单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 563 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-04 |
Single-nucleus RNA sequencing demonstrates an autosomal dominant Alzheimer's disease profile and possible mechanisms of disease protection
2024-Jun-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.02.009
PMID:38417436
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研究论文 | 本研究比较了27个病例的单核转录组，以探讨自某种携带突变的阿尔茨海默病的特征。 | 研究揭示了PSEN1-E280A病例与散发性AD之间的明显区别，特别是在自噬基因和伴侣蛋白的激活方面。 | 尚未深入探讨在特定细胞类型中区分这些AD形式的下游通路。 | 探讨自某种突变的阿尔茨海默病的转录组特征及其潜在的保护机制。 | 27个病例，包括PSEN1-E280A ADAD携带者、散发性AD和对照组。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27个病例 |
| 462 | 2024-08-05 |
Detection of novel PPP1R1B::STARD3 fusion transcript in acute myeloid leukemia: a case report
2024-Jun-05, Journal of medical case reports
IF:0.9Q3
DOI:10.1186/s13256-024-04536-w
PMID:38835078
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case report | 本文首次报告了急性髓性白血病患者中PPP1R1B::STARD3融合转录本的存在 | 首次发现PPP1R1B::STARD3融合转录本在急性髓性白血病中的作用 | 研究仅基于单一病例，缺乏大规模样本支持 | 探索PPP1R1B::STARD3融合转录本在急性髓性白血病中的存在及其可能机制 | 一名12岁男孩急性髓性白血病患者 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | RNA测序 | NA | 转录本 | 1 |
| 463 | 2024-08-04 |
System analysis based on Anoikis-related genes identifies MAPK1 as a novel therapy target for osteosarcoma with neoadjuvant chemotherapy
2024-Jun-04, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-07547-2
PMID:38835052
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研究论文 | 该文章探讨了与Anoikis相关的基因，并确定MAPK1作为神经母细胞瘤的新治疗靶点 | 首创基于Anoikis相关基因的风险评分模型，并鉴定MAPK1作为新的治疗靶点 | 尚未探讨Anoikis在骨肉瘤中的具体机制 | 评估Anoikis相关基因对骨肉瘤患者预后的影响 | 研究对象为骨肉瘤患者，并针对其肿瘤微环境和药物敏感性进行分析 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 464 | 2024-08-05 |
Glucagon-like peptide 1 receptor is a T cell-negative costimulatory molecule
2024-Jun-04, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.05.001
PMID:38838642
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研究论文 | 本文研究了GLP-1R在T淋巴细胞免疫应答中的角色 | 发现GLP-1R作为T细胞的负共刺激分子，并且其信号通路可以延长异种移植物存活 | 目前仅在小鼠模型中进行测试，尚未在人类研究中验证 | 探讨GLP-1R在免疫应答中对T淋巴细胞的影响 | 主要针对在异移植过程中表达GLP-1R的T淋巴细胞进行研究 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-08-04 |
Gut-Derived Exosomes Mediate the Microbiota Dysbiosis-Induced Spermatogenesis Impairment by Targeting Meioc in Mice
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310110
PMID:38526201
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研究论文 | 这项研究展示了肠来源的外泌体如何通过靶向Meioc导致肠道微生物失调引起的精子发生障碍 | 本研究首次揭示了非生殖组织来源的外泌体在精子发生调节中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚需在人类模型中验证 | 探讨肠道微生物失调对小鼠精子发生的影响及其机制 | 本研究以肠道微生物失调的小鼠为研究对象 | 数字病理学 | 肥胖症和肠道炎症疾病 | 单细胞测序 | NA | 循环外泌体 | 使用肠道微生物失调的小鼠与野生小鼠进行对比 |
| 466 | 2024-08-04 |
A novel single-cell model reveals ferroptosis-associated biomarkers for individualized therapy and prognostic prediction in hepatocellular carcinoma
2024-Jun-10, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01931-z
PMID:38853238
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研究论文 | 本研究探讨了一种与铁死亡相关的单细胞预测模型，以改善肝细胞癌(HCC)的治疗反应和预后预测。 | 通过LASSO-Cox算法构建了一个包含10个与铁死亡相关的单细胞生物标志物的新模型，提供了个性化治疗和预后预测的新视角。 | 未明确提及研究的局限性 | 旨在提高肝细胞癌患者的治疗反应和预后预测准确性。 | 研究对象为肝细胞癌细胞及其相关的单细胞生物标志物。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO-Cox模型 | 基因表达数据 | 涉及HCC细胞亚群体的单细胞样本 |
| 467 | 2024-08-04 |
Deciphering the genetic code of neuronal type connectivity through bilinear modeling
2024-Jun-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91532
PMID:38857169
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研究论文 | 本研究提出了一种新的双线性建模方法，用于解码神经元类型之间的遗传连接方式 | 该模型首次将基因表达与连接组数据相结合，成功捕捉了神经元之间的遗传相互作用 | 样本数据有限，模型在特定类型神经元的连接解读中可能存在局限性 | 研究神经元类型之间的遗传连接及其对大脑功能的影响 | 利用小鼠视网膜神经元数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 双线性模型 | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经元数据集中包含的样本数量未具体说明 |
| 468 | 2024-08-04 |
Mapping the cellular biogeography of human bone marrow niches using single-cell transcriptomics and proteomic imaging
2024-Jun-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.04.013
PMID:38714197
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序和蛋白质组成像描绘人类骨髓的细胞生态图谱。 | 首次揭示了人类骨髓中非造血细胞的变异性和空间组织，以及其与造血细胞的相互关系。 | 研究主要集中在急性髓性白血病患者样本，可能限制了结果的广泛适用性。 | 探究人类骨髓中细胞的空间分布和相互作用，推动对造血过程的理解。 | 分析了29325个非造血细胞和53417个造血细胞的转录组特征。 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序和共检测索引(CODEX) | NA | 细胞转录组数据和空间成像数据 | 29325个非造血细胞和53417个造血细胞 |
| 469 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed White Matter Repair Following Subarachnoid Hemorrhage
2024-Jun-11, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01265-6
PMID:38861152
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析，揭示了蛛网膜下腔出血后白 matter 修复的机理 | 首次识别出SAH模型小鼠中微胶质细胞和少突胶质细胞前体细胞之间的重要互作及其信号通路 | 主要集中在小鼠模型上，结果转化到人类的有效性尚需进一步验证 | 探究蛛网膜下腔出血后大脑细胞亚群在急性和亚急性阶段的作用 | 蛛网膜下腔出血模型小鼠及其大脑细胞亚群 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | SAH模型小鼠 |
| 470 | 2024-08-05 |
Unveiling novel cell clusters and biomarkers in glioblastoma and its peritumoral microenvironment at the single-cell perspective
2024-Jun-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05313-5
PMID:38851695
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研究论文 | 该研究以单细胞视角描绘了胶质母细胞瘤及其肿瘤周围微环境的细胞景观 | 首次发现了胶质母细胞瘤中新的细胞亚群和生物标志物，并为精准治疗提供了理论依据 | 样本量较小，仅包含4名患者的8个组织样本，因此结果的普遍适用性可能受到限制 | 描绘胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境的细胞景观，以发现新的细胞亚型和生物标志物 | 4名胶质母细胞瘤患者的组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 8个组织样本，来自4名胶质母细胞瘤患者 |
| 471 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals the effects of the FecB mutation on the transcriptome profile in ovine cumulus cells
2024-06-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64001-y
PMID:38849498
|
研究论文 | 研究FecB突变对绵羊卵泡细胞转录组特征的影响 | 采用单细胞RNA测序技术揭示了不同FecB基因型的卵泡细胞在基因表达上的异质性 | 研究中未涉及其他可能影响卵泡细胞分化的遗传因素 | 探索FecB突变如何影响绵羊卵泡细胞的分化过程 | 来自不同FecB基因型的小尾寒羊的卵泡细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三种FecB基因型的小尾寒羊卵泡细胞样本 |
| 472 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2024-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594719
PMID:38826447
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研究论文 | 本研究详细描绘了小鼠卵巢中排卵的单细胞和时空特征 | 首次以单细胞分辨率描述排卵过程的精确时机，并揭示了卵巢细胞类型的时序转录状态和特定的定位特征 | 研究仅限于小鼠卵巢的排卵过程，尚未验证其他物种的适用性 | 研究排卵过程中的细胞动态变化和分子机制 | 小鼠卵巢中的细胞类型及其在排卵过程中的变化 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA数据 | 成对小鼠卵巢 |
| 473 | 2024-08-05 |
B cell-mediated antigen presentation promotes adverse cardiac remodeling in chronic heart failure
2024-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.08.593153
PMID:38766182
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研究论文 | 本文探讨脾脏B细胞通过MHC II介导的抗原呈现对慢性心力衰竭的影响 | 首次揭示了脾脏B细胞在慢性心力衰竭中通过MHC II介导的抗原呈现促进不良心脏重塑的机制 | 对特定免疫细胞在心脏重塑中的具体作用机制的理解仍然有限 | 研究脾脏B细胞在慢性心力衰竭中的作用 | 小鼠和人类心肌梗塞患者的脾脏B细胞 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 细胞 | NA |
| 474 | 2024-08-04 |
Stress-free single-cell transcriptomic profiling and functional genomics of murine eosinophils
2024-Jun, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-00967-3
PMID:38504138
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研究论文 | 该文章涉及一种无压力的小鼠嗜酸性粒细胞的单细胞转录组分析和功能基因组学方法 | 开发了一种无压力的协议，能够高质量地捕获小鼠组织内嗜酸性粒细胞的单细胞RNA，并揭示了其在结肠炎中的不同肠道亚群及作用 | 需要较高的技术水平，虽然方法可被任何具备基础分子生物学和流式细胞术技能的研究人员使用，但仍需适应其他粒细胞 | 研究嗜酸性粒细胞的异质性及其在健康和疾病中的功能 | 小鼠嗜酸性粒细胞及其在不同组织中的亚群 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞RNA捕获，CRISPR基因筛选 | NA | RNA数据 | 多种组织来源的嗜酸性粒细胞 |
| 475 | 2024-08-04 |
S100A16 is a potential target for reshaping the tumor microenvironment in the hypoxic context of liver cancer
2024-Jun-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112076
PMID:38733818
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研究论文 | 本文研究了S100A16在肝癌肿瘤微环境中的作用，尤其是在缺氧条件下的表现 | 首次揭示了S100A16与肝癌缺氧微环境中免疫细胞浸润的显著关联 | 尚需进一步研究以明确S100A16在肝癌不同阶段的具体功能及机制 | 探讨S100A16在肝癌肿瘤微环境中，特别是在缺氧背景下的作用 | 肝癌肿瘤组织及其免疫细胞浸润的特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 武汉队列的样本 |
| 476 | 2024-08-04 |
Identification of CXCL13 as a Promising Biomarker for Immune Checkpoint Blockade Therapy and PARP Inhibitor Therapy in Ovarian Cancer
2024-Jun-10, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01207-5
PMID:38856873
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研究论文 | 这篇文章探讨了CXCL13作为卵巢癌中免疫检查点抑制疗法和PARP抑制剂疗法的潜在生物标志物。 | CXCL13不仅反映了HRD状态，还提出了卵巢癌中ICB预测性生物标志物的新视角。 | 该研究可能受到样本选择和数据来源的限制，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究CXCL13在卵巢癌免疫检查点抑制疗法中的生物标志物作用。 | 卵巢癌患者的HRD肿瘤及相关免疫微环境。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 基因组测序、免疫组化、单细胞测序 | NA | 生物标志物数据、临床试验数据 | 通过公共数据库收集的数据，样本数量不详 |
| 477 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals the role of YAP1 in prefrontal cortex microglia in depression
2024-Jun-07, BMC neurology
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12883-024-03685-1
PMID:38849737
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了YAP1在抑郁症前额叶皮层小胶质细胞中的致病机制 | 识别YAP1作为抑郁症发展中的关键分子，并提出其作为预测抑郁症发作的生物标志物的潜力 | NA | 探讨YAP1在抑郁症前额叶皮层小胶质细胞中的作用 | 正常和抑郁前额叶皮层组织的小胶质细胞 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据集以及临床样本 |
| 478 | 2024-08-04 |
The curses of performing differential expression analysis using single-cell data
2024-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.596315
PMID:38853843
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞转录组学中进行差异表达分析的挑战与局限性 | 提出了一种新的范式来应对单细胞差异表达分析中的多个问题 | 现有工作流程在归一化、过多零值、供体效应和累积偏差等方面存在显著缺陷 | 研究单细胞转录组学中的差异表达分析的挑战 | 单细胞数据中的差异表达基因 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 479 | 2024-08-04 |
Somatic mutations associate with clonal expansion of CD8+ T cells
2024-Jun-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj0787
PMID:38848368
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研究论文 | 本文研究了CD8+ T细胞中的体细胞突变与克隆扩增之间的关系 | 揭示了非恶性T细胞中的突变谱，并首次确认CD8细胞中的非同义变异频率高于同义变异 | 未明确提及对样本选择和其他T细胞类型的影响 | 了解体细胞突变对CD8 T细胞扩增的影响 | 来自90位血液和免疫疾病患者的CD8和CD4 T细胞 | 数字病理学 | 免疫疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 90名患者的T细胞 |
| 480 | 2024-08-05 |
Prediction of Clinically Significant Prostate Cancer by a Specific Collagen-related Transcriptome, Proteome, and Urinome Signature
2024-Jun-07, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2024.05.014
PMID:38851995
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研究论文 | 该文章分析了与胶原相关的转录组、蛋白组和尿液组的变化，以检测临床显著性前列腺癌 | 通过胶原相关转录组、蛋白组和尿液组的特征建立了机器学习模型，显著优于传统的前列腺特异抗原 (PSA) 方法 | 本研究的一个局限性是其回顾性特征 | 研究胶原在前列腺癌检测中的作用 | 涉及临床显著性前列腺癌患者的转录组、蛋白组和尿液组数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习模型 | 转录组数据，蛋白组数据，尿液组数据 | 转录组1393个，蛋白组104个，尿液组923个 |