单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 563 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-05 |
Identification of New Chemoresistance-Associated Genes in Triple-Negative Breast Cancer by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2024-Jun-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25136853
PMID:38999963
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析识别了与三阴性乳腺癌化学耐药相关的新基因 | 首次揭示了三阴性乳腺癌细胞中转录异质性的显著性，并通过scRNA-seq识别了稀有的抗药性相关细胞亚群 | 未能明确所有机制，特别是在其他亚群中的耐药基因的作用 | 揭示三阴性乳腺癌中化疗耐药的转录特征 | 三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了多种三阴性乳腺癌细胞样本，具体样本数量未说明 |
| 222 | 2024-08-05 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-Jun-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
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研究论文 | 本研究探讨了KRAS靶向疗法对肿瘤微环境的影响。 | 提出将SOS1和MEK抑制联合用于改善免疫疗法反应的新策略。 | 缺乏持久反应，且肿瘤微环境仍然高度免疫抑制。 | 研究KRAS抑制如何影响肿瘤微环境以增强抗肿瘤效果。 | 使用KrasG12D、p53突变的鼠源性胰腺导管腺癌细胞系进行研究。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞系 | 使用多种KPCY细胞系进行实验 |
| 223 | 2024-08-05 |
Cabergoline targets multiple pathways to inhibit PRL secretion and increases stromal fibrosis
2024-Jun-05, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvae055
PMID:38781434
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研究论文 | 本研究揭示了CABergoline对人类泌乳素瘤及其微环境中细胞的影响机制 | 首次描述了CABergoline治疗后CD8+ T细胞的激活，这在之前并未被认识 | 研究样本量较小，仅分析了5个手术切除的泌乳素瘤 | 探究多巴胺激动剂治疗在人类泌乳素瘤肿瘤及其邻近间质和免疫细胞中的作用机制 | 研究对象为手术切除的泌乳素瘤及其微环境中的细胞 | 数字病理学 | 泌乳素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 5个手术切除的泌乳素瘤样本 |
| 224 | 2024-08-04 |
Glycolysis in hepatic stellate cells coordinates fibrogenic extracellular vesicle release spatially to amplify liver fibrosis
2024-Jun-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn5228
PMID:38941469
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研究论文 | 本文揭示了肝星状细胞的糖酵解如何空间性调节纤维生成性细胞外囊泡的释放以增强肝纤维化 | 本研究首次展示了肝星状细胞特异性遗传抑制糖酵解会减少肝纤维化，并揭示了纤维化介导的细胞外囊泡相关通路的空间特征 | 本文没有详细探讨其他细胞类型在糖酵解对肝纤维化影响中的作用 | 研究糖酵解在肝星状细胞如何通过特定组织区间通路协调纤维化的作用 | 研究对象为肝星状细胞及其在肝纤维化中的功能 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 空间转录组学 | NA | NA | 糖酵解缺乏小鼠及糖酵解正常小鼠的EV样本 |
| 225 | 2024-08-04 |
Action of circulating and infiltrating B cells in the immune microenvironment of colorectal cancer by single-cell sequencing analysis
2024-Jun-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i6.2683
PMID:38994150
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨了循环和浸润B细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 | 该研究揭示了结直肠癌中B细胞的异质性及其在肿瘤免疫中的功能差异 | 样本量相对较小，仅涉及23名结直肠癌患者，可能影响结果的普适性 | 探讨结直肠癌免疫微环境中循环和浸润B细胞亚群的作用 | 分析来自23名CRC患者的肿瘤、正常和外周血样本中的B细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 样本 | 69个样本（包括正常、肿瘤和外周血样本） |
| 226 | 2024-08-05 |
Immunological and microbial shifts in the aging rhesus macaque lung during nontuberculous mycobacterial infection
2024-Jun-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00829-24
PMID:38771046
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研究论文 | 本研究比较了年轻和老年猕猴在非结核分枝杆菌感染中的免疫和微生物变化 | 本研究揭示了老年猕猴对非结核分枝杆菌感染的免疫反应增强，提供了对人类年龄相关疾病机制的新见解 | 缺乏对非人灵长类动物的更大样本量的研究，可能限制了结果的广泛适用性 | 探究老年猕猴在非结核分枝杆菌感染过程中免疫和微生物的变化 | 研究对象为三只年轻和两只老年的猕猴 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据，免疫细胞反应数据 | 五只猕猴（两只年轻雌性，一只年轻雄性，两个老年雌性） |
| 227 | 2024-08-05 |
Phenotypic and transcriptional changes in peripheral blood mononuclear cells during alphavirus encephalitis in mice
2024-Jun-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00736-24
PMID:38695564
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研究论文 | 本研究利用小鼠Sindbis病毒感染模型探讨外周血单核细胞在病毒脑炎中的表型和转录组变化 | 首次将单细胞RNA测序与流式细胞术结合，系统分析了小鼠外周血单核细胞的转录和表型变化 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 研究SINV感染对小鼠外周血单核细胞的影响，以理解病毒脑炎的免疫机制 | SINV感染的小鼠，特别是其外周血单核细胞及中枢神经系统内的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA |
| 228 | 2024-08-05 |
Spatial genomic, biochemical and cellular mechanisms underlying meningioma heterogeneity and evolution
2024-Jun, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01747-1
PMID:38760638
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研究论文 | 研究了影响脑膜瘤内部异质性及其演化的空间基因组、 Biochemical 和细胞机制 | 通过空间方法揭示出驱动高等级脑膜瘤内部异质性的基因和蛋白表达程序 | 对驱动内部异质性的可针对机制理解不足 | 揭示脑膜瘤内部异质性与其分子、时间和空间演化之间的联系 | 高等级脑膜瘤和其复发样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR干扰 | NA | 空间转录组 | 配对的原发和复发脑膜瘤样本 |
| 229 | 2024-08-05 |
Endothelial Cell Flow-Mediated Quiescence Is Temporally Regulated and Utilizes the Cell Cycle Inhibitor p27
2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320671
PMID:38602102
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研究论文 | 这篇文章研究了内皮细胞如何通过血流诱导的机制转变为静止状态，并分析了相关的基因表达调控 | 文章揭示了内皮细胞流动介导的静止状态的独特特性和时间调控机制，并强调了p27在调节静止深度中的重要作用 | 主要研究集中在特定的模拟血流条件下，未必能全面反映真实生理状态下的细胞反应 | 探讨内皮细胞在血流影响下的静止状态调控机制 | 主要研究人类内皮细胞，并使用小鼠和斑马鱼作为模型来分析其细胞周期调节 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 主要使用人类内皮细胞，小鼠和斑马鱼模型的相应细胞样本 |
| 230 | 2024-08-04 |
Identification and validation of Cystatin A as a novel promising therapeutic target for gastric cancer
2024-Jun-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-941
PMID:38989439
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研究论文 | 本研究确定并验证了Cystatin A作为胃癌的新型有前景的治疗靶点 | 本研究通过生物信息学技术识别与胃癌复发无生存期相关的11个基因，并探讨了Cystatin A对信号通路和治疗的影响 | 研究尚未深入探索其他潜在的预后相关基因，可能忽略了一些重要因素 | 揭示胃癌发展的分子机制并确认新的预后靶点 | 胃癌患者的基因和单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 生物信息学技术、单细胞测序、免疫组织化学 | LASSO-Cox模型 | 基因数据 | 涉及胃癌患者的TCGA-STAD和GSE54129数据集 |
| 231 | 2024-08-05 |
Role of TAP1 in the identification of immune-hot tumor microenvironment and its prognostic significance for immunotherapeutic efficacy in gastric carcinoma
2024-Jun-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-28
PMID:38989426
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研究论文 | 本研究探讨了TAP1在胃癌免疫炎症微环境中的作用及其对免疫治疗效果的预后意义 | 本研究揭示了TAP1与免疫特征之间的积极相关性，并将其作为反映炎性肿瘤微环境和免疫反应的新生物标志物 | 未能发现TAP1表达与不同临床病理特征显著相关性，表明其对分子亚型并不特异 | 本研究旨在阐明TAP1表达与免疫特征的关联，并利用其作为反映免疫治疗反应的生物标志物 | 研究对象为胃癌患者及其肿瘤微环境特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA-STAD队列和GEO门户的数据 |
| 232 | 2024-08-05 |
Optimizing single-cell RNA sequencing methods for human colon biopsies: droplet-based vs. picowell-based platforms
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600526
PMID:38979379
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研究论文 | 本研究比较了两种单细胞RNA测序平台在处理人类结肠活检样本时的效果 | 本研究首次系统比较了滴液基础与微井基础单细胞RNA测序平台在结肠活检样本中的应用差异 | 研究样本数量有限，仅涉及两名成人的活检样本 | 评估和优化人类结肠活检的单细胞RNA测序方法 | 来源于两名成人结肠的内镜直肠-乙状结肠黏膜活检细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 2名成人的结肠活检样本 |
| 233 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell and bulk RNA-seq analyses reveal a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature in ovarian cancer
2024-06-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205966
PMID:38925650
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研究论文 | 本文通过单细胞测序分析开发了一个新的CD8+ T细胞相关预后模型，应用于卵巢癌 | 开发了基于CD8 T细胞标记的新颖预后模型，并首次深入探索了CD8 T细胞在卵巢癌中的预后作用 | 未提供具体的样本大小及样本来源的细节 | 探讨CD8 T细胞在卵巢癌中的预后作用，并开发相应的预后模型 | 卵巢癌患者的CD8 T细胞及其相关预后 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归与LASSO回归 | NA | NA |
| 234 | 2024-08-04 |
Characterization of tumor endothelial cells (TEC) in gastric cancer and development of a TEC-based risk signature using single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data
2024-06-12, Aging
DOI:10.18632/aging.205928
PMID:38870270
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研究论文 | 本研究旨在阐明胃癌中的肿瘤内皮细胞（TEC）特征，并构建基于TEC的预后风险模型以预测患者的临床结果 | 本研究首次发现了胃癌中的5个TEC簇，并构建了一个包含8个基因的风险标记，与肿瘤免疫细胞浸润相关联 | 研究未阐明该风险标记在其他类型癌症中的适用性 | 探讨胃癌中肿瘤内皮细胞的特征及其在预后中的重要性 | 胃癌患者的肿瘤内皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和总体RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 3302个不同表达基因（DEGs） |
| 235 | 2024-08-04 |
ST-CellSeg: Cell segmentation for imaging-based spatial transcriptomics using multi-scale manifold learning
2024-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012254
PMID:38935799
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研究论文 | 提出了一种基于影像的机器学习方法ST-CellSeg，用于空间转录组的细胞分割 | ST-CellSeg在多尺度信息的考虑上具有创新性，利用流形进行细胞分割 | 尚未提及具体的局限性 | 研究空间转录组数据中的细胞分割问题 | 针对具有不同形状的空间转录组细胞进行分割 | 数字病理学 | NA | 机器学习 | NA | 影像 | 在选定数据集中明显优于基线模型的算法评估 |
| 236 | 2024-08-05 |
Genomic characteristics of adipose-derived stromal cells induced into neurons based on single-cell RNA sequencing
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33079
PMID:38984299
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪来源的基质细胞（ADSCs）诱导分化为神经元的基因组特征 | 阐明了ADSCs分化为神经元的分子机制及基因组特性 | 对ADSCs诱导分化的分子机制了解不足 | 研究脂肪来源的基质细胞向神经元分化的表观遗传学机制 | 成年ADSCs群体及不同诱导时间组的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七个时间点的样本 |
| 237 | 2024-08-04 |
AraLeTA: An Arabidopsis leaf expression atlas across diurnal and developmental scales
2024-Jun-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae117
PMID:38428997
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研究论文 | 本文构建了拟南芥叶片在日间和发育时间尺度上细胞类型特异性基因表达的地图 | 结合了单细胞RNA测序数据与整叶时间序列数据，揭示了不同细胞类型在时间上的转录本浓度变化 | 虽然进一步的细胞类型特征分析得到了加强，但依然无法完全消除整叶RNA测序的平均基因表达值的局限性 | 研究拟南芥叶片不同细胞类型基因表达随时间变化的模式 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana）叶片的不同细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 238 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics in cancer research and potential clinical impact: a narrative review
2024-Jun-08, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05816-0
PMID:38850363
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综述 | 本综述总结了空间转录组学在癌症研究中的应用及其潜在临床影响 | 空间转录组学提供了肿瘤微环境的新见解，并能够捕捉肿瘤异质性和多灶性 | 缺乏针对临床应用中的空间信息整合的深度分析 | 探索空间转录组学在精准肿瘤学及肿瘤研究中的应用 | 主要关注固体肿瘤的现有空间转录组学研究 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学（ST） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 239 | 2024-08-04 |
Endothelial cell signature in muscle stem cells validated by VEGFA-FLT1-AKT1 axis promoting survival of muscle stem cell
2024-Jun-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73592
PMID:38842166
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研究论文 | 该研究揭示了内皮细胞转录本在肌肉干细胞生存中的作用 | 本研究通过揭示肌肉干细胞行为如何受特定内皮细胞转录本影响，挑战了他们具有不同基因特征的传统观点 | 本研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类肌肉干细胞 | 探讨内皮细胞标记物在肌肉干细胞中的表达及其对存活的影响 | 成年肌肉干细胞及其与内皮细胞的信号通路的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠肌肉干细胞 |
| 240 | 2024-08-04 |
Mapping the immune cell landscape of severe atopic dermatitis by single-cell RNA-seq
2024-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16121
PMID:38817208
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了严重特应性皮炎患者的免疫细胞景观 | 本研究揭示了严重特应性皮炎中内源性免疫细胞的显著变化，尤其是与疾病严重程度相关的特定免疫细胞亚群 | 需进一步研究这些免疫细胞变化对疾病发病机制的影响以及潜在治疗靶点的有效性 | 分析严重特应性皮炎（AD）患者全身免疫景观的综合特征 | 来自12名严重特应性皮炎患者和6名健康对照者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 12名严重AD患者和6名健康对照者，分析超过30万个外周血单核细胞 |