单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 563 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis of cavernous tissues reveals the key roles of pericytes in diabetic erectile dysfunction
2024-Jun-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88942
PMID:38856719
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研究论文 | 本研究通过单细胞 RNA 测序分析了海绵体组织，揭示了周细胞在糖尿病勃起功能障碍中的关键作用 | 研究发现了新的周细胞特异性标记 Limb Bud-Heart (Lbh)，表明其在糖尿病勃起功能障碍中的重要性 | 研究主要集中在小鼠和人类的海绵体组织，可能缺乏其他类型组织的全面数据 | 深入理解糖尿病条件下海绵体微环境和细胞间通讯以开发新疗法 | 研究对象包括糖尿病患者的海绵体组织和相关的细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病勃起功能障碍 | 单细胞 RNA 测序 | NA | RNA数据 | 研究涉及小鼠和人类的海绵体组织样本 |
| 182 | 2024-08-04 |
Gene representation bias in spatial transcriptomics
2024-Jun, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720024500070
PMID:39036848
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研究论文 | 本研究探讨了在空间转录组学中，与大规模RNA-seq相比，哪些基因在Visium中常常被低检测到。 | 本研究揭示了在Visium中，特定基因由于聚合酶(T)结构的影响而被低检测的潜在机制。 | 该研究基于有限的人类和小鼠样本，可能未能涵盖所有组织来源的差异。 | 识别在Visium中相比大规模RNA-seq常常低检测的基因及其潜在机制。 | 研究对象包括28个人类样本和19个小鼠样本，涉及多种组织源。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 基因计数矩阵 | 28个人类样本和19个小鼠样本 |
| 183 | 2024-08-04 |
NDMNN: A novel deep residual network based MNN method to remove batch effects from scRNA-seq data
2024-Jun, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S021972002450015X
PMID:39036845
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研究论文 | 提出一种名为NDMNN的新颖方法来去除scRNA-seq数据中的批次效应 | NDMNN方法结合了密集深度残差网络模型和MNN方法，显著改善了批次效应的修正 | NA | 主要研究如何有效去除单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 深度残差网络 | 数据 | NA |
| 184 | 2024-08-05 |
Dynamic Transcriptional Programs During Single NK Cell Killing: Connecting Form to Function in Cellular Immunotherapy
2024-Jun, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-024-00812-3
PMID:39050513
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研究论文 | 本文探讨了在单个NK细胞杀伤过程中转录程序的动态变化，并将形态与功能连接起来。 | 结合了单细胞RNA测序和活细胞成像的方法，以深入理解NK细胞的杀伤表型。 | 研究限于NK-92细胞系与HeLa细胞的共培养，可能不完全反映真实生理状态。 | 目标是揭示NK细胞杀伤机制中的转录调控。 | 主要研究NK细胞与HeLa宫颈癌细胞的相互作用。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 使用NK-92细胞系和HeLa细胞进行共培养，样本量未具体说明 |
| 185 | 2024-08-05 |
S100A8/A9hi neutrophils induce mitochondrial dysfunction and PANoptosis in endothelial cells via mitochondrial complex I deficiency during sepsis
2024-Jun-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06849-6
PMID:38942784
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研究论文 | S100A8/A9高表达的中性粒细胞通过线粒体复合体I缺陷诱导内皮细胞的线粒体功能障碍和PANoptosis | 首次揭示了S100A8/A9通过调节Nrf1表达而抑制线粒体复合体I中Ndufa3的表达，从而导致内皮细胞线粒体功能障碍的机制 | 研究的机制需要进一步探讨，尤其是在临床转化方面的应用 | 探讨S100A8/A9在脓毒症中引发内皮细胞功能障碍的机制 | 高表达S100A8/A9的中性粒细胞与内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脓毒症 | scRNA-seq和bulk RNA-seq分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 186 | 2024-08-05 |
Enhanced abscopal anti-tumor response via a triple combination of thermal ablation, IL-21, and PD-1 inhibition therapy
2024-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03718-1
PMID:38833177
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研究论文 | 该研究探讨了热消融、IL-21和PD-1抑制治疗的三重组合在肿瘤治疗中的作用 | 研究首次探讨了热消融、IL-21和抗PD-1单克隆抗体的联合疗法对肿瘤的抗肿瘤效果 | 研究未提供不同治疗组的外部验证和临床试验数据 | 研究三重组合疗法在转移性癌症治疗中的潜力 | 探讨热消融对肿瘤浸润淋巴细胞中IL-21R表达的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-05 |
SIRPG expression positively associates with an inflamed tumor microenvironment and response to PD-1 blockade
2024-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03737-y
PMID:38833156
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研究论文 | 本研究旨在探讨信号调节蛋白伽玛（SIRPG）与肿瘤免疫微环境表型及T细胞介导的适应性抗肿瘤免疫之间的关系 | 高SIRPG表达与癌症中的发炎免疫表型及对PD-1阻断的良好反应相关，暗示其作为预测生物标志物和新的免疫治疗靶点的潜力 | 缺乏对不同癌症类型中SIRPG功能机制的深入研究 | 探讨SIRPG与肿瘤免疫微环境及PD-1阻断反应的关系 | 对157名非小细胞肺癌和黑色素瘤患者进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 157名患者的临床数据和103,599个细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 188 | 2024-08-04 |
The neuroblastoma tumor microenvironment: From an in-depth characterization towards novel therapies
2024-Jun, EJC paediatric oncology
DOI:10.1016/j.ejcped.2024.100161
PMID:39036648
|
综述 | 本文总结了神经母细胞瘤肿瘤微环境的特征及其针对新疗法的研究进展 | 提出通过深入理解肿瘤微环境以识别新的疗法组合，特别是针对免疫逃逸和药物耐受性的组合策略 | 本文主要是对已有研究的总结，缺乏新的实验数据 | 探讨神经母细胞瘤肿瘤微环境的特征以及靶向该微环境的新疗法 | 神经母细胞瘤患者的肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞群体 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | 体内和体外实验模型 | 文本 | 众多相关临床试验和研究数据 |
| 189 | 2024-08-04 |
TRPV1 inhibition suppresses non-small cell lung cancer progression by inhibiting tumour growth and enhancing the immune response
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00894-7
PMID:37902941
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研究论文 | 本研究探讨了TRPV1在非小细胞肺癌(NSCLC)中的作用，发现其表现为肿瘤促进因子。 | 首次明确了TRPV1在NSCLC中的促进肿瘤生长和影响免疫反应的机制。 | 缺乏长期的临床数据或患者数量的足够样本来全面评估TRPV1的作用。 | 探讨TRPV1在非小细胞肺癌中的作用及其对肿瘤进展的影响。 | 研究对象为非小细胞肺癌组织及相关细胞系。 | 数字病理学 | 肺癌 | LC-MS/MS, ELISA, 免疫组化, CCK8, 流式细胞仪, qPCR, 西方印迹 | NA | 组织样本, 细胞系 | 使用了来自TCGA数据库的多个肿瘤组织和小鼠肿瘤异种移植模型 |
| 190 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq of the rare virosphere reveals the native hosts of giant viruses in the marine environment
2024-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01669-y
PMID:38605173
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研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序方法，揭示了海洋环境中巨病毒的原生宿主 | 首次通过单细胞RNA测序技术配对活跃的巨病毒与其原生原生生物宿主 | 未能全面覆盖所有可能的宿主和巨病毒之间的相互作用 | 研究巨病毒的原生宿主及其生态重要性 | 研究在诱导的藻类 bloom 中收集的样本中，与巨病毒感染相关的宿主细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 在多个宿主谱系中检测到数百个单细胞 |
| 191 | 2024-08-05 |
The Efficacy of Imiquimod-Induced Psoriasis Model on Murine Cells
2024-Jun, Cureus
DOI:10.7759/cureus.62914
PMID:39040747
|
研究论文 | 本研究集中于使用Imiquimod诱导小鼠皮肤细胞的类银屑病模型的有效性 | 本研究通过单细胞RNA测序和轨迹分析首次阐明了IMQ诱导的细胞与对照细胞在分化模式上的显著差异 | 研究指出IMQ诱导的细胞与银屑病细胞之间的差异因素仍需进一步探索 | 研究IMQ在诱导类银屑病模型中的有效性 | 小鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 192 | 2024-08-05 |
ITGB2-ICAM1 axis promotes liver metastasis in BAP1-mutated uveal melanoma with retained hypoxia and ECM signatures
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00908-4
PMID:38150154
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研究论文 | 这项研究探讨了ITGB2-ICAM1轴在BAP1突变的葡萄膜黑色素瘤中促进肝转移的机制 | 揭示了BAP1缺失驱动UM转移的机制，并提出了ITGB2-ICAM1轴作为潜在的治疗靶点 | 本研究主要基于小鼠模型，临床转化的可行性尚待验证 | 研究BAP1突变葡萄膜黑色素瘤中的转移机制和相关的信号通路 | 主要分析BAP1突变与转移性葡萄膜黑色素瘤的单细胞RNA测序数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 免疫竞争性小鼠肝脏转移模型 | 基因表达数据 | 包含初级和转移性UM样本的单细胞RNA测序数据，且使用免疫小鼠模型进行实验 |
| 193 | 2024-08-05 |
[Analysis of correlation between high expression of nucleoporin 85 (NUP85) and immune cell infiltration in hepatocellular carcinoma]
2024-Jun, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:38952090
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研究论文 | 该研究探讨了核孔蛋白85（NUP85）在肝细胞癌中的表达及其与免疫反应的相关性 | 首次系统分析了NUP85在HCC中高表达与免疫细胞浸润的相关性，并提出其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 本研究的局限性在于使用的数据库和分析方法可能存在的数据偏差 | 研究NUP85在肝细胞癌中的意义及其与免疫反应的关系 | 肝细胞癌（HCC）样本中的NUP85表达及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，基因表达分析 | NA | mRNA和蛋白数据 | 涉及HCC样本的突变率为19% |
| 194 | 2024-08-05 |
Conditional deletion of miR-204 and miR-211 in murine retinal pigment epithelium results in retinal degeneration
2024-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107344
PMID:38705389
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研究论文 | 本研究探讨了miR-204和miR-211在小鼠视网膜色素上皮中的作用及其导致的视网膜退化 | 首次通过条件性敲除miR-204和miR-211探讨其在小鼠视网膜中的功能 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类情况 | 确定miR-204和miR-211在视网膜色素上皮中的功能及其对视网膜的影响 | 小鼠视网膜色素上皮及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 视网膜退化 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠 | 图像 | 两个条件性基因敲除小鼠系 |
| 195 | 2024-08-05 |
Unravelling infiltrating T-cell heterogeneity in kidney renal clear cell carcinoma: Integrative single-cell and spatial transcriptomic profiling
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18403
PMID:39031800
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研究论文 | 本文系统地探讨了肾透明细胞癌中浸润性T细胞的异质性 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组数据全面表征了浸润性T细胞的特征，并建立了基于ITSG的稳定预后模型 | 尚未提及特定的局限性 | 研究浸润性T细胞在肾透明细胞癌中的作用和异质性 | 浸润性和增殖中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 12种KIRC治疗剂的预后相关数据 |
| 196 | 2024-08-05 |
Cell Tree Rings: the structure of somatic evolution as a human aging timer
2024-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-01053-4
PMID:38172489
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序构建细胞谱系树，以反映个体的衰老状态和生物年龄 | 提出了通过细胞谱系树结构与生物时间进行关联的新方法，可能成为一种更基本的衰老时钟 | 单细胞变异体的检测是一个重大技术挑战 | 探讨体细胞突变与衰老机制的关系，从而改善衰老评估 | 人类外周血单核细胞中的体细胞突变 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 惩罚多重回归模型 | 基因序列数据 | 来自数千个细胞的样本 |
| 197 | 2024-08-05 |
Characteristics of splenic PD-1+ γδT cells in Plasmodium yoelii nigeriensis infection
2024-Jun, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-023-09441-w
PMID:38265549
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研究论文 | 本文研究了感染Plasmodium yoelii nigeriensis的小鼠中PD-1+ γδT细胞的表型和功能特征 | 文章首次探讨了PD-1在调节γδT细胞功能中的作用，并提出RORα在此过程中的重要性 | 研究的范围主要局限于小鼠模型，可能无法直接推广到其他生物体或人类 | 探讨PD-1+ γδT细胞在Plasmodium yoelii nigeriensis感染中的作用及机制 | PD-1表达的γδT细胞及感染Plasmodium yoelii nigeriensis的小鼠 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | 感染的小鼠样本 |
| 198 | 2024-08-05 |
[Advancements in Single-cell RNA Sequencing Technology
in the Study of the Tumor Microenvironment in Lung Cancer]
2024-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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综述 | 本综述讨论了单细胞RNA测序技术在研究肺癌肿瘤微环境异质性中的最新进展 | 提出了单细胞RNA测序技术可用于揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性和新生细胞亚群体 | 传统的批量测序技术无法有效解决单细胞水平的异质性问题 | 探讨如何通过单细胞RNA测序技术深入理解肺癌肿瘤微环境的复杂性 | 研究肿瘤微环境中免疫细胞的组成和功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-05 |
A guide to single-cell RNA sequencing analysis using web-based tools for non-bioinformatician
2024-Jun, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17036
PMID:38148322
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研究论文 | 本研究介绍了针对非生物信息学家的单细胞RNA测序分析的网络工具 | 提供了用户友好的网络工具和详细的初学者分析流程 | 需要更多文献来帮助克服使用障碍 | 旨在使研究人员能够进行单细胞RNA测序分析 | 非生物信息学家 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-05 |
Foundation models in molecular biology
2024-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2024.240006
PMID:39027316
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研究论文 | 本文总结了基于分子生物学中各种数据的基础模型。 | 介绍了在分子生物学中发展的基础模型，并探讨了其潜在的研究方向。 | 未提及具体的局限性 | 探索和总结分子生物学中基础模型的发展情况。 | 聚焦于RNA序列、DNA序列、蛋白质序列、单细胞转录组和空间转录组数据。 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型 | 基础模型 | RNA序列数据、DNA序列数据、蛋白质序列数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA |