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当前共找到 544 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-29 |
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597485
PMID:38895472
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研究论文 | 本研究揭示了平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中向肌成纤维细胞分化的轨迹，并发现转录因子KLF4在此过程中的关键作用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学方法，首次阐明了冠状动脉相关AdvSca1-SM细胞在心脏纤维化中的促纤维化分化轨迹，并发现KLF4的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；KLF4调控AdvSca1-SM表型的具体分子机制仍需进一步探索 | 探究AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中的作用及KLF4的调控机制 | 小鼠血管平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞及人类心脏肥厚组织 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-03-21 |
Insights into the heterogeneity of the tumor microenvironment in lung adenocarcinoma and squamous carcinoma through single-cell transcriptomic analysis: Implications for distinct immunotherapy outcomes
2024-06, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3694
PMID:38847309
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肺腺癌和肺鳞癌肿瘤微环境的异质性，并探讨了其对免疫治疗结果差异的影响 | 首次通过单细胞RNA测序结合批量转录组和多重免疫荧光验证，系统比较了LUAD和LUSC的肿瘤微环境差异，并发现了与免疫治疗反应相关的特定细胞亚群和基因表达特征 | 样本量相对较小（38例NSCLC患者），且验证队列可能受到中心特异性因素影响 | 探究肺腺癌和肺鳞癌肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗结果差异的影响机制 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者，特别是肺腺癌（LUAD）和肺鳞癌（LUSC）亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，批量转录组数据，图像数据 | 38例NSCLC患者（单细胞队列），外加验证队列（批量转录组和mIF） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学（通过mIF间接相关） | NA | NA |
| 3 | 2026-03-21 |
The profile of cytokines against bacterial infection in dental pulp
2024-06, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3707
PMID:38811236
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序数据，分析了健康与炎症牙髓组织中细胞因子的表达特征，揭示了不同细胞类型在细菌感染下的响应机制 | 首次在单细胞水平上系统总结了健康与炎症牙髓中各类细胞的细胞因子分泌谱，并揭示了牙髓作为封闭环境模型在细菌感染研究中的独特价值 | 研究基于公共GEO数据集，可能受限于样本来源和测序深度，且未进行实验验证 | 探究牙髓细胞在细菌感染过程中通过细胞因子响应的机制 | 健康与炎症状态的人类牙髓组织 | 单细胞转录组学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组表达矩阵 | 从GEO数据集下载的健康与炎症牙髓组织单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-17 |
The Absence of Intra-Tumoral Tertiary Lymphoid Structures is Associated with a Worse Prognosis and mTOR Signaling Activation in Hepatocellular Carcinoma with Liver Transplantation: A Multicenter Retrospective Study
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309348
PMID:38498682
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌肝移植患者肿瘤内三级淋巴结构的缺失与预后不良及mTOR信号通路激活的关系，并构建了基于影像组学的非侵入性预测模型 | 首次在肝细胞癌肝移植患者中系统研究肿瘤内三级淋巴结构与预后的关系，并利用大规模影像组学数据构建了首个非侵入性预测三级淋巴结构丰度的分类器 | 这是一项多中心回顾性研究，可能存在选择偏倚，且需要前瞻性研究进一步验证影像组学模型的临床适用性 | 探究肝细胞癌肝移植患者肿瘤内三级淋巴结构的临床意义及其与非侵入性预测方法的关联 | 肝细胞癌肝移植患者的肿瘤组织及影像数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 影像组学 | 分类器 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 影像数据 | 最大规模的具有可用影像组学数据的肝细胞癌患者队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-15 |
Gut-Derived Exosomes Mediate the Microbiota Dysbiosis-Induced Spermatogenesis Impairment by Targeting Meioc in Mice
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310110
PMID:38526201
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研究论文 | 本研究揭示了肠道菌群失调通过肠道来源的外泌体miR-211-5p靶向睾丸中的Meioc基因，从而干扰减数分裂过程并损害精子发生 | 首次阐明了非生殖组织来源的外泌体在精子发生调控中的作用，定义了“肠道-睾丸”轴的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；具体信号通路细节需进一步探索 | 探究肠道菌群失调导致雄性生育能力下降的调控机制 | 小鼠（包括肠道菌群失调模型和野生型小鼠） | 生殖生物学 | 生育障碍 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 未明确指定样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-15 |
Pan-Cancer Single-Cell and Spatial-Resolved Profiling Reveals the Immunosuppressive Role of APOE+ Macrophages in Immune Checkpoint Inhibitor Therapy
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401061
PMID:38569519
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组数据，揭示了APOE+巨噬细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的免疫抑制角色，并构建了一个预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序、机器学习及空间转录组技术，系统性地探究了APOE+巨噬细胞在泛癌种ICI治疗中的免疫抑制机制，并开发了基于巨噬细胞特征的预测模型 | 模型验证主要基于回顾性数据，前瞻性临床验证有待加强；机制研究虽结合了体内外实验，但具体信号通路细节仍需进一步阐明 | 探究巨噬细胞异质性对免疫检查点抑制剂治疗响应的影响，并开发预测模型 | 泛癌种患者样本、三阴性乳腺癌患者样本、4T1荷瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 泛癌种（重点关注三阴性乳腺癌） | 单细胞RNA测序，空间转录组技术，多重免疫组化，机器学习 | 机器学习算法（具体未指明，如SVM、随机森林等） | 单细胞RNA测序数据，bulk RNA测序数据，空间转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-03-14 |
Mgp High-Expressing MSCs Orchestrate the Osteoimmune Microenvironment of Collagen/Nanohydroxyapatite-Mediated Bone Regeneration
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308986
PMID:38588510
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了胶原/纳米羟基磷灰石骨修复材料周围骨免疫微环境的细胞图谱，并鉴定了一组高表达基质Gla蛋白（Mgp）的功能性间充质干细胞亚群 | 首次在单细胞水平结合空间转录组学描绘了骨修复材料植入后的骨免疫微环境动态图谱，并鉴定出Mgp高表达间充质干细胞（MgpMSCs）这一关键先驱亚群及其通过Mdk/Lrp1配体-受体对调控巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要聚焦于早期骨再生阶段，长期效应及临床转化潜力仍需进一步验证 | 阐明生物材料介导的骨再生早期阶段中功能性间充质干细胞亚群的作用及其调控骨免疫微环境的分子机制 | 植入胶原/纳米羟基磷灰石骨修复材料后的小鼠骨修复区域细胞 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-14 |
Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308384
PMID:38634607
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学技术，研究了渗透胁迫对拟南芥根尖发育的影响，并重建了转录调控网络 | 首次在单细胞水平同时捕获基因表达和染色质可及性，并构建了高分辨率的转录调控网络，揭示了渗透胁迫下细胞异质性 | 数据整合仍存在挑战，且样本仅限于拟南芥根尖，可能不适用于其他植物或组织 | 研究渗透胁迫下拟南芥根尖发育的细胞特异性转录调控网络 | 拟南芥根尖细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞多组学（scRNA-seq和scATAC-seq） | 伪时间轨迹分析 | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | 16,670个拟南芥根尖细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-03-06 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2024-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01831-y
PMID:38698087
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了抗原特异性浆细胞前体的发育动态和基因组编程，特别是长寿命骨髓浆细胞的生成机制 | 发现了浆细胞前体的双相生成模式，并识别出一个新的浆细胞过渡状态，该状态依赖于TIGIT的可诱导表达进行克隆扩增 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证，且样本规模可能有限 | 阐明浆细胞前体的发育动力学和基因组编程，特别是长寿命浆细胞的生成机制 | 小鼠模型中的抗原特异性浆细胞前体，包括脾脏和骨髓中的B细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，B细胞抗原受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，B细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-03-02 |
FGF receptors mediate cellular senescence in the cystic fibrosis airway epithelium
2024-Jun-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174888
PMID:38916962
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研究论文 | 本文研究了囊性纤维化（CF）气道中成纤维细胞生长因子受体（FGFR）介导的细胞衰老及其对黏液纤毛清除功能的影响 | 揭示了FGFR/MAPK p38信号通路在CF气道细胞衰老中的作用，并首次提出抑制FGFR（特别是FGFR4和FGFR1）可减轻细胞衰老并改善黏液纤毛清除功能 | 研究主要基于体外细胞模型和动物模型，尚未在人体临床试验中验证，且CF ex vivo模型的适用性可能有限 | 探究CF气道中细胞衰老的机制及其对黏液纤毛清除功能的影响，以寻找潜在的治疗策略 | 非CF和CF供体的人原代支气管上皮细胞、CF支气管上皮细胞系、Cftr基因敲除大鼠 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，但涉及人原代细胞、细胞系和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-02 |
Single-cell signatures identify microenvironment factors in tumors associated with patient outcomes
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100799
PMID:38889686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scBeacon的工具，用于通过整合和聚类多个单细胞RNA测序数据集来推导细胞类型特征，以解卷积批量肿瘤样本中的细胞组成，并在TCGA队列中识别与患者预后相关的肿瘤微环境因素 | 开发了scBeacon工具，通过整合多个scRNA-seq数据集来提取细胞类型特征，用于解卷积无关的批量肿瘤数据集，从而揭示传统癌症分型方法无法识别的内在肿瘤细胞特性 | NA | 识别肿瘤微环境中的细胞和分子特征，以关联患者预后 | 肿瘤及其微环境中的细胞组分 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量肿瘤样本数据 | TCGA队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-02 |
Single-Cell RNA Sequencing of Mutant Whole Mouse Embryos: From the Epiblast to the End of Gastrulation
2024-Jun-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66866
PMID:38949298
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研究论文 | 本文介绍了一种针对突变小鼠胚胎从E6.5到E8天（原肠胚形成期）进行单细胞RNA测序的稳健流程，旨在克服基因分型等技术限制 | 开发了一种结合育种优化、同日基因分型（3小时）和微滴单细胞分析的完整方法，提高了突变胚胎在原肠胚形成阶段单细胞研究的可行性 | 方法主要针对小鼠胚胎，且在原肠胚形成早期阶段细胞数量有限，可能仍需面对样本同步性和基因型获取率的挑战 | 研究突变如何影响原肠胚形成期的细胞景观，促进早期发育中基因表达动态和细胞异质性的分析 | 突变小鼠胚胎（从E6.5到E8天，涵盖原肠胚形成起始至完成阶段） | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及多个胚胎阶段（E6.5至E8天） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微滴单细胞分析 |
| 13 | 2026-03-02 |
Glioblastoma-Infiltrating CD8+ T Cells Are Predominantly a Clonally Expanded GZMK+ Effector Population
2024-Jun-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-0913
PMID:38416133
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了胶质母细胞瘤中浸润的CD8+ T细胞特征，发现其主要是克隆扩增的GZMK+效应T细胞群 | 揭示了胶质母细胞瘤中CD8+ T细胞主要为克隆扩增的GZMK+效应T细胞，而非典型耗竭T细胞，这与其他癌症类型不同 | 样本量较小（仅15例患者），且未涉及长期疗效或治疗干预的验证 | 探究胶质母细胞瘤中肿瘤浸润淋巴细胞的特性，以解释T细胞免疫疗法疗效有限的原因 | 高级别胶质瘤（包括胶质母细胞瘤和IDH突变型4级星形细胞瘤）患者中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、配对V(D)J测序、细胞转录组和表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据、V(D)J序列数据 | 15例高级别胶质瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-03-02 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用现状及其与传统方法的权衡 | 将单细胞RNA测序这一创新技术引入斑马鱼生殖毒理学领域，提供细胞水平的转录组视角 | 单细胞RNA测序在生殖毒理学中仍属未充分利用的技术，且与传统方法存在权衡需考虑 | 探索单细胞RNA测序在生殖毒理学，特别是斑马鱼模型中的应用潜力 | 斑马鱼性腺组织 | 生殖毒理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-02-28 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-06-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，构建了成年雌性埃及伊蚊中肠的细胞图谱 | 首次建立了埃及伊蚊中肠单细胞分离与RNA测序的方案，并系统注释了其细胞类型，为在单细胞水平研究虫媒病毒与中肠的相互作用提供了基础 | 研究未直接应用于病毒-中肠相互作用的实验验证，且为新建立的方法，其广泛适用性有待进一步验证 | 构建埃及伊蚊中肠的单细胞转录组图谱，以支持后续在单细胞水平研究虫媒病毒感染机制 | 成年雌性埃及伊蚊的中肠组织 | 单细胞组学 | 虫媒病毒感染（如登革热、寨卡病毒等） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，研究对象为成年雌性埃及伊蚊中肠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-02-27 |
Single-cell transcriptome atlas of testes from mice with high-fat diets
2024-06-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03435-5
PMID:38834587
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了肥胖和瘦小鼠睾丸中的超过70,000个细胞，以探究高脂饮食诱导的肥胖对非生精细胞和精子发生的影响 | 首次提供了饮食诱导肥胖小鼠睾丸的单细胞RNA-seq数据集，为研究高脂饮食相关的男性生殖损伤提供了创新性见解和方向 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类转化的适用性可能有限，且未详细探讨肥胖影响的具体分子机制 | 探究肥胖对睾丸在分子水平的影响，特别是高脂饮食如何破坏睾丸内的细胞间通讯网络和影响精子发生 | 肥胖和瘦小鼠的睾丸细胞，包括非生精细胞和从精原细胞到精子的所有生精细胞 | 数字病理学 | 肥胖相关生殖损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过70,000个细胞来自肥胖和瘦小鼠的睾丸 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-02-18 |
iIMPACT: integrating image and molecular profiles for spatial transcriptomics analysis
2024-06-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03289-5
PMID:38844966
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研究论文 | 本文提出了一种名为iIMPACT的多阶段统计方法，用于整合组织学图像和分子数据以改进空间转录组学分析 | iIMPACT首次结合AI重建的组织学图像和基因表达空间背景来定义空间区域，并检测区域特异性差异表达基因，提升了准确性和可解释性 | 未在摘要中明确说明 | 克服现有空间转录组学聚类分析仅依赖分子信息而忽略形态特征的局限 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-02-05 |
Machine learning identifies activation of RUNX/AP-1 as drivers of mesenchymal and fibrotic regulatory programs in gastric cancer
2024-06-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278565.123
PMID:38777607
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研究论文 | 本研究利用ATAC-seq和RNA-seq数据，通过机器学习方法识别了胃癌中驱动间质和纤维化调控程序的关键转录因子，特别是RUNX/AP-1的激活 | 开发了一种基于ATAC-seq数据的机器学习方法，首次系统性地确定了胃癌中间质和上皮状态的转录因子驱动者，并揭示了拷贝数变异如何影响这些转录因子的失调 | NA | 探究胃癌中间质表型的调控机制，识别驱动胃癌异质性和进展的关键转录因子 | 胃癌细胞系和原发性肿瘤样本 | 机器学习 | 胃癌 | ATAC-seq, RNA-seq | 机器学习方法 | 基因组和转录组数据 | NA | NA | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-02-05 |
ScSNViz: a user-friendly toolset for visualization and analysis of Cell-Specific Expressed SNVs
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596816
PMID:38895293
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scSNViz的R语言工具集，用于可视化和分析单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异 | scSNViz是首个提供3D sceSNV可视化功能、兼容主流scRNA-seq处理工具（如Seurat、SingleR、scType）并支持轨迹推断（如Slingshot）的综合性工具集，填补了单细胞水平遗传变异分析工具的空缺 | 工具依赖于R环境，可能对非编程用户有一定学习曲线，且未提及处理大规模数据时的性能优化 | 开发一个用户友好的工具集，以可视化和分析单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异，促进对细胞异质性、克隆进化和基因表达调控的理解 | 单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过空间转录组学数据提供子图块图像的基因组特征，以弥补现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M是首个将病理图像子图块与高维基因表达数据（15,000-30,000维）配对的大规模数据集，提供了前所未有的空间分辨率，支持多模态数据分析的深入研究 | 数据集中仅包含1,149张原始图像，且基因表达数据维度较高，可能对计算资源要求较高，同时未提及数据来源的具体疾病类型或样本多样性 | 旨在通过提供细粒度的图像-基因表达配对数据，推动计算病理学和多模态算法的发展 | 空间转录组学数据中的病理图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |