单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2024-08-05	Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma 2024-Jun-17, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06699-2 PMID:38886351	研究论文	本研究提出了一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略，显著提高了患者的抗肿瘤免疫反应	首次提出聚焦于SAMD4B-APOA2-PD-L1轴的协同免疫化疗，组合了三种常见抗肿瘤药物以提高肝细胞癌患者的三年生存率	缺乏更大规模临床试验的验证以及长期效果的数据	提高晚期肝细胞癌患者的预后和生存率	晚期肝细胞癌患者和PDX小鼠模型	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序、2'-O-甲基化修饰、多重免疫荧光染色	NA	文本	包括临床实践中的晚期肝细胞癌患者和PDX小鼠模型
202	2024-08-05	Comprehensive pan-cancer analysis of mitochondrial outer membrane permeabilisation activity reveals positive immunomodulation and assists in identifying potential therapeutic targets for immunotherapy resistance 2024-Jun, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.1735 PMID:38899748	研究论文	本研究深入探讨了肿瘤线粒体外膜通透性活动对免疫的影响	创新性地开发了MOMP特征（MOMP.Sig）以准确反映肿瘤MOMP活动，并使用机器学习模型展示了其临床预测价值	NA	明确肿瘤MOMP对免疫及免疫疗法效果的影响，指导更有效的免疫治疗策略	分析了包括30种癌症类型转录组和免疫疗法转录组在内的综合数据集	数字病理学	皮肤黑色素瘤和三阴性乳腺癌	scRNA-seq	机器学习模型	转录组数据	涉及30种癌症类型的转录组和20个免疫治疗转录组以及3个免疫治疗scRNA-seq数据集
203	2024-08-04	A bibliometric study of the intellectual base and global research hotspots for single-cell sequencing [2009-2022] in breast cancer 2024-Jun-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33219 PMID:39022007	研究论文	该研究总结并量化了与乳腺癌单细胞测序相关的研究动态和趋势	提供了关于乳腺癌单细胞测序的全面和公正的研究状态报告	当前缺乏对研究结果的深入分析，未来需更多跨国合作	研究乳腺癌单细胞测序的研究动态和热点	与乳腺癌单细胞测序相关的研究文章和评论	数字病理学	乳腺癌	单细胞测序	NA	文献数据	分析了583篇文章和评论
204	2024-08-04	Comprehensive analysis and experimental verification reveal the molecular characteristics of EGLN3 in pan-cancer and its relationship with the proliferation and apoptosis of lung cancer 2024-Jun-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33206 PMID:39021988	研究论文	这篇文章探讨了EGLN3在各种癌症中的分子特征及其在肺癌增殖和细胞凋亡中的作用	本研究首次全面分析了EGLN3在泛癌症中的表达模式及其与免疫细胞浸润的关系	本研究的局限性在于未能充分阐明EGLN3在不同癌症类型中的特异性作用	研究EGLN3在癌症中的生物功能及其临床意义	研究对象为EGLN3及其与肺癌细胞增殖和凋亡的关系	数字病理	肺癌	RNA-seq, 单细胞测序, 免疫荧光	NA	细胞数据	NA
205	2024-08-04	A Cullin 5-based complex serves as an essential modulator of ORF9b stability in SARS-CoV-2 replication 2024-Jun-28, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-024-01874-5 PMID:38937432	研究论文	本研究揭示了CUL5-TOM70-HSP90α复合体在SARS-CoV-2 ORF9b稳定性调控中的关键作用	首次识别CUL5-TOM70-HSP90α复合体作为ORF9b蛋白稳定性的关键调节因子	未提及该研究的具体限制	探讨SARS-CoV-2中ORF9b蛋白的调控机制	SARS-CoV-2 ORF9b蛋白及其变异株	病毒学	COVID-19	单细胞测序	NA	蛋白质	对COVID-19患者的肺上皮细胞进行研究
206	2024-08-05	Intense impact of IL-1β expressing inflammatory macrophages in acute aortic dissection 2024-06-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-65931-3 PMID:38937528	研究论文	本文探讨了IL-1β表达的炎症巨噬细胞对急性主动脉夹层的影响	首次识别了与急性主动脉夹层相关的新治疗靶点，尤其是IL-1β炎症巨噬细胞的作用	研究主要基于小鼠模型，可能与人类的病理机制存在差异	识别与炎症细胞相关的新治疗靶点	人类急性主动脉夹层样本和小鼠急性主动脉夹层模型	数字病理学	急性主动脉夹层	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	组织样本	人类样本和小鼠模型的数量未具体说明
207	2024-08-05	Farnesyltransferase inhibition overcomes oncogene-addicted non-small cell lung cancer adaptive resistance to targeted therapies 2024-Jun-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49360-4 PMID:38937474	研究论文	本研究探讨了磷酸酰基转移酶抑制剂在克服非小细胞肺癌适应性抗药性方面的作用	该研究揭示了药物适应的共同路径和早期抗药性细胞的特征，并确定了FTI作为有效的治疗组合	研究中对分子事件的动力学和序列了解仍然不足	研究如何克服非小细胞肺癌对靶向疗法产生的适应性抗药性	包括EGFR、ALK、BRAF和KRAS突变的非小细胞肺癌细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序、实时细胞周期动态监测	NA	细胞	广泛的肿瘤细胞系，包括多种突变类型
208	2024-08-04	The Absence of Intra-Tumoral Tertiary Lymphoid Structures is Associated with a Worse Prognosis and mTOR Signaling Activation in Hepatocellular Carcinoma with Liver Transplantation: A Multicenter Retrospective Study 2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202309348 PMID:38498682	研究论文	本研究探讨了肝细胞癌（HCC）患者中肿瘤内三级淋巴结构的缺失如何与更差的预后及mTOR信号通路激活相关	首次探讨了通过放射学非侵入性预测肝脏移植后的肝细胞癌中的肿瘤内三级淋巴结构的可能性，并建立了相应的分类器	该研究的局限性在于为回顾性研究，可能存在选择偏倚和数据的局限性	研究肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的存在对预后的影响	肝细胞癌患者，尤其是接受肝脏移植的患者	数字病理学	肝癌	RNA测序	分类器	肿瘤组织样本	最大 cohort，包括多名肝细胞癌患者
209	2024-08-05	miR-124-3p and miR-194-5p regulation of the PI3K/AKT pathway via ROR2 in medulloblastoma progression 2024-Jun, Cancer gene therapy IF:4.8Q1 DOI:10.1038/s41417-024-00762-y PMID:38632356	研究论文	该文章探讨了miR-124-3p和miR-194-5p通过ROR2调控PI3K/AKT通路在髓母细胞瘤进展中的作用	揭示了miR-124-3p和miR-194-5p作为肿瘤抑制因子的作用及其在髓母细胞瘤中的潜在治疗靶点	对miRNAs在髓母细胞瘤肿瘤发生中的具体作用尚不明确	研究miR-124-3p和miR-194-5p在髓母细胞瘤进展中的调控机制	关注miR-124-3p、miR-194-5p及ROR2在髓母细胞瘤组织和细胞系中的表现	数字病理学	髓母细胞瘤	单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫荧光、Western blot	NA	生物组织样本	NA
210	2024-08-04	Liver cancer from the perspective of single-cell sequencing: a review combined with bibliometric analysis 2024-Jun-24, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-024-05855-7 PMID:38910204	综述	本研究通过文献计量学分析，全面概述了单细胞测序在肝癌研究中的知识结构和研究热点	这项研究是首次综合总结单细胞测序在肝癌应用的研究趋势和发展	具体的局限性未在摘要中提及	提供单细胞测序在肝癌研究领域的知识结构和研究热点的概述	与单细胞测序技术在肝癌研究中的应用相关的文献	数字病理学	肝癌	单细胞测序	NA	文献	331篇相关出版物
211	2024-08-05	Leveraging Integrated RNA Sequencing to Decipher Adrenomedullin's Protective Mechanisms in Experimental Bronchopulmonary Dysplasia 2024-Jun-19, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes15060806 PMID:38927741	研究论文	本研究旨在阐明肾上腺髓质素在实验性支气管肺发育不良中的保护机制	本研究整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了肾上腺髓质素缺乏与炎症、自然杀伤细胞频率增加及内皮细胞和二型肺泡细胞频率下降之间的关系	本研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类情况	阐明肾上腺髓质素对支气管肺发育不良病理机制的影响	使用LPS诱导的小鼠实验模型研究肾上腺髓质素的作用	数字病理学	肺部疾病	RNA测序	NA	基因表达数据	包含肾上腺髓质素足量（野生型或基因敲除）和肾上腺髓质素单倍缺失（haplodeficient）小鼠的肺组织样本
212	2024-08-04	LHFPL2 Serves as a Potential Biomarker for M2 Polarization of Macrophages in Renal Cell Carcinoma 2024-Jun-18, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25126707 PMID:38928412	研究论文	本文探讨了LHFPL2在肾细胞癌中作为巨噬细胞M2极化的潜在生物标志物的作用	揭示了LHFPL2与肾细胞癌及其在巨噬细胞M2极化中的关系，并提出了潜在的靶向药物	尚未在体外或临床试验中验证LHFPL2作为生物标志物的有效性	研究LHFPL2在肾细胞癌中对巨噬细胞极化的影响及其作为癌症治疗靶点的潜力	研究对象为609名肾透明细胞癌患者的转录组数据及34,326个肾癌细胞的单细胞测序数据	数字病理学	肾癌	转录组测序和单细胞测序	NA	基因表达数据	609名KIRC患者和34,326个肾癌细胞
213	2024-08-05	Identifying the protective effects of miR-874-3p/ATF3 axis in intervertebral disc degeneration by single-cell RNA sequencing and validation 2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.18492 PMID:38890795	研究论文	本文探讨了miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的保护作用	首次揭示miR-874-3p通过靶向ATF3调控椎间盘退变的病理过程	仅在实验室环境和动物模型中验证，临床应用尚需进一步研究	研究miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的作用及机制	椎间盘退变患者和椎间盘退变大鼠模型	数字病理	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	包含椎间盘退变患者和多种细胞类型的椎间盘退变大鼠样本
214	2024-08-05	Single-cell transcriptome profiling highlights the importance of telocyte, kallikrein genes, and alternative splicing in mouse testes aging 2024-06-26, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-65710-0 PMID:38926537	研究论文	该研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠睾丸衰老过程中包头细胞和卡利克林基因的重要性	首次探讨了睾丸包头细胞和卡利克林基因在小鼠睾丸衰老中的作用，及其细胞类型特异性的可变剪接动态	本研究仅基于小鼠模型，未来需要在其他物种中验证结果	深入理解睾丸衰老过程中的转录组变化	年轻和老年小鼠的睾丸单细胞	数字病理	NA	转录组测序	NA	基因表达数据	43323个睾丸单细胞
215	2024-08-05	Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression 2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England) DOI:10.1186/s13014-024-02472-z PMID:38926892	研究论文	本研究通过单细胞转录分析揭示了辐射皮肤中成纤维细胞亚群的变化及洞穴蛋白表达的变异性	本研究介绍了洞穴蛋白参与的一个新途径，可能对辐射损伤后的纤维化发展有贡献	当前研究的样本量有限，仅包含六名患者的皮肤样本	研究辐射损伤后皮肤纤维化的细胞机制	对六名接受乳腺重建手术的女性患者的辐射和非辐射皮肤样本进行分析	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	组织样本	6名女性患者的皮肤样本
216	2024-08-05	Cbl and Cbl-b ubiquitin ligases are essential for intestinal epithelial stem cell maintenance 2024-Jun-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109912 PMID:38974465	研究论文	这篇文章展示了Cbl和Cbl-b泛素连接酶对肠上皮干细胞维持的重要性	揭示了Cbl家族泛素连接酶在调节肠上皮干细胞和分化之间平衡的作用	本研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类肠上皮干细胞的验证	探讨Cbl和Cbl-b在肠上皮干细胞维持中的功能	Lgr5+肠干细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序、LacZ谱系追踪	NA	RNA数据	NA
217	2024-08-05	Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Spatial Heterogeneity and Functional Alteration of Endothelial Cells in Chronic Hepatitis B Infection 2024-Jun-27, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25137016 PMID:39000126	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序分析慢性乙型肝炎感染小鼠肝脏中的内皮细胞的空间异质性和功能改变。	揭示了内皮细胞的三种亚群体在慢性乙型肝炎感染中的功能变化及其与免疫细胞的相互作用，尤其是VISFATIN/Nampt信号通路的潜在作用。	研究中主要使用了小鼠模型，结果可否完全推广至人类尚需进一步验证。	研究慢性乙型肝炎感染中内皮细胞的异质性及其功能变化。	慢性乙型肝炎感染小鼠肝脏中的内皮细胞。	数字病理学	慢性乙型肝炎	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	在小鼠模型中分析了十种细胞类型的内皮细胞
218	2024-08-04	Machine learning identifies activation of RUNX/AP-1 as drivers of mesenchymal and fibrotic regulatory programs in gastric cancer 2024-06-25, Genome research IF:6.2Q1 DOI:10.1101/gr.278565.123 PMID:38777607	研究论文	本文通过机器学习确定了RUNX/AP-1的激活作为胃癌中间质和纤维化调控程序的驱动因子	创新点在于开发了一种机器学习方法来识别调节胃癌亚型的转录因子，并绘制了转录因子活性图谱	尚未充分理解调节胃癌表型转变的具体机制	探讨胃癌中间质表型的调控机制及其与转录因子的关系	使用胃癌细胞系和原发肿瘤的ATAC-seq和RNA-seq数据进行研究	机器学习	胃癌	ATAC-seq, RNA-seq	NA	基因组数据	来自多个胃癌细胞系和原发肿瘤的数据集
219	2024-08-05	Mapping the Development of Human Spermatogenesis Using Transcriptomics-Based Data: A Scoping Review 2024-Jun-25, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25136925 PMID:39000031	综述	本文回顾了人类精子发生的转录组数据和发育过程	提供了关于人类睾丸发育的转录特征的新见解，并提出了优化体外成熟的方法	对于体细胞谱系的数据有限，尤其是在Sertoli细胞方面存在技术问题	描述睾丸从胎儿期到成年期的发育过程，并寻找优化体外成熟的相关信息	与原生和体外培养的人类睾丸细胞及单细胞RNA测序相关的研究论文	数字病理学	无梗阻性无精症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	NA	NA
220	2024-08-05	Tumor-associated characteristics and immune dysregulation in nasopharyngeal carcinoma under the regulation of m7G-related tumor microenvironment cells 2024-Jun-25, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1 DOI:10.1186/s12957-024-03441-2 PMID:38918785	研究论文	本研究揭示了在m7G相关肿瘤微环境细胞调控下，鼻咽癌微环境中的肿瘤相关特征和免疫失调	揭示了m7G调控的肿瘤微环境细胞与鼻咽癌免疫分布及其生物学特征之间的关系	本研究未详细探讨m7G修饰的具体机制及其在治疗中的潜在应用	探索m7G修饰相关的肿瘤微环境细胞在鼻咽癌中的作用	分析来自11个鼻咽癌肿瘤样本和3个鼻咽淋巴增生样本的68,795个单细胞	数字病理学	鼻咽癌	单细胞RNA测序	非负矩阵分解算法	单细胞数据	68,795个单细胞，来自11个鼻咽癌样本和3个鼻咽淋巴增生样本