单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 563 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human blood eosinophils reveals plasticity and absence of canonical cell subsets
2024-Jun-27, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16213
PMID:38934897
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics combined with single-nucleus RNA sequencing reveals glial cell heterogeneity in the human spinal cord
2024-Jun-26, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-01876
PMID:38934400
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单核RNA测序揭示了人类脊髓中胶质细胞的异质性 | 通过结合高通量单核RNA测序和空间转录组学，首次系统地映射了人类脊髓中胶质细胞的转录组特征 | 该研究较少涉及其他物种的比较以及功能研究 | 探讨人类脊髓中胶质细胞的转录组特征及其异质性 | 人类脊髓中的星形胶质细胞、小胶质细胞和髓鞘胶质细胞 | 数字病理学 | 慢性疼痛、肌萎缩侧索硬化症、多发性硬化症 | 高通量单核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration
2024-Jun-26, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-02083
PMID:38934409
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研究论文 | 这项研究使用单细胞RNA测序探讨了斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞和穆勒胶质细胞的细胞异质性和相互作用 | 首次揭示了斑马鱼视网膜再生中免疫细胞与穆勒胶质细胞之间的广泛交互及其异质性 | 该研究主要基于斑马鱼模型，结果可能不完全适用于哺乳动物 | 探究免疫细胞和穆勒胶质细胞在斑马鱼视网膜再生中的作用 | 斑马鱼视网膜中的穆勒胶质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 344 | 2024-08-05 |
Longitudinal single-cell data informs deterministic modelling of inflammatory bowel disease
2024-Jun-24, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00395-9
PMID:38914538
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研究论文 | 本研究探讨如何利用纵向单细胞数据进行炎症性肠病的确定性建模 | 提出了利用ODE模型定量描述免疫动态的新方法，并验证了细胞周转率与生物过程之间的关系 | 模型的验证主要依赖于小鼠实验，可能不完全适用于人类 | 旨在通过数学建模深入理解炎症性肠病中的免疫动态 | 研究小鼠结肠炎中的细胞变化与人类炎症性肠病患者的数据 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 常微分方程(ODE) | 细胞计数数据和基因表达数据 | 涉及小鼠结肠炎模型和人类IBD患者的统一数据 |
| 345 | 2024-08-04 |
Advances in spatial transcriptomics and its applications in cancer research
2024-Jun-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02040-9
PMID:38902727
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研究论文 | 本文总结了空间转录组技术的发展及其在癌症研究中的应用 | 本研究通过空间转录组技术能够实现基因表达的空间上下文量化与可视化，提供了比传统转录组更多的信息 | 目前的空间转录组方法存在一些局限性和挑战 | 探讨空间转录组技术在癌症研究中的应用及其未来发展方向 | 癌症相关的转录组数据及其空间表达 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 346 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing revealed the role of the Th17 pathway in the development of anti- human leukocyte antigen antibodies in a highly sensitized mouse model
2024-Jun-13, Kidney research and clinical practice
IF:2.9Q1
DOI:10.23876/j.krcp.23.317
PMID:38934039
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了人类白细胞抗原（HLA）敏化过程中Th17通路的角色。 | 首次揭示了Th17细胞及其细胞因子在HLA敏化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类生理 | 探究在人类白细胞抗原敏化中涉及的特定通路 | 使用HLA.A2转基因小鼠开发的异体敏化小鼠模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 分别从ALLO和SYN生成9190和8890个单细胞转录组 |
| 347 | 2024-08-04 |
Hierarchically Assembled Nanofiber Scaffold Guides Long Bone Regeneration by Promoting Osteogenic/Chondrogenic Differentiation of Endogenous Mesenchymal Stem Cells
2024-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202309868
PMID:38259052
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研究论文 | 该文章探讨了一种分层组装的纳米纤维支架在促进内源性间充质干细胞向骨细胞和软骨细胞分化方面的作用，从而指导长骨再生 | 文章中开发的三维垂直排列纳米纤维支架(VAS)具有长通道和大孔径，能够有效招募骨髓间充质干细胞(BMSCs)并促进其分化 | 该研究主要在体内进行，尚需进一步临床验证以确认其有效性 | 研究的目的是开发一种新型的支架以促进长骨的再生 | 研究的对象是使用禾本科（BMSCs）在损伤骨骼修复中的作用 | 数字病理学 | 骨折相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 体内数据 | 在4和8周植入后对比实验组和胶原蛋白组进行了评估 |
