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当前共找到 544 篇文献,本页显示第 421 - 440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
421 2024-08-05
RIPK1 protects naive and regulatory T cells from TNFR1-induced apoptosis
2024-Jun, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 本研究探讨了RIPK1在维持外周T细胞存活和防止TNFR1诱导的凋亡中的重要作用 揭示了RIPK1在不同外周T细胞亚群中的功能差异,且RIPK1的支架功能对T细胞的存活至关重要 未能明确不同外周T细胞亚群对RIPK1的需求差异 研究RIPK1在外周T细胞的生存和免疫反应中的作用 以RIPK1条件性缺失小鼠和其他基因敲除小鼠作为研究对象 免疫学 自身免疫性疾病 小鼠基因敲除技术 NA 转录组数据,细胞分选数据 涉及的样本包括不同亚群的CD4和CD8 T细胞 NA NA NA NA
422 2024-08-05
T cells in testicular germ cell tumors: new evidence of fundamental contributions by rare subsets
2024-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本文分析了罕见T细胞亚型在睾丸生殖细胞肿瘤(TGCT)中的基本贡献 首次发现人类睾丸中稀有Treg和Tfh细胞与TGCT的病理生物学相关 样本来源和患者间的显著异质性可能影响结果的普遍性 研究TGCT中免疫细胞组成的变化及其在肿瘤微环境中的角色 分析来自独立患者队列的人类睾丸标本中的免疫细胞 数字病理学 睾丸癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组化和流式细胞术 NA 组织样本 来自多个独立患者队列的人类睾丸标本 NA NA NA NA
423 2024-08-05
Spatially distinct epithelial and mesenchymal cell subsets along progressive lineage restriction in the branching embryonic mammary gland
2024-Jun, The EMBO journal
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序绘制了小鼠乳腺上皮和间充质的图谱,并重建了多能干细胞的分化轨迹 确定了承诺的和多能乳腺干细胞的早期分子标记,并定义了它们在发育组织中的空间分布 缺乏对早期命运特征的具体标记,限制了对乳腺干细胞衍生的谱系承诺前体的描述 阐释多能干细胞的谱系特征及其在乳腺发育中的空间定位 小鼠乳腺上皮和间充质中的多能干细胞及其后代 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 E13.5到分娩阶段的小鼠样本 NA NA NA NA
424 2024-08-05
Multi-omics profiling reveal cells with novel oncogenic cluster, TRAP1low/CAMSAP3low, emerge more aggressive behavior and poor-prognosis in early-stage endometrial cancer
2024-Jun-17, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 该研究通过多组学分析揭示了一种新的癌基因集群,TRAP1低表达/CAMSAP3低表达在早期子宫内膜癌中表现出更具攻击性的行为和较差的预后。 首次发现TRAP1和CAMSAP3在特定细胞集群中显著下调,并构建了结合TRAP1、CAMSAP3和TP53的新的预测模型。 本研究的样本量相对较小,仅包含24名早期子宫内膜癌患者,可能限制了结果的普遍适用性。 研究早期子宫内膜癌的临床异质性,识别高质量预后标志物及其在肿瘤攻击性行为中的潜在作用。 研究对象为早期子宫内膜癌患者及其癌和旁癌组织的样本。 数字病理学 子宫内膜癌 蛋白质组学和单细胞转录组测序(scRNA-seq) NA 生物样本 24名早期子宫内膜癌患者 NA NA NA NA
425 2024-08-04
Cystatin F attenuates neuroinflammation and demyelination following murine coronavirus infection of the central nervous system
2024-Jun-15, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 Cystatin F在小鼠冠状病毒感染后的神经炎症和脱髓鞘化过程中的作用 首次详细探讨了Cystatin F在病毒感染后神经疾病严重性中的影响 主要使用小鼠模型,结果可能无法直接推广到人类 研究Cystatin F在小鼠冠状病毒引起的神经疾病中的作用 Cystatin F缺失的小鼠和野生型小鼠 数字病理学 NA qPCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 电子显微镜 NA 细胞, RNA Cst7-/-小鼠和控制小鼠的细胞样本 NA NA NA NA
426 2024-08-04
Chemokine expression profile of an innate granuloma
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究旨在表征参与形成粒腺瘤的趋化因子。 使用空间转录组学技术动态研究趋化因子表达在粒腺瘤形成过程中的变化。 研究中对其他免疫细胞的角色探索不足。 探索趋化因子在免疫细胞形成粒腺瘤中的作用。 小鼠感染模型和其免疫反应中的单核细胞来源巨噬细胞。 数字病理学 NA 空间转录组学 NA NA 小鼠感染模型 NA NA NA NA
427 2024-08-04
Single-cell lineage capture across genomic modalities with CellTag-multi reveals fate-specific gene regulatory changes
2024-Jun, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本研究提出了一种新的方法CellTag-multi,用于在不同的单细胞基因组测序中进行细胞谱系追踪 提出了CellTag-multi方法,可以直接捕获作为多腺苷酸化转录本表达的遗传随机条形码,适用于多种单细胞测定 NA 研究细胞谱系追踪与转录组分析相结合的方法 小鼠造血过程中的前体细胞谱系及其重编程过程中的基因调控机制 数字病理学 NA 单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测定 NA 转录本 小鼠造血过程中的前体细胞 NA NA NA NA
428 2024-08-04
Spatial transcriptomics in embryonic mouse diaphragm muscle reveals regional gradients and subdomains of developmental gene expression
2024-Jun-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文提供了小鼠胚胎横膈肌空间基因表达数据,揭示了肌肉区域的基因特征及其发育过程 首次报告了小鼠胚胎横膈肌的空间基因表达模式 目前缺乏对其他胚胎时期或不同肌肉类型的系统性研究 研究小鼠胚胎横膈肌的发育和神经肌肉连接形成中的基因表达模式 小鼠胚胎横膈肌,特别是在胚胎天数E14.5和E18.5的样本 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 横截面小鼠胚胎样本,具体样本大小未提供 NA NA NA NA
429 2024-08-05
Resident vascular Sca1+ progenitors differentiate into endothelial cells in vascular remodeling via miR-145-5p/ERG signaling pathway
2024-Jun-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 这篇文章研究了血管重塑中Sca1+前体细胞如何通过miR-145-5p/ERG信号通路分化为内皮细胞。 文章创新点在于揭示了Sca1细胞在血管重塑中的分化过程及其受miR-145-5p/ERG通路的负调控。 本研究的局限性在于未完全阐明Sca1细胞的所有潜在起源及机制。 研究的目的是探讨Sca1+前体细胞向内皮细胞分化的机制。 研究对象为小鼠模型中的Sca1+前体细胞及其在血管重塑过程中的作用。 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA序列数据 小鼠模型中的Sca1+前体细胞 NA NA NA NA
430 2024-08-05
Decoding temporal heterogeneity in NSCLC through machine learning and prognostic model construction
2024-Jun-13, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了非小细胞肺癌(NSCLC)中的时间异质性及其预后模型的构建 首次结合cNMF和XGBoost进行NSCLC细胞功能模块分类及标记基因选择,并建立了基于基因的风险评分模型 研究范围可能受限于所选择的样本数量及其异质性,影响结果的普适性 识别与非小细胞肺癌进展相关的时间异质性生物标志物 93,406个来自22名非小细胞肺癌患者的单细胞转录组数据 数字病理学 肺癌 单细胞转录组分析,XGBoost,cNMF,LASSO回归 XGBoost 转录组数据 93,406个细胞,来自22名患者 NA NA NA NA
431 2024-08-05
IPF-related new macrophage subpopulations and diagnostic biomarker identification - combine machine learning with single-cell analysis
2024-Jun-13, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究分析了特发性肺纤维化(IPF)患者的单细胞转录组测序数据,识别了IPF相关的巨噬细胞亚群并探讨其分子特征和生物功能 首次识别了IPF特有的ATP5-MΦ巨噬细胞亚群及其特征基因,揭示了其与氧化磷酸化和质子跨膜转运的关联 对巨噬细胞的异质性和分子特征的理解仍然有限,临床相关性待进一步验证 探讨IPF患者巨噬细胞的分子特征及其在疾病预后中的价值 特发性肺纤维化患者的肺组织中的巨噬细胞 数字病理学 特发性肺纤维化 单细胞转录组测序(scRNA-seq) 机器学习 基因组数据 IPF患者肺组织中的单细胞样本 NA NA NA NA
432 2024-08-04
Oxytocin alleviates liver fibrosis via hepatic macrophages
2024-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 这项研究探讨了催产素通过肝巨噬细胞缓解肝纤维化的机制 首次揭示了催产素在肝脏中调节巨噬细胞表型的新路径 研究主要集中在小鼠模型,临床应用效果尚需验证 研究催产素在肝纤维化中的作用及其机制 使用小鼠模型来研究肝纤维化和巨噬细胞的表型变化 数字病理学 肝纤维化 单细胞测序 小鼠模型 细胞群体数据 使用若干肝纤维化小鼠模型 NA NA NA NA
433 2024-08-04
Development of Novel Models of Aggressive Variants of Castration-resistant Prostate Cancer
2024-Jun, European urology oncology IF:8.3Q1
研究论文 本研究开发了代表侵袭性去势抵抗性前列腺癌新模型 提出了新的前临床模型,包括患者来源的异种移植(PDX)、PDX衍生的类器官(PDXO)和患者来源的类器官(PDO) 样本量有限,且主要集中于特定的前列腺癌亚型 开发新的预临床模型并为新药评估制定策略 51名转移性前列腺癌患者的肿瘤样本 数字病理学 前列腺癌 全外显子测序(WES)、RNA测序(RNA-seq)和单细胞RNA测序 PDX、PDXO、PDO 基因组数据和药物敏感性数据 51名患者,建立了20个前临床模型(5个NEPC、7个DDR、1个MSI-high PDX,16个PDXO和6个PDO) NA NA NA NA
434 2024-08-05
CellMarkerPipe: cell marker identification and evaluation pipeline in single cell transcriptomes
2024-06-07, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出了一种自动化细胞类型特异性标记基因识别和评估的平台CellMarkerPipe 开发了一个统一的计算平台,能够自动识别和评估标记基因,提高效率 具体局限性未在摘要中体现 旨在简化单细胞转录组数据中细胞标记基因的识别和评估过程 涉及多种样本的单细胞RNA-seq数据 数字病理学 NA scRNA-seq NA 数据集 多种样本 NA NA NA NA
435 2024-08-04
Unravelling the metabolic landscape of cutaneous melanoma: Insights from single-cell sequencing analysis and machine learning for prognostic assessment of lactate metabolism
2024-Jun, Experimental dermatology IF:3.5Q1
研究论文 本文全面探讨了乳酸代谢相关基因在皮肤黑色素瘤中的潜在预后作用 该研究利用单细胞测序和机器学习构建了乳酸代谢的预后模型,并验证了关键基因NDUFS7的生物学功能 样本量和 cohorts 的多样性可能限制了模型的普适性 旨在评估乳酸代谢相关基因在皮肤黑色素瘤中的预后价值 涉及的研究对象为皮肤黑色素瘤患者的肿瘤组织样本 机器学习 皮肤黑色素瘤 单细胞测序,机器学习 NA 转录组数据 多个 cohort,具体样本量未提及 NA NA NA NA
436 2024-08-05
TGF-β signalling limits effector function capacity of NK cell anti-tumour immunity in human bladder cancer
2024-Jun, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究探讨了TGF-β信号如何限制NK细胞在膀胱癌中的抗肿瘤免疫功能 本研究揭示了TGF-β信号通路通过下调CD16抑制NK细胞介导的抗体依赖性细胞毒性(ADCC)机制 本研究的局限性在于仅使用了一种小鼠模型,可能无法全面反映人类膀胱癌中的所有免疫机制 研究TGF-β信号在膀胱癌中对NK细胞功能的影响 膀胱癌患者中的肿瘤浸润性NK细胞 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和高维流式细胞术 人源化小鼠模型 基因表达数据 NA NA NA NA NA
437 2024-08-05
Ketogenic diet modifies ribosomal protein dysregulation in KMT2D Kabuki syndrome
2024-Jun, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究探讨了生酮饮食如何改变KMT2D卡布基综合症中的核糖体蛋白功能失调 本研究首次揭示了赖氨酸甲基转移酶缺陷与核糖体蛋白功能障碍之间的关联,并展示了生酮饮食对改善认知功能的潜在影响 样本量较小,仅涉及八名参与者,可能影响结果的普适性 研究生酮饮食对KMT2D卡布基综合症相关的分子机制和临床结果的影响 对4名卡布基综合症患者与4名对照组进行比较分析 数字病理学 NA 单细胞RNA测序和基于质谱的蛋白质组学 NA RNA和蛋白质数据 8名参与者(4名卡布基综合症患者和4名对照组) NA NA NA NA
438 2024-08-05
Single-cell landscape reveals the epithelial cell-centric pro-inflammatory immune microenvironment in dry eye development
2024-Jun, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了干眼病发展中的以上皮细胞为中心的促炎免疫微环境 通过单细胞转录组测序,我们识别出在干眼病急性阶段出现的一种具有纤维母细胞特征的上皮亚型 本研究主要基于环境诱导的干眼小鼠模型,可能无法完全反映人类的情况 探讨干眼病的免疫学改变与发病机制 采用环境诱导的干眼小鼠的结膜组织进行单细胞转录组测序 数字病理学 干眼病 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 使用了环境诱导的干眼小鼠的结膜组织 NA NA NA NA
439 2024-08-05
scRNA-seq reveals the diversity of the developing cardiac cell lineage and molecular players in heart rhythm regulation
2024-Jun-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文利用scRNA-seq delineate了斑马鱼心脏中细胞类型的多样性 首次描述了发育心脏中多种细胞谱系和心律调节的新分子参与者 未提及具体的样本大小与实验范围 揭示发育中心脏的细胞和分子机制 斑马鱼心脏中的50,000多个细胞 数字病理学 NA scRNA-seq NA 转录组数据 超过50,000个细胞 NA NA NA NA
440 2024-08-04
DCRELM: dual correlation reduction network-based extreme learning machine for single-cell RNA-seq data clustering
2024-06-12, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出了一种基于双重相关降低网络的极限学习机DCRELM,用于单细胞RNA-seq数据的聚类 DCRELM结合了极限学习机和双重相关降低网络的方法,增强了对高维、噪声和稀疏数据的处理能力 未提及具体的限制 研究单细胞RNA-seq数据的聚类方法 单细胞RNA-seq数据 数字病理学 NA 极限学习机(ELM) 自编码器 RNA序列数据 未提及具体样本量 NA NA NA NA
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