单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 558 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-09-06 |
Spatiotemporal Evolution of Developing Palate in Mice
2024-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241232317
PMID:38619065
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序，揭示了小鼠胚胎期腭部发育的时空转录景观 | 首次整合单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序，揭示了腭部发育过程中细胞亚群的空间分布和细胞间通讯网络 | 研究仅限于C57BL/6 J小鼠，结果的普适性有待进一步验证 | 探索腭部发育过程中主要细胞群体及其作用机制 | 小鼠胚胎期腭部细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间增强分辨率组学测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6 J小鼠胚胎期腭部样本，分别在胚胎第12.5天、14.5天和16.5天采集 |
| 102 | 2024-09-04 |
De novo identification of CD4+ T cell epitopes
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02255-0
PMID:38658646
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研究论文 | 本文介绍了使用SABR-IIs平台进行CD4 T细胞抗原发现的方法，该平台能够展示共价连接的肽段并诱导信号传导 | 开发了一种新的SABR-IIs平台，用于快速、灵活、可扩展和多功能的CD4 T细胞配体从头鉴定 | NA | 探索和鉴定CD4 T细胞的抗原特异性 | CD4 T细胞及其抗原识别 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 103 | 2024-09-02 |
MR1-restricted T cell clonotypes are associated with "resistance" to Mycobacterium tuberculosis infection
2024-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.166505
PMID:38716731
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研究论文 | 研究探讨了MR1限制性T细胞克隆型与抵抗结核分枝杆菌感染之间的关系 | 发现MR1限制性T细胞克隆型与抵抗结核分枝杆菌感染有关，揭示了人类MR1T细胞TCR谱系的捐赠者特异性多样性 | NA | 研究MR1限制性T细胞与抵抗结核分枝杆菌感染的关联 | MR1限制性T细胞克隆型及其与结核分枝杆菌感染的关系 | NA | 结核病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 18,251个MR1T细胞，来自8名捐赠者 |
| 104 | 2024-09-01 |
Multi-omics analysis of macrophage-associated receptor and ligand reveals a strong prognostic signature and subtypes in hepatocellular carcinoma
2024-05-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62668-x
PMID:38806553
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，识别与肝细胞癌相关的巨噬细胞相关受体配体标记基因，并探索其分子免疫机制 | 本研究开发了一种新的肝细胞癌风险调整模型，并发现了SPP1、ANGPT2和NCL作为肝细胞癌的关键生物学目标，以及wortmannin、ribavirin和tarnafloxin作为潜在的治疗药物 | NA | 旨在识别与肝细胞癌相关的巨噬细胞相关受体配体标记基因，并探索其分子免疫机制 | 肝细胞癌患者及其免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, ELISA | LASSO回归模型 | RNA序列数据 | 包含原发和复发的单细胞RNA测序数据，以及来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus数据库的bulk RNA-Seq数据 |
| 105 | 2024-08-31 |
Characterizing enteric neurons in dopamine transporter (DAT)-Cre reporter mice reveals dopaminergic subtypes with dual-transmitter content
2024-May, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16307
PMID:38487941
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研究论文 | 本研究利用报告鼠系对肠道中的多巴胺能神经元进行了全面表征，揭示了具有双重递质含量的多巴胺能亚型。 | 本研究首次在肠道神经系统中发现了一种新型多巴胺能神经元群体，这些神经元同时表达胆碱乙酰转移酶和多巴胺转运体。 | 需要进一步研究以定义这些多巴胺能肠道神经元的功能特征及其在疾病中的作用。 | 旨在全面表征肠道中的多巴胺能神经元，并揭示其亚型和功能。 | 肠道神经系统中的多巴胺能神经元及其亚型。 | 神经科学 | NA | 免疫荧光、单细胞转录组学、原位杂交 | NA | 图像 | 使用多巴胺转运体报告鼠系进行研究 |
| 106 | 2024-08-31 |
Involvement of microglia-expressed MS4A6A in the onset of glioblastoma
2024-May, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16309
PMID:38488530
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研究论文 | 本文探讨了微胶质细胞表达的MS4A6A在胶质母细胞瘤发病中的作用 | 首次揭示了MS4A6A在胶质母细胞瘤中的表达及其对肿瘤细胞增殖和迁移的影响 | 尚未阐明MS4A6A参与胶质母细胞瘤调控的具体机制 | 研究MS4A6A在胶质母细胞瘤中的作用及其作为潜在生物标志物的可能性 | 胶质母细胞瘤患者样本及微胶质细胞中的MS4A6A表达 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胶质母细胞瘤患者样本 |
| 107 | 2024-08-28 |
Single cell RNA-sequencing reveals the cellular senescence of placental mesenchymal stem/stromal cell in preeclampsia
2024-05, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2024.03.014
PMID:38588616
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了子痫前期中胎盘间充质干细胞/基质细胞的细胞衰老机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了子痫前期中胎盘间充质干细胞/基质细胞的细胞衰老特征，并鉴定了与子痫前期相关的特征基因CTSZ | NA | 揭示子痫前期中胎盘间充质干细胞/基质细胞的细胞衰老机制 | 胎盘间充质干细胞/基质细胞在子痫前期中的细胞衰老 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的多个数据集，包括GSE173193、GSE99007和GSE75010 |
| 108 | 2024-08-26 |
Prognositic value of anoikis and tumor immune microenvironment-related gene in the treatment of osteosarcoma
2024-May-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
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研究论文 | 本研究探讨了与肿瘤免疫微环境相关的细胞凋亡（anoikis）基因在骨肉瘤治疗中的预后价值 | 首次在骨肉瘤中研究了anoikis及其与肿瘤免疫微环境的关系，并构建了基于这些基因的预后模型 | NA | 阐明anoikis及肿瘤免疫微环境相关基因在骨肉瘤治疗中的预后价值 | 骨肉瘤患者及其肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 51个与肿瘤微环境密切相关的关键anoikis相关基因（ANRGs） |
| 109 | 2024-08-25 |
The analysis of transcriptomic signature of TNBC-searching for the potential RNA-based predictive biomarkers to determine the chemotherapy sensitivity
2024-May-09, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-024-00876-x
PMID:38722458
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析46例三阴性乳腺癌（TNBC）患者的固定石蜡包埋（FFPE）肿瘤样本的转录组特征，旨在寻找与新辅助化疗敏感性相关的潜在RNA基预测生物标志物 | 本研究首次基于RNA测序数据，筛选出24个在肿瘤恶性细胞中特异性表达的基因，这些基因可能作为预测TNBC患者新辅助化疗反应的转录组标志物 | 研究样本量相对较小，且仅基于FFPE样本进行分析，未来需要更大规模的研究来验证这些发现 | 识别与三阴性乳腺癌新辅助化疗疗效显著相关的基因表达 | 三阴性乳腺癌患者的FFPE肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq | PLSR | 转录组数据 | 46例TNBC患者的FFPE肿瘤样本 |
| 110 | 2024-08-24 |
Angiogenesis-related immune response may be the prelude to the syndesmophyte formation in Ankylosing spondylitis
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112040
PMID:38631220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序方法，分析了强直性脊柱炎模型中疾病进展过程中的外周血单个核细胞比例变化，并探讨了局部炎症与骨形成之间的关系。 | 首次揭示了CD4+CXCR5+ T滤泡辅助细胞在强直性脊柱炎骨病变中的定位及其作为促血管生成级联反应上游启动者的作用。 | NA | 探讨强直性脊柱炎中局部炎症与骨形成之间的关系，并阐明其发病机制。 | 强直性脊柱炎模型中的外周血单个核细胞及骨病变。 | 免疫学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及强直性脊柱炎的猕猴模型 |
| 111 | 2024-08-24 |
Integrative multiomics enhancer activity profiling identifies therapeutic vulnerabilities in cholangiocarcinoma of different etiologies
2024-05-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330483
PMID:38050079
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研究论文 | 本研究通过综合多组学增强子活性分析，识别不同病因胆管癌的治疗脆弱性 | 首次在胆管癌中探讨增强子活性的失调及其对致癌过程的影响，并利用这些信息识别新的治疗靶点 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，可能与临床实际情况存在差异 | 旨在通过增强子活性分析，识别不同胆管癌亚型的潜在治疗靶点 | 胆管癌（CCA）的不同亚型 | NA | 胆管癌 | NanoString、多重免疫组织化学染色和单细胞空间转录组学 | NA | 细胞系、患者来源的异种移植模型 | 使用了多种胆管癌细胞系、患者来源和细胞系来源的异种移植模型 |
| 112 | 2024-08-07 |
A New Immunological Index for the Elderly: High Proportion of Multiple TCR T Cells Based on scRNA-Seq
2024-May-07, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0509-1
PMID:38722790
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-23 |
Role of macrophages in regression of myocardial fibrosis following alleviation of left ventricular pressure overload
2024-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00240.2023
PMID:38363214
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞在减轻左心室压力超负荷后心肌纤维化消退中的作用 | 首次展示了巨噬细胞在心肌纤维化发展和消退过程中的动态变化及其对胶原降解和部分纤维化消退的潜在益处 | NA | 确定心肌巨噬细胞表型在横断主动脉缩窄（TAC）和解除TAC（unTAC）后的时间变化，并研究巨噬细胞耗竭是否影响unTAC后的胶原降解 | 心肌巨噬细胞的数量和表型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 免疫组织化学、流式细胞术、RT-PCR、免疫测定和免疫印迹 | NA | 图像 | 包括非TAC、2周、4周TAC，以及2周、4周和6周unTAC的样本 |
| 114 | 2024-08-22 |
Examining the Effects of Nutrient Supplementation on Metabolic Pathways via Mitochondrial Ferredoxin in Aging Ovaries
2024-05-13, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu16101470
PMID:38794708
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研究论文 | 研究通过营养补充剂对衰老卵巢中线粒体铁氧还原蛋白在代谢途径中的作用进行探讨 | 采用多组学分析方法，结合空间转录组学、单细胞RNA测序、人类卵巢病理学和临床活检数据，探讨FDX1作为卵巢衰老标志物的潜力 | 研究仅涉及70名患者，且仅进行了两个月的临床试验，可能需要更大规模和更长时间的研究来验证结果 | 探讨营养补充剂对衰老卵巢中代谢途径的影响，特别是通过线粒体铁氧还原蛋白FDX1的作用 | 衰老卵巢中的卵母细胞 | NA | NA | 多组学分析 | NA | 转录组数据 | 70名患有衰老卵巢的患者 |
| 115 | 2024-08-22 |
ScRNA-seq of gastric cancer tissues reveals differences in the immune microenvironment of primary tumors and metastases
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03012-5
PMID:38555278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胃癌原发肿瘤和转移瘤组织的转录组，揭示了两者在免疫微环境上的差异 | 首次详细比较了胃癌原发肿瘤和转移瘤在免疫微环境中的差异，特别是CD8 T细胞和表达ApoE的巨噬细胞的差异 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探究胃癌原发肿瘤和转移瘤在免疫微环境中的差异及其潜在机制 | 胃癌的原发肿瘤和转移瘤组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 46份胃癌原发肿瘤、邻近非肿瘤组织和转移瘤组织 |
| 116 | 2024-08-21 |
A hybrid demultiplexing strategy that improves performance and robustness of cell hashing
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae254
PMID:38828640
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研究论文 | 本文介绍了一种混合解复用策略，提高了细胞哈希技术在多样本单细胞测序中的准确性和细胞回收率 | 引入了一种结合细胞哈希和遗传变异聚类的混合解复用策略，以及开发了HTOreader工具，提高了在多标签或样本大小不平衡实验中的准确性和细胞回收率 | 未提及具体限制 | 提高细胞哈希技术在多样本单细胞测序中的性能和鲁棒性 | 细胞哈希技术及其在单细胞测序中的应用 | 单细胞测序 | NA | 细胞哈希 | NA | 单细胞测序数据 | 未提及具体样本数量 |
| 117 | 2024-08-21 |
An integrated multi-omics analysis reveals osteokines involved in global regulation
2024-May-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.03.006
PMID:38574738
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析方法，探讨了骨分泌蛋白（osteokines）在骨代谢和全身稳态中的作用及其调控机制 | 本研究首次识别了375种候选osteokines及其在衰老和机械加载/卸载条件下的变化，并揭示了它们在骨和其他器官间的通信机制 | NA | 揭示osteokines的真实身份、细胞来源及其调控机制 | 骨和非骨骼组织、成骨细胞条件培养基、骨髓上清液和血清中的osteokines | 数字病理学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | RNA、蛋白质 | NA |
| 118 | 2024-08-17 |
Deciphering novel TCF4-driven mechanisms underlying a common triplet repeat expansion-mediated disease
2024-May, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011230
PMID:38713708
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研究论文 | 本文研究了Fuchs角膜内皮营养不良（FECD）中由CTG18.1重复元素扩展驱动的分子机制，通过分析患者来源的角膜内皮细胞的转录组数据，揭示了扩展特异性的转录组标志物和TCF4异构体比例偏斜。 | 首次全面描述了CTG18.1扩展在FECD中的分子机制，包括全局剪接改变和独特的转录本，以及TCF4异构体比例的偏斜。 | NA | 揭示由CTG18.1重复元素扩展介导的FECD的分子机制 | 患者来源的角膜内皮细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 长读长测序、短读长测序和空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 134例FECD患者 |
| 119 | 2024-08-16 |
DNMT1-targeting remodeling global DNA hypomethylation for enhanced tumor suppression and circumvented toxicity in oral squamous cell carcinoma
2024-May-16, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-01993-1
PMID:38755637
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研究论文 | 本研究通过靶向DNMT1调控口腔鳞状细胞癌（OSCC）中的全局DNA低甲基化，以增强肿瘤抑制并减少毒性 | 本研究首次揭示了DNMT1调控的全新全局DNA低甲基化模式，通过平衡信号协同作用来增强抗癌效果并减少潜在毒性 | NA | 探讨DNMT1在口腔鳞状细胞癌中的作用及其对全局DNA甲基化的影响 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC） | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | shRNA敲低技术，DNA甲基化微阵列，单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据，RNA序列数据 | 包括体外口腔癌细胞和异种移植OSCC小鼠模型 |
| 120 | 2024-08-16 |
A Mettl16/m6A/mybl2b/Igf2bp1 axis ensures cell cycle progression of embryonic hematopoietic stem and progenitor cells
2024-May, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00082-9
PMID:38605226
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研究论文 | 本文通过跨物种单细胞RNA测序分析，揭示了METTL16在胚胎造血干细胞和祖细胞（HSPCs）中的高表达及其在细胞周期进展中的关键作用。 | 首次发现METTL16通过m6A修饰调控细胞周期转录因子mybl2b，并通过METTL16-mA-MYBL2-IGF2BP1轴在人类中保守控制G1/S进展。 | NA | 阐明METTL16介导的m6A修饰在早期胚胎发育中对HSPC细胞周期进展的关键功能。 | 胚胎造血干细胞和祖细胞（HSPCs）及其细胞周期进展。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及斑马鱼和人类样本 |