单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 539 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
Type I interferons induce an epigenetically distinct memory B cell subset in chronic viral infection
2024-05-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.03.016
PMID:38593796
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了慢性病毒感染中I型干扰素诱导形成表观遗传特征独特的记忆B细胞亚群 | 首次发现慢性病毒感染中存在富含干扰素刺激基因的独特记忆B细胞亚群，并证明早期干扰素受体阻断可改变其表观遗传特征 | 感染4周后记忆B细胞对干预措施产生抵抗，限制了治疗时间窗口 | 探究慢性病毒感染中记忆B细胞发育异常的机制及可逆性 | 急性和慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型中的记忆B细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化程序 | 发现了新生儿肺间充质细胞的新亚型，包括能够分化为成熟肺泡肌成纤维细胞的未成熟祖细胞 | NA | 研究新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化机制 | 新生小鼠肺组织中的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞分选,原代细胞培养,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
Immunomodulatory Role of the Stem Cell Circadian Clock in Muscle Repair
2024-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.24.595728
PMID:38854114
|
研究论文 | 本研究揭示了肌肉干细胞生物钟通过调控NAD+代谢节律影响免疫微环境的时间依赖性机制 | 首次发现肌肉干细胞生物钟通过NAD+代谢节律调控中性粒细胞活化的时间依赖性免疫反应 | 未明确说明样本规模和实验模型的具体细节 | 探究生物钟调控肌肉干细胞与免疫微环境互作的分子机制 | 肌肉干细胞和再生肌肉微环境中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肌肉再生障碍 | 单核单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
Integrative spatial analysis reveals a multi-layered organization of glioblastoma
2024-May-09, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.029
PMID:38653236
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学、空间蛋白质组学和计算方法，揭示胶质母细胞瘤的多层次组织结构 | 首次结合多种空间组学技术系统揭示胶质瘤细胞状态的三类组织模式，发现缺氧作为长程组织者的新功能 | 未明确说明样本规模和技术平台的详细参数 | 解析胶质瘤细胞状态的组织结构和空间分布规律 | 胶质瘤组织样本，包括高级别和低级别IDH突变胶质瘤 | 空间生物学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 计算分析 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-06 |
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200884
PMID:38722217
|
综述 | 探讨细胞类型进化研究的新机遇与方法学挑战 | 强调结合基因编辑工具和单细胞基因组学技术研究细胞类型进化，提出通过发育本体论准确识别同源细胞的新视角 | 未涉及具体实验验证，主要提出理论框架和研究方向 | 解析细胞类型进化机制及其在动物演化中的作用 | 多种研究生物体的细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学，基因编辑 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-10-07 |
Accelerating Single-Cell Sequencing Data Analysis with SciDAP: A User-Friendly Approach
2024-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582604
PMID:38464095
|
研究论文 | 介绍用于加速单细胞测序数据分析的用户友好平台SciDAP | 开发了基于通用工作流语言(CWL)的可移植和可重复分析流程，为非计算专业的生物学家提供单细胞数据分析解决方案 | 未提及平台在处理特定数据类型或大规模数据集时的性能限制 | 解决单细胞测序数据分析的复杂性和可重复性问题 | 单细胞RNA测序、ATAC测序和多组学测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | SciDAP | 基于通用工作流语言(CWL)的科学数据分析平台 |
| 107 | 2025-10-07 |
The Mas-related G protein-coupled receptor d (Mrgprd) mediates pain hypersensitivity in painful diabetic neuropathy
2024-May-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003120
PMID:38147415
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Mrgprd在糖尿病神经痛模型中的关键作用，并证实其介导疼痛过敏的机制 | 首次揭示Mrgprd在疼痛性糖尿病神经病变中通过增强背根神经节伤害感受器兴奋性介导神经病理性疼痛的新机制 | 研究仅限于高脂饮食小鼠模型，尚未在人类样本或临床环境中验证 | 探索疼痛性糖尿病神经病变中背根神经节伤害感受器超兴奋性的分子机制 | 高脂饮食诱导的疼痛性糖尿病神经病变小鼠模型的背根神经节神经元 | 神经科学 | 糖尿病神经病变 | 单细胞RNA测序, 体内钙成像 | NA | 基因表达数据, 钙信号数据 | 高脂饮食小鼠模型的背根神经节组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-07 |
Role of macrophages in regression of myocardial fibrosis following alleviation of left ventricular pressure overload
2024-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00240.2023
PMID:38363214
|
研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞在左心室压力超负荷缓解后心肌纤维化消退中的作用 | 首次揭示巨噬细胞在压力超负荷缓解后对胶原降解和间质纤维化部分消退的潜在益处 | 纤维化消退不完全，具体机制仍需进一步研究 | 确定巨噬细胞表型在压力超负荷和负荷缓解过程中的时间变化及其对胶原降解的影响 | 小鼠心肌组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 免疫组织化学,流式细胞术,RT-PCR,免疫印迹,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞表型数据 | 对照组,2周和4周TAC组,2周,4周和6周unTAC组小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-07 |
SOCS3 regulates pathological retinal angiogenesis through modulating SPP1 expression in microglia and macrophages
2024-May-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.025
PMID:38504518
|
研究论文 | 本研究揭示了SOCS3通过调控小胶质细胞和巨噬细胞中SPP1表达在病理性视网膜血管生成中的作用机制 | 首次发现SOCS3/STAT3/SPP1轴在病理性视网膜血管生成中的关键调控作用，并确定SPP1是STAT3的直接转录靶基因 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证 | 探究髓系细胞在病理性眼血管生成中的分子机制 | 小鼠视网膜血管生成模型中的小胶质细胞和巨噬细胞 | 分子生物学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-07 |
Macrophages in necrotic liver lesion repair: opportunities for therapeutical applications
2024-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00053.2024
PMID:38618702
|
综述 | 本文综述了肝脏巨噬细胞在坏死性肝损伤修复中的不同作用及其治疗应用前景 | 通过特异性巨噬细胞标记物、靶向细胞清除和单细胞RNA测序技术，揭示了单核来源巨噬细胞亚群在肝损伤和修复中的不同功能 | NA | 探讨肝脏巨噬细胞在坏死性肝损伤修复中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肝脏巨噬细胞（包括库普弗细胞和单核来源巨噬细胞） | NA | 急性肝衰竭、慢加急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序、靶向细胞清除 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序首次描述了小鼠肾脏淋巴管内皮细胞在急性肾损伤中的异质性和分子响应机制 | 首次系统描述肾脏淋巴管内皮细胞异质性，揭示其在急性肾损伤中调控局部免疫反应的新分子通路 | 淋巴管内皮细胞在肾脏中相对稀少，可能影响测序数据的全面性 | 研究肾脏淋巴管内皮细胞在急性肾损伤中的分子响应机制 | 小鼠肾脏淋巴管内皮细胞 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，定量PCR，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal Evolution of Developing Palate in Mice
2024-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241232317
PMID:38619065
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序技术，构建了小鼠腭部发育的时空转录图谱 | 首次整合scRNA-seq和stereo-seq技术解析腭部发育的时空动态变化，发现间充质和上皮细胞在空间上分为3个功能域 | 研究仅针对C57BL/6J小鼠特定胚胎时期，结果可能不适用于其他物种或发育阶段 | 探索腭部发育过程中的主要细胞群体及其功能作用 | C57BL/6J小鼠胚胎期12.5、14.5和16.5天的腭部组织 | 发育生物学 | 腭部发育异常 | 单细胞RNA测序, 空间增强分辨率组学测序 | CellTrek | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 3个发育时间点的小鼠腭部样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-07 |
Interleukin 21 Drives a Hypermetabolic State and CD4+ T-Cell-Associated Pathogenicity in Chronic Intestinal Inflammation
2024-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.01.026
PMID:38266738
|
研究论文 | 本研究揭示了白细胞介素21通过调控调节性T细胞的代谢状态驱动慢性肠道炎症的机制 | 首次发现IL21通过破坏线粒体-内质网接触点，诱导调节性T细胞进入高代谢状态并增强其炎症反应 | 研究主要基于体外实验和动物模型，在人类疾病中的直接应用仍需进一步验证 | 探究细胞代谢在调节性T细胞维持肠道稳态中的作用机制 | 人类调节性T细胞和CD4+ T细胞诱导的小鼠结肠炎模型 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 电子显微镜、共聚焦成像、邻近连接分析、免疫印迹、质谱流式、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、蛋白质、代谢物、基因表达 | NA | Agilent | 代谢分析 | Seahorse XF分析仪 | Seahorse XF实时代谢分析系统 |
| 114 | 2025-10-07 |
Group 1 ILCs: Heterogeneity, plasticity, and transcriptional regulation
2024-05, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13327
PMID:38563448
|
综述 | 本文系统综述了小鼠第1组先天淋巴细胞的异质性、可塑性及转录调控机制 | 整合单细胞RNA测序和命运图谱研究的最新发现，揭示第1组ILC的异质性和组织特异性特征 | 主要基于小鼠模型研究，人类第1组ILC的直接证据有限 | 探讨第1组先天淋巴细胞的发育程序、表型异质性和转录调控机制 | 小鼠第1组先天淋巴细胞（包括ILC1和自然杀伤细胞） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 命运图谱技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-07 |
Unveiling cell subpopulations in T1D mouse islets using single-cell RNA sequencing
2024-May-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00323.2023
PMID:38506753
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析1型糖尿病小鼠胰岛细胞亚群，揭示α和β细胞的异质性及其在疾病进展中的潜在作用 | 首次在STZ诱导的1型糖尿病小鼠模型中构建全面的胰岛单细胞图谱，发现11种主要细胞类型并揭示α和β细胞亚群的异质性 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；样本数量未明确说明 | 探究1型糖尿病胰岛细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | STZ诱导的1型糖尿病小鼠模型的胰岛细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-10-07 |
Nfe2l3 promotes neuroprotection and long-distance axon regeneration after injury in vivo
2024-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114741
PMID:38395216
|
研究论文 | 本研究揭示了Nfe2l3在神经保护和长距离轴突再生中的新功能 | 首次发现Nfe2l3具有促进神经保护和轴突再生的功能，并鉴定其相关基因网络 | NA | 探究Nfe2l3在CNS损伤后神经保护和轴突再生中的作用 | 皮层和视网膜神经节细胞（RGC）CNS投射神经元 | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-07 |
Multimodal Learning for Mapping the Genotype-Phenotype Dynamics
2024-May-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4355413/v1
PMID:38798675
|
研究论文 | 开发了一个多模态基础模型来探索人类转录组学在细胞水平的基因型-表型关系流形 | 提出了计算整合遗传学框架，同时分析基因型和表型的高维景观，通过多模态基础模型揭示传统基因表达分析无法检测的跨组织生物标志物 | NA | 解析基因表达与表型表现之间的动态相互作用关系 | 人类转录组学数据，特别是内皮细胞中的VWF基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，语言模型 | 多模态基础模型，语言模型 | 基因表达数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2025-10-07 |
Human Umbilical Cord Mesenchymal Stromal Cell-Derived Extracellular Vesicles Induce Fetal Wound Healing Features Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2024-05-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c01401
PMID:38751164
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人脐带间充质基质细胞来源的细胞外囊泡诱导胎儿样伤口愈合特征 | 首次发现hucMSC-EVs诱导产生造血性成纤维细胞和MMP13+成纤维细胞，并揭示其通过PIEZO1-钙-HIF1α-VEGF-MMP13通路激活的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化价值仍需验证 | 探究hucMSC-EVs在伤口愈合中的作用机制 | 小鼠皮肤伤口微环境中的成纤维细胞和角质形成细胞 | 单细胞组学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-10-07 |
A blueprint for tumor-infiltrating B cells across human cancers
2024-05-03, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj4857
PMID:38696569
|
研究论文 | 本研究通过构建涵盖20种癌症类型的B细胞蓝图，揭示了肿瘤浸润B细胞的异质性及其与临床预后的关联 | 首次系统构建了跨癌种的B细胞发育图谱，发现两条独立发育路径及其与免疫治疗响应的关联，揭示了表观遗传-代谢交互作用机制 | 样本量相对有限（269例患者），尚未验证代谢干预的实验效果 | 解析肿瘤浸润B细胞的功能特征及其在癌症免疫中的作用机制 | 人类肿瘤组织中的B淋巴细胞 | 单细胞生物学 | 多癌种肿瘤 | 单细胞转录组测序, B细胞受体谱分析, 染色质可及性检测 | NA | 单细胞多组学数据 | 477个样本来自269名患者，涵盖20种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-07 |
Transcript and protein signatures derived from shared molecular interactions across cancers are associated with mortality
2024-05-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05268-7
PMID:38734658
|
研究论文 | 通过分析多种实体癌中的共享细胞间相互作用，构建多细胞肿瘤模型并识别与死亡率相关的基因特征 | 首次构建跨癌种的共享多细胞肿瘤模型，并在mRNA和蛋白质水平验证基因特征与死亡率关联 | 研究仅涵盖五种实体癌，样本来源有限 | 识别跨癌种的共享细胞间相互作用及其与癌症死亡率的关系 | 乳腺癌、结肠癌、肝癌、肺癌和卵巢癌患者 | 生物信息学 | 多癌种 | 单细胞RNA测序，NicheNet分析，Cox比例风险模型 | 共享多细胞肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据，蛋白质组数据 | TCGA队列：9185个肿瘤样本和727个对照；UKBB队列：10384名癌症患者和5063个对照 | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |