单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 563 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-08-05 |
Remodeling ceramide homeostasis promotes functional maturation of human pluripotent stem cell-derived β cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.010
PMID:38697109
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研究论文 | 该研究探讨了人类多能干细胞来源的β细胞的功能成熟过程 | 揭示了蜕膜代谢重塑，尤其是对神经酰胺代谢活动的下调对β细胞成熟的重要性 | 研究中具体的细胞标志物和环境因素对成熟过程的影响未深入探讨 | 研究人类胰腺β细胞的成熟机制及其功能获得 | 人类多能干细胞来源的β细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单细胞转座酶易接触染色质测序 (scATAC-seq) | NA | NA | NA |
| 482 | 2024-08-05 |
Neuronal cell populations in circumoral nerve ring of sea cucumber Apostichopus japonicus: Ultrastructure and transcriptional profile
2024-Jun-05, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101263
PMID:38850626
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研究论文 | 本文观察了海参Apostichopus japonicus中环口神经环内神经细胞的超微结构和转录特征 | 首次应用单细胞RNA测序研究海参中神经细胞的转录特征并识别了六种神经细胞类型 | 缺乏对神经细胞功能及其在生态系统中作用的进一步研究 | 研究海参神经细胞的超微结构以及其转录特征 | 海参Apostichopus japonicus的环口神经环中的神经细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 六种神经细胞类型 |
| 483 | 2024-08-05 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jun-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序建立了成蚊Aedes aegypti中肠细胞图谱 | 首次建立了Aedes aegypti中肠单细胞RNA测序的分离和测序协议 | 缺乏对已知转录组的重复性验证和其他中肠细胞的功能研究 | 研究Aedes aegypti中肠细胞类型及其在arbovirus感染中的作用 | Aedes aegypti成虫的中肠细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | NA |
| 484 | 2024-08-04 |
Modifications of lipid pathways restrict SARS-CoV-2 propagation in human induced pluripotent stem cell-derived 3D airway organoids
2024-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.08.005
PMID:37557954
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研究论文 | 本研究探讨了脂质代谢修改如何限制SARS-CoV-2在类人气道器官中的传播 | 通过建立人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，首次揭示了脂质通路修改对SARS-CoV-2传播的限制作用 | 本研究主要基于体外模型，尚需进一步验证在真实生物体中的效果 | 揭示脂质代谢在COVID-19病毒感染中的作用机制 | 人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，主要关注SARS-CoV-2的感染和传播 | 数字病理学 | 新冠病毒感染 | 单细胞测序（ScRNAseq） | 气道类器官（iPSC-AOs） | 细胞与分子生物数据 | NA |
| 485 | 2024-08-05 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
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评论 | 本文回顾了单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用和转录组权衡。 | 提出了单细胞RNA测序(scRNA-seq)作为一种创新且尚未充分利用的技术，提供了独特的细胞层面转录组分析视角。 | 需要考虑传统方法与scRNA-seq之间的权衡。 | 探讨单细胞RNA测序在生殖毒理学中的应用及其对毒性物质暴露的响应。 | 主要研究斑马鱼的个体细胞基因表达谱。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 486 | 2024-08-04 |
Smoking-induced CCNA2 expression promotes lung adenocarcinoma tumorigenesis by boosting AT2/AT2-like cell differentiation
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216922
PMID:38704137
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研究论文 | 该论文探讨了吸烟诱导的CCNA2表达如何通过促进AT2/AT2样细胞的分化来促进肺腺癌肿瘤发生 | 揭示了吸烟诱导的CCNA2过表达及其对WNT/β-catenin信号通路的抑制作为控制AT2细胞分化和肺腺癌肿瘤发生的新机制 | 研究中没有探讨其他可能影响CCNA2表达和肿瘤发生的因素 | 本研究旨在探讨吸烟如何影响与肺腺癌相关的AT2细胞分化机制 | 研究对象为肺腺癌及其相关细胞，特别关注AT2细胞及其转变为AT2样细胞的过程 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含147个差异表达基因的分析 |
| 487 | 2024-08-05 |
Adipocyte Progenitor Pools Composition and Cellular Niches Affect Adipogenesis Divergence in Porcine Subcutaneous and Intramuscular Fat
2024-Jun-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c01044
PMID:38848240
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研究论文 | 本研究探讨了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成过程中的差异 | 揭示了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成的内在和微环境机制上的新发现 | 研究可能未涵盖所有脂肪细胞类型的差异 | 深入理解猪的皮下脂肪和内脏脂肪间的脂肪生成差异 | 研究对象为猪的皮下脂肪和内脏脂肪细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 未具体提到样本量 |
| 488 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a high glycolysis B cell and tumor-associated macrophages cluster correlated with poor prognosis and exhausted immune microenvironment in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00605-w
PMID:38840205
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研究论文 | 这项研究揭示了与差生大B细胞淋巴瘤相关的高糖酵解B细胞和肿瘤相关巨噬细胞群体的代谢特征。 | 创新点在于首次利用单细胞转录组学和空间转录组学揭示糖酵解在DLBCL进展中的作用及其与免疫微环境的关系。 | 样本量相对有限，可能影响结果的普遍性和推广性。 | 研究DLBCL进展中的代谢特征，为个性化治疗提供依据。 | 研究对象包括高度恶性DLBCL细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、免疫荧光 | NA | 多组学数据 | 5个单细胞转录组样本，966个总体转录组样本，10个空间转录组样本，34个免疫组化样本和20个免疫荧光样本 |
| 489 | 2024-08-04 |
HyperGCN: an effective deep representation learning framework for the integrative analysis of spatial transcriptomics data
2024-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10469-x
PMID:38840049
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研究论文 | 本文提出了HyperGCN框架用于空间转录组数据的综合分析 | HyperGCN利用超图引导的图卷积网络处理高几何复杂度的组织，提升了空间转录组数据的分析能力 | NA | 研究空间转录组数据的综合分析方法 | 来自不同组织和技术的数据集，包括人类前额叶皮层、人类乳腺肿瘤等 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | 超图卷积网络 | 转录组数据 | 四个真实数据集，包括不同组织和技术 |
| 490 | 2024-08-07 |
Author Correction: Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48984-w
PMID:38839746
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2024-08-05 |
Integrative bioinformatics approach yields a novel gene expression risk model for prognosis and progression prediction in prostate cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18405
PMID:38842134
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研究论文 | 本文构建了一个基于基因表达的新型前列腺癌预后和进展预测风险模型 | 开发了一个整合多种数据集的风险模型，并鉴定出八个独立预后因子 | 模型的验证仅通过一个独立数据集进行，可能限制了其广泛适用性 | 旨在建立一个有效的前列腺癌进展预测模型 | 前列腺癌患者，重点分析基因表达与无进展生存期之间的关系 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两例去势相关前列腺癌和两例激素相关前列腺癌样本 |
| 492 | 2024-08-05 |
3D model of mouse embryonic pancreas and endocrine compartment using stem cell-derived mesoderm and pancreatic progenitors
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109959
PMID:38832019
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研究论文 | 本研究旨在通过将小鼠胚胎干细胞分化为中胚层祖细胞和胰腺祖细胞来生成胰腺聚集体 | 该工作使用干细胞衍生的中胚层和胰腺前体生成胰腺模型，且不使用Matrigel，首次展示了PP与MP聚集的效果 | 该研究可能在组织的形态和功能复现方面存在局限性，未考虑其他可能影响胰腺发育的因素 | 研究小鼠胰腺的发育及其内分泌腺的形成机制 | 小鼠胚胎干细胞及其衍生的中胚层祖细胞和胰腺祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 493 | 2024-08-05 |
Molecular maps of synovial cells in inflammatory arthritis using an optimized synovial tissue dissociation protocol
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109707
PMID:38832018
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研究论文 | 本研究优化了滑膜组织活检的解离方法，为单细胞组学研究创建了人类滑膜在炎症性关节炎中的单细胞图谱 | 提出了一种有效的滑膜解离方法，并建立了包含多种滑膜细胞亚群的新型单细胞RNA-seq图谱 | 研究中仅涉及了25个滑膜组织样本，可能限制结果的普适性 | 优化滑膜组织解离协议，以提升单细胞组学研究的效率 | 来自25个患有炎症性关节炎的滑膜组织的单细胞 | 数字病理学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及25个滑膜组织样本，包含超过100,000个未分拣的滑膜细胞 |
| 494 | 2024-08-05 |
Qi Lang formula relieves constipation via targeting SCF/c-kit signaling pathway: An integrated study of network pharmacology and experimental validation
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31860
PMID:38841509
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研究论文 | 本研究探讨了Qi Lang公式（QLF）通过靶向SCF/c-kit信号通路在缓解便秘中的作用 | 阐明了QLF在促进ICC增殖以及恢复神经递质水平的机制 | 本研究仅在大鼠模型中进行，可能限制了其临床应用的普遍性 | 揭示Qi Lang公式缓解便秘的潜在机制 | 通过分析QLF及其靶点来研究与ICC相关的便秘 | 数字病理学 | 便秘 | UPLC-MS/MS, scRNA-seq, ELISA, Western blot, 免疫荧光 | NA | NA | 使用大鼠模型进行实验，具体样本数量未说明 |
| 495 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Uncovers Striking Cellular Heterogeneity of Lung-Infiltrating Regulatory T Cells during Eosinophilic versus Neutrophilic Allergic Airway Inflammation
2024-Jun-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300646
PMID:38647384
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研究论文 | 这篇文章揭示了肺内浸润的调节性T细胞在不同类型的过敏性气道炎症中的显著细胞异质性 | 提出了一种新机制，表明不同类型的炎症可能导致表型独特的肺驻留调节性T细胞的形成 | 未探讨不同的过敏气道炎症反应是否影响浸润的调节性T细胞异质性或肺驻留特征 | 研究不同类型的过敏性气道炎症中肺浸润调节性T细胞的异质性 | 肺内浸润的调节性T细胞，重点关注嗜酸性和中性粒细胞介导的炎症模型 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | N/A | N/A | N/A |
| 496 | 2024-08-05 |
Gene regulatory landscape of cerebral cortex folding
2024-Jun-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn1640
PMID:38838158
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研究论文 | 该文章研究了影响大脑皮层褶皱形成的基因调控机制 | 文章揭示了皮层发育过程中基因表达和表观遗传学动态的时空特征 | 未详细探讨不同物种间的调控机制差异 | 研究大脑皮层褶皱形成的基因调控景观 | 使用雪貂作为模型，研究发育过程中基因和表观遗传的动态 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用雪貂作为样本进行实验 |
| 497 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA-seq unveils the immune infiltration landscape associated with cuproptosis in cerebral cavernous malformations
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00603-y
PMID:38835051
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研究论文 | 该研究揭示了与杯死亡相关的分子特征在脑海绵状血管畸形中的作用 | 首次展示了杯死亡与脑海绵状血管畸形病理之间的分子联系以及新识别的三个关键基因 | 研究中的样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨与脑海绵状血管畸形发展相关的杯死亡分子特征 | 分析了15例脑海绵状血管畸形样本和6例对照样本 | 数字病理学 | 脑海绵状血管畸形 | RNA测序 | 机器学习模型（LASSO和随机森林） | 基因表达数据 | 15例脑海绵状血管畸形样本和6例对照样本 |
| 498 | 2024-08-04 |
Deciphering the role of zinc homeostasis in the tumor microenvironment and prognosis of prostate cancer
2024-Jun-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01006-z
PMID:38833013
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研究论文 | 这篇文章探讨了锌稳态在前列腺癌肿瘤微环境和预后中的作用 | 构建了锌稳态模式亚型并开发了锌稳态相关风险评分以改进前列腺癌预后预测 | 锌稳态在前列腺癌中的具体影响尚未完全探明 | 研究锌稳态在前列腺癌中的作用及其对预后的影响 | 前列腺癌患者的临床样本和相关基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序，贝叶斯网络推断 | 多种机器学习算法 | 临床样本，基因组数据 | NA |
| 499 | 2024-08-04 |
Specialized Tfh cell subsets driving type-1 and type-2 humoral responses in lymphoid tissue
2024-Jun-04, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00681-0
PMID:38834551
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研究论文 | 该研究探讨了T滤泡辅助细胞(Tfh)在类型1和类型2免疫反应中的特化功能 | 通过机器学习方法建立了能够区分Tfh1和Tfh2细胞的基因表达特征 | 缺乏对人类免疫反应的全面验证，主要基于小鼠模型 | 研究在不同免疫状况下Tfh细胞的特殊化以及其在生发中心中的功能 | 聚焦于Tfh细胞在类型1和类型2免疫反应下的特化及其在淋巴结中的定位 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学，机器学习 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本和人类个体样本 |
| 500 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptome atlas of testes from mice with high-fat diets
2024-Jun-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03435-5
PMID:38834587
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序分析了高脂饮食导致肥胖小鼠睾丸中的细胞变化 | 这是首个在饮食诱导肥胖小鼠睾丸中应用单细胞RNA测序的研究，提供了对肥胖相关男性生殖损伤的新见解 | 在分子水平上，肥胖对睾丸的影响仍然缺乏全面探讨 | 研究肥胖对小鼠睾丸非生精细胞和生精过程的影响 | 分析来自肥胖和瘦小鼠的睾丸细胞数据 | 数字病理学 | 肥胖相关生殖健康问题 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 70,000个细胞 |