单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 546 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA transcriptomic reveal the mechanism of MSC derived small extracellular vesicles against DKD fibrosis
2024-Jun-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02613-2
PMID:38890734
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研究论文 | 该研究使用单细胞RNA测序分析MSC来源的小外泌体在糖尿病肾病纤维化中的机制 | 发现了与纤维化相关的新型TGF-βArg1巨噬细胞亚群，并揭示了MSC-sEV对肾间质纤维化的独特治疗机制 | 研究未提及样本数量和临床有效性验证 | 探讨MSC-sEV在糖尿病肾病纤维化中的作用机制 | 分析32724个肾脏单细胞以研究巨噬细胞和肾小管细胞的变化 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 分析了32724个细胞 |
| 402 | 2024-08-04 |
Clinically unfavorable transcriptome subtypes of non-WNT/non-SHH medulloblastomas are associated with a predominance in proliferating and progenitor-like cell subpopulations
2024-06-07, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02746-6
PMID:38847845
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研究论文 | 本研究探讨了非WNT/非SHH髓母细胞瘤中临床不良转录组亚型与细胞群体特征之间的关系。 | 识别出不同次级群体中具有独特基因表达特征和信号通路的预后相关转录组亚型。 | 缺乏对每个SGS MB分别应用单细胞技术的验证。 | 旨在探索非WNT/非SHH髓母细胞瘤中细胞组成与临床预后的关系。 | 研究对象为非WNT/非SHH髓母细胞瘤的不同转录组亚型及其细胞亚群体。 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 包括多个次级群体（SGS I-VIII）的样本 |
| 403 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis uncovers high-proliferative tumour cell subtypes and their interactions in the microenvironment of gastric cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18373
PMID:38894657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现胃癌微环境中的高增殖肿瘤细胞亚群及其相互作用 | 首次识别了胃癌中高度增殖的C2 UBE2C+肿瘤细胞亚群，并建立了基于UBE2C相关基因的预后评分模型 | 研究对象仅限于27名胃癌患者，数据来源单一，可能影响研究结果的广泛适用性 | 揭示胃癌快速进展的分子生物学机制 | 对胃癌患者的肿瘤微环境及其细胞亚群进行分析 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 27名胃癌患者的38个样本 |
| 404 | 2024-08-05 |
Single-Cell Dissection of the Immune Response After Acute Myocardial Infarction
2024-Jun, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.123.004374
PMID:38752343
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研究论文 | 本研究揭示了急性心肌梗死后免疫反应的细胞类型和疾病阶段。 | 通过单细胞RNA测序和血浆蛋白表达分析，识别了急性心肌梗死影响的免疫途径和细胞类型，提供了针对抗炎疗法受益患者的见解。 | 该研究的样本规模较小，仅包括38名患者和38名对照，可能限制结果的广泛适用性。 | 研究急性心肌梗死后免疫系统的反应及其对未来治疗的影响。 | 38名急性心肌梗死患者与38名对照参与者。 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液样本 | 38名急性心肌梗死患者和38名对照，共计95,995个病变外周血单核细胞和33,878个对照外周血单核细胞 |
| 405 | 2024-08-05 |
Ultrasound Neuromodulation of an Anti-Inflammatory Pathway at the Spleen Improves Experimental Pulmonary Hypertension
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323679
PMID:38712557
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研究论文 | 研究进行了脾脏的非侵入性聚焦超声刺激对实验性肺动脉高血压的影响 | 首次探讨了通过超声神经调节抑制脾脏的抗炎途径来改善实验性肺动脉高血压的潜力 | 主要在动物模型中进行，结果是否适用于人类尚需进一步验证 | 旨在探索非侵入性超声刺激对肺动脉高血压的治疗潜力 | 大鼠实验模型，包括Sugen/hypoxia模型和单克痕模型 | 数字病理学 | 肺动脉高血压 | 聚焦超声刺激 | NA | 组织学、免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 大鼠样本，具体数量未提供 |
| 406 | 2024-08-05 |
Identification and characterization of intermediate states in mammalian neural crest cell epithelial to mesenchymal transition and delamination
2024-Jun-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92844
PMID:38873887
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研究论文 | 该文章研究了哺乳动物神经脊细胞的上皮-间质转化及分层过程中的中间状态 | 首次通过单细胞RNA测序识别了神经脊细胞的中间状态，并在体内定位 | 目前对于中间状态在发育上皮-间质转化中的存在尚不清楚 | 探讨神经脊细胞上皮-间质转化过程中是否存在中间状态 | 小鼠胚胎中的神经脊细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎 |
| 407 | 2024-08-05 |
Prioritization of Kidney Cell Types Highlights Myofibroblast Cells in Regulating Human Blood Pressure
2024-Jun, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2024.03.001
PMID:38899223
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研究论文 | 本文探讨了肾脏特定细胞类型在调节人类血压中的作用 | 首次确认肌成纤维细胞在血压调节中的重要性，并通过多组独立数据进行了验证 | 研究仅集中于特定成人群体，可能不适用于其他人群 | 探讨肾脏中细胞类型如何影响血压的基因调控 | 主要研究肌成纤维细胞和内皮细胞在血压调节中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据和单细胞转录组数据 | 1028980名欧洲血统成年人和14个成熟人类肾脏的单细胞数据 |
| 408 | 2024-08-05 |
The CDK9 inhibitor enitociclib overcomes resistance to BTK inhibition and CAR-T therapy in mantle cell lymphoma
2024-Jun-18, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00589-7
PMID:38886769
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研究论文 | 该文章探讨了CDK9抑制剂enitociclib对抗MCL中的BTK抑制和CAR-T疗法的耐药性 | 研究表明CDK9是双重耐药样本中上调基因的关键成分，提出针对CDK9的治疗可能有效对抗耐药性 | 尚未提及临床试验的数据和对其他类型淋巴瘤的适用性 | 研究新疗法以克服对BTK抑制和CAR-T治疗的耐药性 | 主要研究了mantle cell lymphoma (MCL) 的耐药性以及enitociclib的疗效 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞系 | 涉及MCL和弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系 |
| 409 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing unveils extensive intratumoral heterogeneity of cancer/testis antigen expression in melanoma and lung cancer
2024-Jun-17, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008759
PMID:38886115
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素瘤和肺癌中癌/睾丸抗原表达的广泛肿瘤内异质性 | 首次使用单细胞mRNA测序详细描述了肿瘤内癌/睾丸抗原表达的异质性，特别是在黑色素瘤和肺癌中 | 虽然研究揭示了广泛的异质性，但肺癌中只在五个肿瘤中发现一个肿瘤的均匀表达，因此发现可能不足 | 研究癌/睾丸抗原在黑色素瘤和肺癌中的表达异质性及其对免疫治疗的影响 | 临床获得的黑色素瘤和肺癌样本中的癌细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤; 肺癌 | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 临床衍生样本中的多肿瘤细胞 |
| 410 | 2024-08-05 |
PR-SET7 epigenetically restrains uterine interferon response and cell death governing proper postnatal stromal development
2024-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49342-6
PMID:38858353
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研究论文 | 该文章全面阐述了新生子宫在单细胞分辨率下的动态发展，及PR-SET7在子宫内干扰素应答和细胞死亡中的作用 | 揭示了PR-SET7通过催化H4K20me1对新生子宫基质发展进行表观遗传调控的机制 | 研究未明确探讨PR-SET7在其他阶段或不同生理条件下的作用 | 阐明PR-SET7在新生子宫基质发育中的表观遗传调控作用 | 新生子宫基质及其细胞群体 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 411 | 2024-08-05 |
D-SPIN constructs gene regulatory network models from multiplexed scRNA-seq data revealing organizing principles of cellular perturbation response
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537364
PMID:37131803
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研究论文 | 本文介绍了一种计算框架D-SPIN，用于从单细胞RNA测序数据中构建基因调控网络模型 | D-SPIN模型能够通过量化的方式揭示细胞在基因敲低干扰下的调控逻辑和细胞路径组织 | NA | 旨在重建基因调控网络，理解细胞如何在有不同干扰条件下调节基因表达 | 大规模的Perturb-seq和药物反应数据集 | 计算生物学 | NA | 单细胞mRNA测序 | 概率模型 | 基因表达数据 | 来自数千种不同干扰条件的单细胞数据集 |
| 412 | 2024-08-05 |
Neutrophil extracellular traps induced by IL-1β promote endothelial dysfunction and aggravate limb ischemia
2024-Jun, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension
IF:4.3Q1
DOI:10.1038/s41440-024-01661-3
PMID:38605142
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）在肢体缺血相关的血管炎症和重塑中的功能意义 | 研究揭示了IL-1β诱导的NETs在肢体缺血中加剧内皮功能障碍的机制 | 未提供肢体缺血中NETs作用的全面机制和治疗效果的长期观察 | 研究NETs在肢体缺血相关血管炎症中的作用 | 本研究对象为人类肢体缺血中的中性粒细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫荧光法 | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-08-05 |
RIPK1 protects naive and regulatory T cells from TNFR1-induced apoptosis
2024-Jun, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01301-w
PMID:38734851
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研究论文 | 本研究探讨了RIPK1在维持外周T细胞存活和防止TNFR1诱导的凋亡中的重要作用 | 揭示了RIPK1在不同外周T细胞亚群中的功能差异，且RIPK1的支架功能对T细胞的存活至关重要 | 未能明确不同外周T细胞亚群对RIPK1的需求差异 | 研究RIPK1在外周T细胞的生存和免疫反应中的作用 | 以RIPK1条件性缺失小鼠和其他基因敲除小鼠作为研究对象 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 小鼠基因敲除技术 | NA | 转录组数据，细胞分选数据 | 涉及的样本包括不同亚群的CD4和CD8 T细胞 |
| 414 | 2024-08-05 |
T cells in testicular germ cell tumors: new evidence of fundamental contributions by rare subsets
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02669-9
PMID:38649788
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研究论文 | 本文分析了罕见T细胞亚型在睾丸生殖细胞肿瘤（TGCT）中的基本贡献 | 首次发现人类睾丸中稀有Treg和Tfh细胞与TGCT的病理生物学相关 | 样本来源和患者间的显著异质性可能影响结果的普遍性 | 研究TGCT中免疫细胞组成的变化及其在肿瘤微环境中的角色 | 分析来自独立患者队列的人类睾丸标本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化和流式细胞术 | NA | 组织样本 | 来自多个独立患者队列的人类睾丸标本 |
| 415 | 2024-08-05 |
Spatially distinct epithelial and mesenchymal cell subsets along progressive lineage restriction in the branching embryonic mammary gland
2024-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00115-3
PMID:38760574
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序绘制了小鼠乳腺上皮和间充质的图谱，并重建了多能干细胞的分化轨迹 | 确定了承诺的和多能乳腺干细胞的早期分子标记，并定义了它们在发育组织中的空间分布 | 缺乏对早期命运特征的具体标记，限制了对乳腺干细胞衍生的谱系承诺前体的描述 | 阐释多能干细胞的谱系特征及其在乳腺发育中的空间定位 | 小鼠乳腺上皮和间充质中的多能干细胞及其后代 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | E13.5到分娩阶段的小鼠样本 |
| 416 | 2024-08-05 |
Multi-omics profiling reveal cells with novel oncogenic cluster, TRAP1low/CAMSAP3low, emerge more aggressive behavior and poor-prognosis in early-stage endometrial cancer
2024-Jun-17, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02039-2
PMID:38880903
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研究论文 | 该研究通过多组学分析揭示了一种新的癌基因集群，TRAP1低表达/CAMSAP3低表达在早期子宫内膜癌中表现出更具攻击性的行为和较差的预后。 | 首次发现TRAP1和CAMSAP3在特定细胞集群中显著下调，并构建了结合TRAP1、CAMSAP3和TP53的新的预测模型。 | 本研究的样本量相对较小，仅包含24名早期子宫内膜癌患者，可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究早期子宫内膜癌的临床异质性，识别高质量预后标志物及其在肿瘤攻击性行为中的潜在作用。 | 研究对象为早期子宫内膜癌患者及其癌和旁癌组织的样本。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 蛋白质组学和单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 生物样本 | 24名早期子宫内膜癌患者 |
| 417 | 2024-08-04 |
Cystatin F attenuates neuroinflammation and demyelination following murine coronavirus infection of the central nervous system
2024-Jun-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03153-0
PMID:38879499
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研究论文 | Cystatin F在小鼠冠状病毒感染后的神经炎症和脱髓鞘化过程中的作用 | 首次详细探讨了Cystatin F在病毒感染后神经疾病严重性中的影响 | 主要使用小鼠模型，结果可能无法直接推广到人类 | 研究Cystatin F在小鼠冠状病毒引起的神经疾病中的作用 | Cystatin F缺失的小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 电子显微镜 | NA | 细胞, RNA | Cst7-/-小鼠和控制小鼠的细胞样本 |
| 418 | 2024-08-04 |
Chemokine expression profile of an innate granuloma
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.30.577927
PMID:38352492
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研究论文 | 本研究旨在表征参与形成粒腺瘤的趋化因子。 | 使用空间转录组学技术动态研究趋化因子表达在粒腺瘤形成过程中的变化。 | 研究中对其他免疫细胞的角色探索不足。 | 探索趋化因子在免疫细胞形成粒腺瘤中的作用。 | 小鼠感染模型和其免疫反应中的单核细胞来源巨噬细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 小鼠感染模型 |
| 419 | 2024-08-05 |
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597485
PMID:38895472
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研究论文 | 本文研究KLF4在平滑肌细胞来源的祖细胞中的作用，探讨其对心脏炎症和纤维化的影响 | 首次发现源自成熟血管平滑肌细胞的AdvSca1-SM细胞在心脏纤维化中的作用，并揭示了KLF4在调控这些细胞向致纤维化表型转变过程中的关键角色 | 目前尚不清楚KLF4如何具体调节AdvSca1-SM表型的分子机制 | 探讨KLF4在心脏炎症和纤维化相关过程中对平滑肌细胞来源祖细胞的作用 | 研究对象为来自主动脉、颈动脉和股动脉的AdvSca1-SM细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学方法 | NA | 基因组数据 | NA |
| 420 | 2024-08-05 |
ScSNViz: a user-friendly toolset for visualization and analysis of Cell-Specific Expressed SNVs
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596816
PMID:38895293
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研究论文 | 介绍了一种名为scSNViz的R基础工具集，用于可视化和分析细胞特异性表达的单核苷酸变异。 | 提供了3D可视化功能，兼容多个流行的scRNA-seq处理工具，并能够进行统计指标的估计和图形表示。 | NA | 旨在理解单细胞水平的遗传变异，以获取细胞异质性和基因表达调控的见解。 | 着重分析细胞特异性表达的单核苷酸变异（sceSNVs）。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |