单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 539 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a signature based on myofibroblastic cancer-associated fibroblast marker genes for predicting prognosis, immune infiltration, and therapeutic response in bladder cancer
2024-May, Investigative and clinical urology
IF:2.5Q2
DOI:10.4111/icu.20230300
PMID:38714517
|
研究论文 | 本研究探讨了用于预测膀胱癌预后、免疫浸润和治疗反应的肌成纤维癌相关成纤维细胞标记基因的特征。 | 本研究构建了一个基于两个基因(COL6A1和MAP1B)的风险特征，为膀胱癌患者提供了新的治疗靶点。 | 本研究在样本选择和数据分析上可能存在一定的局限性，未详细讨论如何克服这些局限。 | 研究目的在于探索膀胱癌患者临床诊断和治疗中的myCAF标记基因生物标志物。 | 研究对象为膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据和临床数据。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因组学 | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2024-08-05 |
Shared and Compartment-Specific Processes in Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus During Intervertebral Disc Degeneration
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309032
PMID:38403470
|
研究论文 | 本研究揭示了在椎间盘退化过程中，细胞群体的共享与特定过程。 | 该论文首次识别了退化中椎间盘各特定细胞群体的机制与分子，提供了更精确的IDD预防和治疗靶点。 | 具体样本来源及数量在研究中没有详细阐述。 | 研究椎间盘退化中细胞群体如何促使发病与进展。 | 对人类健康与病变椎间盘的环状纤维与髓核进行单细胞RNA测序分析。 | 数字病理学 | 椎间盘退化 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 共计70,000多个细胞样本，其中AF为26,983和19,978个细胞，NP为24,489和20,884个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 483 | 2024-08-04 |
Airway injury induces alveolar epithelial and mesenchymal responses mediated by macrophages
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.02.587596
PMID:38617297
|
研究论文 | 急性气道损伤激活局部前体细胞并刺激细胞间相互作用的变化以恢复稳态 | 本研究揭示了气道损伤对远端肺部反应的影响，特别是通过巨噬细胞介导的AT2前体细胞的增殖以及MANC2细胞的动态变化 | 未涉及更广泛的临床应用和长期效应的探讨 | 研究气道急性损伤后的肺组织反应及其细胞间相互作用变化 | 小鼠模型，重点关注气道特异性上皮损伤后的肺泡和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 484 | 2024-08-04 |
Nitrogen sensing and regulatory networks: it's about time and space
2024-May-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae038
PMID:38366121
|
综述 | 本文探讨了植物对氮信号的感知与调控网络的时间和空间维度 | 揭示了氮感知/信号传导的时空系统生物学新方面，特别是在拟南芥模型中的应用 | 主要集中在拟南芥模型上，可能限制结果的普遍适用性 | 研究植物如何在不同细胞类型及长距离上整合氮的响应以确保实时协调 | 主要研究对象为植物，尤其是拟南芥中的氮感知和信号传导机制 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序、轨迹推断、伪时间分析、机器学习 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 485 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Identifies NOTCH3-Mediated Interactions between Stromal Cells That Promote Microenvironment Remodeling and Invasion in Lung Adenocarcinoma
2024-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1183
PMID:38335304
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了NOTCH3介导的间质细胞间相互作用在肺腺癌中的作用 | 首次揭示了NOTCH信号在肿瘤微环境重塑和细胞侵袭中的作用 | 尚未明确NOTCH3信号靶向治疗的临床应用前景 | 深入理解肺腺癌中的间质生物学 | 9名未接受治疗的肺腺癌患者的256,379个细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自9名患者的256,379个细胞，包括13,857个间充质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-08-05 |
919 granules improve postpartum depression through the regulation of abnormal peripheral blood IL-1β
2024-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2024.116623
PMID:38643545
|
研究论文 | 该文探讨919颗粒通过调节异常外周血IL-1β来改善产后抑郁症 | 首次揭示了产后抑郁症患者外周血cDC2和增殖B细胞的比例升高与IL-1β的显著相关性 | 研究中未提及样本的多样性和长期疗效验证 | 研究产后抑郁症的发病机制及919颗粒的治疗效果 | 健康产后女性和产后抑郁症患者的外周血样本 | 数字病理 | 产后抑郁症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 动物模型 | 外周血样本 | 健康产后女性与产后抑郁症患者的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 487 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to elucidate the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and cancer cells in hepatocellular carcinoma with spleen-deficiency syndrome
2024-May, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2023.11.008
PMID:38707923
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）合并脾虚综合征（SDS）中癌症相关成纤维细胞（CAFs）与癌细胞之间的相互作用 | 揭示了CAFs与癌细胞之间的交互在SDS中促进肿瘤发展，并确认了PDGF信号通路在此过程中的重要作用 | 本研究主要基于小鼠模型，临床应用和人类数据的验证需进一步研究 | 研究脾虚综合征下肝细胞癌中细胞间的相互作用 | 主要研究对象为肝细胞癌细胞及其相关的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞转录组学与空间转录组学 | NA | 基因组数据 | 建立了以HCC-SDS小鼠为模型共29个细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 488 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals 2D cytokine assay can model atopic dermatitis more accurately than immune-competent 3D setup
2024-May, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15077
PMID:38711200
|
研究论文 | 本研究探讨了不同体外模型对特应性皮炎（AD）模拟的准确性。 | 首次使用单细胞RNA测序数据比较了2D和3D细胞培养在模拟AD方面的效果。 | 未能研究Th2细胞对模型AD的影响，且仅基于特定细胞类型的研究，结果可能有限。 | 理解特应性皮炎的病理生理，并识别新的治疗方法。 | 使用原代成纤维细胞和角质形成细胞进行的体外模型实验。 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 2D/3D细胞培养 | 基因表达数据 | 使用来自临床研究的皮肤活检的单细胞RNA测序数据和健康与AD供体的已发布数据 | NA | NA | NA | NA |
| 489 | 2024-08-05 |
Deciphering Müller cell heterogeneity signatures in diabetic retinopathy across species: an integrative single-cell analysis
2024-May-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01847-y
PMID:38698486
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析阐明了糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的复杂特征 | 首次揭示了不同物种中穆勒细胞的异质性及其在糖尿病视网膜病变中的作用 | 未明确提到该研究的局限性 | 深入理解糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的细胞机制 | 糖尿病视网膜病变中的穆勒细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了斯普拉吉-道利大鼠模型和人类患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 490 | 2024-08-04 |
A cuproptosis-related signature predicts prognosis and indicates cross-talk with immunocyte in ovarian cancer
2024-May-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00981-7
PMID:38696071
|
研究论文 | 本文构建了一个新的与铜死亡相关的基因特征，具有良好的预后能力，以评估卵巢癌患者的结果 | 建立了与铜死亡相关的预后模型，并发现了其与免疫细胞的交互作用和化疗反应的关系 | 本研究主要依赖于TCGA和GEO数据库，可能存在数据偏差问题 | 研究铜死亡与卵巢癌进展之间的关系 | 卵巢癌患者的基因组数据和细胞实验 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因组数据 | TCGA中583名卵巢癌患者和GEO中260名卵巢癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2024-08-05 |
Development of an Automated Morphometric Approach to Assess Vascular Outcomes following Exposure to Environmental Chemicals in Zebrafish
2024-May, Environmental health perspectives
IF:10.1Q1
DOI:10.1289/EHP13214
PMID:38701112
|
研究论文 | 本文开发了一种自动化形态度量方法来评估环境化学物质对血管的影响 | 提出了一个基于深度学习的定量框架ECA-ResXUnet，用于自动分割血管网和提取特征 | 对环境化学物质对血管的影响研究还不够全面 | 研究环境化学物质对血管形态的影响并开发评估方法 | Tg(fli1a:eGFP)斑马鱼胚胎作为实验对象 | 数字病理学 | NA | 高含量成像平台和单细胞RNA测序 | ECA-ResXUnet | 图像 | 对150种环境化学物质处理的斑马鱼幼体进行了评估 | NA | NA | NA | NA |
| 492 | 2024-08-05 |
Pan-cancer analysis of prognostic and immunological role of IL4I1 in human tumors: a bulk omics research and single cell sequencing validation
2024-May-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01000-5
PMID:38691253
|
研究论文 | 本研究探讨了IL4I1在多种肿瘤中的预后和免疫学角色 | IL4I1被发现与癌症的预后和免疫细胞浸润密切相关，且可能作为新的治疗靶点 | 研究主要依赖于现有数据库，可能存在数据偏差 | 探索IL4I1在肿瘤中的表达及其与预后和免疫的关系 | IL4I1在多种人类肿瘤中的表达和作用 | 数字病理学 | 肿瘤相关疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 493 | 2024-08-04 |
Exhaled volatolomics profiling facilitates personalized screening for gastric cancer
2024-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216881
PMID:38614384
|
研究论文 | 本研究建立了一种非侵入性方法，通过呼气挥发物组学和集成学习来检测胃癌 | 该研究开发了一种基于质谱的程序，筛选出用于区分胃癌与对照组的 biomarkers 面板，并表现出高准确性 | 未提及具体的局限性 | 旨在开发一种有效的非侵入性筛查工具用于胃癌的早期检测 | 研究对象为314个呼吸样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 质谱 | 集成学习 | 呼吸样本 | 314个呼吸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 494 | 2024-08-04 |
BMP signaling maintains auricular chondrocyte identity and prevents microtia development by inhibiting protein kinase A
2024-May-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91883
PMID:38690987
|
研究论文 | 本文研究BMP信号在维持耳廓软骨细胞身份及防止微小耳畸形发展中的作用 | 发现BMP-Smad1/5/9信号激活与耳廓软骨细胞再生活性降低相关，提供了微小耳发病机理的新见解 | 目前对于微小耳发病机制的理解仍不完全，研究可能未能涵盖所有相关基因和路径 | 探讨BMP信号如何维持耳廓软骨细胞身份以及防止微小耳的发病 | 研究对象为成人小鼠耳廓软骨细胞以及人类微小耳样本 | 数字病理学 | 微小耳畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成人小鼠耳廓软骨细胞和人类微小耳样本 | NA | NA | NA | NA |
| 495 | 2024-08-05 |
Acute Lymphoblastic Leukemia with Myeloid Mutations Is a High-Risk Disease Associated with Clonal Hematopoiesis
2024-May-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0106
PMID:38150184
|
研究论文 | 本研究探讨了急性淋巴细胞白血病（ALL）中与骨髓突变相关的克隆性造血的影响 | 该研究首次揭示了急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的存在及其对预后的影响 | 本研究的样本量可能不足以全面反映该疾病的所有临床特征 | 研究急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的作用及其病理机制 | 成年人急性淋巴细胞白血病患者 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞蛋白基因组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 研究涉及的成年ALL案例中，包括TP53突变和骨髓克隆突变的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 496 | 2024-08-05 |
Galectin-3 inhibition ameliorates alveolar epithelial cell pyroptosis in phosgene-induced acute lung injury
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111965
PMID:38583242
|
研究论文 | 本研究探讨了Galectin-3抑制对磷酸酯引发的急性肺损伤中的肺泡上皮细胞焦亡的改善作用 | 首次提出Galectin-3通过抑制Gal3/caspase-8/GSDMD信号通路来改善肺泡上皮细胞焦亡的机制 | 该研究主要在小鼠模型中进行，临床应用的转化需要进一步验证 | 探究Galectin-3在磷酸酯引发的急性肺损伤中的作用及其机制 | 磷酸酯引发的急性肺损伤模型中的肺泡上皮细胞和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 小鼠模型，未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 497 | 2024-08-05 |
Establishment and validation of a tumor-infiltrating γδT cell related prognostic gene signature in head and neck squamous cell carcinoma
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112054
PMID:38608477
|
研究论文 | 本文建立并验证了与肿瘤浸润γδT细胞相关的预后基因特征在头颈部鳞状细胞癌中的应用 | 首次提出γδT细胞基因特征作为头颈部鳞状细胞癌患者的独立预后指标 | 本研究仅使用了TCGA HNSCC数据库及100个肿瘤样本，样本数量可能限制了结果的广泛适用性 | 评估γδT细胞在头颈部鳞状细胞癌中的浸润及其与临床病理因素的关联 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本和相应的基因特征 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因组数据 | 100个头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-08-05 |
CXCR6 defines therapeutic subtypes of CD4+ cytotoxic T cell lineage for adoptive cell transfer therapy in pediatric B cell acute lymphoblastic leukemia
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111972
PMID:38569429
|
研究论文 | 本研究探讨CXCR6作为新生儿B细胞急性淋巴细胞白血病中细胞毒性CD4 T细胞的治疗亚型的作用 | 提出CXCR6可以作为小儿B-ALL患者骨髓中细胞毒性CD4 Trm细胞的标志 | 需要更多的临床数据验证CXCR6在其他患者群体中的作用 | 研究CXCR6在小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者中细胞毒性CD4 T细胞的影响 | 小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者及健康供体的骨髓和外周血样本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 流式细胞术 (FCM), 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 集成机器学习算法 | 血液样本 | 包括小儿B-ALL患者和健康供体的样本，具体数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 499 | 2024-08-05 |
The skin circadian clock gene F3 as a potential marker for psoriasis severity and its bidirectional relationship with IL-17 signaling in keratinocytes
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111993
PMID:38565044
|
研究论文 | 本研究探讨了皮肤生物钟基因F3与牛皮癣严重程度及其与IL-17信号传导之间的双向关系 | 揭示了皮肤生物钟基因F3与IL-17信号通路之间的双向联系，指出F3可能通过激活JAK-STAT信号在角质形成细胞中引发异常细胞内炎症 | 关于F3和IL-17信号通路关系的机制需要进一步研究 | 研究皮肤生物钟基因F3与牛皮癣病理机制之间的关系 | 牛皮癣病灶与健康对照组 | 数字病理 | 牛皮癣 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 生物信息学数据 | GSE121212的牛皮癣病灶和健康对照样本，以及多个数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2024-08-05 |
Living in Syn: T Cell Antigen Identification Based on Synapse Sequencing
2024-May-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0239
PMID:38557780
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于突触测序的T细胞抗原识别新平台Tsyn-seq | 提出了一种新的抗原发现平台Tsyn-seq，利用TCR-肽-HLA诱导的突触进行全基因组表位筛选 | 文章没有提及具体的局限性 | 研究T细胞抗原的识别机制 | 聚焦于通过突触测序识别T细胞表位 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |