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当前共找到 542 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-03-15 |
Pan-Cancer Single-Cell and Spatial-Resolved Profiling Reveals the Immunosuppressive Role of APOE+ Macrophages in Immune Checkpoint Inhibitor Therapy
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401061
PMID:38569519
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组数据，揭示了APOE+巨噬细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的免疫抑制角色，并构建了一个预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序、机器学习及空间转录组技术，系统性地探究了APOE+巨噬细胞在泛癌种ICI治疗中的免疫抑制机制，并开发了基于巨噬细胞特征的预测模型 | 模型验证主要基于回顾性数据，前瞻性临床验证有待加强；机制研究虽结合了体内外实验，但具体信号通路细节仍需进一步阐明 | 探究巨噬细胞异质性对免疫检查点抑制剂治疗响应的影响，并开发预测模型 | 泛癌种患者样本、三阴性乳腺癌患者样本、4T1荷瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 泛癌种（重点关注三阴性乳腺癌） | 单细胞RNA测序，空间转录组技术，多重免疫组化，机器学习 | 机器学习算法（具体未指明，如SVM、随机森林等） | 单细胞RNA测序数据，bulk RNA测序数据，空间转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-03-14 |
Mgp High-Expressing MSCs Orchestrate the Osteoimmune Microenvironment of Collagen/Nanohydroxyapatite-Mediated Bone Regeneration
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308986
PMID:38588510
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了胶原/纳米羟基磷灰石骨修复材料周围骨免疫微环境的细胞图谱，并鉴定了一组高表达基质Gla蛋白（Mgp）的功能性间充质干细胞亚群 | 首次在单细胞水平结合空间转录组学描绘了骨修复材料植入后的骨免疫微环境动态图谱，并鉴定出Mgp高表达间充质干细胞（MgpMSCs）这一关键先驱亚群及其通过Mdk/Lrp1配体-受体对调控巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要聚焦于早期骨再生阶段，长期效应及临床转化潜力仍需进一步验证 | 阐明生物材料介导的骨再生早期阶段中功能性间充质干细胞亚群的作用及其调控骨免疫微环境的分子机制 | 植入胶原/纳米羟基磷灰石骨修复材料后的小鼠骨修复区域细胞 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2026-03-14 |
Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308384
PMID:38634607
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学技术，研究了渗透胁迫对拟南芥根尖发育的影响，并重建了转录调控网络 | 首次在单细胞水平同时捕获基因表达和染色质可及性，并构建了高分辨率的转录调控网络，揭示了渗透胁迫下细胞异质性 | 数据整合仍存在挑战，且样本仅限于拟南芥根尖，可能不适用于其他植物或组织 | 研究渗透胁迫下拟南芥根尖发育的细胞特异性转录调控网络 | 拟南芥根尖细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞多组学（scRNA-seq和scATAC-seq） | 伪时间轨迹分析 | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | 16,670个拟南芥根尖细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-03-06 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2024-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01831-y
PMID:38698087
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了抗原特异性浆细胞前体的发育动态和基因组编程，特别是长寿命骨髓浆细胞的生成机制 | 发现了浆细胞前体的双相生成模式，并识别出一个新的浆细胞过渡状态，该状态依赖于TIGIT的可诱导表达进行克隆扩增 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证，且样本规模可能有限 | 阐明浆细胞前体的发育动力学和基因组编程，特别是长寿命浆细胞的生成机制 | 小鼠模型中的抗原特异性浆细胞前体，包括脾脏和骨髓中的B细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，B细胞抗原受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，B细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-03-02 |
Single-cell signatures identify microenvironment factors in tumors associated with patient outcomes
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100799
PMID:38889686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scBeacon的工具，用于通过整合和聚类多个单细胞RNA测序数据集来推导细胞类型特征，以解卷积批量肿瘤样本中的细胞组成，并在TCGA队列中识别与患者预后相关的肿瘤微环境因素 | 开发了scBeacon工具，通过整合多个scRNA-seq数据集来提取细胞类型特征，用于解卷积无关的批量肿瘤数据集，从而揭示传统癌症分型方法无法识别的内在肿瘤细胞特性 | NA | 识别肿瘤微环境中的细胞和分子特征，以关联患者预后 | 肿瘤及其微环境中的细胞组分 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量肿瘤样本数据 | TCGA队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-03-02 |
Glioblastoma-Infiltrating CD8+ T Cells Are Predominantly a Clonally Expanded GZMK+ Effector Population
2024-Jun-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-0913
PMID:38416133
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了胶质母细胞瘤中浸润的CD8+ T细胞特征，发现其主要是克隆扩增的GZMK+效应T细胞群 | 揭示了胶质母细胞瘤中CD8+ T细胞主要为克隆扩增的GZMK+效应T细胞，而非典型耗竭T细胞，这与其他癌症类型不同 | 样本量较小（仅15例患者），且未涉及长期疗效或治疗干预的验证 | 探究胶质母细胞瘤中肿瘤浸润淋巴细胞的特性，以解释T细胞免疫疗法疗效有限的原因 | 高级别胶质瘤（包括胶质母细胞瘤和IDH突变型4级星形细胞瘤）患者中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、配对V(D)J测序、细胞转录组和表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据、V(D)J序列数据 | 15例高级别胶质瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-03-02 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用现状及其与传统方法的权衡 | 将单细胞RNA测序这一创新技术引入斑马鱼生殖毒理学领域，提供细胞水平的转录组视角 | 单细胞RNA测序在生殖毒理学中仍属未充分利用的技术，且与传统方法存在权衡需考虑 | 探索单细胞RNA测序在生殖毒理学，特别是斑马鱼模型中的应用潜力 | 斑马鱼性腺组织 | 生殖毒理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-02-28 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-06-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，构建了成年雌性埃及伊蚊中肠的细胞图谱 | 首次建立了埃及伊蚊中肠单细胞分离与RNA测序的方案，并系统注释了其细胞类型，为在单细胞水平研究虫媒病毒与中肠的相互作用提供了基础 | 研究未直接应用于病毒-中肠相互作用的实验验证，且为新建立的方法，其广泛适用性有待进一步验证 | 构建埃及伊蚊中肠的单细胞转录组图谱，以支持后续在单细胞水平研究虫媒病毒感染机制 | 成年雌性埃及伊蚊的中肠组织 | 单细胞组学 | 虫媒病毒感染（如登革热、寨卡病毒等） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，研究对象为成年雌性埃及伊蚊中肠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-02-27 |
Single-cell transcriptome atlas of testes from mice with high-fat diets
2024-06-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03435-5
PMID:38834587
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了肥胖和瘦小鼠睾丸中的超过70,000个细胞，以探究高脂饮食诱导的肥胖对非生精细胞和精子发生的影响 | 首次提供了饮食诱导肥胖小鼠睾丸的单细胞RNA-seq数据集，为研究高脂饮食相关的男性生殖损伤提供了创新性见解和方向 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类转化的适用性可能有限，且未详细探讨肥胖影响的具体分子机制 | 探究肥胖对睾丸在分子水平的影响，特别是高脂饮食如何破坏睾丸内的细胞间通讯网络和影响精子发生 | 肥胖和瘦小鼠的睾丸细胞，包括非生精细胞和从精原细胞到精子的所有生精细胞 | 数字病理学 | 肥胖相关生殖损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过70,000个细胞来自肥胖和瘦小鼠的睾丸 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-02-18 |
iIMPACT: integrating image and molecular profiles for spatial transcriptomics analysis
2024-06-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03289-5
PMID:38844966
|
研究论文 | 本文提出了一种名为iIMPACT的多阶段统计方法，用于整合组织学图像和分子数据以改进空间转录组学分析 | iIMPACT首次结合AI重建的组织学图像和基因表达空间背景来定义空间区域，并检测区域特异性差异表达基因，提升了准确性和可解释性 | 未在摘要中明确说明 | 克服现有空间转录组学聚类分析仅依赖分子信息而忽略形态特征的局限 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2026-02-05 |
Machine learning identifies activation of RUNX/AP-1 as drivers of mesenchymal and fibrotic regulatory programs in gastric cancer
2024-06-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278565.123
PMID:38777607
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研究论文 | 本研究利用ATAC-seq和RNA-seq数据，通过机器学习方法识别了胃癌中驱动间质和纤维化调控程序的关键转录因子，特别是RUNX/AP-1的激活 | 开发了一种基于ATAC-seq数据的机器学习方法，首次系统性地确定了胃癌中间质和上皮状态的转录因子驱动者，并揭示了拷贝数变异如何影响这些转录因子的失调 | NA | 探究胃癌中间质表型的调控机制，识别驱动胃癌异质性和进展的关键转录因子 | 胃癌细胞系和原发性肿瘤样本 | 机器学习 | 胃癌 | ATAC-seq, RNA-seq | 机器学习方法 | 基因组和转录组数据 | NA | NA | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-02-05 |
ScSNViz: a user-friendly toolset for visualization and analysis of Cell-Specific Expressed SNVs
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596816
PMID:38895293
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scSNViz的R语言工具集，用于可视化和分析单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异 | scSNViz是首个提供3D sceSNV可视化功能、兼容主流scRNA-seq处理工具（如Seurat、SingleR、scType）并支持轨迹推断（如Slingshot）的综合性工具集，填补了单细胞水平遗传变异分析工具的空缺 | 工具依赖于R环境，可能对非编程用户有一定学习曲线，且未提及处理大规模数据时的性能优化 | 开发一个用户友好的工具集，以可视化和分析单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异，促进对细胞异质性、克隆进化和基因表达调控的理解 | 单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过空间转录组学数据提供子图块图像的基因组特征，以弥补现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M是首个将病理图像子图块与高维基因表达数据（15,000-30,000维）配对的大规模数据集，提供了前所未有的空间分辨率，支持多模态数据分析的深入研究 | 数据集中仅包含1,149张原始图像，且基因表达数据维度较高，可能对计算资源要求较高，同时未提及数据来源的具体疾病类型或样本多样性 | 旨在通过提供细粒度的图像-基因表达配对数据，推动计算病理学和多模态算法的发展 | 空间转录组学数据中的病理图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2026-01-24 |
Single-cell transcriptomics unveiled that early life BDE-99 exposure reprogrammed the gut-liver axis to promote a proinflammatory metabolic signature in male mice at late adulthood
2024-06-26, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfae047
PMID:38648751
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了生命早期暴露于阻燃剂BDE-99会重编程肠道-肝脏轴，导致雄性小鼠在成年后期出现促炎症代谢特征 | 首次结合单细胞转录组测序（scRNA-seq）和无菌（GF）小鼠模型，阐明了生命早期BDE-99暴露如何通过改变肠道微生物组，持久地重编程肝脏细胞类型特异性基因表达和细胞间通讯，从而促进成年后期的促炎症状态 | 研究仅针对雄性C57BL/6小鼠，未探讨性别差异；暴露时间窗口（出生后2-4天）和剂量（57 mg/kg）可能无法完全模拟人类真实暴露场景；机制关联性部分基于预测和相关性分析 | 探究生命早期暴露于环境污染物BDE-99对肠道-肝脏轴的长期影响，特别是其对肝脏免疫代谢稳态和肠道微生物组的重编程作用 | 雄性C57BL/6小鼠（包括常规饲养和无菌小鼠），重点关注其肝脏细胞（如肝细胞、中性粒细胞）和肠道组织 | 单细胞组学 | 代谢与炎症相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），微生物移植 | NA | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 雄性C57BL/6小鼠（具体数量未明确说明），包括BDE-99暴露组和玉米油对照组，并在15月龄进行分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-01-21 |
Deciphering the molecular landscape of human peripheral nerves: implications for diabetic peripheral neuropathy
2024-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.15.599167
PMID:38915676
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研究论文 | 本研究通过批量与空间RNA测序分析人类胫神经和腓肠神经，揭示了糖尿病周围神经病变的分子机制和细胞转录组变化 | 首次结合批量与空间转录组学分析人类周围神经，发现感觉轴突mRNA运输在神经退行中的潜在作用 | 样本主要来自糖尿病患者截肢手术，可能无法完全代表早期或轻度病变 | 深入探究糖尿病周围神经病变的分子机制和细胞变化 | 人类胫神经和腓肠神经 | 数字病理学 | 糖尿病周围神经病变 | 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 来自下肢截肢手术的胫神经和腓肠神经样本，主要来自糖尿病患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2026-01-21 |
SLC45A3 Serves as a Potential Therapeutic Biomarker to Attenuate White Matter Injury After Intracerebral Hemorrhage
2024-06, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-023-01145-5
PMID:36913120
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和动物实验，发现SLC45A3基因在脑出血后白质损伤中作为潜在治疗生物标志物，其过表达可减轻脑损伤 | 首次结合加权基因共表达网络分析、差异表达基因筛选及单细胞RNA-seq技术，系统鉴定SLC45A3在脑出血后白质损伤中的关键作用，并验证其治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据集，尚未在人类临床样本中进行验证，且具体分子机制需进一步探索 | 探究脑出血后白质损伤的分子机制，并寻找潜在治疗靶点 | 脑出血小鼠模型（自体血或胶原酶诱导）及公共基因表达数据集（GSE24265、GSE125512、GSE167593） | 生物信息学与神经科学 | 脑血管疾病（脑出血） | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、差异表达基因分析、单细胞RNA-seq、扩散张量成像（DTI）、基础医学实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、影像数据 | 两个公共数据集（GSE24265和GSE125512）及一个单细胞RNA-seq数据集（GSE167593），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-01-16 |
Single-cell phylotranscriptomics of developmental and cell type evolution
2024-06, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.02.005
PMID:38490933
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综述 | 本文总结了单细胞系统转录组学在揭示发育和细胞类型进化分子机制中的应用 | 利用单细胞系统转录组学分析，揭示了发育过程中谱系和细胞类型间转录组年龄的异质性，并识别了驱动整体生物钟形模式的谱系和组织 | NA | 探讨单细胞系统转录组学在理解发育进化模式和细胞类型进化史中的作用 | 发育过程中的谱系、细胞类型和组织 | 计算生物学 | NA | 单细胞系统转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-01-16 |
The Transpeptidase Sortase A Binds Nucleic Acids and Mediates Mammalian Cell Labeling
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305605
PMID:38581131
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研究论文 | 本文发现金黄色葡萄球菌的转肽酶Sortase A能与核酸结合，并基于此开发了CellID技术用于单细胞RNA测序中的样本多重标记 | 首次揭示了Sortase A与核酸的未知相互作用，并利用这一特性开发了新的细胞标记技术CellID | 未详细探讨Sortase A与核酸结合的具体分子机制，且技术应用潜力尚未完全验证 | 探索Sortase A的非经典功能及其在生物技术中的应用 | 金黄色葡萄球菌Sortase A蛋白、哺乳动物细胞、核酸寡核苷酸 | 生物技术 | NA | CRISPR筛选、scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-01-15 |
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4536158/v1
PMID:38978567
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TACIT的无监督算法，用于空间生物学中的细胞类型和状态注释，无需训练数据，并在多个数据集中验证了其准确性和可扩展性 | 开发了TACIT算法，这是一种无监督方法，利用预定义签名进行细胞注释，无需训练数据，并通过无偏阈值处理区分阳性细胞与背景，专注于相关标记以识别多组学检测中的模糊细胞 | 未明确说明算法的计算资源需求或处理大规模数据时的潜在限制 | 解决空间生物学中细胞类型和状态识别的时间消耗和易错挑战，提高注释的准确性和可扩展性 | 细胞类型和细胞状态，涉及大脑、肠道和腺体三个生态位 | 空间生物学 | 炎症性腺体疾病 | 空间转录组学和空间蛋白质组学 | 无监督算法 | 空间多组学数据 | 五个数据集，总计5,000,000个细胞，涉及51种细胞类型 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 80 | 2026-01-15 |
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596861
PMID:38895230
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TACIT的无监督算法，用于空间生物学中的细胞类型和状态注释，无需训练数据，通过预定义签名和阈值区分细胞，并在多个数据集中验证其准确性和可扩展性 | 开发了TACIT算法，这是一种无监督方法，利用预定义签名和阈值区分细胞，无需训练数据，能处理细胞、邻域和生态位层面的变异性，在多组学分析中识别模糊细胞 | NA | 解决空间生物学中细胞类型和状态注释的耗时和易错挑战，提高注释的准确性和可扩展性 | 细胞类型和状态，包括来自大脑、肠道和腺体等生态位的细胞 | 空间生物学 | 炎症性腺体疾病 | 空间转录组学和蛋白质组学 | 无监督算法 | 空间多组学数据 | 5个数据集，涉及5,000,000个细胞和51种细胞类型 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |