单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 553 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-19 |
Complex immune microenvironment of chordoma: a road map for future treatment
2024-Jun-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009313
PMID:38908855
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序等技术，深入分析了脊索瘤的复杂免疫微环境，并探讨了免疫治疗在该疾病中的应用前景 | 首次采用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，结合CellChat和基因集变异分析，全面解析了脊索瘤的免疫微环境 | 研究样本量较小，仅包括126名脊索瘤患者和6名患者的单细胞RNA测序数据 | 探讨脊索瘤的免疫微环境特征及其对免疫治疗效果的影响 | 脊索瘤的免疫微环境及其对患者预后的影响 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 126名脊索瘤患者和6名患者的单细胞RNA测序数据 |
| 182 | 2024-08-18 |
MD-ALL: an integrative platform for molecular diagnosis of B-acute lymphoblastic leukemia
2024-06-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283706
PMID:37981856
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research paper | 介绍了一个名为MD-ALL的综合平台，用于基于基因表达谱和RNA测序数据中的关键遗传改变进行B-急性淋巴细胞白血病的敏感和准确分类 | MD-ALL平台整合了RNA测序数据中的多种关键遗传改变，包括序列突变、大规模拷贝数变异和基因重排，以进行全面的B-ALL分类 | NA | 开发一个用户友好的B-ALL分类平台，实现集成、准确和全面的B-ALL亚型分类 | B-急性淋巴细胞白血病及其亚型分类 | machine learning | 血液病 | RNA-seq | machine learning algorithms | RNA-seq data | 2,955个B-ALL RNA-seq样本 |
| 183 | 2024-08-17 |
Dysfunction of infiltrating cytotoxic CD8+ T cells within the graft promotes murine kidney allotransplant tolerance
2024-Jun-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179709
PMID:38888968
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研究论文 | 研究探讨了在小鼠肾脏同种异体移植中，浸润的细胞毒性CD8+ T细胞功能障碍如何促进移植耐受 | 首次揭示了细胞毒性CD8+ T细胞在移植器官内被重新编程为耗竭/调节样表型，并通过IFN-γ介导的机制促进肾脏移植耐受 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨细胞毒性CD8+ T细胞在肾脏同种异体移植中的作用及其对移植耐受的影响 | 小鼠肾脏同种异体移植中的细胞毒性CD8+ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及小鼠肾脏同种异体移植模型 |
| 184 | 2024-08-17 |
Advances and challenges in investigating B-cells via single-cell transcriptomics
2024-Jun, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2024.102443
PMID:38968762
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research paper | 本文探讨了通过单细胞转录组学研究B细胞的进展与挑战 | 利用单细胞RNA测序（scRNAseq）和VDJ分析，揭示了B细胞的中间状态及其在免疫反应中的保护作用 | 在研究跨组织的人类B细胞状态、空间位置与B细胞表型和功能的关系、抗体同型转换事件以及克隆关系的明确确定方面仍存在挑战 | 旨在通过单细胞转录组学技术深化对B细胞发育和分化的理解 | B细胞的中间状态、其在免疫反应中的作用以及克隆关系的确定 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 185 | 2024-08-16 |
Molecular cascade reveals sequential milestones underlying hippocampal neural stem cell development into an adult state
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114339
PMID:38852158
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研究论文 | 本研究通过靶向单细胞RNA测序分析，揭示了小鼠海马齿状回早期新生期神经干细胞发育为成年状态的分子级联反应 | 首次详细描述了神经干细胞从发育状态过渡到成年状态的多步骤过程及其关键里程碑，包括静息前自噬爆发和细胞活性氧水平升高 | NA | 揭示神经干细胞从发育状态过渡到成年状态的过程、里程碑和机制 | 小鼠海马齿状回中的神经干细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 186 | 2024-08-07 |
[Applications of single-cell RNA sequencing in chronic rhinosinusitis: the progress and prospect]
2024-Jun-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-07 |
[Application and progress of single-cell RNA sequencing in chronic rhinosinusitis]
2024-Jun-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-08-10 |
Age-associated reduction of sinus macrophages in human mesenteric lymph nodes
2024-Jun-27, Journal of clinical and experimental hematopathology : JCEH
IF:0.9Q4
DOI:10.3960/jslrt.24001
PMID:38462485
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研究论文 | 本研究评估了结直肠癌手术中切除的肠系膜淋巴结中窦状巨噬细胞（SMs）的分布情况，发现老年患者尤其是80岁以上患者中SMs显著减少 | 首次揭示了老年患者淋巴结中窦状巨噬细胞减少的现象，并探讨了其可能的免疫功能影响 | 研究仅基于手术中移除的肠系膜淋巴结样本，可能存在样本选择偏倚 | 探讨老年患者淋巴结中窦状巨噬细胞的分布及其与免疫功能的关系 | 肠系膜淋巴结中的窦状巨噬细胞 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 189 | 2024-08-08 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
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研究论文 | 本文总结了2023年EMBO研讨会'发育代谢：能量、物质和信息的流动'中的关键讨论，强调了现代发育生物学的挑战与机遇 | 文章介绍了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等技术的进步，为探索细胞特异性和组织特异性代谢网络、器官间代谢交流以及基因与代谢物在时间和空间上的相互作用提供了新机会 | NA | 探讨发育代谢领域的新技术革命及其对生物学研究的影响 | 细胞特异性和组织特异性代谢网络、器官间代谢交流、基因与代谢物的相互作用 | 发育生物学 | NA | 代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序、计算模型 | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Illuminates Thymic Development: An Updated Framework for Understanding Thymic Epithelial Tumors
2024-Jun-03, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyae046
PMID:38520743
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序技术对胸腺上皮肿瘤（TETs）的研究进展，探讨了胸腺发育和肿瘤形成的分子机制 | 利用单细胞分子 profiling 技术深入分析肿瘤细胞的分子特征，为胸腺上皮肿瘤的研究提供了新的视角 | 胸腺上皮肿瘤的罕见性限制了对肿瘤发生机制的深入研究和合理治疗方案的开发 | 探讨胸腺上皮肿瘤的生物学特性，加速开发针对这些罕见肿瘤的改进治疗策略 | 胸腺上皮肿瘤及其在胸腺发育和老化过程中的细胞多样性 | NA | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 191 | 2024-08-07 |
A pathologically expanded, clonal lineage of IL-21-producing CD4+ T cells drives inflammatory neuropathy
2024-Jun-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178602
PMID:39087473
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-Seq）分析了炎症性神经病变小鼠模型的外周神经，识别出表达IL-21的克隆扩增和多功能的CD4+ T细胞，这些细胞由两个转录上不同的扩增细胞群组成，表达与T滤泡辅助细胞（Tfh）和T外周辅助细胞（Tph）相关的基因。 | 首次揭示了IL-21表达的CD4+ T细胞在炎症性神经病变中的克隆扩增和多功能特性，并提出了IL-21信号传导、Tfh/Tph分化和CXCR6介导的细胞定位作为潜在的治疗靶点。 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 探讨炎症性神经病变中CD4+ T细胞的关键特性和潜在治疗靶点。 | 炎症性神经病变小鼠模型的外周神经中的CD4+ T细胞。 | NA | 炎症性神经病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），单细胞T细胞受体测序（scTCR-Seq） | NA | 单细胞RNA，单细胞T细胞受体 | 炎症性神经病变小鼠模型的外周神经样本 |
| 192 | 2024-08-07 |
An attenuated lymphocytic choriomeningitis virus vector enhances tumor control in mice partly via IFN-I
2024-Jun-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178945
PMID:38861331
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研究论文 | 研究报道了一种基于减毒淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（r3LCMV）的非裂解性病毒载体在多种肿瘤模型中显著增强肿瘤控制和提高生存率的效果 | 首次展示了r3LCMV病毒载体在免疫缺陷小鼠模型中的肿瘤控制效果，并揭示了宿主内在的IFN-I在其抗肿瘤功效中的关键作用 | 文章未明确提及具体的局限性 | 探索和验证新型病毒载体在癌症治疗中的应用效果 | 肿瘤模型中的小鼠 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个肿瘤模型中的小鼠 |
| 193 | 2024-08-07 |
PIK3CA inhibition in models of proliferative glomerulonephritis and lupus nephritis
2024-Jun-06, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176402
PMID:38842935
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研究论文 | 本文通过使用多种遗传工程小鼠模型、单细胞RNA测序和空间转录组学，展示了PIK3CA通路在增殖性肾小球肾炎发展中的关键作用，并证明了PI3Kα抑制剂alpelisib在不同小鼠模型中改善肾小球病变和肾功能的效果。 | 首次揭示了PI3Kα抑制剂在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎中的双重作用，不仅影响足细胞，还影响免疫系统。 | 研究主要基于小鼠模型和从活动性狼疮性肾炎患者中分离的人淋巴细胞，尚未在更广泛的人类患者群体中进行验证。 | 探讨PIK3CA抑制在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎中的作用及其机制。 | 增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎的小鼠模型及活动性狼疮性肾炎患者的人淋巴细胞。 | NA | 肾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA | 多种遗传工程小鼠模型及活动性狼疮性肾炎患者的人淋巴细胞 |
| 194 | 2024-08-07 |
DeepIMAGER: Deeply Analyzing Gene Regulatory Networks from scRNA-seq Data
2024-Jun-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070766
PMID:39062480
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepIMAGER的高级计算工具，用于通过深度学习和数据集成推断细胞特异性基因调控网络（GRNs） | DeepIMAGER通过将基因对的共表达模式转换为图像样表示，并利用转录因子（TF）结合信息进行模型训练，提高了GRN推断的准确性和鲁棒性 | NA | 研究目的是开发一种新的计算工具，以提高从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中推断基因调控网络的准确性 | 研究对象包括多种细胞类型的基因调控网络和转录因子 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq, ChIP-seq | 深度学习模型 | 图像, 基因表达数据 | 涉及六种细胞系的scRNA-seq和ChIP-seq数据 |
| 195 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of immunological responses in elderly patients with sepsis
2024-Jun-22, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00446-z
PMID:38909272
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年脓毒症患者的外周血样本，探讨了免疫细胞的转录组特征及其在老年脓毒症患者中的变化 | 首次揭示了老年脓毒症患者中免疫细胞的表型转变、表达异质性及细胞间通讯，并发现了HLA-KIR的新型相互作用 | NA | 探究老年脓毒症患者免疫反应的病理机制 | 老年脓毒症患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年脓毒症患者的外周血样本 |
| 196 | 2024-08-04 |
Pharmacological Improvement of Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Function Rescues Airway Epithelial Homeostasis and Host Defense in Children with Cystic Fibrosis
2024-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202310-1836OC
PMID:38259174
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研究论文 | 该研究探讨了药理改善囊性纤维化转膜导管调节因子（CFTR）功能对儿童囊性纤维化患者上呼吸道上皮稳态和宿主防御的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了ETI对儿童囊性纤维化患者鼻上皮和免疫细胞转录组的影响 | 仅在小样本的儿童群体中进行观察，结果可能无法推广到更广泛的人群 | 研究ETI对儿童囊性纤维化患者鼻上皮细胞和免疫细胞的机制 | 儿童囊性纤维化患者的鼻拭子样本 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13名囊性纤维化儿童和12名健康儿童 |
| 197 | 2024-08-04 |
Glioma hexokinase 3 positively correlates with malignancy and macrophage infiltration
2024-Jun, Metabolic brain disease
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11011-023-01333-0
PMID:38687460
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研究论文 | 这项研究全面评估了HK3在胶质瘤中的表达分布和免疫学效应 | 首次系统研究HK3与胶质瘤肿瘤微环境特征的关系 | 研究主要基于公共数据库，可能存在数据的不完整性和偏倚 | 探讨HK3在胶质瘤中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 胶质瘤患者样本和癌症相关公共数据集 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 免疫组化技术、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GTEx、CCLE、TCGA和CGGA的数据集 |
| 198 | 2024-08-05 |
Impact of tumour stroma-immune interactions on survival prognosis and response to neoadjuvant chemotherapy in bladder cancer
2024-Jun, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105152
PMID:38728838
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤基质与免疫相互作用对膀胱癌存活预后和新辅助化疗反应的影响 | 开发了一种基于影像组学特征的肿瘤基质预测模型，用于非侵入性评估膀胱癌患者的肿瘤基质比例 | 研究为回顾性分析，可能受制于已有数据的局限性 | 研究肿瘤基质与免疫相互作用对膀胱癌患者临床结果的影响 | 830名膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序、免疫组化、单细胞RNA测序、影像组学 | NA | 临床数据 | 830 |
| 199 | 2024-08-05 |
Deafness DFNB128 Associated with a Recessive Variant of Human MAP3K1 Recapitulates Hearing Loss of Map3k1-Deficient Mice
2024-Jun-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070845
PMID:39062623
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研究论文 | 本研究描述了一种与人类MAP3K1隐性变体相关的耳聋DFNB128，以及其与耳聋小鼠模型的相似性 | 首次识别了与非综合征性耳聋相关的新型隐性变体，并显示了其在小鼠耳蜗的表达 | 仅在一个巴基斯坦家族中进行研究，样本量有限 | 探索与隐性耳聋相关的新变体以及其机制 | 巴基斯坦的一个亲属家族，其中有两个兄弟姐妹出现非综合征性耳聋 | 数字病理学 | 耳聋 | 微阵列和外显子测序 | 基因缺失小鼠模型 | 转录组数据 | 一个家族的多个成员，其中两名兄弟姐妹受到影响 |
| 200 | 2024-08-05 |
Macrophage biomimetic nanoparticle-targeted functional extracellular vesicle micro-RNAs revealed via multiomics analysis alleviate sepsis-induced acute lung injury
2024-Jun-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02597-z
PMID:38910259
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研究论文 | 这项研究通过多组学分析识别功能性细胞外囊泡小RNA，并探寻其在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用 | 提出了一种新方法来筛选功能性EV-miRNAs，并强调了巨噬细胞来源EV在急性肺损伤中的关键作用 | 尚未明确揭示更有效的EV-miRNA作为治疗靶标的策略 | 研究脓毒症患者的急性肺损伤中，细胞外囊泡小RNA的功能性及其治疗潜力 | 脓毒症患者的血清EV微RNA档案及对应器官的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序和多组学分析 | NA | RNA数据 | 涉及脓毒症患者的血清和小鼠模型 |