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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-11-02 |
Remodeling of anti-tumor immunity with antibodies targeting a p53 mutant
2024-06-18, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01566-1
PMID:38886748
|
研究论文 | 开发针对p53突变体的单克隆抗体,并通过脂质纳米颗粒递送,以重塑抗肿瘤免疫反应 | 首次开发出针对p53热点突变E285K的单克隆抗体,并通过脂质纳米颗粒递送,显示出强大的抗肿瘤效果 | 研究主要集中在体外和体内实验,尚未进行临床试验 | 探索针对p53突变体的精准治疗策略 | p53突变体及其在肿瘤中的作用 | 癌症研究 | 癌症 | 单细胞测序(scRNA-seq) | 单克隆抗体(mAbs) | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-10-24 |
Global trends of single cell sequence associated in cancer from 2011 to 2024: A bibliometric analysis
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32847
PMID:38975217
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meta-analysis | 本文通过文献计量分析探讨了2011年至2024年间与癌症相关的单细胞测序研究的趋势和前沿 | 本文首次通过文献计量分析方法,系统地总结了单细胞测序在癌症研究中的应用趋势和前沿 | 本文主要依赖于文献计量分析,未涉及具体的实验数据或技术细节 | 探索基于单细胞测序的癌症分子和临床病理特征,揭示肿瘤间异质性,并为癌症的早期诊断、治疗和预后分析提供新思路 | 2011年至2024年间发表的与癌症相关的单细胞测序研究 | digital pathology | NA | 单细胞测序 | NA | 文本 | 6189篇文章 | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-10-24 |
Medulloblastoma Spatial Transcriptomics Reveals Tumor Microenvironment Heterogeneity with High-Density Progenitor Cell Regions Correlating with High-Risk Disease
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.25.600684
PMID:38979174
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析了十六例儿童髓母细胞瘤样本,揭示了肿瘤微环境的异质性及其与高风险疾病的关系 | 首次在空间背景下分析髓母细胞瘤的肿瘤微环境,揭示了高密度静止祖细胞区域与高风险疾病特征的相关性 | 样本量相对较小,且仅限于儿童髓母细胞瘤 | 探讨髓母细胞瘤肿瘤微环境的异质性及其与疾病进展和治疗反应的关系 | 十六例儿童髓母细胞瘤样本及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 神经系统肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 十六例儿童髓母细胞瘤样本,包括两对诊断-复发匹配样本 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-10-24 |
B cell-mediated antigen presentation promotes adverse cardiac remodeling in chronic heart failure
2024-Jun-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4536350/v1
PMID:38978561
|
研究论文 | 研究探讨了B细胞通过MHC II介导的抗原呈递在慢性心力衰竭中促进不良心脏重塑的作用 | 揭示了B细胞通过MHC II介导的抗原呈递在慢性心力衰竭中的新机制,并提出MHC II介导的信号通路作为治疗慢性心力衰竭的新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和人类心肌梗死患者的循环B细胞分析,可能需要进一步的人类临床研究来验证其普遍性 | 探讨特定免疫细胞在慢性心力衰竭中的作用机制,特别是B细胞通过MHC II介导的抗原呈递的作用 | 小鼠和人类心肌梗死患者的B细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类心肌梗死患者的B细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-10-24 |
Identify Regulatory eQTLs by Multiome Sequencing in Prostate Single Cells
2024-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.19.599704
PMID:38948854
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研究论文 | 本文通过多组学单细胞测序技术,研究前列腺癌细胞中调控eQTL及其靶基因的关联 | 首次应用多组学单细胞测序技术在前列腺癌细胞中识别调控eQTL及其靶基因 | 数据稀疏性问题仍然存在,尽管通过靶向测序有所改善 | 验证多组学单细胞测序技术在前列腺癌风险位点识别调控元件及其靶基因的可行性 | 前列腺癌细胞中的调控eQTL及其靶基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多组学测序 | NA | 单细胞数据 | 65,501个高质量单细胞来自8种前列腺细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-10-24 |
Identification of a gene expression signature of vascular invasion and recurrence in stage I lung adenocarcinoma via bulk and spatial transcriptomics
2024-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.07.597993
PMID:38915565
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研究论文 | 通过批量和空间转录组学技术,识别出与血管侵袭和复发相关的基因表达特征,用于预测I期肺腺癌的血管侵袭和复发风险 | 首次通过批量和空间转录组学技术,识别出与血管侵袭和复发相关的基因表达特征,并开发了预测血管侵袭的转录组预测器 | 研究样本量较小,且仅限于I期肺腺癌 | 识别与血管侵袭和复发相关的基因表达特征,并开发预测模型以改善I期肺腺癌的诊断和管理 | I期肺腺癌的血管侵袭和复发风险 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 空间转录组学 (stRNA-seq) | 转录组预测器 | 基因表达数据 | 162个切除的I期肿瘤样本,其中15个样本用于高分辨率空间转录组学分析 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-10-24 |
Spatial Single-cell Analysis Decodes Cortical Layer and Area Specification
2024-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.05.597673
PMID:38915567
|
研究论文 | 本文利用多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH)和基于深度学习的细胞分割技术,研究了人类胎儿皮质在空间分辨单细胞水平上的分子、细胞和细胞结构发育 | 本文首次揭示了在妊娠中期之前,皮质层结构的早期建立,并发现了视觉皮质区域之间分子边界的突然转变,挑战了连续形态发生素梯度决定皮质区域化的传统观点 | NA | 研究人类大脑皮质层和区域分子特化的空间关系 | 人类胎儿皮质在不同妊娠阶段的分子、细胞和细胞结构发育 | 数字病理学 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) | 深度学习 | 空间单细胞数据 | 1600万单细胞,涵盖八个皮质区域,跨越妊娠第二和第三孕期的四个时间点 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-10-24 |
Inhibition of the Eukaryotic Initiation Factor-2-α Kinase PERK Decreases Risk of Autoimmune Diabetes in Mice
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.06.561126
PMID:38895427
|
研究论文 | 研究通过抑制eIF2α激酶PERK来减少小鼠自身免疫性糖尿病的风险 | 首次证明抑制PERK可以逆转人类胰岛中mRNA翻译的阻断,延迟糖尿病的发病,减少胰岛炎症并保护β细胞数量 | 研究仅在T1D易感小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨通过抑制PERK来预防或延迟自身免疫性1型糖尿病的发展 | T1D易感小鼠的胰岛和β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,空间蛋白质组学 | NA | RNA,蛋白质 | T1D易感小鼠的胰岛样本 | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-10-24 |
Computational identification of surface markers for isolating distinct subpopulations from heterogeneous cancer cell populations
2024-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.596337
PMID:38854060
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为clusterCleaver的计算工具,用于识别和分离异质性癌细胞群体中的不同亚群 | 开发了clusterCleaver工具,利用统计距离度量来识别单细胞RNA测序数据中的候选表面标记物,用于FACS分离 | NA | 研究肿瘤内异质性癌细胞亚群的功能和动态变化 | 乳腺癌细胞系MDA-MB-231和MDA-MB-436中的异质性癌细胞亚群 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | MDA-MB-231和MDA-MB-436乳腺癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-10-12 |
Myelin-associated oligodendrocytic basic protein-dependent myelin repair confers the long-lasting antidepressant effect of ketamine
2024-Jun, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02288-5
PMID:37848708
|
研究论文 | 研究探讨了氯胺酮的长期抗抑郁效果与其对髓鞘修复的影响之间的关系 | 首次揭示了髓鞘相关蛋白(Mobp)在氯胺酮长期抗抑郁效果中的关键作用,并发现(R)-氯胺酮比(S)-氯胺酮在髓鞘修复中具有更强的效果 | 研究仅在慢性社会挫败应激的小鼠模型中进行,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨氯胺酮长期抗抑郁效果的机制及其与髓鞘修复的关系 | 小鼠的脑部髓鞘修复及氯胺酮的抗抑郁效果 | NA | NA | 空间转录组学(ST) | NA | 基因表达数据 | 慢性社会挫败应激的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-10-12 |
Nature of epigenetic aging from a single-cell perspective
2024-Jun, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00616-0
PMID:38724733
|
研究论文 | 本文从单细胞角度研究了表观遗传衰老的本质 | 本文通过对比小鼠组织和单细胞DNA甲基化在早期发育和成年衰老过程中的变化,揭示了表观遗传衰老的协同调控和随机成分,并提出了一个用于识别协同调控和随机CpG簇的单细胞算法 | NA | 阐明表观遗传衰老的本质 | 小鼠的组织和单细胞DNA甲基化 | 表观遗传学 | NA | DNA甲基化分析,单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据,RNA测序数据 | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-10-12 |
Analyses of the autism-associated neuroligin-3 R451C mutation in human neurons reveal a gain-of-function synaptic mechanism
2024-Jun, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01834-x
PMID:36280753
|
研究论文 | 研究了与自闭症相关的neuroligin-3 R451C突变在人类神经元中的功能获得性突触机制 | 首次研究了NLGN3 R451C突变对人类神经元的影响,并揭示了其在兴奋性突触传递中的功能获得性增强 | 研究主要集中在体外和移植到小鼠脑内的神经元,缺乏直接的人体研究 | 探讨NLGN3 R451C突变在人类神经元中的突触功能及其对自闭症谱系障碍(ASD)病理生理的影响 | NLGN3 R451C突变和NLGN3敲除的人类神经元 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及NLGN3 R451C突变和NLGN3敲除的人类神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-10-08 |
UPK3A+ umbrella cell damage mediated by TLR3-NR2F6 triggers programmed destruction of urothelium in Hunner-type interstitial cystitis/painful bladder syndrome
2024-06, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6275
PMID:38551071
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了Hunner型间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中尿路上皮细胞的异质性和发育轨迹,并提出了针对UPK3A伞细胞损伤的关键信号通路的治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Hunner型间质性膀胱炎中尿路上皮细胞的异质性和发育轨迹,并确定了TLR3-NR2F6轴作为潜在的治疗靶点 | 治疗效果有限,缺乏对特定细胞类型和分子靶点的充分理解 | 揭示Hunner型间质性膀胱炎中尿路上皮细胞的异质性和发育轨迹,并寻找潜在的治疗靶点 | Hunner型间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中的尿路上皮细胞 | NA | 膀胱疼痛综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | HIC膀胱中的尿路上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-10-07 |
Inferring single-cell spatial gene expression with tissue morphology via explainable deep learning
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.12.598686
PMID:38915550
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研究论文 | 开发了一种基于视觉变换器(ViT)的框架SPiRiT,用于推断单细胞空间基因表达,并结合组织形态学信息 | 提出了SPiRiT框架,通过整合交叉验证和模型解释在超参数调优中,显著提高了预测准确性,并揭示了ViT模型用于预测基因表达的高分辨率高关注区域(HAR) | NA | 探索利用组织形态学信息推断单细胞空间基因表达的可行性 | 人类乳腺癌和小鼠幼崽的组织切片 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 视觉变换器(ViT) | 视觉变换器(ViT) | 图像 | 人类乳腺癌和小鼠幼崽的组织切片,评估数据来自Xenium(10x Genomics)数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-10-04 |
Integrated analyses reveal the diagnostic and predictive values of COL5A2 and association with immune environment in Crohn's disease
2024-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00276-5
PMID:38789829
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研究论文 | 研究通过综合分析揭示了COL5A2在克罗恩病中的诊断和预测价值及其与免疫环境的关联 | 首次揭示了COL5A2在克罗恩病中的诊断和预测价值,并探讨了其与免疫环境的关联 | 研究依赖于公开数据库的数据,可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探讨克罗恩病中免疫细胞异常及其与COL5A2的关联,以寻找潜在的诊断和预测标志物 | 克罗恩病患者的单细胞和批量RNA测序数据,以及COL5A2的表达和功能 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(RNA-seq),免疫组化(IHC) | NA | RNA | 克罗恩病患者和对照组的RNA测序数据,具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-10-02 |
Arrestin beta-2 deficiency exacerbates periodontal inflammation by mediating activating transcription factor 6 activation and abnormal remodelling of the extracellular matrix
2024-06, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13952
PMID:38267365
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研究论文 | 研究了arrestin beta-2 (ARRB2)在牙周炎进展中的具体作用及其机制 | 揭示了ARRB2通过抑制ATF6信号通路介导的细胞外基质重塑对牙周组织的保护作用 | NA | 探讨ARRB2在牙周炎进展中的作用及其机制 | 牙周炎患者和健康对照者的牙周组织 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、实时定量聚合酶链反应、Western blotting、免疫组织化学染色 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-09-27 |
Lysophospholipid Acyltransferase 9 Promotes Emphysema Formation via Platelet-activating Factor
2024-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0253OC
PMID:38377392
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研究论文 | 研究LPLAT9通过血小板活化因子促进肺气肿形成的机制 | 首次揭示了LPLAT9在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的作用及其通过血小板活化因子促进肺气肿形成的机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类中验证 | 探讨LPLAT9在COPD发病机制中的作用 | LPLAT9基因表达、单细胞RNA测序数据、肺泡巨噬细胞 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LPLAT9敲除小鼠和对照小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-09-26 |
Single-Cell Sequencing: High-Resolution Analysis of Cellular Heterogeneity in Autoimmune Diseases
2024-Jun, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-024-09001-6
PMID:39186216
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在自身免疫性疾病中的创新应用及其对疾病诊断和精准治疗的影响 | 单细胞测序技术能够以高分辨率分析细胞异质性,揭示驱动疾病进展的分子机制 | 尽管单细胞测序技术在自身免疫性疾病中有广泛应用,但仍存在一些局限性 | 研究单细胞测序技术在自身免疫性疾病中的应用,以揭示其发病机制和治疗靶点 | 自身免疫性疾病中的细胞异质性和分子机制 | 基因组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序技术,特别是单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组、表观基因组或转录组信息 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-09-25 |
Single Cell Analysis of Peripheral TB-Associated Granulomatous Lymphadenitis
2024-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.596301
PMID:38853908
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了结核病患者淋巴结中的细胞类型及其通信网络 | 首次使用单细胞RNA测序技术检测结核分枝杆菌RNA转录本,并将其与宿主细胞的转录组关联,识别单个感染细胞 | 样本量较小,仅涉及23名患者 | 研究结核病患者淋巴结中的细胞组成及其通信网络 | 结核病患者的淋巴结组织 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 23名结核病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-09-25 |
Cholesterol efflux from C1QB-expressing macrophages is associated with resistance to chimeric antigen receptor T cell therapy in primary refractory diffuse large B cell lymphoma
2024-Jun-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49495-4
PMID:38890370
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研究论文 | 研究报告了C1QB表达的巨噬细胞中胆固醇外流与原发性难治性弥漫性大B细胞淋巴瘤对嵌合抗原受体T细胞疗法的抵抗性之间的关系 | 首次揭示了C1QB表达的巨噬细胞中胆固醇外流通过诱导CD8 T细胞的免疫抑制状态,导致其衰竭,从而抑制CAR-T细胞的细胞毒性 | 研究样本量较小,仅包括12名患者,可能影响结果的普适性 | 探讨原发性难治性弥漫性大B细胞淋巴瘤对CAR-T细胞疗法的抵抗机制 | C1QB表达的巨噬细胞、CAR-T细胞、CD8 T细胞 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名患者 | NA | NA | NA | NA |