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当前共找到 542 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-08-21
PIK3CA inhibition in models of proliferative glomerulonephritis and lupus nephritis
2024-06-06, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过基因工程小鼠模型、单细胞RNA测序和空间转录组学揭示PIK3CA在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎中的关键作用,并展示PI3Kα抑制剂alpelisib的治疗效果 首次发现体细胞PIK3CA功能获得性突变在足细胞中的作用,并证明PI3Kα抑制剂alpelisib不仅靶向足细胞,还影响淋巴细胞功能,这在狼疮性肾炎中尤为重要 研究主要基于小鼠模型,人类验证仅限于来自活动性狼疮性肾炎患者的淋巴细胞,可能无法完全反映人类疾病的复杂性 探究PIK3CA通路在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎发病机制中的作用,并评估PI3Kα抑制剂alpelisib的治疗潜力 增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎的小鼠模型及人类淋巴细胞 数字病理学 肾小球肾炎 单细胞RNA测序, 空间转录组学 基因工程小鼠模型 基因表达数据, 组织切片 多个基因工程小鼠模型及人类淋巴细胞样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
22 2026-08-21
RIPK1 protects naive and regulatory T cells from TNFR1-induced apoptosis
2024-06, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
research paper 本研究揭示了RIPK1作为支架蛋白在维持外周T细胞稳态中的关键作用,并通过条件敲除小鼠模型证明其缺失导致T细胞通过TNF和caspase-8介导的凋亡而死亡 首次证明不同外周T细胞亚群对RIPK1的需求存在差异,并明确了RIPK1缺失导致T细胞凋亡的具体信号通路 研究主要在动物模型中进行,未涉及人类样本验证 探究RIPK1在不同外周T细胞亚群存活中的具体作用及其介导的细胞死亡途径 小鼠外周T细胞亚群,包括naive CD4、naive CD8和FoxP3调节性T细胞 免疫学 自身免疫性疾病 条件性基因敲除、单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 转录组数据(单细胞RNA测序数据) 未明确提及,涉及多种小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
23 2026-08-20
Glioblastoma-Infiltrating CD8+ T Cells Are Predominantly a Clonally Expanded GZMK+ Effector Population
2024-Jun-03, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术分析了胶质母细胞瘤患者的肿瘤浸润CD8+ T细胞,发现其主要是克隆扩增的GZMK+效应T细胞群体。 首次揭示了GBM中CD8+ TIL以GZMK+效应T细胞为主,而非经典的耗竭性T细胞,并在蛋白质水平验证了这一发现。 样本量较小(15例),且未对GZMK+ T细胞的功能进行深入验证,缺乏对治疗意义的直接测试。 探索胶质母细胞瘤中肿瘤浸润T细胞的特征,以理解免疫治疗疗效有限的原因。 15例高级别胶质瘤患者(包括GBM或IDH突变型星形细胞瘤4级)的肿瘤浸润T细胞。 单细胞免疫组学 胶质母细胞瘤 CITE-seq, 单细胞RNA测序, 配对V(D)J测序 NA 单细胞转录组和表位数据、T细胞受体序列数据 15例患者 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞V(D)J测序,CITE-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序,10x Chromium单细胞V(D)J测序,CITE-seq
24 2026-08-20
Branching topology of the human embryo transcriptome revealed by Entropy Sort Feature Weighting
2024-06-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究介绍了一种名为连续熵排序特征加权(cESFW)的替代特征选择方法,用于分析单细胞转录组数据,并应用于人类早期胚胎发育的转录组分析 提出cESFW作为一种无需预设高变基因的数学框架,在合成数据集上优于传统HVG选择,并在未平滑或增强原始计数矩阵的情况下,实现高分辨率嵌入,揭示胚胎发育中的分支拓扑和新的细胞状态 摘要未明确提及局限性,可能包括对合成数据依赖、样本合并偏差或分析方法的适用性限制 开发并验证一种改进的特征选择方法,以解析人类胚胎早期发育的单细胞转录组谱系决策和细胞状态 人类早期胚胎发育的细胞,包括从八细胞期到植入后阶段的细胞,以及多能干细胞培养物 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 不适用(基于熵排序的数学方法,非深度学习模型) 单细胞基因表达数据(计数矩阵) 六个合并的单细胞RNA-seq数据集,覆盖人类早期胚胎发育阶段,具体细胞数量未提供 不适用 单细胞RNA-seq 不适用 不适用
25 2026-08-20
Single cell transcriptomics reveals distinct transcriptional responses to oxycodone and buprenorphine by iPSC-derived brain organoids from patients with opioid use disorder
2024-06, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 利用iPSC来源的脑类器官进行单核RNA测序,揭示了阿片类药物使用障碍患者对羟考酮和丁丙诺啡的不同转录反应 首次利用单细胞转录组学技术,在iPSC来源的脑类器官中比较羟考酮和丁丙诺啡对患者特异性的细胞类型特异性转录反应,并发现羟考酮激活STAT1和I型干扰素信号通路 研究仅包括三名男性OUD患者,样本量较小,且使用iPSC来源的脑类器官可能无法完全模拟体内脑环境的复杂性 在单细胞水平上理解阿片类药物如何调节脑细胞类型功能,特别是比较羟考酮和丁丙诺啡对OUD患者脑类器官的转录影响 来自三名男性OUD患者的iPSC来源的前脑类器官 转录组学 阿片类药物使用障碍 单核RNA测序 Seurat整合分析流程 单核RNA测序数据 25787个细胞,来自三名OUD患者的iPSC来源前脑类器官 NA 单核RNA-seq NA NA
26 2026-08-20
Network-based prioritization and validation of regulators of vascular smooth muscle cell proliferation in disease
2024-06, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过重建单细胞转录组和表观遗传谱的基因调控网络,揭示调控血管平滑肌细胞增殖的分子决定因素,并识别出RUNX1和TIMP1等新的调控因子。 利用单细胞转录组和表观遗传谱重建基因调控网络,结合计算机模拟扰动分析,优先识别出RUNX1和TIMP1作为新的增殖调控因子,并验证TIMP1通过CD74介导的STAT3信号促进增殖。 未提及具体限制。 阐明控制血管平滑肌细胞增殖的分子决定因素,并识别具有临床潜力的疾病靶点。 血管平滑肌细胞(VSMCs),包括增殖倾向、损伤响应和非响应状态的VSMCs。 单细胞转录组学、表观遗传学、基因调控网络 血管疾病(导致心脏病和中风) 单细胞RNA测序、表观遗传分析(如ATAC-seq)、基因调控网络重建、计算机模拟扰动分析 基因调控网络模型 单细胞转录组数据、表观遗传数据 未提及具体样本数量。 NA 单细胞RNA测序、表观遗传分析 NA NA
27 2026-08-18
Single-cell sequencing reveals VEGFR as a potential target for CAR-T cell therapy in chordoma
2024-06, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞测序揭示脊索瘤中VEGFR作为CAR-T细胞治疗的潜在靶点,并验证VEGFR/TGF-β scFv CAR-T细胞的抗肿瘤效果 首次在脊索瘤中利用单细胞RNA测序鉴定VEGFR作为新型免疫治疗靶点,并构建同时靶向VEGFR和TGF-β的CAR-T细胞,增强抗肿瘤活性 研究仅限于体外实验和类器官模型,未进行体内验证 鉴定脊索瘤中可作为免疫治疗靶点的细胞表面蛋白,并评估VEGFR靶向CAR-T细胞的抗肿瘤效果 14例脊索瘤患者样本及原代脊索瘤类器官 单细胞测序 脊索瘤 单细胞RNA测序 CAR-T细胞 单细胞转录组数据 14例脊索瘤患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
28 2026-08-18
Tumour-associated myeloid cells expressing IL-10R2/IL-22R1 as a potential biomarker for diagnosis and recurrence of pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-06, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 研究表达IL-10R2/IL-22R1的肿瘤相关髓系细胞作为胰腺导管腺癌诊断和复发潜在生物标志物的可能性 首次鉴定外周血中IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞作为PDAC早期诊断和复发预测的生物标志物,其比CA19-9早130天提示肿瘤复发 未在大型临床队列中验证该生物标志物的敏感性和特异性,且机制研究主要基于小鼠模型 评估IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞作为胰腺导管腺癌诊断和复发生物标志物的价值 PDAC患者及小鼠模型中的IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确,但涉及PDAC患者和小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
29 2026-08-18
T cells in testicular germ cell tumors: new evidence of fundamental contributions by rare subsets
2024-06, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过免疫组化、流式细胞术和单细胞RNA测序分析了睾丸生殖细胞肿瘤中的T细胞亚群,发现罕见调节性T细胞和滤泡辅助T细胞在肿瘤微环境中具有重要作用 首次在人睾丸中鉴定出罕见的Treg和Tfh细胞亚群,并揭示它们在TGCT病理生物学中的潜在贡献 患者间存在显著异质性,且研究未深入探讨这些T细胞亚群的具体功能机制 阐明睾丸生殖细胞肿瘤中T细胞亚群的组成及其在肿瘤进展和免疫治疗中的意义 人类睾丸组织标本,包括正常睾丸、TGCT及癌前GCNIS病变 数字病理学 睾丸生殖细胞肿瘤 免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 组织图像、流式细胞数据、单细胞转录组数据 来自多个独立患者队列的人睾丸标本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
30 2026-08-17
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-27, Research square
研究论文 开发了一种名为TACIT的无监督算法,利用预定义签名进行细胞注释,以解决空间生物学中细胞类型和状态识别的挑战,并在多个数据集上验证其准确性和可扩展性 TACIT无需训练数据,采用无偏阈值区分阳性细胞与背景,聚焦相关标记物识别多组学检测中的模糊细胞,并整合空间转录组和蛋白质组数据发现疾病相关免疫细胞类型和状态 文中未明确提及局限性 提高空间生物学中细胞类型和状态注释的准确性和可扩展性,并促进多组学数据在临床转化中的应用 五种数据集(500万个细胞、51种细胞类型)来自三个生态位(脑、肠、腺体) 机器学习 炎症性腺疾病 空间转录组学、空间蛋白质组学 无监督算法(TACIT) 空间转录组数据、蛋白质组数据 5,000,000个细胞,涵盖51种细胞类型,来自脑、肠、腺体三个生态位 NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
31 2026-08-17
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了一种无监督算法TACIT,用于空间多组学数据中细胞类型和状态的去卷积,无需训练数据即可进行细胞注释 无需训练数据,使用无偏阈值区分阳性细胞,关注相关标记物识别模糊细胞,适用于多组学检测 未在文中明确提及局限性 解决空间生物学中细胞类型和状态识别耗时且易出错的问题,提高准确性和可扩展性 来自大脑、肠道和腺体三个微环境的数据集,包含约500万个细胞和51种细胞类型 空间生物学、深度学习、机器学习 炎症性腺体疾病 空间转录组学、空间蛋白质组学 无监督算法(TACIT) 空间多组学数据(包括转录组和蛋白质组) 五个数据集,约500万个细胞,51种细胞类型 NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
32 2026-08-08
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 开发了PERCEPTION计算流程,利用患者肿瘤的单细胞转录组预测治疗反应和耐药性 首次利用患者肿瘤的单细胞转录组数据,结合大规模细胞系药物筛选的匹配表达谱,构建个性化治疗反应预测模型 未明确说明局限性,可能涉及对临床样本单细胞数据的依赖和模型泛化性 提高癌症患者个体化治疗的精准性,通过单细胞转录组预测治疗反应和耐药性 癌症患者,包括多发性骨髓瘤、乳腺癌和肺癌患者 精准肿瘤学 多发性骨髓瘤、乳腺癌、肺癌 单细胞RNA测序 计算流程(未指定具体模型类型) 单细胞转录组表达谱 未明确,涉及培养细胞、患者肿瘤来源的原代细胞以及两个临床试验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-08-07
Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1
2024-06-21, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过靶向CMKLR1成像技术评估肺部炎症-纤维化轴,为非侵入性肺纤维化疾病的临床管理提供新的生物标志物 首次验证CMKLR1作为肺炎症-纤维化轴的影像生物标志物,能实现早期预测和空间映射炎症区域,并识别出炎症性内型的IPF患者不良预后 研究主要在动物模型和有限的患者样本中进行,尚需大规模临床验证 评估CMKLR1作为肺纤维化疾病炎症-纤维化轴的影像生物标志物的准确性,以改善风险分层和治疗监控 IPF患者样本和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 医学影像 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序, 正电子发射断层扫描(PET) NA 基因组数据, 影像数据, 临床数据 NA NA 单细胞RNA测序, 正电子发射断层扫描(PET) NA NA
34 2026-08-07
Inhibition of the eukaryotic initiation factor-2α kinase PERK decreases risk of autoimmune diabetes in mice
2024-06-18, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本文研究了抑制eIF2α激酶PERK对自身免疫性糖尿病小鼠模型的保护作用及其机制。 首次证明PERK抑制能通过增加PD-L1稳定性来降低β细胞免疫原性,从而延缓T1D发病,为T1D预防提供新策略。 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚需人体临床试验验证其安全性和有效性。 探究PERK抑制在预防或延缓自身免疫性1型糖尿病中的潜在作用及机制。 自身免疫性糖尿病易感小鼠、人类胰岛、EndoC-βH1人β细胞 数字病理学 1型糖尿病 单细胞RNA测序,空间蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 未明确 10x Genomics, NA 单细胞RNA-seq,空间蛋白质组学 10x Chromium, NA 10x Chromium单细胞RNA测序,空间蛋白质组学分析
35 2026-08-07
Spatially distinct epithelial and mesenchymal cell subsets along progressive lineage restriction in the branching embryonic mammary gland
2024-Jun, The EMBO journal
研究论文 利用单细胞RNA测序技术,从胚胎第13.5天至出生,构建了小鼠乳腺上皮和间充质的图谱,追踪了多能干细胞向基底和腔上皮命运的分化轨迹,揭示了谱系定型的时间点和空间分布,并发现真皮间充质产生的FGF10对乳腺分支形态发生至关重要。 首次在分支形态发生前识别出小鼠乳腺多能干细胞谱系定型的关键时间点(E15.5),并确定了早期分子标记及其空间分布;同时发现胚胎乳腺间充质包含两个空间限制的细胞群体,并鉴定出FGF10作为关键信号分子。 研究仅限于小鼠模型,可能不完全适用于人类;未提供功能性实验验证所有标记物和信号通路;单细胞测序可能受限于组织解离和样本异质性。 阐明乳腺发育中多能干细胞向基底和腔上皮命运分化的时空信号,并揭示间充质细胞在分支形态发生中的信号作用。 小鼠胚胎乳腺组织(从E13.5到出生)的上皮和间充质细胞。 发育生物学,单细胞转录组学 不适用(基础发育研究) 单细胞RNA测序 分化轨迹重建(如Monocle或类似工具) 单细胞转录组数据 从E13.5到出生多个时间点的小鼠胚胎乳腺样本(具体数量未提供)。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'试剂盒(推测,因未明确说明具体版本)
36 2026-08-06
Glioma hexokinase 3 positively correlates with malignancy and macrophage infiltration
2024-06, Metabolic brain disease IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过泛癌分析及多组学数据,全面评估了己糖激酶3在胶质瘤中的表达分布及其与巨噬细胞浸润和肿瘤微环境的关系 首次全面研究HK3与胶质瘤肿瘤微环境特性的关联,揭示其与巨噬细胞浸润的正相关性及对免疫抑制微环境的诱导作用 摘要中未提及研究局限性 探讨HK3在胶质瘤中的表达、预后意义及其与巨噬细胞浸润和肿瘤微环境的关系 胶质瘤患者样本及多种癌症类型的泛癌数据 生物信息学 胶质瘤 RNA-seq, 单细胞测序, 免疫组化 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据, 基因组数据 基于多个公共数据库(GTEx, CCLE, TCGA, CGGA)和TIMER网站的预测数据 NA RNA-seq, 单细胞测序 NA NA
37 2026-08-05
Dysfunction of infiltrating cytotoxic CD8+ T cells within the graft promotes murine kidney allotransplant tolerance
2024-06-18, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和过继转移实验,发现小鼠肾移植耐受中,移植物内浸润的细胞毒性CD8+ T细胞被重编程为衰竭/调节性表型,由IFN-γ介导,这一过程依赖于调节性三级淋巴器官的形成。 首次揭示肾移植耐受中细胞毒性CD8+ T细胞的功能障碍作为一种保护性机制,并命名为“防御性耐受”,且与肿瘤内的免疫逃逸机制相似。 研究主要基于小鼠模型,需进一步验证在人类中的适用性;且CD8+ T细胞在耐受维持中的非必需性需更多探讨。 阐明肾移植耐受中浸润的细胞毒性CD8+ T细胞功能重编程的机制及其在移植耐受和肿瘤免疫抵抗中的意义。 小鼠肾移植模型中的移植物、浸润的CD8+ T细胞、调节性三级淋巴器官,以及肿瘤组织中的类似细胞类型。 数字病理学 移植排斥反应 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、过继转移 未明确指定 单细胞基因表达数据 小鼠肾移植和肿瘤模型的样本;具体数量未在标题和摘要中给出。 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
38 2026-08-05
An attenuated lymphocytic choriomeningitis virus vector enhances tumor control in mice partly via IFN-I
2024-06-11, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究报道了一种基于减毒淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒(r3LCMV)的非裂解性病毒载体在小鼠肿瘤模型中展现出显著的抗肿瘤效果,并揭示了其部分通过I型干扰素(IFN-I)发挥作用的机制。 首次报道了减毒LCMV载体r3LCMV在多种肿瘤模型中具有强效抗肿瘤效果,并在免疫缺陷小鼠中仍有效,提示多种途径参与,且诱导训练免疫,并通过单细胞RNA测序揭示IFN-I的关键作用。 研究主要基于小鼠模型,其抗肿瘤效果在人类中的适用性及安全性仍需进一步验证。 评估基于减毒淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒的病毒载体在小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤效果及其机制。 小鼠肿瘤模型及多种免疫缺陷小鼠(Rag1-/-和MyD88-/-) 免疫学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多种肿瘤模型的小鼠样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
39 2026-08-04
The ω-3 Polyunsaturated Fatty Acid Docosahexaenoic Acid Enhances NK-Cell Antitumor Effector Functions
2024-06-04, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了ω-3多不饱和脂肪酸二十二碳六烯酸(DHA)通过增强NK细胞的抗肿瘤效应功能来抑制肿瘤生长的免疫调节作用 首次从免疫调节角度揭示DHA通过上调NK细胞中PGC-1α信号介导的线粒体氧化磷酸化活性来增强其抗肿瘤功能 研究主要基于小鼠模型,未在人体中进行验证;且未深入探讨DHA对其他免疫细胞类型的潜在长期影响 探究DHA是否通过免疫调节,特别是增强NK细胞功能,来抑制肿瘤生长 小鼠模型中的自然杀伤(NK)细胞,以及B16F10黑色素瘤肿瘤模型 免疫学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确样本数量,涉及小鼠模型和体外NK细胞实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
40 2026-08-04
Comprehensive pan-cancer analysis of mitochondrial outer membrane permeabilisation activity reveals positive immunomodulation and assists in identifying potential therapeutic targets for immunotherapy resistance
2024-06, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过泛癌分析揭示线粒体外膜透化(MOMP)活性对免疫调节和免疫治疗响应的积极作用,并识别免疫治疗耐药潜在靶点 首次进行MOMP活性的泛癌综合分析,开发了MOMP.Sig特征以精确反映肿瘤MOMP活性,并整合CRISPR筛选识别FOXO1作为免疫治疗耐药的核心调节因子 未明确提及局限性 探讨肿瘤MOMP活性对免疫微环境和免疫治疗的影响,并识别克服免疫治疗耐药的潜在靶点 30种癌症类型的转录组队列、20个免疫治疗转录组队列、三个免疫治疗scRNA-seq数据集、65个scRNA-seq数据集以及皮肤黑色素瘤和三阴性乳腺癌患者的临床免疫治疗队列 机器学习 泛癌(包括皮肤黑色素瘤、三阴性乳腺癌) RNA-seq, scRNA-seq 机器学习模型 转录组数据、单细胞转录组数据 30种癌症类型的转录组队列、20个免疫治疗转录组队列、3个免疫治疗scRNA-seq数据集、65个scRNA-seq数据集、2个临床免疫治疗队列 NA RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
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