单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
401	2024-08-04	Traumatic brain injury promotes neurogenesis at the cost of astrogliogenesis in the adult hippocampus of male mice 2024-Jun-18, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49299-6 PMID:38890340	研究论文	创伤性脑损伤(TBI)导致小鼠成年海马中的神经发生增加，同时减少星形胶质细胞生成	本研究揭示了创伤性脑损伤如何改变神经干细胞的命运，促进神经发生而代价于星形胶质细胞生成	本研究仅在雄性小鼠中进行，未考虑性别对结果的影响	探讨创伤性脑损伤对成年小鼠海马神经干细胞及其衍生细胞线的影响	成年雄性小鼠	数字病理学	NA	单细胞RNA测序和空间转录组学	受控皮层撞击模型	细胞、基因表达数据	NA
402	2024-08-05	Empowering artificial intelligence in characterizing the human primary pacemaker of the heart at single cell resolution 2024-06-18, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-63542-6 PMID:38890395	研究论文	本文利用新颖的深度学习解卷积方法对人类窦房结的细胞异质性进行了表征	采用Bulk2space方法揭示了人类窦房结的独特单细胞组成	样本稀缺性可能影响研究结果的全面性	探讨人类窦房结的细胞组成和功能	主要聚焦于人类窦房结的细胞群体	计算机视觉	心血管疾病	RNA-seq	深度学习解卷积模型	单细胞转录组数据	包含18个人类细胞群体以及小鼠scRNA-Seq数据作为参考
403	2024-08-05	Identification of a novel monocyte/macrophage-related gene signature for predicting survival and immune response in acute myeloid leukemia 2024-06-18, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-64567-7 PMID:38890346	研究论文	本研究开发了一种单核细胞/巨噬细胞相关的预后风险评分模型，以预测急性髓系白血病（AML）的生存和免疫反应	首次提出了MMrisk模型，该模型基于八个单核细胞/巨噬细胞相关基因，能有效预测AML患者的生存率和免疫特征	研究可能受限于样本量及所用数据集的特异性，尚需更多临床验证	旨在通过识别新的治疗生物标志物来改善急性髓系白血病的预后和免疫治疗效果	研究对象为急性髓系白血病患者及其单核细胞/巨噬细胞相关基因	数字病理学	急性髓系白血病	单细胞RNA测序，差异表达基因分析	Cox回归分析，LASSO回归分析	基因表达数据	使用两个GEO数据集进行验证，样本具体数量未说明
404	2024-08-05	Single-cell RNA transcriptomic reveal the mechanism of MSC derived small extracellular vesicles against DKD fibrosis 2024-Jun-18, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-024-02613-2 PMID:38890734	研究论文	该研究使用单细胞RNA测序分析MSC来源的小外泌体在糖尿病肾病纤维化中的机制	发现了与纤维化相关的新型TGF-βArg1巨噬细胞亚群，并揭示了MSC-sEV对肾间质纤维化的独特治疗机制	研究未提及样本数量和临床有效性验证	探讨MSC-sEV在糖尿病肾病纤维化中的作用机制	分析32724个肾脏单细胞以研究巨噬细胞和肾小管细胞的变化	数字病理学	糖尿病肾病	单细胞RNA测序	NA	细胞	分析了32724个细胞
405	2024-08-04	Clinically unfavorable transcriptome subtypes of non-WNT/non-SHH medulloblastomas are associated with a predominance in proliferating and progenitor-like cell subpopulations 2024-06-07, Acta neuropathologica IF:9.3Q1 DOI:10.1007/s00401-024-02746-6 PMID:38847845	研究论文	本研究探讨了非WNT/非SHH髓母细胞瘤中临床不良转录组亚型与细胞群体特征之间的关系。	识别出不同次级群体中具有独特基因表达特征和信号通路的预后相关转录组亚型。	缺乏对每个SGS MB分别应用单细胞技术的验证。	旨在探索非WNT/非SHH髓母细胞瘤中细胞组成与临床预后的关系。	研究对象为非WNT/非SHH髓母细胞瘤的不同转录组亚型及其细胞亚群体。	数字病理学	髓母细胞瘤	单细胞RNA-seq	NA	RNA序列数据	包括多个次级群体（SGS I-VIII）的样本
406	2024-08-05	Single-cell analysis uncovers high-proliferative tumour cell subtypes and their interactions in the microenvironment of gastric cancer 2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.18373 PMID:38894657	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析发现胃癌微环境中的高增殖肿瘤细胞亚群及其相互作用	首次识别了胃癌中高度增殖的C2 UBE2C+肿瘤细胞亚群，并建立了基于UBE2C相关基因的预后评分模型	研究对象仅限于27名胃癌患者，数据来源单一，可能影响研究结果的广泛适用性	揭示胃癌快速进展的分子生物学机制	对胃癌患者的肿瘤微环境及其细胞亚群进行分析	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	基因表达数据	27名胃癌患者的38个样本
407	2024-08-05	Single-Cell Dissection of the Immune Response After Acute Myocardial Infarction 2024-Jun, Circulation. Genomic and precision medicine DOI:10.1161/CIRCGEN.123.004374 PMID:38752343	研究论文	本研究揭示了急性心肌梗死后免疫反应的细胞类型和疾病阶段。	通过单细胞RNA测序和血浆蛋白表达分析，识别了急性心肌梗死影响的免疫途径和细胞类型，提供了针对抗炎疗法受益患者的见解。	该研究的样本规模较小，仅包括38名患者和38名对照，可能限制结果的广泛适用性。	研究急性心肌梗死后免疫系统的反应及其对未来治疗的影响。	38名急性心肌梗死患者与38名对照参与者。	心血管疾病	心肌梗死	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	血液样本	38名急性心肌梗死患者和38名对照，共计95,995个病变外周血单核细胞和33,878个对照外周血单核细胞
408	2024-08-05	Ultrasound Neuromodulation of an Anti-Inflammatory Pathway at the Spleen Improves Experimental Pulmonary Hypertension 2024-Jun-21, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323679 PMID:38712557	研究论文	研究进行了脾脏的非侵入性聚焦超声刺激对实验性肺动脉高血压的影响	首次探讨了通过超声神经调节抑制脾脏的抗炎途径来改善实验性肺动脉高血压的潜力	主要在动物模型中进行，结果是否适用于人类尚需进一步验证	旨在探索非侵入性超声刺激对肺动脉高血压的治疗潜力	大鼠实验模型，包括Sugen/hypoxia模型和单克痕模型	数字病理学	肺动脉高血压	聚焦超声刺激	NA	组织学、免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序	大鼠样本，具体数量未提供
409	2024-08-05	Identification and characterization of intermediate states in mammalian neural crest cell epithelial to mesenchymal transition and delamination 2024-Jun-14, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.92844 PMID:38873887	研究论文	该文章研究了哺乳动物神经脊细胞的上皮-间质转化及分层过程中的中间状态	首次通过单细胞RNA测序识别了神经脊细胞的中间状态，并在体内定位	目前对于中间状态在发育上皮-间质转化中的存在尚不清楚	探讨神经脊细胞上皮-间质转化过程中是否存在中间状态	小鼠胚胎中的神经脊细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	小鼠胚胎
410	2024-08-05	Prioritization of Kidney Cell Types Highlights Myofibroblast Cells in Regulating Human Blood Pressure 2024-Jun, Kidney international reports IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.ekir.2024.03.001 PMID:38899223	研究论文	本文探讨了肾脏特定细胞类型在调节人类血压中的作用	首次确认肌成纤维细胞在血压调节中的重要性，并通过多组独立数据进行了验证	研究仅集中于特定成人群体，可能不适用于其他人群	探讨肾脏中细胞类型如何影响血压的基因调控	主要研究肌成纤维细胞和内皮细胞在血压调节中的作用	数字病理学	NA	单细胞转录组测序	NA	基因组数据和单细胞转录组数据	1028980名欧洲血统成年人和14个成熟人类肾脏的单细胞数据
411	2024-08-05	The CDK9 inhibitor enitociclib overcomes resistance to BTK inhibition and CAR-T therapy in mantle cell lymphoma 2024-Jun-18, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-024-00589-7 PMID:38886769	研究论文	该文章探讨了CDK9抑制剂enitociclib对抗MCL中的BTK抑制和CAR-T疗法的耐药性	研究表明CDK9是双重耐药样本中上调基因的关键成分，提出针对CDK9的治疗可能有效对抗耐药性	尚未提及临床试验的数据和对其他类型淋巴瘤的适用性	研究新疗法以克服对BTK抑制和CAR-T治疗的耐药性	主要研究了mantle cell lymphoma (MCL) 的耐药性以及enitociclib的疗效	数字病理学	淋巴瘤	单细胞RNA测序	NA	细胞系	涉及MCL和弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系
412	2024-08-04	Single-cell sequencing unveils extensive intratumoral heterogeneity of cancer/testis antigen expression in melanoma and lung cancer 2024-Jun-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2023-008759 PMID:38886115	研究论文	本研究揭示了黑色素瘤和肺癌中癌/睾丸抗原表达的广泛肿瘤内异质性	首次使用单细胞mRNA测序详细描述了肿瘤内癌/睾丸抗原表达的异质性，特别是在黑色素瘤和肺癌中	虽然研究揭示了广泛的异质性，但肺癌中只在五个肿瘤中发现一个肿瘤的均匀表达，因此发现可能不足	研究癌/睾丸抗原在黑色素瘤和肺癌中的表达异质性及其对免疫治疗的影响	临床获得的黑色素瘤和肺癌样本中的癌细胞	数字病理学	黑色素瘤; 肺癌	单细胞mRNA测序	NA	mRNA表达数据	临床衍生样本中的多肿瘤细胞
413	2024-08-05	PR-SET7 epigenetically restrains uterine interferon response and cell death governing proper postnatal stromal development 2024-Jun-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49342-6 PMID:38858353	研究论文	该文章全面阐述了新生子宫在单细胞分辨率下的动态发展，及PR-SET7在子宫内干扰素应答和细胞死亡中的作用	揭示了PR-SET7通过催化H4K20me1对新生子宫基质发展进行表观遗传调控的机制	研究未明确探讨PR-SET7在其他阶段或不同生理条件下的作用	阐明PR-SET7在新生子宫基质发育中的表观遗传调控作用	新生子宫基质及其细胞群体	数字病理学	NA	RNA测序	NA	单细胞数据	NA
414	2024-08-05	Neutrophil extracellular traps induced by IL-1β promote endothelial dysfunction and aggravate limb ischemia 2024-Jun, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension IF:4.3Q1 DOI:10.1038/s41440-024-01661-3 PMID:38605142	研究论文	本研究探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）在肢体缺血相关的血管炎症和重塑中的功能意义	研究揭示了IL-1β诱导的NETs在肢体缺血中加剧内皮功能障碍的机制	未提供肢体缺血中NETs作用的全面机制和治疗效果的长期观察	研究NETs在肢体缺血相关血管炎症中的作用	本研究对象为人类肢体缺血中的中性粒细胞和内皮细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫荧光法	NA	NA	NA
415	2024-08-05	RIPK1 protects naive and regulatory T cells from TNFR1-induced apoptosis 2024-Jun, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-024-01301-w PMID:38734851	研究论文	本研究探讨了RIPK1在维持外周T细胞存活和防止TNFR1诱导的凋亡中的重要作用	揭示了RIPK1在不同外周T细胞亚群中的功能差异，且RIPK1的支架功能对T细胞的存活至关重要	未能明确不同外周T细胞亚群对RIPK1的需求差异	研究RIPK1在外周T细胞的生存和免疫反应中的作用	以RIPK1条件性缺失小鼠和其他基因敲除小鼠作为研究对象	免疫学	自身免疫性疾病	小鼠基因敲除技术	NA	转录组数据，细胞分选数据	涉及的样本包括不同亚群的CD4和CD8 T细胞
416	2024-08-05	T cells in testicular germ cell tumors: new evidence of fundamental contributions by rare subsets 2024-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-024-02669-9 PMID:38649788	研究论文	本文分析了罕见T细胞亚型在睾丸生殖细胞肿瘤（TGCT）中的基本贡献	首次发现人类睾丸中稀有Treg和Tfh细胞与TGCT的病理生物学相关	样本来源和患者间的显著异质性可能影响结果的普遍性	研究TGCT中免疫细胞组成的变化及其在肿瘤微环境中的角色	分析来自独立患者队列的人类睾丸标本中的免疫细胞	数字病理学	睾丸癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化和流式细胞术	NA	组织样本	来自多个独立患者队列的人类睾丸标本
417	2024-08-05	Spatially distinct epithelial and mesenchymal cell subsets along progressive lineage restriction in the branching embryonic mammary gland 2024-Jun, The EMBO journal DOI:10.1038/s44318-024-00115-3 PMID:38760574	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序绘制了小鼠乳腺上皮和间充质的图谱，并重建了多能干细胞的分化轨迹	确定了承诺的和多能乳腺干细胞的早期分子标记，并定义了它们在发育组织中的空间分布	缺乏对早期命运特征的具体标记，限制了对乳腺干细胞衍生的谱系承诺前体的描述	阐释多能干细胞的谱系特征及其在乳腺发育中的空间定位	小鼠乳腺上皮和间充质中的多能干细胞及其后代	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	E13.5到分娩阶段的小鼠样本
418	2024-08-05	Multi-omics profiling reveal cells with novel oncogenic cluster, TRAP1low/CAMSAP3low, emerge more aggressive behavior and poor-prognosis in early-stage endometrial cancer 2024-Jun-17, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-024-02039-2 PMID:38880903	研究论文	该研究通过多组学分析揭示了一种新的癌基因集群，TRAP1低表达/CAMSAP3低表达在早期子宫内膜癌中表现出更具攻击性的行为和较差的预后。	首次发现TRAP1和CAMSAP3在特定细胞集群中显著下调，并构建了结合TRAP1、CAMSAP3和TP53的新的预测模型。	本研究的样本量相对较小，仅包含24名早期子宫内膜癌患者，可能限制了结果的普遍适用性。	研究早期子宫内膜癌的临床异质性，识别高质量预后标志物及其在肿瘤攻击性行为中的潜在作用。	研究对象为早期子宫内膜癌患者及其癌和旁癌组织的样本。	数字病理学	子宫内膜癌	蛋白质组学和单细胞转录组测序（scRNA-seq）	NA	生物样本	24名早期子宫内膜癌患者
419	2024-08-04	Cystatin F attenuates neuroinflammation and demyelination following murine coronavirus infection of the central nervous system 2024-Jun-15, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03153-0 PMID:38879499	研究论文	Cystatin F在小鼠冠状病毒感染后的神经炎症和脱髓鞘化过程中的作用	首次详细探讨了Cystatin F在病毒感染后神经疾病严重性中的影响	主要使用小鼠模型，结果可能无法直接推广到人类	研究Cystatin F在小鼠冠状病毒引起的神经疾病中的作用	Cystatin F缺失的小鼠和野生型小鼠	数字病理学	NA	qPCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 电子显微镜	NA	细胞, RNA	Cst7-/-小鼠和控制小鼠的细胞样本
420	2024-08-04	Chemokine expression profile of an innate granuloma 2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.01.30.577927 PMID:38352492	研究论文	本研究旨在表征参与形成粒腺瘤的趋化因子。	使用空间转录组学技术动态研究趋化因子表达在粒腺瘤形成过程中的变化。	研究中对其他免疫细胞的角色探索不足。	探索趋化因子在免疫细胞形成粒腺瘤中的作用。	小鼠感染模型和其免疫反应中的单核细胞来源巨噬细胞。	数字病理学	NA	空间转录组学	NA	NA	小鼠感染模型