单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 553 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-05 |
Single-cell phylotranscriptomics of developmental and cell type evolution
2024-Jun, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.02.005
PMID:38490933
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研究论文 | 单细胞进化转录组学作为一种新兴工具，揭示了进化的分子和细胞机制 | 首次分析了发育过程中转录组年龄的异质性，并识别了驱动整体生物体温沙形态的谱系和组织 | 没有提及具体的技术限制或实验范围 | 探索发育与细胞类型进化的分子机制 | 研究不同谱系和组织在整个发育过程中的转录组变化 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 342 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of human oocytes reveals a differential transcriptomic profile associated with agar-like zona pellucida
2024-Jun-26, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01463-8
PMID:38926883
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研究论文 | 该文章探讨了具有琼脂样透明带的单个细胞卵母细胞的转录组特征 | 揭示了与琼脂样透明带相关的分子机制及其涉及的差异表达基因 | 研究样本数量较少，仅涉及四名患者和四名健康供体 | 阐明琼脂样透明带的分子机制及其对卵母细胞的影响 | 琼脂样透明带卵母细胞与健康卵母细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个卵母细胞样本（四个琼脂样透明带患者和四个健康供体） |
| 343 | 2024-08-07 |
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-Jun-26, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2652-y
PMID:38940831
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-05 |
Pan-cancer multi-omics analysis of PTBP1 reveals it as an inflammatory, progressive and prognostic marker in glioma
2024-06-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64979-5
PMID:38918441
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研究论文 | 本研究分析了PTBP1在胶质瘤中的炎症、进展和预后标志物的角色。 | 揭示了PTBP1在多种癌症中的表达、甲基化与预后之间的关系，并首次将其作为胶质瘤的标志物。 | 尚不清楚PTBP1表达与肿瘤微环境的具体关系。 | 探讨PTBP1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力。 | PTBP1在不同癌症类型中的表达与甲基化模式。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 基因集合富集分析（GSEA），单细胞转录组分析，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据，甲基化数据 | 使用了多种数据集，包括TCGA、GTEx和CGGA |
| 345 | 2024-08-05 |
Insight into Fructose-to-Sucrose Ratio as the Potential Target of Urinalysis in Bladder Cancer
2024-Jun-20, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14060345
PMID:38921479
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研究论文 | 本文探讨了尿液中果糖与蔗糖比作为膀胱癌尿液分析的潜在目标 | 研究首次揭示了尿液中果糖与蔗糖比与膀胱癌风险之间的双向负因果关系 | 研究主要依赖于动物模型，可能无法完全反映人类膀胱癌的复杂性 | 研究膀胱癌中可操作的非侵入性筛查生物标志物 | 膀胱癌相关的尿液代谢物及其与膀胱癌风险的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, Mendelian随机化分析 | BBN诱导的小鼠模型 | 生物标志物数据 | 使用BBN诱导的小鼠模型进行验证的样本 |
| 346 | 2024-08-05 |
Identification of therapeutic targets and medicines for comorbid Crohn's disease and rheumatoid arthritis: A comprehensive analysis
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32406
PMID:38933947
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研究论文 | 本研究旨在识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的潜在治疗靶点和药物 | 本研究运用单细胞RNA测序和孟德尔随机化等新方法来识别共患疾病的关键免疫细胞及其靶点 | 未提及研究的具体局限性 | 识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的治疗靶点和潜在药物 | 共患克罗恩病和类风湿关节炎的患者的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 克罗恩病/类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 文本 | 纳入共患克罗恩病和类风湿关节炎患者的PBMC样本 |
| 347 | 2024-08-04 |
GSK3β and UCHL3 govern RIPK4 homeostasis via deubiquitination to enhance tumor metastasis in ovarian cancer
2024-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03040-1
PMID:38664501
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研究论文 | 这项研究揭示了GSK3β和UCHL3在卵巢癌中通过去 ubiquitination 维持 RIPK4 稳定性并增强肿瘤转移的重要作用 | 本研究首次揭示了GSK3β诱导的RIPK4磷酸化如何增强其与UCHL3的相互作用，从而提高RIPK4的去 ubiquitination 和稳定性 | 该研究主要集中于体外和体内模型，临床验证尚需进一步研究 | 研究 RIPK4 在卵巢癌发展中的作用及其调控机制 | 研究主要对象为卵巢癌组织及细胞，重点关注RIPK4、UCHL3和GSK3β的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 348 | 2024-08-04 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
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研究论文 | 开发了一个基于单细胞转录组学的计算管道PERCEPTION，用于预测患者对治疗的反应和抵抗 | 提出了一种新的精准肿瘤治疗计划工具，能够基于单细胞转录组数据预测患者的治疗反应 | 尚未提及任何特定的局限性 | 提升个体癌症患者最佳治疗方案的制定 | 肿瘤患者的单细胞转录组数据 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | 未提供 | 转录组数据 | 在多发性骨髓瘤和乳腺癌的两个临床试验中使用了患者源的初级细胞 |
| 349 | 2024-08-04 |
Evidences of neurological injury caused by COVID-19 from glioma tissues and glioma organoids
2024-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14822
PMID:38923860
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19对神经系统的损伤，并通过胶质瘤组织和胶质瘤类器官的分析提供了证据 | 首次揭示了胶质瘤组织对SARS-CoV-2的易感性以及其对COVID-19相关神经症状的代表性 | 缺乏对SARS-CoV-2入侵中枢神经系统精确机制的深入研究 | 研究COVID-19对神经系统的影响及其机制 | 胶质瘤患者的组织样本和胶质瘤类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、空间转录组分析 | NA | 组织样本、类器官 | 胶质瘤患者的组织样本及其类器官数据 |
| 350 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02255-1
PMID:38724673
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研究论文 | 本研究揭示了AML/T细胞相互作用对患者结果的相关性及ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用 | 该研究首次揭示了ICAM1作为免疫触发因子在小鼠体内T细胞杀死AML细胞中的作用 | 研究主要集中于AML样本与T细胞的体外相互作用，可能未能全面反映整体免疫环境 | 探讨AML患者对T细胞杀伤的敏感性及其相互作用的分子机制 | AML细胞样本与人源工程化的CD4 T细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 多个AML患者样本和CD4 T细胞的组合 |
| 351 | 2024-08-04 |
Beyond the marrow: insights from comprehensive next-generation sequencing of extramedullary multiple myeloma tumors
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02206-w
PMID:38493239
|
研究论文 | 此研究对外髓性多发性骨髓瘤（EMM）肿瘤进行了全面的下一代测序分析 | 首次揭示EMM的肿瘤微环境，识别关键的分子特征和潜在的治疗靶点 | 样本规模相对较小，仅有14个样本 | 探讨EMM肿瘤的分子特征和开发有效的治疗策略 | 外髓性多发性骨髓瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序（NGS） | NA | 肿瘤样本 | 14个样本 |
| 352 | 2024-08-05 |
Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308384
PMID:38634607
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研究论文 | 本研究探讨了渗透压胁迫对拟南芥根尖发育的影响，使用单细胞层面的转录调控网络分析 | 首次在单细胞层面重建了相应的转录调控网络，并捕捉到12,968个单细胞的基因和染色质可及性之间的联系 | 数据整合的准确性仍然是个挑战，尤其是在调查特定细胞类型的转录调控网络时 | 研究拟南芥在渗透压胁迫下的根尖发育机制 | 16,670个拟南芥根尖细胞核 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | 16,670个根尖细胞核 |
| 353 | 2024-08-05 |
Recapitulation of Perturbed Striatal Gene Expression Dynamics of Donors' Brains With Ventral Forebrain Organoids Derived From the Same Individuals With Schizophrenia
2024-Jun-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220723
PMID:37915216
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研究论文 | 本研究通过从精神分裂症患者及神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官探索与精神分裂症相关的纹状体发育变化 | 提出了一种从精神分裂症患者的诱导多能干细胞生成腹侧前脑类器官的方法，并揭示了精神分裂症患者细胞在发育轨迹上的差异 | 研究样本量较小，仅限于四名精神分裂症患者和四名神经正常对照者 | 探索与精神分裂症相关的纹状体神经发育改变 | 来自精神分裂症患者和神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 诱导多能干细胞(IPS细胞)差异化 | 腹侧前脑类器官(VFO) | 单细胞RNA测序 | 四名精神分裂症患者及四名神经正常对照者 |
| 354 | 2024-08-05 |
Amelioration of NAFLD by sleeve gastrectomy-triggered hepatocyte regeneration in mice - experimental research
2024-Jun-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001387
PMID:38573134
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研究论文 | 本研究探讨了袖状胃切除对小鼠非酒精性脂肪肝病的改善及其机制 | 首次揭示了袖状胃切除通过促进肝细胞再生来改善非酒精性脂肪肝病的机制 | 本研究主要基于小鼠模型，缺乏在人体中的验证 | 了解袖状胃切除改善代谢性疾病的潜在机制 | 采用饮食诱导的肥胖小鼠作为研究对象 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 实时定量逆转录PCR, Olink蛋白质组学 | NA | 图像, 生物样本 | 饮食诱导的肥胖小鼠 |
| 355 | 2024-08-05 |
A risk score based on polyamine metabolism and chemotherapy-related genes predicts prognosis and immune cells infiltration of lung adenocarcinoma
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18387
PMID:38924680
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研究论文 | 本文探讨了铂类治疗和多胺代谢相关基因是否能够预测肺腺癌的预后 | 建立了基于铂类治疗和多胺代谢的关键基因的风险评分模型，提供了新颖的预后预测角度 | 行政性缺乏大规模临床试验验证该风险评分模型的准确性 | 研究铂类治疗和多胺代谢基因在LUAD预后预测中的作用 | 与铂类治疗和多胺代谢相关的基因及其对免疫细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | 风险评分模型 | 基因表达数据 | NA |
| 356 | 2024-08-07 |
Using single-cell transcriptomics to predict which tumors will respond to targeted therapy
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00757-6
PMID:38684925
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-05 |
Longitudinal single-cell data informs deterministic modelling of inflammatory bowel disease
2024-Jun-24, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00395-9
PMID:38914538
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研究论文 | 本研究探讨如何利用纵向单细胞数据进行炎症性肠病的确定性建模 | 提出了利用ODE模型定量描述免疫动态的新方法，并验证了细胞周转率与生物过程之间的关系 | 模型的验证主要依赖于小鼠实验，可能不完全适用于人类 | 旨在通过数学建模深入理解炎症性肠病中的免疫动态 | 研究小鼠结肠炎中的细胞变化与人类炎症性肠病患者的数据 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 常微分方程(ODE) | 细胞计数数据和基因表达数据 | 涉及小鼠结肠炎模型和人类IBD患者的统一数据 |
| 358 | 2024-08-04 |
Advances in spatial transcriptomics and its applications in cancer research
2024-Jun-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02040-9
PMID:38902727
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研究论文 | 本文总结了空间转录组技术的发展及其在癌症研究中的应用 | 本研究通过空间转录组技术能够实现基因表达的空间上下文量化与可视化，提供了比传统转录组更多的信息 | 目前的空间转录组方法存在一些局限性和挑战 | 探讨空间转录组技术在癌症研究中的应用及其未来发展方向 | 癌症相关的转录组数据及其空间表达 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 359 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing revealed the role of the Th17 pathway in the development of anti- human leukocyte antigen antibodies in a highly sensitized mouse model
2024-Jun-13, Kidney research and clinical practice
IF:2.9Q1
DOI:10.23876/j.krcp.23.317
PMID:38934039
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了人类白细胞抗原（HLA）敏化过程中Th17通路的角色。 | 首次揭示了Th17细胞及其细胞因子在HLA敏化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类生理 | 探究在人类白细胞抗原敏化中涉及的特定通路 | 使用HLA.A2转基因小鼠开发的异体敏化小鼠模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 分别从ALLO和SYN生成9190和8890个单细胞转录组 |
| 360 | 2024-08-05 |
IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice
2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320800
PMID:38695167
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的动脉粥样硬化逆转的影响 | 本研究首次揭示了IL-1β在饮食诱导动脉粥样硬化中的重要作用和机制 | 研究仅在阿泡蛋白E缺失小鼠模型中进行，可能影响结果的普适性 | 研究饮食改变对动脉粥样硬化病变性质和稳定性的影响 | 使用Apoe-/-小鼠模型来观察饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 心血管病学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫染色，高分辨率共聚焦显微镜分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠18只 |