单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 558 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-10-24 |
Disentangling associations between complex traits and cell types with seismic
2024-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.04.592534
PMID:38765980
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研究论文 | 本文开发了一种新框架，通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和全基因组关联研究（GWAS），揭示复杂性状和疾病相关的细胞类型 | 提出了一个新的特异性评分来表征细胞类型，并展示了该框架在识别与性状相关的细胞组方面的优势 | 未提及 | 揭示复杂性状和疾病相关的细胞类型特异性生物过程 | 复杂性状和细胞类型 | 基因组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），全基因组关联研究（GWAS） | NA | 基因表达数据 | 超过1,000种细胞类型特征化和28种性状 |
| 62 | 2024-10-24 |
Host-derived Interleukin 1α induces an immunosuppressive tumor microenvironment via regulating monocyte-to-macrophage differentiation
2024-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.03.592354
PMID:38746389
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研究论文 | 研究探讨了IL-1α在调节单核细胞向巨噬细胞分化过程中对免疫抑制性肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了IL-1α在调节巨噬细胞分化和活性中的关键作用，并提出其作为乳腺癌治疗潜在靶点的可能性 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨IL-1α在肿瘤微环境中对巨噬细胞分化的调控机制及其对免疫抑制性微环境的影响 | IL-1α、巨噬细胞、肿瘤微环境 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用乳腺癌小鼠模型进行研究 |
| 63 | 2024-10-24 |
Reproducible single cell annotation of programs underlying T-cell subsets, activation states, and functions
2024-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.03.592310
PMID:38746317
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研究论文 | 本文介绍了一种名为T-CellAnnoTator（TCAT）的管道，用于同时量化预定义的基因表达程序（GEP），以捕捉T细胞的激活状态和细胞亚群 | TCAT管道能够从1,700,000个T细胞中识别出46个可重复的GEP，反映了T细胞的核心功能，并应用于描述Covid-19和癌症中的T细胞激活和衰竭 | NA | 推进T细胞的特征化，识别T细胞的激活状态和功能 | T细胞的基因表达程序和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 1,700,000个T细胞，来自700个个体，涉及38种组织和五种不同的疾病背景 |
| 64 | 2024-10-24 |
Unveiling Novel Double-Negative Prostate Cancer Subtypes Through Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.11.553009
PMID:38746150
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了前列腺癌中的新型双阴性亚型 | 发现了两种新型双阴性前列腺癌亚型：KRT7细胞和祖细胞样细胞，并开发了用于可视化基因表达的网络应用程序 | NA | 揭示前列腺癌中的新型亚型，并为临床诊断和治疗策略提供新见解 | 前列腺癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个研究中的公开队列和本研究团队生成的数据 |
| 65 | 2024-10-24 |
Single-cell transcriptomics reveals evolutionary reconfiguration of embryonic cell fate specification in the sea urchin Heliocidaris erythrogramma
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.30.591752
PMID:38746376
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析揭示了海胆Heliocidaris erythrogramma胚胎细胞命运指定在进化过程中的重配置 | 利用单细胞转录组学分析多个物种的发育转录组，揭示了胚胎模式形成中的进化变化 | 需要进一步实验验证候选调控相互作用 | 揭示进化过程中胚胎发育机制的变化 | 海胆Heliocidaris erythrogramma的胚胎细胞命运指定 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个物种的发育时间序列样本 |
| 66 | 2024-10-20 |
Cardiac and perivascular myofibroblasts, matrifibrocytes, and immune fibrocytes in hypertension; commonalities and differences with other cardiovascular diseases
2024-May-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae044
PMID:38395029
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研究论文 | 本文探讨了高血压中不同类型纤维化的分子机制及其在心血管病理生理学中的潜在作用 | 本文提出了新的纤维母细胞亚群（如matrifibrocytes和immune fibrocytes）在心血管纤维化中的作用，并探讨了其潜在的治疗应用 | 本文主要基于实验证据和单细胞RNA测序研究，缺乏临床验证 | 研究高血压和其他心血管疾病中纤维化的分子机制及其潜在治疗策略 | 高血压、压力超负荷、心肌梗死、动脉粥样硬化、主动脉瘤和肾硬化等心血管疾病中的纤维母细胞亚群 | 心血管疾病 | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 67 | 2024-10-19 |
The role of HPV11 E7 in modulating STING-dependent interferon β response in recurrent respiratory papillomatosis
2024-May-14, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01925-23
PMID:38624230
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研究论文 | 研究HPV11 E7在复发性呼吸道乳头状瘤病中调节STING依赖性干扰素β反应的作用 | 首次揭示了HPV11 E7通过抑制STING蛋白的磷酸化来逃避宿主的抗病毒反应，并展示了激活的巨噬细胞在抗病毒免疫中的潜在作用 | 研究主要集中在细胞模型和单细胞RNA测序分析上，缺乏临床试验数据支持 | 探讨HPV在复发性呼吸道乳头状瘤病中逃避宿主先天免疫反应的机制 | 复发性呼吸道乳头状瘤病样本中的免疫细胞状态和HPV感染的细胞模型 | NA | 复发性呼吸道乳头状瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个复发性呼吸道乳头状瘤病样本 |
| 68 | 2024-10-16 |
Efficient and accurate mixed model association tool for single-cell eQTL analysis
2024-May-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.05.15.24307317
PMID:38798318
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研究论文 | 本文提出了一种高效且准确的混合模型关联工具SAIGE-QTL，用于单细胞eQTL分析 | SAIGE-QTL可以直接使用单细胞数据进行eQTL映射，无需聚合到伪批量水平，并且支持通过基于集合的测试来检测稀有遗传变异的影响 | NA | 研究基因表达的遗传基础，以帮助理解人类性状和疾病的分子机制 | 单细胞eQTL映射 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模型 | 单细胞数据 | NA |
| 69 | 2024-10-16 |
Expression of SOX4 Significantly Predicts the Risk of Lymph Node Metastasis for Patients With Early-Stage Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2024-05, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102042
PMID:38431117
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研究论文 | 研究探讨了SOX4基因表达与早期食管鳞状细胞癌患者淋巴结转移风险的关系 | 首次通过单细胞RNA测序发现SOX4基因与侵袭性转移高度相关，并进一步验证了其在预测淋巴结转移中的独立作用 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 研究SOX4基因在早期食管鳞状细胞癌患者淋巴结转移中的预测作用 | SOX4基因表达与食管鳞状细胞癌患者的淋巴结转移风险 | 数字病理学 | 食管癌 | 免疫组化染色 | NA | 组织样本 | 124个组织样本，来自106名患者（106个肿瘤样本和18个淋巴结样本） |
| 70 | 2024-10-12 |
Batf3+ DCs and the 4-1BB/4-1BBL axis are required at the effector phase in the tumor microenvironment for PD-1/PD-L1 blockade efficacy
2024-May-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114141
PMID:38656869
|
研究论文 | 研究探讨了Batf3+ DCs和4-1BB/4-1BBL轴在肿瘤微环境中对PD-1/PD-L1阻断疗法疗效的影响 | 首次明确指出Batf3-lineage树突状细胞在PD-1/PD-L1阻断疗法中的关键作用，并揭示了4-1BBL作为主要的正向共刺激信号 | 研究主要基于基因靶向小鼠和人类肿瘤样本，可能存在种属差异 | 探讨PD-1/PD-L1阻断疗法在肿瘤微环境中的疗效机制 | Batf3+ DCs、4-1BB/4-1BBL轴、CD8 T细胞 | NA | NA | 流式细胞术、免疫荧光、空间转录组学 | NA | 细胞、基因、蛋白质 | 基因靶向小鼠和人类肿瘤样本 |
| 71 | 2024-10-11 |
MAPPING ALZHEIMER'S DISEASE PSEUDO-PROGRESSION WITH MULTIMODAL BIOMARKER TRAJECTORY EMBEDDINGS
2024-May, Proceedings. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging
DOI:10.1109/isbi56570.2024.10635249
PMID:39371469
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研究论文 | 本研究提出了一种新的方法，通过多模态生物标志物轨迹嵌入来理解阿尔茨海默病的异质性进展 | 采用单细胞转录组学领域的PHATE和Slingshot方法，将多模态生物标志物轨迹投影到低维空间，生成伪时间估计 | NA | 研究阿尔茨海默病的进展，以实现早期检测、及时干预和开发有效治疗方法 | 阿尔茨海默病的多模态生物标志物轨迹 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | PHATE, Slingshot | NA | 多模态生物标志物数据 | 阿尔茨海默病神经影像学倡议(ADNI)数据集中的多个疾病阶段个体 |
| 72 | 2024-10-10 |
A novel sorting method for the enrichment of early human spermatocytes from clinical biopsies
2024-May, F&S science
DOI:10.1016/j.xfss.2024.02.002
PMID:38369016
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研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光激活细胞分选（FACS）从人类睾丸活检中富集早期精母细胞的新方法 | 首次使用TSP50和SWI5-dependent homologous recombination repair protein 1作为表面标记物，通过FACS成功富集早期精母细胞 | 研究样本量较小，仅涉及三名患者 | 确定是否可以通过FACS从人类睾丸活检中富集早期精母细胞 | 早期精母细胞 | NA | NA | 荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三名患有阻塞性无精症的男性（年龄范围30-40岁） |
| 73 | 2024-10-09 |
Human IL-6 fosters long-term engraftment of patient-derived disease-driving myeloma cells in immunodeficient mice
2024-May-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177300
PMID:38713510
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研究论文 | 研究展示了人IL-6转基因NSG小鼠支持恶性及前恶性人浆细胞的植入，并建立了一个有效的患者来源的异种移植模型 | 首次展示了NSG+hIL6小鼠作为多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病的有效患者来源异种移植模型 | NA | 建立一个有效的动物模型来重现人类多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病 | 多发性骨髓瘤及相关浆细胞疾病 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括单克隆丙种球蛋白病、前及复发后骨髓瘤、浆细胞白血病和轻链淀粉样变性的患者来源的浆细胞 |
| 74 | 2024-10-06 |
Endoluminal Biopsy for Vein of Galen Malformation
2024-May-15, Neurosurgery
IF:3.9Q1
DOI:10.1227/neu.0000000000002986
PMID:38747605
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研究论文 | 本文探讨了使用内窥镜组织采样（ETS）对Galen静脉畸形（VOGM）病变进行原位分析的可行性，并可能推进对VOGM遗传学、发病机制和维持机制的理解 | 首次提出使用内窥镜组织采样（ETS）对VOGM病变进行原位分析，并通过单细胞RNA测序展示了其可行性 | 样本量较小，仅包含6名患者，且未详细讨论ETS技术的长期安全性和有效性 | 探讨内窥镜组织采样（ETS）在VOGM病变原位分析中的可行性，并推进对VOGM遗传学和发病机制的理解 | Galen静脉畸形（VOGM）病变的内皮细胞（ECs）和外周内皮细胞 | NA | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名患者，共进行了10次ETS程序，采集了98 ± 88个实验性内皮细胞（CD31+和CD45-） |
| 75 | 2024-10-05 |
Single-cell analysis reveals an antiviral network that controls Zika virus infection in human dendritic cells
2024-May-14, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00194-24
PMID:38567950
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人类树突状细胞对寨卡病毒感染的抗病毒反应 | 首次在单细胞水平上揭示了寨卡病毒感染时抗病毒网络的组成和功能 | 研究仅限于人类树突状细胞，未涉及其他细胞类型 | 深入理解宿主对寨卡病毒感染的反应机制 | 人类树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 一批人类单核细胞衍生的树突状细胞 |
| 76 | 2024-10-01 |
Helicobacter pylori CagA Promotes the Formation of Gallstones by Increasing the Permeability of Gallbladder Epithelial Cells
2024 May-Jun, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.13100
PMID:38873839
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研究论文 | 研究了幽门螺杆菌CagA通过增加胆囊上皮细胞的通透性促进胆结石形成的作用 | 首次发现幽门螺杆菌CagA是导致胆结石形成的关键致病因素 | 研究主要基于小鼠模型和少量患者样本，需要进一步的人体研究验证 | 探索导致慢性炎症和胆结石形成的关键致病菌及其机制 | 胆结石患者和小鼠模型的胆囊上皮细胞 | NA | 胆结石 | 单细胞转录组测序、bulk转录组测序、16S rRNA测序 | NA | 转录组数据、微生物组数据 | 6名胆结石患者和6名肝移植供体的胆囊黏膜样本，以及胆结石小鼠模型 |
| 77 | 2024-09-28 |
LYVE-1-expressing Macrophages Modulate the Hyaluronan-containing Extracellular Matrix in the Mammary Stroma and Contribute to Mammary Tumor Growth
2024-May-31, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0205
PMID:38717149
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研究论文 | 研究LYVE-1+巨噬细胞在乳腺基质中调节透明质酸基质外基质的作用及其对乳腺肿瘤生长的影响 | 首次揭示了LYVE-1+巨噬细胞在肿瘤微环境中促进肿瘤生长的机制，并展示了其在透明质酸重塑中的作用 | 研究主要基于遗传小鼠模型，可能无法完全反映人类乳腺肿瘤中的情况 | 探讨LYVE-1+巨噬细胞在乳腺基质中的功能及其对乳腺肿瘤生长的影响 | LYVE-1+巨噬细胞、透明质酸基质外基质、乳腺肿瘤 | NA | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 78 | 2024-09-28 |
HCCDB v2.0: Decompose Expression Variations by Single-cell RNA-seq and Spatial Transcriptomics in HCC
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae011
PMID:38886186
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研究论文 | 本文介绍了HCCDB v2.0数据库，该数据库整合了肝细胞癌（HCC）临床样本的bulk、单细胞和空间转录组数据，提供了对HCC分子特征的深入理解 | 提出了sc-2D指标，用于总结细胞类型特异性和失调基因表达模式，并整合了最新的单细胞和空间转录组数据 | NA | 通过整合大规模转录组数据，深入理解肝细胞癌的分子特征 | 肝细胞癌（HCC）临床样本的bulk、单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 共整合了3917个bulk样本和1656个新样本，以及182,832个单细胞和69,352个空间位点 |
| 79 | 2024-09-21 |
Interactions between LAMP3+ dendritic cells and T-cell subpopulations promote immune evasion in papillary thyroid carcinoma
2024-May-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008983
PMID:38816233
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研究论文 | 研究探讨了LAMP3+树突状细胞与T细胞亚群在乳头状甲状腺癌中的相互作用及其对免疫逃逸的影响 | 首次揭示了LAMP3+树突状细胞在乳头状甲状腺癌进展中的高度浸润及其与T细胞亚群的相互作用，为免疫治疗提供了新的思路 | 研究样本量较小，且仅限于手术组织样本，可能影响结果的普适性 | 探讨乳头状甲状腺癌免疫重塑的机制，寻找新的治疗靶点 | LAMP3+树突状细胞与T细胞亚群在乳头状甲状腺癌中的相互作用 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 18个手术组织样本，来自14名患者 |
| 80 | 2024-09-21 |
ARID1B maintains mesenchymal stem cell quiescence via inhibition of BCL11B-mediated non-canonical Activin signaling
2024-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48285-2
PMID:38816354
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研究论文 | 研究探讨了ARID1B在维持间充质干细胞静止状态中的作用及其机制 | 揭示了ARID1B通过抑制BCL11B介导的非经典Activin信号通路维持间充质干细胞静止状态的新机制 | NA | 探讨ARID1B在间充质干细胞中的调控功能及其机制 | 间充质干细胞 | NA | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠切牙模型进行研究 |