单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 546 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-04 |
Long-read single-cell sequencing reveals the transcriptional landscape of spermatogenesis in obstructive azoospermia and Sertoli cell-only patients
2024-Jun-25, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcae009
PMID:38192002
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研究论文 | 本研究展示了阻塞性无精症和仅有塞尔托利细胞患者中生精过程的长读转录组特征 | 首次利用PacBio长读测序揭示了人类生精过程中的新转录本和新基因 | 研究样本量较小，仅限于患者的睾丸活检样本 | 揭示阻塞性无精症患者中生精的转录组特征 | 阻塞性无精症和非阻塞性无精症患者的睾丸细胞 | 数字病理学 | 生育不孕 | PacBio长读单细胞测序 | NA | 转录组数据 | OA患者3个样本，NOA患者3个样本 |
| 382 | 2024-08-05 |
SCTC: inference of developmental potential from single-cell transcriptional complexity
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae340
PMID:38709881
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞转录复杂性指标(SCTC)，用于更准确地推断单细胞的发育潜力。 | 引入了经济复杂性理论的见解，以改进对单细胞发育潜力的测量，比现有指标SCTD更精确。 | 在某些情况下，G表达并不会单调减少，这可能影响现有发育潜力估计的准确性。 | 研究单细胞分析中发育潜力的推断及伪时间重建方法。 | 关注单细胞转录组数据，这些数据能够提供细胞的发育潜力信息。 | 数字病理 | NA | scRNA-Seq | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-05 |
Lysine acetyltransferase 14 mediates TGF-β-induced fibrosis in ovarian endometrioma via co-operation with serum response factor
2024-Jun-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05243-2
PMID:38867256
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研究论文 | 这篇文章探讨了赖氨酸乙酰转移酶14在TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿纤维化中的作用 | 揭示了KAT14通过与血清反应因子SRF的合作，促进组蛋白H4乙酰化并增加ECM生成的机制 | 尚未深入探讨KAT14在其他类型内膜异位症中的作用及其潜在临床应用 | 研究TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿相关纤维化的分子机制 | 研究对象为卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类内膜间质细胞 | 数字病理学 | 卵巢内膜囊肿 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本，细胞系 | 涉及卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类间质细胞 |
| 384 | 2024-08-04 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Verification Define Different Angiogenesis Subtypes in Endometrial Carcinoma and Identify a Prognostic Signature
2024-Jun-18, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c03034
PMID:38911819
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，定义了子宫内膜癌的不同血管生成亚型，并识别了预后标志。 | 发现了子宫内膜癌患者的五种血管生成亚型，并构建了与血管生成相关的预后风险评分（APRS），提供了个体化的预后评估。 | 本研究的特定分子介导的血管生成对肿瘤免疫微环境的影响尚未清楚说明。 | 探讨血管生成在子宫内膜癌中的作用，并评估其对个体预后的影响。 | 研究了506例子宫内膜癌患者的血管生成模式及其相关的预后因素。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | qRT-PCR、免疫组化和单细胞测序数据分析 | NA | 转录组信息 | 506名子宫内膜癌患者 |
| 385 | 2024-08-04 |
Single-cell multi-ome and immune profiles of the Inspiration4 crew reveal conserved, cell-type, and sex-specific responses to spaceflight
2024-Jun-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49211-2
PMID:38862516
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研究论文 | 本研究揭示了宇航员在太空飞行中出现的免疫反应。 | 文章首次系统性绘制了太空飞行对免疫系统影响的单细胞多组学特征，并确认了与多个独立数据集的相符性。 | 研究可能受限于样本大小和只涵盖了特定太空任务的宇航员健康数据。 | 研究太空飞行对宇航员免疫反应的影响。 | SpaceX Inspiration4 (I4) 任务的宇航员。 | 数字病理学 | NA | 单细胞多组学、cfRNA、biochemical 数据及血液学数据 | NA | 基因表达数据 | SpaceX Inspiration4 任务的宇航员数据以及 NASA Twins Study 和其他独立数据集 |
| 386 | 2024-08-05 |
A body-brain circuit that regulates body inflammatory responses
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07469-y
PMID:38692285
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研究论文 | 该文章展示了一个调节身体炎症反应的身体-大脑回路 | 本研究首次揭示了外周免疫损伤如何激活身体-大脑轴以调节免疫反应 | 尚未探讨该回路在所有免疫疾病中的普遍适用性 | 研究身体-大脑轴在调节免疫反应中的作用 | 主要研究外周免疫刺激下的身体-大脑回路及其对炎症反应的影响 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 功能成像数据 | NA |
| 387 | 2024-08-07 |
Uncovering intestinal macrophages through the integration of single-cell and spatial transcriptomics
2024-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00242-7
PMID:38142267
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-05 |
Microcirculatory disturbance in acute liver injury is triggered by IFNγ-CD40 axis
2024-Jun-21, Journal of inflammation (London, England)
DOI:10.1186/s12950-024-00387-w
PMID:38907339
|
研究论文 | 文章分析了急性肝损伤中IFNγ-CD40轴引发的微循环障碍的分子机制 | 首次揭示了IFNγ-CD40轴在急性肝损伤微循环障碍中的关键作用 | 研究仅限于单中心的回顾性分析，结果可能有限于特定人群和模型 | 探讨急性肝损伤的发病机制及其与微循环障碍的关系 | 急性肝损伤患者和小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | Con A诱导的小鼠模型 | 血液样本、肝脏组织 | 120名急性肝损伤患者 |
| 389 | 2024-08-05 |
Identifying Novel Proteins for Chronic Pain: Integration of Human Brain Proteomes and Genome-Wide Association Data
2024-Jun-21, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2024.104610
PMID:38909833
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研究论文 | 本文旨在通过整合人脑蛋白组数据和全基因组关联数据来识别慢性疼痛的新蛋白质 | 提出了一种整合蛋白组和基因组数据的方法，以识别调节慢性疼痛风险的关键基因 | 研究可能受到样本选择和数据整合方法的限制 | 探讨遗传变异如何影响慢性疼痛的易感性 | 重点研究通过调节脑蛋白表达来影响慢性疼痛风险的关键基因 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序 | 整合蛋白组与基因组的数据分析 | 蛋白质组数据，转录组数据 | 387,649（GWAS数据），376和152（发现和确认的蛋白质组数据） |
| 390 | 2024-08-04 |
A Novel Macrophage Subpopulation Conveys Increased Genetic Risk of Coronary Artery Disease
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324172
PMID:38747151
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研究论文 | 该文章探讨了一种新的巨噬细胞亚群如何增加冠状动脉疾病的遗传风险 | 研究揭示了CD52-hi巨噬细胞亚群在动脉粥样硬化中的关键作用，以及与冠状动脉疾病相关的特定遗传变异和候选致病基因 | 研究可能在样本规模和病例异质性方面存在局限性 | 探索冠状动脉疾病中巨噬细胞亚群的遗传贡献和致病机制 | 主要以人类单核细胞源的巨噬细胞为研究对象 | 数字病理学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序和单细胞多组学 | NA | 基因组数据 | 来自38个动脉粥样硬化样本的5000多个巨噬细胞 |
| 391 | 2024-08-05 |
Integration mapping of cardiac fibroblast single-cell transcriptomes elucidates cellular principles of fibrosis in diverse pathologies
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8501
PMID:38905342
|
研究论文 | 本研究提供了一幅心脏纤维化的单细胞转录组整合图，揭示了多种病理状态下细胞纤维化的原理 | 创新性地整合了不同实验设计和分析流程的单细胞转录组数据，阐明心脏纤维化在心血管疾病中的病理生理学 | NA | 探讨心脏纤维化与各种心血管疾病的关系 | 心脏纤维细胞的单细胞转录组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 392 | 2024-08-04 |
Establishment and validation of a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature for predicting clinical outcomes and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01092-z
PMID:38900330
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研究论文 | 本文建立并验证了一个新的CD8+ T细胞相关预后标志，通过整合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据来预测肝细胞癌的临床结果和免疫治疗反应 | 提出了基于CD8+ T细胞的预后标志，这为肝细胞癌患者临床结果和免疫治疗反应的预测提供了强有力的模型 | 尚未提及研究的具体局限性 | 探讨CD8+ T细胞相关基因在肝细胞癌中的预后意义 | 利用来自不同数据库的HCC的单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | Cox-Lasso回归模型 | RNA数据 | NA |
| 393 | 2024-08-05 |
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07478-x
PMID:38839950
|
research paper | 本文探讨了MYCT1在调节人类造血干细胞（HSCs）环境感知和内吞作用中的重要性 | 发现MYCT1是人类HSC的重要调控因子，其缺失使HSC在培养中失去干性 | 研究主要基于体外实验，未在体内模型中验证结果 | 揭示MYCT1在保持人类造血干细胞干性中的作用 | 人类造血干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA |
| 394 | 2024-08-04 |
Structure and dynamics of enterovirus genotype networks
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1693
PMID:38896609
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研究论文 | 该论文研究了肠道病毒基因型网络的结构和动态 | 使用单细胞测序方法揭示了病毒种群结构的复杂性，并将宿主细胞转录表型与病毒基因型结构联系起来 | NA | 理解病毒种群如何适应选择环境的变化 | 肠道病毒的基因型及其与宿主细胞转录组的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | mRNA | 来自数百个感染细胞的病毒单倍型 |
| 395 | 2024-08-04 |
Expansion of learning capacity elicited by interspecific hybridization
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3409
PMID:38896617
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研究论文 | 该文章探讨了跨种杂交引发的学习能力扩展，特别是关于鸟类的歌唱学习 | 研究揭示了杂交鸟类在学习能力上超越亲本的机制，特别是在神经元转录特征方面的独特性 | 缺乏对环境因素及其影响的具体研究 | 探索物种特定的歌唱学习的神经遗传机制 | F杂交鸟类的学习能力及其神经元特征 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | F杂交鸟类的多个个体 |
| 396 | 2024-08-04 |
Tissue module discovery in single-cell-resolution spatial transcriptomics data via cell-cell interaction-aware cell embedding
2024-Jun-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.05.001
PMID:38823396
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research paper | 本研究提出了一种新的深度学习方法SPACE，用于通过细胞相互作用意识的细胞嵌入分析单细胞分辨率的空间转录组数据 | SPACE能够识别具有特殊空间分布模式和不同邻近相互作用细胞类型的空间信息细胞亚型，并自动发现具有明显边界的细胞社区 | NA | 揭示个体细胞如何发挥组织特异性功能的空间组织原则 | 单细胞分辨率的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 397 | 2024-08-05 |
Knockdown of ATRX enhances radiosensitivity in glioblastoma
2024-Jun-19, Chinese neurosurgical journal
DOI:10.1186/s41016-024-00371-6
PMID:38898533
|
研究论文 | 本研究探讨了ATRX在胶质母细胞瘤中的放射敏感性作用 | 揭示了ATRX突变对胶质母细胞瘤患者生存期的影响，并提出ATRX作为克服放射抗性的新靶点 | 未提供具体的临床试验数据支持 | 研究ATRX在胶质母细胞瘤放射抗性中的作用 | 胶质母细胞瘤患者的ATRX突变率及其表达 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从癌症基因组图谱中获取的胶质瘤患者数据 |
| 398 | 2024-08-04 |
Traumatic brain injury promotes neurogenesis at the cost of astrogliogenesis in the adult hippocampus of male mice
2024-Jun-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49299-6
PMID:38890340
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研究论文 | 创伤性脑损伤(TBI)导致小鼠成年海马中的神经发生增加，同时减少星形胶质细胞生成 | 本研究揭示了创伤性脑损伤如何改变神经干细胞的命运，促进神经发生而代价于星形胶质细胞生成 | 本研究仅在雄性小鼠中进行，未考虑性别对结果的影响 | 探讨创伤性脑损伤对成年小鼠海马神经干细胞及其衍生细胞线的影响 | 成年雄性小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 受控皮层撞击模型 | 细胞、基因表达数据 | NA |
| 399 | 2024-08-05 |
Empowering artificial intelligence in characterizing the human primary pacemaker of the heart at single cell resolution
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63542-6
PMID:38890395
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研究论文 | 本文利用新颖的深度学习解卷积方法对人类窦房结的细胞异质性进行了表征 | 采用Bulk2space方法揭示了人类窦房结的独特单细胞组成 | 样本稀缺性可能影响研究结果的全面性 | 探讨人类窦房结的细胞组成和功能 | 主要聚焦于人类窦房结的细胞群体 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | RNA-seq | 深度学习解卷积模型 | 单细胞转录组数据 | 包含18个人类细胞群体以及小鼠scRNA-Seq数据作为参考 |
| 400 | 2024-08-05 |
Identification of a novel monocyte/macrophage-related gene signature for predicting survival and immune response in acute myeloid leukemia
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64567-7
PMID:38890346
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研究论文 | 本研究开发了一种单核细胞/巨噬细胞相关的预后风险评分模型，以预测急性髓系白血病（AML）的生存和免疫反应 | 首次提出了MMrisk模型，该模型基于八个单核细胞/巨噬细胞相关基因，能有效预测AML患者的生存率和免疫特征 | 研究可能受限于样本量及所用数据集的特异性，尚需更多临床验证 | 旨在通过识别新的治疗生物标志物来改善急性髓系白血病的预后和免疫治疗效果 | 研究对象为急性髓系白血病患者及其单核细胞/巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序，差异表达基因分析 | Cox回归分析，LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用两个GEO数据集进行验证，样本具体数量未说明 |