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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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221 | 2024-09-06 |
A Novel Mechanism of MSCs Responding to Occlusal Force for Bone Homeostasis
2024-06, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241236120
PMID:38665065
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研究论文 | 研究了咬合力对骨稳态的影响机制,特别是MSC在失去咬合力后对牙槽骨的影响 | 首次揭示了咬合力通过Yap/Taz/Ptn轴调控MSC介导的血管生成,从而维持牙槽骨稳态的机制 | 研究仅在鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨失去咬合力后牙槽骨损失的机制 | 鼠牙槽骨中的非造血细胞(CD45细胞) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鼠牙槽骨中的非造血细胞 |
222 | 2024-09-06 |
Single cell transcriptomics reveals distinct transcriptional responses to oxycodone and buprenorphine by iPSC-derived brain organoids from patients with opioid use disorder
2024-Jun, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01837-8
PMID:36302966
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组学分析了来自阿片类药物使用障碍患者的iPSC衍生的脑类器官对羟考酮和丁丙诺啡的不同转录反应 | 首次在单细胞水平上揭示了羟考酮和丁丙诺啡对iPSC衍生的脑类器官的不同转录反应,特别是丁丙诺啡对胶质细胞的显著影响和羟考酮诱导的I型干扰素信号 | 研究仅限于男性OUD患者,样本量较小,且仅进行了7天的药物处理 | 探讨阿片类药物对脑细胞类型功能的单细胞水平调控机制 | 来自阿片类药物使用障碍患者的iPSC衍生的脑类器官 | 单细胞转录组学 | 阿片类药物使用障碍 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | Seurat整合分析管道 | 转录组数据 | 3名男性OUD患者 |
223 | 2024-09-05 |
Oncogenic Cell Tagging and Single-Cell Transcriptomics Reveal Cell Type-Specific and Time-Resolved Responses to Vhl Inactivation in the Kidney
2024-Jun-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3248
PMID:38502859
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研究论文 | 本研究通过肿瘤细胞标记和单细胞转录组学技术,纵向研究了von Hippel Lindau (VHL)肿瘤抑制基因失活对肾脏细胞类型特异性及时间解析反应的影响。 | 本研究采用了一种实验策略,即在细胞自然环境中生成携带遗传改变的细胞,进行标记并随时间分析,以理解致癌过程。 | NA | 旨在定义肿瘤发生初期的细胞反应,以理解癌症的起始。 | von Hippel Lindau (VHL)肿瘤抑制基因失活对肾脏细胞的影响。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
224 | 2024-09-01 |
Protein phosphatases regulate the formation of Müller glia-derived progenitor cells in the chick retina
2024-Jun, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103932
PMID:38679247
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了蛋白磷酸酶在正常和受损鸡视网膜中对穆勒胶质细胞向穆勒胶质源性前体细胞转化的调控作用 | 首次详细研究了蛋白磷酸酶在穆勒胶质细胞转化过程中的作用,并揭示了不同磷酸酶对前体细胞形成的不同影响 | 研究主要集中在鸡视网膜模型,可能需要进一步在其他物种中验证结果 | 探讨蛋白磷酸酶在视网膜中对穆勒胶质细胞向穆勒胶质源性前体细胞转化的调控作用 | 鸡视网膜中的穆勒胶质细胞及其前体细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个类型的视网膜神经元及穆勒胶质细胞和穆勒胶质源性前体细胞 |
225 | 2024-09-01 |
Macrophages upregulate mural cell-like markers and support healing of ischemic injury by adopting functions important for vascular support
2024-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00478-0
PMID:39196227
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞在缺血性损伤后是否采取壁细胞表型,以促进组织修复 | 首次通过单细胞RNA测序证实巨噬细胞在缺血性肌肉中向壁细胞转变,并发现这一转变对血管成熟和功能恢复至关重要 | 研究主要在鼠模型中进行,未来需在人类样本中验证这些发现 | 探究巨噬细胞在缺血性损伤后的功能转变及其对组织修复的影响 | 巨噬细胞在缺血性肌肉中的表型转变及其功能相关性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鼠肌肉中的巨噬细胞 |
226 | 2024-08-30 |
A practical guide to spatial transcriptomics
2024-06, Molecular aspects of medicine
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.mam.2024.101276
PMID:38776574
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综述 | 本文是一篇关于空间转录组学的实用指南,旨在为研究人员提供关于已商业化的技术及其应用的最新信息 | 介绍了空间转录组学领域的快速发展及其在多个学科中的应用,特别是已商业化的技术 | 文章主要关注已商业化的技术,可能未涵盖所有新兴技术 | 为研究人员提供空间转录组学技术的基本原理、数据分析挑战、实验考虑因素以及方法选择指南 | 空间转录组学技术及其在生物学和疾病研究中的应用 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
227 | 2024-08-29 |
SLC45A3 Serves as a Potential Therapeutic Biomarker to Attenuate White Matter Injury After Intracerebral Hemorrhage
2024-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-023-01145-5
PMID:36913120
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研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析和单细胞RNA测序,确定SLC45A3基因在脑出血后白质损伤中的作用,并验证其作为治疗靶点的潜力。 | 首次确定SLC45A3基因在脑出血后白质损伤中的关键作用,并提出其作为治疗靶点的可能性。 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步的人体临床试验验证。 | 探讨脑出血后白质损伤的分子机制及潜在治疗靶点。 | 脑出血后的白质损伤及SLC45A3基因的功能。 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、扩散张量成像 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 两个数据集(GSE24265和GSE125512)及单细胞RNA测序数据(GSE167593) |
228 | 2024-08-24 |
Integrated Analysis Construct a Tumor-Associated Macrophage Novel Signature with Promising Implications in Predicting the Prognosis and Immunotherapeutic Response of Gastric Cancer Patients
2024-Jun, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-024-08365-1
PMID:38573378
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研究论文 | 本研究通过综合分析构建了一个与肿瘤相关巨噬细胞(TAM)相关的新型风险特征,用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 开发了一个基于TAM的九基因风险特征,能够准确预测胃癌的预后,并为临床诊断、预测和免疫治疗提供新的视角 | NA | 研究TAM在胃癌中的特征,并开发基于TAM的风险特征以预测胃癌患者的预后 | 胃癌患者的肿瘤相关巨噬细胞(TAM)及其相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA |
229 | 2024-08-23 |
Differential expression and prognostic value of TLR4 in kidney renal clear cell carcinoma
2024-Jun, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2024.101959
PMID:38579915
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据结合体外研究,评估了TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其预后价值 | 首次详细探讨了TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系,并发现TLR4在女性患者中具有保护作用 | 研究仅在特定细胞系和性别中进行了分析,可能需要更多的样本和性别来验证结果 | 评估TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其预后价值 | TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
230 | 2024-08-23 |
Bone marrow CD8+ Trm cells induced by IL-15 and CD16+ monocytes contribute to HSPC destruction in human severe aplastic anemia
2024-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110223
PMID:38636890
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了严重再生障碍性贫血(SAA)患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞(PBMCs)和骨髓单个核细胞(BMMCs),发现骨髓中的CD8 Trm细胞通过高表达IFN-γ和FasL,增强了对造血干细胞和祖细胞(HSPCs)的诱导凋亡能力。 | 首次揭示了IL-15诱导的CD8 Trm细胞在SAA患者中作为病理性细胞,介导HSPC破坏的机制。 | NA | 探究严重再生障碍性贫血(SAA)中T细胞诱导的造血干细胞和祖细胞(HSPCs)破坏的机制。 | 严重再生障碍性贫血(SAA)患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞(PBMCs)和骨髓单个核细胞(BMMCs)。 | NA | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 严重再生障碍性贫血(SAA)患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞(PBMCs)和骨髓单个核细胞(BMMCs) |
231 | 2024-08-22 |
SLC44A2 regulates vascular smooth muscle cell phenotypic switching and aortic aneurysm
2024-Jun-25, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173690
PMID:38916960
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研究论文 | 本文研究了SLC44A2在血管平滑肌细胞表型转换和主动脉瘤中的作用 | 首次揭示了SLC44A2通过与NRP1和ITGB3相互作用激活TGF-β/SMAD信号通路,从而调控血管平滑肌细胞的表型转换 | NA | 探讨SLC44A2在主动脉瘤中的作用及其机制 | SLC44A2在血管平滑肌细胞中的表达及其对主动脉瘤的影响 | 心血管疾病 | 主动脉瘤 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括腹主动脉瘤患者和Ang II诱导的Apoe-/-小鼠的主动脉组织 |
232 | 2024-08-21 |
Deletion of Fbxw7 in oocytes causes follicle loss and premature ovarian insufficiency in mice
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18487
PMID:39031722
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研究论文 | 研究FBXW7基因在卵母细胞中的缺失如何导致小鼠卵泡丢失和卵巢功能早衰 | 首次证明了FBXW7在卵巢中的功能,揭示了其在卵泡发生和卵巢功能中的重要作用 | NA | 探讨FBXW7基因在卵巢功能早衰中的作用 | 小鼠卵母细胞中的FBXW7基因 | NA | 女性不孕症 | 单细胞RNA测序和原位杂交 | NA | RNA | NA |
233 | 2024-08-19 |
Complex immune microenvironment of chordoma: a road map for future treatment
2024-Jun-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009313
PMID:38908855
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序等技术,深入分析了脊索瘤的复杂免疫微环境,并探讨了免疫治疗在该疾病中的应用前景 | 首次采用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,结合CellChat和基因集变异分析,全面解析了脊索瘤的免疫微环境 | 研究样本量较小,仅包括126名脊索瘤患者和6名患者的单细胞RNA测序数据 | 探讨脊索瘤的免疫微环境特征及其对免疫治疗效果的影响 | 脊索瘤的免疫微环境及其对患者预后的影响 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | 126名脊索瘤患者和6名患者的单细胞RNA测序数据 |
234 | 2024-08-18 |
MD-ALL: an integrative platform for molecular diagnosis of B-acute lymphoblastic leukemia
2024-06-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283706
PMID:37981856
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research paper | 介绍了一个名为MD-ALL的综合平台,用于基于基因表达谱和RNA测序数据中的关键遗传改变进行B-急性淋巴细胞白血病的敏感和准确分类 | MD-ALL平台整合了RNA测序数据中的多种关键遗传改变,包括序列突变、大规模拷贝数变异和基因重排,以进行全面的B-ALL分类 | NA | 开发一个用户友好的B-ALL分类平台,实现集成、准确和全面的B-ALL亚型分类 | B-急性淋巴细胞白血病及其亚型分类 | machine learning | 血液病 | RNA-seq | machine learning algorithms | RNA-seq data | 2,955个B-ALL RNA-seq样本 |
235 | 2024-08-17 |
Advances and challenges in investigating B-cells via single-cell transcriptomics
2024-Jun, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2024.102443
PMID:38968762
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research paper | 本文探讨了通过单细胞转录组学研究B细胞的进展与挑战 | 利用单细胞RNA测序(scRNAseq)和VDJ分析,揭示了B细胞的中间状态及其在免疫反应中的保护作用 | 在研究跨组织的人类B细胞状态、空间位置与B细胞表型和功能的关系、抗体同型转换事件以及克隆关系的明确确定方面仍存在挑战 | 旨在通过单细胞转录组学技术深化对B细胞发育和分化的理解 | B细胞的中间状态、其在免疫反应中的作用以及克隆关系的确定 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
236 | 2024-08-16 |
Molecular cascade reveals sequential milestones underlying hippocampal neural stem cell development into an adult state
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114339
PMID:38852158
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研究论文 | 本研究通过靶向单细胞RNA测序分析,揭示了小鼠海马齿状回早期新生期神经干细胞发育为成年状态的分子级联反应 | 首次详细描述了神经干细胞从发育状态过渡到成年状态的多步骤过程及其关键里程碑,包括静息前自噬爆发和细胞活性氧水平升高 | NA | 揭示神经干细胞从发育状态过渡到成年状态的过程、里程碑和机制 | 小鼠海马齿状回中的神经干细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
237 | 2024-08-07 |
[Applications of single-cell RNA sequencing in chronic rhinosinusitis: the progress and prospect]
2024-Jun-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
238 | 2024-08-07 |
[Application and progress of single-cell RNA sequencing in chronic rhinosinusitis]
2024-Jun-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
239 | 2024-08-10 |
Age-associated reduction of sinus macrophages in human mesenteric lymph nodes
2024-Jun-27, Journal of clinical and experimental hematopathology : JCEH
IF:0.9Q4
DOI:10.3960/jslrt.24001
PMID:38462485
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研究论文 | 本研究评估了结直肠癌手术中切除的肠系膜淋巴结中窦状巨噬细胞(SMs)的分布情况,发现老年患者尤其是80岁以上患者中SMs显著减少 | 首次揭示了老年患者淋巴结中窦状巨噬细胞减少的现象,并探讨了其可能的免疫功能影响 | 研究仅基于手术中移除的肠系膜淋巴结样本,可能存在样本选择偏倚 | 探讨老年患者淋巴结中窦状巨噬细胞的分布及其与免疫功能的关系 | 肠系膜淋巴结中的窦状巨噬细胞 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
240 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Illuminates Thymic Development: An Updated Framework for Understanding Thymic Epithelial Tumors
2024-Jun-03, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyae046
PMID:38520743
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序技术对胸腺上皮肿瘤(TETs)的研究进展,探讨了胸腺发育和肿瘤形成的分子机制 | 利用单细胞分子 profiling 技术深入分析肿瘤细胞的分子特征,为胸腺上皮肿瘤的研究提供了新的视角 | 胸腺上皮肿瘤的罕见性限制了对肿瘤发生机制的深入研究和合理治疗方案的开发 | 探讨胸腺上皮肿瘤的生物学特性,加速开发针对这些罕见肿瘤的改进治疗策略 | 胸腺上皮肿瘤及其在胸腺发育和老化过程中的细胞多样性 | NA | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |