单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 545 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-04 |
Liver cancer from the perspective of single-cell sequencing: a review combined with bibliometric analysis
2024-Jun-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05855-7
PMID:38910204
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综述 | 本研究通过文献计量学分析，全面概述了单细胞测序在肝癌研究中的知识结构和研究热点 | 这项研究是首次综合总结单细胞测序在肝癌应用的研究趋势和发展 | 具体的局限性未在摘要中提及 | 提供单细胞测序在肝癌研究领域的知识结构和研究热点的概述 | 与单细胞测序技术在肝癌研究中的应用相关的文献 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 文献 | 331篇相关出版物 |
| 282 | 2024-08-05 |
Leveraging Integrated RNA Sequencing to Decipher Adrenomedullin's Protective Mechanisms in Experimental Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Jun-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060806
PMID:38927741
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研究论文 | 本研究旨在阐明肾上腺髓质素在实验性支气管肺发育不良中的保护机制 | 本研究整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了肾上腺髓质素缺乏与炎症、自然杀伤细胞频率增加及内皮细胞和二型肺泡细胞频率下降之间的关系 | 本研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类情况 | 阐明肾上腺髓质素对支气管肺发育不良病理机制的影响 | 使用LPS诱导的小鼠实验模型研究肾上腺髓质素的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含肾上腺髓质素足量（野生型或基因敲除）和肾上腺髓质素单倍缺失（haplodeficient）小鼠的肺组织样本 |
| 283 | 2024-08-04 |
LHFPL2 Serves as a Potential Biomarker for M2 Polarization of Macrophages in Renal Cell Carcinoma
2024-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25126707
PMID:38928412
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研究论文 | 本文探讨了LHFPL2在肾细胞癌中作为巨噬细胞M2极化的潜在生物标志物的作用 | 揭示了LHFPL2与肾细胞癌及其在巨噬细胞M2极化中的关系，并提出了潜在的靶向药物 | 尚未在体外或临床试验中验证LHFPL2作为生物标志物的有效性 | 研究LHFPL2在肾细胞癌中对巨噬细胞极化的影响及其作为癌症治疗靶点的潜力 | 研究对象为609名肾透明细胞癌患者的转录组数据及34,326个肾癌细胞的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 转录组测序和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 609名KIRC患者和34,326个肾癌细胞 |
| 284 | 2024-08-05 |
Identifying the protective effects of miR-874-3p/ATF3 axis in intervertebral disc degeneration by single-cell RNA sequencing and validation
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18492
PMID:38890795
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研究论文 | 本文探讨了miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的保护作用 | 首次揭示miR-874-3p通过靶向ATF3调控椎间盘退变的病理过程 | 仅在实验室环境和动物模型中验证，临床应用尚需进一步研究 | 研究miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的作用及机制 | 椎间盘退变患者和椎间盘退变大鼠模型 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包含椎间盘退变患者和多种细胞类型的椎间盘退变大鼠样本 |
| 285 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling highlights the importance of telocyte, kallikrein genes, and alternative splicing in mouse testes aging
2024-06-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65710-0
PMID:38926537
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠睾丸衰老过程中包头细胞和卡利克林基因的重要性 | 首次探讨了睾丸包头细胞和卡利克林基因在小鼠睾丸衰老中的作用，及其细胞类型特异性的可变剪接动态 | 本研究仅基于小鼠模型，未来需要在其他物种中验证结果 | 深入理解睾丸衰老过程中的转录组变化 | 年轻和老年小鼠的睾丸单细胞 | 数字病理 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 43323个睾丸单细胞 |
| 286 | 2024-08-05 |
Cbl and Cbl-b ubiquitin ligases are essential for intestinal epithelial stem cell maintenance
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109912
PMID:38974465
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研究论文 | 这篇文章展示了Cbl和Cbl-b泛素连接酶对肠上皮干细胞维持的重要性 | 揭示了Cbl家族泛素连接酶在调节肠上皮干细胞和分化之间平衡的作用 | 本研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类肠上皮干细胞的验证 | 探讨Cbl和Cbl-b在肠上皮干细胞维持中的功能 | Lgr5+肠干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、LacZ谱系追踪 | NA | RNA数据 | NA |
| 287 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Spatial Heterogeneity and Functional Alteration of Endothelial Cells in Chronic Hepatitis B Infection
2024-Jun-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25137016
PMID:39000126
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析慢性乙型肝炎感染小鼠肝脏中的内皮细胞的空间异质性和功能改变。 | 揭示了内皮细胞的三种亚群体在慢性乙型肝炎感染中的功能变化及其与免疫细胞的相互作用，尤其是VISFATIN/Nampt信号通路的潜在作用。 | 研究中主要使用了小鼠模型，结果可否完全推广至人类尚需进一步验证。 | 研究慢性乙型肝炎感染中内皮细胞的异质性及其功能变化。 | 慢性乙型肝炎感染小鼠肝脏中的内皮细胞。 | 数字病理学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 在小鼠模型中分析了十种细胞类型的内皮细胞 |
| 288 | 2024-08-05 |
Mapping the Development of Human Spermatogenesis Using Transcriptomics-Based Data: A Scoping Review
2024-Jun-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25136925
PMID:39000031
|
综述 | 本文回顾了人类精子发生的转录组数据和发育过程 | 提供了关于人类睾丸发育的转录特征的新见解，并提出了优化体外成熟的方法 | 对于体细胞谱系的数据有限，尤其是在Sertoli细胞方面存在技术问题 | 描述睾丸从胎儿期到成年期的发育过程，并寻找优化体外成熟的相关信息 | 与原生和体外培养的人类睾丸细胞及单细胞RNA测序相关的研究论文 | 数字病理学 | 无梗阻性无精症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 289 | 2024-08-05 |
Tumor-associated characteristics and immune dysregulation in nasopharyngeal carcinoma under the regulation of m7G-related tumor microenvironment cells
2024-Jun-25, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-024-03441-2
PMID:38918785
|
研究论文 | 本研究揭示了在m7G相关肿瘤微环境细胞调控下，鼻咽癌微环境中的肿瘤相关特征和免疫失调 | 揭示了m7G调控的肿瘤微环境细胞与鼻咽癌免疫分布及其生物学特征之间的关系 | 本研究未详细探讨m7G修饰的具体机制及其在治疗中的潜在应用 | 探索m7G修饰相关的肿瘤微环境细胞在鼻咽癌中的作用 | 分析来自11个鼻咽癌肿瘤样本和3个鼻咽淋巴增生样本的68,795个单细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解算法 | 单细胞数据 | 68,795个单细胞，来自11个鼻咽癌样本和3个鼻咽淋巴增生样本 |
| 290 | 2024-08-05 |
Identification of New Chemoresistance-Associated Genes in Triple-Negative Breast Cancer by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2024-Jun-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25136853
PMID:38999963
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析识别了与三阴性乳腺癌化学耐药相关的新基因 | 首次揭示了三阴性乳腺癌细胞中转录异质性的显著性，并通过scRNA-seq识别了稀有的抗药性相关细胞亚群 | 未能明确所有机制，特别是在其他亚群中的耐药基因的作用 | 揭示三阴性乳腺癌中化疗耐药的转录特征 | 三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了多种三阴性乳腺癌细胞样本，具体样本数量未说明 |
| 291 | 2024-08-05 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-Jun-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
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研究论文 | 本研究探讨了KRAS靶向疗法对肿瘤微环境的影响。 | 提出将SOS1和MEK抑制联合用于改善免疫疗法反应的新策略。 | 缺乏持久反应，且肿瘤微环境仍然高度免疫抑制。 | 研究KRAS抑制如何影响肿瘤微环境以增强抗肿瘤效果。 | 使用KrasG12D、p53突变的鼠源性胰腺导管腺癌细胞系进行研究。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞系 | 使用多种KPCY细胞系进行实验 |
| 292 | 2024-08-04 |
Action of circulating and infiltrating B cells in the immune microenvironment of colorectal cancer by single-cell sequencing analysis
2024-Jun-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i6.2683
PMID:38994150
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨了循环和浸润B细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 | 该研究揭示了结直肠癌中B细胞的异质性及其在肿瘤免疫中的功能差异 | 样本量相对较小，仅涉及23名结直肠癌患者，可能影响结果的普适性 | 探讨结直肠癌免疫微环境中循环和浸润B细胞亚群的作用 | 分析来自23名CRC患者的肿瘤、正常和外周血样本中的B细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 样本 | 69个样本（包括正常、肿瘤和外周血样本） |
| 293 | 2024-08-05 |
Immunological and microbial shifts in the aging rhesus macaque lung during nontuberculous mycobacterial infection
2024-Jun-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00829-24
PMID:38771046
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研究论文 | 本研究比较了年轻和老年猕猴在非结核分枝杆菌感染中的免疫和微生物变化 | 本研究揭示了老年猕猴对非结核分枝杆菌感染的免疫反应增强，提供了对人类年龄相关疾病机制的新见解 | 缺乏对非人灵长类动物的更大样本量的研究，可能限制了结果的广泛适用性 | 探究老年猕猴在非结核分枝杆菌感染过程中免疫和微生物的变化 | 研究对象为三只年轻和两只老年的猕猴 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据，免疫细胞反应数据 | 五只猕猴（两只年轻雌性，一只年轻雄性，两个老年雌性） |
| 294 | 2024-08-05 |
Phenotypic and transcriptional changes in peripheral blood mononuclear cells during alphavirus encephalitis in mice
2024-Jun-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00736-24
PMID:38695564
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研究论文 | 本研究利用小鼠Sindbis病毒感染模型探讨外周血单核细胞在病毒脑炎中的表型和转录组变化 | 首次将单细胞RNA测序与流式细胞术结合，系统分析了小鼠外周血单核细胞的转录和表型变化 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 研究SINV感染对小鼠外周血单核细胞的影响，以理解病毒脑炎的免疫机制 | SINV感染的小鼠，特别是其外周血单核细胞及中枢神经系统内的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA |
| 295 | 2024-08-05 |
Spatial genomic, biochemical and cellular mechanisms underlying meningioma heterogeneity and evolution
2024-Jun, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01747-1
PMID:38760638
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研究论文 | 研究了影响脑膜瘤内部异质性及其演化的空间基因组、 Biochemical 和细胞机制 | 通过空间方法揭示出驱动高等级脑膜瘤内部异质性的基因和蛋白表达程序 | 对驱动内部异质性的可针对机制理解不足 | 揭示脑膜瘤内部异质性与其分子、时间和空间演化之间的联系 | 高等级脑膜瘤和其复发样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR干扰 | NA | 空间转录组 | 配对的原发和复发脑膜瘤样本 |
| 296 | 2024-08-04 |
Identification and validation of Cystatin A as a novel promising therapeutic target for gastric cancer
2024-Jun-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-941
PMID:38989439
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研究论文 | 本研究确定并验证了Cystatin A作为胃癌的新型有前景的治疗靶点 | 本研究通过生物信息学技术识别与胃癌复发无生存期相关的11个基因，并探讨了Cystatin A对信号通路和治疗的影响 | 研究尚未深入探索其他潜在的预后相关基因，可能忽略了一些重要因素 | 揭示胃癌发展的分子机制并确认新的预后靶点 | 胃癌患者的基因和单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 生物信息学技术、单细胞测序、免疫组织化学 | LASSO-Cox模型 | 基因数据 | 涉及胃癌患者的TCGA-STAD和GSE54129数据集 |
| 297 | 2024-08-05 |
Role of TAP1 in the identification of immune-hot tumor microenvironment and its prognostic significance for immunotherapeutic efficacy in gastric carcinoma
2024-Jun-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-28
PMID:38989426
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研究论文 | 本研究探讨了TAP1在胃癌免疫炎症微环境中的作用及其对免疫治疗效果的预后意义 | 本研究揭示了TAP1与免疫特征之间的积极相关性，并将其作为反映炎性肿瘤微环境和免疫反应的新生物标志物 | 未能发现TAP1表达与不同临床病理特征显著相关性，表明其对分子亚型并不特异 | 本研究旨在阐明TAP1表达与免疫特征的关联，并利用其作为反映免疫治疗反应的生物标志物 | 研究对象为胃癌患者及其肿瘤微环境特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA-STAD队列和GEO门户的数据 |
| 298 | 2024-08-05 |
Optimizing single-cell RNA sequencing methods for human colon biopsies: droplet-based vs. picowell-based platforms
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600526
PMID:38979379
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研究论文 | 本研究比较了两种单细胞RNA测序平台在处理人类结肠活检样本时的效果 | 本研究首次系统比较了滴液基础与微井基础单细胞RNA测序平台在结肠活检样本中的应用差异 | 研究样本数量有限，仅涉及两名成人的活检样本 | 评估和优化人类结肠活检的单细胞RNA测序方法 | 来源于两名成人结肠的内镜直肠-乙状结肠黏膜活检细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 2名成人的结肠活检样本 |
| 299 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell and bulk RNA-seq analyses reveal a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature in ovarian cancer
2024-06-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205966
PMID:38925650
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研究论文 | 本文通过单细胞测序分析开发了一个新的CD8+ T细胞相关预后模型，应用于卵巢癌 | 开发了基于CD8 T细胞标记的新颖预后模型，并首次深入探索了CD8 T细胞在卵巢癌中的预后作用 | 未提供具体的样本大小及样本来源的细节 | 探讨CD8 T细胞在卵巢癌中的预后作用，并开发相应的预后模型 | 卵巢癌患者的CD8 T细胞及其相关预后 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归与LASSO回归 | NA | NA |
| 300 | 2024-08-04 |
Characterization of tumor endothelial cells (TEC) in gastric cancer and development of a TEC-based risk signature using single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data
2024-06-12, Aging
DOI:10.18632/aging.205928
PMID:38870270
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研究论文 | 本研究旨在阐明胃癌中的肿瘤内皮细胞（TEC）特征，并构建基于TEC的预后风险模型以预测患者的临床结果 | 本研究首次发现了胃癌中的5个TEC簇，并构建了一个包含8个基因的风险标记，与肿瘤免疫细胞浸润相关联 | 研究未阐明该风险标记在其他类型癌症中的适用性 | 探讨胃癌中肿瘤内皮细胞的特征及其在预后中的重要性 | 胃癌患者的肿瘤内皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和总体RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 3302个不同表达基因（DEGs） |