单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 543 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-01 |
TRPV1 inhibition suppresses non-small cell lung cancer progression by inhibiting tumour growth and enhancing the immune response
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00894-7
PMID:37902941
|
研究论文 | 研究发现TRPV1在非小细胞肺癌中表达上调，抑制TRPV1可通过阻断Ca2+-IGF1R信号和抑制GABA分泌来抑制肿瘤生长并增强免疫反应 | 首次揭示TRPV1通过Ca2+-IGF1R信号通路促进NSCLC增殖并抑制凋亡，同时发现TRPV1通过调节GABA分泌影响肿瘤免疫微环境的新机制 | 未提及具体局限性 | 探索TRPV1在非小细胞肺癌发展中的作用及其机制 | 非小细胞肺癌细胞系和BALB/C、C57BL/6J小鼠肿瘤模型 | 机器学习 | 肺癌 | NA | NA | 空间转录组数据 | TCGA数据库；10× Genomics空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x 空间转录组学 | NA |
| 2 | 2026-05-01 |
ITGB2-ICAM1 axis promotes liver metastasis in BAP1-mutated uveal melanoma with retained hypoxia and ECM signatures
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00908-4
PMID:38150154
|
研究论文 | 揭示ITGB2-ICAM1轴在BAP1突变葡萄膜黑色素瘤肝转移中的作用及机制 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫活性小鼠模型发现ITGB2-ICAM1轴在BAP1突变相关葡萄膜黑色素瘤转移中维持缺氧和细胞外基质特征的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探索BAP1缺失驱动葡萄膜黑色素瘤转移的分子机制 | 葡萄膜黑色素瘤原发和转移肿瘤细胞、小鼠肝转移模型 | 单细胞转录组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 包含原发和转移性葡萄膜黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-04-30 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
|
研究论文 | 开发了PERCEPTION计算流程，利用单细胞转录组数据预测癌症患者治疗反应和耐药性 | 首次利用匹配的批量与单细胞表达谱构建个性化治疗反应模型，并成功在多个临床试验中验证 | NA | 开发基于单细胞转录组的精准肿瘤学计算工具，实现患者分层与治疗优化 | 培养细胞、患者肿瘤来源的原代细胞、多发性骨髓瘤和乳腺癌临床试验样本、肺癌患者 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤, 乳腺癌, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 大规模细胞系药物筛选数据及多个临床队列 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-04-29 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
|
研究论文 | 构建新生儿和成年小鼠T细胞发育的转录和表观遗传图谱，揭示年龄相关差异的基因调控程序 | 首次整合转录组和表观遗传组数据，揭示T细胞发育中与年龄相关的基因调控程序差异，并利用CRISPR扰动结合单细胞测序鉴定关键调控因子 | 仅基于小鼠模型，人类年龄相关差异需进一步验证 | 研究T细胞发育过程中与年龄相关的基因调控程序及其机制 | 新生儿和成年小鼠的胸腺细胞发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR扰动、表观遗传分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 新生儿和成年小鼠的胸腺细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒，结合CRISPR扰动技术 |
| 5 | 2026-04-29 |
Single-Cell Sequencing Illuminates Thymic Development: An Updated Framework for Understanding Thymic Epithelial Tumors
2024-06-03, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyae046
PMID:38520743
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解析胸腺上皮肿瘤研究中揭示的胸腺发育新框架，包括胸腺上皮区室的细胞多样性、分化与衰老过程及肿瘤发生机制 | 利用单细胞分子分析技术为胸腺上皮肿瘤的临床和基础研究提供新视角，提出针对肿瘤异质性和起源细胞等未解问题的新见解 | 胸腺上皮肿瘤的罕见性限制了肿瘤发生机制的研究和合理治疗方案的开发 | 探讨单细胞测序如何深化对胸腺正常发育和恶性转化的理解，以推动罕见胸腺上皮肿瘤的改进治疗策略 | 胸腺上皮肿瘤（包括胸腺瘤和胸腺癌）及正常胸腺组织 | 单细胞组学 | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-27 |
CTLA-4-expressing ILC3s restrain interleukin-23-mediated inflammation
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07537-3
PMID:38867048
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现肠道IL-23受体表达细胞中，ILC3s上调CTLA-4以抑制IL-23介导的炎症 | 首次揭示ILC3s表达CTLA-4作为免疫检查点限制IL-23病理作用的新机制 | 未阐明CTLA-4阳性ILC3s在人类炎症性肠病中的具体功能变化及长期效应 | 探究IL-23介导组织保护与病理炎症之间的调控机制 | 肠道IL-23受体表达细胞（T细胞和ILC3s）及小鼠模型 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肠道细胞及人类ILC3s样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 7 | 2026-04-24 |
Comprehensive single cell transcriptomics analysis of murine osteosarcoma uncovers Skp2 function in metastasis, genomic instability and immune activation and reveals additional target pathways
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597347
PMID:38895216
|
研究论文 | 对小鼠骨肉瘤进行单细胞转录组学分析，揭示Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的作用及额外靶向通路 | 首次通过单细胞RNA测序在免疫活性转基因小鼠模型中全面分析Skp2敲除对骨肉瘤肿瘤异质性、微环境复杂性、转移和免疫激活的影响，并发现潜在逃逸机制 | NA | 探索Skp2在骨肉瘤中的功能及其作为治疗靶点的潜力，并揭示相关分子机制 | 小鼠骨肉瘤肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨肉瘤小鼠模型的原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-24 |
Neutrophil extracellular traps induced by IL-1β promote endothelial dysfunction and aggravate limb ischemia
2024-06, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension
IF:4.3Q1
DOI:10.1038/s41440-024-01661-3
PMID:38605142
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-1β诱导的中性粒细胞胞外陷阱在肢体缺血中促进内皮功能障碍和加重缺血的机制 | 首次揭示IL-1β通过诱导NETs形成，并激活STAT1信号通路，导致内皮细胞激活和炎症，从而加重下肢缺血 | 文章未提及具体实验样本量及模型局限性 | 探究NETs在肢体缺血相关血管炎症和重塑中的功能意义 | 人类肢体缺血组织及小鼠缺血模型中的中性粒细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 下肢缺血，血管疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光，蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据，图像，蛋白质表达数据 | 人类肢体缺血样本和小鼠缺血模型样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-04-20 |
A body-brain circuit that regulates body inflammatory responses
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07469-y
PMID:38692285
|
研究论文 | 本文揭示了外周免疫刺激通过体-脑轴调控免疫反应的神经回路机制 | 首次发现促炎和抗炎细胞因子分别与不同迷走神经元群体通信，并证明选择性操纵该神经回路可有效抑制促炎反应并增强抗炎状态 | 未明确该神经回路在具体人类免疫疾病模型中的验证数据 | 探究体-脑轴在调控外周免疫反应中的作用机制 | 小鼠模型中的迷走神经元和免疫细胞 | 神经免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，功能成像 | NA | 基因表达数据，成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-04-19 |
Hypoxia inducible factor 2α promotes tolerogenic macrophage development during cardiac transplantation through transcriptional regulation of colony stimulating factor 1 receptor
2024-Jun-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2319623121
PMID:38889142
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析心脏移植排斥与耐受模型，发现HIF-2α通过转录调控CSF1R促进耐受性巨噬细胞发育，从而诱导移植耐受 | 首次在单细胞水平上无偏倚地鉴定出HIF-2α是耐受性单细胞亚群的关键转录因子，并揭示其通过直接调控CSF1R表达促进移植耐受的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体移植受者中验证；HIF稳定剂roxadustat的靶向递送系统仍需进一步优化 | 探索心脏移植中诱导免疫耐受的细胞与分子机制 | 小鼠心脏同种异体移植模型中的髓系细胞（单核细胞与巨噬细胞） | 单细胞组学与免疫学 | 器官移植免疫 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，条件性基因功能缺失/获得小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及急性排斥与耐受状态的心脏移植物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-17 |
Large-scale neurophysiology and single-cell profiling in human neuroscience
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07405-0
PMID:38898291
|
综述 | 本文探讨了大规模单细胞神经生理学、单细胞RNA测序和空间转录组学等技术在人类神经科学研究中的整合应用及其前景 | 提出了将清醒脑手术中切除的功能映射人脑组织进行体外培养，并进行多模态细胞与功能分析的工作流程，为理解人脑功能细胞架构提供了统一框架 | NA | 为人类神经科学研究提供一个统一框架，探索网络水平活动背后的细胞基础 | 人脑组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 神经像素技术, 体外组织长期培养 | NA | 神经生理学数据, 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-04-15 |
Hepatic organoids move from adolescence to maturity
2024-06, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15893
PMID:38451053
|
综述 | 本文回顾了肝类器官作为研究工具的发展历程，并探讨了其在肝脏基础研究、药物发现与安全性测试以及疾病病理生物学理解三个领域的贡献 | 系统性地阐述了肝类器官从“青春期”向“成熟期”发展的关键路径，并前瞻性地指出了未来五年内单细胞RNA测序、CRISPR技术与类器官方法学改进相结合将带来的突破 | 未提供具体的实验数据或案例研究，主要基于现有文献和发展趋势进行评述 | 评估肝类器官作为研究工具的当前应用与未来潜力，推动其在肝脏疾病研究和治疗中的应用 | 肝类器官及其在肝脏研究中的应用 | 组织工程与疾病模型 | 肝脏疾病（包括肝纤维化） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR技术、类器官培养技术 | 类器官模型 | 综述性文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-04-14 |
DeepIMAGER: Deeply Analyzing Gene Regulatory Networks from scRNA-seq Data
2024-06-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070766
PMID:39062480
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepIMAGER的先进计算工具，通过深度学习和数据整合来推断细胞特异性基因调控网络 | DeepIMAGER采用监督学习方法，将基因对的共表达模式转化为类图像表示，并整合转录因子结合信息进行模型训练，显著提高了基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种能够从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞特异性基因调控网络的工具 | 基因调控网络，涉及多种细胞类型，包括多发性骨髓瘤树突状细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq, ChIP-seq | 深度学习 | 图像表示（由基因对共表达模式转化而来） | 六种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-04-14 |
Exploring the Molecular Mechanism of Comorbidity of Type 2 Diabetes Mellitus and Colorectal Cancer: Insights from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-06-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060693
PMID:38927096
|
研究论文 | 本研究首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制，并识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3作为潜在的免疫生物标志物和药物靶点 | 首次整合bulk组学和单细胞测序验证来系统揭示T2DM与CRC共病的分子机制，识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3，并发现ENTPD3阳性的癌症相关成纤维细胞亚群具有独特的肿瘤抑制特征和免疫治疗预测价值 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏体内外实验验证；样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制和免疫学基础 | 2型糖尿病和结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Connectivity Map, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-04-11 |
Accurate Identification of Spatial Domain by Incorporating Global Spatial Proximity and Local Expression Proximity
2024-06-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060674
PMID:38927077
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SECE的深度学习方法，用于准确识别空间转录组学数据中的空间域，通过整合全局空间邻近性和局部表达邻近性来优化组织微环境和生物功能分析 | SECE方法首次同时捕捉局部和全局空间关系，并利用表达相似性和空间相似性聚合信息，克服了现有方法仅基于局部或全局关系进行分割的局限性 | NA | 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性，以更好地阐明组织微环境和生物功能 | 空间转录组学数据中的空间点（spots） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间转录组学数据 | 六个真实空间转录组学数据集，涵盖四个不同平台 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2026-04-11 |
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07478-x
PMID:38839950
|
研究论文 | 本研究揭示了MYCT1在调控人类造血干细胞内吞和环境感知中的关键作用，以维持干细胞特性 | 首次将MYCT1识别为人类造血干细胞的关键调节因子，通过控制内吞作用和环境感知来维持干细胞特性，并发现其在细胞培养中下调是HSC扩增的脆弱点 | 研究主要基于胎儿肝脏和脐带血来源的HSPCs，未涉及成人或其他来源的造血干细胞，且机制细节如MYCT1与信号通路的相互作用需进一步探索 | 探究人类造血干细胞自我更新和移植能力的调控机制，以改善体外培养扩增功能 | 人类造血干细胞和祖细胞（HSPCs），包括胎儿肝脏和脐带血来源 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序，慢病毒介导的基因敲低和过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胎儿肝脏和脐带血HSPCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-04-09 |
Unfolding the mysteries of heterogeneity from a high-resolution perspective: integration analysis of single-cell multi-omics and spatial omics revealed functionally heterogeneous cancer cells in ccRCC
2024-06-26, Aging
DOI:10.18632/aging.205974
PMID:38944814
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞多组学和空间组学数据，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中功能异质性癌细胞的分类、空间分布及其临床意义 | 首次结合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组测序，从多组学和空间维度系统解析ccRCC的肿瘤内异质性，并识别出调控功能异质性癌细胞的关键转录因子 | 未明确说明样本数量及具体测序平台细节，可能限制了结果的普适性和技术可重复性 | 阐明透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤内异质性的分子机制及其在癌症转移、复发和治疗抵抗中的作用 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤组织 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq），空间转录组测序（stRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq） | 一致性非负矩阵分解（cNMF）算法 | 单细胞转录组数据，染色质可及性数据，空间转录组数据，批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学，批量RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-04-07 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2024-06, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02255-1
PMID:38724673
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病（AML）与T细胞的相互作用，揭示了AML对T细胞杀伤敏感或抵抗的转录程序，并发现ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用 | 利用单细胞RNA-seq技术首次在AML与T细胞相互作用前后进行转录组分析，识别出与患者生存相关的抵抗程序，并验证ICAM1作为免疫突触关键成分在T细胞杀伤中的触发作用 | AML异质性意味着多种因素可能影响其对T细胞杀伤的敏感性，研究可能未涵盖所有决定因素 | 探究AML对T细胞杀伤的敏感性和抵抗机制，以及ICAM1在T细胞介导的AML杀伤中的作用 | 原发性AML患者样本、人工程细胞毒性CD4 T细胞、原代离体分离的CD8 T细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及原发性AML患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-04-07 |
Beyond the marrow: insights from comprehensive next-generation sequencing of extramedullary multiple myeloma tumors
2024-06, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02206-w
PMID:38493239
|
研究论文 | 本研究通过对14例髓外多发性骨髓瘤肿瘤样本进行全面的二代测序分析，揭示了其关键分子特征和肿瘤微环境 | 这是迄今为止最全面的EMM肿瘤二代测序分析，首次报告了EMM的肿瘤微环境特征，并首次开展了EMM的纵向研究以追踪从诊断到复发的分子变化 | 样本量较小（N=14），可能限制结果的普遍性 | 探究髓外多发性骨髓瘤的分子特征、肿瘤微环境及其与疾病发展和免疫治疗反应的关系 | 髓外多发性骨髓瘤肿瘤样本 | NA | 多发性骨髓瘤 | 二代测序，单细胞测序 | NA | 基因组测序数据，单细胞测序数据 | 14例EMM肿瘤样本，并利用大型CoMMpass数据集进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-04-05 |
Transcriptional control of the Cryptosporidium life cycle
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07466-1
PMID:38811723
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了隐孢子虫完整生命周期的基因表达程序，并鉴定了控制雄性发育的关键转录因子Myb-M | 推翻了现有模型，提出隐孢子虫仅存在三种细胞内阶段；首次鉴定了决定雄性命运的最早转录因子Myb-M；通过条件性表达和敲除证明了该因子对发育程序和感染的调控作用 | NA | 阐明隐孢子虫生命周期和性别发育的分子机制，为疫苗和治疗开发提供新靶点 | 隐孢子虫（Cryptosporidium parvum） | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 体外培养和感染动物模型中的隐孢子虫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |