单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
541	2024-08-05	Integrated enhancer regulatory network by enhancer-promoter looping in gastric cancer 2024-Jun, NAR cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1093/narcan/zcae020 PMID:38720882	研究论文	本研究分析了胃癌细胞中增强子-启动子环状相互作用的调控网络	发现胃癌特异性增强子通过增强子-启动子环与近邻启动子相互作用激活多个基因，尤其是在胃癌细胞中表达的肿瘤相关基因	未提及具体的局限性	研究胃癌细胞中增强子如何调控癌基因转录	胃癌细胞系与正常胃上皮细胞	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序，CRISPR干扰	NA	基因表达数据	使用了两种胃癌细胞系和临床胃癌样本
542	2024-08-04	Cell communication pathway prognostic model identified detrimental neurodevelopmental pathways in neuroblastoma 2024-06, Neoplasia (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.neo.2024.100997 PMID:38669760	研究论文	该文章开发了一种细胞通信通路预后模型，以识别神经母细胞瘤中的有害神经发育通路	文章提出了细胞通信通路预后模型（CCPPM），为研究细胞通信通路对疾病预后的影响提供了新的方法	由于样本量有限和单细胞RNA-seq数据的临床生存信息不完整，确定这些通信通路对预后的影响具有挑战性	研究细胞通信路径对神经母细胞瘤预后的影响	神经母细胞瘤的细胞通信通路	数字病理学	神经母细胞瘤	单细胞RNA-seq和批量RNA-seq	NA	RNA-seq数据	NA
543	2024-08-04	TIGIT Blockade Reshapes the Tumor Microenvironment Based on the Single-cell RNA-Sequencing Analysis 2024-Jun-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997) DOI:10.1097/CJI.0000000000000511 PMID:38545758	研究论文	这篇文章研究了TIGIT阻断治疗对肿瘤微环境的影响。	文章提供了对TIGIT阻断后免疫微环境变化的新理解，并揭示了其在肿瘤免疫疗法中的潜力。	文章中没有提到具体的临床数据和长期疗效评估。	研究TIGIT阻断在肿瘤免疫治疗中的作用和机制。	小鼠在接受抗TIGIT治疗前后的单细胞RNA测序分析。	数字病理学	肿瘤	单细胞RNA测序	NA	细胞样本	在小鼠中进行的单细胞测序
544	2024-08-05	Narrow band imaging-based radiogenomics for predicting radiosensitivity in nasopharyngeal carcinoma 2024-Jun, European journal of radiology open IF:1.8Q3 DOI:10.1016/j.ejro.2024.100563 PMID:38681663	研究论文	本研究评估了窄带成像内镜在利用放射组学预测鼻咽癌放射敏感性的有效性，并探讨相关的分子机制	基于窄带成像的放射组学模型为预测鼻咽癌放射敏感性提供了一种新颖有效的方法	论文中未提及研究的局限性	研究的目的是评估窄带成像内镜在鼻咽癌放射敏感性预测中的有效性	参与研究的对象是57名经过病理诊断的鼻咽癌患者	数字病理学	鼻咽癌	RNA测序	随机森林算法	图像	57名鼻咽癌患者
545	2024-08-04	Single-cell sequencing analysis of chronic subdural hematoma cell subpopulations and their potential therapeutic mechanisms 2024-Jun-01, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2024.110936 PMID:38554980	研究论文	该研究分析了慢性硬膜下血肿(CSDH)患者外围血液和术后切除血肿中的细胞亚群及其潜在治疗机制	首次通过单细胞测序对慢性硬膜下血肿中细胞进行详细分类，揭示了不同细胞在CSDH发病机制中的作用	尚未充分探讨不同细胞亚群在临床实践中的具体应用和影响	分析慢性硬膜下血肿患者血液和术后血肿中的细胞亚群，探索其在CSDH复发中的关联	慢性硬膜下血肿患者的外围血液和术后切除的血肿样本	数字病理学	慢性硬膜下血肿	单细胞测序	NA	细胞数据	分析了切除的血肿和外围血液中的细胞群体
546	2024-08-05	Targeting cellular senescence as a therapeutic vulnerability in gastric cancer 2024-Jun-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2024.122631 PMID:38621585	研究论文	本研究构建了一个胃癌的细胞衰老图谱，并探索了潜在的治疗方案	首次提出胃癌特异性细胞衰老评分（GSS）并发现其与临床结果有关联	本研究主要依赖于体外实验，临床验证尚需进一步研究	探讨细胞衰老在胃癌中的应用作为治疗脆弱性	胃癌患者中的细胞衰老相关调节因子	数字病理学	胃癌	scRNA-seq	NA	基因数据	38个与衰老相关的调节因子
547	2024-08-04	Unique challenges and best practices for single cell transcriptomic analysis in toxicology 2024-Jun, Current opinion in toxicology IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.cotox.2024.100475 PMID:38645720	综述	本综述探讨了在毒理学中应用单细胞转录组分析面临的独特挑战及最佳实践	提出了针对毒理学中单细胞转录组分析的关键挑战和实用分析解决方案	该论文未提供具体的实验数据或样本分析	提高单细胞转录组学在毒理学中的应用	单细胞转录组数据在毒理学中的应用	数字病理学	NA	NA	NA	转录组数据	NA
548	2024-08-04	Comprehensive single-cell transcriptomic profiling reveals molecular subtypes and prognostic biomarkers with implications for targeted therapy in esophageal squamous cell carcinoma 2024-Jun, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101948 PMID:38582059	研究论文	这篇文章揭示了食道鳞状细胞癌的分子亚型和预后生物标志物。	本研究通过单细胞转录组分析揭示了食道鳞状细胞癌的分子异质性和新的预后生物标志物。	该研究可能未涵盖所有可能的分子亚型和标志物，需进一步实验验证。	本研究旨在识别食道鳞状细胞癌中与DNA复制压力相关的生物标志物，以改善预后风险分层。	研究对象为食道鳞状细胞癌（ESCC）样本。	数字病理学	食道癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	ESCC样本（具体样本数未提供）
549	2024-08-04	High-dimensional deconstruction of ovarian cancer at single-cell precision reveals HEBP2 that reshape the TIME and drive carboplatin resistance 2024-Jun, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101917 PMID:38554571	研究论文	该研究利用单细胞测序分析卵巢癌患者的肿瘤免疫微环境，探讨不同巨噬细胞亚群在卵巢癌进展中的作用。	该研究首次揭示了脂肪酸相关基因HEBP2在卵巢癌化疗耐药中的重要作用，且说明了其在改变肿瘤免疫微环境中发挥的作用。	未提及具体的样本量和实验细节，可能对结果的普遍适用性产生影响。	旨在揭示卵巢癌化疗耐药的机制，并研究HEBP2在这一过程中的作用。	研究对象为卵巢癌患者的肿瘤组织及其免疫细胞环境。	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	肿瘤组织样本	未具体提及
550	2024-08-07	CCR7 affects the tumor microenvironment by regulating the activation of naïve CD8+ T cells to promote the proliferation of oral squamous cell carcinoma 2024-Jun, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101924 PMID:38430712	研究论文	本文研究了CCR7通过调节幼稚CD8+ T细胞的激活来影响口腔鳞状细胞癌（OSCC）肿瘤微环境的机制	首次深入研究了CCR7在肿瘤微环境中对幼稚CD8+ T细胞抗肿瘤免疫反应的作用	仅通过CCR7敲除小鼠模型进行研究，可能需要更多临床数据支持	探讨CCR7在口腔鳞状细胞癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力	CCR7在口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的作用及对幼稚CD8+ T细胞的影响	NA	口腔鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	CCR7敲除小鼠模型
551	2024-08-07	Insights into the role of the N6-methyladenosine reader IGF2BP3 in the progression of oral squamous cell carcinoma and its connection to cell-cycle control 2024-Jun, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101932 PMID:38492500	研究论文	本研究探讨了N6-甲基腺苷阅读器IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌进展中的作用及其与细胞周期控制的联系	本研究首次揭示了IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌中的过度表达，并发现其与细胞周期G2/M转换阶段的关联	研究主要基于批量测序和单细胞RNA测序数据，可能需要更多实验验证	探究IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌中的作用及其对细胞周期的影响	口腔鳞状细胞癌中的IGF2BP3表达及其对细胞周期的影响	数字病理学	口腔鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	具体样本数量未在摘要中提及
552	2024-08-07	Inter- and trans-generational impacts of environmental exposures on the germline resolved at the single-cell level 2024-Jun, Current opinion in toxicology IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.cotox.2024.100465 PMID:38586548	research paper	本文探讨了单细胞技术在解析环境暴露对生殖细胞跨代影响的现状与应用	利用单细胞RNA测序、ATAC测序和多组学方法，深入理解毒物对生殖细胞功能的影响及其在不同组织和细胞类型中的差异响应	NA	探讨单细胞技术在生殖毒理学研究中的应用，并展示其在不同模型生物和环境暴露中的价值	生殖细胞及其对环境暴露的响应	NA	NA	单细胞RNA测序、ATAC测序、多组学	NA	单细胞数据	NA
553	2024-08-04	Label-free single-cell analysis in microdroplets using a light-scattering-based optofluidic chip 2024-Jun-01, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2024.116148 PMID:38428071	研究论文	本研究提出了一种新颖的基于光散射的微滴单细胞分析方法	采用光散射技术实现对微滴中单细胞的无标签检测和特征分析	未提及具体实验数据和临床应用的验证	开发一种高通量、无标签的微滴单细胞分析平台	主要研究微滴中单细胞的光散射特性	数字病理	NA	光散射	NA	NA	研究中涉及到的微滴单细胞及其人工合成的胶珠