified neuronal populations in vivo
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103135
PMID:38875113
|
研究论文 | 介绍一种在体功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序样本收集协议 | 结合病毒传递的活性依赖性标记工具(CaMPARI2)和虚拟现实环境，实现在体功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序 | NA | 开发功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序样本收集方法 | 小鼠神经元群体 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Protocol to detect immune levels, abnormal metabolism, and signaling pathways in tumor tissue based on scRNA-seq obtained from patient databases
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103065
PMID:38753488
|
研究论文 | 基于GEO数据库的单细胞测序数据开发检测肿瘤组织中免疫水平、异常代谢和信号通路的分析流程 | 整合肿瘤免疫微环境评估、肿瘤纯度分析和异常信号通路识别的一体化分析方案 | 依赖公开数据库数据，缺乏实验验证 | 建立肿瘤组织免疫状态和代谢异常的检测方法 | 肿瘤组织单细胞测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Protocol for high-quality single-cell RNA-seq from tissue sections with DRaqL
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103050
PMID:38703368
|
研究论文 | 介绍一种从组织切片中获取高质量单细胞RNA测序的DRaqL协议 | 将DRaqL与Smart-seq2结合，实现从酒精固定小鼠卵巢切片中获取高质量单细胞RNA测序数据，并提供福尔马林固定切片的可选方案 | NA | 开发高质量单细胞RNA测序实验方案 | 小鼠卵巢组织切片 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，激光捕获显微切割 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | DRaqL-Smart-seq2，DRaqL-Protease-Smart-seq2 |
| 87 | 2025-10-06 |
Protocol for preparing formalin-fixed paraffin-embedded musculoskeletal tissue samples from mice for spatial transcriptomics
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102986
PMID:38555590
|
研究论文 | 本文提供了一种用于小鼠骨组织和多组织肌肉骨骼FFPE样本的空间转录组学实验方案 | 开发了专门针对矿化组织脱钙的FFPE样本空间转录组学完整流程 | 实验周期较长（约18天），其中超过50%时间用于矿化组织脱钙 | 建立肌肉骨骼FFPE样本的空间转录组学标准化实验流程 | 小鼠股骨及相邻肌肉组织的FFPE样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 测序数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Protocol for quantifying stem-cell-derived cardiomyocyte maturity using transcriptomic entropy score
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103083
PMID:38781077
|
研究论文 | 提出一种基于单细胞RNA测序的转录组熵值评分协议，用于量化干细胞来源的心肌细胞成熟度 | 开发了基于单细胞RNA测序的熵值评分指标来量化心肌细胞成熟度，为评估干细胞分化效率提供了新工具 | 协议依赖于特定的R代码实现，可能需要一定的生物信息学技能 | 建立量化干细胞来源心肌细胞成熟度的标准化方法 | 多能干细胞来源的心肌细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
A deep learning framework for denoising and ordering scRNA-seq data using adversarial autoencoder with dynamic batching
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103067
PMID:38748883
|
研究论文 | 提出一种基于动态批处理对抗自编码器的深度学习框架，用于单细胞RNA测序数据的去噪和排序 | 开发了动态批处理对抗自编码器(DB-AAE)，结合对抗训练和动态批处理技术改进单细胞RNA测序数据的去噪效果 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的技术噪音问题，提高数据质量 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器(AAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Mapping the cellular biogeography of human bone marrow niches using single-cell transcriptomics and proteomic imaging
2024-Jun-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.04.013
PMID:38714197
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和蛋白质组学成像技术绘制人类骨髓微环境的细胞生物地理图谱 | 首次整合单细胞RNA测序和CODEX空间成像技术，系统揭示人类骨髓非造血细胞的异质性及其空间组织模式 | 样本数量有限，主要关注非造血细胞，对某些稀有细胞亚型的覆盖可能不足 | 解析人类骨髓微环境中非造血细胞的异质性和空间分布特征 | 人类骨髓中的非造血细胞和造血细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, CODEX成像 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质空间成像数据 | 82,742个单细胞（29,325个非造血细胞 + 53,417个造血细胞），超过120万个细胞的空间成像 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | CODEX（共检测索引）技术用于空间细胞分析 |
| 91 | 2025-10-06 |
Metabolic regulator ERRγ governs gastric stem cell differentiation into acid-secreting parietal cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.016
PMID:38733994
|
研究论文 | 本研究揭示了代谢调节因子ERRγ在胃干细胞分化为泌酸壁细胞过程中的关键调控作用 | 首次发现ERRγ作为壁细胞分化的关键调节因子，并系统描绘了壁细胞分化的分子、细胞和超微结构阶段 | 研究主要基于小鼠模型和人类胃细胞，临床转化需要进一步验证 | 阐明胃壁细胞分化的分子机制 | 小鼠模型和人类胃细胞 | 细胞生物学 | 胃部疾病 | scRNA-seq, 谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Defining mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived suppressor cells using single-cell transcriptomics
2024-Jun-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.04.026
PMID:38627968
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析间充质干细胞诱导的髓源性抑制细胞特征 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析MSC诱导的MDSCs转录谱，并鉴定CSF-1R作为关键表面标志物 | RELM-γ在MDSCs免疫抑制功能中的具体作用机制尚未明确 | 阐明间充质干细胞诱导髓源性抑制细胞的分子特征和免疫调节功能 | 小鼠骨髓来源的CD11b+Ly6C+免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性葡萄膜视网膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Single-nucleus RNA sequencing demonstrates an autosomal dominant Alzheimer's disease profile and possible mechanisms of disease protection
2024-Jun-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.02.009
PMID:38417436
|
研究论文 | 通过单核RNA测序比较常染色体显性阿尔茨海默病与散发性阿尔茨海默病的细胞类型特异性差异 | 首次在单细胞水平揭示ADAD与散发性AD的转录组差异，发现自噬基因和分子伴侣在ADAD中的特异性激活 | 样本量较小（27例），需要更大规模研究验证发现 | 探索常染色体显性阿尔茨海默病与散发性阿尔茨海默病的分子机制差异 | 人脑组织样本 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 27例病例（包括PSEN1-E280A ADAD携带者、散发性AD患者和对照组） | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics unveil a unique molecular profile of mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived immune suppressor cells
2024-Jun-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.009
PMID:38795702
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
The reparative immunologic consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596699
PMID:38895305
|
研究论文 | 本研究探讨自体造血干细胞移植作为难治性克罗恩病细胞疗法的免疫修复机制 | 首次通过高维细胞表型分析和功能研究揭示干细胞移植通过重建肠道巨噬细胞促进黏膜愈合的机制 | 样本量有限，需要更大规模研究验证HSC异质性对移植结果的影响 | 阐明干细胞移植治疗难治性克罗恩病的免疫修复机制 | 难治性克罗恩病患者的外周血、肠道组织样本和干细胞移植物 | 免疫学 | 克罗恩病 | 质谱流式细胞技术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), T细胞受体(TCR)测序, 流式细胞术 | 异种移植模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 基因组数据 | 难治性克罗恩病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞技术 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids reveal tubular epithelial pathobiology of heterozygous HNF1B-associated dysplastic kidney malformations
2024-06-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.04.011
PMID:38788724
|
研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞衍生的肾脏类器官揭示HNF1B杂合突变导致肾发育不良的肾小管上皮病理机制 | 首次利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建HNF1B杂合突变肾脏类器官模型，发现谷氨酸能信号通路在肾脏发育中的新作用 | 类器官模型可能无法完全模拟体内肾脏发育的复杂性 | 研究HNF1B杂合突变导致肾发育不良的病理机制 | 人类胚胎干细胞和诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 发育生物学 | 肾发育不良 | CRISPR-Cas9基因编辑, RNA测序 | 肾脏类器官模型 | 基因表达数据 | 来自HNF1B相关肾发育不良家族的iPSCs和基因编辑的ESCs | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
The Contribution of Meckel's Cartilage-Derived Type II Collagen-Positive Cells to the Jawbone Development and Repair
2024-Jun-05, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554241259059
PMID:38836522
|
研究论文 | 本研究揭示了源自米克尔软骨的II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复中的关键作用 | 首次发现II型胶原阳性细胞来源于原始米克尔软骨，并在胚胎期和出生后阶段均参与下颌骨成骨过程 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复中的具体作用机制 | 小鼠下颌骨组织 | 发育生物学 | 骨骼发育异常 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，他莫昔芬诱导CreER系统 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 胚胎期10.5天小鼠下颌骨 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
Multi-omic profiling reveals potential biomarkers of hepatocellular carcinoma prognosis and therapy response among mitochondria-associated cell death genes in the context of 3P medicine
2024-Jun, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-024-00362-8
PMID:38841626
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析构建了基于线粒体相关细胞死亡基因的肝细胞癌预后预测模型 | 开发了整合10种机器学习算法和67种组合的共识线粒体细胞死亡指数(MCDI)，首次在3P医学框架下系统评估线粒体细胞死亡基因在肝细胞癌中的预后和治疗反应预测价值 | 需要进一步的大规模临床验证来确认模型的普适性 | 构建肝细胞癌预后和治疗反应预测模型以支持预测性、预防性和个性化医学策略 | 肝细胞癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 多组学分析、RT-qPCR、western blotting、免疫组织化学染色 | 集成机器学习算法 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 训练队列、验证队列和内部临床队列 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
The diversification of methods for studying cell-cell interactions and communication
2024-Jun, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00685-8
PMID:38238518
|
综述 | 本文探讨细胞间相互作用研究方法的最新进展和工具多样化 | 重点关注下一代计算工具的演变，能够处理细胞异质性、空间组织和复杂数据集 | NA | 推动细胞间相互作用和通讯研究的发展 | 细胞间分子相互作用和通讯机制 | 生物信息学 | NA | 转录组学，单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据，单细胞数据，空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
Acquisition of Drug Resistance in Basal Cell Nevus Syndrome Tumors through Basal to Squamous Cell Carcinoma Transition
2024-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.10.040
PMID:38157930
|
研究论文 | 本研究通过多组学和空间转录组学分析，揭示了基底细胞痣综合征肿瘤通过基底细胞向鳞状细胞癌转化获得SMO抑制剂耐药性的机制 | 首次发现Gorlin综合征肿瘤可通过基底细胞向鳞状细胞癌转化获得SMO抑制剂耐药性，并鉴定出PCYT2、ETNK1和磷脂酰乙醇胺生物合成途径作为该耐药性的遗传抑制因子 | 基于单个病例研究，样本量有限，需要更多病例验证 | 探究Gorlin综合征患者长期SMO抑制剂治疗后产生耐药性的分子机制 | 基底细胞痣综合征（Gorlin综合征）患者的SMO抑制剂耐药性肿瘤 | 数字病理学 | 基底细胞癌 | 多组学分析, 空间转录组学, 空间全外显子组基因组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 1例Gorlin综合征患者的耐药性肿瘤 | NA | 空间转录组学, 全外显子组测序 | NA | NA |