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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Positionally distinct interferon stimulated dermal immune acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet's syndrome
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600500
PMID:38979312
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了Sweet综合征中成纤维细胞通过I型干扰素信号通路促进中性粒细胞招募的机制 | 首次在Sweet综合征中发现位置特异的免疫活性成纤维细胞亚群,并阐明其通过不同趋化因子空间分布调控中性粒细胞浸润 | 研究基于存档临床样本,样本数量有限,且为观察性研究 | 探究Sweet综合征中中性粒细胞浸润的细胞分子机制 | Sweet综合征患者皮肤组织样本和原代人真皮成纤维细胞 | 数字病理学 | Sweet综合征 | 单核RNA测序, 批量转录组学, 单分子空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 存档临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Sex differences and immune correlates of Long COVID development, persistence, and resolution
2024-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.18.599612
PMID:38948732
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析长新冠发展的性别差异和免疫相关性 | 首次系统揭示长新冠发展、持续和消退过程中性别特异的免疫失调机制 | 样本量较小(45例患者),需要更大规模研究验证 | 探究长新冠发展的免疫学基础及性别差异 | 45名发展为长新冠或康复的COVID-19患者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, 血浆蛋白质组学 | NA | 血液样本 | 45例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Anti-PD-1 cancer immunotherapy induces central nervous system immune-related adverse events by microglia activation
2024-06-12, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adj9672
PMID:38865481
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研究论文 | 本研究揭示了抗PD-1免疫疗法通过直接激活小胶质细胞引发中枢神经系统免疫相关不良事件的机制 | 首次发现抗PD-1抗体可直接作用于小胶质细胞而非通过外周T细胞激活引发CNS-irAEs,并鉴定Syk为关键治疗靶点 | 患者队列样本量有限,机制研究主要基于小鼠模型 | 探究抗PD-1免疫疗法引发中枢神经系统不良反应的细胞机制 | 小鼠模型和接受抗PD-1治疗的患者中枢神经组织 | 免疫学 | 癌症免疫治疗相关神经系统并发症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 成像质谱流式细胞术 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 | 小鼠实验模型和患者队列组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Development of a nanoparticle-based tendon-targeting drug delivery system to pharmacologically modulate tendon healing
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn2332
PMID:38896625
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研究论文 | 开发了一种基于纳米颗粒的肌腱靶向药物递送系统,用于药理学调节肌腱愈合 | 首次发现肌腱愈合过程中的TRAP活性,并利用TRAP结合肽功能化纳米颗粒实现肌腱特异性药物递送 | 仅在小鼠模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发改善肌腱愈合的药理学治疗方法 | 急性肌腱损伤的愈合过程 | 生物医学工程 | 肌腱损伤 | 空间转录组学、纳米颗粒药物递送系统 | NA | 基因表达数据、生物力学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Structure and dynamics of enterovirus genotype networks
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1693
PMID:38896609
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示肠道病毒种群通过突变网络维持与多个适应性基因型连接的进化动态 | 开发SEARCHLIGHT方法实现单细胞水平同时获取病毒单倍型和宿主转录组信息,首次在单细胞分辨率揭示病毒种群结构复杂性 | NA | 解析肠道病毒基因型网络的结构和动态,理解病毒种群如何适应选择性环境变化 | 肠道病毒种群 | 基因组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、病毒单倍型数据 | 数百个受感染的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | SEARCHLIGHT(scRNA-seq-enabled acquisition of mRNA and consensus haplotypes linking individual genotypes and host transcriptomes) |
| 66 | 2025-10-06 |
Expansion of learning capacity elicited by interspecific hybridization
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3409
PMID:38896617
|
研究论文 | 本研究通过种间杂交培育F1杂交鸣禽,探索了物种特异性学习能力的神经遗传机制 | 首次发现杂交鸣禽具有扩展的学习能力,能模仿双亲物种及其他异种鸣叫,并揭示这与发声运动投射神经元的特异性转录特征相关 | 尽管发现神经回路大小和神经元数量保守,但具体分子机制仍需进一步验证 | 探索物种特异性鸣叫学习的神经遗传机制 | F1杂交鸣禽及其亲本物种 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | F1杂交鸣禽个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
MOXD1 is a lineage-specific gene and a tumor suppressor in neuroblastoma
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1583
PMID:38905335
|
研究论文 | 本研究通过分析神经母细胞瘤样本的RNA测序数据,发现MOXD1基因是神经母细胞瘤中的谱系特异性肿瘤抑制基因 | 首次将MOXD1鉴定为神经母细胞瘤中的谱系限制性肿瘤抑制基因,并揭示了其在肿瘤发展中的决定性作用 | 缺乏适当的早期肿瘤驱动事件研究模型 | 探索神经母细胞瘤的胚胎起源和早期肿瘤驱动事件 | 人类神经母细胞瘤样本、人类神经母细胞瘤细胞、胎儿肾上腺、斑马鱼、小鸡和小鼠模型 | 癌症生物学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类神经母细胞瘤样本和多种动物模型 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9817
PMID:38896611
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研究论文 | 本研究验证了CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴成像生物标志物的潜力 | 首次将CMKLR1确定为单核细胞源性巨噬细胞的瞬时标志物,并开发了CMKLR1靶向PET成像技术用于肺部炎症和纤维化的无创评估 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证仍需进一步开展 | 开发用于纤维化肺疾病风险分层和治疗监测的可靠生物标志物 | 特发性肺纤维化患者和小鼠肺纤维化模型 | 数字病理 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,正电子发射断层扫描 | NA | 基因表达数据,影像数据 | 特发性肺纤维化患者队列和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9173
PMID:38905344
|
研究论文 | 构建了跨物种三叉神经节和背根神经节的统一细胞图谱,促进不同物种和研究间的细胞类型比较 | 创建了首个涵盖6个物种、31个数据集的统一感觉神经节细胞图谱,改进了稀疏神经元亚型的注释 | 研究主要基于转录组数据,可能未完全捕捉蛋白质水平和功能特性的差异 | 比较不同物种感觉神经节的细胞类型多样性并建立统一注释标准 | 三叉神经节和背根神经节的感觉神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 6个物种、31个数据集 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Integration mapping of cardiac fibroblast single-cell transcriptomes elucidates cellular principles of fibrosis in diverse pathologies
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8501
PMID:38905342
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据构建心脏纤维化的综合参考图谱 | 建立了首个全面的心脏纤维化单细胞转录组整合图谱,揭示了不同病理模型中成纤维细胞的相似性动态变化 | NA | 阐明不同病理条件下心脏纤维化的细胞学原理 | 心脏成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类健康及患病心脏样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
APOE Christchurch enhances a disease-associated microglial response to plaque but suppresses response to tau pathology
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597211
PMID:38895362
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研究论文 | 本研究探讨APOE Christchurch突变在不同阿尔茨海默病小鼠模型中对小胶质细胞反应的调节作用 | 首次系统研究APOE Christchurch突变在淀粉样斑块和tau蛋白病变两种不同病理模型中的差异性调节作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;样本量相对有限 | 阐明APOE Christchurch突变对阿尔茨海默病病理发展的保护机制 | 携带ApoeCh突变的5xFAD淀粉样病变小鼠模型和PS19 tau病变小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 免疫组织化学分析、生化分析、单细胞空间转录组学、蛋白质组学 | 小鼠疾病模型 | 图像数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
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综述 | 本文总结了2023年EMBO研讨会关于发育代谢领域的关键讨论,重点探讨了该领域面临的挑战与新兴机遇 | 强调了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等技术革命为发育代谢研究带来的全新探索维度 | NA | 探讨发育代谢领域的历史障碍和新兴机遇 | 细胞特异性代谢网络、组织间代谢通讯、基因-代谢物时空相互作用 | 发育生物学 | NA | 代谢组学, 小分子传感器, 单细胞RNA测序, 计算建模 | 计算模型 | 代谢数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Somatic mutations associate with clonal expansion of CD8+ T cells
2024-06-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj0787
PMID:38848368
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研究论文 | 本研究通过分析90名血液和免疫疾病患者的CD4和CD8 T细胞,揭示了体细胞突变与CD8+T细胞克隆扩增的关联 | 首次在非恶性T细胞中系统研究体细胞突变谱,发现CD8+T细胞突变负荷更高且非同义突变具有非随机性特征 | 样本仅来自血液和免疫疾病患者,未包含健康对照组 | 探究体细胞突变在T细胞中的分布特征及其与克隆扩增的关系 | 90名血液和免疫疾病患者的CD4和CD8 T细胞 | 免疫基因组学 | 血液和免疫疾病 | T细胞受体测序, 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据, 单细胞测序数据 | 90名患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Gene regulatory landscape of cerebral cortex folding
2024-06-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn1640
PMID:38838158
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研究论文 | 本研究揭示了大脑皮层折叠的基因调控机制,通过表征雪貂大脑发育过程中的基因表达和表观遗传动态 | 首次揭示了H3K27ac表观遗传景观在定义大脑皮层折叠模式中的关键作用,并证明通过操纵转录因子表达可改变皮层折叠模式 | 研究仅限于雪貂模型,未在其他哺乳动物中进行验证 | 探索大脑皮层折叠模式的基因调控机制 | 雪貂大脑皮层发育过程中的基因表达和表观遗传变化 | 发育神经生物学 | 神经系统发育障碍 | 单细胞RNA测序,H3K27ac染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 雪貂胚胎发育不同阶段的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
Gene representation bias in spatial transcriptomics
2024-06, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720024500070
PMID:39036848
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研究论文 | 本研究通过比较Visium空间转录组和bulk RNA-seq数据,识别在Visium中频繁低检测的基因并探索其潜在机制 | 首次系统性地发现空间转录组数据中存在基因表示偏倚,并揭示poly(T)基序可能通过形成发夹结构影响mRNA捕获效率 | 样本量相对有限(28个人类样本和19个小鼠样本),需要更多实验验证poly(T)基序形成发夹结构的假设 | 识别空间转录组数据中频繁低检测的基因并探究其潜在分子机制 | 人类和小鼠组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序,bulk RNA-seq,基序分析 | NA | 基因-点计数矩阵,序列数据 | 28个人类样本和19个小鼠样本,涵盖多种组织来源 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组技术 |
| 76 | 2025-10-06 |
NDMNN: A novel deep residual network based MNN method to remove batch effects from scRNA-seq data
2024-06, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S021972002450015X
PMID:39036845
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研究论文 | 提出一种基于深度残差网络的NDMNN方法,用于消除单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 将密集深度残差网络(NDnetwork)与MNN方法相结合,设计出新的批次效应校正方法 | NA | 开发更有效的单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度残差网络 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Circulating KLRG1+ long-lived effector memory T cells retain the flexibility to become tissue resident
2024-06-28, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adj8356
PMID:38941479
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研究论文 | 本研究揭示KLRG1+长效效应记忆T细胞在继发感染时能进入非淋巴组织并建立组织驻留记忆 | 发现长效效应细胞虽不能分化为其他循环记忆亚群,但仍保留进入组织建立驻留记忆的灵活性 | 研究主要基于小鼠病毒感染模型,人类相关性需进一步验证 | 探究KLRG1+记忆T细胞在继发感染中的分化潜力和组织驻留能力 | 小鼠感染模型中的KLRG1+ CD8 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Glutamatergic neuronal activity regulates angiogenesis and blood-retinal barrier maturation via Norrin/β-catenin signaling
2024-Jun-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.011
PMID:38599212
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研究论文 | 本研究揭示了谷氨酸能神经元活动通过调节内皮细胞Norrin/β-catenin信号通路调控视网膜血管生成和血-视网膜屏障成熟的新机制 | 首次发现谷氨酸能神经元活动通过Norrin/β-catenin信号通路调控视网膜深层血管丛生成和血-视网膜屏障成熟 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类视网膜中验证 | 探究谷氨酸能神经元活动如何调控视网膜血管生成和血-视网膜屏障成熟 | 小鼠视网膜的神经元-血管相互作用 | 神经血管生物学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 体内遗传学研究, 功能验证 | 基因修饰小鼠模型(Vglut1和Gnat1) | 基因表达数据, 功能表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
3D reconstruction of the mouse cochlea from scRNA-seq data suggests morphogen-based principles in apex-to-base specification
2024-06-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.028
PMID:38593801
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠耳蜗单细胞RNA测序数据,重建了耳蜗三维结构并揭示了形态发生素在耳蜗顶-基轴特异性形成中的机制 | 首次从单细胞RNA测序数据重建小鼠耳蜗三维结构,发现视黄酸和hedgehog通路形成相反的顶-基轴梯度并共同调控耳蜗纵向轴特化 | 研究仅基于E12.5和E14.5两个时间点的数据,未覆盖耳蜗发育全过程 | 探索小鼠耳蜗顶-基轴特异性基因表达的分子调控机制 | 小鼠耳蜗发育过程中的细胞 | 单细胞转录组学 | 听觉系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | E12.5和E14.5两个发育时间点的小鼠耳蜗细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Target-Oriented Reference Construction for supervised cell-type identification in scRNA-seq
2024-Jun-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4559348/v1
PMID:38978578
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研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序监督细胞类型识别的目标导向参考构建方法 | 首次提出针对目标数据集选择和构建参考数据的方法,缓解参考数据与目标数据之间数据分布和细胞类型组成的差异 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中监督细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 模拟数据和真实数据分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |