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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-08-04 |
TENET: Triple-enhancement based graph neural network for cell-cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics
2024-May-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168543
PMID:38508302
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研究论文 | 本文提出了一种新的图神经网络方法TENET,用于从空间转录组数据重构细胞-细胞相互作用网络 | TENET采用三重增强机制来改善细胞-细胞相互作用网络的重构精度,尤其在稀疏连接和噪声数据的情况下表现出色 | 可能在特定类型的噪声数据或极端稀疏的连接情况下依然存在准确性挑战 | 旨在提升细胞-细胞相互作用网络的重构准确性 | 重构细胞-细胞相互作用网络 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络 | 真实和合成空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 502 | 2024-08-05 |
High-Frequency Spinal Stimulation Suppresses Microglial Kaiso-P2X7 Receptor Axis-Induced Inflammation to Alleviate Neuropathic Pain in Rats
2024-May, Annals of neurology
IF:8.1Q1
DOI:10.1002/ana.26898
PMID:38450773
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研究论文 | 本研究探讨了高频脊髓刺激对神经病理性疼痛的减轻效果及其机制 | 揭示了HF10 SCS通过抑制小胶质细胞的Kaiso-P2X7受体病理轴来减少免疫反应,从而提供持久的疼痛缓解 | 仅在动物模型中进行试验,尚需在人类临床研究中验证结果 | 探讨10kHz HF SCS在疼痛缓解中的作用机制 | 以神经病理性疼痛大鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用大鼠模型进行测试,具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 503 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic landscape of peripheral blood cells provides insights into adaptation of red-eared sliders (Trachemys scripta elegans)
2024-May, Integrative zoology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/1749-4877.12725
PMID:37226359
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研究论文 | 本研究描绘了红耳龟外周血细胞的单细胞转录组图谱,探讨了其环境适应机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术对红耳龟外周血细胞进行转录组分析,发现新的免疫信号类型 | 目前的研究主要集中在外周血细胞的转录组分析,未深入探讨其功能和机制 | 研究红耳龟在环境压力下的适应机制,主要通过血液学角度进行探索 | 红耳龟外周血细胞的多种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 504 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing unveils T-cell characteristic in acute myeloid leukemia
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111927
PMID:38555820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性髓性白血病中T细胞的特征 | 文章创新性地分析了急性髓性白血病患者的T细胞亚群,特别是CD4+和CD8+ T细胞的组成变化 | 本研究的样本数量有限,可能影响结果的普遍适用性 | 探讨不同T细胞亚型在急性髓性白血病免疫失调中的作用 | 来自三名急性髓性白血病患者的骨髓样本中的T细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三名急性髓性白血病患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 505 | 2024-08-04 |
Differences in nature killer cell response and interference with mitochondrial DNA induced apoptosis in moxifloxacin environment
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111970
PMID:38608472
|
研究论文 | 本文研究了环境中莫西沙星对自然杀伤细胞反应的影响及其对线粒体DNA诱导的凋亡的干扰 | 揭示了莫西沙星环境中NK细胞的新亚群体及其激活反应机制 | 样本量较小,仅来自3名健康成人 | 探索莫西沙星对NK细胞的免疫调节作用及其机制 | 健康成年人外周血单核细胞(PBMC) | 免疫学 | NA | 单细胞测序和流式细胞术 | NA | 细胞样本 | 3名健康成年人 | NA | NA | NA | NA |
| 506 | 2024-08-05 |
Identification and validation of regulatory T cell-associated gene signatures to predict colon adenocarcinoma prognosis
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112034
PMID:38588631
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞相关基因特征在预测结肠腺癌预后中的作用 | 创新点在于建立了Tregs相关风险评分,并验证了其在结肠腺癌预后中的预测能力 | 本研究的局限性在于样本主要来源于TCGA数据集,可能存在选择偏倚 | 研究调节性T细胞在结肠腺癌预后中的重要性,以及寻找潜在的生物标志物 | 研究对象为结肠腺癌患者的临床信息、RNA-seq数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA-seq, qPCR | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA数据集中的结肠腺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 507 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell-cell communication and potential biomarker in sepsis and septic shock patients
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111938
PMID:38593502
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症与脓毒性休克患者的细胞间通信及潜在生物标志物 | 研究首次识别了脓毒症单核细胞中的Resistin信号通路和脓毒性休克单核细胞中的IL16信号,证明了这两个分子可能作为脓毒症和脓毒性休克的潜在诊断标志物 | 研究仅在鼠模型中进行了验证,尚需更大规模的人体临床数据支持 | 旨在识别脓毒症和脓毒性休克的潜在生物标志物 | 健康个体、脓毒症和脓毒性休克患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及健康个体与脓毒症、脓毒性休克患者的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 508 | 2024-08-05 |
Prognostic and immunological implications of glutathione metabolism genes in lung adenocarcinoma: A focus on the core gene SMS and its impact on M2 macrophage polarization
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111940
PMID:38593503
|
研究论文 | 该研究探讨了谷胱甘肽代谢基因在肺腺癌中的预后和免疫环境的作用。 | 提出了一个包含七个谷胱甘肽代谢基因的风险特征模型,并发现核心基因SMS与M2巨噬细胞极化相关。 | 本文对谷胱甘肽代谢在肺腺癌中的角色缺乏全面的研究,可能导致结论的局限性。 | 研究谷胱甘肽代谢基因与肺腺癌患者预后和免疫微环境之间的关系。 | 肺腺癌患者,分为高风险和低风险组进行分析。 | 数字病理学 | 肺癌 | Lasso结合Cox回归,单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了六个GEO数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 509 | 2024-08-05 |
Revealing the pathogenesis of keloids based on the status: Active vs inactive
2024-May, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15088
PMID:38685820
|
研究论文 | 本研究分析了活跃与非活跃瘢痕疙瘩的转录组特征。 | 首次将瘢痕疙瘩的活动状态纳入转录组分析,揭示了活跃瘢痕疙瘩中促炎性成纤维细胞的显著增加。 | 研究仅限于上胸部或背部的瘢痕疙瘩样本,可能影响结果的广泛适用性。 | 旨在探究不同活动状态瘢痕疙瘩的病理机制。 | 选取了活跃和非活跃的瘢痕疙瘩、成熟瘢痕及正常瘢痕样本。 | 数字病理 | 疤痕疙瘩 | 单细胞RNA测序和多重免疫荧光 | NA | 组织样本 | 使用了活跃和非活跃的瘢痕疙瘩、成熟瘢痕和正常瘢痕样本 | NA | NA | NA | NA |
| 510 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell dysfunction in the peripheral blood of patients with highly aggressive gastric cancer
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13591
PMID:38319150
|
研究论文 | 本研究采用单细胞RNA测序揭示了高度侵袭性胃癌患者外周血中免疫细胞的功能障碍 | 首次通过单细胞RNA测序展示了HAGC患者外周血单核细胞的显著变化,特别是嗜中性粒细胞的成熟度及其对T细胞的抑制作用 | 研究样本量较小,仅包括18名患者,可能限制了结果的普遍适用性 | 这个研究旨在揭示高度侵袭性胃癌患者的免疫反应 | 研究对象包括七名HAGC患者、六名正常晚期胃癌患者及五名健康个体 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 共18个样本,其中包括7名HAGC患者、6名正常晚期胃癌患者和5名健康个体 | NA | NA | NA | NA |
| 511 | 2024-08-05 |
Comprehensive profiling of endocrine metabolism identifies a novel signature with robust predictive value in ovarian cancer
2024-May, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3686
PMID:38689382
|
研究论文 | 本研究通过综合剖析内分泌代谢,识别出一种在卵巢癌中具有强大预测价值的新特征 | 提出了一种基于分泌信号通路的卵巢癌预后标志物,显示出良好的预后性能 | 未明确提及研究的局限性 | 探讨卵巢癌中内分泌代谢特征与预后的关系 | 卵巢癌患者的基因和免疫细胞的数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 基因数据 | 从TCGA和GEO数据集中提取的卵巢癌数据 | NA | NA | NA | NA |
| 512 | 2024-08-04 |
Identification of eight genes associated with recurrent patellar dislocation
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109697
PMID:38680665
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研究论文 | 本研究首次通过全外显子测序识别与反复髌骨脱臼相关的八个基因 | 识别出CPD基因与反复髌骨脱臼的相关性,提供了全新的视角来理解该疾病 | 研究可能缺乏大样本验证,样本的多样性有待提升 | 识别反复髌骨脱臼的易感基因并探讨其潜在发病机制 | 关注反复髌骨脱臼患者的基因组特征 | NA | NA | 全外显子测序 (WES) | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 513 | 2024-08-05 |
Genetic and Immunological Characterization of Brain Metastases from Solid Cancers
2024-May, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17001
PMID:38677762
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研究论文 | 本研究对来自实体癌症的脑转移瘤进行了遗传和免疫特征的分析 | 通过分析脑转移瘤的肿瘤突变负担和相关免疫基因,确定了新的预后标志物和治疗靶点 | 样本数量较小,仅基于九名癌症患者的肿瘤样本 | 调查脑转移瘤特异性的生物标志物和相关预后因素 | 来自静冈癌症中心九名癌症患者的原发癌和转移癌病变 | 数字病理学 | 脑转移癌症 | 下一代测序,单细胞RNA测序,定量PCR | NA | 基因数据 | 九名癌症患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 514 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling transcriptomic reveals cellular heterogeneity and cellular crosstalk in choroidal neovascularization model
2024-May, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109877
PMID:38537669
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研究论文 | 本文通过单细胞测序探索了脉络膜新生血管化模型中的细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次详细描述了RPE/脉络膜复合体内的细胞多样性和特定细胞类型之间复杂的相互作用 | 研究可能需要更大样本量和长时间跟踪,以充分验证发现的细胞类型及其功能 | 探索与年龄相关性黄斑变性相关的脉络膜新生血管化中的细胞组成和相互作用 | 主要研究脉络膜/视网膜色素上皮复合体中的各种细胞类型,包括内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 515 | 2024-08-04 |
Roxithromycin exposure induces motoneuron malformation and behavioral deficits of zebrafish by interfering with the differentiation of motor neuron progenitor cells
2024-May, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116327
PMID:38626605
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研究论文 | 本研究探讨了罗克沙星(ROX)对斑马鱼运动神经元发育和行为缺陷的影响 | 首次揭示罗克沙星暴露导致斑马鱼运动神经元前体细胞分化受阻 | 研究仅在斑马鱼模型中进行,可能无法完全适用于人类 | 研究罗克沙星早期暴露的发育毒性及其对运动功能的影响 | 使用斑马鱼作为脊椎动物模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 胚胎 | 总样本数为410(n=100,n=100,n=100,n=80,n=30,n=80) | NA | NA | NA | NA |
| 516 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals lung cell fate evolution initiated by smoking to explore gene predictions of correlative diseases
2024-May, Toxicology mechanisms and methods
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15376516.2023.2293117
PMID:38064719
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据揭示了吸烟对肺组织和细胞的影响以及免疫反应的变化 | 揭示了吸烟导致的肺细胞命运演变及新标志基因的筛选 | 尚未全面阐明烟雾成分对肺主要细胞的刺激效应和作用机制 | 探讨吸烟引发的肺细胞命运演变及相关疾病的基因预测 | 从吸烟者和非吸烟者的肺样本中获取单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | UMAP | 转录组数据 | 三份肺样本(吸烟者与非吸烟者) | NA | NA | NA | NA |
| 517 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis extracted CAFs-related genes to established online app to predict clinical outcome and radiotherapy prognosis of prostate cancer
2024-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03348-6
PMID:38070051
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析提取与癌症相关成纤维细胞(CAFs)相关的基因,并建立在线应用程序,用于预测前列腺癌的临床结果和放疗预后 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和差异基因表达分析,识别出与前列腺癌预后相关的CAFs相关基因,并开发了一个在线预测工具 | 本研究主要依赖于公共数据库的数据,未来需要更多临床样本验证模型的准确性 | 旨在通过单细胞分析识别CAFs相关基因,评估其在预测前列腺癌预后和放疗预后中的潜力 | 前列腺癌及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | COX和LASSO分析 | 转录组数据 | 训练集257例,测试集129例,GSE70770集199例,GSE116918集248例 | NA | NA | NA | NA |
| 518 | 2024-08-07 |
Microenvironmental changes in familial adenomatous polyposis during colorectal cancer carcinogenesis
2024-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216822
PMID:38521200
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了家族性腺瘤性息肉病(FAP)患者的正常组织、腺瘤和癌组织的转录组,揭示了FAP在结直肠癌发生过程中的微环境变化 | 首次通过单细胞RNA测序详细分析了FAP患者的微环境变化,并比较了FAP与散发性结直肠癌的微环境差异 | 样本量相对较小,仅包括四名FAP患者和40名散发性结直肠癌患者 | 探究家族性腺瘤性息肉病在结直肠癌发生过程中的微环境变化 | 家族性腺瘤性息肉病患者的正常组织、腺瘤和癌组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 56,225个未分类的单细胞,来自4名FAP患者和26名FAP患者及40名散发性结直肠癌患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 519 | 2024-08-07 |
OH2 oncolytic virus: A novel approach to glioblastoma intervention through direct targeting of tumor cells and augmentation of anti-tumor immune responses
2024-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216834
PMID:38537773
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研究论文 | 本研究介绍了OH2溶瘤病毒,一种源自单纯疱疹病毒2型(HSV-2)的疗法,用于治疗胶质母细胞瘤(GBM),通过直接靶向肿瘤细胞和增强抗肿瘤免疫反应 | OH2溶瘤病毒通过选择性靶向肿瘤细胞复制、诱导细胞毒性DNA损伤应激和激发抗肿瘤免疫反应,显示出显著的抗肿瘤活性 | NA | 探索OH2溶瘤病毒作为胶质母细胞瘤治疗新方法的有效性 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其治疗 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 520 | 2024-08-07 |
Correction: Single-cell RNA sequencing reveals the lineage of malignant epithelial cells and upregulation of TAGLN2 promotes peritoneal metastasis in gastric cancer
2024-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03402-x
PMID:38492153
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |