单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 543 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-05 |
Macrophages as determinants and regulators of systemic sclerosis-related interstitial lung disease
2024-Jun-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05403-4
PMID:38937794
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在系统性硬化症相关间质性肺病中的影响和调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序区分系统性硬化症相关间质性肺病与特发性肺纤维化，并提出了潜在的预防和治疗方向 | 研究限于使用NCBI Gene Expression Omnibus数据库，可能存在样本偏差 | 阐明系统性硬化症相关间质性肺病与特发性肺纤维化的病理机制差异 | 通过单细胞分析研究健康对照组、特发性肺纤维化及系统性硬化症相关间质性肺病的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 利用来自GSE159354和GSE212109的样本进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-05 |
The Alk receptor tyrosine kinase regulates Sparkly, a novel activity regulating neuropeptide precursor in the Drosophila central nervous system
2024-Jun-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88985
PMID:38904987
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研究论文 | 本文描述了Alk受体酪氨酸激酶在果蝇中枢神经系统中调控一种新的神经肽前体的作用 | 揭示了Alk信号通路在神经内分泌基因表达转录调控中的新功能，以及新发现的神经肽前体作为Alk信号的转录靶标 | 对Alk信号通路的具体分子机制理解仍然较为有限 | 探讨Alk受体酪氨酸激酶在果蝇中枢神经系统中的功能及其调控机制 | 研究对象为果蝇幼虫的中枢神经系统和相关的基因表达 | 神经生物学 | NA | Targeted DamID (TaDa) 转录剖析 | NA | scRNA-seq数据和转录组数据 | 果蝇幼虫的中枢神经系统组织 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-05 |
Branching topology of the human embryo transcriptome revealed by Entropy Sort Feature Weighting
2024-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202832
PMID:38691188
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研究论文 | 本文展示了一种新的用于单细胞转录组学分析的特征选择数学框架Entropic Sorting。 | 创新点在于提出了连续熵排序特征加权（cESFW），并展示其在细胞状态特异基因区分上的优越性。 | 未提及具体的局限性 | 研究的目的是开发一种新的特征选择方法，以更好地分析人胚胎发育中的单细胞转录组数据。 | 研究对象为六个合并的人类早期胚胎发育的单细胞转录组数据集。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 六个单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-05 |
Global dynamics and cytokinin participation of salt gland development trajectory in recretohalophyte Limonium bicolor
2024-Jun-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae199
PMID:38588029
|
研究论文 | 本文研究了盐腺的发展轨迹及其相关的分子机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了海熏衣草盐腺的演变及细胞命运的决定机制 | 研究仅基于盐腺发育的特定阶段，可能无法全面反映整个发育过程 | 揭示盐腺的发育轨迹以及细胞命运决定的分子机制 | 研究对象为海熏衣草（Limonium bicolor）中的盐腺及其相关基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-05 |
Breast cancer patient-derived organoids for the investigation of patient-specific tumour evolution
2024-Jun-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03375-5
PMID:38926706
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研究论文 | 开发了一种可靠的来自乳腺癌患者的类器官模型，以调查肿瘤演变 | 首次利用患者来源的类器官模型研究新辅助化疗和手术前后的肿瘤演变 | 研究基于单一病例，需要更多样本验证普遍性 | 研究患者特异性的肿瘤演变过程 | 69岁乳腺癌女性患者的组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、药物筛选 | 类器官 | 组织培养 | 2个类器官样本（则为治疗前后的组织） | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-04 |
MOI is a comprehensive database collecting processed multi-omics data associated with viral infection
2024-06-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65629-6
PMID:38926513
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研究论文 | 本研究开发了一个名为'MOI'的综合数据库，聚合与病毒感染相关的处理过的多组学数据 | MOI数据库填补了缺乏集中存储病毒宿主反应数据的空白，并为病毒宿主相互作用的深入研究提供了宝贵资源 | 本文未提及数据库的持续更新和数据验证过程的具体细节 | 研究病毒宿主相互作用的分子机制，以推动对病毒致病机制的理解及治疗干预的发展 | 涉及3200多个病毒感染样本，包括人类和小鼠感染 | 数字病理学 | NA | RNA测序, ChIP测序, ATAC-seq | NA | 多组学数据 | 3200多个病毒感染样本 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-05 |
Mobilization and activation of tumor-infiltrating dendritic cells inhibits lymph node metastasis in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Jun-26, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-024-02079-z
PMID:38926350
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研究论文 | 本文研究了肝内胆管癌中肿瘤浸润性树突状细胞的动员与激活对淋巴结转移的抑制作用 | 揭示了肿瘤细胞内源性β-连环蛋白激活作为在肝内胆管癌中逃避树突状细胞介导的抗肿瘤免疫的关键机制 | 尚未探讨FL-pIC疗法或β-连环蛋白抑制剂的临床有效性 | 探讨淋巴结转移的机制及肿瘤免疫控制的潜在治疗方法 | 研究了244例肝内胆管癌样本中的树突状细胞浸润和相关免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | scRNA-seq和bulk RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 219例手术切除的肝内胆管癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-05 |
The Advancement and Application of the Single-Cell Transcriptome in Biological and Medical Research
2024-Jun-19, Biology
DOI:10.3390/biology13060451
PMID:38927331
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序技术的发展及其在生物和医学研究中的应用 | 深入分析了不同单细胞转录组技术的发展过程，并总结其与其他组学分析的整合 | 当前单细胞转录组技术仍不完善，存在一些不足之处 | 帮助更深入理解scRNA-seq技术及其在生物和医学研究中的应用 | 单细胞转录组数据及其在多个研究领域的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic and Targeted Genomic Profiling Adjusted for Inflammation and Therapy Bias Reveal CRTAM and PLCB1 as Novel Hub Genes for Anti-Tumor Necrosis Factor Alpha Therapy Response in Crohn's Disease
2024-Jun-19, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics16060835
PMID:38931955
|
研究论文 | 该研究揭示了 CRTAM 和 PLCB1 作为克罗恩病抗肿瘤坏死因子 Alpha 治疗反应的新中心基因 | 该研究采用单细胞 RNA 测序探索特定免疫细胞亚群体，为抗 TNFα 生物治疗的生物标志物发现提供了新的视角 | 本研究主要集中于特定细胞类型，可能未能涵盖更广泛的生物标志物探索 | 研究抗肿瘤坏死因子 Alpha 治疗的生物标志物以改善克罗恩病患者的个性化治疗 | 克罗恩病患者的外周血单核细胞基因表达 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞 RNA 测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自不同治疗状态的克罗恩病患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-04 |
Advances in Single-Cell Transcriptome Sequencing and Spatial Transcriptome Sequencing in Plants
2024-Jun-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13121679
PMID:38931111
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研究论文 | 文章概述了植物单细胞转录组和空间转录组测序的研究进展以及它们在植物中的应用和挑战 | 介绍了单细胞和空间转录组测序技术的创新以及其对细胞特异性表达的揭示 | 该研究主要集中在植物领域，可能不适用于动物细胞转录组的分析 | 探讨单细胞和空间转录组测序在植物研究中的应用 | 主要研究植物组织中单个细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序与空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-04 |
Exploring the Molecular Mechanism of Comorbidity of Type 2 Diabetes Mellitus and Colorectal Cancer: Insights from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-Jun-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060693
PMID:38927096
|
研究论文 | 本研究首次使用批量RNA测序和单细胞RNA测序数据探讨2型糖尿病与结直肠癌之间的分子机制 | 本研究揭示了EVPL和ENTPD3作为2型糖尿病和结直肠癌共病的特征分子，强调了免疫机制在这两种疾病共同发展的重要性 | 本研究可能在探索分子机制方面存在一定的局限性，尤其是需要更多样本验证结果 | 研究2型糖尿病与结直肠癌之间的共享分子机制 | 重点研究EVPL和ENTPD3这两个核心共病基因 | 数字病理学 | 2型糖尿病和结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-04 |
Accurate Identification of Spatial Domain by Incorporating Global Spatial Proximity and Local Expression Proximity
2024-Jun-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060674
PMID:38927077
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研究论文 | 文章提出了一种新的深度学习方法SECE，用于准确识别空间转录组数据中的空间域 | 提出的SECE方法结合了局部与全局空间关系，充分利用空间信息，提高了识别精度 | 研究未提及可能在不同生物组织中的适用性 | 旨在提高空间转录组数据分析中空间域的识别准确性 | 针对真实的空间转录组数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 空间转录组数据 | 六个真实数据集，涵盖四个不同平台 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-05 |
Integrated Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Metabolic Reprogramming of Liver Cancer and Establishes a Prognostic Risk Model
2024-Jun-08, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060755
PMID:38927691
|
研究论文 | 该文章分析了肝癌的代谢重编程，并建立了预后风险模型 | 通过单细胞转录组分析和代谢视角建立的预后风险模型对于肝癌的精确预防和治疗具有重要意义 | 该研究仅限于所选样本，可能无法广泛适用于所有肝癌患者 | 旨在提供肝癌患者的分层和精确治疗方法 | 研究对象包括105,829个单细胞转录组分析中识别的11种细胞类型 | 数字病理 | 肝癌 | scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq | NA | 细胞数据 | 105,829个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-04 |
Ploidy inference from single-cell data: application to human and mouse cell atlases
2024-06-05, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae061
PMID:38651869
|
研究论文 | 本研究开发了一种从单细胞ATAC-seq数据推断细胞倍性的统计方法 | 首次将倍性分析集成到单细胞研究中，并能够系统地检测多倍性 | 可能需要额外的测定步骤以测量倍性 | 旨在填补单细胞研究中倍性分析的空白 | 人类和小鼠细胞图谱的数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 人类和小鼠的多个细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-05 |
Single-cell phylotranscriptomics of developmental and cell type evolution
2024-Jun, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.02.005
PMID:38490933
|
研究论文 | 单细胞进化转录组学作为一种新兴工具，揭示了进化的分子和细胞机制 | 首次分析了发育过程中转录组年龄的异质性，并识别了驱动整体生物体温沙形态的谱系和组织 | 没有提及具体的技术限制或实验范围 | 探索发育与细胞类型进化的分子机制 | 研究不同谱系和组织在整个发育过程中的转录组变化 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of human oocytes reveals a differential transcriptomic profile associated with agar-like zona pellucida
2024-Jun-26, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01463-8
PMID:38926883
|
研究论文 | 该文章探讨了具有琼脂样透明带的单个细胞卵母细胞的转录组特征 | 揭示了与琼脂样透明带相关的分子机制及其涉及的差异表达基因 | 研究样本数量较少，仅涉及四名患者和四名健康供体 | 阐明琼脂样透明带的分子机制及其对卵母细胞的影响 | 琼脂样透明带卵母细胞与健康卵母细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个卵母细胞样本（四个琼脂样透明带患者和四个健康供体） | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-07 |
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-Jun-26, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2652-y
PMID:38940831
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-05 |
Pan-cancer multi-omics analysis of PTBP1 reveals it as an inflammatory, progressive and prognostic marker in glioma
2024-06-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64979-5
PMID:38918441
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研究论文 | 本研究分析了PTBP1在胶质瘤中的炎症、进展和预后标志物的角色。 | 揭示了PTBP1在多种癌症中的表达、甲基化与预后之间的关系，并首次将其作为胶质瘤的标志物。 | 尚不清楚PTBP1表达与肿瘤微环境的具体关系。 | 探讨PTBP1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力。 | PTBP1在不同癌症类型中的表达与甲基化模式。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 基因集合富集分析（GSEA），单细胞转录组分析，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据，甲基化数据 | 使用了多种数据集，包括TCGA、GTEx和CGGA | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-05 |
Insight into Fructose-to-Sucrose Ratio as the Potential Target of Urinalysis in Bladder Cancer
2024-Jun-20, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14060345
PMID:38921479
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研究论文 | 本文探讨了尿液中果糖与蔗糖比作为膀胱癌尿液分析的潜在目标 | 研究首次揭示了尿液中果糖与蔗糖比与膀胱癌风险之间的双向负因果关系 | 研究主要依赖于动物模型，可能无法完全反映人类膀胱癌的复杂性 | 研究膀胱癌中可操作的非侵入性筛查生物标志物 | 膀胱癌相关的尿液代谢物及其与膀胱癌风险的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, Mendelian随机化分析 | BBN诱导的小鼠模型 | 生物标志物数据 | 使用BBN诱导的小鼠模型进行验证的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-05 |
Identification of therapeutic targets and medicines for comorbid Crohn's disease and rheumatoid arthritis: A comprehensive analysis
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32406
PMID:38933947
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研究论文 | 本研究旨在识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的潜在治疗靶点和药物 | 本研究运用单细胞RNA测序和孟德尔随机化等新方法来识别共患疾病的关键免疫细胞及其靶点 | 未提及研究的具体局限性 | 识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的治疗靶点和潜在药物 | 共患克罗恩病和类风湿关节炎的患者的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 克罗恩病/类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 文本 | 纳入共患克罗恩病和类风湿关节炎患者的PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |