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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-15 |
Analyses of the autism-associated neuroligin-3 R451C mutation in human neurons reveal a gain-of-function synaptic mechanism
2024-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01834-x
PMID:36280753
|
研究论文 | 分析自闭症相关NLGN3 R451C突变在人神经元中的功能增益突触机制 | 首次在人类神经元中研究NLGN3 R451C突变的影响,发现其增强兴奋性突触强度而不影响抑制性突触,并通过体内移植实验证实 | 文中未明确提及局限性 | 探究NLGN3 R451C突变对人类神经元突触功能的影响及其在自闭症发病机制中的作用 | 人类NLGN3 R451C敲入和NLGN3敲除神经元 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-06-07 |
SCTC: inference of developmental potential from single-cell transcriptional complexity
2024-06-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae340
PMID:38709881
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论文 | 提出一种基于经济复杂性理论的新型指标SCTC,用于从单细胞转录组数据推断发育潜能和伪时间 | 首次将经济复杂性理论应用于单细胞转录组分析,提出比传统指标SCTD更准确的发育潜能度量标准 | 基于特定假设(基因表达在发育过程中非单调下降),可能不适用于所有生物系统 | 准确推断单细胞发育潜能和重建细胞发育伪时间路径 | 单细胞转录组数据中的细胞和基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督算法 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-06-07 |
Senescence of human pancreatic beta cells enhances functional maturation through chromatin reorganization and promotes interferon responsiveness
2024-06-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae313
PMID:38682582
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研究论文 | 研究人类胰腺β细胞衰老通过染色质重组增强功能成熟并促进干扰素反应 | 首次揭示人类胰腺β细胞衰老通过染色质重组激活功能成熟基因增强子,并提高干扰素反应能力,而不产生典型的衰老相关分泌表型 | 未明确说明,但基于摘要可能缺乏体内功能验证或大规模临床样本验证 | 探究人类胰腺β细胞衰老状态及其对胰岛素分泌和干扰素反应的影响机制 | 人类胰腺β细胞(包括p16阳性衰老细胞) | machine learning | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成人胰腺β细胞数据集(单细胞转录组) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 24 | 2026-06-01 |
Loss of cell junctional components and matrix alterations drive cell desquamation and fibrotic changes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.17.599411
PMID:38948715
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和空间蛋白质组学分析,揭示了特发性肺纤维化中细胞连接成分丢失和基质改变导致上皮脱屑和纤维化变化 | 首次鉴定了IPF中远端细支气管上皮脱屑现象,并揭示了细胞连接丢失与基质失调之间的相互作用机制 | NA | 探究特发性肺纤维化中上皮脱屑的分子机制 | IPF患者和健康对照的远端细支气管上皮细胞和基底膜 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | IPF患者和健康对照的肺组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 25 | 2026-06-01 |
Progress of single-cell RNA sequencing combined with spatial transcriptomics in tumour microenvironment and treatment of pancreatic cancer
2024-06-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05307-3
PMID:38867230
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序结合空间转录组学在胰腺癌肿瘤微环境和治疗中的研究进展 | 系统阐述了scRNA-seq与ST联合分析在揭示肿瘤异质性和细胞间相互作用中的互补优势,特别是在胰腺癌治疗中的新见解 | 单细胞RNA测序无法获取细胞的空间位置信息,需依赖空间转录组学进行补充 | 总结单细胞RNA测序与空间转录组学在胰腺癌肿瘤微环境和治疗中的应用进展 | 胰腺癌的肿瘤微环境及治疗相关研究 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-06-01 |
Lysine acetyltransferase 14 mediates TGF-β-induced fibrosis in ovarian endometrioma via co-operation with serum response factor
2024-06-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05243-2
PMID:38867256
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研究论文 | 研究揭示了赖氨酸乙酰转移酶14通过与血清响应因子协同作用,介导TGF-β诱导的卵巢子宫内膜瘤纤维化 | 首次发现KAT14通过与SRF相互作用,增强组蛋白H4乙酰化,促进α-SMA表达,从而驱动TGF-β诱导的纤维化进程,并验证了KAT14/SRF复合物在子宫内膜瘤纤维化中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 阐明KAT14在TGF-β诱导的卵巢子宫内膜瘤纤维化中的分子机制 | 卵巢子宫内膜瘤患者的异位病灶、永生化人子宫内膜间质细胞、原代异位子宫内膜间质细胞、小鼠子宫内膜异位症模型 | 数字病理学 | 卵巢子宫内膜瘤 | 基因过表达、敲除、敲低、腺相关病毒介导的基因沉默、单细胞转录组测序 | NA | 图像 | 子宫内膜瘤患者和健康对照者的子宫内膜活检样本、已发表的子宫内膜异位症单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-06-01 |
Macrophage and fibroblast trajectory inference and crosstalk analysis during myocardial infarction using integrated single-cell transcriptomic datasets
2024-06-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05353-x
PMID:38867219
|
research paper | 通过整合单细胞转录组数据集,分析心肌梗死后巨噬细胞和成纤维细胞的轨迹及其相互作用 | 首次利用多个单细胞RNA测序数据集的综合分析,揭示了心肌梗死后ECM生成成纤维细胞亚群(修复性心脏成纤维细胞和基质成纤维细胞)的动态变化和转录特征,并发现了SPP1hi巨噬细胞与成纤维细胞在胶原沉积和瘢痕形成中的特定相互作用 | 仅基于公开数据集进行二次分析,缺乏大样本前瞻性验证;动物模型和体外实验的验证范围有限,可能无法完全反映人类疾病复杂性 | 阐明心肌梗死后巨噬细胞和成纤维细胞亚群的异质性、分化轨迹及细胞间相互作用 | 心肌梗死后的心脏组织样本(人类和小鼠)中的巨噬细胞和成纤维细胞 | machine learning | cardiovascular disease | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, scVelo, PAGA, Slingshot, CellphoneDB, NicheNet, immunofluorescence staining | NA | gene expression data | 12个不同研究的单细胞和单核RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-06-01 |
Unveiling novel cell clusters and biomarkers in glioblastoma and its peritumoral microenvironment at the single-cell perspective
2024-06-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05313-5
PMID:38851695
|
研究论文 | 从单细胞视角揭示胶质母细胞瘤及其瘤周微环境中的新型细胞群和生物标志物 | 首次在单细胞水平上描绘了胶质母细胞瘤不同区域(肿瘤与瘤周)的细胞景观,发现了具有线粒体基因高表达的增殖性少突胶质细胞群以及两种不同表型的髓系细胞群,并识别出XIST、KCNH7、SYT1和DIAPH3作为潜在恶性细胞增殖相关因子 | 研究样本量较小,仅来自4名患者,可能无法完全代表胶质母细胞瘤的异质性;此外,研究结果尚需在更大样本和临床环境中验证 | 从单细胞视角揭示胶质母细胞瘤及其瘤周微环境的细胞组成和异质性,为精准治疗提供理论基础 | 4名胶质母细胞瘤患者的8个组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 10x单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名患者的8个组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞转录组测序 |
| 29 | 2026-05-31 |
Single-cell proteomics by mass spectrometry: Advances and implications in cancer research
2024-06, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202300210
PMID:38727198
|
研究论文 | 本文综述了单细胞蛋白质组学在癌症研究中的应用,并揭示了该技术的最新发展进展 | 本文重点介绍了单细胞蛋白质组学在癌症研究中的新兴应用,并分析了该领域的研究空白和未来方向 | 本文未明确指出局限性,但可能受限于单细胞蛋白质组学技术的当前发展水平和数据复杂性 | 总结单细胞蛋白质组学在癌症研究中的应用,并推动该技术在癌症研究中的进一步发展 | 单细胞蛋白质组学技术及癌症研究领域 | 机器学习 | 癌症 | 质谱法 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2026-05-28 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-06-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
|
评论 | 本文总结了2023年EMBO研讨会“发育代谢:能量、物质和信息的流动”中的关键讨论,强调了现代发育生物学面临的挑战和机遇 | 提出了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算建模等新技术在发育代谢领域中的应用,为探索细胞和组织特异性代谢网络、器官间代谢通信以及基因与代谢物在时空上的交互作用提供了新机会 | 本文为研讨会总结,未提供具体实验数据或验证,属于观点性文章 | 总结发育代谢领域的最新进展和未来研究方向 | 发育代谢中的代谢网络、器官间通信和基因-代谢物相互作用 | 其他 | NA | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 计算建模 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-05-27 |
Interstitial macrophages are a focus of viral takeover and inflammation in COVID-19 initiation in human lung
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20232192
PMID:38597954
|
研究论文 | 利用健康人肺组织感染SARS-CoV-2并进行单细胞RNA测序,揭示间质巨噬细胞是病毒感染和炎症的关键靶点 | 首次发现活化的间质巨噬细胞是SARS-CoV-2病毒大量复制和转录组劫持的主要场所,并鉴定病毒进入该细胞的受体为DC-SIGN/CD209 | 研究基于体外感染模型,可能无法完全反映体内早期感染的复杂微环境 | 阐明SARS-CoV-2在人类肺组织中的细胞嗜性和转录组效应 | 健康人类肺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 健康人类肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 32 | 2026-05-21 |
Cabergoline targets multiple pathways to inhibit PRL secretion and increases stromal fibrosis
2024-Jun-05, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvae055
PMID:38781434
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析卡麦角林治疗对泌乳素瘤肿瘤及微环境细胞的影响 | 首次揭示卡麦角林治疗后CD8+ T细胞的激活及其可能参与肿瘤杀伤作用 | 样本量较小(仅5例肿瘤),且缺乏功能验证实验 | 揭示多巴胺激动剂在人类泌乳素瘤及周围基质和免疫细胞中的靶向和非靶向作用机制 | 5例手术切除的泌乳素瘤(3例经卡麦角林治疗,2例未经治疗) | 数字病理学 | 泌乳素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例人类泌乳素瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 33 | 2026-05-20 |
Differential CpG methylation at Nnat in the early establishment of beta cell heterogeneity
2024-Jun, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06123-6
PMID:38512414
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研究论文 | 本研究揭示了Nnat基因的差异性CpG甲基化在胰岛β细胞异质性早期建立中的作用,发现Nnat mRNA在离散的β细胞亚群中差异表达,其表达受发育阶段和DNA甲基化酶DNMT3A调控 | 首次证明Nnat基因的差异DNA甲基化是β细胞异质性在发育过程中建立的新机制,并发现NNAT+ β细胞亚群特化于胰岛素产生,而‘枢纽’细胞在此群体中较少 | 研究主要基于小鼠模型(转基因小鼠和db/db小鼠),人类样本分析限于成人胰岛,缺乏对发育中期人类β细胞的直接验证 | 探究表观遗传机制,特别是DNA甲基化在胰岛β细胞异质性建立和功能特化中的作用 | 小鼠和人类胰岛β细胞,重点关注Nnat基因表达和CpG甲基化模式 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,亚硫酸氢盐测序,RNA测序,亲和纯化质谱,共聚焦成像 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据,DNA甲基化数据,蛋白质组数据,钙成像数据 | 包含胚胎和成年小鼠β细胞样本,以及人类胰岛样本,具体数量未在摘要中说明 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 使用10x Genomics平台的单细胞RNA-seq进行数据分析,此外使用FACS分选结合亚硫酸氢盐测序和RNA-seq分析 |
| 34 | 2026-05-01 |
TRPV1 inhibition suppresses non-small cell lung cancer progression by inhibiting tumour growth and enhancing the immune response
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00894-7
PMID:37902941
|
研究论文 | 研究发现TRPV1在非小细胞肺癌中表达上调,抑制TRPV1可通过阻断Ca2+-IGF1R信号和抑制GABA分泌来抑制肿瘤生长并增强免疫反应 | 首次揭示TRPV1通过Ca2+-IGF1R信号通路促进NSCLC增殖并抑制凋亡,同时发现TRPV1通过调节GABA分泌影响肿瘤免疫微环境的新机制 | 未提及具体局限性 | 探索TRPV1在非小细胞肺癌发展中的作用及其机制 | 非小细胞肺癌细胞系和BALB/C、C57BL/6J小鼠肿瘤模型 | 机器学习 | 肺癌 | NA | NA | 空间转录组数据 | TCGA数据库;10× Genomics空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x 空间转录组学 | NA |
| 35 | 2026-05-01 |
ITGB2-ICAM1 axis promotes liver metastasis in BAP1-mutated uveal melanoma with retained hypoxia and ECM signatures
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00908-4
PMID:38150154
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研究论文 | 揭示ITGB2-ICAM1轴在BAP1突变葡萄膜黑色素瘤肝转移中的作用及机制 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫活性小鼠模型发现ITGB2-ICAM1轴在BAP1突变相关葡萄膜黑色素瘤转移中维持缺氧和细胞外基质特征的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探索BAP1缺失驱动葡萄膜黑色素瘤转移的分子机制 | 葡萄膜黑色素瘤原发和转移肿瘤细胞、小鼠肝转移模型 | 单细胞转录组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 包含原发和转移性葡萄膜黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-04-30 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
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研究论文 | 开发了PERCEPTION计算流程,利用单细胞转录组数据预测癌症患者治疗反应和耐药性 | 首次利用匹配的批量与单细胞表达谱构建个性化治疗反应模型,并成功在多个临床试验中验证 | NA | 开发基于单细胞转录组的精准肿瘤学计算工具,实现患者分层与治疗优化 | 培养细胞、患者肿瘤来源的原代细胞、多发性骨髓瘤和乳腺癌临床试验样本、肺癌患者 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤, 乳腺癌, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 大规模细胞系药物筛选数据及多个临床队列 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2026-04-29 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
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研究论文 | 构建新生儿和成年小鼠T细胞发育的转录和表观遗传图谱,揭示年龄相关差异的基因调控程序 | 首次整合转录组和表观遗传组数据,揭示T细胞发育中与年龄相关的基因调控程序差异,并利用CRISPR扰动结合单细胞测序鉴定关键调控因子 | 仅基于小鼠模型,人类年龄相关差异需进一步验证 | 研究T细胞发育过程中与年龄相关的基因调控程序及其机制 | 新生儿和成年小鼠的胸腺细胞发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR扰动、表观遗传分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 新生儿和成年小鼠的胸腺细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,结合CRISPR扰动技术 |
| 38 | 2026-04-29 |
Single-Cell Sequencing Illuminates Thymic Development: An Updated Framework for Understanding Thymic Epithelial Tumors
2024-06-03, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyae046
PMID:38520743
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解析胸腺上皮肿瘤研究中揭示的胸腺发育新框架,包括胸腺上皮区室的细胞多样性、分化与衰老过程及肿瘤发生机制 | 利用单细胞分子分析技术为胸腺上皮肿瘤的临床和基础研究提供新视角,提出针对肿瘤异质性和起源细胞等未解问题的新见解 | 胸腺上皮肿瘤的罕见性限制了肿瘤发生机制的研究和合理治疗方案的开发 | 探讨单细胞测序如何深化对胸腺正常发育和恶性转化的理解,以推动罕见胸腺上皮肿瘤的改进治疗策略 | 胸腺上皮肿瘤(包括胸腺瘤和胸腺癌)及正常胸腺组织 | 单细胞组学 | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-04-27 |
CTLA-4-expressing ILC3s restrain interleukin-23-mediated inflammation
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07537-3
PMID:38867048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现肠道IL-23受体表达细胞中,ILC3s上调CTLA-4以抑制IL-23介导的炎症 | 首次揭示ILC3s表达CTLA-4作为免疫检查点限制IL-23病理作用的新机制 | 未阐明CTLA-4阳性ILC3s在人类炎症性肠病中的具体功能变化及长期效应 | 探究IL-23介导组织保护与病理炎症之间的调控机制 | 肠道IL-23受体表达细胞(T细胞和ILC3s)及小鼠模型 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肠道细胞及人类ILC3s样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 40 | 2026-04-24 |
Comprehensive single cell transcriptomics analysis of murine osteosarcoma uncovers Skp2 function in metastasis, genomic instability and immune activation and reveals additional target pathways
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597347
PMID:38895216
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研究论文 | 对小鼠骨肉瘤进行单细胞转录组学分析,揭示Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的作用及额外靶向通路 | 首次通过单细胞RNA测序在免疫活性转基因小鼠模型中全面分析Skp2敲除对骨肉瘤肿瘤异质性、微环境复杂性、转移和免疫激活的影响,并发现潜在逃逸机制 | NA | 探索Skp2在骨肉瘤中的功能及其作为治疗靶点的潜力,并揭示相关分子机制 | 小鼠骨肉瘤肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨肉瘤小鼠模型的原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |