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当前共找到 539 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
De novo detection of somatic mutations in high-throughput single-cell profiling data sets
2024-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01863-z
PMID:37414936
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研究论文 | 开发了一种名为SComatic的算法，用于直接从单细胞转录组和ATAC-seq数据中检测体细胞突变 | 无需匹配的bulk或单细胞DNA测序数据即可直接检测体细胞突变，能够检测多克隆组织中分化细胞的突变 | 未明确说明算法在特定突变类型或低质量数据上的性能限制 | 开发单细胞水平体细胞突变检测方法，用于研究癌症进化、克隆镶嵌和细胞可塑性 | 688个单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq数据集中的超过260万个单细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 统计算法 | 单细胞测序数据 | 超过260万个单细胞，来自688个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Blimp-1 and c-Maf regulate immune gene networks to protect against distinct pathways of pathobiont-induced colitis
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01814-z
PMID:38609547
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了转录因子Blimp-1和c-Maf在调节肠道免疫反应中的关键作用 | 首次发现Blimp-1和c-Maf共同主导调节Il10表达，同时负调控促炎细胞因子，并揭示其在保护免受不同病原体诱导结肠炎途径中的特异性作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类疾病相关性仍需进一步验证 | 探究转录因子Blimp-1和c-Maf在肠道免疫调节中的作用机制 | 结肠固有层白细胞和纯化的CD4 T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,RNA-seq,ATAC-seq | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 多种基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
scAI-SNP: a method for inferring ancestry from single-cell data
2024-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.14.594208
PMID:38798590
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研究论文 | 开发了一种直接从单细胞基因组数据推断祖先来源的工具scAI-SNP | 首次实现了直接从稀疏的单细胞数据中准确推断个体祖先来源的方法 | 依赖于1000 Genomes Project数据集中的祖先信息SNP，可能不覆盖所有人群 | 开发从单细胞数据推断祖先来源的计算方法 | 单细胞基因组数据中的祖先信息单核苷酸多态性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 1000 Genomes Project中的3201个个体，来自26个人群群体 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
A phase 2 randomized trial with autologous polyclonal expanded regulatory T cells in children with new-onset type 1 diabetes
2024-05-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn2404
PMID:38718135
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研究论文 | 评估自体多克隆扩增调节性T细胞在新发1型糖尿病儿童中的疗效和安全性的随机二期临床试验 | 首次在儿童新发1型糖尿病患者中开展自体多克隆扩增调节性T细胞的随机二期临床试验 | 单次剂量治疗未能阻止β细胞功能衰退，样本量有限（110例） | 评估自体多克隆扩增调节性T细胞在1型糖尿病儿童中的治疗效果 | 新发1型糖尿病的儿童和青少年患者 | 临床医学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术，bulk RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，基因表达数据 | 110例新发1型糖尿病儿童和青少年 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591541
PMID:38746119
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研究论文 | 通过单细胞测序分析CAR信号传导，揭示驱动体内持久性的关键因素 | 首次使用单细胞测序系统性地将不同胞内信号域结构与转录输出关联，发现特定结构具有独特的强直信号特征 | 研究中发现的强直信号特征仅在液体肿瘤中驱动持久疗效，在实体瘤中无效 | 解码CAR信号传导设计原则，指导下一代胞内信号域结构的合理设计 | 表达嵌合抗原受体(CARs)的工程化T细胞 | 单细胞分析 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Bioengineered vascular grafts with a pathogenic TGFBR1 variant model aneurysm formation in vivo and reveal underlying collagen defects
2024-05-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg6298
PMID:38718134
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研究论文 | 本研究通过结合hiPSC、生物工程血管移植物和基因编辑技术，在动物体内建立了功能性人类胸主动脉瘤模型 | 首次将hiPSC来源的血管平滑肌细胞与基因编辑技术结合，在动物体内构建了模拟人类胸主动脉瘤形成的生物工程血管移植物模型 | 研究样本量有限，仅针对特定TGFBR1变异，需要在更大多样性样本中验证 | 建立更好的人类胸主动脉瘤疾病模型并研究其发病机制 | 人类诱导多能干细胞来源的血管平滑肌细胞和生物工程血管移植物 | 组织工程 | 胸主动脉瘤 | 基因编辑，空间转录组学，组织学分析，蛋白质测定 | 生物工程血管移植物模型 | 转录组数据，组织学图像，蛋白质数据 | 使用isogenic对照hiPSC、基因编辑突变细胞和LDS患者来源细胞构建的多种生物工程血管移植物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
Villus myofibroblasts are developmental and adult progenitors of mammalian gut lymphatic musculature
2024-05-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.005
PMID:38537630
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和定量谱系追踪揭示了小鼠肠道绒毛平滑肌的发育起源和维持机制 | 首次发现绒毛肌成纤维细胞作为肠道淋巴管肌层在发育期和成年期的祖细胞，并揭示了NOTCH3-DLL4信号轴在平滑肌纤维组装和脂肪吸收中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类肠道中验证 | 探究肠道绒毛平滑肌的形成、组装和维持机制 | 小鼠肠道绒毛平滑肌细胞和淋巴管乳糜管 | 发育生物学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序，定量谱系追踪 | NA | 基因表达数据，谱系追踪数据 | 小鼠肠道组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Metaplastic regeneration in the mouse stomach requires a reactive oxygen species pathway
2024-05-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.002
PMID:38521055
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠胃部损伤后胃主细胞通过活性氧途径进行化生再生的机制 | 首次在单细胞分辨率下阐明了活性氧和线粒体调控在胃部化生再生中的关键作用，并发现该机制同样适用于胰腺腺泡细胞 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究胃部损伤后化生再生的分子机制 | 小鼠胃部细胞和胰腺腺泡细胞 | 单细胞生物学 | 胃部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Deep Transcriptomics Reveals Cell-Specific Isoforms of Pan-Neuronal Genes
2024-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.16.594572
PMID:38826410
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究神经元特异性剪接模式 | 开发新算法识别细胞特异性表达模式，发现神经元特异性异构体和调控RNA结合蛋白，并建立用户友好的空间转录组可视化平台 | 单细胞RNA-Seq方法的捕获效率和灵敏度限制 | 研究神经系统神经元特异性剪接模式和调控机制 | 神经元 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | CeNGEN联盟生成的深度细胞特异性转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals transcriptional dynamics of Encephalitozoon intestinalis parasites in human macrophages
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596468
PMID:38853846
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究人类巨噬细胞中Encephalitozoon intestinalis寄生虫感染的转录动态 | 首次在单细胞分辨率同时分析宿主和寄生虫在感染过程中的转录变化，揭示寄生虫通过避免宿主检测的潜行策略 | 研究仅关注人类巨噬细胞，未涉及其他细胞类型或体内环境 | 探究微孢子虫感染过程中宿主反应和寄生虫发育的转录调控机制 | 人类巨噬细胞和Encephalitozoon intestinalis寄生虫 | 单细胞生物学 | 机会性感染疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Inferring B Cell Phylogenies from Paired H and L Chain BCR Sequences with Dowser
2024-May-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300851
PMID:38557795
|
研究论文 | 本研究开发了利用配对重链和轻链BCR序列推断B细胞系统发育树的方法 | 首次系统研究如何整合配对重链和轻链序列构建B细胞系统发育树，发现轻链整合显著提高树准确性和可重复性 | 当部分轻链数据缺失时（如混合单细胞和批量测序数据），许多系统发育方法会估计有偏的枝长 | 研究使用配对重链和轻链BCR序列构建B细胞系统发育树的策略 | B细胞受体(BCR)序列 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，系统发育分析 | 最大似然法 | 基因序列数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-May-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.04.006
PMID:38754367
|
研究论文 | 提出Polaris分析流程，通过弱监督深度学习实现图像空间转录组学中的单分子点检测 | 结合深度学习细胞分割与点检测模型及概率基因解码器，为多种空间转录技术提供统一解决方案 | NA | 开发准确量化单细胞基因表达的空间转录组学分析流程 | 图像空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 弱监督深度学习 | 深度学习模型 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学,MERFISH,seqFISH,原位RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Targeting SCD triggers lipotoxicity of cancer cells and enhances anti-tumor immunity in breast cancer brain metastasis mouse models
2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.06.592766
PMID:38766019
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研究论文 | 本研究探讨SCD抑制剂通过诱导癌细胞脂毒性并增强抗肿瘤免疫来治疗乳腺癌脑转移的机制 | 首次揭示SCD抑制剂通过重塑肿瘤脂质组、增强树突细胞抗原呈递和改善T细胞功能来协同抑制乳腺癌脑转移 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对乳腺癌脑转移的新型治疗策略 | 乳腺癌细胞和乳腺癌脑转移小鼠模型 | 癌症研究 | 乳腺癌脑转移 | 脂质组学分析，qPCR，western blot，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
Type I interferons induce an epigenetically distinct memory B cell subset in chronic viral infection
2024-05-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.03.016
PMID:38593796
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了慢性病毒感染中I型干扰素诱导形成表观遗传特征独特的记忆B细胞亚群 | 首次发现慢性病毒感染中存在富含干扰素刺激基因的独特记忆B细胞亚群，并证明早期干扰素受体阻断可改变其表观遗传特征 | 感染4周后记忆B细胞对干预措施产生抵抗，限制了治疗时间窗口 | 探究慢性病毒感染中记忆B细胞发育异常的机制及可逆性 | 急性和慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型中的记忆B细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化程序 | 发现了新生儿肺间充质细胞的新亚型，包括能够分化为成熟肺泡肌成纤维细胞的未成熟祖细胞 | NA | 研究新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化机制 | 新生小鼠肺组织中的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞分选,原代细胞培养,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Immunomodulatory Role of the Stem Cell Circadian Clock in Muscle Repair
2024-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.24.595728
PMID:38854114
|
研究论文 | 本研究揭示了肌肉干细胞生物钟通过调控NAD+代谢节律影响免疫微环境的时间依赖性机制 | 首次发现肌肉干细胞生物钟通过NAD+代谢节律调控中性粒细胞活化的时间依赖性免疫反应 | 未明确说明样本规模和实验模型的具体细节 | 探究生物钟调控肌肉干细胞与免疫微环境互作的分子机制 | 肌肉干细胞和再生肌肉微环境中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肌肉再生障碍 | 单核单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Integrative spatial analysis reveals a multi-layered organization of glioblastoma
2024-May-09, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.029
PMID:38653236
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研究论文 | 通过整合空间转录组学、空间蛋白质组学和计算方法，揭示胶质母细胞瘤的多层次组织结构 | 首次结合多种空间组学技术系统揭示胶质瘤细胞状态的三类组织模式，发现缺氧作为长程组织者的新功能 | 未明确说明样本规模和技术平台的详细参数 | 解析胶质瘤细胞状态的组织结构和空间分布规律 | 胶质瘤组织样本，包括高级别和低级别IDH突变胶质瘤 | 空间生物学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 计算分析 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200884
PMID:38722217
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综述 | 探讨细胞类型进化研究的新机遇与方法学挑战 | 强调结合基因编辑工具和单细胞基因组学技术研究细胞类型进化，提出通过发育本体论准确识别同源细胞的新视角 | 未涉及具体实验验证，主要提出理论框架和研究方向 | 解析细胞类型进化机制及其在动物演化中的作用 | 多种研究生物体的细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学，基因编辑 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-07 |
Accelerating Single-Cell Sequencing Data Analysis with SciDAP: A User-Friendly Approach
2024-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582604
PMID:38464095
|
研究论文 | 介绍用于加速单细胞测序数据分析的用户友好平台SciDAP | 开发了基于通用工作流语言(CWL)的可移植和可重复分析流程，为非计算专业的生物学家提供单细胞数据分析解决方案 | 未提及平台在处理特定数据类型或大规模数据集时的性能限制 | 解决单细胞测序数据分析的复杂性和可重复性问题 | 单细胞RNA测序、ATAC测序和多组学测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | SciDAP | 基于通用工作流语言(CWL)的科学数据分析平台 |
| 100 | 2025-10-07 |
The Mas-related G protein-coupled receptor d (Mrgprd) mediates pain hypersensitivity in painful diabetic neuropathy
2024-May-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003120
PMID:38147415
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Mrgprd在糖尿病神经痛模型中的关键作用，并证实其介导疼痛过敏的机制 | 首次揭示Mrgprd在疼痛性糖尿病神经病变中通过增强背根神经节伤害感受器兴奋性介导神经病理性疼痛的新机制 | 研究仅限于高脂饮食小鼠模型，尚未在人类样本或临床环境中验证 | 探索疼痛性糖尿病神经病变中背根神经节伤害感受器超兴奋性的分子机制 | 高脂饮食诱导的疼痛性糖尿病神经病变小鼠模型的背根神经节神经元 | 神经科学 | 糖尿病神经病变 | 单细胞RNA测序, 体内钙成像 | NA | 基因表达数据, 钙信号数据 | 高脂饮食小鼠模型的背根神经节组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |