单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
161	2024-08-05	N-MYC impairs innate immune signaling in high-grade serous ovarian carcinoma 2024-May-17, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adj5428 PMID:38748789	研究论文	该文章研究了N-MYC在高等级浆液性卵巢癌中的作用，特别是其对先天免疫信号的抑制	揭示了N-MYC通过抑制STING信号和RIG-I样受体信号来减弱肿瘤细胞的先天免疫反应，这是该领域的创新发现	研究主要集中在HGSC细胞系上，临床样本的多样性可能影响结果的普适性	探讨N-MYC如何影响高等级浆液性卵巢癌中的免疫信号传导	高等级浆液性卵巢癌细胞系与临床样本	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	涉及多个人类临床HGSC样本
162	2024-08-05	Single-cell transcriptome analysis reveals subtype-specific clonal evolution and microenvironmental changes in liver metastasis of pancreatic adenocarcinoma and their clinical implications 2024-May-03, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-024-02003-0 PMID:38702773	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺腺癌肝转移的亚型特异性克隆演化和微环境变化及其临床意义	揭示了基底样亚型细胞在化疗反应和患者结局中的关键作用以及PDAC的克隆演变与癌症相关基因的剂量变化之间的关系	研究仍需进一步探讨不同细胞亚型与TME的具体相互作用	了解胰腺导管腺癌的肿瘤演变和其临床关联	治疗前的原发性胰腺导管腺癌样本及其配对肝转移样本	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA数据	治疗前的原发性PDAC样本和配对的肝转移样本
163	2024-08-04	The mucosal concept in chronic rhinosinusitis: Focus on the epithelial barrier 2024-May, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.01.015 PMID:38295881	综述	该文献主要探讨了慢性鼻窦炎中上皮屏障的关键作用	文章强调了新技术（如单细胞转录组学）揭示的上皮屏障的新功能，如炎症记忆和神经内分泌功能	未提供具体的实验数据或样本数量，以支持提出的观点	旨在深入理解慢性鼻窦炎中的上皮细胞在粘膜框架中的作用	针对慢性鼻窦炎中上皮细胞的相关研究	NA	慢性鼻窦炎	单细胞转录组学	NA	NA	NA
164	2024-08-05	STAT3 protects hematopoietic stem cells by preventing activation of a deleterious autocrine type-I interferon response 2024-May, Leukemia IF:12.8Q1 DOI:10.1038/s41375-024-02218-6 PMID:38467768	研究论文	本研究探讨了STAT3在造血干细胞中的保护作用，防止有害自分泌式I型干扰素反应的激活	揭示了STAT3如何通过抑制有害的自分泌型I型干扰素反应来维持造血干细胞功能的全新机制	由于在骨髓嵌合小鼠中进行的研究，可能存在系统性炎症未完全消除的潜在影响	研究STAT3在造血干细胞功能中的作用及其潜在的治疗应用	STAT3缺失的造血干细胞和祖细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	20%的造血腔室中的混合骨髓嵌合小鼠
165	2024-08-05	Rejuvenation of peripheral immune cells attenuates Alzheimer's disease-like pathologies and behavioral deficits in a mouse model 2024-May-31, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adl1123 PMID:38809977	研究论文	本研究探讨了免疫复兴作为阿尔茨海默病治疗策略的潜力	该研究首次通过年轻骨髓移植恢复了老年小鼠血液免疫细胞中与衰老和AD相关基因的表达	研究仅在小鼠模型中进行，未在临床试验中验证其有效性	研究免疫复兴在阿尔茨海默病治疗中的应用	老年小鼠的免疫系统及其在阿尔茨海默病中的作用	数字病理学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	老年小鼠
166	2024-08-04	LINC01002 functions as a ceRNA to regulate FRMD8 by sponging miR-4324 for the development of COVID-19 2024-05-11, Virology journal IF:4.0Q2 DOI:10.1186/s12985-024-02382-2 PMID:38734674	研究论文	本研究探讨了SARS-CoV-2 N蛋白通过调节LINC01002作为ceRNA的功能，以抑制IFN-β的诱导。	本研究首次揭示了LINC01002通过吸附miR-4324调节FRMD8，并指出其在SARS-CoV-2感染早期干预治疗中的潜力。	本研究的局限性在于仅使用了A549细胞线，未在其他细胞类型中验证结果。	研究SARS-CoV-2 N蛋白在免疫逃逸中的作用机制。	研究的对象为SARS-CoV-2结构蛋白及相关的免疫调节基因。	数字病理学	COVID-19	RNA-seq	NA	基因表达数据	使用了A549细胞线及858个差异表达基因
167	2024-08-05	Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy 2024-May, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-024-02617-7 PMID:38424167	研究论文	该文章探讨了IL-7治疗如何通过激活T细胞和促炎性髓系细胞来诱导抗肿瘤免疫	发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多重表达，并证实IL-7治疗在小鼠模型中的有效性	在研究中未提供人类患者的临床数据以支持发现	研究IL-7抗癌免疫治疗对T细胞和免疫微环境的共同刺激作用	分析来自多种人类癌症和小鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	来自多个人类癌症的数据与一个小鼠肿瘤移植模型
168	2024-08-04	Comprehensive single-cell RNA-seq analysis using deep interpretable generative modeling guided by biological hierarchy knowledge 2024-May-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae314 PMID:38960404	研究论文	本文提出了一种深度可解释生成模型d-scIGM，用于单细胞数据分析。	d-scIGM结合锯齿连接技术和残差网络，并引入生物领域的层次先验知识，增强了模型的可解释性。	之前基于生成模型的研究大多限于浅层神经网络，可能限制了模型的能力。	探讨细胞异质性并提高单细胞转录组数据分析的可解释性。	单细胞转录组数据及其生物学解释。	计算机视觉	黑色素瘤	RNA-seq	深度生成模型	单细胞数据	涉及多个大规模实验和黑色素瘤数据集
169	2024-08-05	Identification of MUC1-C as a Target for Suppressing Progression of Head and Neck Squamous Cell Carcinomas 2024-May-14, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0011 PMID:38619287	研究论文	本研究报告了MUC1-C蛋白在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其作为抑制癌症进展的靶点	揭示了MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌中的新角色，并且表明其与肿瘤干细胞状态的联系	该研究在临床应用方面的具体有效性尚需进一步验证	探究MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌的发病机制中的作用	头颈部鳞状细胞癌细胞系	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
170	2024-08-04	A phosphate transporter in VIPergic neurons of the suprachiasmatic nucleus gates locomotor activity during the light/dark transition in mice 2024-May-28, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114220 PMID:38735047	研究论文	这篇文章研究了磷酸盐转运蛋白PiT2在小鼠上丘脑SCN中对行为的影响	鉴定了PiT2作为调节小鼠活动的磷酸盐转运蛋白，揭示了其在昼夜转换中的作用	研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于其他物种	探索上丘脑如何通过分子机制调节行为	小鼠SCN中的VipNms神经元	数字病理学	NA	斑点钳记录和单细胞测序	NA	生物电活动和基因表达数据	涉及的样本为小鼠SCN神经元群体
171	2024-08-05	Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma 2024-May-28, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114139 PMID:38652658	研究论文	本文探讨了胶质母细胞瘤中对KIF11抑制剂的抵抗机制	首次将谱系追踪条形码和单细胞RNA测序结合用于分析患者来源的胶质母细胞瘤中的药物抵抗	主要集中在药物对细胞的影响，缺乏对更大临床样本的验证	研究胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂的抵抗机制	患者来源的胶质母细胞瘤神经球及其对ispinesib的反应	数字病理学	胶质瘤	单细胞RNA测序	患者来源的异种移植模型	基因表达数据	涉及多个患者来源的胶质母细胞瘤样本
172	2024-08-05	The molecular basis of scale development highlighted by a single-cell atlas of Bicyclus anynana butterfly pupal forewings 2024-May-28, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114147 PMID:38662541	research paper	本研究探讨了Bicyclus anynana蝴蝶蛹前翅中鳞片细胞的多样性及其分子基础	通过单细胞RNA测序技术识别了不同类型的鳞片细胞，并揭示了关键基因在细胞分化中的作用	研究主要集中在单一物种的细胞类型，可能无法全面代表其他节肢动物的情况	探索蝴蝶翅膀鳞片细胞的多样性及其转录组学基础	Bicyclus anynana蝴蝶的雄性蛹前翅中的大约5200个鳞片细胞	机遇	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞转录组数据	约5200个大细胞
173	2024-08-05	Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of neutrophils in non-small cell lung cancer 2024-May, The journal of gene medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1002/jgm.3690 PMID:38735760	研究论文	本研究探讨了非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性	识别了四种主要类型的肿瘤相关中性粒细胞，并分析了其动态特征及转录因子调控	未提及具体的样本数量和来源的多样性	研究非小细胞肺癌中中性粒细胞的异质性	肿瘤相关的中性粒细胞和人源多形核中性粒细胞	数字病理学	非小细胞肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自基因表达综合数据库的样本
174	2024-08-05	Multi-omics analysis of human tendon adhesion reveals that ACKR1-regulated macrophage migration is involved in regeneration 2024-May-07, Bone research IF:14.3Q1 DOI:10.1038/s41413-024-00324-w PMID:38714649	研究论文	本文通过多组学分析揭示了ACKR1调控的巨噬细胞迁移参与人类肌腱粘连的再生过程	发现了一种新的抗纤维化巨噬细胞群体及其来源	研究中的抗纤维化机制仍需进一步验证和探讨	研究肌腱损伤后肌腱粘连的纤维化微环境	分析人类和小鼠的肌腱粘连组织样本	数字病理学	NA	单细胞RNA测序、蛋白组学	NA	组织样本	超过74000个单细胞
175	2024-08-05	scRNA-seq data from the larval Drosophila ventral cord provides a resource for studying motor systems function and development 2024-May-06, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.016 PMID:38569548	研究论文	本文利用高质量的单细胞RNA测序创建了幼虫腹神经索细胞类型的全面普查	揭示了腹神经索的神经谱系在幼虫阶段已经被定义但处于静息状态，为进一步研究提供了新资源	未提及具体的实验条件和样本采集的局限性	旨在研究和理解运动系统的发展和功能	研究幼虫腹神经索的细胞类型和相应的神经元集群	数字病理学	NA	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	细胞类型数据	NA
176	2024-08-04	MetalinksDB: a flexible and contextualizable resource of metabolite-protein interactions 2024-May-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae347 PMID:39038934	研究论文	本文介绍了一个名为MetalinksDB的资源，用于代谢物与蛋白质之间的相互作用	MetalinksDB比现有的代谢物-受体资源大一个数量级，并能够根据具体的生物学背景进行定制	目前的细胞间知识资源对于代谢物关注的范围有限，但MetalinksDB致力于对此进行扩展	研究代谢物与蛋白质之间的相互作用，以理解其在细胞功能中的重要性	代谢物和蛋白质的相互作用，特别是在肾癌和急性肾损伤中的作用	数字病理学	肾癌	空间转录组学	知识图谱	多组学数据	NA
177	2024-08-04	Single-Cell multiomics reveals ENL mutation perturbs kidney developmental trajectory by rewiring gene regulatory landscape 2024-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.05.09.591709 PMID:38766219	研究论文	研究单细胞多组学揭示ENL突变通过重塑基因调控景观来扰乱肾脏发育轨迹	该研究首次揭示了与Wilms肿瘤相关的ENL突变如何在单细胞水平上重塑基因调控网络并影响肾脏发育	该研究主要集中于小鼠模型，可能不完全适用于人类肾脏发育的研究	探讨表观遗传调控因子突变在肾脏发育和病理生理中的作用	Wilms肿瘤相关的ENL突变及其对肾脏发育的影响	数字病理学	肾癌	单细胞转录组学，组蛋白乙酰化结合活性抑制	小鼠模型	基因组数据	NA
178	2024-08-05	Increased Thyroid DPP4 Expression Is Associated With Inflammatory Process in Patients With Hashimoto Thyroiditis 2024-May-17, The Journal of clinical endocrinology and metabolism DOI:10.1210/clinem/dgad723 PMID:38127960	研究论文	本研究旨在调查Hashimoto甲状腺炎患者外周血和甲状腺组织中DPP4的表达，并探索其在病理生理过程中的作用	首次在Hashimoto甲状腺炎患者的甲状腺中发现DPP4表达显著增加，并主要局限于淋巴细胞	样本量较小，且未能探讨DPP4在其他类型甲状腺疾病中的作用	研究Hashimoto甲状腺炎患者中DPP4的表达及其在炎症过程中的角色	40名未服药的Hashimoto甲状腺炎患者和81名对照个体	数字病理学	Hashimoto甲状腺炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	血液和甲状腺组织样本	共121个样本（40名HT患者和81名对照个体）
179	2024-08-04	Stem-cell states converge in multistage cutaneous squamous cell carcinoma development 2024-May-31, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.adi7453 PMID:38815020	研究论文	本研究探讨了干细胞状态在多阶段皮肤鳞状细胞癌发展中的收敛性	研究揭示了前恶性肿瘤细胞中干细胞状态的收敛性，提供了新的癌症治疗靶点	研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类肿瘤生物学	理解干细胞在皮肤鳞状细胞癌发展中的作用	小鼠组织样本，包括正常组织和肿瘤组织	数字病理学	皮肤癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	数百个小鼠组织样本（正常和肿瘤）
180	2024-08-04	HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data 2024-05-21, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-024-03267-x PMID:38773520	研究论文	本文介绍了一种新算法HATCHet2，用于从肿瘤的多样本群体DNA测序数据中同时推断克隆和单倍型特异的拷贝数异常。	HATCHet2改进了早期HATCHet方法，通过引入新的统计量mhBAF来提高对焦点拷贝数异常的识别，并能识别镜像亚克隆CNAs。	该研究可能受限于从相对较小的样本中得出的结论，并未涵盖更广泛的样本多样性。	研究的目的是提高从肿瘤样本中推断拷贝数异常的准确性。	研究对象为来自10名前列腺癌患者的肿瘤样本。	数字病理学	前列腺癌	群体DNA测序	HATCHet2	基因组数据	10个前列腺癌患者的肿瘤样本