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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Unraveling molecular advancements in chordoma tumorigenesis and treatment response: a review of scientific discoveries and clinical implications
2024-05, Neurosurgical focus
IF:3.3Q1
DOI:10.3171/2024.2.FOCUS2417
PMID:38691860
|
综述 | 本文系统回顾了脊索瘤分子发病机制的科学发现及其临床治疗意义 | 整合单细胞转录组分析、空间转录组学和游离DNA等新兴技术,揭示脊索瘤异质性分子通路 | NA | 总结脊索瘤分子发病机制的最新进展及其对神经外科治疗的增强作用 | 脊索瘤肿瘤发生机制与治疗反应 | 数字病理 | 脊索瘤 | 单细胞转录组分析, 空间转录组学, 游离DNA分析, 基因组学, 转录组学, 表观基因组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
Exploring the potential relationship between short sleep risks and cognitive function from the perspective of inflammatory biomarkers and cellular pathways: Insights from population-based and mice studies
2024-05, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14783
PMID:38797980
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研究论文 | 通过人群和动物研究探讨短睡眠风险与认知功能的关系及其炎症机制 | 结合人群流行病学数据与单细胞转录组学分析,揭示短睡眠通过炎症通路影响认知功能的细胞机制 | 观察性研究设计无法确定因果关系,小鼠模型结果向人类外推需谨慎 | 研究短睡眠对认知功能的影响及其分子机制 | 美国NHANES人群数据(2011-2014)和实验小鼠 | 生物医学研究 | 认知功能障碍 | 生物信息学分析, 单细胞转录组测序, GO和KEGG富集分析 | NA | 血液检测数据, 认知测试数据, 基因表达数据 | NHANES人群数据(2011-2014)和小鼠实验数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | NA | GSE137665单细胞转录组数据集 |
| 43 | 2025-10-06 |
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-05-31, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01840-1
PMID:38816371
|
综述 | 系统总结巨噬细胞在心血管疾病中的表型多样性、功能可塑性及其调控机制,并探讨单细胞测序技术带来的新见解 | 整合单细胞测序技术揭示的巨噬细胞异质性和细胞互作机制,聚焦不同心血管疾病背景下炎症与纤维化的关系 | 主要基于现有文献总结,缺乏原始实验数据验证 | 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的分子机制和潜在治疗靶点 | 巨噬细胞在心血管疾病中的表型和功能 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-05-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01838-9
PMID:38811552
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研究论文 | 本研究揭示靶向BCL9/BCL9L通过促进cDC1树突状细胞活化和肿瘤浸润来增强抗原呈递 | 首次阐明BCL9/BCL9L通过XCL1-XCR1轴和NF-κB/IRF1信号通路调控cDC1功能的新机制 | 未明确BCL9/BCL9L在其它免疫细胞亚群中的作用 | 探究靶向BCL9/BCL9L对肿瘤抗原呈递和抗肿瘤免疫的影响 | 常规1型树突状细胞(cDC1)、CD8 T细胞、肿瘤微环境 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组测序、基因敲除、药理学抑制 | NA | 基因表达数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Integrated Single-cell Multiomic Analysis of HIV Latency Reversal Reveals Novel Regulators of Viral Reactivation
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae003
PMID:38902848
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学分析揭示HIV潜伏逆转的新调控因子 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术同时分析潜伏感染细胞的转录组和表观基因组特征,并利用机器学习预测病毒再激活 | 研究仅针对CD4+ T细胞,未涉及其他潜在HIV潜伏库细胞类型 | 揭示HIV潜伏逆转的分子机制和新型调控因子 | 约125,000个潜伏感染的原代CD4+ T细胞 | 单细胞多组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 约125,000个原代CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Young glial progenitor cells competitively replace aged and diseased human glia in the adult chimeric mouse brain
2024-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01798-5
PMID:37460676
|
研究论文 | 本研究通过移植年轻健康的人类胶质祖细胞成功替代成年嵌合小鼠大脑中的衰老和病变胶质细胞 | 首次发现年轻健康胶质祖细胞在成年大脑中具有竞争优势,能够通过YAP1/MYC/E2F信号通路取代衰老和病变胶质细胞 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床环境中验证 | 探究健康胶质细胞是否能在成年前脑中竞争取代病变人类胶质细胞 | 人类胶质祖细胞和亨廷顿病模型小鼠 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 嵌合小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Discovery and characterization of dietary antigens in oral tolerance
2024-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.26.593976
PMID:38853977
|
研究论文 | 本研究通过鉴定玉米、小麦和大豆特异性T细胞受体,揭示了植物源性食物中引发口服耐受的关键抗原表位及其功能特性 | 首次系统性地鉴定并表征了玉米、小麦和大豆中引发口服耐受的T细胞表位,发现这些表位均来源于抗降解的种子贮藏蛋白 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;仅针对三种主要谷物进行研究 | 探索植物源性食物中引发口服免疫耐受的抗原表位及其免疫学机制 | 小鼠T细胞受体、玉米、小麦和大豆中的抗原表位、肠道调节性T细胞 | 免疫学 | 食物过敏 | 表达克隆、MHC四聚体技术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质序列数据 | NA | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Batf3+ DCs and the 4-1BB/4-1BBL axis are required at the effector phase in the tumor microenvironment for PD-1/PD-L1 blockade efficacy
2024-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114141
PMID:38656869
|
研究论文 | 本研究揭示了Batf3+树突状细胞和4-1BB/4-1BBL轴在肿瘤微环境中对PD-1/PD-L1阻断疗效的关键作用 | 首次明确Batf3谱系树突状细胞通过4-1BBL信号在肿瘤微环境中为CD8 T细胞提供正向共刺激信号,是PD-1/PD-L1阻断疗效的必要条件 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究PD-1/PD-L1阻断治疗中肿瘤微环境内重新激活T细胞的细胞来源和分子机制 | Batf3+树突状细胞、CD8 T细胞、4-1BB/4-1BBL信号轴 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 流式细胞术、基因靶向小鼠、阻断抗体研究、免疫荧光、空间转录组学 | NA | 流式细胞数据、基因表达数据、空间分布数据 | 人类肿瘤样本和小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Nextflow pipeline for Visium and H&E data from patient-derived xenograft samples
2024-May-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100759
PMID:38626768
|
研究论文 | 开发了一个用于处理10x Genomics Visium空间转录组数据和H&E染色全切片图像的Nextflow流程 | 设计了专门针对患者来源异种移植样本优化的空间转录组定量流程,能够同时处理转录组数据和图像数据 | 仅展示了在四个黑色素瘤PDX样本上的应用,样本规模有限 | 开发空间转录组数据分析流程 | 患者来源异种移植癌症样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学,全切片图像分析 | NA | 空间转录组数据,H&E染色图像 | 四个黑色素瘤PDX样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 50 | 2025-10-06 |
Determination of permissive and restraining cancer-associated fibroblast (DeCAF) subtypes
2024-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.14.594197
PMID:38798565
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研究论文 | 开发了一种名为DeCAF的单样本分类器,用于鉴定临床限制性和允许性癌症相关成纤维细胞亚型 | 将单细胞RNA测序衍生的CAF标志基因转化为可用于批量RNA测序数据的分类工具,并在多种肿瘤类型中验证其临床适用性 | NA | 开发能够分类癌症相关成纤维细胞亚型的临床适用工具 | 胰腺导管腺癌、间皮瘤、膀胱癌和肾细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 单样本分类器 | 转录组数据 | 19个独立批量转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Genetic and transcriptomic landscape of colonic diverticulosis
2024-05-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331267
PMID:38443061
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研究论文 | 通过遗传学和转录组学分析揭示结肠憩室病的分子机制和细胞基础 | 首次整合DNA/RNA测序、单细胞RNA-seq数据和孟德尔随机化方法系统研究结肠憩室病 | 样本量相对有限(404例),仅针对结肠组织进行分析 | 识别结肠憩室病的遗传和细胞决定因素及其与其他胃肠道疾病的关系 | 结肠憩室病患者和对照人群的结肠组织 | 基因组学 | 结肠憩室病 | DNA测序, RNA测序, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 多基因风险评分 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 404例患者(172例憩室病,232例对照) | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联研究 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
A Mettl16/m6A/mybl2b/Igf2bp1 axis ensures cell cycle progression of embryonic hematopoietic stem and progenitor cells
2024-May, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00082-9
PMID:38605226
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研究论文 | 本研究揭示了METTL16介导的m6A修饰通过调控mybl2b/Igf2bp1轴确保胚胎造血干细胞和祖细胞周期进程的关键机制 | 首次发现METTL16-m6A-MYBL2-IGF2BP1轴在胚胎造血干细胞周期调控中的保守功能,阐明METTL16甲基转移酶活性对细胞G1/S期进程的必要性 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的验证仍需进一步深入 | 探究METTL16介导的RNA m6A修饰在胚胎造血干细胞发育中的功能机制 | 脊椎动物胚胎造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | 发育生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序, 跨物种分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Effects of SPI1-mediated transcriptome remodeling on Alzheimer's disease-related phenotypes in mouse models of Aβ amyloidosis
2024-May-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48484-x
PMID:38734693
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研究论文 | 本研究通过调控SPI1表达水平探究其对阿尔茨海默病相关病理表型的影响 | 首次在Aβ淀粉样变性小鼠模型中系统验证SPI1下调与过表达对AD病理的相反作用,并揭示其通过免疫反应和补体系统等通路发挥作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究SPI1表达水平调控对阿尔茨海默病发病机制的影响 | Spi1基因敲除和过表达的小鼠模型 | 转录组学 | 阿尔茨海默病 | 靶向转录组学,单细胞转录组学 | 基因敲除模型,基因过表达模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
Characterization of the responses of brain macrophages to focused ultrasound-mediated blood-brain barrier opening
2024-May, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01107-0
PMID:37857722
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了聚焦超声开放血脑屏障后脑巨噬细胞的免疫重塑机制 | 首次在单细胞水平系统表征聚焦超声开放血脑屏障后小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞的动态响应 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究聚焦超声介导的血脑屏障开放对脑巨噬细胞的影响机制 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
Stem-cell states converge in multistage cutaneous squamous cell carcinoma development
2024-05-31, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adi7453
PMID:38815020
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研究论文 | 通过构建基因表达网络并结合谱系追踪和单细胞RNA测序,揭示皮肤鳞状细胞癌多阶段发展过程中干细胞状态的收敛现象 | 发现癌前肿瘤细胞中表达谱系可塑性和耐药性标记的细胞状态收敛现象,并揭示增殖状态与多谱系可塑性状态之间的互斥关系 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚需进一步研究 | 探索干细胞在癌症发展过程中的作用机制 | 小鼠正常组织和肿瘤组织 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 基因表达网络分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 数百个小鼠组织样本(包括正常和肿瘤组织) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Pioneer factor ETV2 safeguards endothelial cell specification by recruiting the repressor REST to restrict alternative lineage commitment
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.595971
PMID:38853821
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研究论文 | 本研究揭示了先驱因子ETV2通过招募抑制因子REST来限制替代谱系承诺,从而保障内皮细胞特化的机制 | 首次发现ETV2通过招募转录抑制因子REST来抑制非内皮细胞谱系基因,揭示了先驱因子招募抑制因子以限制替代谱系承诺的新机制 | 研究主要基于体外诱导多能干细胞分化系统,需要在体内模型中进一步验证 | 探索ETV2驱动细胞命运特化的分子机制,特别是内皮细胞谱系特化过程 | 人诱导多能干细胞来源的中胚层祖细胞和内皮细胞 | 发育生物学 | NA | CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组学数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma
2024-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114139
PMID:38652658
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研究论文 | 本研究利用单细胞谱系追踪技术分析胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂的耐药机制 | 首次在患者来源的胶质母细胞瘤神经球中结合谱系追踪条码和单细胞RNA测序技术研究KIF11抑制剂耐药性 | 主要基于体外模型研究,动物模型验证相对有限 | 探究胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂ispinesib的耐药机制和潜在联合治疗策略 | 患者来源的胶质母细胞瘤神经球、患者来源的异种移植模型、人源离体胶质母细胞瘤切片 | 单细胞测序 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者来源的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
Envelope protein-specific B cell receptors direct lentiviral vector tropism in vivo
2024-May-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.002
PMID:38449314
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研究论文 | 本研究揭示了慢病毒载体通过B细胞受体介导的靶向转导机制 | 发现不同假型包膜蛋白通过特异性BCR基因型靶向转导不同B细胞亚群 | 研究主要聚焦于脾脏B细胞,未涉及其他组织或细胞类型 | 探究慢病毒载体体内转导的靶向性机制 | 小鼠脾脏B细胞 | 基因治疗 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
Prognostic gene landscapes and therapeutic insights in sepsis-induced coagulopathy
2024-05, Thrombosis research
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.thromres.2024.03.011
PMID:38513536
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研究论文 | 本研究通过分析脓毒症患者的转录组数据,识别了与凝血相关的关键基因,并开发了预后模型和列线图来预测患者生存 | 首次通过单细胞测序揭示脓毒症中血小板与免疫细胞间的通讯改变,并发现FYN基因在凝血功能障碍中的核心作用 | 研究样本量有限,机制研究主要在动物模型中进行,需要进一步临床验证 | 探索脓毒症诱导凝血病(SIC)的预后基因标志物和治疗靶点 | 脓毒症患者和脓毒症大鼠模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞测序, 实时定量PCR | 预后模型, 列线图, 共识聚类 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 脓毒症患者全血转录组数据,脓毒症大鼠模型 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
COPD basal cells are primed towards secretory to multiciliated cell imbalance driving increased resilience to environmental stressors
2024-05-20, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thorax-2022-219958
PMID:38286613
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研究论文 | 本研究揭示了COPD患者基底细胞向分泌型细胞分化失衡的分子机制及其对环境应激的增强耐受性 | 首次发现COPD-IV期基底细胞存在独特的分子特征,包括KRT5和LAMB3表达上调及Wnt/Notch信号通路激活,驱动分泌型与多纤毛细胞失衡 | 样本量较小(COPD-IV n=4,COPD-II n=3,健康对照n=4),且仅针对特定环境纳米颗粒进行研究 | 阐明环境污染物作用下COPD患者支气管上皮细胞的耐受机制 | 原发性人支气管上皮细胞(pHBECs) | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组测序,功能分析,蛋白质分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 11例人支气管上皮细胞样本(4例COPD-IV期,3例COPD-II期,4例健康对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |