单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
381	2024-08-05	Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2 2024-Jun-18, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06820-5 PMID:38890311	研究论文	本研究探讨了趋化因子chemerin在中性粒细胞逆向迁移中的作用机制	首次揭示了chemerin通过与C-C动机趋化因子受体样2的相互作用，吸引中性粒细胞离开炎症部位的机制	该研究主要集中在急性肺损伤模型，尚未在其他疾病模型中验证	旨在探索中性粒细胞逆向迁移的机制	主要研究在急性肺损伤模型中逆向迁移的中性粒细胞	数字病理学	肺癌	scRNA-seq	NA	血液样本	急性肺损伤模型中的白细胞
382	2024-08-05	Empowering artificial intelligence in characterizing the human primary pacemaker of the heart at single cell resolution 2024-06-18, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-63542-6 PMID:38890395	研究论文	本文利用新颖的深度学习解卷积方法对人类窦房结的细胞异质性进行了表征	采用Bulk2space方法揭示了人类窦房结的独特单细胞组成	样本稀缺性可能影响研究结果的全面性	探讨人类窦房结的细胞组成和功能	主要聚焦于人类窦房结的细胞群体	计算机视觉	心血管疾病	RNA-seq	深度学习解卷积模型	单细胞转录组数据	包含18个人类细胞群体以及小鼠scRNA-Seq数据作为参考
383	2024-08-05	Identification of a novel monocyte/macrophage-related gene signature for predicting survival and immune response in acute myeloid leukemia 2024-06-18, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-64567-7 PMID:38890346	研究论文	本研究开发了一种单核细胞/巨噬细胞相关的预后风险评分模型，以预测急性髓系白血病（AML）的生存和免疫反应	首次提出了MMrisk模型，该模型基于八个单核细胞/巨噬细胞相关基因，能有效预测AML患者的生存率和免疫特征	研究可能受限于样本量及所用数据集的特异性，尚需更多临床验证	旨在通过识别新的治疗生物标志物来改善急性髓系白血病的预后和免疫治疗效果	研究对象为急性髓系白血病患者及其单核细胞/巨噬细胞相关基因	数字病理学	急性髓系白血病	单细胞RNA测序，差异表达基因分析	Cox回归分析，LASSO回归分析	基因表达数据	使用两个GEO数据集进行验证，样本具体数量未说明
384	2024-08-05	Single-cell RNA transcriptomic reveal the mechanism of MSC derived small extracellular vesicles against DKD fibrosis 2024-Jun-18, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-024-02613-2 PMID:38890734	研究论文	该研究使用单细胞RNA测序分析MSC来源的小外泌体在糖尿病肾病纤维化中的机制	发现了与纤维化相关的新型TGF-βArg1巨噬细胞亚群，并揭示了MSC-sEV对肾间质纤维化的独特治疗机制	研究未提及样本数量和临床有效性验证	探讨MSC-sEV在糖尿病肾病纤维化中的作用机制	分析32724个肾脏单细胞以研究巨噬细胞和肾小管细胞的变化	数字病理学	糖尿病肾病	单细胞RNA测序	NA	细胞	分析了32724个细胞
385	2024-08-04	Unveiling inflammatory and prehypertrophic cell populations as key contributors to knee cartilage degeneration in osteoarthritis using multi-omics data integration 2024-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/ard-2023-224420 PMID:38325908	研究论文	本研究通过多组学数据整合揭示了炎症和预高血压细胞群体在骨关节炎膝关节软骨退化中的关键作用	首次识别了新的细胞类型（炎症软骨细胞和预高血压软骨细胞），并指出其在骨关节炎中的重要性	样本数量相对较小，仅来自8个骨关节炎患者和3个对照组	探讨膝关节软骨组织中与骨关节炎相关的细胞群体及其转录组特征	研究对象包括来自骨关节炎和非骨关节炎捐赠者的膝关节软骨组织样本	数字病理学	骨关节炎	单细胞RNA测序和空间转录组技术	NA	组织样本	共19个样本，来自8名骨关节炎患者和3名非骨关节炎对照
386	2024-08-04	Clinically unfavorable transcriptome subtypes of non-WNT/non-SHH medulloblastomas are associated with a predominance in proliferating and progenitor-like cell subpopulations 2024-06-07, Acta neuropathologica IF:9.3Q1 DOI:10.1007/s00401-024-02746-6 PMID:38847845	研究论文	本研究探讨了非WNT/非SHH髓母细胞瘤中临床不良转录组亚型与细胞群体特征之间的关系。	识别出不同次级群体中具有独特基因表达特征和信号通路的预后相关转录组亚型。	缺乏对每个SGS MB分别应用单细胞技术的验证。	旨在探索非WNT/非SHH髓母细胞瘤中细胞组成与临床预后的关系。	研究对象为非WNT/非SHH髓母细胞瘤的不同转录组亚型及其细胞亚群体。	数字病理学	髓母细胞瘤	单细胞RNA-seq	NA	RNA序列数据	包括多个次级群体（SGS I-VIII）的样本
387	2024-08-05	Single-cell analysis uncovers high-proliferative tumour cell subtypes and their interactions in the microenvironment of gastric cancer 2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.18373 PMID:38894657	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析发现胃癌微环境中的高增殖肿瘤细胞亚群及其相互作用	首次识别了胃癌中高度增殖的C2 UBE2C+肿瘤细胞亚群，并建立了基于UBE2C相关基因的预后评分模型	研究对象仅限于27名胃癌患者，数据来源单一，可能影响研究结果的广泛适用性	揭示胃癌快速进展的分子生物学机制	对胃癌患者的肿瘤微环境及其细胞亚群进行分析	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	基因表达数据	27名胃癌患者的38个样本
388	2024-08-05	Single-Cell Dissection of the Immune Response After Acute Myocardial Infarction 2024-Jun, Circulation. Genomic and precision medicine DOI:10.1161/CIRCGEN.123.004374 PMID:38752343	研究论文	本研究揭示了急性心肌梗死后免疫反应的细胞类型和疾病阶段。	通过单细胞RNA测序和血浆蛋白表达分析，识别了急性心肌梗死影响的免疫途径和细胞类型，提供了针对抗炎疗法受益患者的见解。	该研究的样本规模较小，仅包括38名患者和38名对照，可能限制结果的广泛适用性。	研究急性心肌梗死后免疫系统的反应及其对未来治疗的影响。	38名急性心肌梗死患者与38名对照参与者。	心血管疾病	心肌梗死	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	血液样本	38名急性心肌梗死患者和38名对照，共计95,995个病变外周血单核细胞和33,878个对照外周血单核细胞
389	2024-08-04	Targeting MAPK14 in microglial cells: neuroimmune implications of Panax ginseng in post-stroke inflammation 2024-Jun-21, The Journal of pharmacy and pharmacology IF:2.8Q2 DOI:10.1093/jpp/rgae067 PMID:38902954	研究论文	本研究探讨了人参及其皂苷如何减轻缺血性中风后的神经炎症损伤。	研究表明，Ginsenoside-Rc可以靶向并调节MAPK14活性，从而抑制炎症反应。	未来的研究需要通过临床试验评估Ginsenoside-Rc在患者中的疗效和安全性。	阐明人参成分在缺血性中风后对神经炎症损伤的影响及其相关分子通路。	研究对象为缺血性中风后的神经细胞及微胶质细胞。	神经免疫学	缺血性中风	单细胞测序和转录组分析	NA	基因表达数据	NA
390	2024-08-05	Ultrasound Neuromodulation of an Anti-Inflammatory Pathway at the Spleen Improves Experimental Pulmonary Hypertension 2024-Jun-21, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323679 PMID:38712557	研究论文	研究进行了脾脏的非侵入性聚焦超声刺激对实验性肺动脉高血压的影响	首次探讨了通过超声神经调节抑制脾脏的抗炎途径来改善实验性肺动脉高血压的潜力	主要在动物模型中进行，结果是否适用于人类尚需进一步验证	旨在探索非侵入性超声刺激对肺动脉高血压的治疗潜力	大鼠实验模型，包括Sugen/hypoxia模型和单克痕模型	数字病理学	肺动脉高血压	聚焦超声刺激	NA	组织学、免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序	大鼠样本，具体数量未提供
391	2024-08-05	3D reconstruction of the mouse cochlea from scRNA-seq data suggests morphogen-based principles in apex-to-base specification 2024-Jun-17, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.028 PMID:38593801	研究论文	本文探讨了小鼠耳蜗的三维重建，并提出了形态发生因子在耳蜗自顶到基底特征中的作用	创新之处在于通过scRNA-seq数据重建耳蜗，揭示了形态发生因子在空间身份赋予中的重要作用	无法完全明确调控小鼠耳蜗音调基因表达的分子机制	研究小鼠耳蜗中音调基因表达的分子机制	小鼠耳蜗的发育和相关的基因表达	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	E12.5和E14.5时间点的数据
392	2024-08-05	Identification and characterization of intermediate states in mammalian neural crest cell epithelial to mesenchymal transition and delamination 2024-Jun-14, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.92844 PMID:38873887	研究论文	该文章研究了哺乳动物神经脊细胞的上皮-间质转化及分层过程中的中间状态	首次通过单细胞RNA测序识别了神经脊细胞的中间状态，并在体内定位	目前对于中间状态在发育上皮-间质转化中的存在尚不清楚	探讨神经脊细胞上皮-间质转化过程中是否存在中间状态	小鼠胚胎中的神经脊细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	小鼠胚胎
393	2024-08-05	[Explorations about the correlation between biological changes of meninges in periodontitis mice and cognitive impairment via single-cell RNA sequencing] 2024-Jun-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology DOI:10.3760/cma.j.cn112144-20231102-00234 PMID:38808420	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析牙周炎小鼠脑膜的生物变化与认知障碍之间的潜在关联	首次揭示了牙周炎小鼠脑膜的生物变化与认知障碍之间的相关性，且通过单细胞RNA测序对脑膜细胞进行了详细分类	仅使用了C57BL/6小鼠作为研究对象，样本量较小，结果可能不具普遍性	探讨牙周炎对小鼠认知功能的影响及其潜在机制	C57BL/6小鼠，分为对照组和实验组	数字病理学	牙周病	单细胞RNA测序	NA	RNA表达数据，小鼠行为数据	30只C57BL/6小鼠
394	2024-08-05	Prioritization of Kidney Cell Types Highlights Myofibroblast Cells in Regulating Human Blood Pressure 2024-Jun, Kidney international reports IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.ekir.2024.03.001 PMID:38899223	研究论文	本文探讨了肾脏特定细胞类型在调节人类血压中的作用	首次确认肌成纤维细胞在血压调节中的重要性，并通过多组独立数据进行了验证	研究仅集中于特定成人群体，可能不适用于其他人群	探讨肾脏中细胞类型如何影响血压的基因调控	主要研究肌成纤维细胞和内皮细胞在血压调节中的作用	数字病理学	NA	单细胞转录组测序	NA	基因组数据和单细胞转录组数据	1028980名欧洲血统成年人和14个成熟人类肾脏的单细胞数据
395	2024-08-05	The CDK9 inhibitor enitociclib overcomes resistance to BTK inhibition and CAR-T therapy in mantle cell lymphoma 2024-Jun-18, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-024-00589-7 PMID:38886769	研究论文	该文章探讨了CDK9抑制剂enitociclib对抗MCL中的BTK抑制和CAR-T疗法的耐药性	研究表明CDK9是双重耐药样本中上调基因的关键成分，提出针对CDK9的治疗可能有效对抗耐药性	尚未提及临床试验的数据和对其他类型淋巴瘤的适用性	研究新疗法以克服对BTK抑制和CAR-T治疗的耐药性	主要研究了mantle cell lymphoma (MCL) 的耐药性以及enitociclib的疗效	数字病理学	淋巴瘤	单细胞RNA测序	NA	细胞系	涉及MCL和弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系
