单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
521	2024-08-07	Microenvironmental changes in familial adenomatous polyposis during colorectal cancer carcinogenesis 2024-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216822 PMID:38521200	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了家族性腺瘤性息肉病（FAP）患者的正常组织、腺瘤和癌组织的转录组，揭示了FAP在结直肠癌发生过程中的微环境变化	首次通过单细胞RNA测序详细分析了FAP患者的微环境变化，并比较了FAP与散发性结直肠癌的微环境差异	样本量相对较小，仅包括四名FAP患者和40名散发性结直肠癌患者	探究家族性腺瘤性息肉病在结直肠癌发生过程中的微环境变化	家族性腺瘤性息肉病患者的正常组织、腺瘤和癌组织	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	56,225个未分类的单细胞，来自4名FAP患者和26名FAP患者及40名散发性结直肠癌患者的组织样本
522	2024-08-07	OH2 oncolytic virus: A novel approach to glioblastoma intervention through direct targeting of tumor cells and augmentation of anti-tumor immune responses 2024-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216834 PMID:38537773	研究论文	本研究介绍了OH2溶瘤病毒，一种源自单纯疱疹病毒2型（HSV-2）的疗法，用于治疗胶质母细胞瘤（GBM），通过直接靶向肿瘤细胞和增强抗肿瘤免疫反应	OH2溶瘤病毒通过选择性靶向肿瘤细胞复制、诱导细胞毒性DNA损伤应激和激发抗肿瘤免疫反应，显示出显著的抗肿瘤活性	NA	探索OH2溶瘤病毒作为胶质母细胞瘤治疗新方法的有效性	胶质母细胞瘤（GBM）及其治疗	数字病理学	脑癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
523	2024-08-07	Correction: Single-cell RNA sequencing reveals the lineage of malignant epithelial cells and upregulation of TAGLN2 promotes peritoneal metastasis in gastric cancer 2024-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03402-x PMID:38492153	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
524	2024-08-04	Elucidating key immunological biomarkers and immune microenvironment dynamics in aging-related intracranial aneurysm through integrated multi-omics analysis 2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24117 PMID:38214030	研究论文	本文通过整合多组学分析阐明了与衰老相关的颅内动脉瘤中的关键免疫生物标志物和免疫微环境动态	通过对小鼠脑动脉瘤模型的单细胞测序数据进行分析，识别了重要的免疫细胞亚群及其相互作用，有助于揭示免疫微环境的变化	该研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的临床情况	本研究旨在探讨颅内动脉瘤的免疫微环境及其动态变化	研究对象为小鼠模型中诱导的Willis动脉瘤及其免疫细胞组成	数字病理学	NA	单细胞测序，RNA测序	NA	细胞数据，基因表达数据	97个颅内动脉瘤样本
525	2024-08-04	Unraveling neoantigen-associated genes in bladder cancer: An in-depth analysis employing 101 machine learning algorithms 2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24123 PMID:38189174	研究论文	本研究探讨了与膀胱癌相关的新抗原基因及其对预后的影响	采用101种机器学习算法组合进行全面分析，构建了包含九个基因的预后模型	模型的有效性需要在更大规模和多样化的人群中进一步验证	探索膀胱癌中新抗原相关基因的机制及其对预后的影响	主要研究对象为膀胱癌的相关新抗原基因及其在预后中的作用	机器学习	膀胱癌	单细胞测序与大规模测序	机器学习模型	基因组数据	来自公共数据库的多个样本
526	2024-08-04	PANoptosis-related signature in melanoma: Transcriptomic mapping and clinical prognostication 2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24126 PMID:38189554	研究论文	本研究探讨了PANoptosis在黑色素瘤中的作用及其与临床预后之间的关系	首次将PANoptosis的基因特征与黑色素瘤预后相关联，并建立了预测模型	未明确指出具体的样本来源和数量限制，可能影响结果的普适性	研究PANoptosis在黑色素瘤中的作用及其与免疫治疗反应的关系	黑色素瘤细胞及患者样本	数字病理学	皮肤癌	单细胞转录组分析、机器学习建模	NA	转录组数据	多种患者队列的样本，具体数量未说明
527	2024-08-07	Ferroptosis heterogeneity within the tumor microenvironment revealed a genetic blueprint of breast cancer 2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24142 PMID:38251953	研究论文	本研究通过分析大量RNA和单细胞RNA测序数据，揭示了铁死亡在乳腺癌肿瘤微环境中的异质性及其遗传基础	首次构建了基于铁死亡和浸润免疫细胞的乳腺癌预后模型，并揭示了SLC39A7基因在乳腺癌发病机制中的作用	研究主要基于数据分析，未来需要实验验证结果的可靠性	探索铁死亡与免疫检查点阻断反应在乳腺癌中的关系	乳腺癌患者的肿瘤微环境和铁死亡相关基因	数字病理学	乳腺癌	RNA测序	LASSO回归	RNA	1217个样本，包括1104名乳腺癌患者和113名对照
528	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of biomarker in allergic rhinitis patient undergoing intracervical lymphatic immunotherapy and related pan-cancer analysis 2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24151 PMID:38291708	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了过敏性鼻炎患者在接受宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化，并进行了相关的泛癌分析	首次采用宫颈淋巴免疫治疗（ICLIT）方法，并利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫细胞反应的分子机制	NA	探究过敏性鼻炎患者在接受宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化及其与肿瘤的关联	过敏性鼻炎患者的B细胞及其在宫颈淋巴免疫治疗后的转录组变化	数字病理学	过敏性疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
529	2024-08-07	Tumor markers for lipid metabolism-related genes: Based on small cell lung cancer and bronchial asthma dual analysis 2024-May, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24152 PMID:38293814	研究论文	本研究通过分析小细胞肺癌和哮喘的scRNA-seq数据，探讨了脂质代谢相关基因在哮喘向小细胞肺癌转变中的作用	提出了一个新的脂质代谢相关基因标记，有助于深入理解哮喘向小细胞肺癌发展的机制	研究未直接关注衰老相关的分子改变	旨在开发更准确的预测模型，揭示哮喘与小细胞肺癌之间免疫信号通路的潜在联系	小细胞肺癌和哮喘的脂质代谢相关基因	数字病理学	小细胞肺癌	scRNA-seq	NA	基因表达数据	使用了来自GEO数据库的GSE164404（小细胞肺癌）和GSE145013（严重哮喘）的scRNA-seq数据
530	2024-08-04	Ablation of Brg1 in fibroblast/myofibroblast lineages attenuates renal fibrosis in mice with diabetic nephropathy 2024-May-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2024.122578 PMID:38537899	研究论文	本研究探讨了Brg1在糖尿病肾病小鼠中对肾纤维化的影响	提供了Brg1与成纤维细胞-肌成纤维细胞转化之间的新遗传联系	尚未明确与Brg1相关的所有表观遗传机制	探讨Brg1在糖尿病肾病相关肾纤维化中的作用	C57B6/j小鼠中的成纤维细胞和肌成纤维细胞	数字病理学	糖尿病肾病	定量PCR和西方印迹	NA	基因表达数据	C57B6/j小鼠的样本数量未明确提及
531	2024-08-05	Role of crosstalk between synovial cells and chondrocytes in osteoarthritis (Review) 2024-May, Experimental and therapeutic medicine IF:2.4Q3 DOI:10.3892/etm.2024.12490 PMID:38590580	综述	本文全面探讨了滑膜细胞与软骨细胞在骨关节炎中的相互作用及其机制	本综述更新了单细胞测序技术在研究滑膜与软骨细胞相互作用中的应用	未提及特定实验数据或临床试验的应用	阐明滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用机制	滑膜细胞与软骨细胞在骨关节炎中的相互作用	数字病理学	骨关节炎	单细胞测序	NA	组织学与病理学数据	NA
532	2024-08-07	Specific photoreceptor cell fate pathways are differentially altered in NR2E3-associated diseases 2024-May, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2024.106463 PMID:38485095	研究论文	本研究通过scRNA-seq技术分析野生型和两种Nr2e3基因突变小鼠模型的视网膜，揭示了NR2E3基因在调节光感受器细胞分化中的作用。	发现了先前未报道的产生混合锥细胞的锥途径，这些混合锥细胞同时表达锥和杆相关基因。	NA	解析NR2E3基因在杆和锥转录网络中的精确作用。	NR2E3基因突变相关的视网膜疾病。	数字病理学	视网膜疾病	scRNA-seq	NA	基因表达数据	野生型和两种Nr2e3基因突变小鼠模型的视网膜样本
533	2024-08-04	Perturbed liver gene zonation in a mouse model of non-alcoholic steatohepatitis 2024-May, Metabolism: clinical and experimental DOI:10.1016/j.metabol.2024.155830 PMID:38428673	研究论文	本研究探讨了非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型中肝脏基因分区的扰动	揭示了Wnt信号通路在小鼠NASH模型中如何影响肝脏基因分区的变化	研究未能探讨RSPO3过表达或Rspo3敲低对NASH病理的影响	研究非酒精性脂肪性肝炎中的肝脏基因分区及其调节机制	小鼠模型中的非酒精性脂肪性肝炎	数字病理学	非酒精性脂肪性肝炎	空间转录组学、bulk RNAseq、原位杂交	NA	基因表达数据	NA
534	2024-08-07	Cellular and molecular characteristics of stromal Lkb1 deficiency-induced gastrointestinal polyposis based on single-cell RNA sequencing 2024-05, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6259 PMID:38389501	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和基于成像的谱系追踪，探讨了与Peutz-Jeghers综合征相关的胃肠道息肉的细胞复杂性。	本研究揭示了Lkb1相关息肉的异常干细胞样特征，并识别了Spp1-Cd44或Spp1-Itga8/Itgb1轴在息肉中的重要相互作用。	NA	研究Lkb1缺乏引起的胃肠道息肉的细胞和分子特征。	Lkb1;Myh11-Cre/ERT2和Lkb1;PDGFRα-Cre/ERT2小鼠模型中的胃肠道息肉。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	Lkb1;Myh11-Cre/ERT2和Lkb1;PDGFRα-Cre/ERT2小鼠模型
535	2024-08-07	Nfe2l3 promotes neuroprotection and long-distance axon regeneration after injury in vivo 2024-May, Experimental neurology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114741 PMID:38395216	研究论文	研究探讨了Nfe2l3基因在中枢神经系统（CNS）损伤后的神经保护和轴突再生中的作用	首次揭示了Nfe2l3在神经保护和轴突再生中的作用，并展示了其作为治疗CNS损伤和疾病的潜在疗法	NA	研究Nfe2l3在CNS损伤后的神经保护和轴突再生中的功能	Nfe2l3基因在皮质和视网膜神经节细胞（RGC）中的表达及其在CNS损伤后的作用	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	皮质和视网膜神经节细胞（RGC）
536	2024-08-04	CCNA2 and NEK2 regulate glioblastoma progression by targeting the cell cycle 2024-May, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2024.14339 PMID:38516683	研究论文	该研究旨在探究CCNA2和NEK2在胶质母细胞瘤中的分子机制	首次系统阐明CCNA2和NEK2在胶质母细胞瘤进展中的作用，并建立了生存预测的诺模图	目前研究中并未明确说明样本量和不同亚类型的详细数据	探讨CCNA2和NEK2在胶质母细胞瘤中的特定功能和分子机制	胶质母细胞瘤中CCNA2和NEK2的表达及其预后	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞测序、西方印迹法和免疫组化染色	NA	基因表达数据	NA
537	2024-08-04	Machine learning combined with single-cell analysis reveals predictive capacity and immunotherapy response of T cell exhaustion-associated lncRNAs in uterine corpus endometrial carcinoma 2024-05, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111077 PMID:38311301	研究论文	本研究建立了与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 在子宫体内膜癌中的预测模型并研究了其免疫特征	首次探讨了与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 在子宫体内膜癌中的作用，并建立了相关的预测模型	研究主要基于公共数据库的数据，可能存在信息的偏倚和不足	建立与子宫体内膜癌 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 的预测模型	与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA	数字病理学	子宫体内膜癌	转录组和单细胞测序	逻辑回归模型	基因表达数据	使用癌症基因组图谱和基因表达综合数据库中的数据，具体样本数量未提及
538	2024-08-07	Multi-omics reveals the switch role of abnormal methylation in the regulation of decidual macrophages function in recurrent spontaneous abortion 2024-05, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111071 PMID:38295895	研究论文	本文通过整合转录组学、DNA甲基化组学和单细胞RNA测序，探讨了DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系	首次系统地描绘了异常DNA甲基化在调控蜕膜巨噬细胞功能中的作用，为复发性自然流产的发生机制提供了新的见解	NA	阐明DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系	复发性自然流产中的DNA甲基化和蜕膜细胞功能	数字病理学	生殖系统疾病	转录组学、DNA甲基化组学、单细胞RNA测序	NA	转录组数据、DNA甲基化数据、单细胞RNA测序数据	涉及22个低甲基化的CpG位点和16个关键通路
539	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals the MIF-ACKR3 receptor-ligand interaction between iCAFs and tumor cells in esophageal squamous cell carcinoma 2024-05, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111093 PMID:38336189	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了食管鳞状细胞癌（ESCC）样本，揭示了肿瘤微环境中iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3受体-配体相互作用。	本研究首次在ESCC中发现并验证了iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3相互作用，并揭示了其在肿瘤细胞迁移和侵袭中的作用。	研究主要基于GEO数据库中的ESCC样本进行单细胞RNA测序分析，可能存在样本选择偏倚。	深入理解食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境异质性，并识别新的治疗靶点。	食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤微环境及其细胞间的相互作用。	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	31,283个单细胞
540	2024-08-07	Image-activated pico-injection for single-cell analysis 2024-May-15, Talanta IF:5.6Q1 DOI:10.1016/j.talanta.2024.125765 PMID:38346358	研究论文	本文介绍了一种名为图像激活皮科注射（imgPico）的新技术，用于在无需标记的情况下，按需向液滴中补充试剂	imgPico技术通过实时图像分析检测目标液滴，并进行针对性的皮科注射，提高了液滴应用中试剂添加的精确性和效率	NA	研究并优化图像激活皮科注射技术，以提高其在单细胞分析中的应用效果	液滴中的单细胞分析	计算机视觉	NA	图像分析	NA	图像	分别包含一个、两个和三个细胞的液滴