单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 553 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-05 |
Identifying Novel Proteins for Chronic Pain: Integration of Human Brain Proteomes and Genome-Wide Association Data
2024-Jun-21, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2024.104610
PMID:38909833
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研究论文 | 本文旨在通过整合人脑蛋白组数据和全基因组关联数据来识别慢性疼痛的新蛋白质 | 提出了一种整合蛋白组和基因组数据的方法，以识别调节慢性疼痛风险的关键基因 | 研究可能受到样本选择和数据整合方法的限制 | 探讨遗传变异如何影响慢性疼痛的易感性 | 重点研究通过调节脑蛋白表达来影响慢性疼痛风险的关键基因 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序 | 整合蛋白组与基因组的数据分析 | 蛋白质组数据，转录组数据 | 387,649（GWAS数据），376和152（发现和确认的蛋白质组数据） |
| 382 | 2024-08-04 |
A Novel Macrophage Subpopulation Conveys Increased Genetic Risk of Coronary Artery Disease
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324172
PMID:38747151
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研究论文 | 该文章探讨了一种新的巨噬细胞亚群如何增加冠状动脉疾病的遗传风险 | 研究揭示了CD52-hi巨噬细胞亚群在动脉粥样硬化中的关键作用，以及与冠状动脉疾病相关的特定遗传变异和候选致病基因 | 研究可能在样本规模和病例异质性方面存在局限性 | 探索冠状动脉疾病中巨噬细胞亚群的遗传贡献和致病机制 | 主要以人类单核细胞源的巨噬细胞为研究对象 | 数字病理学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序和单细胞多组学 | NA | 基因组数据 | 来自38个动脉粥样硬化样本的5000多个巨噬细胞 |
| 383 | 2024-08-05 |
Integration mapping of cardiac fibroblast single-cell transcriptomes elucidates cellular principles of fibrosis in diverse pathologies
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8501
PMID:38905342
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研究论文 | 本研究提供了一幅心脏纤维化的单细胞转录组整合图，揭示了多种病理状态下细胞纤维化的原理 | 创新性地整合了不同实验设计和分析流程的单细胞转录组数据，阐明心脏纤维化在心血管疾病中的病理生理学 | NA | 探讨心脏纤维化与各种心血管疾病的关系 | 心脏纤维细胞的单细胞转录组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 384 | 2024-08-04 |
Establishment and validation of a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature for predicting clinical outcomes and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01092-z
PMID:38900330
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研究论文 | 本文建立并验证了一个新的CD8+ T细胞相关预后标志，通过整合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据来预测肝细胞癌的临床结果和免疫治疗反应 | 提出了基于CD8+ T细胞的预后标志，这为肝细胞癌患者临床结果和免疫治疗反应的预测提供了强有力的模型 | 尚未提及研究的具体局限性 | 探讨CD8+ T细胞相关基因在肝细胞癌中的预后意义 | 利用来自不同数据库的HCC的单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | Cox-Lasso回归模型 | RNA数据 | NA |
| 385 | 2024-08-05 |
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07478-x
PMID:38839950
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research paper | 本文探讨了MYCT1在调节人类造血干细胞（HSCs）环境感知和内吞作用中的重要性 | 发现MYCT1是人类HSC的重要调控因子，其缺失使HSC在培养中失去干性 | 研究主要基于体外实验，未在体内模型中验证结果 | 揭示MYCT1在保持人类造血干细胞干性中的作用 | 人类造血干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA |
| 386 | 2024-08-04 |
Structure and dynamics of enterovirus genotype networks
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1693
PMID:38896609
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研究论文 | 该论文研究了肠道病毒基因型网络的结构和动态 | 使用单细胞测序方法揭示了病毒种群结构的复杂性，并将宿主细胞转录表型与病毒基因型结构联系起来 | NA | 理解病毒种群如何适应选择环境的变化 | 肠道病毒的基因型及其与宿主细胞转录组的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | mRNA | 来自数百个感染细胞的病毒单倍型 |
| 387 | 2024-08-04 |
Expansion of learning capacity elicited by interspecific hybridization
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3409
PMID:38896617
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研究论文 | 该文章探讨了跨种杂交引发的学习能力扩展，特别是关于鸟类的歌唱学习 | 研究揭示了杂交鸟类在学习能力上超越亲本的机制，特别是在神经元转录特征方面的独特性 | 缺乏对环境因素及其影响的具体研究 | 探索物种特定的歌唱学习的神经遗传机制 | F杂交鸟类的学习能力及其神经元特征 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | F杂交鸟类的多个个体 |
| 388 | 2024-08-04 |
Tissue module discovery in single-cell-resolution spatial transcriptomics data via cell-cell interaction-aware cell embedding
2024-Jun-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.05.001
PMID:38823396
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research paper | 本研究提出了一种新的深度学习方法SPACE，用于通过细胞相互作用意识的细胞嵌入分析单细胞分辨率的空间转录组数据 | SPACE能够识别具有特殊空间分布模式和不同邻近相互作用细胞类型的空间信息细胞亚型，并自动发现具有明显边界的细胞社区 | NA | 揭示个体细胞如何发挥组织特异性功能的空间组织原则 | 单细胞分辨率的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 389 | 2024-08-05 |
Knockdown of ATRX enhances radiosensitivity in glioblastoma
2024-Jun-19, Chinese neurosurgical journal
DOI:10.1186/s41016-024-00371-6
PMID:38898533
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研究论文 | 本研究探讨了ATRX在胶质母细胞瘤中的放射敏感性作用 | 揭示了ATRX突变对胶质母细胞瘤患者生存期的影响，并提出ATRX作为克服放射抗性的新靶点 | 未提供具体的临床试验数据支持 | 研究ATRX在胶质母细胞瘤放射抗性中的作用 | 胶质母细胞瘤患者的ATRX突变率及其表达 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从癌症基因组图谱中获取的胶质瘤患者数据 |
| 390 | 2024-08-04 |
Traumatic brain injury promotes neurogenesis at the cost of astrogliogenesis in the adult hippocampus of male mice
2024-Jun-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49299-6
PMID:38890340
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研究论文 | 创伤性脑损伤(TBI)导致小鼠成年海马中的神经发生增加，同时减少星形胶质细胞生成 | 本研究揭示了创伤性脑损伤如何改变神经干细胞的命运，促进神经发生而代价于星形胶质细胞生成 | 本研究仅在雄性小鼠中进行，未考虑性别对结果的影响 | 探讨创伤性脑损伤对成年小鼠海马神经干细胞及其衍生细胞线的影响 | 成年雄性小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 受控皮层撞击模型 | 细胞、基因表达数据 | NA |
| 391 | 2024-08-05 |
Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2
2024-Jun-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06820-5
PMID:38890311
|
研究论文 | 本研究探讨了趋化因子chemerin在中性粒细胞逆向迁移中的作用机制 | 首次揭示了chemerin通过与C-C动机趋化因子受体样2的相互作用，吸引中性粒细胞离开炎症部位的机制 | 该研究主要集中在急性肺损伤模型，尚未在其他疾病模型中验证 | 旨在探索中性粒细胞逆向迁移的机制 | 主要研究在急性肺损伤模型中逆向迁移的中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 血液样本 | 急性肺损伤模型中的白细胞 |
| 392 | 2024-08-05 |
Empowering artificial intelligence in characterizing the human primary pacemaker of the heart at single cell resolution
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63542-6
PMID:38890395
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研究论文 | 本文利用新颖的深度学习解卷积方法对人类窦房结的细胞异质性进行了表征 | 采用Bulk2space方法揭示了人类窦房结的独特单细胞组成 | 样本稀缺性可能影响研究结果的全面性 | 探讨人类窦房结的细胞组成和功能 | 主要聚焦于人类窦房结的细胞群体 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | RNA-seq | 深度学习解卷积模型 | 单细胞转录组数据 | 包含18个人类细胞群体以及小鼠scRNA-Seq数据作为参考 |
| 393 | 2024-08-05 |
Identification of a novel monocyte/macrophage-related gene signature for predicting survival and immune response in acute myeloid leukemia
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64567-7
PMID:38890346
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研究论文 | 本研究开发了一种单核细胞/巨噬细胞相关的预后风险评分模型，以预测急性髓系白血病（AML）的生存和免疫反应 | 首次提出了MMrisk模型，该模型基于八个单核细胞/巨噬细胞相关基因，能有效预测AML患者的生存率和免疫特征 | 研究可能受限于样本量及所用数据集的特异性，尚需更多临床验证 | 旨在通过识别新的治疗生物标志物来改善急性髓系白血病的预后和免疫治疗效果 | 研究对象为急性髓系白血病患者及其单核细胞/巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序，差异表达基因分析 | Cox回归分析，LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用两个GEO数据集进行验证，样本具体数量未说明 |
| 394 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA transcriptomic reveal the mechanism of MSC derived small extracellular vesicles against DKD fibrosis
2024-Jun-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02613-2
PMID:38890734
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研究论文 | 该研究使用单细胞RNA测序分析MSC来源的小外泌体在糖尿病肾病纤维化中的机制 | 发现了与纤维化相关的新型TGF-βArg1巨噬细胞亚群，并揭示了MSC-sEV对肾间质纤维化的独特治疗机制 | 研究未提及样本数量和临床有效性验证 | 探讨MSC-sEV在糖尿病肾病纤维化中的作用机制 | 分析32724个肾脏单细胞以研究巨噬细胞和肾小管细胞的变化 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 分析了32724个细胞 |
| 395 | 2024-08-04 |
Clinically unfavorable transcriptome subtypes of non-WNT/non-SHH medulloblastomas are associated with a predominance in proliferating and progenitor-like cell subpopulations
2024-06-07, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02746-6
PMID:38847845
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研究论文 | 本研究探讨了非WNT/非SHH髓母细胞瘤中临床不良转录组亚型与细胞群体特征之间的关系。 | 识别出不同次级群体中具有独特基因表达特征和信号通路的预后相关转录组亚型。 | 缺乏对每个SGS MB分别应用单细胞技术的验证。 | 旨在探索非WNT/非SHH髓母细胞瘤中细胞组成与临床预后的关系。 | 研究对象为非WNT/非SHH髓母细胞瘤的不同转录组亚型及其细胞亚群体。 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 包括多个次级群体（SGS I-VIII）的样本 |
| 396 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis uncovers high-proliferative tumour cell subtypes and their interactions in the microenvironment of gastric cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18373
PMID:38894657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现胃癌微环境中的高增殖肿瘤细胞亚群及其相互作用 | 首次识别了胃癌中高度增殖的C2 UBE2C+肿瘤细胞亚群，并建立了基于UBE2C相关基因的预后评分模型 | 研究对象仅限于27名胃癌患者，数据来源单一，可能影响研究结果的广泛适用性 | 揭示胃癌快速进展的分子生物学机制 | 对胃癌患者的肿瘤微环境及其细胞亚群进行分析 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 27名胃癌患者的38个样本 |
| 397 | 2024-08-05 |
Single-Cell Dissection of the Immune Response After Acute Myocardial Infarction
2024-Jun, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.123.004374
PMID:38752343
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研究论文 | 本研究揭示了急性心肌梗死后免疫反应的细胞类型和疾病阶段。 | 通过单细胞RNA测序和血浆蛋白表达分析，识别了急性心肌梗死影响的免疫途径和细胞类型，提供了针对抗炎疗法受益患者的见解。 | 该研究的样本规模较小，仅包括38名患者和38名对照，可能限制结果的广泛适用性。 | 研究急性心肌梗死后免疫系统的反应及其对未来治疗的影响。 | 38名急性心肌梗死患者与38名对照参与者。 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液样本 | 38名急性心肌梗死患者和38名对照，共计95,995个病变外周血单核细胞和33,878个对照外周血单核细胞 |
| 398 | 2024-08-05 |
Ultrasound Neuromodulation of an Anti-Inflammatory Pathway at the Spleen Improves Experimental Pulmonary Hypertension
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323679
PMID:38712557
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研究论文 | 研究进行了脾脏的非侵入性聚焦超声刺激对实验性肺动脉高血压的影响 | 首次探讨了通过超声神经调节抑制脾脏的抗炎途径来改善实验性肺动脉高血压的潜力 | 主要在动物模型中进行，结果是否适用于人类尚需进一步验证 | 旨在探索非侵入性超声刺激对肺动脉高血压的治疗潜力 | 大鼠实验模型，包括Sugen/hypoxia模型和单克痕模型 | 数字病理学 | 肺动脉高血压 | 聚焦超声刺激 | NA | 组织学、免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 大鼠样本，具体数量未提供 |
| 399 | 2024-08-05 |
3D reconstruction of the mouse cochlea from scRNA-seq data suggests morphogen-based principles in apex-to-base specification
2024-Jun-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.028
PMID:38593801
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研究论文 | 本文探讨了小鼠耳蜗的三维重建，并提出了形态发生因子在耳蜗自顶到基底特征中的作用 | 创新之处在于通过scRNA-seq数据重建耳蜗，揭示了形态发生因子在空间身份赋予中的重要作用 | 无法完全明确调控小鼠耳蜗音调基因表达的分子机制 | 研究小鼠耳蜗中音调基因表达的分子机制 | 小鼠耳蜗的发育和相关的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | E12.5和E14.5时间点的数据 |
| 400 | 2024-08-05 |
Identification and characterization of intermediate states in mammalian neural crest cell epithelial to mesenchymal transition and delamination
2024-Jun-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92844
PMID:38873887
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研究论文 | 该文章研究了哺乳动物神经脊细胞的上皮-间质转化及分层过程中的中间状态 | 首次通过单细胞RNA测序识别了神经脊细胞的中间状态，并在体内定位 | 目前对于中间状态在发育上皮-间质转化中的存在尚不清楚 | 探讨神经脊细胞上皮-间质转化过程中是否存在中间状态 | 小鼠胚胎中的神经脊细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎 |