单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 544 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-04 |
Mapping the immune cell landscape of severe atopic dermatitis by single-cell RNA-seq
2024-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16121
PMID:38817208
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了严重特应性皮炎患者的免疫细胞景观 | 本研究揭示了严重特应性皮炎中内源性免疫细胞的显著变化，尤其是与疾病严重程度相关的特定免疫细胞亚群 | 需进一步研究这些免疫细胞变化对疾病发病机制的影响以及潜在治疗靶点的有效性 | 分析严重特应性皮炎（AD）患者全身免疫景观的综合特征 | 来自12名严重特应性皮炎患者和6名健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名严重AD患者和6名健康对照者，分析超过30万个外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-04 |
scHolography: a computational method for single-cell spatial neighborhood reconstruction and analysis
2024-06-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03299-3
PMID:38915088
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scHolography的方法，该方法用于重建单细胞空间邻域并进行分析 | 提出了一种基于机器学习的方法，用于重构单细胞的空间邻域并促进3D组织可视化 | NA | 旨在提高对组织复杂性，特别是在单细胞分辨率下的组织结构分析 | 研究对象包括人类和小鼠的空间转录组学数据 | 数字病理学 | 肿瘤免疫微环境 | 空间转录组测序和单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 人类和小鼠的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics analysis identifies a tumor-promoting function of the meningeal stroma in melanoma leptomeningeal disease
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101606
PMID:38866016
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研究论文 | 该文章研究了脑膜病中的肿瘤微环境，揭示了脑膜基质在黑色素瘤脑膜病中的肿瘤促进作用 | 文章创新性地确定了脑膜基质在黑色素瘤脑膜病中的肿瘤促进作用，并提供了克服微环境介导的药物抵抗的机制 | 样本数量有限，仅包含两个患者的九个临床标本 | 探讨黑色素瘤脑膜病的肿瘤微环境及其与基质的相互作用 | 研究对象为黑色素瘤脑膜病及与之匹配的额外颅外转移组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 两名患者的九个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-04 |
Glycoengineering-based anti-PD-1-iRGD peptide conjugate boosts antitumor efficacy through T cell engagement
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101590
PMID:38843844
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研究论文 | 该文章介绍了一种通过糖工程方法合成的抗PD-1-iRGD肽共轭物，能够增强抗肿瘤效能 | 通过双重靶向同时激活肿瘤细胞和PD-1 T细胞，实现肿瘤特异性T细胞激活和增殖，具有创新性 | 在研究中没有提及具体的临床应用或长期安全性评估 | 研究目标是提升肿瘤免疫治疗的效果 | 主要研究对象为抗PD-1-iRGD肽共轭物及其在小鼠模型中的应用 | 肿瘤学 | 癌症 | 糖工程 | NA | 流式细胞术和单细胞RNA-seq数据 | 在多个同系小鼠模型中进行了实验 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-04 |
Single-cell multiomics profiling reveals heterogeneous transcriptional programs and microenvironment in DSRCTs
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101582
PMID:38781959
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研究论文 | 本研究揭示了DSRCT肿瘤细胞的异质转录程序和微环境特征 | 首次利用单细胞多组学分析展示了DSRCT细胞在转录程序上的多样性及其与微环境的关系 | 样本数量有限，仅研究了五位患者的12个样本，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨DSRCT肿瘤细胞的转录程序多样性及其微环境影响 | 对DSRCT患者的肿瘤细胞进行单细胞多组学分析 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞多组学 | NA | 转录组数据 | 来自五位患者的12个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-08-04 |
Distinctive multicellular immunosuppressive hubs confer different intervention strategies for left- and right-sided colon cancers
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101589
PMID:38806057
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研究论文 | 本文探讨了左侧和右侧结肠癌的免疫抑制特征和干预策略的差异 | 提出了左侧和右侧结肠癌特定的转录组表达元程序，揭示了其独特的细胞相互作用 | 研究可能未考虑所有潜在的肿瘤微环境因素的影响 | 研究左侧和右侧结肠癌在临床和分子特征上的差异 | 分析了来自105名结肠癌患者的426,863个单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自105名结肠癌患者的426,863个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-08-05 |
Venetoclax acts as an immunometabolic modulator to potentiate adoptive NK cell immunotherapy against leukemia
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101580
PMID:38776913
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研究论文 | 这篇文章报告了venetoclax作为免疫代谢调节剂的作用，通过增强NK细胞对急性髓性白血病的细胞毒性来提升NK细胞免疫疗法的效果 | 发现venetoclax不仅抑制BCL-2，还能激活NK细胞并提高其对AML细胞的亲和力 | 未足够探讨venetoclax在不同类型肿瘤中的应用和长期效果 | 研究venetoclax如何通过调节NK细胞功能来增强癌症免疫疗法的效果 | NK细胞和急性髓性白血病(AML)细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | bulk和单细胞RNA测序，亲和力测量和功能测试 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-05 |
scRank infers drug-responsive cell types from untreated scRNA-seq data using a target-perturbed gene regulatory network
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101568
PMID:38754419
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研究论文 | 本文介绍了scRank，它通过未处理的单细胞转录组数据推断药物响应性细胞类型 | 创新性地采用目标扰动基因调控网络，通过 in silico 药物扰动排名药物响应性细胞群体 | 未提及具体的模型限制 | 旨在识别药物响应性细胞群体以阐明药物作用机制 | 药物响应性细胞类型以及其在不同疾病中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤，重度抑郁障碍，心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 未处理的单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实数据集，包括脑瘤和重度抑郁障碍的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-08-05 |
GENIX enables comparative network analysis of single-cell RNA sequencing to reveal signatures of therapeutic interventions
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100794
PMID:38861988
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研究论文 | 该文章介绍了GENIX，这一计算框架超越了差异表达分析，能够构建基因关联网络并识别拓扑特征基因 | GENIX能够识别经典差异表达分析遗漏的特征基因，扩展了精准医疗中的目标基因发现范围 | 可能未提及具体的算法细节和真实数据集限制 | 研究单细胞RNA测序对治疗干预的细胞反应的理解 | 利用GENIX分析合成和实验数据集，包括从康复COVID-19患者的外周血单核细胞中分析流感疫苗诱导的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络模型 | 数据集 | 使用合成和实验数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-05 |
ScHGSC-IGDC: Identifying genes with differential correlations of high-grade serous ovarian cancer based on single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32909
PMID:38975079
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析确定了高等级浆液性卵巢癌中的差异关联基因 | 提出了ScHGSC-IGDC框架，以识别HGSC发展中的核心基因，并通过分析找到34个模块的基因互作网络 | 未在更广泛的人群中验证结果的普适性 | 旨在通过HGSC的scRNA-seq数据分析识别正常与肿瘤状态之间的差异关联核心基因 | 高等级浆液性卵巢癌患者的肿瘤及其相邻正常组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及的人类卵巢癌细胞系和组织样本未具体说明数量 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-08-04 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals a dystrophic trajectory following a developmental bifurcation of myoblast cell fates in facioscapulohumeral muscular dystrophy
2024-06-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278717.123
PMID:38777608
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研究论文 | 这篇文章使用单细胞空间转录组学揭示了面肩肱肌营养不良症中肌母细胞命运发育分叉后的退化轨迹 | 本文使用多重错误稳健荧光原位杂交技术实现了对多核肌管转录组的高分辨率分析 | 单细胞或细胞核RNA测序无法充分捕捉多核大肌管的转录组 | 研究面肩肱肌营养不良症（FSHD）中肌母细胞分化过程中的转录组变化 | 研究对象为健康对照、同源D4Z4收缩突变体和FSHD患者样本中的体外分化肌管及未融合单核细胞 | 数字病理学 | 面肩肱肌营养不良症 | 多重错误稳健荧光原位杂交（MERFISH） | NA | RNA转录本 | 包括控制组、同源突变体和FSHD患者样本的多个肌管和单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional profile of CD34+ hematopoietic progenitor cells from del(5q) myelodysplastic syndromes and impact of lenalidomide
2024-Jun-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49529-x
PMID:38902243
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研究论文 | 本研究揭示了del(5q)骨髓增生异常综合症患者CD34+造血祖细胞的转录组变化及其对来那度胺治疗的影响 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了del(5q) MDS中存在的转录改变及其潜在的治疗影响 | 本研究未探讨其他可能的致病机制和较大样本的验证 | 阐明del(5q) MDS的转录变化及其影响来那度胺治疗的机制 | del(5q) MDS患者的CD34+造血祖细胞 | 数字病理学 | 骨髓增生异常综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自del(5q) MDS患者的CD34+细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-05 |
Distinct pulmonary and systemic effects of dexamethasone in severe COVID-19
2024-Jun-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49756-2
PMID:38942804
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研究论文 | 本研究探讨了地塞米松在重症COVID-19患者中对肺部和全身免疫细胞的影响 | 揭示了地塞米松在不同细胞区室中的特异性作用及其潜在机制 | 未提及特定的限制条件NA | 研究地塞米松在重症COVID-19患者中的免疫学效应及机制 | 重症COVID-19患者的下呼吸道和血液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | 无 | 血液样本和下呼吸道样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-05 |
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2024-Jun-24, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202502
PMID:38912572
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研究论文 | 该研究定义了胚胎eCNm的分子亚域并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元中的保守作用 | 首次使用scRNA-seq和空间表达分析定义了胚胎eCNm的分子亚域，并描述了它们的发育过程 | 未涉及其他小脑核团的发育机制和影响 | 研究胚胎小脑兴奋性神经元的分子多样性及其生存机制 | 胚胎小脑中间核的兴奋性神经元及其分子亚域 | 数字病理 | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-05 |
Machine learning integrative approaches to advance computational immunology
2024-06-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01350-3
PMID:38862979
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评论 | 这篇文章讨论了机器学习整合方法在计算免疫学中的应用。 | 文章强调了现代机器学习技术在整合多种‘组学’数据方面的创新能力，尤其是在单细胞和空间分析中的应用。 | 文章提到了一些整体方法的挑战，但具体的限制未详细说明 | 探讨机器学习整合技术如何推动免疫学研究的发展。 | 聚焦于免疫学领域内多层次数据集的整合分析。 | 计算免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-08-05 |
Mitochondrial Oxidative Stress Regulates FOXP3+ T-Cell Activity and CD4-Mediated Inflammation in Older Adults with Frailty
2024-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25116235
PMID:38892421
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研究论文 | 本研究阐明了衰弱老年人CD4/Treg轴的复杂免疫动力学 | 首次揭示了衰弱老年人Treg细胞亚群及其转录组特征与CD4 T细胞反应失调之间的关系 | 当前研究主要比较年轻和老年人群，未充分考虑健康老年人与经历病理衰老者之间的差异 | 研究衰弱老年人中CD4/Treg轴的免疫调节机制 | 衰弱老年人及其与同龄健康老年人的比较 | 数字病理学 | 衰弱 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用公开的外周血单核细胞数据进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-05 |
Tumor suppressive role of the epigenetic master regulator BRD3 in colorectal cancer
2024-Jun, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16129
PMID:38494600
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研究论文 | 本研究探讨了BET家族蛋白BRD3在结直肠癌中的肿瘤抑制作用 | 首次展示了BRD3通过诱导p21表达抑制细胞周期并抑制肿瘤生长的作用 | 未讨论BRD3以外的其他BET家族成员在结直肠癌中的作用 | 研究BRD3在结直肠癌（CRC）中的功能角色 | 结直肠癌细胞及临床样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化分析 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of immune cells from the coronary sinus reveals immune mechanisms of the progression of persistent atrial fibrillation
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110127
PMID:38966571
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研究论文 | 该文章探讨了来自冠状窦的免疫细胞在持续性心房颤动进程中的作用 | 首次通过单细胞测序揭示了持续性心房颤动患者冠状窦中免疫细胞的异质性及其与心房颤动复发的相关性 | 研究未明确提及样本量及潜在的临床应用限制 | 探索免疫细胞在持续性心房颤动进展中的作用及机制 | 持续性心房颤动患者的冠状窦免疫细胞 | 数字病理学 | 心房颤动 | 单细胞测序 | NA | 免疫细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-08-04 |
An integrated single-cell RNA-seq map of human neuroblastoma tumors and preclinical models uncovers divergent mesenchymal-like gene expression programs
2024-06-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03309-4
PMID:38898465
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研究论文 | 本研究生成了神经母细胞瘤细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的单细胞RNA-seq图谱 | 提出了一种无监督机器学习方法(acNMF)来比较临床与前临床模型中的基因表达程序 | 未详细研究弱表达的间充质样基因表达与药物耐受机制之间的关系 | 更好地理解患者肿瘤异质性与前临床模型之间的关系 | 聚焦于神经母细胞瘤细胞系及其前临床模型的基因表达程序 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | 无监督机器学习模型 | 基因表达数据 | 涉及多种细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-04 |
Advances in single-cell long-read sequencing technologies
2024-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae047
PMID:38774511
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综述 | 本文讨论了单细胞长读长测序技术的最新进展 | 提供了针对细胞复杂性来源的新见解，并强调了单细胞RNA异构体测序(scRiso-seq)的显著进展 | 主要集中在下游分析的实际考虑和操作挑战上 | 探讨单细胞测序技术在转录组和基因组研究中的应用 | 长读长测序技术在单细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | RNA和DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |