单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
501	2024-08-05	Modeling acute myocardial infarction and cardiac fibrosis using human induced pluripotent stem cell-derived multi-cellular heart organoids 2024-May-01, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06703-9 PMID:38693114	研究论文	本研究利用人诱导多能干细胞衍生的多细胞心脏类器官建模急性心肌梗死和心脏纤维化	该研究通过生成自组织的心脏类器官，首次将心肌细胞、成纤维细胞和内皮细胞的多细胞组成结合在一起，从而模仿人心脏的细胞组成	该研究可能在细胞模型的完全功能性和长期稳定性方面存在限制	研究旨在创建与临床相关的心脏疾病体外模型，以促进心脏疾病的研究和药物筛选	研究对象为使用人诱导多能干细胞生成的心脏类器官	数字病理学	心脏病	单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术、q-PCR	多细胞模型	细胞和组织样本	NA
502	2024-08-05	Pan-cancer analysis of prognostic and immunological role of IL4I1 in human tumors: a bulk omics research and single cell sequencing validation 2024-May-01, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01000-5 PMID:38691253	研究论文	本研究探讨了IL4I1在多种肿瘤中的预后和免疫学角色	IL4I1被发现与癌症的预后和免疫细胞浸润密切相关，且可能作为新的治疗靶点	研究主要依赖于现有数据库，可能存在数据偏差	探索IL4I1在肿瘤中的表达及其与预后和免疫的关系	IL4I1在多种人类肿瘤中的表达和作用	数字病理学	肿瘤相关疾病	scRNA-seq	NA	基因表达数据	涉及多种肿瘤样本
503	2024-08-04	Exhaled volatolomics profiling facilitates personalized screening for gastric cancer 2024-May-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216881 PMID:38614384	研究论文	本研究建立了一种非侵入性方法，通过呼气挥发物组学和集成学习来检测胃癌	该研究开发了一种基于质谱的程序，筛选出用于区分胃癌与对照组的 biomarkers 面板，并表现出高准确性	未提及具体的局限性	旨在开发一种有效的非侵入性筛查工具用于胃癌的早期检测	研究对象为314个呼吸样本	数字病理学	胃癌	质谱	集成学习	呼吸样本	314个呼吸样本
504	2024-08-04	BMP signaling maintains auricular chondrocyte identity and prevents microtia development by inhibiting protein kinase A 2024-May-01, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.91883 PMID:38690987	研究论文	本文研究BMP信号在维持耳廓软骨细胞身份及防止微小耳畸形发展中的作用	发现BMP-Smad1/5/9信号激活与耳廓软骨细胞再生活性降低相关，提供了微小耳发病机理的新见解	目前对于微小耳发病机制的理解仍不完全，研究可能未能涵盖所有相关基因和路径	探讨BMP信号如何维持耳廓软骨细胞身份以及防止微小耳的发病	研究对象为成人小鼠耳廓软骨细胞以及人类微小耳样本	数字病理学	微小耳畸形	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	成人小鼠耳廓软骨细胞和人类微小耳样本
505	2024-08-05	Acute Lymphoblastic Leukemia with Myeloid Mutations Is a High-Risk Disease Associated with Clonal Hematopoiesis 2024-May-01, Blood cancer discovery IF:11.5Q1 DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0106 PMID:38150184	研究论文	本研究探讨了急性淋巴细胞白血病（ALL）中与骨髓突变相关的克隆性造血的影响	该研究首次揭示了急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的存在及其对预后的影响	本研究的样本量可能不足以全面反映该疾病的所有临床特征	研究急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的作用及其病理机制	成年人急性淋巴细胞白血病患者	数字病理学	急性淋巴细胞白血病	单细胞蛋白基因组分析，单细胞RNA测序	NA	基因组数据	研究涉及的成年ALL案例中，包括TP53突变和骨髓克隆突变的患者
506	2024-08-05	Galectin-3 inhibition ameliorates alveolar epithelial cell pyroptosis in phosgene-induced acute lung injury 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.111965 PMID:38583242	研究论文	本研究探讨了Galectin-3抑制对磷酸酯引发的急性肺损伤中的肺泡上皮细胞焦亡的改善作用	首次提出Galectin-3通过抑制Gal3/caspase-8/GSDMD信号通路来改善肺泡上皮细胞焦亡的机制	该研究主要在小鼠模型中进行，临床应用的转化需要进一步验证	探究Galectin-3在磷酸酯引发的急性肺损伤中的作用及其机制	磷酸酯引发的急性肺损伤模型中的肺泡上皮细胞和肺泡巨噬细胞	数字病理学	急性肺损伤	scRNA-seq	NA	细胞	小鼠模型，未具体说明样本数量
507	2024-08-05	Establishment and validation of a tumor-infiltrating γδT cell related prognostic gene signature in head and neck squamous cell carcinoma 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112054 PMID:38608477	研究论文	本文建立并验证了与肿瘤浸润γδT细胞相关的预后基因特征在头颈部鳞状细胞癌中的应用	首次提出γδT细胞基因特征作为头颈部鳞状细胞癌患者的独立预后指标	本研究仅使用了TCGA HNSCC数据库及100个肿瘤样本，样本数量可能限制了结果的广泛适用性	评估γδT细胞在头颈部鳞状细胞癌中的浸润及其与临床病理因素的关联	头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本和相应的基因特征	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	scRNA-seq	Cox回归模型	基因组数据	100个头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本
508	2024-08-05	CXCR6 defines therapeutic subtypes of CD4+ cytotoxic T cell lineage for adoptive cell transfer therapy in pediatric B cell acute lymphoblastic leukemia 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.111972 PMID:38569429	研究论文	本研究探讨CXCR6作为新生儿B细胞急性淋巴细胞白血病中细胞毒性CD4 T细胞的治疗亚型的作用	提出CXCR6可以作为小儿B-ALL患者骨髓中细胞毒性CD4 Trm细胞的标志	需要更多的临床数据验证CXCR6在其他患者群体中的作用	研究CXCR6在小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者中细胞毒性CD4 T细胞的影响	小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者及健康供体的骨髓和外周血样本	数字病理学	B细胞急性淋巴细胞白血病	流式细胞术 (FCM), 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	集成机器学习算法	血液样本	包括小儿B-ALL患者和健康供体的样本，具体数量未说明
509	2024-08-05	The skin circadian clock gene F3 as a potential marker for psoriasis severity and its bidirectional relationship with IL-17 signaling in keratinocytes 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.111993 PMID:38565044	研究论文	本研究探讨了皮肤生物钟基因F3与牛皮癣严重程度及其与IL-17信号传导之间的双向关系	揭示了皮肤生物钟基因F3与IL-17信号通路之间的双向联系，指出F3可能通过激活JAK-STAT信号在角质形成细胞中引发异常细胞内炎症	关于F3和IL-17信号通路关系的机制需要进一步研究	研究皮肤生物钟基因F3与牛皮癣病理机制之间的关系	牛皮癣病灶与健康对照组	数字病理	牛皮癣	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	生物信息学数据	GSE121212的牛皮癣病灶和健康对照样本，以及多个数据集进行验证
510	2024-08-05	Living in Syn: T Cell Antigen Identification Based on Synapse Sequencing 2024-May-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0239 PMID:38557780	研究论文	本文介绍了一种基于突触测序的T细胞抗原识别新平台Tsyn-seq	提出了一种新的抗原发现平台Tsyn-seq，利用TCR-肽-HLA诱导的突触进行全基因组表位筛选	文章没有提及具体的局限性	研究T细胞抗原的识别机制	聚焦于通过突触测序识别T细胞表位	数字病理	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
511	2024-08-04	TENET: Triple-enhancement based graph neural network for cell-cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics 2024-May-01, Journal of molecular biology IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jmb.2024.168543 PMID:38508302	研究论文	本文提出了一种新的图神经网络方法TENET，用于从空间转录组数据重构细胞-细胞相互作用网络	TENET采用三重增强机制来改善细胞-细胞相互作用网络的重构精度，尤其在稀疏连接和噪声数据的情况下表现出色	可能在特定类型的噪声数据或极端稀疏的连接情况下依然存在准确性挑战	旨在提升细胞-细胞相互作用网络的重构准确性	重构细胞-细胞相互作用网络	数字病理学	NA	空间转录组学	图神经网络	真实和合成空间转录组数据	NA
512	2024-08-05	High-Frequency Spinal Stimulation Suppresses Microglial Kaiso-P2X7 Receptor Axis-Induced Inflammation to Alleviate Neuropathic Pain in Rats 2024-May, Annals of neurology IF:8.1Q1 DOI:10.1002/ana.26898 PMID:38450773	研究论文	本研究探讨了高频脊髓刺激对神经病理性疼痛的减轻效果及其机制	揭示了HF10 SCS通过抑制小胶质细胞的Kaiso-P2X7受体病理轴来减少免疫反应，从而提供持久的疼痛缓解	仅在动物模型中进行试验，尚需在人类临床研究中验证结果	探讨10kHz HF SCS在疼痛缓解中的作用机制	以神经病理性疼痛大鼠模型为研究对象	数字病理学	神经病理性疼痛	RNA测序	NA	生物样本	使用大鼠模型进行测试，具体样本数量未提及
513	2024-08-05	Single-cell transcriptomic landscape of peripheral blood cells provides insights into adaptation of red-eared sliders (Trachemys scripta elegans) 2024-May, Integrative zoology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/1749-4877.12725 PMID:37226359	研究论文	本研究描绘了红耳龟外周血细胞的单细胞转录组图谱，探讨了其环境适应机制	首次使用单细胞RNA测序技术对红耳龟外周血细胞进行转录组分析，发现新的免疫信号类型	目前的研究主要集中在外周血细胞的转录组分析，未深入探讨其功能和机制	研究红耳龟在环境压力下的适应机制，主要通过血液学角度进行探索	红耳龟外周血细胞的多种细胞类型	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
514	2024-08-04	Single-cell sequencing unveils T-cell characteristic in acute myeloid leukemia 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.111927 PMID:38555820	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性髓性白血病中T细胞的特征	文章创新性地分析了急性髓性白血病患者的T细胞亚群，特别是CD4+和CD8+ T细胞的组成变化	本研究的样本数量有限，可能影响结果的普遍适用性	探讨不同T细胞亚型在急性髓性白血病免疫失调中的作用	来自三名急性髓性白血病患者的骨髓样本中的T细胞	数字病理学	急性髓性白血病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	三名急性髓性白血病患者的骨髓样本
515	2024-08-04	Differences in nature killer cell response and interference with mitochondrial DNA induced apoptosis in moxifloxacin environment 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.111970 PMID:38608472	研究论文	本文研究了环境中莫西沙星对自然杀伤细胞反应的影响及其对线粒体DNA诱导的凋亡的干扰	揭示了莫西沙星环境中NK细胞的新亚群体及其激活反应机制	样本量较小，仅来自3名健康成人	探索莫西沙星对NK细胞的免疫调节作用及其机制	健康成年人外周血单核细胞（PBMC）	免疫学	NA	单细胞测序和流式细胞术	NA	细胞样本	3名健康成年人
516	2024-08-05	Identification and validation of regulatory T cell-associated gene signatures to predict colon adenocarcinoma prognosis 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112034 PMID:38588631	研究论文	本研究探讨了调节性T细胞相关基因特征在预测结肠腺癌预后中的作用	创新点在于建立了Tregs相关风险评分，并验证了其在结肠腺癌预后中的预测能力	本研究的局限性在于样本主要来源于TCGA数据集，可能存在选择偏倚	研究调节性T细胞在结肠腺癌预后中的重要性，以及寻找潜在的生物标志物	研究对象为结肠腺癌患者的临床信息、RNA-seq数据和小鼠模型	数字病理学	结肠癌	RNA-seq, qPCR	NA	基因表达数据	使用TCGA数据集中的结肠腺癌患者数据
517	2024-08-05	Single-cell RNA sequencing reveals cell-cell communication and potential biomarker in sepsis and septic shock patients 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.111938 PMID:38593502	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症与脓毒性休克患者的细胞间通信及潜在生物标志物	研究首次识别了脓毒症单核细胞中的Resistin信号通路和脓毒性休克单核细胞中的IL16信号，证明了这两个分子可能作为脓毒症和脓毒性休克的潜在诊断标志物	研究仅在鼠模型中进行了验证，尚需更大规模的人体临床数据支持	旨在识别脓毒症和脓毒性休克的潜在生物标志物	健康个体、脓毒症和脓毒性休克患者的外周血单核细胞	数字病理学	脓毒症	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	涉及健康个体与脓毒症、脓毒性休克患者的外周血单核细胞
518	2024-08-05	Prognostic and immunological implications of glutathione metabolism genes in lung adenocarcinoma: A focus on the core gene SMS and its impact on M2 macrophage polarization 2024-May-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.111940 PMID:38593503	研究论文	该研究探讨了谷胱甘肽代谢基因在肺腺癌中的预后和免疫环境的作用。	提出了一个包含七个谷胱甘肽代谢基因的风险特征模型，并发现核心基因SMS与M2巨噬细胞极化相关。	本文对谷胱甘肽代谢在肺腺癌中的角色缺乏全面的研究，可能导致结论的局限性。	研究谷胱甘肽代谢基因与肺腺癌患者预后和免疫微环境之间的关系。	肺腺癌患者，分为高风险和低风险组进行分析。	数字病理学	肺癌	Lasso结合Cox回归，单细胞转录组分析	NA	基因表达数据	使用了六个GEO数据集进行验证
519	2024-08-05	Revealing the pathogenesis of keloids based on the status: Active vs inactive 2024-May, Experimental dermatology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/exd.15088 PMID:38685820	研究论文	本研究分析了活跃与非活跃瘢痕疙瘩的转录组特征。	首次将瘢痕疙瘩的活动状态纳入转录组分析，揭示了活跃瘢痕疙瘩中促炎性成纤维细胞的显著增加。	研究仅限于上胸部或背部的瘢痕疙瘩样本，可能影响结果的广泛适用性。	旨在探究不同活动状态瘢痕疙瘩的病理机制。	选取了活跃和非活跃的瘢痕疙瘩、成熟瘢痕及正常瘢痕样本。	数字病理	疤痕疙瘩	单细胞RNA测序和多重免疫荧光	NA	组织样本	使用了活跃和非活跃的瘢痕疙瘩、成熟瘢痕和正常瘢痕样本
520	2024-08-05	Single-cell RNA sequencing reveals immune cell dysfunction in the peripheral blood of patients with highly aggressive gastric cancer 2024-May, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13591 PMID:38319150	研究论文	本研究采用单细胞RNA测序揭示了高度侵袭性胃癌患者外周血中免疫细胞的功能障碍	首次通过单细胞RNA测序展示了HAGC患者外周血单核细胞的显著变化，特别是嗜中性粒细胞的成熟度及其对T细胞的抑制作用	研究样本量较小，仅包括18名患者，可能限制了结果的普遍适用性	这个研究旨在揭示高度侵袭性胃癌患者的免疫反应	研究对象包括七名HAGC患者、六名正常晚期胃癌患者及五名健康个体	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	共18个样本，其中包括7名HAGC患者、6名正常晚期胃癌患者和5名健康个体