单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
521	2024-08-05	Heterogeneity of myeloid cells in common cancers: Single cell insights and targeting strategies 2024-Jun-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112253 PMID:38735257	综述	本文全面概述了高发癌症中髓系细胞的异质性及其靶向策略	通过单细胞RNA测序技术，建立了新亚群体和靶点，提供了对髓系细胞异质性的深入理解	研究主要基于文献综述，缺乏实证研究数据支撑	理解髓系细胞在肿瘤微环境中的异质性及其潜在的靶向治疗策略	高发癌症中的髓系细胞亚群体及其功能	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
522	2024-08-05	TM-Score predicts immunotherapy efficacy and improves the performance of the machine learning prognostic model in gastric cancer 2024-Jun-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112224 PMID:38723370	研究论文	本研究提出了一种新颖的TM-Score评分，以预测胃癌患者的免疫治疗效果并提高机器学习预后模型的性能	研究结合肿瘤突变负担和主要组织相容性复合体相关中心基因建立了TM-Score，显示出优于传统预测指标的性能	研究的限制未在摘要中详细描述	优化与胃癌免疫治疗相关的患者筛选	胃癌患者	数字病理学	胃癌	RNA-seq和scRNA-seq	机器学习模型	基因表达数据	NA
523	2024-08-04	The diversification of methods for studying cell-cell interactions and communication 2024-Jun, Nature reviews. Genetics DOI:10.1038/s41576-023-00685-8 PMID:38238518	研究论文	本文章探讨了细胞间相互作用和通信研究方法的多样化进展	文章强调了新一代计算工具的多样化，这些工具使得对细胞间交互的研究更加复杂且有效	文章中未提及具体的限制	研究细胞间相互作用在其群体中所扮演的角色	细胞之间的分子相互作用	计算生物学	NA	转录组学	NA	单细胞和空间转录组数据	未提供具体的样本大小
524	2024-08-05	Syngeneic murine models with distinct immune microenvironments represent subsets of human intrahepatic cholangiocarcinoma 2024-Jun, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.008 PMID:38458319	研究论文	本研究开发并表征了具有不同遗传驱动的免疫能力强的CCA小鼠模型，以探讨肿瘤基因组学、免疫生物学与治疗反应间的关联	建立了一种遗传小鼠模型以模拟人类肝内胆管癌，并展示了肿瘤基因型与免疫微环境表型之间的关联	研究没有详细说明样本的具体数量和来源	理解肿瘤基因型与肿瘤免疫微环境特征之间的关系	肝内胆管癌的免疫能力强的小鼠模型	数字病理学	NA	scRNA-seq，CITE-seq，整体外显子和大量RNA测序	小鼠模型	基因组数据，转录组数据	NA
525	2024-08-04	YTHDF2 favors protumoral macrophage polarization and implies poor survival outcomes in triple negative breast cancer 2024-Jun-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109902 PMID:38812540	研究论文	该研究聚焦于YTHDF2及其在三阴性乳腺癌中对巨噬细胞极化的影响	发现YTHDF2促进巨噬细胞的促肿瘤表型极化，并与抗原呈递信号的下调密切相关	NA	探讨YTHDF2在三阴性乳腺癌中巨噬细胞极化及其影响	三阴性乳腺癌中的巨噬细胞	数字病理学	三阴性乳腺癌	单细胞测序	NA	NA	NA
526	2024-08-04	Zinc-a2-Glycoprotein Acts as a Component of PNN to Protect Hippocampal Neurons from Apoptosis 2024-Jun, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-023-03771-4 PMID:38001359	研究论文	本文首次展示了锌-α-糖蛋白(ZAG)在鼠脑中的分布与功能	本研究首次揭示ZAG在PNN中定位及其对神经元凋亡的保护作用	研究主要集中在小鼠模型，可能无法完全推及人类	探讨锌-α-糖蛋白在成年人脑中的作用及其对神经元的保护机制	成人小鼠的海马、皮层及其它包含PNN的神经元	数字病理学	NA	单细胞测序、分子对接	NA	细胞数据	HT22细胞
527	2024-08-04	Single-cell sequencing reveals the impact of endothelial cell PIEZO1 expression on thoracic aortic aneurysm 2024-Jun, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2 DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.04.015 PMID:38718563	研究论文	本研究探讨了内皮细胞中PIEZO1表达对胸主动脉瘤（TAA）的影响	首次揭示了PIEZO1在胸主动脉瘤发展中的作用，并建议其作为治疗靶点的潜力	研究中使用的动物模型可能与人类病理情况存在差异	研究PIEZO1在胸主动脉瘤中的作用及其潜在的治疗价值	TAA患者的单细胞数据库及小鼠模型	数字病理学	胸主动脉瘤	单细胞测序	条件性敲除小鼠模型	RNA及蛋白质水平数据	使用了小鼠模型进行的实验
528	2024-08-05	The profile of cytokines against bacterial infection in dental pulp 2024-Jun, The journal of gene medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1002/jgm.3707 PMID:38811236	研究论文	文章总结了健康和炎症牙髓中不同细胞类型的细胞因子分泌谱	首次在单细胞水平分析牙髓中细胞对细菌感染的细胞因子反应模式	仅依赖于GEO数据集的单细胞转录组数据，缺乏进一步的实验证实	研究牙髓细胞如何通过细胞因子响应细菌感染	健康和炎症状态下的牙髓组织细胞	数字病理	NA	单细胞转录组测序	NA	基因表达数据	健康牙髓和炎症牙髓样本的基因表达数据
529	2024-08-05	M2 macrophage-derived TGF-β induces age-associated loss of adipogenesis through progenitor cell senescence 2024-Jun, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2024.101943 PMID:38657734	研究论文	这项研究揭示了M2巨噬细胞来源的TGF-β通过前体细胞衰老引起的与年龄相关的脂肪生成损失	本研究首次展示了p16high衰老前体细胞在年龄相关的脂肪生成损失中的生物学作用	研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全代表人类的生理和病理状态	探索与年龄相关的脂肪生成衰退的分子机制	衰老的脂肪前体细胞及其与免疫细胞的相互作用	数字病理学	癌症消耗症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA-seq数据	老年p16-CreERT2/Rosa26-LSL-tdTomato小鼠中的p16high脂肪细胞
530	2024-08-05	Macrophage-Derived GSDMD Plays an Essential Role in Atherosclerosis and Cross Talk Between Macrophages via the Mitochondria-STING-IRF3/NF-κB Axis 2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320612 PMID:38695170	研究论文	本研究探讨了巨噬细胞衍生的GSDMD在动脉粥样硬化及巨噬细胞之间的相互作用中的关键作用	揭示了GSDMD在动脉粥样硬化进程中的新机制，并提出GSDMD作为动脉粥样硬化的潜在治疗靶点	本研究主要使用小鼠模型，尚需在人类样本中验证其发现	研究巨噬细胞衍生的GSDMD如何影响动脉粥样硬化及其机制	使用ApoE-/-和Gsdmd-/- ApoE-/-小鼠及其骨髓移植模型	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	组织样本	使用了ApoE-/-和Gsdmd-/- ApoE-/-小鼠的样本
531	2024-08-05	Characteristics of peripheral blood mononuclear cells and potential related molecular mechanisms in patients with autoimmune hepatitis: a single-cell RNA sequencing analysis 2024-Jun, Medical molecular morphology IF:1.2Q3 DOI:10.1007/s00795-024-00380-5 PMID:38340154	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性肝炎患者外周血单核细胞的特征及潜在相关分子机制	首次利用单细胞RNA测序技术系统性分析自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞特征	对免疫细胞群体特征的理解仍然有限，可能没有考虑其他类型的免疫细胞	分析自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞特点及其潜在的分子机制	来自4名健康对照和4名自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞	数字病理学	自身免疫性肝炎	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	3690个来自健康对照和3511个来自自身免疫性肝炎患者的单细胞转录组
532	2024-08-05	FTO elicits tumor neovascularization in cancer-associated fibroblasts through eliminating m6A modifications of multiple pro-angiogenic factors 2024-Jun-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216911 PMID:38685450	研究论文	本研究揭示了FTO通过消除多种促血管生成因子的m6A修饰，促进癌症相关成纤维细胞（CAFs）介导的肿瘤血管生成	首次明确了FTO在肿瘤微环境中对CAFs介导的血管生成的作用机制	本研究的局限性在于未能明确m6A修饰对CAFs激活的具体作用	探讨FTO在CAFs介导的血管生成中的作用及机制	研究癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	眼睑黑色素瘤	单细胞转录组分析、多组学分析	NA	mRNA	CAFs样本数量未明确
533	2024-08-04	Single-Cell and Spatial Transcriptome Analysis of Dermal Fibroblast Development in Perinatal Mouse Skin: Dynamic Lineage Differentiation and Key Driver Genes 2024-Jun, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2023.11.008 PMID:38072389	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析和空间转录组学研究了胎儿鼠皮肤中真皮成纤维细胞的发展	首次系统分析了不同发育阶段的单细胞RNA测序数据，并识别了多个重要驱动基因	主要集中在小鼠的发育阶段，可能不适用于其他物种或更广泛的生物学过程	探讨皮肤发育过程中真皮成纤维细胞的动态谱系分化及其关键驱动基因	聚焦于不同发育阶段小鼠皮肤的真皮成纤维细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序，空间转录组学	NA	RNA数据	多个阶段的小鼠样本（胚胎13.5天，14.5天，16.5天和出生后0天，2天，4天）
534	2024-08-05	Hepatic organoids move from adolescence to maturity 2024-Jun, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1 DOI:10.1111/liv.15893 PMID:38451053	研究论文	这篇文章探讨了肝脏类器官在肝脏研究中的贡献和未来发展	指出肝脏类器官在基本研究、药物发现和疾病病理生物学理解方面的四种先进应用	没有具体提及研究的局限性	旨在评估肝脏类器官在肝脏疾病研究中的应用	肝脏类器官及其在不同领域的应用	数字病理学	肝脏疾病	单细胞RNA测序和CRISPR技术	类器官模型	细胞和组织	NA
535	2024-08-04	Single-cell and spatial transcriptomics analysis of human adrenal aging 2024-Jun, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2024.101954 PMID:38718896	研究论文	本研究对人类肾上腺老化机制进行了单细胞和空间转录组分析	该研究是第一项在单细胞分辨率下详细分析人类老化肾上腺皮质的研究	由于人类肾上腺生物学的显著物种差异，相关机制的研究仍然不足	阐明人类肾上腺皮质的功能和结构变化与老化之间的关系	老化的人类肾上腺皮质	数字病理学	NA	单细胞RNA测序和空间转录组学分析	NA	转录组数据	NA
536	2024-08-04	Atherosclerotic Plaque Epigenetic Age Acceleration Predicts a Poor Prognosis and Is Associated With Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Humans 2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320692 PMID:38634280	研究论文	该文章探讨了动脉粥样硬化斑块的表观遗传年龄加速（EAA）与心血管事件风险之间的关系	文章首次揭示了动脉粥样硬化斑块的EAA是预示未来不良预后的独立标志	研究局限于单一的观察性队列，缺乏更广泛人群的验证	探究动脉粥样硬化斑块的表观遗传年龄加速对心血管事件风险的预测能力	研究对象包括485例人类颈动脉动脉粥样硬化斑块和93例血液样本	数字病理	心血管疾病	全基因组DNA甲基化分析和单细胞RNA测序	Cox回归模型	血液和组织样本	总样本数为578例，其中斑块样本485例，血液样本93例
537	2024-08-05	NK Cell-Monocyte Cross-talk Underlies NK Cell Activation in Severe COVID-19 2024-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2300731 PMID:38578283	研究论文	这篇文章探讨了重症COVID-19患者外周血中的NK细胞与单核细胞之间的相互作用及其对NK细胞激活和功能障碍的影响	首次结合了细胞间通讯分析与体外原代细胞共培养实验，以揭示COVID-19中NK细胞功能障碍的机制	仅在体外模型中进行验证，尚未在活体系统中进行全面观察	了解重症COVID-19中NK细胞功能障碍的机制	重症COVID-19患者的NK细胞和单核细胞	免疫学	COVID-19	单细胞RNA测序，体外共培养实验	NA	细胞数据	健康供体的NK细胞与来自重症COVID-19患者或健康供体的单核细胞共培养
538	2024-08-05	Integration of multiomics analyses reveals unique insights into CD24-mediated immunosuppressive tumor microenvironment of breast cancer 2024-Jun, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2 DOI:10.1007/s00011-024-01882-9 PMID:38622285	研究论文	本研究揭示了CD24介导的乳腺癌免疫抑制肿瘤微环境的独特见解	使用多组学分析方法深入探索了CD24与免疫细胞的相互作用及其对预后模型的影响	未探讨所有可能的免疫标志物，可能限制了研究的全面性	探讨CD24在乳腺癌中的免疫调节作用及其作为免疫治疗靶点的潜力	CD24相关基因及其与免疫细胞之间的相互作用	数字病理学	乳腺癌	scRNA-seq和MQIF	机器学习预后模型	基因表达数据	基于 bulk RNA-seq 数据构建的风险模型包含1488个差异基因
539	2024-08-05	Integrated single-cell transcriptome and T cell receptor profiling reveals defects of T cell exhaustion in pulmonary tuberculosis 2024-Jun, The Journal of infection IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.jinf.2024.106158 PMID:38642678	研究论文	本研究利用单细胞转录组学和T细胞受体分析揭示了肺结核中T细胞耗竭的缺陷。	首次探索了肺结核中T细胞耗竭的功能障碍，并揭示了CD8+ T细胞的耗竭水平显著降低。	未能完全明确慢性炎症的性质和免疫抑制细胞的特定作用	探讨肺结核中T细胞耗竭的功能障碍及其可能的影響	研究了肺结核患者中的T细胞耗竭响应与免疫抑制细胞	数字病理学	肺结核	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
540	2024-08-04	Single-cell sequencing reveals distinct immune cell features in cutaneous lesions of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid 2024-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110219 PMID:38631594	研究论文	本研究通过单细胞测序揭示了天疱疮和大疱性类天疱疮皮肤损伤中的免疫细胞特征	首次通过单细胞RNA测序和单细胞VDJ测序详细分析了BP和PV皮肤损伤中的免疫细胞组成和状态	对皮肤损伤中的免疫特征的认识仍然有限，可能需要更大的样本量和其他生物标志物的验证	探究BP和PV皮肤损伤中的免疫细胞特征和转录谱	大疱性类天疱疮和天疱疮患者的皮肤病变	数字病理学	大疱性类天疱疮，天疱疮	单细胞RNA测序，单细胞VDJ测序	NA	细胞转录组数据	涉及BP和PV患者的皮肤损伤样本