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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-10 |
Anoikis and SPP1 in idiopathic pulmonary fibrosis: integrating bioinformatics, cell, and animal studies to explore prognostic biomarkers and PI3K/AKT signaling regulation
2024-06, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2315218
PMID:38318669
|
研究论文 | 整合生物信息学、细胞和动物实验,探索失巢凋亡和SPP1在特发性肺纤维化中的预后生物标志物及PI3K/AKT信号调控 | 首次通过失巢凋亡相关基因构建特发性肺纤维化的预后模型,并揭示SPP1通过PI3K/AKT通路调控肺纤维化的新机制 | 未提及具体样本量及外部验证队列 | 探究失巢凋亡在特发性肺纤维化中的相关性,识别相关生物标志物和信号通路 | 特发性肺纤维化患者及小鼠肺成纤维细胞 | 机器学习 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | Lasso回归、多变量Cox回归 | 基因表达数据 | 未指定 | 未指定 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-07-10 |
Protein phosphatases regulate the formation of Müller glia-derived progenitor cells in the chick retina
2024-06, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103932
PMID:38679247
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研究论文 | 研究了蛋白磷酸酶在鸡视网膜中Müller胶质细胞转化为祖细胞过程中的调控作用 | 首次揭示了DUSP1/6和PP2C等蛋白磷酸酶在Müller胶质细胞重编程中的关键调控作用,并发现不同磷酸酶对细胞信号通路具有差异化调节 | 未对磷酸酶抑制在无损伤视网膜中的长期效果及分子机制进行深入探讨 | 探究蛋白磷酸酶对Müller胶质细胞来源祖细胞形成的调控机制 | 鸡视网膜中的Müller胶质细胞及其来源祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | 正常和受损鸡视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-04 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109916
PMID:38812536
|
研究论文 | 生成了迄今最大规模的小鼠视网膜单细胞RNA测序数据集,并整合公共数据构建了涵盖12个主要类别和138种细胞类型的小鼠视网膜细胞图谱(MRCA) | 通过抗体介导的磁珠分选富集稀有细胞群体,生成了约190,000个单细胞的最大视网膜scRNA-seq数据集,并整合公共数据构建了包含330,000个细胞、138种细胞类型的综合图谱,发现新细胞类型并提供了公共访问资源 | 未提及具体局限性 | 构建全面的小鼠视网膜单细胞基因表达图谱,填补现有数据集的局限性 | C57BL/6J小鼠视网膜细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 约190,000个单细胞(来自C57BL/6J小鼠视网膜),整合后超过330,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-01 |
Human inherited PD-L1 deficiency is clinically and immunologically less severe than PD-1 deficiency
2024-06-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231704
PMID:38634869
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研究论文 | 报道两例PD-L1缺陷患者,其临床与免疫学严重程度低于PD-1缺陷 | 首次比较PD-L1和PD-1缺陷在人类中的临床和免疫表型差异,揭示PD-L1缺陷不导致致命性自身免疫和广泛白细胞失调 | 仅报道两个家系,样本量小,可能限制结论的普适性 | 探索人类遗传性PD-L1缺陷的临床和免疫学特征,并与PD-1缺陷进行比较 | 两名PD-L1缺陷的兄弟姐妹(年龄10和11岁)及其免疫细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2名PD-L1缺陷患者及其对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-07-01 |
Single-cell sequencing reveals distinct immune cell features in cutaneous lesions of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid
2024-06, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110219
PMID:38631594
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞VDJ测序,解析寻常型天疱疮与大疱性类天疱疮皮肤病变中的免疫细胞特征 | 首次系统描绘两种自身免疫性大疱病皮肤病变的单细胞转录组及T/B细胞克隆型图谱,揭示CD8 Trm在PV中的扩增及其分化轨迹,并发现BP病变中CD8 Tem和CD4 Treg高表达耗竭相关基因 | 未提供明确的局限性描述 | 探究寻常型天疱疮和大疱性类天疱疮皮肤病变中的免疫细胞特征 | 寻常型天疱疮和大疱性类天疱疮患者的皮肤病变组织 | 单细胞组学 | 自身免疫性大疱病 | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞免疫组库数据 | BP患者、PV患者及健康对照的皮肤病变样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞VDJ-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-07-01 |
Differential expression and prognostic value of TLR4 in kidney renal clear cell carcinoma
2024-06, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2024.101959
PMID:38579915
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,结合体外实验,评估TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其预后价值 | 首次系统揭示TLR4在KIRC中的差异表达及其与免疫细胞浸润的关联,并发现其仅在女性患者中具有保护性预后意义 | 未深入探讨TLR4调控免疫微环境的具体分子机制,且体外实验仅在786-O细胞系中进行验证 | 阐明TLR4在肾透明细胞癌中的表达模式、预后价值及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肾透明细胞癌组织样本及786-O细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学染色, 体外细胞实验 | NA | RNA测序数据, 组织切片图像 | 包含KIRC肿瘤组织与正常肾组织样本,具体数量未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-07-01 |
Bone marrow CD8+ Trm cells induced by IL-15 and CD16+ monocytes contribute to HSPC destruction in human severe aplastic anemia
2024-06, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110223
PMID:38636890
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研究论文 | 揭示IL-15和CD16+单核细胞诱导的骨髓CD8+组织驻留记忆T细胞在重度再生障碍性贫血中破坏造血干祖细胞的机制 | 首次在重度再生障碍性贫血中发现CD8 Trm细胞作为致病细胞,并阐明IL-15和CD16单核细胞在其诱导中的作用及CD38抑制剂78c的抑制作用 | NA | 探究重度再生障碍性贫血中T细胞破坏造血干祖细胞的机制 | 重度再生障碍性贫血患者和健康捐献者的外周血单核细胞和骨髓单核细胞 | 单细胞组学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 重度再生障碍性贫血患者和健康捐献者的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 8 | 2026-06-26 |
Elevated phagocytic capacity directs innate spinal cord repair
2024-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.11.598515
PMID:38915507
|
研究论文 | 本研究比较斑马鱼与哺乳动物在脊髓损伤后的免疫反应,发现斑马鱼巨噬细胞具有更高的吞噬能力并促进再生,而表达人类MACRO基因可加速组织修复 | 首次通过跨物种比较揭示巨噬细胞吞噬能力是脊髓先天修复的关键驱动因素,并证明人类MACRO基因可增强斑马鱼的吞噬和再生功能 | 未明确说明人类MACRO基因在哺乳动物模型中是否具有相同效果,以及长期安全性评估 | 探究巨噬细胞吞噬能力在脊髓损伤后先天修复中的作用机制 | 斑马鱼与哺乳动物(小鼠)的脊髓损伤模型 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组学、基因敲除、基因表达 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics unveil a unique molecular profile of mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived immune suppressor cells
2024-06-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.009
PMID:38795702
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-06-20 |
Single-cell and genome-wide Mendelian randomization identifies causative genes for gout
2024-06-03, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03348-z
PMID:38831441
|
研究论文 | 结合单细胞转录组学和全基因组孟德尔随机化分析,鉴定与痛风相关的致病基因 | 首次整合单细胞转录组学、全基因组关联研究、表达数量性状位点和甲基化数量性状位点数据,利用孟德尔随机化方法揭示蛋白质与痛风的因果关系 | 未明确提及,但可能包括样本量有限或验证不足等常见局限 | 研究痛风疾病中基因表达调控机制并阐明其发病机制 | 痛风相关的基因、甲基化位点和蛋白质 | 机器学习 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、全基因组关联研究、孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据、甲基化数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-06-19 |
FGF receptors mediate cellular senescence in the cystic fibrosis airway epithelium
2024-06-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174888
PMID:38916962
|
研究论文 | 该研究揭示了FGFR/MAPK p38信号通路在囊性纤维化气道上皮细胞衰老中的作用,并发现抑制FGFR可减轻细胞衰老并改善黏液纤毛清除功能 | 首次阐明成纤维细胞生长因子受体(FGFR)特别是FGFR4通过MAPK p38信号介导囊性纤维化气道上皮细胞衰老,并提出靶向衰老作为治疗策略 | 未明确说明,但可能涉及体外模型与体内情况的差异以及样本量限制 | 探究囊性纤维化气道上皮细胞衰老的分子机制及其对黏液纤毛清除功能的影响 | 囊性纤维化患者的气道上皮细胞、非囊性纤维化对照、CF支气管上皮细胞系和Cftr基因敲除大鼠 | 机器学习 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自非CF和CF捐献者的原代支气管上皮细胞、CF支气管上皮细胞系及Cftr敲除大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-19 |
Tissue module discovery in single-cell-resolution spatial transcriptomics data via cell-cell interaction-aware cell embedding
2024-06-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.05.001
PMID:38823396
|
研究论文 | 提出一种深度学习方法SPACE,通过细胞间相互作用感知的细胞嵌入,从单细胞分辨率空间转录组数据中识别细胞类型和发现组织模块 | 通过细胞嵌入同时捕获基因表达谱和空间邻域相互作用,自动发现具有可辨别边界和均匀细胞类型分布的组织模块(细胞社区),并输出与生理过程相关的特征性近端细胞-细胞相互作用网络 | 未提及具体局限性 | 开发计算方法以揭示单细胞如何在空间中组织并发挥组织特异性功能 | 单细胞分辨率空间转录组数据中的细胞和组织模块 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 深度学习(SPACE) | 单细胞分辨率空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-06-18 |
Adrenal gland macrophages regulate glucocorticoid production through Trem2 and TGF-β
2024-06-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174746
PMID:38869957
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型,揭示了肾上腺巨噬细胞通过Trem2和TGF-β调节糖皮质激素生成的分子机制 | 首次发现肾上腺巨噬细胞中的Trem2在应激反应中上调,并通过TGF-β信号通路负调控糖皮质激素生成,为压力相关疾病的免疫干预提供了新靶点 | 主要基于小鼠模型,结果向人类转化的可行性尚需验证;未对Trem2-TGF-β通路的上下游信号进行完整解析 | 探究肾上腺巨噬细胞在急性或慢性应激条件下调控糖皮质激素生成的分子机制 | 小鼠肾上腺巨噬细胞 | 机器学习 | 压力相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量,涉及野生型小鼠和Trem2条件性敲除小鼠的肾上腺组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 14 | 2026-06-18 |
DRA involvement in linaclotide-stimulated bicarbonate secretion during loss of CFTR function
2024-06-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172364
PMID:38869953
|
研究论文 | 研究林氯西肽在CFTR功能缺失情况下刺激十二指肠碳酸氢盐分泌的机制及DRA参与作用 | 首次发现林氯西肽能通过上调DRA表达来补偿CFTR功能缺失,促进十二指肠碳酸氢盐分泌,为囊性纤维化患者提供潜在治疗新策略 | 具体分子调控通路尚未完全阐明,且研究主要在动物模型和体外实验中进行,缺乏长期临床验证数据 | 探究林氯西肽在CFTR功能缺失时刺激十二指肠碳酸氢盐分泌的机制,以及DRA在该过程中的作用 | 小鼠十二指肠、人类十二指肠活检组织及类器官 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | scRNA-Seq, 共聚焦显微镜 | NA | 转录组测序数据、图像数据 | CFTR基因敲除小鼠、CFTR功能抑制剂处理的十二指肠标本、人类十二指肠单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 人类十二指肠单细胞RNA测序数据集分析 |
| 15 | 2026-06-18 |
Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of a TLR9 agonist in autochthonous murine sarcomas
2024-06-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.178767
PMID:39133651
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research paper | 通过瘤内注射TLR9激动剂增强原位小鼠肉瘤的放疗反应 | 首次在原位软组织肉瘤模型中使用CRISPR/Cas9和化学致癌剂MCA生成高肿瘤突变负荷肿瘤,并证明CpG联合放疗通过CD8+ T细胞依赖机制显著增强肿瘤反应 | 未说明 | 研究TLR9激动剂CpG联合放疗增强肉瘤反应的免疫机制 | 原位软组织肉瘤小鼠模型 | machine learning | soft-tissue sarcoma | NA | NA | NA | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-06-18 |
Deletion of Fbxw7 in oocytes causes follicle loss and premature ovarian insufficiency in mice
2024-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18487
PMID:39031722
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研究论文 | 该研究揭示了卵母细胞特异性敲除Fbxw7会导致小鼠卵泡丢失和卵巢早衰,并探讨了其机制 | 首次证明了Fbxw7在卵巢功能中的重要作用,特别是通过单细胞RNA测序揭示了Clu和Ccl2转录本积累可能加速卵巢早衰的机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证,且未深入探讨FBXW7在卵巢中的具体调控网络 | 探讨FBXW7在卵泡发生和卵巢功能中的作用及其与卵巢早衰的关系 | 顺铂诱导的卵巢早衰小鼠模型和卵母细胞特异性Fbxw7敲除小鼠 | 机器学习 | 卵巢早衰 | 单细胞RNA测序,原位杂交 | 无 | 基因表达数据 | 使用顺铂处理小鼠模型和Fbxw7敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-06-18 |
Identifying the protective effects of miR-874-3p/ATF3 axis in intervertebral disc degeneration by single-cell RNA sequencing and validation
2024-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18492
PMID:38890795
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和验证揭示miR-874-3p/ATF3轴在椎间盘退变中的保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定ATF3为椎间盘退变的关键铁死亡基因,并验证miR-874-3p通过靶向ATF3抑制髓核细胞铁死亡、凋亡、炎症和细胞外基质降解的保护机制 | 未提及具体的局限性 | 探究miR-874-3p/ATF3信号轴在椎间盘退变中的病理机制和治疗潜力 | 椎间盘退变患者样本、大鼠模型及髓核细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、Western blotting、流式细胞术、ELISA、动物实验 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 | 椎间盘退变患者和椎间盘退变大鼠模型样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对患者样本和大鼠模型进行单细胞RNA测序分析 |
| 18 | 2026-06-17 |
SFTPB in serum extracellular vesicles as a biomarker of progressive pulmonary fibrosis
2024-06-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177937
PMID:38855869
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研究论文 | 探讨血清细胞外囊泡中的SFTPB作为进行性肺纤维化生物标志物的研究 | 首次发现血清细胞外囊泡中的SFTPB(尤其是其前体形式pro-SFTPB)比已知标志物KL-6和SP-D能更好地预测间质性肺病进展,并独立于性别-年龄-生理学指数 | 未明确说明限制 | 识别进行性肺纤维化的新型生物标志物,用于早期检测高风险患者 | 进行性肺纤维化患者及健康对照组的血清细胞外囊泡和小鼠模型 | 数字病理学 | 进行性肺纤维化 | 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 蛋白质组学数据,单细胞RNA测序数据 | 多个患者队列(具体数目未说明)和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-06-15 |
Myelin-associated oligodendrocytic basic protein-dependent myelin repair confers the long-lasting antidepressant effect of ketamine
2024-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02288-5
PMID:37848708
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研究论文 | 使用空间转录组学揭示氯胺酮通过髓鞘相关少突胶质细胞碱性蛋白依赖的髓鞘修复实现长效抗抑郁作用 | 首次发现氯胺酮通过促进少突胶质前体细胞分化成熟、恢复受损髓鞘来产生长效抗抑郁效应,并阐明(R)-氯胺酮与(S)-氯胺酮在髓鞘修复效应上的差异 | 未明确提及,但可能包括动物模型与人类的差异及机制验证的局限性 | 阐明氯胺酮长效抗抑郁作用的髓鞘修复机制及其与立体异构体差异的关系 | 经受慢性社交挫败应激的小鼠 | 机器学习 | 抑郁症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠脑组织样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-06-15 |
Single cell transcriptomics reveals distinct transcriptional responses to oxycodone and buprenorphine by iPSC-derived brain organoids from patients with opioid use disorder
2024-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01837-8
PMID:36302966
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研究论文 | 利用iPSC衍生的脑类器官进行单细胞转录组学分析,揭示阿片类药物使用障碍患者对羟考酮和丁丙诺啡的差异性转录反应 | 首次在单细胞分辨率下比较了OUD患者来源的iPSC衍生的前脑类器官对羟考酮和丁丙诺啡的转录反应差异,并发现了丁丙诺啡对胶质细胞转录调控的显著影响以及羟考酮诱导的I型干扰素信号通路激活 | 仅使用了三名男性OUD患者的样本,样本量较小;研究结果可能受性别和个体差异影响;类器官模型无法完全模拟体内复杂的脑环境 | 阐明阿片类药物在单细胞水平上如何调节脑细胞类型功能,特别是羟考酮和丁丙诺啡对OUD患者脑类器官的特异性转录反应机制 | 三名男性阿片类药物使用障碍(OUD)患者诱导多能干细胞(iPSC)衍生的前脑类器官 | 单细胞转录组学 | 阿片类药物使用障碍 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 25787个细胞,来自三名男性OUD患者的iPSC衍生前脑类器官 | 10x Genomics | 单核RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序 |