单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 545 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-05 |
Flow Cytometry Analysis of Microglial Phenotypes in the Murine Brain During Aging and Disease
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5018
PMID:38948260
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研究论文 | 本文提出一种优化的流式细胞术方法，用于分析小鼠脑中微胶质细胞的各种表型 | 本研究展示了一种不需要细胞分选的流式细胞分析协议，并且允许灵活结合额外标记以增强标记面板 | 所提方法仍可能受到诸如标记抗体选择与定量方法的限制 | 研究小鼠脑中微胶质细胞的不同表型以获得生物学见解 | 小鼠脑组织中不同表型的微胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术 | NA | 细胞表型 | NA |
| 322 | 2024-08-04 |
Mgp High-Expressing MSCs Orchestrate the Osteoimmune Microenvironment of Collagen/Nanohydroxyapatite-Mediated Bone Regeneration
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308986
PMID:38588510
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研究论文 | 本文描述了Mgp高表达的间充质干细胞（MSCs）如何调控胶原蛋白/纳米羟基磷灰石介导的骨再生中的骨免疫微环境 | 该研究首次揭示了生物材料对间充质干细胞时空表达模式的调控，并识别出一组功能性MSC亚群体 | 尚未详尽探讨生物材料与MSC之间长时间的相互作用 | 研究生物材料对骨再生过程中的干细胞调节作用 | 高表达Mgp的间充质干细胞及其在骨再生中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序与空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 323 | 2024-08-05 |
Pan-Cancer Single-Cell and Spatial-Resolved Profiling Reveals the Immunosuppressive Role of APOE+ Macrophages in Immune Checkpoint Inhibitor Therapy
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401061
PMID:38569519
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研究论文 | 本研究探讨了APOE+巨噬细胞在免疫检查点抑制剂（ICI）治疗中的免疫抑制作用 | 结合单细胞RNA测序和机器学习方法，构建了M.Sig模型用于预测ICI反应，揭示了APOE巨噬细胞在ICI治疗中的重要作用 | 本研究可能缺乏对其他类型巨噬细胞的全面比较，未涵盖所有癌症类型 | 研究APOE+巨噬细胞在癌症免疫治疗中的作用与机制 | APOE+巨噬细胞以及与之互动的CD8+耗竭T细胞 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和机器学习 | M.Sig模型 | RNA数据 | 使用了4T1肿瘤-bearing小鼠模型和真实世界免疫治疗数据 |
| 324 | 2024-08-05 |
Distinct pulmonary and systemic effects of dexamethasone in severe COVID-19
2024-Jun-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49756-2
PMID:38942804
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研究论文 | 本研究探讨了地塞米松在重症COVID-19患者中对肺部和全身免疫细胞的影响 | 揭示了地塞米松在不同细胞区室中的特异性作用及其潜在机制 | 未提及特定的限制条件NA | 研究地塞米松在重症COVID-19患者中的免疫学效应及机制 | 重症COVID-19患者的下呼吸道和血液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | 无 | 血液样本和下呼吸道样本 | NA |
| 325 | 2024-08-05 |
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2024-Jun-24, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202502
PMID:38912572
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研究论文 | 该研究定义了胚胎eCNm的分子亚域并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元中的保守作用 | 首次使用scRNA-seq和空间表达分析定义了胚胎eCNm的分子亚域，并描述了它们的发育过程 | 未涉及其他小脑核团的发育机制和影响 | 研究胚胎小脑兴奋性神经元的分子多样性及其生存机制 | 胚胎小脑中间核的兴奋性神经元及其分子亚域 | 数字病理 | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-05 |
Machine learning integrative approaches to advance computational immunology
2024-06-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01350-3
PMID:38862979
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评论 | 这篇文章讨论了机器学习整合方法在计算免疫学中的应用。 | 文章强调了现代机器学习技术在整合多种‘组学’数据方面的创新能力，尤其是在单细胞和空间分析中的应用。 | 文章提到了一些整体方法的挑战，但具体的限制未详细说明 | 探讨机器学习整合技术如何推动免疫学研究的发展。 | 聚焦于免疫学领域内多层次数据集的整合分析。 | 计算免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 多组学数据 | NA |
| 327 | 2024-08-05 |
Mitochondrial Oxidative Stress Regulates FOXP3+ T-Cell Activity and CD4-Mediated Inflammation in Older Adults with Frailty
2024-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25116235
PMID:38892421
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研究论文 | 本研究阐明了衰弱老年人CD4/Treg轴的复杂免疫动力学 | 首次揭示了衰弱老年人Treg细胞亚群及其转录组特征与CD4 T细胞反应失调之间的关系 | 当前研究主要比较年轻和老年人群，未充分考虑健康老年人与经历病理衰老者之间的差异 | 研究衰弱老年人中CD4/Treg轴的免疫调节机制 | 衰弱老年人及其与同龄健康老年人的比较 | 数字病理学 | 衰弱 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用公开的外周血单核细胞数据进行分析 |
| 328 | 2024-08-05 |
Tumor suppressive role of the epigenetic master regulator BRD3 in colorectal cancer
2024-Jun, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16129
PMID:38494600
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研究论文 | 本研究探讨了BET家族蛋白BRD3在结直肠癌中的肿瘤抑制作用 | 首次展示了BRD3通过诱导p21表达抑制细胞周期并抑制肿瘤生长的作用 | 未讨论BRD3以外的其他BET家族成员在结直肠癌中的作用 | 研究BRD3在结直肠癌（CRC）中的功能角色 | 结直肠癌细胞及临床样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 329 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of immune cells from the coronary sinus reveals immune mechanisms of the progression of persistent atrial fibrillation
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110127
PMID:38966571
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研究论文 | 该文章探讨了来自冠状窦的免疫细胞在持续性心房颤动进程中的作用 | 首次通过单细胞测序揭示了持续性心房颤动患者冠状窦中免疫细胞的异质性及其与心房颤动复发的相关性 | 研究未明确提及样本量及潜在的临床应用限制 | 探索免疫细胞在持续性心房颤动进展中的作用及机制 | 持续性心房颤动患者的冠状窦免疫细胞 | 数字病理学 | 心房颤动 | 单细胞测序 | NA | 免疫细胞 | NA |
| 330 | 2024-08-04 |
An integrated single-cell RNA-seq map of human neuroblastoma tumors and preclinical models uncovers divergent mesenchymal-like gene expression programs
2024-06-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03309-4
PMID:38898465
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研究论文 | 本研究生成了神经母细胞瘤细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的单细胞RNA-seq图谱 | 提出了一种无监督机器学习方法(acNMF)来比较临床与前临床模型中的基因表达程序 | 未详细研究弱表达的间充质样基因表达与药物耐受机制之间的关系 | 更好地理解患者肿瘤异质性与前临床模型之间的关系 | 聚焦于神经母细胞瘤细胞系及其前临床模型的基因表达程序 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | 无监督机器学习模型 | 基因表达数据 | 涉及多种细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的多个样本 |
| 331 | 2024-08-04 |
Advances in single-cell long-read sequencing technologies
2024-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae047
PMID:38774511
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综述 | 本文讨论了单细胞长读长测序技术的最新进展 | 提供了针对细胞复杂性来源的新见解，并强调了单细胞RNA异构体测序(scRiso-seq)的显著进展 | 主要集中在下游分析的实际考虑和操作挑战上 | 探讨单细胞测序技术在转录组和基因组研究中的应用 | 长读长测序技术在单细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | RNA和DNA序列 | NA |
| 332 | 2024-08-05 |
Systematic evaluation with practical guidelines for single-cell and spatially resolved transcriptomics data simulation under multiple scenarios
2024-06-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03290-y
PMID:38831386
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研究论文 | 本文系统评估了49种针对单细胞RNA测序和空间分辨转录组数据的模拟方法 | 提供了关于不同模拟方法的准确性、功能性、可扩展性和可用性的详细比较，并提出了实际的选择指导 | 没有任何方法在所有标准上表现最佳，且某些方法只能生成不真实的模拟数据 | 评估单细胞RNA测序和空间分辨转录组数据的模拟方法以提供实践指导 | 49种用于单细胞RNA测序和空间分辨转录组的数据模拟方法 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 转录组数据 | 152个来自24个平台的参考数据集 |
| 333 | 2024-08-05 |
Integrated bioinformatics analysis and experimental validation identifies CPE as a potential biomarker and therapeutic target for skin aging
2024-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15120
PMID:38886965
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研究论文 | 本文通过整合生物信息学分析和实验验证，识别了CPE作为皮肤衰老的潜在生物标志物和治疗靶点。 | 创新点在于首次通过加权基因共表达网络分析和机器学习技术，确定了CPE作为皮肤衰老的关键标志物，揭示其在皮肤衰老中的功能。 | 本文未提及特定的临床试验或广泛的人群数据以验证CPE的生物标志物和治疗靶点的有效性。 | 研究皮肤衰老的机制并识别新的生物标志物和治疗靶点。 | 研究对象为人类真皮成纤维细胞(HDFs)，分析其在衰老过程中的CPE表达变化。 | 数字病理学 | 皮肤衰老 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习 | NA | 转录组数据 | 使用了衰老相关的总体转录组和单细胞转录组数据 |
| 334 | 2024-08-05 |
Deficiency of Secreted Phosphoprotein 1 Alleviates Hyperoxia-induced Bronchopulmonary Dysplasia in Neonatal Mice
2024-Jun-29, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02088-1
PMID:38951356
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研究论文 | 该研究探讨了分泌型磷蛋白1(SPP1)在缺氧诱导的支气管肺发育不良(BPD)中的作用 | 研究首次揭示了SPP1在BPD进展中的重要作用，表明其可能作为新的治疗靶标 | 没有具体提到研究的样本量限制或实验条件的详细限制 | 探索SPP1在缺氧诱导的支气管肺发育不良中的作用及其机制 | 新生小鼠以及在不同氧气条件下的肺组织和细胞 | 数字病理 | 肺部疾病 | scRNA-seq | 小鼠模型 | 组织样本 | 新生小鼠及人类BPD患者组织样本 |
| 335 | 2024-08-05 |
Mesenchymal stem cells-extracellular vesicles alleviate pulmonary fibrosis by regulating immunomodulators
2024-Jun-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i6.670
PMID:38948098
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研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞外泌体（MSC-EVs）在减轻肺纤维化中的治疗潜力 | 本研究首次系统评估了MSC-EVs对肺纤维化、氧化应激和免疫炎症的影响 | 研究中未明确描述MSC-EVs的具体分子机制和长期效果 | 研究MSC-EVs在治疗肺纤维化及其相关病理过程中的潜力 | 研究对象包括A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞和小鼠肺组织样本 | 使用A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 |
| 336 | 2024-08-05 |
Microglia-astrocyte crosstalk in the amyloid plaque niche of an Alzheimer's disease mouse model, as revealed by spatial transcriptomics
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114216
PMID:38819990
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研究论文 | 本文探讨了阿尔茨海默病小鼠模型中淀粉样斑块环境下小胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用 | 本文利用高分辨率空间转录组学平台揭示了淀粉样斑块环境的细胞组成和信号扰动的异质性 | 研究仅限于小鼠模型，尚需在人类样本中验证 | 研究淀粉样斑块环境中小胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用及其对神经元信号的影响 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 337 | 2024-08-05 |
Immunotherapeutic targeting of surfaceome heterogeneity in AML
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114260
PMID:38838225
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研究论文 | 本文分析急性髓性白血病（AML）原发性人类样本的表面蛋白组，识别潜在的免疫治疗靶点 | 成功识别众多特异性表达于初级AML细胞的抗原和标记物，揭示了AML的表面组异质性 | 未提及具体的医学临床试验数据来验证识别的抗原和标记物的治疗效果 | 识别AML免疫治疗干预的潜在靶点 | 分析100个遗传多样性的原发性人类AML标本的表面蛋白组 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 蛋白组数据 | 100个原发性人类AML样本 |
| 338 | 2024-08-05 |
Single-cell-resolved interspecies comparison shows a shared inflammatory axis and a dominant neutrophil-endothelial program in severe COVID-19
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114328
PMID:38861386
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探讨了严重COVID-19中的共享炎症轴和以中性粒细胞-内皮细胞为主的程序 | 通过比较不同种类的仓鼠在COVID-19感染中的反应，本研究揭示了不同种类仓鼠在免疫反应上的差异，为COVID-19的病理机制提供了新的见解 | 该研究依赖于仓鼠模型，可能无法完全代表人类COVID-19的所有特征 | 研究COVID-19的发病机制及其免疫反应的差异 | 健康和严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染的叙利亚和罗波罗斯基仓鼠 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 利用了多种仓鼠样本，与人类COVID-19的研究数据进行了比较 |
| 339 | 2024-08-05 |
Decoding heterogeneous and coordinated tissue architecture in glioblastoma using spatial transcriptomics
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110064
PMID:38947514
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探讨胶质母细胞瘤中的基因表达异质性 | 首次揭示了胶质母细胞瘤中组织干细胞特征在坏死和肿瘤周边区域的富集 | 缺乏对空间复杂性的深入探讨 | 探讨胶质母细胞瘤的基因表达异质性及其空间分布 | 临床胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 临床胶质母细胞瘤标本（具体数量未提供） |
| 340 | 2024-08-05 |
Generation and characterization of inducible KRAB-dCas9 iPSCs from primates for cross-species CRISPRi
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110090
PMID:38947524
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研究论文 | 本论文生成并验证了来自灵长类动物的可诱导KRAB-dCas9 iPS细胞系。 | 提供了灵长类动物iPS细胞系的独特资源，以便于跨物种的CRISPR干扰研究。 | 尽管在不同细胞系中KRAB-dCas9的表达水平不同，但对目标基因的下调效果相似，可能限制了结果的普遍性。 | 研究灵长类动物的分子表型比较，为理解人类生物学和进化提供信息。 | 三个人类、三种大猩猩和两种猕猴iPS细胞系。 | 数字病理学 | NA | CRISPR干扰（CRISPRi） | NA | 单细胞RNA测序 | 八个iPS细胞系 |