单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 546 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
Unravelling infiltrating T-cell heterogeneity in kidney renal clear cell carcinoma: Integrative single-cell and spatial transcriptomic profiling
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18403
PMID:39031800
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研究论文 | 本文系统地探讨了肾透明细胞癌中浸润性T细胞的异质性 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组数据全面表征了浸润性T细胞的特征，并建立了基于ITSG的稳定预后模型 | 尚未提及特定的局限性 | 研究浸润性T细胞在肾透明细胞癌中的作用和异质性 | 浸润性和增殖中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 12种KIRC治疗剂的预后相关数据 |
| 262 | 2024-08-05 |
Cell Tree Rings: the structure of somatic evolution as a human aging timer
2024-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-01053-4
PMID:38172489
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序构建细胞谱系树，以反映个体的衰老状态和生物年龄 | 提出了通过细胞谱系树结构与生物时间进行关联的新方法，可能成为一种更基本的衰老时钟 | 单细胞变异体的检测是一个重大技术挑战 | 探讨体细胞突变与衰老机制的关系，从而改善衰老评估 | 人类外周血单核细胞中的体细胞突变 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 惩罚多重回归模型 | 基因序列数据 | 来自数千个细胞的样本 |
| 263 | 2024-08-05 |
[Advancements in Single-cell RNA Sequencing Technology
in the Study of the Tumor Microenvironment in Lung Cancer]
2024-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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综述 | 本综述讨论了单细胞RNA测序技术在研究肺癌肿瘤微环境异质性中的最新进展 | 提出了单细胞RNA测序技术可用于揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性和新生细胞亚群体 | 传统的批量测序技术无法有效解决单细胞水平的异质性问题 | 探讨如何通过单细胞RNA测序技术深入理解肺癌肿瘤微环境的复杂性 | 研究肿瘤微环境中免疫细胞的组成和功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-08-05 |
A guide to single-cell RNA sequencing analysis using web-based tools for non-bioinformatician
2024-Jun, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17036
PMID:38148322
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研究论文 | 本研究介绍了针对非生物信息学家的单细胞RNA测序分析的网络工具 | 提供了用户友好的网络工具和详细的初学者分析流程 | 需要更多文献来帮助克服使用障碍 | 旨在使研究人员能够进行单细胞RNA测序分析 | 非生物信息学家 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-08-05 |
Foundation models in molecular biology
2024-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2024.240006
PMID:39027316
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研究论文 | 本文总结了基于分子生物学中各种数据的基础模型。 | 介绍了在分子生物学中发展的基础模型，并探讨了其潜在的研究方向。 | 未提及具体的局限性 | 探索和总结分子生物学中基础模型的发展情况。 | 聚焦于RNA序列、DNA序列、蛋白质序列、单细胞转录组和空间转录组数据。 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型 | 基础模型 | RNA序列数据、DNA序列数据、蛋白质序列数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA |
| 266 | 2024-08-05 |
Comprehensive pan-cancer analysis of mitochondrial outer membrane permeabilisation activity reveals positive immunomodulation and assists in identifying potential therapeutic targets for immunotherapy resistance
2024-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1735
PMID:38899748
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研究论文 | 本研究深入探讨了肿瘤线粒体外膜通透性活动对免疫的影响 | 创新性地开发了MOMP特征（MOMP.Sig）以准确反映肿瘤MOMP活动，并使用机器学习模型展示了其临床预测价值 | NA | 明确肿瘤MOMP对免疫及免疫疗法效果的影响，指导更有效的免疫治疗策略 | 分析了包括30种癌症类型转录组和免疫疗法转录组在内的综合数据集 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤和三阴性乳腺癌 | scRNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | 涉及30种癌症类型的转录组和20个免疫治疗转录组以及3个免疫治疗scRNA-seq数据集 |
| 267 | 2024-08-04 |
A bibliometric study of the intellectual base and global research hotspots for single-cell sequencing [2009-2022] in breast cancer
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33219
PMID:39022007
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研究论文 | 该研究总结并量化了与乳腺癌单细胞测序相关的研究动态和趋势 | 提供了关于乳腺癌单细胞测序的全面和公正的研究状态报告 | 当前缺乏对研究结果的深入分析，未来需更多跨国合作 | 研究乳腺癌单细胞测序的研究动态和热点 | 与乳腺癌单细胞测序相关的研究文章和评论 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | 分析了583篇文章和评论 |
| 268 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis and experimental verification reveal the molecular characteristics of EGLN3 in pan-cancer and its relationship with the proliferation and apoptosis of lung cancer
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33206
PMID:39021988
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研究论文 | 这篇文章探讨了EGLN3在各种癌症中的分子特征及其在肺癌增殖和细胞凋亡中的作用 | 本研究首次全面分析了EGLN3在泛癌症中的表达模式及其与免疫细胞浸润的关系 | 本研究的局限性在于未能充分阐明EGLN3在不同癌症类型中的特异性作用 | 研究EGLN3在癌症中的生物功能及其临床意义 | 研究对象为EGLN3及其与肺癌细胞增殖和凋亡的关系 | 数字病理 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序, 免疫荧光 | NA | 细胞数据 | NA |
| 269 | 2024-08-04 |
A Cullin 5-based complex serves as an essential modulator of ORF9b stability in SARS-CoV-2 replication
2024-Jun-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01874-5
PMID:38937432
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研究论文 | 本研究揭示了CUL5-TOM70-HSP90α复合体在SARS-CoV-2 ORF9b稳定性调控中的关键作用 | 首次识别CUL5-TOM70-HSP90α复合体作为ORF9b蛋白稳定性的关键调节因子 | 未提及该研究的具体限制 | 探讨SARS-CoV-2中ORF9b蛋白的调控机制 | SARS-CoV-2 ORF9b蛋白及其变异株 | 病毒学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质 | 对COVID-19患者的肺上皮细胞进行研究 |
| 270 | 2024-08-05 |
Intense impact of IL-1β expressing inflammatory macrophages in acute aortic dissection
2024-06-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65931-3
PMID:38937528
|
研究论文 | 本文探讨了IL-1β表达的炎症巨噬细胞对急性主动脉夹层的影响 | 首次识别了与急性主动脉夹层相关的新治疗靶点，尤其是IL-1β炎症巨噬细胞的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类的病理机制存在差异 | 识别与炎症细胞相关的新治疗靶点 | 人类急性主动脉夹层样本和小鼠急性主动脉夹层模型 | 数字病理学 | 急性主动脉夹层 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 组织样本 | 人类样本和小鼠模型的数量未具体说明 |
| 271 | 2024-08-05 |
Farnesyltransferase inhibition overcomes oncogene-addicted non-small cell lung cancer adaptive resistance to targeted therapies
2024-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49360-4
PMID:38937474
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研究论文 | 本研究探讨了磷酸酰基转移酶抑制剂在克服非小细胞肺癌适应性抗药性方面的作用 | 该研究揭示了药物适应的共同路径和早期抗药性细胞的特征，并确定了FTI作为有效的治疗组合 | 研究中对分子事件的动力学和序列了解仍然不足 | 研究如何克服非小细胞肺癌对靶向疗法产生的适应性抗药性 | 包括EGFR、ALK、BRAF和KRAS突变的非小细胞肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、实时细胞周期动态监测 | NA | 细胞 | 广泛的肿瘤细胞系，包括多种突变类型 |
| 272 | 2024-08-04 |
The Absence of Intra-Tumoral Tertiary Lymphoid Structures is Associated with a Worse Prognosis and mTOR Signaling Activation in Hepatocellular Carcinoma with Liver Transplantation: A Multicenter Retrospective Study
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309348
PMID:38498682
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）患者中肿瘤内三级淋巴结构的缺失如何与更差的预后及mTOR信号通路激活相关 | 首次探讨了通过放射学非侵入性预测肝脏移植后的肝细胞癌中的肿瘤内三级淋巴结构的可能性，并建立了相应的分类器 | 该研究的局限性在于为回顾性研究，可能存在选择偏倚和数据的局限性 | 研究肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的存在对预后的影响 | 肝细胞癌患者，尤其是接受肝脏移植的患者 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | 分类器 | 肿瘤组织样本 | 最大 cohort，包括多名肝细胞癌患者 |
| 273 | 2024-08-05 |
miR-124-3p and miR-194-5p regulation of the PI3K/AKT pathway via ROR2 in medulloblastoma progression
2024-Jun, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00762-y
PMID:38632356
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研究论文 | 该文章探讨了miR-124-3p和miR-194-5p通过ROR2调控PI3K/AKT通路在髓母细胞瘤进展中的作用 | 揭示了miR-124-3p和miR-194-5p作为肿瘤抑制因子的作用及其在髓母细胞瘤中的潜在治疗靶点 | 对miRNAs在髓母细胞瘤肿瘤发生中的具体作用尚不明确 | 研究miR-124-3p和miR-194-5p在髓母细胞瘤进展中的调控机制 | 关注miR-124-3p、miR-194-5p及ROR2在髓母细胞瘤组织和细胞系中的表现 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫荧光、Western blot | NA | 生物组织样本 | NA |
| 274 | 2024-08-04 |
Liver cancer from the perspective of single-cell sequencing: a review combined with bibliometric analysis
2024-Jun-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05855-7
PMID:38910204
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综述 | 本研究通过文献计量学分析，全面概述了单细胞测序在肝癌研究中的知识结构和研究热点 | 这项研究是首次综合总结单细胞测序在肝癌应用的研究趋势和发展 | 具体的局限性未在摘要中提及 | 提供单细胞测序在肝癌研究领域的知识结构和研究热点的概述 | 与单细胞测序技术在肝癌研究中的应用相关的文献 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 文献 | 331篇相关出版物 |
| 275 | 2024-08-05 |
Leveraging Integrated RNA Sequencing to Decipher Adrenomedullin's Protective Mechanisms in Experimental Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Jun-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060806
PMID:38927741
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研究论文 | 本研究旨在阐明肾上腺髓质素在实验性支气管肺发育不良中的保护机制 | 本研究整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了肾上腺髓质素缺乏与炎症、自然杀伤细胞频率增加及内皮细胞和二型肺泡细胞频率下降之间的关系 | 本研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类情况 | 阐明肾上腺髓质素对支气管肺发育不良病理机制的影响 | 使用LPS诱导的小鼠实验模型研究肾上腺髓质素的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含肾上腺髓质素足量（野生型或基因敲除）和肾上腺髓质素单倍缺失（haplodeficient）小鼠的肺组织样本 |
| 276 | 2024-08-04 |
LHFPL2 Serves as a Potential Biomarker for M2 Polarization of Macrophages in Renal Cell Carcinoma
2024-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25126707
PMID:38928412
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研究论文 | 本文探讨了LHFPL2在肾细胞癌中作为巨噬细胞M2极化的潜在生物标志物的作用 | 揭示了LHFPL2与肾细胞癌及其在巨噬细胞M2极化中的关系，并提出了潜在的靶向药物 | 尚未在体外或临床试验中验证LHFPL2作为生物标志物的有效性 | 研究LHFPL2在肾细胞癌中对巨噬细胞极化的影响及其作为癌症治疗靶点的潜力 | 研究对象为609名肾透明细胞癌患者的转录组数据及34,326个肾癌细胞的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 转录组测序和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 609名KIRC患者和34,326个肾癌细胞 |
| 277 | 2024-08-05 |
Identifying the protective effects of miR-874-3p/ATF3 axis in intervertebral disc degeneration by single-cell RNA sequencing and validation
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18492
PMID:38890795
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研究论文 | 本文探讨了miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的保护作用 | 首次揭示miR-874-3p通过靶向ATF3调控椎间盘退变的病理过程 | 仅在实验室环境和动物模型中验证，临床应用尚需进一步研究 | 研究miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的作用及机制 | 椎间盘退变患者和椎间盘退变大鼠模型 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包含椎间盘退变患者和多种细胞类型的椎间盘退变大鼠样本 |
| 278 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling highlights the importance of telocyte, kallikrein genes, and alternative splicing in mouse testes aging
2024-06-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65710-0
PMID:38926537
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠睾丸衰老过程中包头细胞和卡利克林基因的重要性 | 首次探讨了睾丸包头细胞和卡利克林基因在小鼠睾丸衰老中的作用，及其细胞类型特异性的可变剪接动态 | 本研究仅基于小鼠模型，未来需要在其他物种中验证结果 | 深入理解睾丸衰老过程中的转录组变化 | 年轻和老年小鼠的睾丸单细胞 | 数字病理 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 43323个睾丸单细胞 |
| 279 | 2024-08-05 |
Cbl and Cbl-b ubiquitin ligases are essential for intestinal epithelial stem cell maintenance
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109912
PMID:38974465
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研究论文 | 这篇文章展示了Cbl和Cbl-b泛素连接酶对肠上皮干细胞维持的重要性 | 揭示了Cbl家族泛素连接酶在调节肠上皮干细胞和分化之间平衡的作用 | 本研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类肠上皮干细胞的验证 | 探讨Cbl和Cbl-b在肠上皮干细胞维持中的功能 | Lgr5+肠干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、LacZ谱系追踪 | NA | RNA数据 | NA |
| 280 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Spatial Heterogeneity and Functional Alteration of Endothelial Cells in Chronic Hepatitis B Infection
2024-Jun-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25137016
PMID:39000126
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析慢性乙型肝炎感染小鼠肝脏中的内皮细胞的空间异质性和功能改变。 | 揭示了内皮细胞的三种亚群体在慢性乙型肝炎感染中的功能变化及其与免疫细胞的相互作用，尤其是VISFATIN/Nampt信号通路的潜在作用。 | 研究中主要使用了小鼠模型，结果可否完全推广至人类尚需进一步验证。 | 研究慢性乙型肝炎感染中内皮细胞的异质性及其功能变化。 | 慢性乙型肝炎感染小鼠肝脏中的内皮细胞。 | 数字病理学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 在小鼠模型中分析了十种细胞类型的内皮细胞 |