单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202405-202405] [清除筛选条件]
当前共找到 539 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2025-10-06
scRNA+TCR+BCR-seq revealed the proportions and gene expression patterns of dual receptor T and B lymphocytes in NPC and NLH
2024-05-21, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞多组学测序揭示鼻咽癌和鼻咽淋巴增生中双受体淋巴细胞的组成、克隆扩增及基因表达特征 首次在鼻咽癌和鼻咽淋巴增生中发现双受体淋巴细胞的存在,并证实其克隆扩增及谱系特征 样本量较小(7例NPC和3例NLH),需要更大规模研究验证 探究肿瘤微环境中双受体淋巴细胞的生物学特性和功能 鼻咽癌患者和鼻咽淋巴增生患者的淋巴细胞 单细胞组学 鼻咽癌 单细胞RNA测序,TCR测序,BCR测序 NA 单细胞转录组数据,免疫受体序列数据 7例鼻咽癌患者和3例鼻咽淋巴增生患者 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞免疫组库测序 NA scRNA+TCR+BCR-seq技术
62 2025-10-06
Identification of sepsis-associated mitochondrial genes through RNA and single-cell sequencing approaches
2024-05-03, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过RNA测序和单细胞测序方法识别与脓毒症相关的线粒体基因 整合高通量测序与生物信息学分析,首次发现COX7B和NDUFA4两个线粒体基因与脓毒症预后密切相关 样本量较小(20例脓毒症患者和10例健康对照),单细胞测序样本仅5例 识别脓毒症相关的线粒体生物标志物以提高诊断和预后准确性 脓毒症患者和健康志愿者的外周血样本 生物信息学 脓毒症 RNA测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 NA RNA测序数据, 单细胞测序数据 30例(20例脓毒症+10例健康对照)用于RNA-seq,5例用于单细胞测序 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
63 2025-10-06
Notch ligands are biomarkers of anti-TNF response in RA patients
2024-May, Angiogenesis IF:9.2Q1
研究论文 本研究探讨Notch配体在类风湿关节炎滑膜组织中的表达特征及其作为抗TNF治疗反应生物标志物的潜力 首次发现RA骨髓Notch配体可作为抗TNF治疗反应的标志物,并揭示其在FLS和内皮细胞中的转激活作用 研究样本量未明确说明,且主要基于转录组分析,缺乏蛋白质水平验证 阐明Notch通路在RA滑膜组织细胞中的功能意义及RA治疗对其表达的影响 类风湿关节炎患者的滑膜组织细胞,包括巨噬细胞、成纤维样滑膜细胞和内皮细胞 单细胞生物学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序,形态学研究,转录组分析 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
64 2025-10-06
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Immune Landscape of CD4+ T Cells in Coronary Culprit Plaques With Acute Coronary Syndrome in Humans-Brief Report
2024-05, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性冠脉综合征患者冠状动脉斑块中CD4+ T细胞的免疫景观特征 首次在单细胞水平揭示了ACS患者冠状动脉斑块中CD4+ T细胞的特性,发现了中央记忆CD4+ T细胞在ACS斑块中的比例升高及其分化轨迹 样本量较小(7例患者),仅分析了冠状动脉斑块中的免疫细胞 表征ACS患者冠状动脉斑块中T细胞的单细胞水平特征,评估T细胞克隆扩增,寻找预防ACS的治疗靶点 急性冠脉综合征和慢性冠脉综合征患者的冠状动脉斑块样本 单细胞测序 心血管疾病 单细胞RNA测序,T细胞受体谱分析 NA 单细胞转录组数据,TCR序列数据 7例患者(4例慢性冠脉综合征,3例急性冠脉综合征)的冠状动脉斑块样本,另加3例ACS斑块样本用于TCR分析 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x单细胞RNA测序平台
65 2025-10-06
Developmental regulation of primitive erythropoiesis
2024-05-01, Current opinion in hematology IF:3.1Q2
综述 本文综述原始红细胞生成的最新研究进展,重点关注其胚胎起源、物种特异性发育调控差异以及终末分化的分子和代谢通路 结合单细胞转录组学和先进谱系追踪技术揭示原始红细胞起源,发现转录延伸调控因子和表观遗传修饰剂DOT1L的非经典功能,揭示磷酸戊糖途径等关键代谢通路的激活 基于小鼠模型和罕见人类胚胎样本的研究,人类样本数量有限且存在物种差异 解析原始红细胞生成的发育调控机制,为体外生成治疗性红细胞提供理论基础 小鼠胚胎和人类早期胚胎中的原始红细胞 发育生物学 NA 单细胞转录组学,谱系追踪,代谢组学,蛋白质组学 NA 转录组数据,表观遗传数据,代谢数据 未明确样本数量,使用小鼠胚胎和罕见人类胚胎样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
66 2025-10-06
Unraveling molecular advancements in chordoma tumorigenesis and treatment response: a review of scientific discoveries and clinical implications
2024-05, Neurosurgical focus IF:3.3Q1
综述 本文系统回顾了脊索瘤分子发病机制的科学发现及其临床治疗意义 整合单细胞转录组分析、空间转录组学和游离DNA等新兴技术,揭示脊索瘤异质性分子通路 NA 总结脊索瘤分子发病机制的最新进展及其对神经外科治疗的增强作用 脊索瘤肿瘤发生机制与治疗反应 数字病理 脊索瘤 单细胞转录组分析, 空间转录组学, 游离DNA分析, 基因组学, 转录组学, 表观基因组学 NA 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
67 2025-10-06
Exploring the potential relationship between short sleep risks and cognitive function from the perspective of inflammatory biomarkers and cellular pathways: Insights from population-based and mice studies
2024-05, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 通过人群和动物研究探讨短睡眠风险与认知功能的关系及其炎症机制 结合人群流行病学数据与单细胞转录组学分析,揭示短睡眠通过炎症通路影响认知功能的细胞机制 观察性研究设计无法确定因果关系,小鼠模型结果向人类外推需谨慎 研究短睡眠对认知功能的影响及其分子机制 美国NHANES人群数据(2011-2014)和实验小鼠 生物医学研究 认知功能障碍 生物信息学分析, 单细胞转录组测序, GO和KEGG富集分析 NA 血液检测数据, 认知测试数据, 基因表达数据 NHANES人群数据(2011-2014)和小鼠实验数据 NA 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 NA GSE137665单细胞转录组数据集
68 2025-10-06
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-05-31, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
综述 系统总结巨噬细胞在心血管疾病中的表型多样性、功能可塑性及其调控机制,并探讨单细胞测序技术带来的新见解 整合单细胞测序技术揭示的巨噬细胞异质性和细胞互作机制,聚焦不同心血管疾病背景下炎症与纤维化的关系 主要基于现有文献总结,缺乏原始实验数据验证 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的分子机制和潜在治疗靶点 巨噬细胞在心血管疾病中的表型和功能 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞测序 NA 文献数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
69 2025-10-06
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-05-29, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究揭示靶向BCL9/BCL9L通过促进cDC1树突状细胞活化和肿瘤浸润来增强抗原呈递 首次阐明BCL9/BCL9L通过XCL1-XCR1轴和NF-κB/IRF1信号通路调控cDC1功能的新机制 未明确BCL9/BCL9L在其它免疫细胞亚群中的作用 探究靶向BCL9/BCL9L对肿瘤抗原呈递和抗肿瘤免疫的影响 常规1型树突状细胞(cDC1)、CD8 T细胞、肿瘤微环境 免疫学 癌症 单细胞转录组测序、基因敲除、药理学抑制 NA 基因表达数据 基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
70 2025-10-06
Integrated Single-cell Multiomic Analysis of HIV Latency Reversal Reveals Novel Regulators of Viral Reactivation
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 通过整合单细胞多组学分析揭示HIV潜伏逆转的新调控因子 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术同时分析潜伏感染细胞的转录组和表观基因组特征,并利用机器学习预测病毒再激活 研究仅针对CD4+ T细胞,未涉及其他潜在HIV潜伏库细胞类型 揭示HIV潜伏逆转的分子机制和新型调控因子 约125,000个潜伏感染的原代CD4+ T细胞 单细胞多组学 HIV/AIDS 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 机器学习模型 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 约125,000个原代CD4+ T细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
71 2025-10-06
Young glial progenitor cells competitively replace aged and diseased human glia in the adult chimeric mouse brain
2024-May, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本研究通过移植年轻健康的人类胶质祖细胞成功替代成年嵌合小鼠大脑中的衰老和病变胶质细胞 首次发现年轻健康胶质祖细胞在成年大脑中具有竞争优势,能够通过YAP1/MYC/E2F信号通路取代衰老和病变胶质细胞 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床环境中验证 探究健康胶质细胞是否能在成年前脑中竞争取代病变人类胶质细胞 人类胶质祖细胞和亨廷顿病模型小鼠 神经科学 亨廷顿病 单细胞RNA测序 嵌合小鼠模型 基因表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
72 2025-10-06
Discovery and characterization of dietary antigens in oral tolerance
2024-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过鉴定玉米、小麦和大豆特异性T细胞受体,揭示了植物源性食物中引发口服耐受的关键抗原表位及其功能特性 首次系统性地鉴定并表征了玉米、小麦和大豆中引发口服耐受的T细胞表位,发现这些表位均来源于抗降解的种子贮藏蛋白 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;仅针对三种主要谷物进行研究 探索植物源性食物中引发口服免疫耐受的抗原表位及其免疫学机制 小鼠T细胞受体、玉米、小麦和大豆中的抗原表位、肠道调节性T细胞 免疫学 食物过敏 表达克隆、MHC四聚体技术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质序列数据 NA NA RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
73 2025-10-06
Batf3+ DCs and the 4-1BB/4-1BBL axis are required at the effector phase in the tumor microenvironment for PD-1/PD-L1 blockade efficacy
2024-05-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示了Batf3+树突状细胞和4-1BB/4-1BBL轴在肿瘤微环境中对PD-1/PD-L1阻断疗效的关键作用 首次明确Batf3谱系树突状细胞通过4-1BBL信号在肿瘤微环境中为CD8 T细胞提供正向共刺激信号,是PD-1/PD-L1阻断疗效的必要条件 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 探究PD-1/PD-L1阻断治疗中肿瘤微环境内重新激活T细胞的细胞来源和分子机制 Batf3+树突状细胞、CD8 T细胞、4-1BB/4-1BBL信号轴 肿瘤免疫学 肿瘤 流式细胞术、基因靶向小鼠、阻断抗体研究、免疫荧光、空间转录组学 NA 流式细胞数据、基因表达数据、空间分布数据 人类肿瘤样本和小鼠模型 NA 空间转录组学 NA NA
74 2025-10-06
Nextflow pipeline for Visium and H&E data from patient-derived xenograft samples
2024-May-20, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 开发了一个用于处理10x Genomics Visium空间转录组数据和H&E染色全切片图像的Nextflow流程 设计了专门针对患者来源异种移植样本优化的空间转录组定量流程,能够同时处理转录组数据和图像数据 仅展示了在四个黑色素瘤PDX样本上的应用,样本规模有限 开发空间转录组数据分析流程 患者来源异种移植癌症样本 空间转录组学 黑色素瘤 空间转录组学,全切片图像分析 NA 空间转录组数据,H&E染色图像 四个黑色素瘤PDX样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
75 2025-10-06
Determination of permissive and restraining cancer-associated fibroblast (DeCAF) subtypes
2024-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种名为DeCAF的单样本分类器,用于鉴定临床限制性和允许性癌症相关成纤维细胞亚型 将单细胞RNA测序衍生的CAF标志基因转化为可用于批量RNA测序数据的分类工具,并在多种肿瘤类型中验证其临床适用性 NA 开发能够分类癌症相关成纤维细胞亚型的临床适用工具 胰腺导管腺癌、间皮瘤、膀胱癌和肾细胞癌患者样本 生物信息学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 单样本分类器 转录组数据 19个独立批量转录组数据集 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
76 2025-10-06
Genetic and transcriptomic landscape of colonic diverticulosis
2024-05-10, Gut IF:23.0Q1
研究论文 通过遗传学和转录组学分析揭示结肠憩室病的分子机制和细胞基础 首次整合DNA/RNA测序、单细胞RNA-seq数据和孟德尔随机化方法系统研究结肠憩室病 样本量相对有限(404例),仅针对结肠组织进行分析 识别结肠憩室病的遗传和细胞决定因素及其与其他胃肠道疾病的关系 结肠憩室病患者和对照人群的结肠组织 基因组学 结肠憩室病 DNA测序, RNA测序, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 多基因风险评分 NA 基因组数据, 转录组数据 404例患者(172例憩室病,232例对照) NA 单细胞RNA-seq, 全基因组关联研究 NA NA
77 2025-10-06
A Mettl16/m6A/mybl2b/Igf2bp1 axis ensures cell cycle progression of embryonic hematopoietic stem and progenitor cells
2024-May, The EMBO journal
研究论文 本研究揭示了METTL16介导的m6A修饰通过调控mybl2b/Igf2bp1轴确保胚胎造血干细胞和祖细胞周期进程的关键机制 首次发现METTL16-m6A-MYBL2-IGF2BP1轴在胚胎造血干细胞周期调控中的保守功能,阐明METTL16甲基转移酶活性对细胞G1/S期进程的必要性 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的验证仍需进一步深入 探究METTL16介导的RNA m6A修饰在胚胎造血干细胞发育中的功能机制 脊椎动物胚胎造血干细胞和祖细胞(HSPCs) 发育生物学 造血系统疾病 单细胞RNA测序, 跨物种分析 NA 单细胞转录组数据 斑马鱼胚胎造血干细胞和祖细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
78 2025-10-06
Characterization of the responses of brain macrophages to focused ultrasound-mediated blood-brain barrier opening
2024-May, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术揭示了聚焦超声开放血脑屏障后脑巨噬细胞的免疫重塑机制 首次在单细胞水平系统表征聚焦超声开放血脑屏障后小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞的动态响应 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 探究聚焦超声介导的血脑屏障开放对脑巨噬细胞的影响机制 小鼠脑组织中的小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞 单细胞组学 神经退行性疾病 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
79 2025-10-06
Stem-cell states converge in multistage cutaneous squamous cell carcinoma development
2024-05-31, Science (New York, N.Y.)
研究论文 通过构建基因表达网络并结合谱系追踪和单细胞RNA测序,揭示皮肤鳞状细胞癌多阶段发展过程中干细胞状态的收敛现象 发现癌前肿瘤细胞中表达谱系可塑性和耐药性标记的细胞状态收敛现象,并揭示增殖状态与多谱系可塑性状态之间的互斥关系 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚需进一步研究 探索干细胞在癌症发展过程中的作用机制 小鼠正常组织和肿瘤组织 癌症生物学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 基因表达网络分析 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 数百个小鼠组织样本(包括正常和肿瘤组织) NA 单细胞RNA-seq NA NA
80 2025-10-06
Pioneer factor ETV2 safeguards endothelial cell specification by recruiting the repressor REST to restrict alternative lineage commitment
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了先驱因子ETV2通过招募抑制因子REST来限制替代谱系承诺,从而保障内皮细胞特化的机制 首次发现ETV2通过招募转录抑制因子REST来抑制非内皮细胞谱系基因,揭示了先驱因子招募抑制因子以限制替代谱系承诺的新机制 研究主要基于体外诱导多能干细胞分化系统,需要在体内模型中进一步验证 探索ETV2驱动细胞命运特化的分子机制,特别是内皮细胞谱系特化过程 人诱导多能干细胞来源的中胚层祖细胞和内皮细胞 发育生物学 NA CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 基因组学数据, 转录组数据, 表观基因组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
回到顶部