本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-05 |
Inference of Gene Regulatory Networks Based on Multi-view Hierarchical Hypergraphs
2024-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00604-3
PMID:38342857
|
研究论文 | 该文章提出了一种基于多视图层次超图的基因调控网络推断模型 | 引入了多视图层次超图,以整合多个异质生物信息,模型更好地捕捉多对多的复杂调节关系 | 尚未提及具体限制。 | 旨在改善基因调控网络的推断准确性 | 使用大肠杆菌和酿酒酵母的数据集进行实验验证 | 计算生物学 | NA | 超图卷积网络 | 层次超图模型 | 基因表达数据 | 对5个小鼠和2个人类细胞系的scRNA-seq数据集进行了分析 | NA | NA | NA | NA |
| 282 | 2024-08-05 |
Dimethyl Fumarate Mediates Sustained Vascular Smooth Muscle Cell Remodeling in a Mouse Model of Cerebral Aneurysm
2024-Jun-27, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox13070773
PMID:39061841
|
研究论文 | 本研究探讨了二甲基富马酸在小鼠脑动脉瘤模型中对血管平滑肌细胞(VSMCs)的影响 | 文章创新点在于首次揭示了二甲基富马酸对VSMCs的抑制作用与抗氧化功能紊乱之间的关联 | 尚未调查二甲基富马酸对VSMCs功能的潜在副作用 | 研究二甲基富马酸对脑动脉瘤诱导后VSMCs的影响 | 脑动脉瘤诱导后圈状动脉(VSMCs)中的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 脑动脉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 小鼠模型中未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2024-08-05 |
Reduction of Glyoxalase 1 Expression Links Fetal Methylmercury Exposure to Autism Spectrum Disorder Pathogenesis
2024-Jun-22, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics12070449
PMID:39058101
|
研究论文 | 这篇文章探讨了甘油醛酶1表达的降低将胎儿甲基汞暴露与自闭症谱系障碍的发病机制联系起来 | 研究揭示了甲基汞暴露对自闭症风险基因在皮层发育中的直接影响 | 具体对照组和长时间观察的数据可能不足 | 本研究旨在确定孕期甲基汞诱导早熟神经分化和异常神经发育的分子机制 | 研究对象为孕期暴露于低剂量非凋亡性甲基汞的小鼠模型 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和实时定量PCR (RT-qPCR) | NA | 基因表达数据 | 培养的胚胎放射状胶质前体细胞 (RGPs) | NA | NA | NA | NA |
| 284 | 2024-08-04 |
Unfolding the mysteries of heterogeneity from a high-resolution perspective: integration analysis of single-cell multi-omics and spatial omics revealed functionally heterogeneous cancer cells in ccRCC
2024-Jun-26, Aging
DOI:10.18632/aging.205974
PMID:38944814
|
研究论文 | 本研究整合了单细胞多组学和空间组学的数据,揭示了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中功能异质性癌细胞的特征 | 通过整合scRNA-seq、scATAC-seq和stRNA-seq,首次分类了功能异质性的癌细胞,并探索了其在微环境中的相互作用 | 尚未完全建立ccRCC中肿瘤内异质性的机制 | 探讨透明细胞肾细胞癌中的肿瘤内异质性及其调控网络 | 功能上异质性的癌细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq, scATAC-seq, stRNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 285 | 2024-08-04 |
Beyond benchmarking and towards predictive models of dataset-specific single-cell RNA-seq pipeline performance
2024-06-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03304-9
PMID:38886757
|
研究论文 | 本研究探讨了使用监督机器学习模型来预测针对特定数据集的单细胞RNA测序分析管道性能 | 提出了通过分析288个scRNA-seq管道在86个数据集上的表现来预测最佳管道的可能性 | 未提及具体的局限性 | 研究预测特定数据集的最佳单细胞RNA-seq分析管道 | 288种scRNA-seq分析管道和86个数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督机器学习模型 | 单细胞RNA-seq数据 | 288个分析管道和86个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 286 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis of cavernous tissues reveals the key roles of pericytes in diabetic erectile dysfunction
2024-Jun-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88942
PMID:38856719
|
研究论文 | 本研究通过单细胞 RNA 测序分析了海绵体组织,揭示了周细胞在糖尿病勃起功能障碍中的关键作用 | 研究发现了新的周细胞特异性标记 Limb Bud-Heart (Lbh),表明其在糖尿病勃起功能障碍中的重要性 | 研究主要集中在小鼠和人类的海绵体组织,可能缺乏其他类型组织的全面数据 | 深入理解糖尿病条件下海绵体微环境和细胞间通讯以开发新疗法 | 研究对象包括糖尿病患者的海绵体组织和相关的细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病勃起功能障碍 | 单细胞 RNA 测序 | NA | RNA数据 | 研究涉及小鼠和人类的海绵体组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 287 | 2024-08-05 |
Enhanced abscopal anti-tumor response via a triple combination of thermal ablation, IL-21, and PD-1 inhibition therapy
2024-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03718-1
PMID:38833177
|
研究论文 | 该研究探讨了热消融、IL-21和PD-1抑制治疗的三重组合在肿瘤治疗中的作用 | 研究首次探讨了热消融、IL-21和抗PD-1单克隆抗体的联合疗法对肿瘤的抗肿瘤效果 | 研究未提供不同治疗组的外部验证和临床试验数据 | 研究三重组合疗法在转移性癌症治疗中的潜力 | 探讨热消融对肿瘤浸润淋巴细胞中IL-21R表达的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 288 | 2024-08-05 |
SIRPG expression positively associates with an inflamed tumor microenvironment and response to PD-1 blockade
2024-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03737-y
PMID:38833156
|
研究论文 | 本研究旨在探讨信号调节蛋白伽玛(SIRPG)与肿瘤免疫微环境表型及T细胞介导的适应性抗肿瘤免疫之间的关系 | 高SIRPG表达与癌症中的发炎免疫表型及对PD-1阻断的良好反应相关,暗示其作为预测生物标志物和新的免疫治疗靶点的潜力 | 缺乏对不同癌症类型中SIRPG功能机制的深入研究 | 探讨SIRPG与肿瘤免疫微环境及PD-1阻断反应的关系 | 对157名非小细胞肺癌和黑色素瘤患者进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 157名患者的临床数据和103,599个细胞的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 289 | 2024-08-04 |
The neuroblastoma tumor microenvironment: From an in-depth characterization towards novel therapies
2024-Jun, EJC paediatric oncology
DOI:10.1016/j.ejcped.2024.100161
PMID:39036648
|
综述 | 本文总结了神经母细胞瘤肿瘤微环境的特征及其针对新疗法的研究进展 | 提出通过深入理解肿瘤微环境以识别新的疗法组合,特别是针对免疫逃逸和药物耐受性的组合策略 | 本文主要是对已有研究的总结,缺乏新的实验数据 | 探讨神经母细胞瘤肿瘤微环境的特征以及靶向该微环境的新疗法 | 神经母细胞瘤患者的肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞群体 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | 体内和体外实验模型 | 文本 | 众多相关临床试验和研究数据 | NA | NA | NA | NA |
| 290 | 2024-08-04 |
TRPV1 inhibition suppresses non-small cell lung cancer progression by inhibiting tumour growth and enhancing the immune response
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00894-7
PMID:37902941
|
研究论文 | 本研究探讨了TRPV1在非小细胞肺癌(NSCLC)中的作用,发现其表现为肿瘤促进因子。 | 首次明确了TRPV1在NSCLC中的促进肿瘤生长和影响免疫反应的机制。 | 缺乏长期的临床数据或患者数量的足够样本来全面评估TRPV1的作用。 | 探讨TRPV1在非小细胞肺癌中的作用及其对肿瘤进展的影响。 | 研究对象为非小细胞肺癌组织及相关细胞系。 | 数字病理学 | 肺癌 | LC-MS/MS, ELISA, 免疫组化, CCK8, 流式细胞仪, qPCR, 西方印迹 | NA | 组织样本, 细胞系 | 使用了来自TCGA数据库的多个肿瘤组织和小鼠肿瘤异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 291 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq of the rare virosphere reveals the native hosts of giant viruses in the marine environment
2024-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01669-y
PMID:38605173
|
研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序方法,揭示了海洋环境中巨病毒的原生宿主 | 首次通过单细胞RNA测序技术配对活跃的巨病毒与其原生原生生物宿主 | 未能全面覆盖所有可能的宿主和巨病毒之间的相互作用 | 研究巨病毒的原生宿主及其生态重要性 | 研究在诱导的藻类 bloom 中收集的样本中,与巨病毒感染相关的宿主细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 在多个宿主谱系中检测到数百个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 292 | 2024-08-05 |
The Efficacy of Imiquimod-Induced Psoriasis Model on Murine Cells
2024-Jun, Cureus
DOI:10.7759/cureus.62914
PMID:39040747
|
研究论文 | 本研究集中于使用Imiquimod诱导小鼠皮肤细胞的类银屑病模型的有效性 | 本研究通过单细胞RNA测序和轨迹分析首次阐明了IMQ诱导的细胞与对照细胞在分化模式上的显著差异 | 研究指出IMQ诱导的细胞与银屑病细胞之间的差异因素仍需进一步探索 | 研究IMQ在诱导类银屑病模型中的有效性 | 小鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 293 | 2024-08-05 |
ITGB2-ICAM1 axis promotes liver metastasis in BAP1-mutated uveal melanoma with retained hypoxia and ECM signatures
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00908-4
PMID:38150154
|
研究论文 | 这项研究探讨了ITGB2-ICAM1轴在BAP1突变的葡萄膜黑色素瘤中促进肝转移的机制 | 揭示了BAP1缺失驱动UM转移的机制,并提出了ITGB2-ICAM1轴作为潜在的治疗靶点 | 本研究主要基于小鼠模型,临床转化的可行性尚待验证 | 研究BAP1突变葡萄膜黑色素瘤中的转移机制和相关的信号通路 | 主要分析BAP1突变与转移性葡萄膜黑色素瘤的单细胞RNA测序数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 免疫竞争性小鼠肝脏转移模型 | 基因表达数据 | 包含初级和转移性UM样本的单细胞RNA测序数据,且使用免疫小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 294 | 2024-08-05 |
[Analysis of correlation between high expression of nucleoporin 85 (NUP85) and immune cell infiltration in hepatocellular carcinoma]
2024-Jun, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:38952090
|
研究论文 | 该研究探讨了核孔蛋白85(NUP85)在肝细胞癌中的表达及其与免疫反应的相关性 | 首次系统分析了NUP85在HCC中高表达与免疫细胞浸润的相关性,并提出其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 本研究的局限性在于使用的数据库和分析方法可能存在的数据偏差 | 研究NUP85在肝细胞癌中的意义及其与免疫反应的关系 | 肝细胞癌(HCC)样本中的NUP85表达及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序,基因表达分析 | NA | mRNA和蛋白数据 | 涉及HCC样本的突变率为19% | NA | NA | NA | NA |
| 295 | 2024-08-05 |
Unravelling infiltrating T-cell heterogeneity in kidney renal clear cell carcinoma: Integrative single-cell and spatial transcriptomic profiling
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18403
PMID:39031800
|
研究论文 | 本文系统地探讨了肾透明细胞癌中浸润性T细胞的异质性 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组数据全面表征了浸润性T细胞的特征,并建立了基于ITSG的稳定预后模型 | 尚未提及特定的局限性 | 研究浸润性T细胞在肾透明细胞癌中的作用和异质性 | 浸润性和增殖中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 12种KIRC治疗剂的预后相关数据 | NA | NA | NA | NA |
| 296 | 2024-08-05 |
Cell Tree Rings: the structure of somatic evolution as a human aging timer
2024-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-01053-4
PMID:38172489
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序构建细胞谱系树,以反映个体的衰老状态和生物年龄 | 提出了通过细胞谱系树结构与生物时间进行关联的新方法,可能成为一种更基本的衰老时钟 | 单细胞变异体的检测是一个重大技术挑战 | 探讨体细胞突变与衰老机制的关系,从而改善衰老评估 | 人类外周血单核细胞中的体细胞突变 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 惩罚多重回归模型 | 基因序列数据 | 来自数千个细胞的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 297 | 2024-08-05 |
[Advancements in Single-cell RNA Sequencing Technology
in the Study of the Tumor Microenvironment in Lung Cancer]
2024-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
综述 | 本综述讨论了单细胞RNA测序技术在研究肺癌肿瘤微环境异质性中的最新进展 | 提出了单细胞RNA测序技术可用于揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性和新生细胞亚群体 | 传统的批量测序技术无法有效解决单细胞水平的异质性问题 | 探讨如何通过单细胞RNA测序技术深入理解肺癌肿瘤微环境的复杂性 | 研究肿瘤微环境中免疫细胞的组成和功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 298 | 2024-08-05 |
A guide to single-cell RNA sequencing analysis using web-based tools for non-bioinformatician
2024-Jun, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17036
PMID:38148322
|
研究论文 | 本研究介绍了针对非生物信息学家的单细胞RNA测序分析的网络工具 | 提供了用户友好的网络工具和详细的初学者分析流程 | 需要更多文献来帮助克服使用障碍 | 旨在使研究人员能够进行单细胞RNA测序分析 | 非生物信息学家 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 299 | 2024-08-05 |
Foundation models in molecular biology
2024-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2024.240006
PMID:39027316
|
研究论文 | 本文总结了基于分子生物学中各种数据的基础模型。 | 介绍了在分子生物学中发展的基础模型,并探讨了其潜在的研究方向。 | 未提及具体的局限性 | 探索和总结分子生物学中基础模型的发展情况。 | 聚焦于RNA序列、DNA序列、蛋白质序列、单细胞转录组和空间转录组数据。 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型 | 基础模型 | RNA序列数据、DNA序列数据、蛋白质序列数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 300 | 2024-08-05 |
Comprehensive pan-cancer analysis of mitochondrial outer membrane permeabilisation activity reveals positive immunomodulation and assists in identifying potential therapeutic targets for immunotherapy resistance
2024-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1735
PMID:38899748
|
研究论文 | 本研究深入探讨了肿瘤线粒体外膜通透性活动对免疫的影响 | 创新性地开发了MOMP特征(MOMP.Sig)以准确反映肿瘤MOMP活动,并使用机器学习模型展示了其临床预测价值 | NA | 明确肿瘤MOMP对免疫及免疫疗法效果的影响,指导更有效的免疫治疗策略 | 分析了包括30种癌症类型转录组和免疫疗法转录组在内的综合数据集 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤和三阴性乳腺癌 | scRNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | 涉及30种癌症类型的转录组和20个免疫治疗转录组以及3个免疫治疗scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |