单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 543 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of a TLR9 agonist in autochthonous murine sarcomas
2024-Jun-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.178767
PMID:39133651
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研究论文 | 本研究探讨了TLR9激动剂CpG联合放疗在自体小鼠肉瘤模型中的免疫增强机制 | 首次在自体发生的高肿瘤突变负荷肉瘤模型中证实CpG联合放疗通过CD8+T细胞依赖性机制增强抗肿瘤免疫应答 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 阐明TLR9激动剂增强放疗疗效的免疫机制 | 自体发生的小鼠软组织肉瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 软组织肉瘤 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, TCR克隆性分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 自体发生小鼠肉瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Stress-free single-cell transcriptomic profiling and functional genomics of murine eosinophils
2024-06, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-00967-3
PMID:38504138
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研究论文 | 开发了一种无应激小鼠嗜酸性粒细胞单细胞转录组分析方案，并展示了其在结肠炎研究中的应用 | 建立了首个无应激的嗜酸性粒细胞单细胞转录组捕获方法，结合基因组CRISPR筛选技术研究其分化机制 | 方法主要针对小鼠模型，人类样本的适用性需要进一步验证 | 开发嗜酸性粒细胞单细胞转录组分析和功能基因组学研究方法 | 小鼠组织驻留嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 多组织来源的小鼠嗜酸性粒细胞 | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | 微孔板单细胞RNA捕获系统 |
| 23 | 2025-10-06 |
TIGIT Blockade Reshapes the Tumor Microenvironment Based on the Single-cell RNA-Sequencing Analysis
2024-Jun-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000511
PMID:38545758
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示TIGIT阻断如何重塑肿瘤微环境 | 首次在治疗前后使用单细胞测序全面分析TIGIT阻断对肿瘤免疫微环境的影响，揭示了TIGIT阻断通过抑制Treg细胞、激活NK细胞和促进cDC1成熟的多重机制增强抗肿瘤免疫 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究TIGIT阻断治疗对肿瘤免疫微环境的影响机制 | 小鼠肿瘤模型中的免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 治疗前后的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Evidences of neurological injury caused by COVID-19 from glioma tissues and glioma organoids
2024-06, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14822
PMID:38923860
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研究论文 | 本研究通过神经胶质瘤组织和类器官证实COVID-19可导致神经系统损伤 | 首次发现神经胶质瘤组织具有易感SARS-CoV-2感染的固有特性，并建立神经胶质瘤类器官作为中枢神经系统SARS-CoV-2感染的研究模型 | 样本来源仅限于神经胶质瘤患者，缺乏其他神经系统疾病的对照研究 | 探究SARS-CoV-2侵入中枢神经系统的机制及COVID-19导致的神经损伤 | 神经胶质瘤患者的组织样本和神经胶质瘤类器官 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 空间转录组分析，单细胞测序 | 类器官模型 | 组织样本，转录组数据 | 神经胶质瘤患者组织样本及衍生类器官 | NA | 空间转录组，单细胞测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
A Cullin 5-based complex serves as an essential modulator of ORF9b stability in SARS-CoV-2 replication
2024-06-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01874-5
PMID:38937432
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研究论文 | 本研究揭示了CUL5-TOM70-HSP90α复合物通过调控ORF9b蛋白稳定性在SARS-CoV-2复制中的关键作用 | 首次发现ORF9b蛋白在K67位点发生泛素化并通过蛋白酶体途径降解，鉴定出TOM70作为底物受体连接ORF9b与HSP90α和CUL5形成复合物 | 未明确说明研究的样本规模和技术重复次数 | 阐明SARS-CoV-2 ORF9b蛋白的稳定性调控机制及其在病毒复制中的作用 | SARS-CoV-2病毒ORF9b蛋白及其与宿主蛋白的相互作用 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞测序，蛋白质泛素化分析 | NA | 测序数据，蛋白质相互作用数据 | COVID-19患者肺上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Inhibition of the eukaryotic initiation factor-2α kinase PERK decreases risk of autoimmune diabetes in mice
2024-Jun-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176136
PMID:38889047
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研究论文 | 通过抑制PERK激酶降低小鼠自身免疫性糖尿病风险的研究 | 首次发现PERK抑制可逆转应激人胰岛中的mRNA翻译阻断，并通过稳定PD-L1增强β细胞免疫检查点功能 | 研究主要基于小鼠模型和人胰岛体外实验，尚未进行人体临床试验 | 探索PERK抑制对自身免疫性糖尿病的预防作用 | 易患1型糖尿病的小鼠模型、人胰岛和EndoC-βH1人β细胞系 | 分子生物学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确样本数量的小鼠模型、人胰岛和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
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研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育的转录和表观遗传图谱，揭示了年龄相关差异的基因调控程序 | 首次系统揭示胸腺细胞发育中年龄相关的转录和表观遗传差异，并利用CRISPR扰动结合单细胞RNA测序发现保守的转录调控因子 | 研究仅限于小鼠模型，人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控机制 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞 | 单细胞基因组学 | 免疫系统发育 | 单细胞RNA测序, CRISPR扰动, 表观遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 新生和成年小鼠胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Antitumor efficacy and potential mechanism of FAP-targeted radioligand therapy combined with immune checkpoint blockade
2024-06-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01853-w
PMID:38825657
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研究论文 | 本研究评估了FAP靶向放射性配体疗法LNC1004联合免疫检查点阻断剂的抗肿瘤疗效及机制 | 首次证明FAP靶向放射性核素治疗可诱导PD-L1上调，并与抗PD-L1免疫疗法产生协同抗肿瘤效应，实现肿瘤完全消除 | 临床研究为初步阶段，样本量有限，需要更大规模临床试验验证 | 探索FAP靶向放射性配体疗法联合免疫检查点阻断剂的抗肿瘤疗效及作用机制 | MC38/NIH3T3-FAP和CT26/NIH3T3-FAP肿瘤异种移植小鼠模型及难治性癌症患者 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，TCR测序，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，免疫组化图像，临床数据 | 小鼠肿瘤模型和难治性癌症患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Deafness DFNB128 Associated with a Recessive Variant of Human MAP3K1 Recapitulates Hearing Loss of Map3k1-Deficient Mice
2024-Jun-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070845
PMID:39062623
|
研究论文 | 本研究通过发现MAP3K1基因的新型隐性变异与人类非综合征性耳聋DFNB128的关联，并利用小鼠模型验证其功能 | 首次发现MAP3K1基因隐性变异导致人类非综合征性耳聋，并通过计算模型预测其结构改变与表型的关系 | 研究仅基于一个近亲巴基斯坦家系，样本量有限 | 鉴定导致罕见形式耳聋的新致病基因 | 巴基斯坦近亲家系中的耳聋患者和小鼠耳蜗细胞 | 遗传学 | 耳聋 | 微阵列芯片, 外显子组测序, 单细胞转录组测序 | 计算结构建模 | 基因组数据, 转录组数据 | 一个巴基斯坦家系中的两个同胞群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
A robust model for cell type-specific interindividual variation in single-cell RNA sequencing data
2024-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49242-9
PMID:38898015
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研究论文 | 开发了一种名为CTMM的新模型，用于检测和量化单细胞RNA测序数据中细胞类型特异性个体间变异 | 首次提出专门针对细胞类型特异性个体间变异的线性混合模型，能够识别传统方法难以发现的阶段特异性变异基因 | 单细胞RNA测序样本量相对较小，模型校准具有挑战性 | 开发统计模型来解析单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性个体间变异 | 人类诱导多能干细胞分化过程中的转录组变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Dysfunction of infiltrating cytotoxic CD8+ T cells within the graft promotes murine kidney allotransplant tolerance
2024-Jun-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179709
PMID:38888968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现，小鼠肾脏异体移植耐受性与浸润性CD8+ T细胞在移植物内重编程为耗竭/调节样表型相关 | 首次揭示细胞毒性CD8+ T细胞在移植肾脏内通过IFN-γ介导重编程为耗竭/调节样表型，并提出'防御性耐受'新概念 | 研究仅限于小鼠模型，CD8-KO实验表明调节样表型细胞对耐受诱导并非必需，机制尚未完全阐明 | 探究肾脏异体移植耐受的免疫学机制 | 小鼠肾脏异体移植模型和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 移植免疫 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，过继性T细胞转移 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
A pathologically expanded, clonal lineage of IL-21-producing CD4+ T cells drives inflammatory neuropathy
2024-Jun-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178602
PMID:39087473
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术鉴定出驱动炎症性神经病变的IL-21产生型CD4+ T细胞克隆谱系 | 首次发现IL-21表达CD4+ T细胞在炎症性神经病变中的克隆扩增和多功能特性，揭示Tfh/Tph细胞亚群共同谱系分化途径 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明炎症性神经病变中致病性CD4+ T细胞的关键特性 | 炎症性神经病变小鼠模型中外周神经组织 | 免疫学 | 炎症性神经病变 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Self-regulating CAR-T cells modulate cytokine release syndrome in adoptive T-cell therapy
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221988
PMID:38607370
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研究论文 | 本研究开发了能够自我调节的自体CAR-T细胞，通过分泌细胞因子抑制剂减轻细胞因子释放综合征 | 首次设计能够分泌托珠单抗衍生单链可变片段的CAR-T细胞，实现自我调节炎症反应 | 研究基于人源化小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 改善CAR-T细胞治疗的安全性并同时增强疗效 | CD19 CAR-T细胞和细胞因子释放综合征 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源化NSG-SGM3小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Vascular restoration through local delivery of angiogenic factors stimulates bone regeneration in critical size defects
2024-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.003
PMID:39100886
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨缺损修复机制，并开发了搭载Spp1和Cxcl12的PCL/PLGA支架材料促进血管生成和骨再生 | 首次在单细胞水平揭示临界尺寸骨缺损中血管生成障碍的关键机制，并创新性地开发了可局部缓释Spp1和Cxcl12的双电纺支架材料 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未在大型动物或临床实验中测试 | 探索临界尺寸骨缺损的修复机制并开发促进骨再生的新型治疗方法 | 小鼠临界尺寸骨缺损模型及再生组织中的细胞群体 | 骨组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序，电纺丝技术，电喷雾技术 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织学数据，行为学数据 | 小鼠骨缺损模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
A count-based model for delineating cell-cell interactions in spatial transcriptomics data
2024-06-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae219
PMID:38940134
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研究论文 | 提出一种基于计数模型的细胞-细胞相互作用推断方法Copulacci，用于空间转录组数据 | 使用高斯copula模型在低转录本计数情况下建模配体-受体表达依赖关系，优于传统的Spearman和Pearson相关系数方法 | 未明确说明方法在特定组织类型或实验条件下的适用性限制 | 开发从空间转录组数据中推断细胞-细胞相互作用的新计算方法 | 空间转录组数据中的配体-受体相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 高斯copula模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Joint inference of cell lineage and mitochondrial evolution from single-cell sequencing data
2024-06-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae231
PMID:38940122
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研究论文 | 提出MERLIN算法，从单细胞测序数据联合推断细胞谱系和线粒体进化 | 首次形式化线粒体克隆树与细胞谱系树一致性问题，开发能同时建模线粒体异质性和树一致性的算法 | 未提及算法在大规模数据集上的计算效率限制 | 开发从单细胞测序数据联合推断细胞谱系和线粒体进化的计算方法 | 单细胞测序数据中的线粒体突变和细胞谱系关系 | 计算生物学 | 胃癌 | 单细胞全基因组测序 | 混合整数线性规划 | 基因组测序数据 | 5220个胃癌细胞系细胞 | NA | 单细胞全基因组测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Mutant Whole Mouse Embryos: From the Epiblast to the End of Gastrulation
2024-Jun-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66866
PMID:38949298
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研究论文 | 开发了一种用于小鼠突变胚胎从原肠胚形成开始到结束的单细胞RNA测序分析方法 | 建立了针对突变胚胎的单细胞分析流程，解决了基因分型、定时妊娠和细胞数量少等技术限制 | 方法主要针对小鼠胚胎，且需要特定的育种和定时妊娠安排 | 研究突变如何影响原肠胚形成期的细胞景观 | E6.5至E8期的小鼠突变胚胎 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微滴式单细胞分析 |
| 38 | 2025-10-06 |
SIMS: A deep-learning label transfer tool for single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jun-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100581
PMID:38823397
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序分析的深度学习标签迁移工具SIMS | 提出了一种低代码、数据高效的单细胞RNA分类流程，能在小训练集（<3,500个细胞）下实现高精度分类 | NA | 开发用于单细胞RNA测序数据细胞类型分类的自动化工具 | 脑组织细胞、发育中大脑的神经元亚型、皮质类器官细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织和物种的数据集，训练集<3,500个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597485
PMID:38895472
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研究论文 | 本研究揭示了平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中向肌成纤维细胞分化的机制 | 首次发现KLF4不仅维持AdvSca1-SM细胞的干性，还在其促纤维化反应中起关键作用 | KLF4调控AdvSca1-SM表型的具体分子机制仍不完全清楚 | 探究KLF4在AdvSca1-SM细胞促纤维化分化中的作用机制 | 血管平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM祖细胞 | 单细胞生物学 | 心脏纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Glycolysis in hepatic stellate cells coordinates fibrogenic extracellular vesicle release spatially to amplify liver fibrosis
2024-06-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn5228
PMID:38941469
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研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞糖酵解通过空间特异性方式协调纤维化细胞外囊泡释放以放大肝纤维化的机制 | 首次阐明肝星状细胞糖酵解通过组蛋白修饰调控Rab31表达，在肝小叶中央区特异性促进纤维化细胞外囊泡释放的空间协调机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究肝星状细胞糖酵解如何通过空间特异性途径协调肝纤维化放大 | 肝星状细胞(HSCs)及其分泌的细胞外囊泡(EVs) | 空间转录组学 | 肝纤维化 | 空间转录组学, 遗传学抑制, 组蛋白修饰分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |