单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
501	2024-08-05	A Subpopulation of Luminal Progenitors Secretes Pleiotrophin to Promote Angiogenesis and Metastasis in Inflammatory Breast Cancer 2024-Jun-04, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2640 PMID:38507720	研究论文	本文揭示了在炎性乳腺癌中，某一亚群的腔道祖细胞分泌多效生长因子以促进血管生成和转移	发现腔道祖细胞通过分泌多效生长因子PTN与内皮尖细胞相互作用，从而促进炎性乳腺癌的血管生成和转移	未提及本研究的局限性	探讨炎性乳腺癌中微环境对疾病表型的影响	炎性乳腺癌患者的单细胞RNA测序和血清分析	数字病理学	炎性乳腺癌	单细胞RNA测序、复合染色、血清分析	NA	NA	在炎性乳腺癌患者中进行的分析样本量未明确提及
502	2024-08-05	The ω-3 Polyunsaturated Fatty Acid Docosahexaenoic Acid Enhances NK-Cell Antitumor Effector Functions 2024-Jun-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0359 PMID:38526128	研究论文	本研究探讨了ω-3多不饱和脂肪酸二十二碳六烯酸（DHA）在免疫 competent 小鼠中抑制肿瘤生长的免疫调节作用	揭示了DHA通过上调PGC-1α信号介导的线粒体氧化磷酸化活性增强NK细胞抗肿瘤效应的机制	未具体说明其他免疫细胞的变化	研究DHA在抑制肿瘤生长方面的作用及其机制	DHA对免疫 competent 小鼠中NK细胞抗肿瘤效应的影响	数字病理学	肿瘤	单细胞RNA测序	小鼠B16F10黑色素瘤模型	细胞和组织样本	使用Rag2-/-小鼠和NK细胞耗竭的实验
503	2024-08-07	Author Correction: Gene-expression memory-based prediction of cell lineages from scRNA-seq datasets 2024-Jun-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48978-8 PMID:38834555	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
504	2024-08-04	Single-cell and genome-wide Mendelian randomization identifies causative genes for gout 2024-Jun-03, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-024-03348-z PMID:38831441	研究论文	本研究探讨了痛风疾病中基因表达调控的机制及其发病机制	识别了17个与痛风相关的独特遗传位点以及三个与痛风因果关联的蛋白	未在标题和摘要中具体提及研究的限制	研究痛风的发病机制及基因表达调控	基于GWAS、单细胞转录组学和相关数据分析痛风基因	数字病理学	痛风	GWAS, scRNA-seq, eQTL, mQTL, 孟德尔随机化	NA	基因组数据	NA
505	2024-08-04	Single-cell and spatial transcriptomics reveal alterations in trophoblasts at invasion sites and disturbed myometrial immune microenvironment in placenta accreta spectrum disorders 2024-Jun-03, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-024-00598-6 PMID:38831319	研究论文	本研究揭示了胎盘植入谱系障碍（PAS）中滋养层细胞的变化及子宫肌层免疫微环境的干扰	通过单细胞RNA测序和空间转录组学，首次系统描述了PAS中滋养层细胞的细胞组成和空间组织	样本数量较小，仅包括四名PAS患者，可能影响结论的广泛适用性	探讨胎盘植入谱系障碍的机制，特别是滋养层细胞在其中的作用	来自四名PAS患者和三名健康孕妇的组织样本	数字病理学	胎盘植入谱系障碍	空间转录组学（ST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	组织样本	7个样本（包括4个PAS患者的组织样本和3个健康孕妇的子宫肌层样本）
506	2024-08-04	Single-cell RNA-seq of in vitro expanded cells from cranial neural crest reveals a rare odontogenic sub-population 2024-Jun, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13598 PMID:38196265	研究论文	本文研究了体外扩增的颅神经嵴细胞的单细胞RNA测序，揭示了稀有的成牙亚群体	首次分析了体外培养的颅神经嵴细胞的细胞图谱，并识别了稀有的Alx3+/Barx1+亚群体	仅在小鼠模型中进行实验，可能限制了结果的广泛性	探讨体外培养的颅神经嵴细胞在成牙过程中的细胞异质性	体外培养的小鼠颅神经嵴细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞	包括初级细胞和传代5的细胞
507	2024-08-05	Neutrophil and macrophage crosstalk might be a potential target for liver regeneration 2024-Jun, FEBS open bio IF:2.8Q3 DOI:10.1002/2211-5463.13803 PMID:38710666	研究论文	该研究探讨了中性粒细胞与巨噬细胞之间的相互作用在肝脏再生中的潜在作用	研究揭示了中性粒细胞在肝脏再生中的关键作用及其与巨噬细胞之间复杂的相互作用	该研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类	探讨中性粒细胞在肝脏再生中的角色	小鼠部分肝切除模型中的肝细胞和非实质细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型中的多个样本
508	2024-08-05	Neutrophil-derived PAD4 induces citrullination of CKMT1 exacerbates mucosal inflammation in inflammatory bowel disease 2024-Jun, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-024-01158-6 PMID:38720063	研究论文	本研究探讨了中性粒细胞衍生的PAD4在炎症性肠病中的作用	发现PAD4通过对CKMT1进行瓜氨酸化来调节肠上皮细胞的可塑性，提出PAD4作为IBD潜在治疗靶点	研究主要使用小鼠模型，临床分析结果需要进一步验证	了解PAD4在炎症性肠病中的确切角色	探讨中性粒细胞衍生的PAD4和CKMT1在IBD中的关系	数字病理学	炎症性肠病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	小鼠模型	基因表达数据	使用了多个小鼠模型和临床IBD患者数据
509	2024-08-05	The Transpeptidase Sortase A Binds Nucleic Acids and Mediates Mammalian Cell Labeling 2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202305605 PMID:38581131	研究论文	这篇文章探讨了金黄色葡萄球菌的Sortase A与核酸的相互作用及其在哺乳动物细胞标记中的应用	发现Sortase A与核酸的未知相互作用，并利用这一特性开发了CellID技术	未详细阐述Sortase A在其他细胞类型中的普遍适用性	研究Sortase A与核酸的相互作用及其在细胞标记中的应用	金黄色葡萄球菌Sortase A及其与哺乳动物细胞的相互作用	生物技术	NA	CRISPR筛选，scRNA-seq	NA	核酸，细胞表面标记	涉及金黄色葡萄球菌和哺乳动物细胞的多样本
510	2024-08-05	Impact of benzo[a]pyrene, PCB153 and sex hormones on human ESC-Derived thyroid follicles using single cell transcriptomics 2024-Jun, Environment international IF:10.3Q1 DOI:10.1016/j.envint.2024.108748 PMID:38763096	研究论文	本研究探讨了人类胚胎干细胞衍生的甲状腺小体在不同性别激素环境下对内分泌干扰物的反应	该研究首次应用单细胞转录组学研究了内分泌干扰物在不同激素背景下的影响	研究仅在体外环境中进行，未能模拟完整的生理状态	研究内分泌干扰物如何影响人类甲状腺功能及不同性别激素的作用	人类胚胎干细胞衍生的甲状腺小体	数字病理学	甲状腺疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
511	2024-08-05	Insights into the heterogeneity of the tumor microenvironment in lung adenocarcinoma and squamous carcinoma through single-cell transcriptomic analysis: Implications for distinct immunotherapy outcomes 2024-Jun, The journal of gene medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1002/jgm.3694 PMID:38847309	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌和鳞癌肿瘤微环境的异质性及其对免疫治疗结果的影响	首次通过单细胞RNA测序揭示肺腺癌与鳞癌在肿瘤免疫微环境上的显著差异	研究仅基于38例非小细胞肺癌患者，样本量较小	探讨肺腺癌和鳞癌之间在肿瘤微环境及免疫治疗反应上的差异	38例非小细胞肺癌患者	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	38例非小细胞肺癌患者
512	2024-08-05	Characterization of a Human Respiratory Mucosa Model to Study Odorant Metabolism 2024-Jun-05, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c00752 PMID:38775624	研究论文	本文研究了人类呼吸粘膜模型，以探索气味物质代谢	首次揭示了组织工程化人类呼吸粘膜模型的XME特征，并证明其适合用于研究鼻腔气味物质代谢	该研究主要集中在特定的代谢酶上，其他酶的角色尚未探索	研究人类鼻腔呼吸粘膜在气味物质代谢中的作用	人类呼吸组织模型及其内部的代谢酶活动	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	组织工程化模型	生物实验数据	NA
513	2024-08-04	Memory/Active T-Cell Activation Is Associated with Immunotherapeutic Response in Fumarate Hydratase-Deficient Renal Cell Carcinoma 2024-Jun-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-2760 PMID:38512114	研究论文	本研究探讨了记忆/活跃T细胞激活与富马酸酯水合酶缺乏型肾细胞癌免疫治疗反应之间的关系	识别了一种与ICI+TKI治疗有效性相关的记忆和效应T细胞的特征	需要进一步验证记忆/活跃T细胞特征与治疗效果之间的关联	研究富马酸酯水合酶缺乏型肾细胞癌的最佳治疗和分子相关性	91名来自15个医疗中心的富马酸酯水合酶缺乏型肾细胞癌患者	数字病理学	肾癌	RNA测序	NA	基因组数据和RNA数据	91名患者
514	2024-08-05	Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates 2024-Jun, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-024-01831-y PMID:38698087	研究论文	该文章研究了亲和力成熟的浆细胞的发育动态和基因组程序。	文章提出了一个新的浆细胞转变状态，并揭示了浆细胞前体的增殖和编程模型	研究主要基于小鼠模型，结果可能在其他物种中不完全适用	阐明抗原特异性浆细胞前体的发展动态和基因组程序	浆细胞前体，特别是长寿命骨髓浆细胞的生成	NA	NA	单细胞RNA测序和B细胞抗原受体测序	NA	NA	使用小鼠模型进行实验
515	2024-08-05	Plasma proteome analysis implicates novel proteins as potential therapeutic targets for chronic kidney disease: A proteome-wide association study 2024-Jun-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31704 PMID:38828357	研究论文	该研究通过全基因组关联研究结合人类血浆蛋白组学识别与慢性肾病相关的新型蛋白。	本研究首次系统性识别出22种与慢性肾病显著相关的血浆蛋白，其中INHBC、LMAN2和SNUPN被提出作为新的治疗靶点。	研究集中于特定种类的已知蛋白，可能存在未识别新的潜在靶点的局限。	识别与慢性肾病发病机制相关的新型蛋白和潜在的治疗靶点。	研究涉及与慢性肾病相关的22种血浆蛋白及其在疾病中的作用。	数字病理学	慢性肾病	单细胞RNA测序	NA	蛋白质组数据	分析了健康人类和小鼠肾脏的单细胞RNA测序数据，具体样本量未列明
516	2024-08-05	Comprehensive analysis of gene signatures associated with aging in human aortic dissection 2024-Jun-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31298 PMID:38828294	研究论文	本文通过生物信息学分析探讨了与人类主动脉夹层相关的衰老基因签名。	研究识别了与衰老相关的枢纽基因，并提出了ESR1下调可能加重主动脉夹层的假说。	研究需要进一步验证有关ESR1在主动脉夹层形成中的作用，尤其是在临床环境中。	分析衰老相关基因与主动脉夹层的关联，以提供新见解和治疗策略。	衰老相关基因及其在主动脉夹层中表达的调控网络。	数字病理学	主动脉夹层	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	涉及从13名主动脉夹层患者的197,605个主动脉细胞中获得的数据
517	2024-08-05	Molecular characterization of nodose ganglia development reveals a novel population of Phox2b+ glial progenitors in mice 2024-Jun-03, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience DOI:10.1523/JNEUROSCI.1441-23.2024 PMID:38830761	研究论文	本文研究了迷走神经结的发展，并发现了一种新的Phox2b+胶质前体细胞群体	揭示了迷走神经结的胶质前体细胞具有独特的转录程序，并且这些细胞能够产生自主神经元	对迷走神经胶质细胞的发育基因程序尚未完全理解	探究迷走神经结中的胶质细胞前体的发育和转录特征	以小鼠为研究对象，分析迷走神经结中胶质前体细胞的性质	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA数据	小鼠，性别不限
518	2024-08-04	Mitochondrial RNA modification-based signature to predict prognosis of lower grade glioma: a multi-omics exploration and verification study 2024-06-01, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-63592-w PMID:38824202	研究论文	该研究探讨了线粒体RNA修饰在低级别胶质瘤预后中的作用	提出了一种基于线粒体RNA修饰的评分系统以预测低级别胶质瘤的预后，并通过多组学数据进行验证	线粒体RNA修饰相关基因的作用机制可能尚未完全解释	研究线粒体RNA修饰对低级别胶质瘤的影响及其预后预测能力	低级别胶质瘤及其相关的线粒体RNA修饰基因	数字病理学	低级别胶质瘤	RNA-seq	LASSO回归, 随机生存森林	基因表达数据	1120个正常脑组织样本和529个低级别胶质瘤样本
519	2024-08-05	Single-cell and bulk RNA sequencing reveal heterogeneity and diagnostic markers in papillary thyroid carcinoma lymph-node metastasis 2024-Jun, Journal of endocrinological investigation IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s40618-023-02262-6 PMID:38146045	研究论文	本研究分析了乳头状甲状腺癌的淋巴结转移，寻找诊断标记物和治疗靶点	首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，探索了乳头状甲状腺癌淋巴结转移的异质性	研究中样本量有限，仅包括66名患者的样本	旨在发现乳头状甲状腺癌淋巴结转移的诊断标记物及治疗靶点	研究对象为乳头状甲状腺癌患者的淋巴结转移细胞	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和常规模RNA测序（RNA-seq）	NA	RNA	66名乳头状甲状腺癌患者的样本
520	2024-08-04	Dynamic Single-Cell RNA-Seq reveals mechanism of Selinexor-Resistance in Chronic myeloid leukemia 2024-Jun-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112212 PMID:38728882	研究论文	本研究揭示了慢性髓性白血病中Selinexor耐药的机制	首次通过动态单细胞RNA测序分析慢性髓性白血病中selinexor耐药相关的基因表达变化	本研究仅限于K562细胞系，可能无法完全代表所有CML中的耐药性	探讨慢性髓性白血病中selinexor的耐药机制	建立了对selinexor耐药的K562细胞系	数字病理学	慢性髓性白血病	动态单细胞RNA测序	NA	RNA	对亲本和耐药细胞群体进行了多样性分析