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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-07 |
Adhesion G Protein-Coupled Receptor Gpr126 (Adgrg6) Expression Profiling in Diseased Mouse, Rat, and Human Kidneys
2024-05-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100874
PMID:38786096
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研究论文 | 本研究系统分析了黏附G蛋白偶联受体Gpr126在小鼠、大鼠和人类肾脏疾病中的表达谱 | 首次在多种肾脏疾病模型中详细表征Gpr126的表达变化,并发现其在肾小管和肾小球损伤中的差异表达模式 | 研究主要关注表达谱分析,功能机制研究相对有限 | 探索Gpr126在肾脏疾病中的表达变化及其潜在治疗价值 | 小鼠、大鼠和人类肾脏组织样本 | 分子生物学 | 肾脏疾病 | RT-PCR, RNAscope定量分析, 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织样本 | 多种肾脏疾病患者样本(狼疮性肾炎、IgA肾病、FSGS、高血压、糖尿病、急性肾损伤、慢性肾脏病) | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列分析 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Unveils Dynamic Immune Cell Responses during Haemonchus contortus Infection
2024-05-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100842
PMID:38786064
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示山羊在捻转血矛线虫感染期间外周血单个核细胞的动态免疫细胞反应 | 首次在单细胞水平上系统解析捻转血矛线虫感染期间宿主外周血单个核细胞的转录组特征和细胞通讯网络 | 样本量较小(仅4只山羊),需要更大规模研究验证 | 探究山羊对捻转血矛线虫感染的免疫应答机制 | 波尔山羊的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序,qPCR,粪便虫卵计数 | NA | 单细胞转录组数据 | 4只波尔山羊(2只感染组,2只对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-07 |
ARID1B maintains mesenchymal stem cell quiescence via inhibition of BCL11B-mediated non-canonical Activin signaling
2024-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48285-2
PMID:38816354
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研究论文 | 本研究揭示了ARID1B通过抑制BCL11B介导的非经典Activin信号通路维持间充质干细胞静息状态的新机制 | 首次发现ARID1B通过直接结合Bcl11b第三内含子抑制其表达,从而调控非经典Activin信号通路维持MSC静息状态 | 研究主要基于小鼠切牙模型,在人类系统中的验证尚需进一步研究 | 探究ARID1B在间充质干细胞静息维持中的调控功能和分子机制 | 小鼠GLI1+间充质干细胞谱系 | 干细胞生物学 | Coffin-Siris综合征 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-07 |
Triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) regulates phagocytosis in glioblastoma
2024-05-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad257
PMID:38237157
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研究论文 | 本研究探讨了TREM2在胶质母细胞瘤中对髓系细胞吞噬功能的调控作用 | 首次发现TREM2在胶质瘤中与吞噬功能标志物正相关而非免疫抑制通路,并揭示其通过Syk信号通路介导吞噬作用 | 使用小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病,研究样本量未明确说明 | 探究TREM2在胶质母细胞瘤免疫病理和进展中的作用机制 | 人类胶质瘤样本和两种不同的小鼠胶质瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体内吞噬追踪方法,体外实验 | 小鼠胶质瘤模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-07 |
A phosphate transporter in VIPergic neurons of the suprachiasmatic nucleus gates locomotor activity during the light/dark transition in mice
2024-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114220
PMID:38735047
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研究论文 | 本研究通过电生理记录和单细胞测序发现视交叉上核VIP能神经元中的磷酸盐转运蛋白PiT2在夜间上调,调控小鼠明暗转换时的运动活动 | 首次发现PiT2磷酸盐转运蛋白在视交叉上核VIP能神经元中表达,并证明其通过调节神经元放电和蛋白质磷酸化来调控昼夜节律行为 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类或其他物种中验证 | 探索视交叉上核调控昼夜行为节律的分子机制 | 小鼠视交叉上核神经元 | 神经科学 | 昼夜节律紊乱 | 膜片钳记录,单细胞测序 | NA | 电生理数据,基因表达数据 | 小鼠视交叉上核单个神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-07 |
The molecular basis of scale development highlighted by a single-cell atlas of Bicyclus anynana butterfly pupal forewings
2024-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114147
PMID:38662541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了双环蝶前翅鳞片细胞发育的分子基础 | 首次在蝴蝶翅膀中应用单细胞RNA测序技术,识别了多种细胞类型的分子标记,并发现senseless和HR38基因在鳞片细胞分化中的关键调控作用 | 研究仅针对双环蝶特定发育阶段(22.5-25小时雄性蛹期)的前翅大细胞,样本范围有限 | 探索蝴蝶翅膀鳞片细胞多样性的分子基础 | 双环蝶前翅鳞片细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、原位杂交、免疫荧光、CRISPR-Cas9基因编辑 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 约5,200个大细胞(>6μm) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 147 | 2025-10-07 |
Understanding glioblastoma at the single-cell level: Recent advances and future challenges
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002640
PMID:38814900
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在胶质母细胞瘤研究中的最新进展与未来挑战 | 系统总结了单细胞转录组学在揭示胶质母细胞瘤异质性和细胞可塑性方面的新见解 | 存在成本高昂、数据分析复杂、临床转化困难等挑战 | 深入理解胶质母细胞瘤在单细胞水平的特征 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals the metastasis-associated immune signature of hepatocellular carcinoma
2024-05, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.1264
PMID:38780041
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌转移相关的免疫特征 | 发现转移性肝细胞癌中效应调节性T细胞富集和CCR7+树突状细胞分化抑制的新机制 | 研究基于生物信息学分析,需要实验验证 | 探索肝细胞癌转移相关的免疫特征 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 生物信息学分析 | 单细胞RNA测序数据 | 不同分期的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics reveals gene interactions and signaling pathway dynamics in rat embryos with anorectal malformation
2024-05-21, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09878-1
PMID:38769159
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了大鼠胚胎肛门直肠畸形的基因表达特征和信号通路动态 | 首次在胚胎发育过程中应用空间转录组学技术,揭示了肛门直肠畸形中位置特异性基因表达模式和信号通路协同作用 | 研究仅针对GD14-GD16胚胎期,缺乏更早期或更晚期的发育阶段分析 | 探究肛门直肠畸形的分子机制和基因调控网络 | 大鼠胚胎(正常组和肛门直肠畸形组) | 空间转录组学 | 肛门直肠畸形 | 空间转录组学,免疫荧光染色,WGCNA,GSEA,PROGENy | NA | 空间基因表达数据,图像数据 | GD14-GD16胚胎期大鼠样本(包含正常和畸形病例) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 150 | 2025-10-07 |
LYVE-1-expressing Macrophages Modulate the Hyaluronan-containing Extracellular Matrix in the Mammary Stroma and Contribute to Mammary Tumor Growth
2024-05-31, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0205
PMID:38717149
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研究论文 | 本研究揭示了LYVE-1+巨噬细胞通过调节透明质酸细胞外基质促进乳腺肿瘤生长的机制 | 首次证明LYVE-1+巨噬细胞通过降解透明质酸和调节免疫微环境促进肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究LYVE-1+巨噬细胞在乳腺基质和肿瘤微环境中的功能 | 小鼠乳腺组织和乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2025-10-07 |
Identification of MUC1-C as a Target for Suppressing Progression of Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2024-05-14, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0011
PMID:38619287
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研究论文 | 本研究揭示了MUC1-C蛋白在头颈部鳞状细胞癌进展中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现MUC1-C通过整合STAT1炎症通路与∆Np63、SOX2基因表达,驱动头颈部鳞癌干细胞状态 | 主要基于细胞系研究,需要更多体内实验验证 | 探索MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌进展中的作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系和肿瘤样本 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-07 |
Role of ferroptosis in neuroimmunity and neurodegeneration in multiple sclerosis revealed by multi-omics data
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18396
PMID:38801304
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研究论文 | 通过多组学数据揭示铁死亡在多发性硬化症神经免疫和神经退行性变中的作用 | 开发了铁死亡水平的计算指标,首次通过整合单核RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学数据系统研究铁死亡在多发性硬化症中的作用机制 | 铁死亡在多发性硬化症中的确切作用机制仍需进一步验证 | 探究铁死亡在多发性硬化症发病机制中的作用 | 多发性硬化症患者样本 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | snRNA-seq, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, AUCell方法 | 诊断模型 | 多组学数据 | 七个不同白质病变区域的样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 153 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals evolutionary reconfiguration of embryonic cell fate specification in the sea urchin Heliocidaris erythrogramma
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.30.591752
PMID:38746376
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研究论文 | 通过单细胞转录组比较分析揭示海胆胚胎细胞命运特化的进化重配置 | 首次利用比较单细胞RNA-seq发育时间序列揭示胚胎模式形成中的多样化进化变化 | 需要后续实验验证候选调控相互作用的假设 | 研究发育进化中调控互作的改变如何影响表型多样性 | 海胆Heliocidaris erythrogramma和其近缘物种的胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海胆物种的发育时间序列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 154 | 2025-01-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics analysis of non-small cell lung cancer
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48700-8
PMID:38782901
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,探讨了非小细胞肺癌中的肿瘤生态系统,特别是髓系细胞的作用 | 揭示了肿瘤中抗炎性巨噬细胞与NK细胞/T细胞之间的反向关系,以及巨噬细胞在肿瘤中的转录重编程现象 | 样本量相对较小,仅包括25名未接受治疗的患者 | 研究非小细胞肺癌肿瘤生态系统中的免疫细胞类型及其作用 | 25名未接受治疗的腺癌和鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 约900,000个细胞,来自25名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2025-01-07 |
MUSTANG: Multi-sample spatial transcriptomics data analysis with cross-sample transcriptional similarity guidance
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100986
PMID:38800365
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MUSTANG的空间转录组数据分析框架,能够通过跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性进行多样本空间转录组数据的细胞去卷积 | MUSTANG框架创新性地结合了跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性,提升了多样本空间转录组数据的分析能力 | NA | 开发一种能够有效分析多样本空间转录组数据的框架,以揭示组织样本细胞特征中的生物学见解 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 一个半合成空间转录组数据集和三个真实世界空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2025-01-07 |
DeepDecon accurately estimates cancer cell fractions in bulk RNA-seq data
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100969
PMID:38800361
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研究论文 | 本文介绍了DeepDecon,一种利用单细胞基因表达信息准确预测大块组织中癌细胞比例的深度神经网络模型 | DeepDecon通过迭代估计癌细胞比例的策略,提高了大块RNA-seq数据中细胞组成分解的准确性 | NA | 研究目的是提高大块RNA-seq数据中癌细胞比例的估计准确性 | 大块RNA-seq数据中的癌细胞比例 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | 深度神经网络 | RNA-seq数据 | 模拟和真实癌症数据 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2025-01-07 |
Comprehensive integration of single-cell transcriptomic data illuminates the regulatory network architecture of plant cell fate specification
2024-May, Plant diversity
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.pld.2024.03.008
PMID:38798726
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研究论文 | 本文通过整合63个已发表的单细胞转录组数据集,构建了一个全面的植物幼苗单细胞转录组图谱,揭示了细胞类型特异性基因调控网络 | 首次整合大量单细胞转录组数据,构建了涵盖广泛组织的植物细胞图谱,并系统性地构建了细胞类型特异性基因调控网络 | NA | 揭示植物细胞命运决定的调控网络架构 | 植物幼苗 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了63个已发表的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2025-01-06 |
MNMST: topology of cell networks leverages identification of spatial domains from spatial transcriptomics data
2024-05-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03272-0
PMID:38783355
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研究论文 | 本文提出了一种多层网络模型MNMST,用于通过联合学习识别空间转录组数据中的空间域 | 利用细胞网络的拓扑结构精确表征和区分空间域,提高了空间域的识别和可解释性,超越了现有基线方法 | 未提及具体局限性 | 提高空间转录组数据中空间域的识别和可解释性 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 多层网络模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2025-01-01 |
The expression of immune related genes and potential regulatory mechanisms in schizophrenia
2024-05, Schizophrenia research
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.schres.2023.11.007
PMID:37993327
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和批量RNA数据分析,探讨了免疫功能障碍在精神分裂症发病机制中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了精神分裂症组织中细胞组成的显著差异及免疫相关基因的异常表达 | 未涉及实验验证,且样本来源和数量未明确说明 | 探讨免疫功能障碍在精神分裂症发病机制中的作用 | 精神分裂症患者的脑组织 | 生物信息学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-12-22 |
Barcoding Notch signaling in the developing brain
2024-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.10.593533
PMID:38766256
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SABER-seq的CRISPR-Cas分子记录器,用于在发育中的斑马鱼大脑中记录Notch信号,并通过单细胞转录组学进行后期解构 | SABER-seq是一种新型平台,能够快速、可扩展且高分辨率地映射发育过程中的信号活动 | 传统的基于荧光的信号报告器在可扩展性和细胞类型的分子分辨率方面存在局限性 | 开发一种新的技术来记录和分析发育过程中的信号输入 | 斑马鱼大脑中的Notch信号 | NA | NA | CRISPR-Cas, 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | 斑马鱼大脑中的细胞 | NA | NA | NA | NA |