单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 544 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-05 |
Mobilization and activation of tumor-infiltrating dendritic cells inhibits lymph node metastasis in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Jun-26, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-024-02079-z
PMID:38926350
|
研究论文 | 本文研究了肝内胆管癌中肿瘤浸润性树突状细胞的动员与激活对淋巴结转移的抑制作用 | 揭示了肿瘤细胞内源性β-连环蛋白激活作为在肝内胆管癌中逃避树突状细胞介导的抗肿瘤免疫的关键机制 | 尚未探讨FL-pIC疗法或β-连环蛋白抑制剂的临床有效性 | 探讨淋巴结转移的机制及肿瘤免疫控制的潜在治疗方法 | 研究了244例肝内胆管癌样本中的树突状细胞浸润和相关免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | scRNA-seq和bulk RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 219例手术切除的肝内胆管癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-05 |
The Advancement and Application of the Single-Cell Transcriptome in Biological and Medical Research
2024-Jun-19, Biology
DOI:10.3390/biology13060451
PMID:38927331
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序技术的发展及其在生物和医学研究中的应用 | 深入分析了不同单细胞转录组技术的发展过程，并总结其与其他组学分析的整合 | 当前单细胞转录组技术仍不完善，存在一些不足之处 | 帮助更深入理解scRNA-seq技术及其在生物和医学研究中的应用 | 单细胞转录组数据及其在多个研究领域的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic and Targeted Genomic Profiling Adjusted for Inflammation and Therapy Bias Reveal CRTAM and PLCB1 as Novel Hub Genes for Anti-Tumor Necrosis Factor Alpha Therapy Response in Crohn's Disease
2024-Jun-19, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics16060835
PMID:38931955
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研究论文 | 该研究揭示了 CRTAM 和 PLCB1 作为克罗恩病抗肿瘤坏死因子 Alpha 治疗反应的新中心基因 | 该研究采用单细胞 RNA 测序探索特定免疫细胞亚群体，为抗 TNFα 生物治疗的生物标志物发现提供了新的视角 | 本研究主要集中于特定细胞类型，可能未能涵盖更广泛的生物标志物探索 | 研究抗肿瘤坏死因子 Alpha 治疗的生物标志物以改善克罗恩病患者的个性化治疗 | 克罗恩病患者的外周血单核细胞基因表达 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞 RNA 测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自不同治疗状态的克罗恩病患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-04 |
Advances in Single-Cell Transcriptome Sequencing and Spatial Transcriptome Sequencing in Plants
2024-Jun-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13121679
PMID:38931111
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研究论文 | 文章概述了植物单细胞转录组和空间转录组测序的研究进展以及它们在植物中的应用和挑战 | 介绍了单细胞和空间转录组测序技术的创新以及其对细胞特异性表达的揭示 | 该研究主要集中在植物领域，可能不适用于动物细胞转录组的分析 | 探讨单细胞和空间转录组测序在植物研究中的应用 | 主要研究植物组织中单个细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序与空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-04 |
Exploring the Molecular Mechanism of Comorbidity of Type 2 Diabetes Mellitus and Colorectal Cancer: Insights from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-Jun-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060693
PMID:38927096
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研究论文 | 本研究首次使用批量RNA测序和单细胞RNA测序数据探讨2型糖尿病与结直肠癌之间的分子机制 | 本研究揭示了EVPL和ENTPD3作为2型糖尿病和结直肠癌共病的特征分子，强调了免疫机制在这两种疾病共同发展的重要性 | 本研究可能在探索分子机制方面存在一定的局限性，尤其是需要更多样本验证结果 | 研究2型糖尿病与结直肠癌之间的共享分子机制 | 重点研究EVPL和ENTPD3这两个核心共病基因 | 数字病理学 | 2型糖尿病和结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-04 |
Accurate Identification of Spatial Domain by Incorporating Global Spatial Proximity and Local Expression Proximity
2024-Jun-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060674
PMID:38927077
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研究论文 | 文章提出了一种新的深度学习方法SECE，用于准确识别空间转录组数据中的空间域 | 提出的SECE方法结合了局部与全局空间关系，充分利用空间信息，提高了识别精度 | 研究未提及可能在不同生物组织中的适用性 | 旨在提高空间转录组数据分析中空间域的识别准确性 | 针对真实的空间转录组数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 空间转录组数据 | 六个真实数据集，涵盖四个不同平台 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-05 |
Integrated Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Metabolic Reprogramming of Liver Cancer and Establishes a Prognostic Risk Model
2024-Jun-08, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060755
PMID:38927691
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研究论文 | 该文章分析了肝癌的代谢重编程，并建立了预后风险模型 | 通过单细胞转录组分析和代谢视角建立的预后风险模型对于肝癌的精确预防和治疗具有重要意义 | 该研究仅限于所选样本，可能无法广泛适用于所有肝癌患者 | 旨在提供肝癌患者的分层和精确治疗方法 | 研究对象包括105,829个单细胞转录组分析中识别的11种细胞类型 | 数字病理 | 肝癌 | scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq | NA | 细胞数据 | 105,829个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-04 |
Ploidy inference from single-cell data: application to human and mouse cell atlases
2024-06-05, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae061
PMID:38651869
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研究论文 | 本研究开发了一种从单细胞ATAC-seq数据推断细胞倍性的统计方法 | 首次将倍性分析集成到单细胞研究中，并能够系统地检测多倍性 | 可能需要额外的测定步骤以测量倍性 | 旨在填补单细胞研究中倍性分析的空白 | 人类和小鼠细胞图谱的数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 人类和小鼠的多个细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of human oocytes reveals a differential transcriptomic profile associated with agar-like zona pellucida
2024-Jun-26, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01463-8
PMID:38926883
|
研究论文 | 该文章探讨了具有琼脂样透明带的单个细胞卵母细胞的转录组特征 | 揭示了与琼脂样透明带相关的分子机制及其涉及的差异表达基因 | 研究样本数量较少，仅涉及四名患者和四名健康供体 | 阐明琼脂样透明带的分子机制及其对卵母细胞的影响 | 琼脂样透明带卵母细胞与健康卵母细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个卵母细胞样本（四个琼脂样透明带患者和四个健康供体） | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-07 |
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-Jun-26, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2652-y
PMID:38940831
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-05 |
Pan-cancer multi-omics analysis of PTBP1 reveals it as an inflammatory, progressive and prognostic marker in glioma
2024-06-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64979-5
PMID:38918441
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研究论文 | 本研究分析了PTBP1在胶质瘤中的炎症、进展和预后标志物的角色。 | 揭示了PTBP1在多种癌症中的表达、甲基化与预后之间的关系，并首次将其作为胶质瘤的标志物。 | 尚不清楚PTBP1表达与肿瘤微环境的具体关系。 | 探讨PTBP1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力。 | PTBP1在不同癌症类型中的表达与甲基化模式。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 基因集合富集分析（GSEA），单细胞转录组分析，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据，甲基化数据 | 使用了多种数据集，包括TCGA、GTEx和CGGA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-05 |
Insight into Fructose-to-Sucrose Ratio as the Potential Target of Urinalysis in Bladder Cancer
2024-Jun-20, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14060345
PMID:38921479
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研究论文 | 本文探讨了尿液中果糖与蔗糖比作为膀胱癌尿液分析的潜在目标 | 研究首次揭示了尿液中果糖与蔗糖比与膀胱癌风险之间的双向负因果关系 | 研究主要依赖于动物模型，可能无法完全反映人类膀胱癌的复杂性 | 研究膀胱癌中可操作的非侵入性筛查生物标志物 | 膀胱癌相关的尿液代谢物及其与膀胱癌风险的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, Mendelian随机化分析 | BBN诱导的小鼠模型 | 生物标志物数据 | 使用BBN诱导的小鼠模型进行验证的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-05 |
Identification of therapeutic targets and medicines for comorbid Crohn's disease and rheumatoid arthritis: A comprehensive analysis
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32406
PMID:38933947
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研究论文 | 本研究旨在识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的潜在治疗靶点和药物 | 本研究运用单细胞RNA测序和孟德尔随机化等新方法来识别共患疾病的关键免疫细胞及其靶点 | 未提及研究的具体局限性 | 识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的治疗靶点和潜在药物 | 共患克罗恩病和类风湿关节炎的患者的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 克罗恩病/类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 文本 | 纳入共患克罗恩病和类风湿关节炎患者的PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02255-1
PMID:38724673
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研究论文 | 本研究揭示了AML/T细胞相互作用对患者结果的相关性及ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用 | 该研究首次揭示了ICAM1作为免疫触发因子在小鼠体内T细胞杀死AML细胞中的作用 | 研究主要集中于AML样本与T细胞的体外相互作用，可能未能全面反映整体免疫环境 | 探讨AML患者对T细胞杀伤的敏感性及其相互作用的分子机制 | AML细胞样本与人源工程化的CD4 T细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 多个AML患者样本和CD4 T细胞的组合 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-04 |
Beyond the marrow: insights from comprehensive next-generation sequencing of extramedullary multiple myeloma tumors
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02206-w
PMID:38493239
|
研究论文 | 此研究对外髓性多发性骨髓瘤（EMM）肿瘤进行了全面的下一代测序分析 | 首次揭示EMM的肿瘤微环境，识别关键的分子特征和潜在的治疗靶点 | 样本规模相对较小，仅有14个样本 | 探讨EMM肿瘤的分子特征和开发有效的治疗策略 | 外髓性多发性骨髓瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序（NGS） | NA | 肿瘤样本 | 14个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-05 |
Recapitulation of Perturbed Striatal Gene Expression Dynamics of Donors' Brains With Ventral Forebrain Organoids Derived From the Same Individuals With Schizophrenia
2024-Jun-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220723
PMID:37915216
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研究论文 | 本研究通过从精神分裂症患者及神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官探索与精神分裂症相关的纹状体发育变化 | 提出了一种从精神分裂症患者的诱导多能干细胞生成腹侧前脑类器官的方法，并揭示了精神分裂症患者细胞在发育轨迹上的差异 | 研究样本量较小，仅限于四名精神分裂症患者和四名神经正常对照者 | 探索与精神分裂症相关的纹状体神经发育改变 | 来自精神分裂症患者和神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 诱导多能干细胞(IPS细胞)差异化 | 腹侧前脑类器官(VFO) | 单细胞RNA测序 | 四名精神分裂症患者及四名神经正常对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-05 |
A risk score based on polyamine metabolism and chemotherapy-related genes predicts prognosis and immune cells infiltration of lung adenocarcinoma
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18387
PMID:38924680
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研究论文 | 本文探讨了铂类治疗和多胺代谢相关基因是否能够预测肺腺癌的预后 | 建立了基于铂类治疗和多胺代谢的关键基因的风险评分模型，提供了新颖的预后预测角度 | 行政性缺乏大规模临床试验验证该风险评分模型的准确性 | 研究铂类治疗和多胺代谢基因在LUAD预后预测中的作用 | 与铂类治疗和多胺代谢相关的基因及其对免疫细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | 风险评分模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-07 |
Using single-cell transcriptomics to predict which tumors will respond to targeted therapy
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00757-6
PMID:38684925
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-05 |
Longitudinal single-cell data informs deterministic modelling of inflammatory bowel disease
2024-Jun-24, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00395-9
PMID:38914538
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研究论文 | 本研究探讨如何利用纵向单细胞数据进行炎症性肠病的确定性建模 | 提出了利用ODE模型定量描述免疫动态的新方法，并验证了细胞周转率与生物过程之间的关系 | 模型的验证主要依赖于小鼠实验，可能不完全适用于人类 | 旨在通过数学建模深入理解炎症性肠病中的免疫动态 | 研究小鼠结肠炎中的细胞变化与人类炎症性肠病患者的数据 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 常微分方程(ODE) | 细胞计数数据和基因表达数据 | 涉及小鼠结肠炎模型和人类IBD患者的统一数据 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-04 |
Advances in spatial transcriptomics and its applications in cancer research
2024-Jun-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02040-9
PMID:38902727
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研究论文 | 本文总结了空间转录组技术的发展及其在癌症研究中的应用 | 本研究通过空间转录组技术能够实现基因表达的空间上下文量化与可视化，提供了比传统转录组更多的信息 | 目前的空间转录组方法存在一些局限性和挑战 | 探讨空间转录组技术在癌症研究中的应用及其未来发展方向 | 癌症相关的转录组数据及其空间表达 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |