单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 553 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-08-04 |
Smoking-induced CCNA2 expression promotes lung adenocarcinoma tumorigenesis by boosting AT2/AT2-like cell differentiation
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216922
PMID:38704137
|
研究论文 | 该论文探讨了吸烟诱导的CCNA2表达如何通过促进AT2/AT2样细胞的分化来促进肺腺癌肿瘤发生 | 揭示了吸烟诱导的CCNA2过表达及其对WNT/β-catenin信号通路的抑制作为控制AT2细胞分化和肺腺癌肿瘤发生的新机制 | 研究中没有探讨其他可能影响CCNA2表达和肿瘤发生的因素 | 本研究旨在探讨吸烟如何影响与肺腺癌相关的AT2细胞分化机制 | 研究对象为肺腺癌及其相关细胞，特别关注AT2细胞及其转变为AT2样细胞的过程 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含147个差异表达基因的分析 |
| 482 | 2024-08-05 |
Adipocyte Progenitor Pools Composition and Cellular Niches Affect Adipogenesis Divergence in Porcine Subcutaneous and Intramuscular Fat
2024-Jun-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c01044
PMID:38848240
|
研究论文 | 本研究探讨了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成过程中的差异 | 揭示了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成的内在和微环境机制上的新发现 | 研究可能未涵盖所有脂肪细胞类型的差异 | 深入理解猪的皮下脂肪和内脏脂肪间的脂肪生成差异 | 研究对象为猪的皮下脂肪和内脏脂肪细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 未具体提到样本量 |
| 483 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a high glycolysis B cell and tumor-associated macrophages cluster correlated with poor prognosis and exhausted immune microenvironment in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00605-w
PMID:38840205
|
研究论文 | 这项研究揭示了与差生大B细胞淋巴瘤相关的高糖酵解B细胞和肿瘤相关巨噬细胞群体的代谢特征。 | 创新点在于首次利用单细胞转录组学和空间转录组学揭示糖酵解在DLBCL进展中的作用及其与免疫微环境的关系。 | 样本量相对有限，可能影响结果的普遍性和推广性。 | 研究DLBCL进展中的代谢特征，为个性化治疗提供依据。 | 研究对象包括高度恶性DLBCL细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、免疫荧光 | NA | 多组学数据 | 5个单细胞转录组样本，966个总体转录组样本，10个空间转录组样本，34个免疫组化样本和20个免疫荧光样本 |
| 484 | 2024-08-04 |
HyperGCN: an effective deep representation learning framework for the integrative analysis of spatial transcriptomics data
2024-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10469-x
PMID:38840049
|
研究论文 | 本文提出了HyperGCN框架用于空间转录组数据的综合分析 | HyperGCN利用超图引导的图卷积网络处理高几何复杂度的组织，提升了空间转录组数据的分析能力 | NA | 研究空间转录组数据的综合分析方法 | 来自不同组织和技术的数据集，包括人类前额叶皮层、人类乳腺肿瘤等 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | 超图卷积网络 | 转录组数据 | 四个真实数据集，包括不同组织和技术 |
| 485 | 2024-08-07 |
Author Correction: Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48984-w
PMID:38839746
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-08-05 |
Integrative bioinformatics approach yields a novel gene expression risk model for prognosis and progression prediction in prostate cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18405
PMID:38842134
|
研究论文 | 本文构建了一个基于基因表达的新型前列腺癌预后和进展预测风险模型 | 开发了一个整合多种数据集的风险模型，并鉴定出八个独立预后因子 | 模型的验证仅通过一个独立数据集进行，可能限制了其广泛适用性 | 旨在建立一个有效的前列腺癌进展预测模型 | 前列腺癌患者，重点分析基因表达与无进展生存期之间的关系 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两例去势相关前列腺癌和两例激素相关前列腺癌样本 |
| 487 | 2024-08-05 |
3D model of mouse embryonic pancreas and endocrine compartment using stem cell-derived mesoderm and pancreatic progenitors
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109959
PMID:38832019
|
研究论文 | 本研究旨在通过将小鼠胚胎干细胞分化为中胚层祖细胞和胰腺祖细胞来生成胰腺聚集体 | 该工作使用干细胞衍生的中胚层和胰腺前体生成胰腺模型，且不使用Matrigel，首次展示了PP与MP聚集的效果 | 该研究可能在组织的形态和功能复现方面存在局限性，未考虑其他可能影响胰腺发育的因素 | 研究小鼠胰腺的发育及其内分泌腺的形成机制 | 小鼠胚胎干细胞及其衍生的中胚层祖细胞和胰腺祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 488 | 2024-08-05 |
Molecular maps of synovial cells in inflammatory arthritis using an optimized synovial tissue dissociation protocol
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109707
PMID:38832018
|
研究论文 | 本研究优化了滑膜组织活检的解离方法，为单细胞组学研究创建了人类滑膜在炎症性关节炎中的单细胞图谱 | 提出了一种有效的滑膜解离方法，并建立了包含多种滑膜细胞亚群的新型单细胞RNA-seq图谱 | 研究中仅涉及了25个滑膜组织样本，可能限制结果的普适性 | 优化滑膜组织解离协议，以提升单细胞组学研究的效率 | 来自25个患有炎症性关节炎的滑膜组织的单细胞 | 数字病理学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及25个滑膜组织样本，包含超过100,000个未分拣的滑膜细胞 |
| 489 | 2024-08-05 |
Qi Lang formula relieves constipation via targeting SCF/c-kit signaling pathway: An integrated study of network pharmacology and experimental validation
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31860
PMID:38841509
|
研究论文 | 本研究探讨了Qi Lang公式（QLF）通过靶向SCF/c-kit信号通路在缓解便秘中的作用 | 阐明了QLF在促进ICC增殖以及恢复神经递质水平的机制 | 本研究仅在大鼠模型中进行，可能限制了其临床应用的普遍性 | 揭示Qi Lang公式缓解便秘的潜在机制 | 通过分析QLF及其靶点来研究与ICC相关的便秘 | 数字病理学 | 便秘 | UPLC-MS/MS, scRNA-seq, ELISA, Western blot, 免疫荧光 | NA | NA | 使用大鼠模型进行实验，具体样本数量未说明 |
| 490 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Uncovers Striking Cellular Heterogeneity of Lung-Infiltrating Regulatory T Cells during Eosinophilic versus Neutrophilic Allergic Airway Inflammation
2024-Jun-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300646
PMID:38647384
|
研究论文 | 这篇文章揭示了肺内浸润的调节性T细胞在不同类型的过敏性气道炎症中的显著细胞异质性 | 提出了一种新机制，表明不同类型的炎症可能导致表型独特的肺驻留调节性T细胞的形成 | 未探讨不同的过敏气道炎症反应是否影响浸润的调节性T细胞异质性或肺驻留特征 | 研究不同类型的过敏性气道炎症中肺浸润调节性T细胞的异质性 | 肺内浸润的调节性T细胞，重点关注嗜酸性和中性粒细胞介导的炎症模型 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | N/A | N/A | N/A |
| 491 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA-seq unveils the immune infiltration landscape associated with cuproptosis in cerebral cavernous malformations
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00603-y
PMID:38835051
|
研究论文 | 该研究揭示了与杯死亡相关的分子特征在脑海绵状血管畸形中的作用 | 首次展示了杯死亡与脑海绵状血管畸形病理之间的分子联系以及新识别的三个关键基因 | 研究中的样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨与脑海绵状血管畸形发展相关的杯死亡分子特征 | 分析了15例脑海绵状血管畸形样本和6例对照样本 | 数字病理学 | 脑海绵状血管畸形 | RNA测序 | 机器学习模型（LASSO和随机森林） | 基因表达数据 | 15例脑海绵状血管畸形样本和6例对照样本 |
| 492 | 2024-08-04 |
Deciphering the role of zinc homeostasis in the tumor microenvironment and prognosis of prostate cancer
2024-Jun-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01006-z
PMID:38833013
|
研究论文 | 这篇文章探讨了锌稳态在前列腺癌肿瘤微环境和预后中的作用 | 构建了锌稳态模式亚型并开发了锌稳态相关风险评分以改进前列腺癌预后预测 | 锌稳态在前列腺癌中的具体影响尚未完全探明 | 研究锌稳态在前列腺癌中的作用及其对预后的影响 | 前列腺癌患者的临床样本和相关基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序，贝叶斯网络推断 | 多种机器学习算法 | 临床样本，基因组数据 | NA |
| 493 | 2024-08-04 |
Specialized Tfh cell subsets driving type-1 and type-2 humoral responses in lymphoid tissue
2024-Jun-04, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00681-0
PMID:38834551
|
研究论文 | 该研究探讨了T滤泡辅助细胞(Tfh)在类型1和类型2免疫反应中的特化功能 | 通过机器学习方法建立了能够区分Tfh1和Tfh2细胞的基因表达特征 | 缺乏对人类免疫反应的全面验证，主要基于小鼠模型 | 研究在不同免疫状况下Tfh细胞的特殊化以及其在生发中心中的功能 | 聚焦于Tfh细胞在类型1和类型2免疫反应下的特化及其在淋巴结中的定位 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学，机器学习 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本和人类个体样本 |
| 494 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptome atlas of testes from mice with high-fat diets
2024-Jun-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03435-5
PMID:38834587
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序分析了高脂饮食导致肥胖小鼠睾丸中的细胞变化 | 这是首个在饮食诱导肥胖小鼠睾丸中应用单细胞RNA测序的研究，提供了对肥胖相关男性生殖损伤的新见解 | 在分子水平上，肥胖对睾丸的影响仍然缺乏全面探讨 | 研究肥胖对小鼠睾丸非生精细胞和生精过程的影响 | 分析来自肥胖和瘦小鼠的睾丸细胞数据 | 数字病理学 | 肥胖相关生殖健康问题 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 70,000个细胞 |
| 495 | 2024-08-05 |
A Subpopulation of Luminal Progenitors Secretes Pleiotrophin to Promote Angiogenesis and Metastasis in Inflammatory Breast Cancer
2024-Jun-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2640
PMID:38507720
|
研究论文 | 本文揭示了在炎性乳腺癌中，某一亚群的腔道祖细胞分泌多效生长因子以促进血管生成和转移 | 发现腔道祖细胞通过分泌多效生长因子PTN与内皮尖细胞相互作用，从而促进炎性乳腺癌的血管生成和转移 | 未提及本研究的局限性 | 探讨炎性乳腺癌中微环境对疾病表型的影响 | 炎性乳腺癌患者的单细胞RNA测序和血清分析 | 数字病理学 | 炎性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、复合染色、血清分析 | NA | NA | 在炎性乳腺癌患者中进行的分析样本量未明确提及 |
| 496 | 2024-08-05 |
The ω-3 Polyunsaturated Fatty Acid Docosahexaenoic Acid Enhances NK-Cell Antitumor Effector Functions
2024-Jun-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0359
PMID:38526128
|
研究论文 | 本研究探讨了ω-3多不饱和脂肪酸二十二碳六烯酸（DHA）在免疫 competent 小鼠中抑制肿瘤生长的免疫调节作用 | 揭示了DHA通过上调PGC-1α信号介导的线粒体氧化磷酸化活性增强NK细胞抗肿瘤效应的机制 | 未具体说明其他免疫细胞的变化 | 研究DHA在抑制肿瘤生长方面的作用及其机制 | DHA对免疫 competent 小鼠中NK细胞抗肿瘤效应的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠B16F10黑色素瘤模型 | 细胞和组织样本 | 使用Rag2-/-小鼠和NK细胞耗竭的实验 |
| 497 | 2024-08-07 |
Author Correction: Gene-expression memory-based prediction of cell lineages from scRNA-seq datasets
2024-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48978-8
PMID:38834555
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-08-04 |
Single-cell and genome-wide Mendelian randomization identifies causative genes for gout
2024-Jun-03, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03348-z
PMID:38831441
|
研究论文 | 本研究探讨了痛风疾病中基因表达调控的机制及其发病机制 | 识别了17个与痛风相关的独特遗传位点以及三个与痛风因果关联的蛋白 | 未在标题和摘要中具体提及研究的限制 | 研究痛风的发病机制及基因表达调控 | 基于GWAS、单细胞转录组学和相关数据分析痛风基因 | 数字病理学 | 痛风 | GWAS, scRNA-seq, eQTL, mQTL, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据 | NA |
| 499 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal alterations in trophoblasts at invasion sites and disturbed myometrial immune microenvironment in placenta accreta spectrum disorders
2024-Jun-03, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00598-6
PMID:38831319
|
研究论文 | 本研究揭示了胎盘植入谱系障碍（PAS）中滋养层细胞的变化及子宫肌层免疫微环境的干扰 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，首次系统描述了PAS中滋养层细胞的细胞组成和空间组织 | 样本数量较小，仅包括四名PAS患者，可能影响结论的广泛适用性 | 探讨胎盘植入谱系障碍的机制，特别是滋养层细胞在其中的作用 | 来自四名PAS患者和三名健康孕妇的组织样本 | 数字病理学 | 胎盘植入谱系障碍 | 空间转录组学（ST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 7个样本（包括4个PAS患者的组织样本和3个健康孕妇的子宫肌层样本） |
| 500 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq of in vitro expanded cells from cranial neural crest reveals a rare odontogenic sub-population
2024-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13598
PMID:38196265
|
研究论文 | 本文研究了体外扩增的颅神经嵴细胞的单细胞RNA测序，揭示了稀有的成牙亚群体 | 首次分析了体外培养的颅神经嵴细胞的细胞图谱，并识别了稀有的Alx3+/Barx1+亚群体 | 仅在小鼠模型中进行实验，可能限制了结果的广泛性 | 探讨体外培养的颅神经嵴细胞在成牙过程中的细胞异质性 | 体外培养的小鼠颅神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括初级细胞和传代5的细胞 |