| 348 | 2024-08-05 |
IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice
2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320800
PMID:38695167
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的动脉粥样硬化逆转的影响 | 本研究首次揭示了IL-1β在饮食诱导动脉粥样硬化中的重要作用和机制 | 研究仅在阿泡蛋白E缺失小鼠模型中进行，可能影响结果的普适性 | 研究饮食改变对动脉粥样硬化病变性质和稳定性的影响 | 使用Apoe-/-小鼠模型来观察饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 心血管病学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫染色，高分辨率共聚焦显微镜分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠18只 |
| 349 | 2024-08-05 |
Vanin-2 is expressed in peripheral blood T cells and upregulated in SLE patients
2024-Jun-26, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae145
PMID:38920355
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研究论文 | 该研究探讨了Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的表达及其在系统性红斑狼疮(SLE)患者中的上调情况 | 发现Vanin-2在T细胞中的独特表达，并与SLE患者T细胞功能变化相关 | 研究中未探讨其他vanin家族成员在T细胞中的作用 | 阐明Vanin-2在外周血T淋巴细胞中的重要性 | 外周血T淋巴细胞及其在SLE患者中的表达 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，西方印迹 | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-04 |
Long-read single-cell sequencing reveals the transcriptional landscape of spermatogenesis in obstructive azoospermia and Sertoli cell-only patients
2024-Jun-25, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcae009
PMID:38192002
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研究论文 | 本研究展示了阻塞性无精症和仅有塞尔托利细胞患者中生精过程的长读转录组特征 | 首次利用PacBio长读测序揭示了人类生精过程中的新转录本和新基因 | 研究样本量较小，仅限于患者的睾丸活检样本 | 揭示阻塞性无精症患者中生精的转录组特征 | 阻塞性无精症和非阻塞性无精症患者的睾丸细胞 | 数字病理学 | 生育不孕 | PacBio长读单细胞测序 | NA | 转录组数据 | OA患者3个样本，NOA患者3个样本 |
| 351 | 2024-08-05 |
SCTC: inference of developmental potential from single-cell transcriptional complexity
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae340
PMID:38709881
|
研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞转录复杂性指标(SCTC)，用于更准确地推断单细胞的发育潜力。 | 引入了经济复杂性理论的见解，以改进对单细胞发育潜力的测量，比现有指标SCTD更精确。 | 在某些情况下，G表达并不会单调减少，这可能影响现有发育潜力估计的准确性。 | 研究单细胞分析中发育潜力的推断及伪时间重建方法。 | 关注单细胞转录组数据，这些数据能够提供细胞的发育潜力信息。 | 数字病理 | NA | scRNA-Seq | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-05 |
GRACE: Unveiling Gene Regulatory Networks With Causal Mechanistic Graph Neural Networks in Single-Cell RNA-Sequencing Data
2024-Jun-19, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2024.3412753
PMID:38896510
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新颖的基于图的因果自编码框架GRACE，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 将结构因果模型与图神经网络结合，以促进基因间因果关系的推理和基因调控网络的推断 | 未提及具体的局限性 | 重建基因调控网络以揭示细胞命运发展和异质性 | 利用单细胞RNA测序数据进行基因调控网络推断 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 在七个基准上进行广泛评估，应用于人外周血单核细胞样本 |
| 353 | 2024-08-05 |
Glutamatergic neuronal activity regulates angiogenesis and blood-retinal barrier maturation via Norrin/β-catenin signaling
2024-Jun-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.011
PMID:38599212
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研究论文 | 本研究揭示了谷氨酸能神经元活动通过调节内皮Norrin/β-连环蛋白信号通路来调控视网膜血管生成和血-retinal屏障的成熟 | 研究首次表明谷氨酸能活动在视网膜血管生成和血-retinal屏障成熟中扮演重要角色 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类 | 探讨谷氨酸能神经元活动如何调控视网膜血管生成和血-retinal屏障成熟 | 小鼠视网膜中的神经元和血管内皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和药理学激活 | NA | 基因组数据和功能验证结果 | 使用了若干小鼠视网膜样本 |
| 354 | 2024-08-05 |
MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing
2024-Jun-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06775-7
PMID:38866777
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研究论文 | 本研究揭示了MAL2如何通过EGFR/SREBP-1通路重编程肝内胆管癌中的脂质代谢 | 发现MAL2在肝内胆管癌中的特异富集及其通过EGFR稳定膜定位来促进脂质积累的机制 | 本研究的局限性在于未能完全阐明MAL2与EGFR之间的所有可能交互作用 | 研究MAL2在肝内胆管癌中的作用及其机制 | 研究对象为肝内胆管癌细胞及其相关的细胞系和类器官 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | scRNA-seq，转录组学和代谢组学分析 | NA | NA | 涉及的样本数量及类型未明确说明 |
| 355 | 2024-08-05 |
Lysine acetyltransferase 14 mediates TGF-β-induced fibrosis in ovarian endometrioma via co-operation with serum response factor
2024-Jun-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05243-2
PMID:38867256
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研究论文 | 这篇文章探讨了赖氨酸乙酰转移酶14在TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿纤维化中的作用 | 揭示了KAT14通过与血清反应因子SRF的合作，促进组蛋白H4乙酰化并增加ECM生成的机制 | 尚未深入探讨KAT14在其他类型内膜异位症中的作用及其潜在临床应用 | 研究TGF-β诱导的卵巢内膜囊肿相关纤维化的分子机制 | 研究对象为卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类内膜间质细胞 | 数字病理学 | 卵巢内膜囊肿 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本，细胞系 | 涉及卵巢内膜囊肿患者的内膜活检样本及人类间质细胞 |
| 356 | 2024-08-05 |
Senescence of human pancreatic beta cells enhances functional maturation through chromatin reorganization and promotes interferon responsiveness
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae313
PMID:38682582
|
研究论文 | 这篇文章研究了人类胰腺β细胞的衰老如何通过染色质重组增强功能成熟并促进干扰素反应性 | 揭示了人类β细胞衰老如何通过染色质驱动的功能成熟程序上调以及干扰素刺激基因的反应性增加 | 未明确探讨衰老β细胞在体内的具体生理影响 | 探讨人类胰腺β细胞衰老对胰岛素分泌的影响及其机制 | 成年人的胰腺β细胞，尤其是表达p16的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA | 成年人胰腺β细胞的单细胞转录组数据集 |
| 357 | 2024-08-04 |
Protocol to detect immune levels, abnormal metabolism, and signaling pathways in tumor tissue based on scRNA-seq obtained from patient databases
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103065
PMID:38753488
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研究论文 | 本文介绍了一种评估肿瘤组织中的免疫水平、异常代谢和信号通路的协议 | 创新性地基于患者数据库的单细胞测序来评估肿瘤免疫微环境和代谢途径 | 未提及具体的样本量和可能的实验限制 | 研究肿瘤组织中的免疫微环境及其代谢特征 | 基于单细胞测序的数据来分析肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-04 |
Protocol for high-quality single-cell RNA-seq from tissue sections with DRaqL
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103050
PMID:38703368
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研究论文 | 本文介绍了用于从组织切片中提取高质量单细胞RNA测序的详细协议 | 开发了结合DRaqL和Smart-seq2的新协议，以提高从酒精固定小鼠卵巢切片中获得的单细胞RNA测序的质量 | 未提及具体样本数量和适用场景的限制 | 研究旨在提供一种高效的单细胞RNA测序方法 | 研究对象为酒精固定的小鼠卵巢切片中的单细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 359 | 2024-08-04 |
Protocol for preparing formalin-fixed paraffin-embedded musculoskeletal tissue samples from mice for spatial transcriptomics
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102986
PMID:38555590
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研究论文 | 本研究提供了一种用于小鼠肌肉骨骼组织固定石蜡包埋样本的空间转录组学的制备方案 | 本方案详细描述了组织收集、样本制备、石蜡嵌入等步骤的创新性方法 | 该协议的完整执行时间长达18天，且对矿化组织的脱钙要求超过50%的时间 | 研究目的在于为小鼠骨骼及多组织肌肉骨骼样本提供标准化的空间转录组学处理方法 | 研究对象为固定石蜡包埋的小鼠肌肉骨骼组织样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 小鼠的股骨及相邻肌肉样本 |
| 360 | 2024-08-05 |
GoT-Splice protocol for multi-omics profiling of gene expression, cell-surface proteins, mutational status, and RNA splicing in human cells
2024-Jun-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102966
PMID:38512867
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研究论文 | 本文介绍了GoT-Splice协议用于对人类细胞中基因表达、细胞表面蛋白、突变状态和RNA剪接进行多组学分析 | 该协议结合了GoT和增强的单细胞转录组及细胞表面蛋白质组分析，克服了区分野生型和突变细胞的挑战 | 仍然需要处理复杂人类组织中的细胞变异和短读片测序数据带来的重构剪接信号的不准确性 | 研究RNA剪接因子突变及其在细胞中的表现 | 人类细胞中的基因表达和细胞表面蛋白 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | 转录组数据和蛋白质组数据 | NA |