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当前共找到 539 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-07 |
Choline metabolism reprogramming mediates an immunosuppressive microenvironment in non-small cell lung cancer (NSCLC) by promoting tumor-associated macrophage functional polarization and endothelial cell proliferation
2024-05-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05242-3
PMID:38730286
|
研究论文 | 本研究探讨胆碱代谢通过调控肿瘤相关巨噬细胞功能和内皮细胞增殖重塑非小细胞肺癌免疫抑制微环境的机制 | 首次发现胆碱酯酶水平与免疫治疗预后的关联，并构建了胆碱代谢相关基因特征揭示其在免疫抑制微环境中的作用机制 | 研究为单中心回顾性分析，样本量有限，需要多中心前瞻性研究验证 | 探索胆碱代谢在非小细胞肺癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 277例接受一线免疫治疗的晚期非小细胞肺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，Cox回归分析，Kaplan-Meier生存分析，功能富集分析 | 预后模型，列线图 | 临床数据，基因表达数据，单细胞测序数据 | 277例晚期NSCLC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-10-07 |
Integrative analyses of bulk and single-cell transcriptomics reveals the infiltration and crosstalk of cancer-associated fibroblasts as a novel predictor for prognosis and microenvironment remodeling in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-05-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05238-z
PMID:38702814
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研究论文 | 本研究通过整合分析和单细胞转录组学揭示了癌症相关成纤维细胞在肝内胆管癌中的浸润特征及其与肿瘤细胞的相互作用 | 首次构建了CAFs浸润评分系统并揭示了成纤维细胞与肿瘤细胞通过多种信号通路相互作用的机制 | 研究结果需要进一步实验验证，样本量相对有限 | 探索肝内胆管癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及其与肿瘤细胞的相互作用 | 肝内胆管癌组织和癌旁正常组织 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 加权基因共表达网络分析,单细胞转录组学分析,SCENIC分析 | WGCNA,回归分析 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | TCGA-CHOL队列,GSE89748队列和107,943队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-10-07 |
A multi-platform analysis of human gingival crevicular fluid reveals ferroptosis as a relevant regulated cell death mechanism during the clinical progression of periodontitis
2024-05-27, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00306-y
PMID:38802345
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研究论文 | 通过多平台分析揭示铁死亡在牙周炎临床进展中的重要作用 | 首次在牙周炎患者中发现与铁死亡相关的蛋白质和生物学过程 | 样本量较小（16名患者），观察时间有限（12周） | 研究铁死亡在牙周炎进展中的作用机制 | 牙周炎患者的龈沟液和牙龈组织 | 生物信息学 | 牙周炎 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、Western blot、生物信息学分析 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 16名牙周炎诊断患者，12周临床监测 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 使用公共单细胞RNA测序数据集GSE164241 |
| 124 | 2025-10-07 |
Machine learning and deep learning to identifying subarachnoid haemorrhage macrophage-associated biomarkers by bulk and single-cell sequencing
2024-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18296
PMID:38702954
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组测序分析蛛网膜下腔出血大鼠模型中的巨噬细胞亚群，并开发诊断模型识别关键生物标志物 | 结合单细胞测序和批量RNA测序识别SAH特异性巨噬细胞亚群，并开发基于机器学习和卷积神经网络的诊断模型 | 需要进一步的实验和临床研究来验证研究结果并探索治疗靶点的临床意义 | 识别蛛网膜下腔出血巨噬细胞相关生物标志物以改进诊断和治疗策略 | 蛛网膜下腔出血大鼠模型的脑组织样本 | 机器学习, 深度学习 | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞转录组测序, 批量RNA测序 | 卷积神经网络, 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-10-07 |
Transcriptomic and spatial dissection of human ex vivo right atrial tissue reveals proinflammatory microvascular changes in ischemic heart disease
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101556
PMID:38776872
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析人类离体右心房组织，揭示缺血性心脏病中促炎性微血管变化 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术系统分析人类右心房组织在心血管疾病中的基因表达变化 | 研究样本为离体组织，可能无法完全反映体内真实情况；对照组为接受预防性手术的瓣膜病患者 | 揭示缺血性心脏病和心力衰竭中右心房组织的分子和细胞变化机制 | 人类离体右心房组织和心包液 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确样本数量（使用瓣膜病患者作为对照组） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-07 |
Systematic dissection of tumor-normal single-cell ecosystems across a thousand tumors of 30 cancer types
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48310-4
PMID:38744958
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研究论文 | 通过整合分析490万个单细胞转录组数据，系统解析了30种癌症类型中肿瘤-正常组织的生态系统 | 首次在如此大规模的单细胞水平上系统描绘肿瘤-正常组织生态系统，发现了AKR1C1或WNT5A标记的炎症成纤维细胞特征及干扰素富集的群落状态 | 样本来源和癌症类型可能存在选择偏差，部分发现需要进一步功能验证 | 全面解析肿瘤微环境中肿瘤与正常组织的相互作用和异质性 | 1070个肿瘤样本和493个正常样本，涵盖30种癌症类型 | 单细胞生物学 | 多癌种 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 去卷积分析, 共现分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 490万单细胞(1070肿瘤+493正常样本), 137个空间转录组, 8887个TCGA样本, 1261个免疫治疗样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2025-10-07 |
Heart failure promotes multimorbidity through innate immune memory
2024-05-24, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade3814
PMID:38787963
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研究论文 | 本研究揭示了心力衰竭通过改变造血干细胞表观基因组驱动多病共存的新机制 | 首次发现心力衰竭通过抑制TGF-β信号通路改变造血干细胞的表观遗传状态，形成天然免疫记忆，从而促进多病共存 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究心力衰竭促进多病共存的分子机制 | 心力衰竭小鼠模型及其造血干细胞 | 基础医学研究 | 心血管疾病 | 骨髓移植、染色质可及性分析、单细胞RNA测序 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-10-07 |
Gene networks and systems biology in Alzheimer's disease: Insights from multi-omics approaches
2024-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13790
PMID:38534018
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综述 | 本文综述了多组学方法在阿尔茨海默病基因网络和系统生物学研究中的应用与发现 | 整合单细胞组学和空间组学技术，在单细胞分辨率和空间维度上研究阿尔茨海默病的基因调控网络 | NA | 全面理解阿尔茨海默病的发病机制 | 阿尔茨海默病相关的基因网络和分子机制 | 系统生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,表观基因组学,空间组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 129 | 2025-10-07 |
Transfer Learning Reveals Cancer-Associated Fibroblasts Are Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition and Inflammation in Cancer Cells in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1660
PMID:38587552
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研究论文 | 本研究通过整合人类肿瘤单细胞数据与类器官共培养实验，揭示了胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞与上皮细胞上皮-间质转化和炎症状态的关联 | 引入从人类单细胞数据到类器官共培养分析的迁移学习方法，用于细胞间相互作用的实验验证 | NA | 识别肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 胰腺导管腺癌患者样本和类器官共培养系统 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，迁移学习，类器官共培养 | 迁移学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-07 |
SCIPAC: quantitative estimation of cell-phenotype associations
2024-05-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03263-1
PMID:38741183
|
研究论文 | 开发了首个能够定量估计单细胞数据中每个细胞与表型关联的算法SCIPAC | 首个能够定量估计单细胞数据中细胞与表型关联的算法，并为每个关联提供p值 | 未在摘要中明确说明 | 确定单细胞RNA测序数据中细胞与表型（如癌症）之间的关联 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | SCIPAC算法 | 单细胞RNA测序数据 | 四个真实数据集（癌性和非癌性） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-10-07 |
Enhanced Complement Expression in the Tumor Microenvironment Following Neoadjuvant Therapy: Implications for Immunomodulation and Survival in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-May-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4104258/v1
PMID:38798691
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响，发现补体基因表达上调与患者生存改善相关 | 首次揭示新辅助治疗通过上调肿瘤微环境中补体基因表达重塑免疫微环境，并发现补体表达水平与患者预后相关 | 样本量有限（36例患者），需要更大规模研究验证 | 探究新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的特异性影响 | 23例接受新辅助治疗和13例未接受新辅助治疗的胰腺导管腺癌患者 | 空间转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36例胰腺导管腺癌患者（23例治疗组，13例对照组） | NA | 空间转录组学,snRNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2025-10-07 |
Single Cell Analysis of Human Colonoids Exposed to Uranium-Bearing Dust
2024-May, Environmental health perspectives
IF:10.1Q1
DOI:10.1289/EHP13855
PMID:38771937
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类结肠类器官暴露于含铀粉尘后的分子和细胞变化 | 首次在人类结肠类器官模型中揭示含铀粉尘暴露对肠道上皮细胞谱系分化的特异性影响，特别是对分泌谱系细胞（肠内分泌细胞）的异常分化 | 仅使用三个生物学上不同的供体样本，样本量有限；仅研究急性暴露效应，未评估长期暴露影响 | 确定结肠在响应含铀粉尘暴露时发生的分子和细胞变化 | 人类结肠类器官 | 单细胞组学 | 环境暴露相关肠道疾病 | 单细胞RNA测序, 形态学分析, 成像技术 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 来自三个不同生物学供体的人类结肠类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-10-07 |
Construction and validation of a novel NAD+ metabolism-related risk model for prognostic prediction in osteosarcoma
2024-05, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.25757
PMID:38047487
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研究论文 | 本研究构建并验证了一个新型NAD+代谢相关风险模型，用于骨肉瘤的预后预测 | 首次将NAD+代谢相关基因与肿瘤免疫微环境联系起来，构建了骨肉瘤预后风险模型，并通过体外实验验证了CBS和INPP1基因通过TGF-β1/Smad2/3通路促进骨肉瘤细胞迁移、增殖和侵袭的机制 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步临床样本验证 | 探讨NAD代谢相关基因与骨肉瘤肿瘤免疫微环境、免疫治疗反应及预后的关联 | 骨肉瘤患者数据和骨肉瘤细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 细胞迁移侵袭实验 | Cox风险比例模型, Lasso回归模型, 诺莫图 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自TARGET和GEO数据库的骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-07 |
SFXN1-mediated immune cell infiltration and tumorigenesis in lung adenocarcinoma: A potential therapeutic target
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111918
PMID:38537539
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研究论文 | 本研究探讨了SFXN1在肺腺癌中的功能作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示SFXN1通过调节ERK磷酸化和CCL20表达影响免疫细胞浸润的分子机制 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库，需要更多临床样本验证 | 研究SFXN1在肺腺癌进展中的功能意义并评估其治疗靶点潜力 | 肺腺癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的RNA-seq和scRNA-seq数据 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, Western blot, IHC | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomic Analysis Identifies Epithelium-Macrophage Crosstalk in Endometriotic Lesions
2024-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.23.586434
PMID:38798560
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研究论文 | 本研究通过空间转录组分析揭示了子宫内膜异位病变中上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用机制 | 首次发现浅表腹膜子宫内膜异位病变上皮细胞通过补体3驱动炎症信号并促进巨噬细胞向促修复表型转化 | 仅分析了浅表腹膜病变，未涉及其他类型子宫内膜异位病变 | 阐明子宫内膜异位病变中细胞类型特异性基因表达变化及细胞间通讯机制 | 子宫内膜异位病变组织和患者匹配的在位子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 患者匹配的病变组织和正常组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-07 |
TRPV4-Expressing Tissue-Resident Macrophages Regulate the Function of Collecting Lymphatic Vessels via Thromboxane A2 Receptors in Lymphatic Muscle Cells
2024-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.21.595189
PMID:38826322
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研究论文 | 本研究揭示了表达TRPV4通道的组织驻留巨噬细胞通过血栓素A2受体调控淋巴管收缩功能的机制 | 首次发现TRPV4阳性组织驻留巨噬细胞通过TXA2-TXA2R信号轴调控淋巴管功能，为淋巴水肿治疗提供新靶点 | 研究主要基于动物模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究TRPV4通道在淋巴管中的表达及其对淋巴管收缩功能的调控机制 | 收集淋巴管、组织驻留巨噬细胞、淋巴肌细胞 | 免疫学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序, 压力肌动描记术 | NA | 基因表达数据, 生理功能数据 | 小鼠、大鼠和非人灵长类动物的淋巴管样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-07 |
Accurately deciphering spatial domains for spatially resolved transcriptomics with stCluster
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae329
PMID:38975895
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研究论文 | 提出一种名为stCluster的新方法，通过整合图对比学习和多任务学习来改进空间转录组数据的表示学习，从而提高空间域识别准确性 | 首次将图对比学习与多任务学习相结合用于空间转录组数据分析，能够识别空间一致性模式并捕获基因表达与空间组织间的复杂关系 | 论文未明确说明方法的具体局限性 | 改进空间转录组数据中的空间域识别准确性 | 空间转录组数据中的空间域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图对比学习, 多任务学习 | 空间基因表达数据 | 多个数据集和平台，涵盖组织、器官和胚胎水平 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2025-10-07 |
The heterogeneity of tumour-associated macrophages contributes to the clinical outcomes and indications for immune checkpoint blockade in colorectal cancer patients
2024-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152805
PMID:38669865
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其与临床预后和免疫检查点阻断治疗的关系 | 首次系统性地定义了21个决定巨噬细胞状态的基因模块，并发现其中7个与临床预后相关、11个与免疫检查点阻断治疗适应症相关，鉴定出具有高免疫治疗响应特征的HIM TAM亚群 | 样本量相对有限（60例患者），需要更大规模的研究验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞异质性对结直肠癌患者临床预后和免疫检查点阻断治疗适应症的影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 配体-受体相互作用分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 60例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-07 |
Ly6Chi Monocytes Are Metabolically Reprogrammed in the Blood during Inflammatory Stimulation and Require Intact OxPhos for Chemotaxis and Monocyte to Macrophage Differentiation
2024-05-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13110916
PMID:38891050
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了Ly6Chi单核细胞在炎症刺激过程中的代谢重编程机制 | 发现单核细胞在血液中经历代谢重编程，且氧化磷酸化对其趋化性和向巨噬细胞分化至关重要 | 研究基于小鼠模型和体外实验，人类体内的直接证据仍需进一步验证 | 探究单核细胞在急性炎症过程中的代谢重编程机制 | 小鼠和人类单核细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞转录组学，细胞趋化实验，细胞分化实验 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-07 |
25-Hydroxycholesterol regulates lysosome AMP kinase activation and metabolic reprogramming to educate immunosuppressive macrophages
2024-05-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.03.021
PMID:38640930
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研究论文 | 本研究揭示了25-羟基胆固醇通过调控溶酶体AMPK激活和代谢重编程来诱导免疫抑制性巨噬细胞形成的机制 | 首次发现IL-4/IL-13通过STAT6诱导Ch25h表达产生25HC，并阐明25HC通过竞争性结合GPR155抑制mTORC1、激活AMPKα的分子机制 | NA | 探究胆固醇代谢物在肿瘤微环境中调控巨噬细胞免疫抑制功能的机制 | 巨噬细胞、CD8 T细胞、肿瘤微环境 | 免疫代谢 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |