单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 543 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-22 |
Examining the Effects of Nutrient Supplementation on Metabolic Pathways via Mitochondrial Ferredoxin in Aging Ovaries
2024-05-13, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu16101470
PMID:38794708
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研究论文 | 研究通过营养补充剂对衰老卵巢中线粒体铁氧还原蛋白在代谢途径中的作用进行探讨 | 采用多组学分析方法，结合空间转录组学、单细胞RNA测序、人类卵巢病理学和临床活检数据，探讨FDX1作为卵巢衰老标志物的潜力 | 研究仅涉及70名患者，且仅进行了两个月的临床试验，可能需要更大规模和更长时间的研究来验证结果 | 探讨营养补充剂对衰老卵巢中代谢途径的影响，特别是通过线粒体铁氧还原蛋白FDX1的作用 | 衰老卵巢中的卵母细胞 | NA | NA | 多组学分析 | NA | 转录组数据 | 70名患有衰老卵巢的患者 |
| 142 | 2024-08-22 |
ScRNA-seq of gastric cancer tissues reveals differences in the immune microenvironment of primary tumors and metastases
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03012-5
PMID:38555278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胃癌原发肿瘤和转移瘤组织的转录组，揭示了两者在免疫微环境上的差异 | 首次详细比较了胃癌原发肿瘤和转移瘤在免疫微环境中的差异，特别是CD8 T细胞和表达ApoE的巨噬细胞的差异 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探究胃癌原发肿瘤和转移瘤在免疫微环境中的差异及其潜在机制 | 胃癌的原发肿瘤和转移瘤组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 46份胃癌原发肿瘤、邻近非肿瘤组织和转移瘤组织 |
| 143 | 2024-08-21 |
A hybrid demultiplexing strategy that improves performance and robustness of cell hashing
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae254
PMID:38828640
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研究论文 | 本文介绍了一种混合解复用策略，提高了细胞哈希技术在多样本单细胞测序中的准确性和细胞回收率 | 引入了一种结合细胞哈希和遗传变异聚类的混合解复用策略，以及开发了HTOreader工具，提高了在多标签或样本大小不平衡实验中的准确性和细胞回收率 | 未提及具体限制 | 提高细胞哈希技术在多样本单细胞测序中的性能和鲁棒性 | 细胞哈希技术及其在单细胞测序中的应用 | 单细胞测序 | NA | 细胞哈希 | NA | 单细胞测序数据 | 未提及具体样本数量 |
| 144 | 2024-08-21 |
An integrated multi-omics analysis reveals osteokines involved in global regulation
2024-May-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.03.006
PMID:38574738
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析方法，探讨了骨分泌蛋白（osteokines）在骨代谢和全身稳态中的作用及其调控机制 | 本研究首次识别了375种候选osteokines及其在衰老和机械加载/卸载条件下的变化，并揭示了它们在骨和其他器官间的通信机制 | NA | 揭示osteokines的真实身份、细胞来源及其调控机制 | 骨和非骨骼组织、成骨细胞条件培养基、骨髓上清液和血清中的osteokines | 数字病理学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | RNA、蛋白质 | NA |
| 145 | 2024-08-17 |
Deciphering novel TCF4-driven mechanisms underlying a common triplet repeat expansion-mediated disease
2024-May, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011230
PMID:38713708
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研究论文 | 本文研究了Fuchs角膜内皮营养不良（FECD）中由CTG18.1重复元素扩展驱动的分子机制，通过分析患者来源的角膜内皮细胞的转录组数据，揭示了扩展特异性的转录组标志物和TCF4异构体比例偏斜。 | 首次全面描述了CTG18.1扩展在FECD中的分子机制，包括全局剪接改变和独特的转录本，以及TCF4异构体比例的偏斜。 | NA | 揭示由CTG18.1重复元素扩展介导的FECD的分子机制 | 患者来源的角膜内皮细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 长读长测序、短读长测序和空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 134例FECD患者 |
| 146 | 2024-08-16 |
DNMT1-targeting remodeling global DNA hypomethylation for enhanced tumor suppression and circumvented toxicity in oral squamous cell carcinoma
2024-May-16, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-01993-1
PMID:38755637
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研究论文 | 本研究通过靶向DNMT1调控口腔鳞状细胞癌（OSCC）中的全局DNA低甲基化，以增强肿瘤抑制并减少毒性 | 本研究首次揭示了DNMT1调控的全新全局DNA低甲基化模式，通过平衡信号协同作用来增强抗癌效果并减少潜在毒性 | NA | 探讨DNMT1在口腔鳞状细胞癌中的作用及其对全局DNA甲基化的影响 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC） | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | shRNA敲低技术，DNA甲基化微阵列，单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据，RNA序列数据 | 包括体外口腔癌细胞和异种移植OSCC小鼠模型 |
| 147 | 2024-08-16 |
A Mettl16/m6A/mybl2b/Igf2bp1 axis ensures cell cycle progression of embryonic hematopoietic stem and progenitor cells
2024-May, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00082-9
PMID:38605226
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研究论文 | 本文通过跨物种单细胞RNA测序分析，揭示了METTL16在胚胎造血干细胞和祖细胞（HSPCs）中的高表达及其在细胞周期进展中的关键作用。 | 首次发现METTL16通过m6A修饰调控细胞周期转录因子mybl2b，并通过METTL16-mA-MYBL2-IGF2BP1轴在人类中保守控制G1/S进展。 | NA | 阐明METTL16介导的m6A修饰在早期胚胎发育中对HSPC细胞周期进展的关键功能。 | 胚胎造血干细胞和祖细胞（HSPCs）及其细胞周期进展。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及斑马鱼和人类样本 |
| 148 | 2024-08-14 |
Sex-specific circulating unconventional neutrophils determine immunological outcome of auto-inflammatory Behçet's uveitis
2024-May-04, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00671-2
PMID:38704363
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析、中性粒细胞特异性基因敲除和转移实验，揭示了两种非常规（干扰素-α响应和T细胞调节）中性粒细胞亚群的失调导致男性在自身炎症性Behçet眼炎中的发病率、严重程度和预后较差 | 首次在单细胞分辨率下识别出正常和自身炎症条件下中性粒细胞组成的广泛性别特异性异质性，并发现非常规中性粒细胞亚群在性别特异性治疗目标中的重要性 | NA | 研究中性粒细胞在性别特异性炎症疾病中的机制 | 中性粒细胞及其在自身炎症性Behçet眼炎中的作用 | 免疫学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 149 | 2024-08-14 |
Diabetes Accelerates Steatohepatitis in Mice: Liver Pathology and Single-Cell Gene Expression Signatures
2024-05, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.01.007
PMID:38309428
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病对非酒精性脂肪性肝炎的影响，并建立了一种新的糖尿病性非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型 | 本研究建立了新的糖尿病性非酒精性脂肪性肝炎模型，并利用单细胞RNA测序分析了糖尿病对肝脏非实质细胞的影响 | NA | 研究糖尿病如何加速小鼠的非酒精性脂肪性肝炎 | C57BL/6J雄性小鼠 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | NA |
| 150 | 2024-08-11 |
Molecular and cellular mechanisms of selective vulnerability in neurodegenerative diseases
2024-May, Nature reviews. Neuroscience
DOI:10.1038/s41583-024-00806-0
PMID:38575768
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综述 | 本文综述了神经退行性疾病中特定神经元亚型选择性脆弱性的分子和细胞机制 | 介绍了单细胞转录组学、基于CRISPR的筛选和人类细胞疾病模型等新方法在理解选择性脆弱性方面的突破 | NA | 旨在阐明决定选择性脆弱性和弹性的分子机制，揭示驱动神经退行性的关键过程 | 神经退行性疾病中的特定脑区和细胞类型 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学, CRISPR, 人类细胞疾病模型 | NA | 细胞 | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
Identification of cell surface markers for acute myeloid leukemia prognosis based on multi-model analysis
2024-May-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.38.20240065
PMID:38807380
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研究论文 | 本研究通过多模型分析构建了一个9个细胞表面标记物的预后模型，用于急性髓系白血病患者的危险分层 | 本研究首次利用多模型分析方法构建了一个包含9个细胞表面标记物的预后模型，并验证了其在独立数据集中的预测价值 | NA | 识别急性髓系白血病的预后生物标志物，并指导治疗 | 急性髓系白血病患者及其细胞表面标记物 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 弹性网络, 自适应LASSO回归 | 基因表达数据 | 涉及三个独立数据集的急性髓系白血病患者 |
| 152 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Shows T-Cell Exhaustion Landscape in the Peripheral Blood of Patients with Hepatitis B Virus-Associated Acute-on-Chronic Liver Failure
2024-05-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl220449
PMID:37317515
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血中T细胞亚群的异质性和耗竭T淋巴细胞的特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血中T细胞的耗竭景观，并分析了耗竭T细胞的基因表达谱和发展轨迹 | 研究样本仅包括乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者和健康对照，未涉及其他疾病状态的患者 | 探索乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血T细胞亚群的异质性和耗竭T淋巴细胞的特征，以识别免疫功能障碍的潜在治疗靶点 | 乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者和健康对照的外周血T细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 83,577个T细胞 |
| 153 | 2024-08-08 |
Spatial and single-cell colocalisation analysis reveals MDK-mediated immunosuppressive environment with regulatory T cells in colorectal carcinogenesis
2024-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105102
PMID:38614865
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞共定位分析，揭示了中肾因子（MDK）介导的免疫抑制环境与调节性T细胞（Tregs）在结直肠癌发生中的作用 | 首次在结直肠癌早期阶段通过空间分布的单细胞分析，识别出MDK作为肿瘤上皮细胞向Tregs发送的主要信号分子，并发现MDK与SDC4的相互作用与Treg共定位相关 | 研究样本量较小，仅包括五个早期结直肠癌病例和一个晚期病例 | 探究促进腺瘤向散发性结直肠癌进展的细胞间相互作用因子，并评估其在结直肠癌患者中的临床意义 | 结直肠癌的肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，单细胞转录组 | 深度生成模型 | 单细胞数据 | 五个早期结直肠癌病例和一个晚期病例 |
| 154 | 2024-08-08 |
Intratumoral CD38+CD19+B cells associate with poor clinical outcomes and immunosuppression in patients with pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105098
PMID:38608514
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨胰腺导管腺癌（PDAC）中B细胞的异质性，并发现CD38+ B细胞的存在与不良临床结果和免疫抑制相关。 | 首次揭示了PDAC中CD38+ B细胞的免疫调节功能及其作为独立预后因子的潜力。 | 研究样本量有限，且未涉及所有可能的B细胞亚型及其在不同肿瘤微环境中的作用。 | 旨在识别PDAC中B细胞的异质性，并探索其作为治疗策略的新靶点。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的B细胞及其与临床结果的关系。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | FUSCC队列147例，TCGA队列176例 |
| 155 | 2024-08-07 |
Genetic and transcriptomic landscape of colonic diverticulosis
2024-05-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331267
PMID:38443061
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研究论文 | 本文通过病例对照研究，分析了结肠憩室病的遗传和转录组学特征 | 首次通过遗传和转录组学研究，揭示了结肠憩室病的发病机制，并发现了与该疾病相关的关键基因 | 研究样本仅限于404名患者，可能影响结果的普遍性 | 旨在识别结肠憩室病的遗传和细胞决定因素，并探讨其与其他胃肠疾病的关系 | 结肠憩室病患者和非患者的结肠组织 | 数字病理学 | 结肠憩室病 | DNA和RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 404名患者（172名患有结肠憩室病，232名未患） |
| 156 | 2024-08-07 |
Targeting MMP9 in CTNNB1 mutant hepatocellular carcinoma restores CD8+ T cell-mediated antitumour immunity and improves anti-PD-1 efficacy
2024-05-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331342
PMID:38123979
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研究论文 | 本文研究了CTNNB1功能获得性突变（CTNNB1 GOF）在肝细胞癌（HCC）中导致的免疫逃逸机制，并提出了一种新的治疗策略以增强HCC中抗PD-1疗法的疗效 | 发现MMP9在CTNNB1 GOF HCC中的显著上调，并通过抑制CD8+ T细胞的浸润和细胞毒性，驱动抑制性肿瘤免疫微环境（TIME）和抗PD-1抵抗 | NA | 探究CTNNB1 GOF HCC介导的免疫逃逸机制，并提出新的治疗策略以增强抗PD-1疗法的疗效 | CTNNB1 GOF HCC中的免疫逃逸机制及MMP9的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | RNA序列、蛋白质 | 使用了体外共培养系统、小鼠皮下或原位模型、条件性基因敲除小鼠的自发肿瘤模型 |
| 157 | 2024-08-07 |
Feature selection followed by a novel residuals-based normalization simplifies and improves single-cell gene expression analysis
2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.02.530891
PMID:38328133
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研究论文 | 本文提出了一种改进的单细胞RNA测序数据分析流程，包括先进行特征选择再进行基于残差的归一化方法 | 提出了一种新的基于残差的归一化方法和先特征选择后归一化的流程，显著改善了下游聚类分析 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 生物已知和模拟的计数数据集 |
| 158 | 2024-08-07 |
Integrative multi-omics profiling in human decedents receiving pig heart xenografts
2024-May, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02972-1
PMID:38760586
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研究论文 | 本文通过多组学分析方法，研究了接受猪心脏异种移植的人类受者的分子和免疫反应 | 首次详细描述了心脏异种移植后早期分子和免疫反应的差异，并揭示了新的见解 | 研究仅基于两名受者的样本，可能限制了结果的普遍性 | 深入理解异种移植后的详细分子景观，并探索改善移植结果的靶向治疗方法 | 接受猪心脏异种移植的人类受者的血液和组织样本 | 数字病理学 | NA | 转录组学、脂质组学、蛋白质组学和代谢组学 | NA | 血液样本和组织样本 | 两名受者 |
| 159 | 2024-08-05 |
N-MYC impairs innate immune signaling in high-grade serous ovarian carcinoma
2024-May-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj5428
PMID:38748789
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研究论文 | 该文章研究了N-MYC在高等级浆液性卵巢癌中的作用，特别是其对先天免疫信号的抑制 | 揭示了N-MYC通过抑制STING信号和RIG-I样受体信号来减弱肿瘤细胞的先天免疫反应，这是该领域的创新发现 | 研究主要集中在HGSC细胞系上，临床样本的多样性可能影响结果的普适性 | 探讨N-MYC如何影响高等级浆液性卵巢癌中的免疫信号传导 | 高等级浆液性卵巢癌细胞系与临床样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涉及多个人类临床HGSC样本 |
| 160 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals subtype-specific clonal evolution and microenvironmental changes in liver metastasis of pancreatic adenocarcinoma and their clinical implications
2024-May-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02003-0
PMID:38702773
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺腺癌肝转移的亚型特异性克隆演化和微环境变化及其临床意义 | 揭示了基底样亚型细胞在化疗反应和患者结局中的关键作用以及PDAC的克隆演变与癌症相关基因的剂量变化之间的关系 | 研究仍需进一步探讨不同细胞亚型与TME的具体相互作用 | 了解胰腺导管腺癌的肿瘤演变和其临床关联 | 治疗前的原发性胰腺导管腺癌样本及其配对肝转移样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 治疗前的原发性PDAC样本和配对的肝转移样本 |