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当前共找到 544 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-04 |
Identification and validation of Cystatin A as a novel promising therapeutic target for gastric cancer
2024-Jun-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-941
PMID:38989439
|
研究论文 | 本研究确定并验证了Cystatin A作为胃癌的新型有前景的治疗靶点 | 本研究通过生物信息学技术识别与胃癌复发无生存期相关的11个基因，并探讨了Cystatin A对信号通路和治疗的影响 | 研究尚未深入探索其他潜在的预后相关基因，可能忽略了一些重要因素 | 揭示胃癌发展的分子机制并确认新的预后靶点 | 胃癌患者的基因和单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 生物信息学技术、单细胞测序、免疫组织化学 | LASSO-Cox模型 | 基因数据 | 涉及胃癌患者的TCGA-STAD和GSE54129数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-08-05 |
Role of TAP1 in the identification of immune-hot tumor microenvironment and its prognostic significance for immunotherapeutic efficacy in gastric carcinoma
2024-Jun-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-28
PMID:38989426
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研究论文 | 本研究探讨了TAP1在胃癌免疫炎症微环境中的作用及其对免疫治疗效果的预后意义 | 本研究揭示了TAP1与免疫特征之间的积极相关性，并将其作为反映炎性肿瘤微环境和免疫反应的新生物标志物 | 未能发现TAP1表达与不同临床病理特征显著相关性，表明其对分子亚型并不特异 | 本研究旨在阐明TAP1表达与免疫特征的关联，并利用其作为反映免疫治疗反应的生物标志物 | 研究对象为胃癌患者及其肿瘤微环境特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA-STAD队列和GEO门户的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-05 |
Optimizing single-cell RNA sequencing methods for human colon biopsies: droplet-based vs. picowell-based platforms
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600526
PMID:38979379
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研究论文 | 本研究比较了两种单细胞RNA测序平台在处理人类结肠活检样本时的效果 | 本研究首次系统比较了滴液基础与微井基础单细胞RNA测序平台在结肠活检样本中的应用差异 | 研究样本数量有限，仅涉及两名成人的活检样本 | 评估和优化人类结肠活检的单细胞RNA测序方法 | 来源于两名成人结肠的内镜直肠-乙状结肠黏膜活检细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 2名成人的结肠活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell and bulk RNA-seq analyses reveal a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature in ovarian cancer
2024-06-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205966
PMID:38925650
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序分析开发了一个新的CD8+ T细胞相关预后模型，应用于卵巢癌 | 开发了基于CD8 T细胞标记的新颖预后模型，并首次深入探索了CD8 T细胞在卵巢癌中的预后作用 | 未提供具体的样本大小及样本来源的细节 | 探讨CD8 T细胞在卵巢癌中的预后作用，并开发相应的预后模型 | 卵巢癌患者的CD8 T细胞及其相关预后 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归与LASSO回归 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2024-08-04 |
Characterization of tumor endothelial cells (TEC) in gastric cancer and development of a TEC-based risk signature using single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data
2024-06-12, Aging
DOI:10.18632/aging.205928
PMID:38870270
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研究论文 | 本研究旨在阐明胃癌中的肿瘤内皮细胞（TEC）特征，并构建基于TEC的预后风险模型以预测患者的临床结果 | 本研究首次发现了胃癌中的5个TEC簇，并构建了一个包含8个基因的风险标记，与肿瘤免疫细胞浸润相关联 | 研究未阐明该风险标记在其他类型癌症中的适用性 | 探讨胃癌中肿瘤内皮细胞的特征及其在预后中的重要性 | 胃癌患者的肿瘤内皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和总体RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 3302个不同表达基因（DEGs） | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-04 |
ST-CellSeg: Cell segmentation for imaging-based spatial transcriptomics using multi-scale manifold learning
2024-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012254
PMID:38935799
|
研究论文 | 提出了一种基于影像的机器学习方法ST-CellSeg，用于空间转录组的细胞分割 | ST-CellSeg在多尺度信息的考虑上具有创新性，利用流形进行细胞分割 | 尚未提及具体的局限性 | 研究空间转录组数据中的细胞分割问题 | 针对具有不同形状的空间转录组细胞进行分割 | 数字病理学 | NA | 机器学习 | NA | 影像 | 在选定数据集中明显优于基线模型的算法评估 | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-08-05 |
Genomic characteristics of adipose-derived stromal cells induced into neurons based on single-cell RNA sequencing
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33079
PMID:38984299
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪来源的基质细胞（ADSCs）诱导分化为神经元的基因组特征 | 阐明了ADSCs分化为神经元的分子机制及基因组特性 | 对ADSCs诱导分化的分子机制了解不足 | 研究脂肪来源的基质细胞向神经元分化的表观遗传学机制 | 成年ADSCs群体及不同诱导时间组的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七个时间点的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-04 |
AraLeTA: An Arabidopsis leaf expression atlas across diurnal and developmental scales
2024-Jun-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae117
PMID:38428997
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研究论文 | 本文构建了拟南芥叶片在日间和发育时间尺度上细胞类型特异性基因表达的地图 | 结合了单细胞RNA测序数据与整叶时间序列数据，揭示了不同细胞类型在时间上的转录本浓度变化 | 虽然进一步的细胞类型特征分析得到了加强，但依然无法完全消除整叶RNA测序的平均基因表达值的局限性 | 研究拟南芥叶片不同细胞类型基因表达随时间变化的模式 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana）叶片的不同细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics in cancer research and potential clinical impact: a narrative review
2024-Jun-08, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05816-0
PMID:38850363
|
综述 | 本综述总结了空间转录组学在癌症研究中的应用及其潜在临床影响 | 空间转录组学提供了肿瘤微环境的新见解，并能够捕捉肿瘤异质性和多灶性 | 缺乏针对临床应用中的空间信息整合的深度分析 | 探索空间转录组学在精准肿瘤学及肿瘤研究中的应用 | 主要关注固体肿瘤的现有空间转录组学研究 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学（ST） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-08-04 |
Endothelial cell signature in muscle stem cells validated by VEGFA-FLT1-AKT1 axis promoting survival of muscle stem cell
2024-Jun-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73592
PMID:38842166
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研究论文 | 该研究揭示了内皮细胞转录本在肌肉干细胞生存中的作用 | 本研究通过揭示肌肉干细胞行为如何受特定内皮细胞转录本影响，挑战了他们具有不同基因特征的传统观点 | 本研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类肌肉干细胞 | 探讨内皮细胞标记物在肌肉干细胞中的表达及其对存活的影响 | 成年肌肉干细胞及其与内皮细胞的信号通路的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠肌肉干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-08-04 |
Mapping the immune cell landscape of severe atopic dermatitis by single-cell RNA-seq
2024-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16121
PMID:38817208
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了严重特应性皮炎患者的免疫细胞景观 | 本研究揭示了严重特应性皮炎中内源性免疫细胞的显著变化，尤其是与疾病严重程度相关的特定免疫细胞亚群 | 需进一步研究这些免疫细胞变化对疾病发病机制的影响以及潜在治疗靶点的有效性 | 分析严重特应性皮炎（AD）患者全身免疫景观的综合特征 | 来自12名严重特应性皮炎患者和6名健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名严重AD患者和6名健康对照者，分析超过30万个外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-08-04 |
scHolography: a computational method for single-cell spatial neighborhood reconstruction and analysis
2024-06-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03299-3
PMID:38915088
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scHolography的方法，该方法用于重建单细胞空间邻域并进行分析 | 提出了一种基于机器学习的方法，用于重构单细胞的空间邻域并促进3D组织可视化 | NA | 旨在提高对组织复杂性，特别是在单细胞分辨率下的组织结构分析 | 研究对象包括人类和小鼠的空间转录组学数据 | 数字病理学 | 肿瘤免疫微环境 | 空间转录组测序和单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 人类和小鼠的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics analysis identifies a tumor-promoting function of the meningeal stroma in melanoma leptomeningeal disease
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101606
PMID:38866016
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研究论文 | 该文章研究了脑膜病中的肿瘤微环境，揭示了脑膜基质在黑色素瘤脑膜病中的肿瘤促进作用 | 文章创新性地确定了脑膜基质在黑色素瘤脑膜病中的肿瘤促进作用，并提供了克服微环境介导的药物抵抗的机制 | 样本数量有限，仅包含两个患者的九个临床标本 | 探讨黑色素瘤脑膜病的肿瘤微环境及其与基质的相互作用 | 研究对象为黑色素瘤脑膜病及与之匹配的额外颅外转移组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 两名患者的九个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-08-04 |
Glycoengineering-based anti-PD-1-iRGD peptide conjugate boosts antitumor efficacy through T cell engagement
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101590
PMID:38843844
|
研究论文 | 该文章介绍了一种通过糖工程方法合成的抗PD-1-iRGD肽共轭物，能够增强抗肿瘤效能 | 通过双重靶向同时激活肿瘤细胞和PD-1 T细胞，实现肿瘤特异性T细胞激活和增殖，具有创新性 | 在研究中没有提及具体的临床应用或长期安全性评估 | 研究目标是提升肿瘤免疫治疗的效果 | 主要研究对象为抗PD-1-iRGD肽共轭物及其在小鼠模型中的应用 | 肿瘤学 | 癌症 | 糖工程 | NA | 流式细胞术和单细胞RNA-seq数据 | 在多个同系小鼠模型中进行了实验 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-04 |
Single-cell multiomics profiling reveals heterogeneous transcriptional programs and microenvironment in DSRCTs
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101582
PMID:38781959
|
研究论文 | 本研究揭示了DSRCT肿瘤细胞的异质转录程序和微环境特征 | 首次利用单细胞多组学分析展示了DSRCT细胞在转录程序上的多样性及其与微环境的关系 | 样本数量有限，仅研究了五位患者的12个样本，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨DSRCT肿瘤细胞的转录程序多样性及其微环境影响 | 对DSRCT患者的肿瘤细胞进行单细胞多组学分析 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞多组学 | NA | 转录组数据 | 来自五位患者的12个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-08-04 |
Distinctive multicellular immunosuppressive hubs confer different intervention strategies for left- and right-sided colon cancers
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101589
PMID:38806057
|
研究论文 | 本文探讨了左侧和右侧结肠癌的免疫抑制特征和干预策略的差异 | 提出了左侧和右侧结肠癌特定的转录组表达元程序，揭示了其独特的细胞相互作用 | 研究可能未考虑所有潜在的肿瘤微环境因素的影响 | 研究左侧和右侧结肠癌在临床和分子特征上的差异 | 分析了来自105名结肠癌患者的426,863个单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自105名结肠癌患者的426,863个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-08-05 |
Venetoclax acts as an immunometabolic modulator to potentiate adoptive NK cell immunotherapy against leukemia
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101580
PMID:38776913
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研究论文 | 这篇文章报告了venetoclax作为免疫代谢调节剂的作用，通过增强NK细胞对急性髓性白血病的细胞毒性来提升NK细胞免疫疗法的效果 | 发现venetoclax不仅抑制BCL-2，还能激活NK细胞并提高其对AML细胞的亲和力 | 未足够探讨venetoclax在不同类型肿瘤中的应用和长期效果 | 研究venetoclax如何通过调节NK细胞功能来增强癌症免疫疗法的效果 | NK细胞和急性髓性白血病(AML)细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | bulk和单细胞RNA测序，亲和力测量和功能测试 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-08-05 |
scRank infers drug-responsive cell types from untreated scRNA-seq data using a target-perturbed gene regulatory network
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101568
PMID:38754419
|
研究论文 | 本文介绍了scRank，它通过未处理的单细胞转录组数据推断药物响应性细胞类型 | 创新性地采用目标扰动基因调控网络，通过 in silico 药物扰动排名药物响应性细胞群体 | 未提及具体的模型限制 | 旨在识别药物响应性细胞群体以阐明药物作用机制 | 药物响应性细胞类型以及其在不同疾病中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤，重度抑郁障碍，心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 未处理的单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实数据集，包括脑瘤和重度抑郁障碍的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-08-05 |
Single-cell signatures identify microenvironment factors in tumors associated with patient outcomes
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100799
PMID:38889686
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研究论文 | 本文介绍了一种工具scBeacon，通过单细胞RNA测序数据识别肿瘤微环境因素与患者结果的关系 | 创新点在于通过整合和聚类多个单细胞RNA测序数据集提取细胞类型特征，进而解构无关肿瘤数据集 | 本文未提及具体的局限性 | 研究肿瘤及其微环境在患者生存和治疗反应中的作用 | 重点研究TCGA（癌症基因组图谱）队列中的肿瘤样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-08-05 |
GENIX enables comparative network analysis of single-cell RNA sequencing to reveal signatures of therapeutic interventions
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100794
PMID:38861988
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研究论文 | 该文章介绍了GENIX，这一计算框架超越了差异表达分析，能够构建基因关联网络并识别拓扑特征基因 | GENIX能够识别经典差异表达分析遗漏的特征基因，扩展了精准医疗中的目标基因发现范围 | 可能未提及具体的算法细节和真实数据集限制 | 研究单细胞RNA测序对治疗干预的细胞反应的理解 | 利用GENIX分析合成和实验数据集，包括从康复COVID-19患者的外周血单核细胞中分析流感疫苗诱导的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络模型 | 数据集 | 使用合成和实验数据集 | NA | NA | NA | NA |