单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 543 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics in cancer research and potential clinical impact: a narrative review
2024-Jun-08, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05816-0
PMID:38850363
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综述 | 本综述总结了空间转录组学在癌症研究中的应用及其潜在临床影响 | 空间转录组学提供了肿瘤微环境的新见解，并能够捕捉肿瘤异质性和多灶性 | 缺乏针对临床应用中的空间信息整合的深度分析 | 探索空间转录组学在精准肿瘤学及肿瘤研究中的应用 | 主要关注固体肿瘤的现有空间转录组学研究 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学（ST） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-08-04 |
Endothelial cell signature in muscle stem cells validated by VEGFA-FLT1-AKT1 axis promoting survival of muscle stem cell
2024-Jun-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73592
PMID:38842166
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研究论文 | 该研究揭示了内皮细胞转录本在肌肉干细胞生存中的作用 | 本研究通过揭示肌肉干细胞行为如何受特定内皮细胞转录本影响，挑战了他们具有不同基因特征的传统观点 | 本研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类肌肉干细胞 | 探讨内皮细胞标记物在肌肉干细胞中的表达及其对存活的影响 | 成年肌肉干细胞及其与内皮细胞的信号通路的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠肌肉干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-04 |
Mapping the immune cell landscape of severe atopic dermatitis by single-cell RNA-seq
2024-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16121
PMID:38817208
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了严重特应性皮炎患者的免疫细胞景观 | 本研究揭示了严重特应性皮炎中内源性免疫细胞的显著变化，尤其是与疾病严重程度相关的特定免疫细胞亚群 | 需进一步研究这些免疫细胞变化对疾病发病机制的影响以及潜在治疗靶点的有效性 | 分析严重特应性皮炎（AD）患者全身免疫景观的综合特征 | 来自12名严重特应性皮炎患者和6名健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名严重AD患者和6名健康对照者，分析超过30万个外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2024-08-04 |
scHolography: a computational method for single-cell spatial neighborhood reconstruction and analysis
2024-06-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03299-3
PMID:38915088
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scHolography的方法，该方法用于重建单细胞空间邻域并进行分析 | 提出了一种基于机器学习的方法，用于重构单细胞的空间邻域并促进3D组织可视化 | NA | 旨在提高对组织复杂性，特别是在单细胞分辨率下的组织结构分析 | 研究对象包括人类和小鼠的空间转录组学数据 | 数字病理学 | 肿瘤免疫微环境 | 空间转录组测序和单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 人类和小鼠的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics analysis identifies a tumor-promoting function of the meningeal stroma in melanoma leptomeningeal disease
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101606
PMID:38866016
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研究论文 | 该文章研究了脑膜病中的肿瘤微环境，揭示了脑膜基质在黑色素瘤脑膜病中的肿瘤促进作用 | 文章创新性地确定了脑膜基质在黑色素瘤脑膜病中的肿瘤促进作用，并提供了克服微环境介导的药物抵抗的机制 | 样本数量有限，仅包含两个患者的九个临床标本 | 探讨黑色素瘤脑膜病的肿瘤微环境及其与基质的相互作用 | 研究对象为黑色素瘤脑膜病及与之匹配的额外颅外转移组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 两名患者的九个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-04 |
Glycoengineering-based anti-PD-1-iRGD peptide conjugate boosts antitumor efficacy through T cell engagement
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101590
PMID:38843844
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研究论文 | 该文章介绍了一种通过糖工程方法合成的抗PD-1-iRGD肽共轭物，能够增强抗肿瘤效能 | 通过双重靶向同时激活肿瘤细胞和PD-1 T细胞，实现肿瘤特异性T细胞激活和增殖，具有创新性 | 在研究中没有提及具体的临床应用或长期安全性评估 | 研究目标是提升肿瘤免疫治疗的效果 | 主要研究对象为抗PD-1-iRGD肽共轭物及其在小鼠模型中的应用 | 肿瘤学 | 癌症 | 糖工程 | NA | 流式细胞术和单细胞RNA-seq数据 | 在多个同系小鼠模型中进行了实验 | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-08-04 |
Single-cell multiomics profiling reveals heterogeneous transcriptional programs and microenvironment in DSRCTs
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101582
PMID:38781959
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研究论文 | 本研究揭示了DSRCT肿瘤细胞的异质转录程序和微环境特征 | 首次利用单细胞多组学分析展示了DSRCT细胞在转录程序上的多样性及其与微环境的关系 | 样本数量有限，仅研究了五位患者的12个样本，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨DSRCT肿瘤细胞的转录程序多样性及其微环境影响 | 对DSRCT患者的肿瘤细胞进行单细胞多组学分析 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞多组学 | NA | 转录组数据 | 来自五位患者的12个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-04 |
Distinctive multicellular immunosuppressive hubs confer different intervention strategies for left- and right-sided colon cancers
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101589
PMID:38806057
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研究论文 | 本文探讨了左侧和右侧结肠癌的免疫抑制特征和干预策略的差异 | 提出了左侧和右侧结肠癌特定的转录组表达元程序，揭示了其独特的细胞相互作用 | 研究可能未考虑所有潜在的肿瘤微环境因素的影响 | 研究左侧和右侧结肠癌在临床和分子特征上的差异 | 分析了来自105名结肠癌患者的426,863个单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自105名结肠癌患者的426,863个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2024-08-05 |
Venetoclax acts as an immunometabolic modulator to potentiate adoptive NK cell immunotherapy against leukemia
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101580
PMID:38776913
|
研究论文 | 这篇文章报告了venetoclax作为免疫代谢调节剂的作用，通过增强NK细胞对急性髓性白血病的细胞毒性来提升NK细胞免疫疗法的效果 | 发现venetoclax不仅抑制BCL-2，还能激活NK细胞并提高其对AML细胞的亲和力 | 未足够探讨venetoclax在不同类型肿瘤中的应用和长期效果 | 研究venetoclax如何通过调节NK细胞功能来增强癌症免疫疗法的效果 | NK细胞和急性髓性白血病(AML)细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | bulk和单细胞RNA测序，亲和力测量和功能测试 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-08-05 |
scRank infers drug-responsive cell types from untreated scRNA-seq data using a target-perturbed gene regulatory network
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101568
PMID:38754419
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研究论文 | 本文介绍了scRank，它通过未处理的单细胞转录组数据推断药物响应性细胞类型 | 创新性地采用目标扰动基因调控网络，通过 in silico 药物扰动排名药物响应性细胞群体 | 未提及具体的模型限制 | 旨在识别药物响应性细胞群体以阐明药物作用机制 | 药物响应性细胞类型以及其在不同疾病中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤，重度抑郁障碍，心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 未处理的单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实数据集，包括脑瘤和重度抑郁障碍的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-08-05 |
Single-cell signatures identify microenvironment factors in tumors associated with patient outcomes
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100799
PMID:38889686
|
研究论文 | 本文介绍了一种工具scBeacon，通过单细胞RNA测序数据识别肿瘤微环境因素与患者结果的关系 | 创新点在于通过整合和聚类多个单细胞RNA测序数据集提取细胞类型特征，进而解构无关肿瘤数据集 | 本文未提及具体的局限性 | 研究肿瘤及其微环境在患者生存和治疗反应中的作用 | 重点研究TCGA（癌症基因组图谱）队列中的肿瘤样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-08-05 |
GENIX enables comparative network analysis of single-cell RNA sequencing to reveal signatures of therapeutic interventions
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100794
PMID:38861988
|
研究论文 | 该文章介绍了GENIX，这一计算框架超越了差异表达分析，能够构建基因关联网络并识别拓扑特征基因 | GENIX能够识别经典差异表达分析遗漏的特征基因，扩展了精准医疗中的目标基因发现范围 | 可能未提及具体的算法细节和真实数据集限制 | 研究单细胞RNA测序对治疗干预的细胞反应的理解 | 利用GENIX分析合成和实验数据集，包括从康复COVID-19患者的外周血单核细胞中分析流感疫苗诱导的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络模型 | 数据集 | 使用合成和实验数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-08-05 |
ScHGSC-IGDC: Identifying genes with differential correlations of high-grade serous ovarian cancer based on single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32909
PMID:38975079
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析确定了高等级浆液性卵巢癌中的差异关联基因 | 提出了ScHGSC-IGDC框架，以识别HGSC发展中的核心基因，并通过分析找到34个模块的基因互作网络 | 未在更广泛的人群中验证结果的普适性 | 旨在通过HGSC的scRNA-seq数据分析识别正常与肿瘤状态之间的差异关联核心基因 | 高等级浆液性卵巢癌患者的肿瘤及其相邻正常组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及的人类卵巢癌细胞系和组织样本未具体说明数量 | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-08-04 |
TrkA + sensory neurons regulate osteosarcoma proliferation and vascularization to promote disease progression
2024-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.20.599869
PMID:38979210
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研究论文 | 该研究探讨了TrkA+感觉神经元在骨肉瘤增殖和血管化中的作用 | 首次揭示了肿瘤相关感觉神经元在骨肉瘤进展中的神经调节功能 | 该研究主要依赖于小鼠模型，可能不完全适用于人类骨肉瘤的情况 | 研究TrkA+感觉神经元如何影响骨肉瘤的发展和血液供应 | 研究的对象为骨肉瘤模型小鼠及其肿瘤微环境中的细胞 | 数字病理学 | 骨癌 | 化学基因学方法 | 转基因小鼠 | 单细胞转录组数据 | 包括小鼠模型和人类骨肉瘤样本的多模态分析 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-04 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals a dystrophic trajectory following a developmental bifurcation of myoblast cell fates in facioscapulohumeral muscular dystrophy
2024-06-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278717.123
PMID:38777608
|
研究论文 | 这篇文章使用单细胞空间转录组学揭示了面肩肱肌营养不良症中肌母细胞命运发育分叉后的退化轨迹 | 本文使用多重错误稳健荧光原位杂交技术实现了对多核肌管转录组的高分辨率分析 | 单细胞或细胞核RNA测序无法充分捕捉多核大肌管的转录组 | 研究面肩肱肌营养不良症（FSHD）中肌母细胞分化过程中的转录组变化 | 研究对象为健康对照、同源D4Z4收缩突变体和FSHD患者样本中的体外分化肌管及未融合单核细胞 | 数字病理学 | 面肩肱肌营养不良症 | 多重错误稳健荧光原位杂交（MERFISH） | NA | RNA转录本 | 包括控制组、同源突变体和FSHD患者样本的多个肌管和单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional profile of CD34+ hematopoietic progenitor cells from del(5q) myelodysplastic syndromes and impact of lenalidomide
2024-Jun-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49529-x
PMID:38902243
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研究论文 | 本研究揭示了del(5q)骨髓增生异常综合症患者CD34+造血祖细胞的转录组变化及其对来那度胺治疗的影响 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了del(5q) MDS中存在的转录改变及其潜在的治疗影响 | 本研究未探讨其他可能的致病机制和较大样本的验证 | 阐明del(5q) MDS的转录变化及其影响来那度胺治疗的机制 | del(5q) MDS患者的CD34+造血祖细胞 | 数字病理学 | 骨髓增生异常综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自del(5q) MDS患者的CD34+细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-08-04 |
Mgp High-Expressing MSCs Orchestrate the Osteoimmune Microenvironment of Collagen/Nanohydroxyapatite-Mediated Bone Regeneration
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308986
PMID:38588510
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研究论文 | 本文描述了Mgp高表达的间充质干细胞（MSCs）如何调控胶原蛋白/纳米羟基磷灰石介导的骨再生中的骨免疫微环境 | 该研究首次揭示了生物材料对间充质干细胞时空表达模式的调控，并识别出一组功能性MSC亚群体 | 尚未详尽探讨生物材料与MSC之间长时间的相互作用 | 研究生物材料对骨再生过程中的干细胞调节作用 | 高表达Mgp的间充质干细胞及其在骨再生中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序与空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-08-05 |
Pan-Cancer Single-Cell and Spatial-Resolved Profiling Reveals the Immunosuppressive Role of APOE+ Macrophages in Immune Checkpoint Inhibitor Therapy
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401061
PMID:38569519
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研究论文 | 本研究探讨了APOE+巨噬细胞在免疫检查点抑制剂（ICI）治疗中的免疫抑制作用 | 结合单细胞RNA测序和机器学习方法，构建了M.Sig模型用于预测ICI反应，揭示了APOE巨噬细胞在ICI治疗中的重要作用 | 本研究可能缺乏对其他类型巨噬细胞的全面比较，未涵盖所有癌症类型 | 研究APOE+巨噬细胞在癌症免疫治疗中的作用与机制 | APOE+巨噬细胞以及与之互动的CD8+耗竭T细胞 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和机器学习 | M.Sig模型 | RNA数据 | 使用了4T1肿瘤-bearing小鼠模型和真实世界免疫治疗数据 | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-08-05 |
Distinct pulmonary and systemic effects of dexamethasone in severe COVID-19
2024-Jun-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49756-2
PMID:38942804
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研究论文 | 本研究探讨了地塞米松在重症COVID-19患者中对肺部和全身免疫细胞的影响 | 揭示了地塞米松在不同细胞区室中的特异性作用及其潜在机制 | 未提及特定的限制条件NA | 研究地塞米松在重症COVID-19患者中的免疫学效应及机制 | 重症COVID-19患者的下呼吸道和血液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | 无 | 血液样本和下呼吸道样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-08-05 |
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2024-Jun-24, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202502
PMID:38912572
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研究论文 | 该研究定义了胚胎eCNm的分子亚域并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元中的保守作用 | 首次使用scRNA-seq和空间表达分析定义了胚胎eCNm的分子亚域，并描述了它们的发育过程 | 未涉及其他小脑核团的发育机制和影响 | 研究胚胎小脑兴奋性神经元的分子多样性及其生存机制 | 胚胎小脑中间核的兴奋性神经元及其分子亚域 | 数字病理 | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |