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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
N-MYC impairs innate immune signaling in high-grade serous ovarian carcinoma
2024-05-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj5428
PMID:38748789
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研究论文 | 本研究揭示N-MYC通过抑制STING和RIG-I样受体信号通路,削弱高级别浆液性卵巢癌的先天免疫应答 | 首次发现N-MYC通过抑制STING寡聚化和MAVS线粒体定位,双重抑制I型干扰素信号通路 | 研究主要基于细胞系和单细胞测序数据,需要更多体内实验验证 | 探究N-MYC在高级别浆液性卵巢癌免疫抑制中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌细胞系和临床样本 | 癌症免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类临床HGSC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
Identification of epigenetic silencing of the SFRP2 gene in colorectal cancer as a clinical biomarker and molecular significance
2024-05-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05329-x
PMID:38802858
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中SFRP2基因表现遗传沉默作为临床生物标志物的潜力 | 首次在大型生物样本队列中系统评估SFRP2甲基化水平,并发现其在血液中可作为癌症分期、淋巴结侵袭和复发的预测指标 | 样本量相对有限(健康参与者110例,CRC患者85例),需要更大规模研究验证 | 研究SFRP2基因甲基化在结直肠癌中的诊断价值和临床意义 | 结直肠癌患者和健康参与者的血液、脂肪和结肠组织样本 | 分子生物学 | 结直肠癌 | qPCR, 450K DNA阵列, DNA焦磷酸测序, scRNA-Seq | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 单细胞RNA测序数据 | 健康参与者110例(男48/女62),CRC患者85例(男61/女24) | Illumina | DNA甲基化阵列, 单细胞RNA测序 | 450K DNA阵列 | Illumina 450K DNA甲基化阵列 |
| 63 | 2025-10-06 |
A new integrative analysis of histopathology and single cell RNA-seq reveals the CCL5 mediated T and NK cell interaction with vascular cells in idiopathic pulmonary arterial hypertension
2024-05-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05304-6
PMID:38797830
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研究论文 | 通过组织病理学和单细胞RNA测序的整合分析,揭示了特发性肺动脉高压中CCL5介导的T细胞和NK细胞与血管细胞的相互作用 | 首次结合组织病理学评分和多种生物信息学方法识别IPAH中的关键炎症基因,并通过单细胞RNA测序解析了CCL5介导的细胞间相互作用机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,实验验证仅限于动物模型 | 探索特发性肺动脉高压中炎症和免疫失调的分子机制 | IPAH患者肺组织、对照组肺组织、野百合碱诱导的大鼠肺动脉高压模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 差异表达分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 功能富集分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | IPAH患者和对照组的肺组织转录组数据(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data reveals a myeloid cell-related regulon predicting neoadjuvant immunotherapy response across cancers
2024-05-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05123-9
PMID:38773508
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,发现与髓系细胞相关的PPARG调控子可预测多种癌症中新辅助免疫治疗的应答 | 首次发现PPARG调控子作为免疫检查点抑制剂应答的预测标志物,并构建了髓系细胞图谱和在线资源平台 | 样本量有限,主要基于公共数据集验证 | 探索免疫治疗应答机制并开发预测生物标志物 | 肺癌、结直肠癌、乳腺癌等多种癌症患者 | 生物信息学 | 肺癌、结直肠癌、乳腺癌等多种癌症 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、转录组分析 | pySCENIC、Symphony参考映射 | 基因表达数据、单细胞数据、转录组数据 | 1例治疗前和1例治疗后达到病理完全缓解的肺腺癌患者,多个公共数据集(TCGA泛癌队列、5个ICI转录组队列等) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Loss of function of male-specific lethal 3 (Msl3) does not affect spermatogenesis in rodents
2024-05, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.669
PMID:37847071
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研究论文 | 本研究探讨了Msl3基因在啮齿类动物精子发生中的作用 | 首次在哺乳动物中使用条件性基因敲除模型研究Msl3在减数分裂中的作用 | 研究仅限于小鼠模型,结果可能不适用于其他哺乳动物 | 探究Msl3基因在哺乳动物减数分裂进入中的作用 | 小鼠精子发生过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
CACIMAR: cross-species analysis of cell identities, markers, regulations, and interactions using single-cell RNA sequencing data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae283
PMID:38856169
|
研究论文 | 开发了名为CACIMAR的工具,用于跨物种分析单细胞RNA测序数据中的细胞身份、标记基因、调控网络和细胞间相互作用 | 基于保守特征的加权和模型开发了多种保守性评分,能够同时分析细胞类型、调控网络和细胞间相互作用的保守性 | NA | 开发跨物种单细胞RNA测序数据分析工具,揭示细胞和分子层面的进化保守性 | 小鼠、斑马鱼和鸡的视网膜再生单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权和模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
Enhancing Vasculogenesis in Dental Pulp Development: DPSCs-ECs Communication via FN1-ITGA5 Signaling
2024-05, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10695-6
PMID:38418738
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了牙髓干细胞与血管内皮细胞通过FN1-ITGA5信号通路促进牙髓发育过程中血管生成的新机制 | 首次发现牙髓干细胞通过FN1-ITGA5信号通路与血管内皮细胞进行细胞间通讯,促进牙髓血管生成 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探索牙髓发育过程中血管形成的调控机制 | 牙髓干细胞(DPSCs)和血管内皮细胞(ECs) | 组织工程与再生医学 | 牙科疾病 | 单细胞测序, 免疫组织化学, Western blot, RT-PCR, 细胞增殖检测, 划痕实验, 管形成实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 发育期和成熟期牙髓样本,小鼠动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
MEK1/2-PKM2 Pathway Modulates the Immunometabolic Reprogramming of Proinflammatory Allograft-infiltrating Macrophages During Heart Transplant Rejection
2024-05-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004899
PMID:38238904
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研究论文 | 本研究揭示了MEK1/2-PKM2通路在心脏移植排斥期间促炎性移植物浸润巨噬细胞免疫代谢重编程中的关键作用 | 首次发现MEK1/2-PKM2通路调控移植物浸润巨噬细胞的免疫代谢重编程,并证实MEK1/2抑制剂trametinib可改善慢性心脏移植排斥 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究心脏移植排斥过程中移植物浸润巨噬细胞免疫代谢表型的分子调控机制 | 心脏移植物浸润免疫细胞,特别是巨噬细胞 | 免疫代谢学 | 心脏移植排斥 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,基因敲除 | 小鼠移植模型 | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
6-Formylindolo[3,2-b]carbazole, a potent ligand for the aryl hydrocarbon receptor, attenuates concanavalin-induced hepatitis by limiting T-cell activation and infiltration of proinflammatory CD11b+ Kupffer cells
2024-05-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae018
PMID:38366630
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研究论文 | 本研究探讨FICZ通过激活芳烃受体在刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型中的保护作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序技术,揭示FICZ通过调控CD3+ T细胞活化和CD11b+ Kupffer细胞浸润减轻肝炎的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;机制研究仍待深入 | 探究FICZ通过芳烃受体在自身免疫性肝炎中的保护作用及机制 | 刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
TCL1A-expressing B cells are critical for tertiary lymphoid structure formation and the prognosis of oral squamous cell carcinoma
2024-05-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05292-7
PMID:38764038
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现TCL1A在B细胞中高表达,并揭示其通过促进三级淋巴结构形成改善口腔鳞癌预后的机制 | 首次揭示TCL1A在B细胞中的表达与三级淋巴结构形成的关系,及其通过调控CR2表达促进B细胞对树突状细胞的胞啃作用 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探究B细胞在口腔鳞癌免疫治疗中的作用机制 | 口腔鳞癌患者组织样本和B淋巴母细胞系 | 癌症免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 慢病毒转导 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织芯片数据, RNA测序数据 | 13例癌组织+8例癌旁组织(单细胞测序), 146例临床样本(组织芯片), 359例TCGA样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Single-cell approaches define two groups of mammalian oligodendrocyte precursor cells and their evolution over developmental time
2024-05-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.03.002
PMID:38579710
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术揭示哺乳动物少突胶质前体细胞在发育过程中的两个亚群及其演化特征 | 首次在发育过程中鉴定出两个具有不同定位、转录和表观遗传特征的少突胶质前体细胞亚群,并发现成年期髓鞘再生过程与发育期存在本质差异 | 研究仅聚焦于小鼠皮层组织,未验证其他脑区或物种的普适性 | 解析哺乳动物少突胶质前体细胞在发育过程中的异质性和演化规律 | 小鼠皮层少突胶质前体细胞(OPCs) | 单细胞组学 | 神经系统发育 | scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组、表观基因组、空间转录组数据 | 小鼠皮层发育不同时间点的OPC细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
Multifactoral immune modulation potentiates durable remission in multiple models of aggressive malignancy
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302675R
PMID:38738472
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研究论文 | 本研究开发了一种联合免疫调节和细胞抑制疗法,可在多种侵袭性恶性肿瘤模型中诱导持久缓解 | 发现独特的多因子免疫调节组合疗法,能重塑肿瘤微环境并消除多种难治性肿瘤模型 | 研究仅限于临床前动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索多通路靶向治疗在侵袭性恶性肿瘤中的协同抗肿瘤效应 | 三阴性乳腺癌(4T-1)、头颈鳞癌(MOC-2)和MYCN扩增型神经母细胞瘤的动物模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌,头颈癌,神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 过继性细胞转移 | NA | 基因表达数据, 治疗反应数据 | 多种肿瘤模型的实验动物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Dissecting tumor transcriptional heterogeneity from single-cell RNA-seq data by generalized binary covariance decomposition
2024-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.15.553436
PMID:37645713
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研究论文 | 提出一种新的统计方法GBCD,用于从单细胞RNA测序数据中解析肿瘤转录异质性 | 开发了广义二元协方差分解方法,能够将转录异质性分解为患者特异性、数据集特异性和疾病亚型相关的共享成分 | 方法在强肿瘤间异质性存在时的性能尚未与其他方法进行全面比较 | 解析肿瘤转录异质性并识别与癌症进展相关的共享模式 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 广义二元协方差分解(GBCD) | 单细胞RNA测序数据 | 来自三项研究的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Double-negative B cells and DNASE1L3 colocalise with microbiota in gut-associated lymphoid tissue
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48267-4
PMID:38744839
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞技术揭示了肠道相关淋巴组织中双阴性B细胞与DNASE1L3在维持肠道稳态中的作用机制 | 首次发现自身免疫疾病相关的双阴性2 B细胞亚群在健康肠道组织中存在,并揭示其与表达DNASE1L3和C1q的树突状细胞的相互作用 | 研究观察到人类与小鼠在DNASE1L3表达树突状细胞功能上存在物种差异,机制尚未完全阐明 | 探究肠道相关淋巴组织对细菌抗原的初始应答机制及细菌处理方式 | 肠道相关淋巴组织中的双阴性B细胞和树突状细胞 | 空间生物学 | 自身免疫疾病 | 空间转录组学, 多重单细胞技术 | NA | 空间转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
Destabilization of mRNAs enhances competence to initiate meiosis in mouse spermatogenic cells
2024-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.20.557439
PMID:37781613
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研究论文 | 本研究揭示MEIOC与YTHDC2、RBM46通过介导mRNA降解增强小鼠精原细胞启动减数分裂能力 | 发现MEIOC在减数分裂启动前通过mRNA destabilization调控转录组变化,早于既往认知 | 研究局限于小鼠模型,未涉及其他哺乳动物验证 | 阐明MEIOC分子机制如何支持精原细胞早期减数分裂 | 小鼠精原细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 发育同步化的精子发生过程样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Tendon-associated gene expression precedes osteogenesis in mid-palatal suture establishment
2024-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.11.590129
PMID:38798531
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了腭中缝建立过程中肌腱相关基因在成骨作用前的关键表达模式 | 首次发现肌腱相关基因在腭中缝形成中发挥重要作用,并建立了细胞外基质基因、肌腱细胞标记物与新型缝线开放候选基因之间的表达关系 | 研究主要聚焦于胚胎晚期至出生早期的发育阶段,对成年期缝线维持机制的探讨较为有限 | 探究腭中缝建立的分子机制及其与颅缝发育的共同生物学原理 | 小鼠腭中缝发育过程中的组织样本和基因表达数据 | 发育生物学 | 颅面畸形 | 组织学技术、多模态转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 胚胎晚期至出生早期多个时间点的小鼠腭中缝样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | FaceBase数据库中的单细胞RNA测序数据集 |
| 77 | 2025-10-06 |
scRNA-seq data from the larval Drosophila ventral cord provides a resource for studying motor systems function and development
2024-05-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.016
PMID:38569548
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术对果蝇幼虫腹神经索细胞类型进行全面普查,为研究运动系统功能与发育提供重要资源 | 首次使用经解剖验证的高质量scRNA-seq创建幼虫VNC细胞类型的全面普查,发现构成成虫VNC的神经谱系在幼虫阶段已确定但处于静止状态 | 研究主要聚焦于幼虫阶段,对发育过程中细胞类型动态变化的分析可能不够全面 | 研究果蝇幼虫腹神经索的细胞类型组成及其在运动系统发育和功能中的作用 | 果蝇幼虫腹神经索细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 果蝇幼虫腹神经索细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
A human neural crest model reveals the developmental impact of neuroblastoma-associated chromosomal aberrations
2024-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47945-7
PMID:38702304
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研究论文 | 通过人类胚胎干细胞分化模型研究神经母细胞瘤相关染色体畸变对神经嵴发育的影响 | 首次建立人类神经嵴发育模型,揭示染色体17q/1q增益与MYCN过表达协同破坏神经嵴细胞分化的机制 | 研究基于体外干细胞分化模型,可能与体内真实发育环境存在差异 | 探究染色体拷贝数变异在胚胎性肿瘤发生中的作用机制 | 人类胚胎干细胞分化的神经嵴细胞及其交感肾上腺衍生物 | 发育生物学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序, 单细胞表观基因组分析 | 人类胚胎干细胞分化模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组学 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Spatial Biology of Breast Cancer
2024-05-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041335
PMID:38110242
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综述 | 探讨空间生物学方法在乳腺癌研究中的应用与进展 | 整合传统空间方法与新兴多重成像技术,揭示空间关系对癌症进展和治疗的影响 | NA | 总结空间方法在乳腺癌研究中的贡献并展望未来研究方向 | 乳腺癌 | 空间生物学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 多重成像技术 | NA | 空间分子数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
The p21+ perinecrotic hepatocytes produce the chemokine CXCL14 after a severe acetaminophen overdose promoting hepatocyte injury and delaying regeneration
2024-05, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2024.153804
PMID:38614205
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研究论文 | 本研究揭示了在对乙酰氨基酚严重过量后,p21+坏死周围肝细胞通过产生趋化因子CXCL14加剧肝细胞损伤并延迟再生 | 首次发现p21+肝细胞亚群通过分泌CXCL14直接阻碍肝脏恢复,而非传统认为的衰老细胞清除机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探索严重对乙酰氨基酚过量后肝脏修复障碍的机制 | 小鼠模型和人类APAP explant肝脏样本 | 分子病理学 | 急性肝衰竭 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 人类肝脏样本和雌雄小鼠模型 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |