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当前共找到 544 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-07 |
Single-cell-resolved interspecies comparison shows a shared inflammatory axis and a dominant neutrophil-endothelial program in severe COVID-19
2024-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114328
PMID:38861386
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较COVID-19感染过程中仓鼠与人类的分子反应特征 | 首次在仓鼠模型中解析COVID-19疾病进展的单细胞转录组动态，并建立与人类数据的跨物种比较框架 | 缺乏患者感染初期的活检样本，依赖动物模型推演人类疾病机制 | 揭示严重COVID-19的炎症反应机制和疾病进展路径 | 叙利亚仓鼠和罗伯罗夫斯基仓鼠的肺组织，以及人类COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液、鼻拭子和尸检肺组织 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康与SARS-CoV-2感染的仓鼠肺组织，配合多个人类COVID-19数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2025-01-15 |
Single-cell transcriptomics reveals antigen-presenting capacity and therapeutic resistance potential of immunomodulatory endothelial cells in colorectal cancer
2024-06, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.1311
PMID:38874280
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了结直肠癌中免疫调节内皮细胞的抗原呈递能力和治疗耐药潜力 | 首次聚焦于免疫调节内皮细胞（IMECs）在肿瘤免疫平衡调节中的作用及其对抗血管生成疗法（AATs）的影响 | 研究主要基于公开数据库的单细胞转录组数据，缺乏实验验证 | 探讨结直肠癌中免疫调节内皮细胞的功能及其对抗血管生成疗法的影响 | 结直肠癌中的免疫调节内皮细胞（IMECs） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于公开数据库的结直肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109916
PMID:38812536
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研究论文 | 构建了迄今为止最全面的小鼠视网膜单细胞图谱，整合了约33万个细胞的数据 | 创建了最大的小鼠视网膜单细胞RNA测序数据集，首次整合多个数据集构建综合细胞图谱，识别了138种细胞类型 | 仅使用C57BL/6J野生型小鼠，可能不适用于其他品系或疾病模型 | 构建全面的小鼠视网膜单细胞图谱以解决现有数据集的局限性 | C57BL/6J小鼠视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，抗体磁珠分选 | NA | 单细胞基因表达数据 | 约190,000个单细胞（本研究），整合后超过330,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-07 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-06-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
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研究论文 | 本研究探讨SOS1和MEK抑制剂联合治疗对KRASG12D胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响及免疫治疗响应改善机制 | 首次揭示SOS1i+MEKi联合治疗通过调节iCAF和髓系细胞导致免疫抑制微环境，并提出CD40激动剂联合检查点阻断的新策略 | 研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索KRAS靶向治疗对肿瘤微环境的影响及改善免疫治疗响应的组合策略 | KRASG12D/p53突变小鼠胰腺导管腺癌细胞系(KPCY)及荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KPCY细胞系及荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-10-07 |
Flow Cytometry Analysis of Microglial Phenotypes in the Murine Brain During Aging and Disease
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5018
PMID:38948260
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研究论文 | 开发了一种优化的流式细胞术方案，用于区分小鼠脑组织中四种不同的小胶质细胞表型 | 建立了无需细胞分选、成像或单细胞RNA测序就能区分四种小胶质细胞表型的流式细胞术方案，具有成本低、通量高的优势 | 该方法依赖于前期单细胞RNA测序研究确定的基因标记，可能需要特定多色检测能力的细胞分析仪 | 开发一种区分小胶质细胞表型的标准化流程 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞 | 免疫学 | 神经退行性疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据 | NA | Cytek | 流式细胞术 | Cytek Aurora | Cytek Aurora 5激光光谱流式细胞仪 |
| 186 | 2024-12-21 |
Proteomic, single-cell and bulk transcriptomic analysis of plasma and tumor tissues unveil core proteins in response to anti-PD-L1 immunotherapy in triple negative breast cancer
2024-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108537
PMID:38744008
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学、单细胞和批量转录组学分析，揭示了三阴性乳腺癌患者在接受抗PD-L1免疫治疗后核心蛋白质的变化 | 构建了一个有效的血浆蛋白质组模型，用于预测免疫治疗的反应，并发现FAP+和COMP+成纤维细胞可能是逆转免疫治疗抵抗的潜在靶点 | 需要进一步验证和扩展样本量以确认研究结果的普遍性和可靠性 | 揭示三阴性乳腺癌患者对免疫治疗的反应机制，并开发预测模型 | 三阴性乳腺癌患者的血浆和肿瘤组织样本 | 蛋白质组学 | 乳腺癌 | TMT质谱分析、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 随机森林模型 | 蛋白质组数据、转录组数据 | 来自三阴性乳腺癌患者的预处理和后处理血浆样本，以及公开的肺癌和黑色素瘤的蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-12-21 |
K-nearest-neighbors induced topological PCA for single cell RNA-sequence data analysis
2024-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108497
PMID:38678944
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研究论文 | 本文提出了一种基于k近邻拓扑的PCA方法，用于单细胞RNA测序数据分析 | 本文创新性地结合了持久拉普拉斯技术和L范数正则化，提出了一种拓扑主成分分析（tPCA）方法，并通过引入k近邻持久拉普拉斯技术（kNN-PL）进一步提升了方法的鲁棒性 | 本文未提及具体的局限性 | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的多尺度多类别异质性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | PCA | 基因表达数据 | 11个不同的单细胞RNA测序基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-12-21 |
ISMI-VAE: A deep learning model for classifying disease cells using gene expression and SNV data
2024-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108485
PMID:38653063
|
研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器（VAE）的深度学习模型ISMI-VAE，用于整合和分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核苷酸变异（SNV）数据，以分类疾病细胞 | ISMI-VAE通过引入注意力机制来反映特征重要性，并分析潜在的致病基因特征，同时利用深度学习技术整合多模态数据并映射到低维空间 | NA | 开发一种能够有效整合和分析单细胞RNA测序和单核苷酸变异数据的方法，以提高疾病细胞分类的准确性和可解释性 | 单细胞RNA测序和单核苷酸变异数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 基因表达数据和SNV数据 | 三个癌症数据集和一个COVID-19数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-12-19 |
A single-cell sequence analysis of mouse subcutaneous white adipose tissue reveals dynamic changes during weaning
2024-06-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06448-3
PMID:38951550
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和其他分子及组织学检测方法，全面比较了小鼠皮下白色脂肪组织在出生后7天到断奶后7天的动态变化 | 首次详细描述了断奶期间小鼠皮下白色脂肪组织中前脂肪细胞的发育轨迹，并揭示了具有米色潜能的前脂肪细胞的转化过程，同时发现了断奶期特有的免疫细胞及其对前脂肪细胞的潜在调控作用 | 研究仅限于小鼠皮下白色脂肪组织，且样本量较小，可能无法完全代表所有脂肪组织的发育变化 | 探讨断奶期间小鼠皮下白色脂肪组织的发育重塑过程及其潜在调控机制 | 小鼠皮下白色脂肪组织在出生后7天到断奶后7天的动态变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮下白色脂肪组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-12-19 |
Single-cell transcriptional profiling of clear cell renal cell carcinoma reveals a tumor-associated endothelial tip cell phenotype
2024-06-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06478-x
PMID:38942917
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境，揭示了肿瘤相关内皮尖端细胞表型 | 发现了与上皮-间质转化相关的未被描述的血管亚群，并揭示了肿瘤血管与基质细胞在肿瘤微环境中对免疫细胞的抑制性相互作用 | 研究主要集中在单细胞RNA测序数据的分析，未涉及实验验证 | 探讨透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境特征及其与疾病进展和治疗反应的关系 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境，包括血管和免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 50,236个来自配对肿瘤和健康邻近肾组织的转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-12-19 |
Regulation of endocrine cell alternative splicing revealed by single-cell RNA sequencing in type 2 diabetes pathogenesis
2024-06-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06475-0
PMID:38937540
|
研究论文 | 本研究通过重新分析已存档的全长单细胞RNA测序数据，探讨了在非糖尿病（ND）和2型糖尿病（T2D）个体中，人类胰腺内分泌细胞类型的可变剪接（AS）调控机制 | 首次揭示了在糖尿病进展过程中，胰腺胰岛细胞的可变剪接对β细胞功能障碍的影响，并提出了通过调控可变剪接来调节β细胞功能的机制 | 研究依赖于已存档的数据，可能无法涵盖所有可能的变异和情况 | 探讨在2型糖尿病病理过程中，胰腺内分泌细胞的可变剪接调控机制 | 人类胰腺内分泌细胞在非糖尿病和2型糖尿病个体中的可变剪接调控 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 非糖尿病和2型糖尿病个体的胰腺内分泌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-12-19 |
A Fusion Learning Model Based on Deep Learning for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2024-06, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0512
PMID:38758925
|
研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习的融合学习模型，用于单细胞RNA测序数据的聚类 | 创新点在于将深度学习技术应用于单细胞RNA测序数据的聚类任务，并提出了一个融合学习模型 | NA | 旨在开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-12-18 |
Subpopulations of fibroblasts derived from human iPS cells
2024-06-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06419-8
PMID:38890483
|
研究论文 | 本文研究了从人诱导多能干细胞（iPSCs）分化而来的成纤维细胞亚群，并分析了它们在不同器官中的特性 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了从iPSCs分化而来的心脏、肝脏和皮肤成纤维细胞的亚群，揭示了基于发育的成纤维细胞异质性 | 研究仅限于心脏、肝脏和皮肤成纤维细胞，未涵盖所有器官的成纤维细胞 | 探讨成纤维细胞在不同器官中的异质性，为控制纤维化提供治疗策略 | 从人诱导多能干细胞分化而来的心脏、肝脏和皮肤成纤维细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从人诱导多能干细胞分化而来的心脏、肝脏和皮肤成纤维细胞的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-12-18 |
Integrative analysis of single-cell RNA-seq and gut microbiome metabarcoding data elucidates macrophage dysfunction in mice with DSS-induced ulcerative colitis
2024-06-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06409-w
PMID:38879692
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和肠道微生物群的宏条形码数据，揭示了DSS诱导的小鼠溃疡性结肠炎中巨噬细胞功能障碍 | 本研究首次整合单细胞RNA测序和16s rRNA扩增子测序数据，揭示了巨噬细胞在慢性溃疡性结肠炎中的异质性和炎症反应的分子机制 | 本研究仅在DSS诱导的小鼠模型中进行，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨免疫和代谢变化在溃疡性结肠炎中的具体作用机制 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型中的结肠细胞和微生物群 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，16s rRNA扩增子测序 | NA | RNA序列，微生物群数据 | 多个时间点的DSS诱导溃疡性结肠炎小鼠结肠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-12-17 |
A Bibliometric Analysis of the Spatial Transcriptomics Literature from 2006 to 2023
2024-Jun-10, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01484-3
PMID:38856921
|
综述 | 本文对2006年至2023年间的空间转录组学文献进行了文献计量分析，揭示了该领域的研究前沿和趋势 | 首次对空间转录组学领域进行了全面的文献计量分析，揭示了该领域的研究热点和全球合作网络 | 文献计量分析主要基于已发表的文献，可能无法全面反映该领域的所有研究动态 | 分析空间转录组学领域的研究前沿和趋势 | 2006年至2023年间发表的空间转录组学相关文献 | NA | NA | 文献计量分析 | NA | 文本 | 1467篇论文和综述 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-12-16 |
Integration of Pan-Cancer Cell Line and Single-Cell Transcriptomic Profiles Enables Inference of Therapeutic Vulnerabilities in Heterogeneous Tumors
2024-06-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3005
PMID:38581448
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研究论文 | 本文开发了一种名为scIDUC的计算框架，通过整合单细胞转录组数据和泛癌细胞系筛选数据，预测个体细胞的药物疗效 | 提出了scIDUC框架，能够高效地将单细胞转录组数据转化为个体细胞的药物反应预测，为异质性肿瘤的治疗提供了新工具 | 需要进一步验证该框架在更多疾病类型和更大样本量中的适用性和准确性 | 开发一种能够预测异质性肿瘤中个体细胞药物反应的计算工具 | 单细胞转录组数据和泛癌细胞系筛选数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及横纹肌肉瘤、胰腺导管腺癌和去势抵抗性前列腺癌三种不同疾病的细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-12-14 |
CTLA-4-expressing ILC3s restrain interleukin-23-mediated inflammation
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07537-3
PMID:38867048
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了IL-23受体表达细胞在肠道中的急性反应，揭示了CTLA-4在ILC3s上的上调及其在调节IL-23介导的炎症中的作用 | 首次发现CTLA-4在ILC3s上的上调，并揭示了其在调节IL-23介导的炎症中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类样本的研究较少，且未探讨CTLA-4在其他炎症性疾病中的作用 | 探讨IL-23介导的炎症反应中CTLA-4的作用机制 | 肠道中的IL-23受体表达细胞及ILC3s | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类ILC3s样本 | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-12-13 |
Intrinsic Gata4 expression sensitizes the aortic root to dilation in a Loeys-Dietz syndrome mouse model
2024-Jun-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4420617/v1
PMID:38883722
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研究论文 | 研究探讨了Loeys-Dietz综合征小鼠模型中主动脉根部扩张的分子机制 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术揭示了LDS小鼠主动脉平滑肌细胞的异质性，并发现Gata4表达的VSMC在主动脉根部表现出较低的分化状态和促炎性特征 | 研究仅限于小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据，尚未在人类患者中进行验证 | 识别Loeys-Dietz综合征中主动脉根部易扩张的分子决定因素 | Loeys-Dietz综合征小鼠模型的主动脉平滑肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | LDS小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-12-13 |
Glioblastoma-Infiltrating CD8+ T Cells Are Predominantly a Clonally Expanded GZMK+ Effector Population
2024-Jun-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-0913
PMID:38416133
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研究论文 | 研究分析了胶质母细胞瘤（GBM）中肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的特征，特别是CD8+ T细胞的克隆扩展和效应功能 | 揭示了GBM中肿瘤浸润的CD8+ T细胞主要为克隆扩展的GZMK+效应T细胞，且缺乏典型的耗竭CD8+ T细胞群体 | 研究样本量较小，仅包括15名高级别胶质瘤患者 | 探讨GBM中TIL的特征及其在免疫治疗中的潜在意义 | 胶质母细胞瘤（GBM）和高级别胶质瘤患者的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL） | NA | 脑癌 | 单细胞RNA测序和配对的V(D)J测序 | NA | 转录组 | 15名高级别胶质瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-12-08 |
CAraCAl: CAMML with the integration of chromatin accessibility
2024-Jun-13, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05833-3
PMID:38872103
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CAraCAl的生物信息学方法，用于在scATAC-seq数据上进行细胞类型注释 | CAraCAl通过整合染色质可及性数据，改进了CAMML方法，使其能够更有效地处理scATAC-seq数据 | 当scRNA-seq数据存在时，CAraCAl的性能并未超过CAMML，仅在仅有scATAC-seq数据时表现较好 | 开发一种新的方法来注释scATAC-seq数据中的细胞类型 | scATAC-seq数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |