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当前共找到 543 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-12-18 |
Subpopulations of fibroblasts derived from human iPS cells
2024-06-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06419-8
PMID:38890483
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研究论文 | 本文研究了从人诱导多能干细胞（iPSCs）分化而来的成纤维细胞亚群，并分析了它们在不同器官中的特性 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了从iPSCs分化而来的心脏、肝脏和皮肤成纤维细胞的亚群，揭示了基于发育的成纤维细胞异质性 | 研究仅限于心脏、肝脏和皮肤成纤维细胞，未涵盖所有器官的成纤维细胞 | 探讨成纤维细胞在不同器官中的异质性，为控制纤维化提供治疗策略 | 从人诱导多能干细胞分化而来的心脏、肝脏和皮肤成纤维细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从人诱导多能干细胞分化而来的心脏、肝脏和皮肤成纤维细胞的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2024-12-18 |
Integrative analysis of single-cell RNA-seq and gut microbiome metabarcoding data elucidates macrophage dysfunction in mice with DSS-induced ulcerative colitis
2024-06-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06409-w
PMID:38879692
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和肠道微生物群的宏条形码数据，揭示了DSS诱导的小鼠溃疡性结肠炎中巨噬细胞功能障碍 | 本研究首次整合单细胞RNA测序和16s rRNA扩增子测序数据，揭示了巨噬细胞在慢性溃疡性结肠炎中的异质性和炎症反应的分子机制 | 本研究仅在DSS诱导的小鼠模型中进行，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨免疫和代谢变化在溃疡性结肠炎中的具体作用机制 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型中的结肠细胞和微生物群 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，16s rRNA扩增子测序 | NA | RNA序列，微生物群数据 | 多个时间点的DSS诱导溃疡性结肠炎小鼠结肠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 223 | 2024-12-17 |
A Bibliometric Analysis of the Spatial Transcriptomics Literature from 2006 to 2023
2024-Jun-10, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01484-3
PMID:38856921
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综述 | 本文对2006年至2023年间的空间转录组学文献进行了文献计量分析，揭示了该领域的研究前沿和趋势 | 首次对空间转录组学领域进行了全面的文献计量分析，揭示了该领域的研究热点和全球合作网络 | 文献计量分析主要基于已发表的文献，可能无法全面反映该领域的所有研究动态 | 分析空间转录组学领域的研究前沿和趋势 | 2006年至2023年间发表的空间转录组学相关文献 | NA | NA | 文献计量分析 | NA | 文本 | 1467篇论文和综述 | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-12-16 |
Integration of Pan-Cancer Cell Line and Single-Cell Transcriptomic Profiles Enables Inference of Therapeutic Vulnerabilities in Heterogeneous Tumors
2024-06-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3005
PMID:38581448
|
研究论文 | 本文开发了一种名为scIDUC的计算框架，通过整合单细胞转录组数据和泛癌细胞系筛选数据，预测个体细胞的药物疗效 | 提出了scIDUC框架，能够高效地将单细胞转录组数据转化为个体细胞的药物反应预测，为异质性肿瘤的治疗提供了新工具 | 需要进一步验证该框架在更多疾病类型和更大样本量中的适用性和准确性 | 开发一种能够预测异质性肿瘤中个体细胞药物反应的计算工具 | 单细胞转录组数据和泛癌细胞系筛选数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及横纹肌肉瘤、胰腺导管腺癌和去势抵抗性前列腺癌三种不同疾病的细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 225 | 2024-12-13 |
Intrinsic Gata4 expression sensitizes the aortic root to dilation in a Loeys-Dietz syndrome mouse model
2024-Jun-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4420617/v1
PMID:38883722
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研究论文 | 研究探讨了Loeys-Dietz综合征小鼠模型中主动脉根部扩张的分子机制 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术揭示了LDS小鼠主动脉平滑肌细胞的异质性，并发现Gata4表达的VSMC在主动脉根部表现出较低的分化状态和促炎性特征 | 研究仅限于小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据，尚未在人类患者中进行验证 | 识别Loeys-Dietz综合征中主动脉根部易扩张的分子决定因素 | Loeys-Dietz综合征小鼠模型的主动脉平滑肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | LDS小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-12-08 |
CAraCAl: CAMML with the integration of chromatin accessibility
2024-Jun-13, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05833-3
PMID:38872103
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CAraCAl的生物信息学方法，用于在scATAC-seq数据上进行细胞类型注释 | CAraCAl通过整合染色质可及性数据，改进了CAMML方法，使其能够更有效地处理scATAC-seq数据 | 当scRNA-seq数据存在时，CAraCAl的性能并未超过CAMML，仅在仅有scATAC-seq数据时表现较好 | 开发一种新的方法来注释scATAC-seq数据中的细胞类型 | scATAC-seq数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-12-08 |
scDMAE: A Generative Denoising Model Adopted Mask Strategy for scRNA-Seq Data Recovery
2024-06, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3383921
PMID:38568766
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scDMAE的生成去噪模型，采用掩码策略用于单细胞RNA测序数据的恢复 | scDMAE模型融合了基因表达特征和拓扑特征，使用带有掩码策略的自编码器来建模丢失事件并分离潜在噪声，结合原始数据恢复真实的生物表达值 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的去噪和恢复准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 多种类型的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-12-02 |
Identification of lipid metabolism-related gene signature in the bone marrow microenvironment of multiple myelomas through deep analysis of transcriptomic data
2024-Jun-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-024-01398-w
PMID:38916672
|
研究论文 | 通过深度分析转录组数据，识别多发性骨髓瘤骨髓微环境中与脂质代谢相关的基因特征 | 本研究通过分析多发性骨髓瘤患者的批量测序和单细胞测序数据，识别出与脂质代谢相关的基因，并构建了预测模型，揭示了脂质代谢相关基因在骨髓微环境中的作用及其对患者生存状态、免疫状态和免疫治疗反应的影响 | 研究主要基于测序数据，未涉及临床试验验证，且样本量相对较小 | 探讨脂质代谢相关基因在多发性骨髓瘤骨髓微环境中的作用机制及其对患者预后的影响 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓微环境及脂质代谢相关基因 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 涉及多发性骨髓瘤患者的批量测序和单细胞测序数据，具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2024-12-02 |
Revolutionary multi-omics analysis revealing prognostic signature of thyroid cancer and subsequent in vitro validation of SNAI1 in mediating thyroid cancer progression through EMT
2024-Jun-13, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-024-01387-z
PMID:38869635
|
研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了甲状腺癌的预后特征，并在体外验证了SNAI1通过EMT介导甲状腺癌进展的作用 | 开发了一种基于多组学数据的共识机器学习驱动的预后模型（CMLS），并验证了其在甲状腺癌患者预后预测中的优越性 | NA | 开发一种基于多组学数据的预后模型，以准确预测甲状腺癌患者的预后 | 甲状腺癌患者的预后特征及SNAI1在甲状腺癌进展中的作用 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、甲基化芯片数据、基因突变数据 | 机器学习模型 | 基因表达数据、lncRNA表达数据、miRNA表达数据、甲基化数据、基因突变数据、临床数据 | 2种未分化甲状腺癌细胞系、1种乳头状甲状腺癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-11-27 |
CD4+ T cells display a spectrum of recall dynamics during re-infection with malaria parasites
2024-Jun-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49879-6
PMID:38944658
|
研究论文 | 研究了在再次感染疟原虫时，CD4+ T细胞的回忆反应动态 | 首次详细描述了在再次感染疟原虫时，不同CD4 T细胞亚群的回忆反应多样性，并提供了用于研究基因表达动态和克隆关系的图形用户界面 | 研究仅在老鼠模型中进行，结果可能不完全适用于人类 | 探讨在再次感染疟原虫时，CD4+ T细胞的回忆反应及其多样性 | CD4+ T细胞及其在再次感染疟原虫时的反应 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、T细胞受体测序（TCR-seq）和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 老鼠模型中的CD4+ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-11-22 |
Bayesian-frequentist hybrid inference framework for single cell RNA-seq analyses
2024-06-20, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00638-0
PMID:38902839
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研究论文 | 本文提出了一种贝叶斯-频率主义混合推断框架，用于单细胞RNA测序分析，以提高识别差异表达基因的能力 | 提出了贝叶斯-频率主义混合框架，相比其他单细胞差异表达方法，在考虑FDR和功效时表现更优 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因的识别能力 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯-频率主义混合框架 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 232 | 2024-11-22 |
TDP2 is a regulator of estrogen-responsive oncogene expression
2024-Jun, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcae016
PMID:38596431
|
研究论文 | 研究了TDP2在雌激素诱导的转录组中的作用，特别是其对TOP2依赖的转录调控的影响 | 揭示了TDP2在雌激素诱导的转录调控中的新作用，特别是在修复TOP2引起的断裂中的作用 | 研究主要集中在TDP2缺陷细胞和老鼠模型上，可能需要进一步验证在其他模型中的适用性 | 探讨TDP2在雌激素受体诱导的转录调控中的作用 | TDP2在雌激素诱导的转录调控中的作用及其对特定致癌基因表达的调控 | NA | NA | RNA-seq | NA | RNA | TDP2缺陷细胞和老鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2024-11-20 |
Development of a Spectral Flow Cytometry Analysis Pipeline for High-Dimensional Immune Cell Characterization
2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.19.599633
PMID:38948780
|
研究论文 | 本文开发了一种用于高维免疫细胞表征的光谱流式细胞术分析管道 | 引入了一种新的分析管道，改进了光谱流式细胞术数据的分析，并将其应用于识别衰老中的稀有T细胞群体 | NA | 开发和验证一种用于高维免疫细胞表征的光谱流式细胞术分析方法 | 年轻和老年雌性小鼠的脾细胞中的T细胞群体 | 生物信息学 | NA | 光谱流式细胞术 | NA | 细胞数据 | 11个脾脏中的3,776,804个T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2024-11-14 |
Differential CpG methylation at Nnat in the early establishment of beta cell heterogeneity
2024-Jun, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06123-6
PMID:38512414
|
研究论文 | 研究探讨了Nnat基因在β细胞异质性早期建立中的差异CpG甲基化机制 | 首次揭示了Nnat基因的差异甲基化在β细胞异质性建立中的作用 | NA | 探讨β细胞异质性建立的分子机制 | 胰腺β细胞及其亚群 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、亲和纯化质谱分析、钙成像 | NA | RNA、蛋白质 | 转基因小鼠和db/db小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-11-11 |
Ephrin Forward Signaling Controls Interspecies Cell Competition in Pluripotent Stem Cells
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.02.597057
PMID:38895424
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研究论文 | 研究探讨了在小鼠和人类多能干细胞共培养中，Ephrin A配体在小鼠细胞中如何通过信号传导导致相邻的人类细胞死亡的机制 | 开发了一种跨物种细胞接触报告系统，揭示了Ephrin A配体在跨物种多能干细胞竞争中的关键作用 | NA | 阐明跨物种多能干细胞竞争在早期胚胎发生中的关键机制，并为在动物中生成人类化组织或器官开辟新途径 | 小鼠和人类多能干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-11-09 |
Early Injury Landscape in Vein Harvest by Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323939
PMID:38808504
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应 | 首次应用单细胞和空间转录组学技术研究静脉病理，揭示了静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应及其分子机制 | 研究仅在犬模型中进行，结果的普适性需进一步验证 | 阐明静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应，识别潜在的治疗靶点 | 静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应及其分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 4只犬 | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-11-09 |
Study on the mechanism of heterogeneous tumor-associated macrophages in three subtypes of breast cancer through the integration of single-cell RNA sequencing and in vitro experiments
2024-Jun-01, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09665-5
PMID:38824268
|
研究论文 | 研究了异质性肿瘤相关巨噬细胞在三种乳腺癌亚型中的机制，通过单细胞RNA测序和体外实验的整合 | 揭示了异质性肿瘤相关巨噬细胞在不同乳腺癌亚型中的作用机制，并通过特定的配体-受体对调控下游通路 | NA | 阐明肿瘤相关巨噬细胞在三种乳腺癌亚型中的作用 | 三种乳腺癌亚型（三阴性乳腺癌、腔内型和HER2型）中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种乳腺癌细胞系（MDA-MB-231、MCF-7和SKBR3）和巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-11-08 |
Elucidating the role of liver enzymes as markers and regulators in ovarian cancer: a synergistic approach using Mendelian randomization, single-cell analysis, and clinical evidence
2024-06-24, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00642-4
PMID:38915066
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研究论文 | 研究肝酶作为卵巢癌标志物和调节因子的作用，通过孟德尔随机化、单细胞分析和临床证据的协同方法 | 首次通过孟德尔随机化和单细胞转录组学分析，揭示了碱性磷酸酶和天冬氨酸氨基转移酶与卵巢癌的因果关系，并提出它们作为保护因子的作用 | 研究主要基于基因组关联研究和单细胞数据，缺乏大规模临床试验验证 | 探讨肝酶与卵巢癌的关联，验证其作为生物标志物的潜力及其在卵巢癌中的机制 | 碱性磷酸酶、天冬氨酸氨基转移酶等肝酶，以及卵巢癌细胞和组织 | NA | 卵巢癌 | 孟德尔随机化、单细胞转录组学分析 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | 283个单核苷酸多态性位点和209个与碱性磷酸酶和天冬氨酸氨基转移酶相关的单核苷酸多态性位点，以及卵巢癌患者和健康个体的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-11-08 |
SARS-CoV-2 infection modifies the transcriptome of the megakaryocytes in the bone marrow
2024-06-11, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023012367
PMID:38522092
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2感染对骨髓中巨核细胞转录组的影响 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染在系统性炎症期间对骨髓巨核细胞转录组的显著影响，并发现这些变化与细胞靠近窦状血管的距离无关 | 研究仅限于小鼠模型，未检测到SARS-CoV-2 RNA在骨髓中的存在 | 探究SARS-CoV-2感染是否会影响骨髓中巨核细胞的转录组 | 骨髓中的巨核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 空间转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 健康小鼠和COVID-19小鼠的骨髓巨核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2024-11-08 |
Development of novel lysosome-related signatures and their potential target drugs based on bulk RNA-seq and scRNA-seq for diabetic foot ulcers
2024-06-11, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00629-1
PMID:38862997
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研究论文 | 本研究通过bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，识别了与糖尿病足溃疡（DFU）相关的1393个差异表达基因（DEGs），并利用机器学习算法筛选出CLU、RABGEF1和ENPEP作为DFU的新型溶酶体相关分子标志物，并验证了其诊断性能。此外，通过靶向这些标志物，发现了latamoxef、parthenolide、meclofenoxate和lomustine作为潜在的抗DFU药物。 | 本研究首次通过bulk RNA-seq和scRNA-seq数据结合机器学习算法，识别出CLU、RABGEF1和ENPEP作为DFU的新型溶酶体相关分子标志物，并发现了潜在的抗DFU药物。 | 本研究主要基于GEO数据库中的数据进行分析，未涉及临床试验验证，因此结果的临床应用仍需进一步验证。 | 识别糖尿病足溃疡（DFU）的新型分子标志物和潜在治疗药物，以改善DFU患者的预后和降低致残率。 | 糖尿病足溃疡（DFU）及其相关分子标志物和治疗药物。 | 数字病理学 | 糖尿病 | RNA-seq | 人工神经网络 | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |