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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02255-1
PMID:38724673
|
研究论文 | 本研究揭示了AML/T细胞相互作用对患者结果的相关性及ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用 | 该研究首次揭示了ICAM1作为免疫触发因子在小鼠体内T细胞杀死AML细胞中的作用 | 研究主要集中于AML样本与T细胞的体外相互作用,可能未能全面反映整体免疫环境 | 探讨AML患者对T细胞杀伤的敏感性及其相互作用的分子机制 | AML细胞样本与人源工程化的CD4 T细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 多个AML患者样本和CD4 T细胞的组合 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-04 |
Beyond the marrow: insights from comprehensive next-generation sequencing of extramedullary multiple myeloma tumors
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02206-w
PMID:38493239
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研究论文 | 此研究对外髓性多发性骨髓瘤(EMM)肿瘤进行了全面的下一代测序分析 | 首次揭示EMM的肿瘤微环境,识别关键的分子特征和潜在的治疗靶点 | 样本规模相对较小,仅有14个样本 | 探讨EMM肿瘤的分子特征和开发有效的治疗策略 | 外髓性多发性骨髓瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序(NGS) | NA | 肿瘤样本 | 14个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-05 |
Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308384
PMID:38634607
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研究论文 | 本研究探讨了渗透压胁迫对拟南芥根尖发育的影响,使用单细胞层面的转录调控网络分析 | 首次在单细胞层面重建了相应的转录调控网络,并捕捉到12,968个单细胞的基因和染色质可及性之间的联系 | 数据整合的准确性仍然是个挑战,尤其是在调查特定细胞类型的转录调控网络时 | 研究拟南芥在渗透压胁迫下的根尖发育机制 | 16,670个拟南芥根尖细胞核 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | 16,670个根尖细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-05 |
Recapitulation of Perturbed Striatal Gene Expression Dynamics of Donors' Brains With Ventral Forebrain Organoids Derived From the Same Individuals With Schizophrenia
2024-Jun-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220723
PMID:37915216
|
研究论文 | 本研究通过从精神分裂症患者及神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官探索与精神分裂症相关的纹状体发育变化 | 提出了一种从精神分裂症患者的诱导多能干细胞生成腹侧前脑类器官的方法,并揭示了精神分裂症患者细胞在发育轨迹上的差异 | 研究样本量较小,仅限于四名精神分裂症患者和四名神经正常对照者 | 探索与精神分裂症相关的纹状体神经发育改变 | 来自精神分裂症患者和神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 诱导多能干细胞(IPS细胞)差异化 | 腹侧前脑类器官(VFO) | 单细胞RNA测序 | 四名精神分裂症患者及四名神经正常对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-05 |
A risk score based on polyamine metabolism and chemotherapy-related genes predicts prognosis and immune cells infiltration of lung adenocarcinoma
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18387
PMID:38924680
|
研究论文 | 本文探讨了铂类治疗和多胺代谢相关基因是否能够预测肺腺癌的预后 | 建立了基于铂类治疗和多胺代谢的关键基因的风险评分模型,提供了新颖的预后预测角度 | 行政性缺乏大规模临床试验验证该风险评分模型的准确性 | 研究铂类治疗和多胺代谢基因在LUAD预后预测中的作用 | 与铂类治疗和多胺代谢相关的基因及其对免疫细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | 风险评分模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-07 |
Using single-cell transcriptomics to predict which tumors will respond to targeted therapy
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00757-6
PMID:38684925
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-05 |
Longitudinal single-cell data informs deterministic modelling of inflammatory bowel disease
2024-Jun-24, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00395-9
PMID:38914538
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研究论文 | 本研究探讨如何利用纵向单细胞数据进行炎症性肠病的确定性建模 | 提出了利用ODE模型定量描述免疫动态的新方法,并验证了细胞周转率与生物过程之间的关系 | 模型的验证主要依赖于小鼠实验,可能不完全适用于人类 | 旨在通过数学建模深入理解炎症性肠病中的免疫动态 | 研究小鼠结肠炎中的细胞变化与人类炎症性肠病患者的数据 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 常微分方程(ODE) | 细胞计数数据和基因表达数据 | 涉及小鼠结肠炎模型和人类IBD患者的统一数据 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-04 |
Advances in spatial transcriptomics and its applications in cancer research
2024-Jun-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02040-9
PMID:38902727
|
研究论文 | 本文总结了空间转录组技术的发展及其在癌症研究中的应用 | 本研究通过空间转录组技术能够实现基因表达的空间上下文量化与可视化,提供了比传统转录组更多的信息 | 目前的空间转录组方法存在一些局限性和挑战 | 探讨空间转录组技术在癌症研究中的应用及其未来发展方向 | 癌症相关的转录组数据及其空间表达 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-05 |
Vanin-2 is expressed in peripheral blood T cells and upregulated in SLE patients
2024-Jun-26, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae145
PMID:38920355
|
研究论文 | 该研究探讨了Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的表达及其在系统性红斑狼疮(SLE)患者中的上调情况 | 发现Vanin-2在T细胞中的独特表达,并与SLE患者T细胞功能变化相关 | 研究中未探讨其他vanin家族成员在T细胞中的作用 | 阐明Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的重要性 | 外周血T淋巴细胞及其在SLE患者中的表达 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,西方印迹 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-04 |
Long-read single-cell sequencing reveals the transcriptional landscape of spermatogenesis in obstructive azoospermia and Sertoli cell-only patients
2024-Jun-25, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcae009
PMID:38192002
|
研究论文 | 本研究展示了阻塞性无精症和仅有塞尔托利细胞患者中生精过程的长读转录组特征 | 首次利用PacBio长读测序揭示了人类生精过程中的新转录本和新基因 | 研究样本量较小,仅限于患者的睾丸活检样本 | 揭示阻塞性无精症患者中生精的转录组特征 | 阻塞性无精症和非阻塞性无精症患者的睾丸细胞 | 数字病理学 | 生育不孕 | PacBio长读单细胞测序 | NA | 转录组数据 | OA患者3个样本,NOA患者3个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-05 |
SCTC: inference of developmental potential from single-cell transcriptional complexity
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae340
PMID:38709881
|
研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞转录复杂性指标(SCTC),用于更准确地推断单细胞的发育潜力。 | 引入了经济复杂性理论的见解,以改进对单细胞发育潜力的测量,比现有指标SCTD更精确。 | 在某些情况下,G表达并不会单调减少,这可能影响现有发育潜力估计的准确性。 | 研究单细胞分析中发育潜力的推断及伪时间重建方法。 | 关注单细胞转录组数据,这些数据能够提供细胞的发育潜力信息。 | 数字病理 | NA | scRNA-Seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-05 |
Lysine acetyltransferase 14 mediates TGF-β-induced fibrosis in ovarian endometrioma via co-operation with serum response factor
2024-Jun-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05243-2
PMID:38867256
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研究论文 | 这篇文章探讨了赖氨酸乙酰转移酶14在TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿纤维化中的作用 | 揭示了KAT14通过与血清反应因子SRF的合作,促进组蛋白H4乙酰化并增加ECM生成的机制 | 尚未深入探讨KAT14在其他类型内膜异位症中的作用及其潜在临床应用 | 研究TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿相关纤维化的分子机制 | 研究对象为卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类内膜间质细胞 | 数字病理学 | 卵巢内膜囊肿 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本,细胞系 | 涉及卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类间质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-04 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Verification Define Different Angiogenesis Subtypes in Endometrial Carcinoma and Identify a Prognostic Signature
2024-Jun-18, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c03034
PMID:38911819
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,定义了子宫内膜癌的不同血管生成亚型,并识别了预后标志。 | 发现了子宫内膜癌患者的五种血管生成亚型,并构建了与血管生成相关的预后风险评分(APRS),提供了个体化的预后评估。 | 本研究的特定分子介导的血管生成对肿瘤免疫微环境的影响尚未清楚说明。 | 探讨血管生成在子宫内膜癌中的作用,并评估其对个体预后的影响。 | 研究了506例子宫内膜癌患者的血管生成模式及其相关的预后因素。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | qRT-PCR、免疫组化和单细胞测序数据分析 | NA | 转录组信息 | 506名子宫内膜癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-05 |
A body-brain circuit that regulates body inflammatory responses
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07469-y
PMID:38692285
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研究论文 | 该文章展示了一个调节身体炎症反应的身体-大脑回路 | 本研究首次揭示了外周免疫损伤如何激活身体-大脑轴以调节免疫反应 | 尚未探讨该回路在所有免疫疾病中的普遍适用性 | 研究身体-大脑轴在调节免疫反应中的作用 | 主要研究外周免疫刺激下的身体-大脑回路及其对炎症反应的影响 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 功能成像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-07 |
Uncovering intestinal macrophages through the integration of single-cell and spatial transcriptomics
2024-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00242-7
PMID:38142267
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-05 |
Microcirculatory disturbance in acute liver injury is triggered by IFNγ-CD40 axis
2024-Jun-21, Journal of inflammation (London, England)
DOI:10.1186/s12950-024-00387-w
PMID:38907339
|
研究论文 | 文章分析了急性肝损伤中IFNγ-CD40轴引发的微循环障碍的分子机制 | 首次揭示了IFNγ-CD40轴在急性肝损伤微循环障碍中的关键作用 | 研究仅限于单中心的回顾性分析,结果可能有限于特定人群和模型 | 探讨急性肝损伤的发病机制及其与微循环障碍的关系 | 急性肝损伤患者和小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | Con A诱导的小鼠模型 | 血液样本、肝脏组织 | 120名急性肝损伤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-05 |
Identifying Novel Proteins for Chronic Pain: Integration of Human Brain Proteomes and Genome-Wide Association Data
2024-Jun-21, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2024.104610
PMID:38909833
|
研究论文 | 本文旨在通过整合人脑蛋白组数据和全基因组关联数据来识别慢性疼痛的新蛋白质 | 提出了一种整合蛋白组和基因组数据的方法,以识别调节慢性疼痛风险的关键基因 | 研究可能受到样本选择和数据整合方法的限制 | 探讨遗传变异如何影响慢性疼痛的易感性 | 重点研究通过调节脑蛋白表达来影响慢性疼痛风险的关键基因 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 基因组关联研究(GWAS),单细胞RNA测序 | 整合蛋白组与基因组的数据分析 | 蛋白质组数据,转录组数据 | 387,649(GWAS数据),376和152(发现和确认的蛋白质组数据) | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-04 |
A Novel Macrophage Subpopulation Conveys Increased Genetic Risk of Coronary Artery Disease
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324172
PMID:38747151
|
研究论文 | 该文章探讨了一种新的巨噬细胞亚群如何增加冠状动脉疾病的遗传风险 | 研究揭示了CD52-hi巨噬细胞亚群在动脉粥样硬化中的关键作用,以及与冠状动脉疾病相关的特定遗传变异和候选致病基因 | 研究可能在样本规模和病例异质性方面存在局限性 | 探索冠状动脉疾病中巨噬细胞亚群的遗传贡献和致病机制 | 主要以人类单核细胞源的巨噬细胞为研究对象 | 数字病理学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序和单细胞多组学 | NA | 基因组数据 | 来自38个动脉粥样硬化样本的5000多个巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-04 |
Establishment and validation of a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature for predicting clinical outcomes and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01092-z
PMID:38900330
|
研究论文 | 本文建立并验证了一个新的CD8+ T细胞相关预后标志,通过整合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据来预测肝细胞癌的临床结果和免疫治疗反应 | 提出了基于CD8+ T细胞的预后标志,这为肝细胞癌患者临床结果和免疫治疗反应的预测提供了强有力的模型 | 尚未提及研究的具体局限性 | 探讨CD8+ T细胞相关基因在肝细胞癌中的预后意义 | 利用来自不同数据库的HCC的单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和大规模RNA测序 | Cox-Lasso回归模型 | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-05 |
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07478-x
PMID:38839950
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research paper | 本文探讨了MYCT1在调节人类造血干细胞(HSCs)环境感知和内吞作用中的重要性 | 发现MYCT1是人类HSC的重要调控因子,其缺失使HSC在培养中失去干性 | 研究主要基于体外实验,未在体内模型中验证结果 | 揭示MYCT1在保持人类造血干细胞干性中的作用 | 人类造血干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA | NA | NA | NA | NA |