单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 543 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-05 |
Machine learning integrative approaches to advance computational immunology
2024-06-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01350-3
PMID:38862979
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评论 | 这篇文章讨论了机器学习整合方法在计算免疫学中的应用。 | 文章强调了现代机器学习技术在整合多种‘组学’数据方面的创新能力，尤其是在单细胞和空间分析中的应用。 | 文章提到了一些整体方法的挑战，但具体的限制未详细说明 | 探讨机器学习整合技术如何推动免疫学研究的发展。 | 聚焦于免疫学领域内多层次数据集的整合分析。 | 计算免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-05 |
Mitochondrial Oxidative Stress Regulates FOXP3+ T-Cell Activity and CD4-Mediated Inflammation in Older Adults with Frailty
2024-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25116235
PMID:38892421
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研究论文 | 本研究阐明了衰弱老年人CD4/Treg轴的复杂免疫动力学 | 首次揭示了衰弱老年人Treg细胞亚群及其转录组特征与CD4 T细胞反应失调之间的关系 | 当前研究主要比较年轻和老年人群，未充分考虑健康老年人与经历病理衰老者之间的差异 | 研究衰弱老年人中CD4/Treg轴的免疫调节机制 | 衰弱老年人及其与同龄健康老年人的比较 | 数字病理学 | 衰弱 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用公开的外周血单核细胞数据进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-05 |
Tumor suppressive role of the epigenetic master regulator BRD3 in colorectal cancer
2024-Jun, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16129
PMID:38494600
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研究论文 | 本研究探讨了BET家族蛋白BRD3在结直肠癌中的肿瘤抑制作用 | 首次展示了BRD3通过诱导p21表达抑制细胞周期并抑制肿瘤生长的作用 | 未讨论BRD3以外的其他BET家族成员在结直肠癌中的作用 | 研究BRD3在结直肠癌（CRC）中的功能角色 | 结直肠癌细胞及临床样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化分析 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of immune cells from the coronary sinus reveals immune mechanisms of the progression of persistent atrial fibrillation
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110127
PMID:38966571
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研究论文 | 该文章探讨了来自冠状窦的免疫细胞在持续性心房颤动进程中的作用 | 首次通过单细胞测序揭示了持续性心房颤动患者冠状窦中免疫细胞的异质性及其与心房颤动复发的相关性 | 研究未明确提及样本量及潜在的临床应用限制 | 探索免疫细胞在持续性心房颤动进展中的作用及机制 | 持续性心房颤动患者的冠状窦免疫细胞 | 数字病理学 | 心房颤动 | 单细胞测序 | NA | 免疫细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-04 |
An integrated single-cell RNA-seq map of human neuroblastoma tumors and preclinical models uncovers divergent mesenchymal-like gene expression programs
2024-06-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03309-4
PMID:38898465
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研究论文 | 本研究生成了神经母细胞瘤细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的单细胞RNA-seq图谱 | 提出了一种无监督机器学习方法(acNMF)来比较临床与前临床模型中的基因表达程序 | 未详细研究弱表达的间充质样基因表达与药物耐受机制之间的关系 | 更好地理解患者肿瘤异质性与前临床模型之间的关系 | 聚焦于神经母细胞瘤细胞系及其前临床模型的基因表达程序 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | 无监督机器学习模型 | 基因表达数据 | 涉及多种细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-08-04 |
Advances in single-cell long-read sequencing technologies
2024-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae047
PMID:38774511
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综述 | 本文讨论了单细胞长读长测序技术的最新进展 | 提供了针对细胞复杂性来源的新见解，并强调了单细胞RNA异构体测序(scRiso-seq)的显著进展 | 主要集中在下游分析的实际考虑和操作挑战上 | 探讨单细胞测序技术在转录组和基因组研究中的应用 | 长读长测序技术在单细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | RNA和DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-08-05 |
Systematic evaluation with practical guidelines for single-cell and spatially resolved transcriptomics data simulation under multiple scenarios
2024-06-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03290-y
PMID:38831386
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研究论文 | 本文系统评估了49种针对单细胞RNA测序和空间分辨转录组数据的模拟方法 | 提供了关于不同模拟方法的准确性、功能性、可扩展性和可用性的详细比较，并提出了实际的选择指导 | 没有任何方法在所有标准上表现最佳，且某些方法只能生成不真实的模拟数据 | 评估单细胞RNA测序和空间分辨转录组数据的模拟方法以提供实践指导 | 49种用于单细胞RNA测序和空间分辨转录组的数据模拟方法 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 转录组数据 | 152个来自24个平台的参考数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-05 |
Integrated bioinformatics analysis and experimental validation identifies CPE as a potential biomarker and therapeutic target for skin aging
2024-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15120
PMID:38886965
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研究论文 | 本文通过整合生物信息学分析和实验验证，识别了CPE作为皮肤衰老的潜在生物标志物和治疗靶点。 | 创新点在于首次通过加权基因共表达网络分析和机器学习技术，确定了CPE作为皮肤衰老的关键标志物，揭示其在皮肤衰老中的功能。 | 本文未提及特定的临床试验或广泛的人群数据以验证CPE的生物标志物和治疗靶点的有效性。 | 研究皮肤衰老的机制并识别新的生物标志物和治疗靶点。 | 研究对象为人类真皮成纤维细胞(HDFs)，分析其在衰老过程中的CPE表达变化。 | 数字病理学 | 皮肤衰老 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习 | NA | 转录组数据 | 使用了衰老相关的总体转录组和单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-08-05 |
Mesenchymal stem cells-extracellular vesicles alleviate pulmonary fibrosis by regulating immunomodulators
2024-Jun-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i6.670
PMID:38948098
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研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞外泌体（MSC-EVs）在减轻肺纤维化中的治疗潜力 | 本研究首次系统评估了MSC-EVs对肺纤维化、氧化应激和免疫炎症的影响 | 研究中未明确描述MSC-EVs的具体分子机制和长期效果 | 研究MSC-EVs在治疗肺纤维化及其相关病理过程中的潜力 | 研究对象包括A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞和小鼠肺组织样本 | 使用A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-05 |
Decoding heterogeneous and coordinated tissue architecture in glioblastoma using spatial transcriptomics
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110064
PMID:38947514
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探讨胶质母细胞瘤中的基因表达异质性 | 首次揭示了胶质母细胞瘤中组织干细胞特征在坏死和肿瘤周边区域的富集 | 缺乏对空间复杂性的深入探讨 | 探讨胶质母细胞瘤的基因表达异质性及其空间分布 | 临床胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 临床胶质母细胞瘤标本（具体数量未提供） | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-08-05 |
Generation and characterization of inducible KRAB-dCas9 iPSCs from primates for cross-species CRISPRi
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110090
PMID:38947524
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研究论文 | 本论文生成并验证了来自灵长类动物的可诱导KRAB-dCas9 iPS细胞系。 | 提供了灵长类动物iPS细胞系的独特资源，以便于跨物种的CRISPR干扰研究。 | 尽管在不同细胞系中KRAB-dCas9的表达水平不同，但对目标基因的下调效果相似，可能限制了结果的普遍性。 | 研究灵长类动物的分子表型比较，为理解人类生物学和进化提供信息。 | 三个人类、三种大猩猩和两种猕猴iPS细胞系。 | 数字病理学 | NA | CRISPR干扰（CRISPRi） | NA | 单细胞RNA测序 | 八个iPS细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-05 |
Isolation of Human Bone Marrow Non-hematopoietic Cells for Single-cell RNA Sequencing
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5020
PMID:38948257
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研究论文 | 本文介绍了一种精确分离人类骨髓非造血细胞以进行单细胞RNA测序的方法 | 提出了一种新的分离协议，特别强调了从人类骨髓中获得高质量骨髓间充质细胞的准确性 | 对非造血细胞表型的理解仍然有限，研究领域内的相关研究较少 | 旨在改善对人类骨髓造血微环境的理解，尤其是非造血细胞的特性 | 人类骨髓中的非造血细胞，特别是骨髓间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of the survival mechanisms of fratricidal CAR-T targeting of T cell malignancies
2024-Jun-11, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102225
PMID:38948332
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了针对T细胞恶性肿瘤的兄弟相杀CAR-T细胞的生存机制 | 首次介绍了兄弟相杀CAR-T细胞的生存机制及其相关分子 | 尚未完全揭示所有介导CAR-T细胞生存的机制 | 研究兄弟相杀CAR-T产品的生存机制和调控因子 | 针对T细胞的CD26 CAR-T和CD44v6 CAR-T，以及控制的CD19 CAR-T | 数字病理学 | T细胞肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 来自同一供体的多个CAR-T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics dissecting the development and evolution of nervous system in insects
2024-06, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2024.101201
PMID:38608931
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综述 | 本文探讨了单细胞转录组学在昆虫神经系统分解中的成就 | 本文创新性在于将单细胞转录组学应用于揭示昆虫神经系统的发展和进化 | 研究限制在于主要聚焦于代表性昆虫，可能无法涵盖所有昆虫的神经系统 | 研究昆虫神经系统在发展和进化过程中的分子和细胞架构 | 代表性的昆虫神经系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-05 |
Enoyl coenzyme a hydratase 1 attenuates aortic valve calcification by suppressing Runx2 via Wnt5a/Ca2+ pathway
2024-Jun, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.12038
PMID:38946717
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研究论文 | 本研究探讨了Enoyl辅酶A水合酶1在钙化主动脉瓣疾病中的作用及其机制 | 发现ECH1通过抑制Wnt信号通路调节Runx2，揭示了ECH1-Wnt5a/Ca在CAVD中的新机制 | 研究主要通过体外和体内实验进行，缺乏临床试验数据 | 探讨ECH1在钙化主动脉瓣疾病中的治疗潜力和机制 | 研究对象为主动脉瓣间质细胞及ApoE小鼠模型 | 数字病理 | 钙化主动脉瓣 | 单细胞测序 | ApoE小鼠模型 | 生物样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-08-05 |
Tumour-associated myeloid cells expressing IL-10R2/IL-22R1 as a potential biomarker for diagnosis and recurrence of pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02676-w
PMID:38643339
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研究论文 | 本研究探讨了与胰腺导管腺癌（PDAC）相关的IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞作为早期预后生物标志物的潜力 | 发现IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞在PDAC及外周血中的存在，并且其与肿瘤进展有正相关，可能成为早期预后标志物 | 未明确讨论IL-10R2+/IL-22R1+细胞对其他类型肿瘤的普遍性应用 | 旨在评估IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞在胰腺导管腺癌中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 重点研究IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞在PDAC患者血液中的表达及其功能 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 血液样本（细胞） | 涉及小鼠模型及人类髓系细胞培养的样本，具体样本大小未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-05 |
Hypoxia inducible factor 2α promotes tolerogenic macrophage development during cardiac transplantation through transcriptional regulation of colony stimulating factor 1 receptor
2024-Jun-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2319623121
PMID:38889142
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研究论文 | 这篇文章探讨了低氧诱导因子2α(HIF-2α)在心脏移植过程中促进耐受性巨噬细胞发育的机制 | 文章首次揭示了HIF-2α作为耐受性单核细胞的关键转录因子，并与CSF1R的表达调控相联系 | 研究中使用的小鼠模型可能限制了结果在临床转化中的适用性 | 探讨介导移植耐受的不同因素 | 急性排斥或耐受性的心脏同种异体移植物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及急性拒绝或耐受心脏同种异体移植物的样本数量未指定 | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis
2024-Jun-20, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.06.008
PMID:38908487
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研究论文 | 本研究构建了小鼠胰腺导管树的单细胞图谱，识别了具有潜在胰腺再生和外分泌病理学影响的新细胞群体 | 首次识别出15种新型胰腺导管细胞群体及其在胰腺再生和外分泌病理中的潜在作用 | 尚未在体内进一步验证这些新细胞群体的特定功能 | 旨在全面表征小鼠胰腺导管的单细胞异质性及其在再生和病理中的作用 | 研究对象包括小鼠胰腺的导管细胞和胰腺肿瘤样本 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 包括健康胰腺、慢性胰腺炎和肿瘤样本的多个细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-08-05 |
Patho-transcriptomic analysis of invasive mucinous adenocarcinoma of the lung (IMA): comparison with lung adenocarcinoma with signet ring cell features (SRCC)
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598839
PMID:38948839
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研究论文 | 该论文分析了侵袭性粘液腺癌（IMA）与具有印戒细胞特征的肺腺癌（SRCC）之间的病理转录组学比较。 | 通过Visium空间转录组学方法揭示了IMA和SRCC中存在的六种不同细胞簇，并识别了各自特征性基因的表达差异。 | 缺乏有效治疗IMA的措施，且在无法进行手术切除的情况下，研究重点可能受限于分子机制的完整性。 | 研究侵袭性粘液腺癌的分子机制及其与印戒细胞特征肺腺癌的差异。 | 侵袭性粘液腺癌（IMA）和具有印戒细胞特征的肺腺癌（SRCC）。 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 分析了两种腺癌类型的不同细胞群体，具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-05 |
Tissue fibroblasts are versatile immune regulators: An evaluation of their impact on the aging process
2024-06, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102296
PMID:38588867
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research paper | 本文章探讨了成纤维细胞作为免疫调节剂在老化过程中的作用 | 揭示了成纤维细胞在组织免疫和炎症中的多种功能及其在老化过程中的重要性 | 未明确提及具体的实验数据和样本量 | 探究成纤维细胞与免疫细胞在衰老过程中的相互作用 | 老化组织中分离的成纤维细胞 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组研究 | NA | 基因表达数据 | 来自老化组织的成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |