单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
541	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of biomarker in allergic rhinitis patient undergoing intracervical lymphatic immunotherapy and related pan-cancer analysis 2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24151 PMID:38291708	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了过敏性鼻炎患者在接受宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化，并进行了相关的泛癌分析	首次采用宫颈淋巴免疫治疗（ICLIT）方法，并利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫细胞反应的分子机制	NA	探究过敏性鼻炎患者在接受宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化及其与肿瘤的关联	过敏性鼻炎患者的B细胞及其在宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化	数字病理学	过敏性疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
542	2024-08-07	Tumor markers for lipid metabolism-related genes: Based on small cell lung cancer and bronchial asthma dual analysis 2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24152 PMID:38293814	研究论文	本研究通过分析小细胞肺癌和哮喘的scRNA-seq数据，探讨了脂质代谢相关基因在哮喘向小细胞肺癌转变中的作用	提出了一个新的脂质代谢相关基因标记，有助于深入理解哮喘向小细胞肺癌发展的机制	研究未直接关注衰老相关的分子改变	旨在开发更准确的预测模型，揭示哮喘与小细胞肺癌之间免疫信号通路的潜在联系	小细胞肺癌和哮喘的脂质代谢相关基因	数字病理学	小细胞肺癌	scRNA-seq	NA	基因表达数据	使用了来自GEO数据库的GSE164404（小细胞肺癌）和GSE145013（严重哮喘）的scRNA-seq数据
543	2024-08-07	Construction and validation of a novel NAD+ metabolism-related risk model for prognostic prediction in osteosarcoma 2024-May, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society IF:2.1Q2 DOI:10.1002/jor.25757 PMID:38047487	研究论文	本研究构建并验证了一种新的与NAD+代谢相关的风险模型，用于预测骨肉瘤的预后	首次探讨了NAD代谢相关基因与骨肉瘤的肿瘤免疫微环境、免疫治疗反应及预后的关联	NA	研究NAD代谢相关基因与骨肉瘤的肿瘤免疫微环境、免疫治疗反应及预后的关联	骨肉瘤患者的NAD代谢相关基因及肿瘤免疫微环境	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	基因表达数据	数据来自TARGET和GEO数据库的骨肉瘤样本
544	2024-08-04	Ablation of Brg1 in fibroblast/myofibroblast lineages attenuates renal fibrosis in mice with diabetic nephropathy 2024-May-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2024.122578 PMID:38537899	研究论文	本研究探讨了Brg1在糖尿病肾病小鼠中对肾纤维化的影响	提供了Brg1与成纤维细胞-肌成纤维细胞转化之间的新遗传联系	尚未明确与Brg1相关的所有表观遗传机制	探讨Brg1在糖尿病肾病相关肾纤维化中的作用	C57B6/j小鼠中的成纤维细胞和肌成纤维细胞	数字病理学	糖尿病肾病	定量PCR和西方印迹	NA	基因表达数据	C57B6/j小鼠的样本数量未明确提及
545	2024-08-05	Role of crosstalk between synovial cells and chondrocytes in osteoarthritis (Review) 2024-May, Experimental and therapeutic medicine IF:2.4Q3 DOI:10.3892/etm.2024.12490 PMID:38590580	综述	本文全面探讨了滑膜细胞与软骨细胞在骨关节炎中的相互作用及其机制	本综述更新了单细胞测序技术在研究滑膜与软骨细胞相互作用中的应用	未提及特定实验数据或临床试验的应用	阐明滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用机制	滑膜细胞与软骨细胞在骨关节炎中的相互作用	数字病理学	骨关节炎	单细胞测序	NA	组织学与病理学数据	NA
546	2024-08-07	Specific photoreceptor cell fate pathways are differentially altered in NR2E3-associated diseases 2024-May, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2024.106463 PMID:38485095	研究论文	本研究通过scRNA-seq技术分析野生型和两种Nr2e3基因突变小鼠模型的视网膜，揭示了NR2E3基因在调节光感受器细胞分化中的作用。	发现了先前未报道的产生混合锥细胞的锥途径，这些混合锥细胞同时表达锥和杆相关基因。	NA	解析NR2E3基因在杆和锥转录网络中的精确作用。	NR2E3基因突变相关的视网膜疾病。	数字病理学	视网膜疾病	scRNA-seq	NA	基因表达数据	野生型和两种Nr2e3基因突变小鼠模型的视网膜样本
547	2024-08-04	Perturbed liver gene zonation in a mouse model of non-alcoholic steatohepatitis 2024-May, Metabolism: clinical and experimental DOI:10.1016/j.metabol.2024.155830 PMID:38428673	研究论文	本研究探讨了非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型中肝脏基因分区的扰动	揭示了Wnt信号通路在小鼠NASH模型中如何影响肝脏基因分区的变化	研究未能探讨RSPO3过表达或Rspo3敲低对NASH病理的影响	研究非酒精性脂肪性肝炎中的肝脏基因分区及其调节机制	小鼠模型中的非酒精性脂肪性肝炎	数字病理学	非酒精性脂肪性肝炎	空间转录组学、bulk RNAseq、原位杂交	NA	基因表达数据	NA
548	2024-08-07	Cellular and molecular characteristics of stromal Lkb1 deficiency-induced gastrointestinal polyposis based on single-cell RNA sequencing 2024-05, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6259 PMID:38389501	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和基于成像的谱系追踪，探讨了与Peutz-Jeghers综合征相关的胃肠道息肉的细胞复杂性。	本研究揭示了Lkb1相关息肉的异常干细胞样特征，并识别了Spp1-Cd44或Spp1-Itga8/Itgb1轴在息肉中的重要相互作用。	NA	研究Lkb1缺乏引起的胃肠道息肉的细胞和分子特征。	Lkb1;Myh11-Cre/ERT2和Lkb1;PDGFRα-Cre/ERT2小鼠模型中的胃肠道息肉。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	Lkb1;Myh11-Cre/ERT2和Lkb1;PDGFRα-Cre/ERT2小鼠模型
549	2024-08-07	Nfe2l3 promotes neuroprotection and long-distance axon regeneration after injury in vivo 2024-May, Experimental neurology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114741 PMID:38395216	研究论文	研究探讨了Nfe2l3基因在中枢神经系统（CNS）损伤后的神经保护和轴突再生中的作用	首次揭示了Nfe2l3在神经保护和轴突再生中的作用，并展示了其作为治疗CNS损伤和疾病的潜在疗法	NA	研究Nfe2l3在CNS损伤后的神经保护和轴突再生中的功能	Nfe2l3基因在皮质和视网膜神经节细胞（RGC）中的表达及其在CNS损伤后的作用	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	皮质和视网膜神经节细胞（RGC）
550	2024-08-04	CCNA2 and NEK2 regulate glioblastoma progression by targeting the cell cycle 2024-May, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2024.14339 PMID:38516683	研究论文	该研究旨在探究CCNA2和NEK2在胶质母细胞瘤中的分子机制	首次系统阐明CCNA2和NEK2在胶质母细胞瘤进展中的作用，并建立了生存预测的诺模图	目前研究中并未明确说明样本量和不同亚类型的详细数据	探讨CCNA2和NEK2在胶质母细胞瘤中的特定功能和分子机制	胶质母细胞瘤中CCNA2和NEK2的表达及其预后	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞测序、西方印迹法和免疫组化染色	NA	基因表达数据	NA
551	2024-08-04	Machine learning combined with single-cell analysis reveals predictive capacity and immunotherapy response of T cell exhaustion-associated lncRNAs in uterine corpus endometrial carcinoma 2024-05, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111077 PMID:38311301	研究论文	本研究建立了与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 在子宫体内膜癌中的预测模型并研究了其免疫特征	首次探讨了与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 在子宫体内膜癌中的作用，并建立了相关的预测模型	研究主要基于公共数据库的数据，可能存在信息的偏倚和不足	建立与子宫体内膜癌 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 的预测模型	与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA	数字病理学	子宫体内膜癌	转录组和单细胞测序	逻辑回归模型	基因表达数据	使用癌症基因组图谱和基因表达综合数据库中的数据，具体样本数量未提及
552	2024-08-07	Multi-omics reveals the switch role of abnormal methylation in the regulation of decidual macrophages function in recurrent spontaneous abortion 2024-05, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111071 PMID:38295895	研究论文	本文通过整合转录组学、DNA甲基化组学和单细胞RNA测序，探讨了DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系	首次系统地描绘了异常DNA甲基化在调控蜕膜巨噬细胞功能中的作用，为复发性自然流产的发生机制提供了新的见解	NA	阐明DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系	复发性自然流产中的DNA甲基化和蜕膜细胞功能	数字病理学	生殖系统疾病	转录组学、DNA甲基化组学、单细胞RNA测序	NA	转录组数据、DNA甲基化数据、单细胞RNA测序数据	涉及22个低甲基化的CpG位点和16个关键通路
553	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals the MIF-ACKR3 receptor-ligand interaction between iCAFs and tumor cells in esophageal squamous cell carcinoma 2024-05, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111093 PMID:38336189	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了食管鳞状细胞癌（ESCC）样本，揭示了肿瘤微环境中iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3受体-配体相互作用。	本研究首次在ESCC中发现并验证了iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3相互作用，并揭示了其在肿瘤细胞迁移和侵袭中的作用。	研究主要基于GEO数据库中的ESCC样本进行单细胞RNA测序分析，可能存在样本选择偏倚。	深入理解食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境异质性，并识别新的治疗靶点。	食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤微环境及其细胞间的相互作用。	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	31,283个单细胞
554	2024-08-07	Image-activated pico-injection for single-cell analysis 2024-May-15, Talanta IF:5.6Q1 DOI:10.1016/j.talanta.2024.125765 PMID:38346358	研究论文	本文介绍了一种名为图像激活皮科注射（imgPico）的新技术，用于在无需标记的情况下，按需向液滴中补充试剂	imgPico技术通过实时图像分析检测目标液滴，并进行针对性的皮科注射，提高了液滴应用中试剂添加的精确性和效率	NA	研究并优化图像激活皮科注射技术，以提高其在单细胞分析中的应用效果	液滴中的单细胞分析	计算机视觉	NA	图像分析	NA	图像	分别包含一个、两个和三个细胞的液滴
555	2024-08-05	Bacterial heat shock protein: A new crosstalk between T lymphocyte and macrophage via JAK2/STAT1 pathway in bloodstream infection 2024-May, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2024.127626 PMID:38330817	研究论文	本研究探讨了细菌热休克蛋白在血流感染中T淋巴细胞和巨噬细胞之间的新型相互作用	发现了细菌外分泌调节蛋白与宿主免疫细胞之间的相互作用，并识别了JAK2/STAT1通路的激活与T细胞耗竭相关	尚未明确该研究在临床治疗中的具体应用效果	调查在高度耐药恶性血流感染中细菌与宿主免疫细胞的相互作用	单细胞测序结果、感染者的免疫细胞和相关信号通路	数字病理学	NA	蛋白质组学、单细胞测序	细胞模型和动物模型	细胞样本与患者血液样本	涉及单细胞样本和感染患者的血液样本
556	2024-08-04	Prediction of immunotherapy responsiveness in melanoma through single-cell sequencing-based characterization of the tumor immune microenvironment 2024-May, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101910 PMID:38417293	研究论文	该文章分析黑色素瘤患者的单细胞测序数据，以预测免疫疗法的响应。	文章提出了一种基于免疫成分组成的免疫疗法响应预测模型，并在黑色素瘤患者中经过验证，表现优于其他现有模型。	研究仅限于黑色素瘤患者，可能无法普遍适用于所有类型的癌症。	探讨黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的反应差异，并建立预测模型。	研究对象为接受免疫检查点抑制剂治疗的黑色素瘤患者。	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	基因组数据	集成自多位黑色素瘤患者的单细胞测序数据
557	2024-08-07	Multi-omics analysis-based macrophage differentiation-associated papillary thyroid cancer patient classifier 2024-May, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101889 PMID:38382228	研究论文	本研究通过多组学分析，构建了一个基于巨噬细胞分化特征的甲状腺乳头状癌患者分类器	本研究首次从免疫学角度探讨甲状腺肿瘤的预后差异机制，并利用巨噬细胞的分化特性为甲状腺乳头状癌的亚型分类提供新方法	NA	重新分类甲状腺乳头状癌	甲状腺乳头状癌患者的巨噬细胞分化特征	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	从公共数据库获取的甲状腺乳头状癌浸润髓样细胞的单细胞RNA测序数据
558	2024-08-07	Integrative transcriptome analysis identifies MYBL2 as a poor prognosis marker for osteosarcoma and a pan-cancer marker of immune infiltration 2024-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2023.04.035 PMID:38292182	研究论文	本研究通过综合转录组分析，发现MYBL2作为骨肉瘤的不良预后标志物以及泛癌免疫浸润标志物的潜力	首次揭示了MYBL2在骨肉瘤及泛癌中的免疫浸润关系，并开发了基于MYBL2的风险评分系统	NA	探索MYBL2在骨肉瘤及泛癌中的预后价值及其与免疫浸润的关系	MYBL2在骨肉瘤及泛癌中的表达及其与免疫浸润的关联	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及