396	2024-08-04	Single-cell sequencing unveils extensive intratumoral heterogeneity of cancer/testis antigen expression in melanoma and lung cancer 2024-Jun-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2023-008759 PMID:38886115	研究论文	本研究揭示了黑色素瘤和肺癌中癌/睾丸抗原表达的广泛肿瘤内异质性	首次使用单细胞mRNA测序详细描述了肿瘤内癌/睾丸抗原表达的异质性，特别是在黑色素瘤和肺癌中	虽然研究揭示了广泛的异质性，但肺癌中只在五个肿瘤中发现一个肿瘤的均匀表达，因此发现可能不足	研究癌/睾丸抗原在黑色素瘤和肺癌中的表达异质性及其对免疫治疗的影响	临床获得的黑色素瘤和肺癌样本中的癌细胞	数字病理学	黑色素瘤; 肺癌	单细胞mRNA测序	NA	mRNA表达数据	临床衍生样本中的多肿瘤细胞
397	2024-08-05	Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveals heterogeneity of serine-glycine-one-carbon metabolism with distinct prognoses and therapeutic vulnerabilities in HNSCC 2024-Jun-17, International journal of oral science IF:10.8Q1 DOI:10.1038/s41368-024-00310-2 PMID:38886346	研究论文	本研究揭示了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中氨基酸-甘氨酸-一碳代谢的异质性及其对预后和治疗易感性的影响	通过单细胞RNA测序和总体转录组学分析，构建了4个SGOC基因预后签名，为HNSCC的个性化治疗提供了新的视角	尚未在更大的人群中验证SGOC代谢相关靶点的有效性	阐明HNSCC代谢异质性及其生物学角色，以推动精准肿瘤学的发展	主要研究头颈部鳞状细胞癌患者的代谢异质性及其预后	数字病理学	头颈部癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	LASSO-COX回归分析	转录组数据	NA
398	2024-08-05	PR-SET7 epigenetically restrains uterine interferon response and cell death governing proper postnatal stromal development 2024-Jun-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49342-6 PMID:38858353	研究论文	该文章全面阐述了新生子宫在单细胞分辨率下的动态发展，及PR-SET7在子宫内干扰素应答和细胞死亡中的作用	揭示了PR-SET7通过催化H4K20me1对新生子宫基质发展进行表观遗传调控的机制	研究未明确探讨PR-SET7在其他阶段或不同生理条件下的作用	阐明PR-SET7在新生子宫基质发育中的表观遗传调控作用	新生子宫基质及其细胞群体	数字病理学	NA	RNA测序	NA	单细胞数据	NA
399	2024-08-04	Defining mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived suppressor cells using single-cell transcriptomics 2024-Jun-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.04.026 PMID:38627968	研究论文	本研究分析了间充质干细胞诱导的髓系来源抑制细胞的转录组特征	识别了MSC诱导的MDSCs的独特转录组特征，并确定了CSF-1R作为检测和富集MDSCs的关键细胞表面标记	研究中未指出关于RELM-γ对T细胞增殖及其他功能的具体影响	揭示间充质干细胞诱导的髓系来源抑制细胞的机制和特征	间充质干细胞诱导的CD11bLy6C细胞及其亚群	数字病理学	自体免疫性疾病	单细胞RNA测序	NA	细胞转录组数据	分析了多种MDSCs和CD11bLy6C细胞亚群
400	2024-08-07	Single-cell transcriptomics unveil a unique molecular profile of mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived immune suppressor cells 2024-Jun-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.009 PMID:38795702	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA