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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-04 |
Time-course RNAseq data of murine AB1 mesothelioma and Renca renal cancer following immune checkpoint therapy
2024-May-03, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03294-0
PMID:38702329
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研究论文 | 本研究提供了小鼠AB1间皮瘤和Renca肾癌在免疫检查点治疗下的RNA测序数据 | 本研究通过时间序列RNA测序和单细胞测序技术,首次全面表征了免疫微环境中转录事件及其对ICB响应的重要性 | 该研究主要集中于小鼠模型,可能无法完全反映人类肿瘤的复杂性 | 本研究旨在通过RNA测序数据,揭示免疫检查点治疗对肿瘤微环境转录特征的影响 | 研究对象包括小鼠模型的AB1间皮瘤和Renca肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | RNAseq数据 | 144个肿瘤样本和12个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-08-04 |
New genetic insights into immunotherapy outcomes in gastric cancer via single-cell RNA sequencing and random forest model
2024-May-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03684-8
PMID:38693422
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序及随机森林模型,探索胃癌免疫治疗结果的新遗传学见解 | 使用单细胞测序识别基因并开发随机森林模型来预测胃癌患者的免疫治疗敏感性 | 该研究的具体样本数量及相应的临床数据未详细说明 | 旨在识别胃癌患者对免疫治疗的敏感性新生物标志物 | 胃癌患者的基因表达及其与免疫治疗敏感性的相关性 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机森林模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-08-04 |
Neuroinflammation generated by HIV-infected microglia promotes dysfunction and death of neurons in human brain organoids
2024-May, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgae179
PMID:38737767
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研究论文 | 本文研究了HIV感染的微胶质细胞如何促进神经元功能障碍和死亡的机制 | 提出HIV感染导致微胶质细胞产生的炎症反应可扩展到多个未感染的旁观者细胞,最终影响神经元功能 | 本研究主要依赖于体外模型,尚需在更复杂的生物系统中验证结果 | 探讨HIV感染微胶质细胞后,神经炎症与神经元功能障碍之间的关联 | 使用人类诱导多能干细胞来源的脑类器官模型进行研究 | 数字病理学 | HIV相关神经认知障碍 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | 使用了两种不同的脑类器官模型(大脑和脉络丛类器官) | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-08-05 |
Characterization of Th17 tissue-resident memory cells in non-inflamed intestinal tissue of Crohn's disease patients
2024-May, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103206
PMID:38554656
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研究论文 | 本文研究了克罗恩病患者小肠中Th17组织驻留记忆细胞的特征及其与免疫细胞的相互作用 | 首次详细描述了克罗恩病小肠中Th17 Trm细胞的转录组特征及其功能特性 | 样本量相对较小,仅包括七名克罗恩病患者和四名对照患者 | 探索克罗恩病患者的小肠中Th17 Trm细胞的特征及其在疾病中的作用 | 七名克罗恩病患者及四名溃疡性结肠炎患者作为对照 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序 | NA | 组织样本 | 七名克罗恩病患者和四名溃疡性结肠炎患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-08-04 |
A time-resolved multi-omics atlas of transcriptional regulation in response to high-altitude hypoxia across whole-body tissues
2024-May-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48261-w
PMID:38730227
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研究论文 | 本研究探讨了高海拔缺氧对整体生理调节的转录调控机制 | 通过生成多组学数据,揭示了不同组织对缺氧的转录响应及调控基因 | 研究主要基于绵羊模型,可能不完全适用于其他物种 | 澄清高海拔缺氧适应过程中的遗传机制 | 使用绵羊作为模型动物研究多组织的转录变化 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序,RNA-Seq,ATAC-Seq,单细胞RNA-Seq | NA | 基因组数据,转录组数据,表型数据 | 20个生物指标的表型数据 | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis of decidual immune cell landscape in the occurrence of adverse pregnancy outcomes induced by Toxoplasma gondii infection
2024-May-10, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-024-06266-w
PMID:38730500
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了Toxoplasma gondii感染下的母体-胎儿微环境中蜕膜免疫细胞的变化 | 首次揭示了在T. gondii感染后蜕膜免疫细胞中一些未知分子的变化 | 尚未探讨感染的具体机制和细胞间相互作用 | 研究T. gondii感染对母体-胎儿微环境中的蜕膜免疫细胞的影响 | 人类蜕膜免疫细胞 | 数字病理学 | 孕产相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-08-05 |
An atlas of spider development at single-cell resolution provides new insights into arthropod embryogenesis
2024-May-10, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-024-00224-4
PMID:38730509
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研究论文 | 本研究创建了一个蛛形纲动物发育单细胞解析图谱,为节肢动物胚胎发生提供新见解 | 首次对家蜘蛛的胚胎进行单细胞RNA测序,识别了20个细胞簇及其基因表达特征 | 尚未探讨所有基因的功能,可能无法全面反映细胞的所有命运 | 研究蜘蛛胚胎的细胞组成及其基因表达 | 常见家蜘蛛Parasteatoda tepidariorum的胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18500个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis defines highly specific leukemia-induced neutrophils and links MMP8 expression to recruitment of tumor associated neutrophils during FGFR1 driven leukemogenesis
2024-May-10, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00514-6
PMID:38730491
|
研究论文 | 该文章定义了特异性的白血病诱导中性粒细胞,并将MMP8表达与肿瘤相关中性粒细胞的招募联系起来 | 研究识别出基于独特基因表达谱的特定白血病响应中性粒细胞亚群,并探讨了MMP基因上调在中性粒细胞发育中的重要作用 | 缺乏对其他可能影响中性粒细胞表现的因素的分析 | 研究FGFR1驱动的白血病发病过程中免疫细胞组成的变化 | 小鼠模型中的白血病相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-08-04 |
YBX1 promotes stemness and cisplatin insensitivity in intrahepatic cholangiocarcinoma via the AKT/β-catenin axis
2024-May, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3689
PMID:38676365
|
研究论文 | 本研究探讨了YBX1在肝内胆管癌中的角色及其对干性和顺铂耐药性的影响 | 该研究揭示了YBX1通过调节AKT/β-β-catenin通路促进肝内胆管癌的干性和顺铂耐受性,为改善肝内胆管癌预后提供了新的潜在治疗靶点 | 未提及该研究的具体限制 | 研究YBX1在肝内胆管癌中的作用及其机制 | 肝内胆管癌细胞和临床样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | RNA-seq,肿瘤球和克隆形成实验 | NA | 临床样本,转录组数据 | 三个RNA-seq数据集和多个临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single cell-RNA sequencing and Mendelian randomization identifies lactate dehydrogenase B as a target of melatonin in ischemic stroke
2024-05, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14741
PMID:38702940
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析确定乳酸脱氢酶B作为缺血性中风的靶标 | 研究首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化结合,发现LDHB在缺血性中风中的新作用 | 尚未在大规模样本中验证LDHB作为生物标志物的临床应用 | 探索不同基因表达对缺血性中风的因果作用 | 研究确定的2339个在10个细胞群中表达不同的基因 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据 | 10个细胞群中的2339个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-08-04 |
Exploring the molecular mechanisms and shared gene signatures between celiac disease and ulcerative colitis based on bulk RNA and single-cell sequencing: Experimental verification
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112059
PMID:38615385
|
研究论文 | 本研究探讨了乳糜泻(CeD)和溃疡性结肠炎(UC)之间的分子机制和共享基因特征 | 识别了REG4作为UC和CeD的共享基因,并提出它可能是一个潜在的生物标志物和治疗靶点 | 对疾病病因及免疫病理机制的理解仍不完全 | 进一步阐明UC和CeD之间的关系 | 研究乳糜泻和溃疡性结肠炎的毫无例外的共享基因表达特征 | 数字病理学 | 乳糜泻与溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序与基因表达谱分析 | LASSO分析 | 基因表达数据 | 使用了两个数据库的基因表达数据集,具体样本量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals cell type-specific variation and development in HLA expression of human skin
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112070
PMID:38640716
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研究论文 | 该研究揭示了人类皮肤中HLA基因表达的细胞类型特异性变化与发育过程 | 首次全面分析了皮肤不同细胞类型中HLA基因表达的变异,特别关注了基质细胞的角色 | 研究中对免疫细胞和基质细胞的比较可能存在偏差,且样本量相对较少 | 该研究旨在揭示皮肤不同细胞类型中HLA表达的特征及其在皮肤发育中的动态变化 | 研究对象为人类皮肤中的多个细胞类型,包括正常成人皮肤、胎儿皮肤及毛囊 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涵盖成人和胎儿皮肤样本,及15、17和22孕周的胎儿皮肤 | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-08-04 |
Large-scale deorphanization of Nematostella vectensis neuropeptide G protein-coupled receptors supports the independent expansion of bilaterian and cnidarian peptidergic systems
2024-May-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90674
PMID:38727714
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研究论文 | 本研究对海葵中的神经肽G蛋白偶联受体进行了大规模去孤儿化,揭示了腔肠动物和双侧动物神经肽系统的独立扩展 | 研究发现了31个受体被特定的神经肽激活,并揭示了腔肠动物中神经肽信号传导的独立扩展 | 没有直接的双侧动物神经肽系统的同源性支持 | 探索腔肠动物中神经肽及其受体的扩展 | 海葵中的神经肽及其G蛋白偶联受体 | NA | NA | 药理学筛选 | NA | 单细胞测序数据 | 64个肽,来自33个前体 | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-08-04 |
The role of FERMT2 in the tumor microenvironment and immunotherapy in pan-cancer using comprehensive single-cell and bulk sequencing
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30505
PMID:38726194
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研究论文 | 该文章探讨了FERMT2在肿瘤微环境及免疫治疗中的作用 | 该研究结合单细胞和大规模测序技术,首次全面分析了FERMT2在不同癌症类型中的免疫特征和预后意义 | 研究的具体方法和样本数量在摘要中未提及,可能影响结果的普适性 | 本研究旨在评估FERMT2在肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 研究对象为在肿瘤微环境中表达FERMT2的不同癌症类型的细胞 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞测序、复合免疫荧光染色 | NA | 组织切片数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis for the prognostic and immunological role of CD47: interact with TNFRSF9 inducing CD8 + T cell exhaustion
2024-May-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00951-z
PMID:38720108
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研究论文 | 本研究探讨了CD47在癌症免疫治疗中的作用及其与CD8+ T细胞耗竭的关系 | 揭示了CD47影响多种癌症类型中CD8+ T细胞耗竭的机制,并提出将CD47和TNFRSF9作为免疫治疗的新靶点 | 未详细讨论CD47在不同癌症微环境中的具体作用机制 | 阐明CD47在癌症免疫微环境中的预后和免疫学相关性 | 本研究对象包括多种癌症类型的患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-08-05 |
Transcriptomic imputation of genetic risk variants uncovers novel whole-blood biomarkers of Parkinson's disease
2024-May-08, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-024-00698-y
PMID:38719867
|
研究论文 | 本研究探讨了基因表达特征作为帕金森病生物标志物的潜力 | 发现PATL2基因作为临床和前驱性帕金森病的潜在生物标志物 | 未在不同人群中验证结果的广泛性 | 通过转录组插补发现新的全血生物标志物用于帕金森病 | 转录组插补生成的全血基因表达签名 | 数字病理学 | 帕金森病 | RNA测序 | 随机森林分类器 | 基因表达数据 | 1176个帕金森病患者、254个前驱症状患者和860个健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-08-04 |
Genomic insights into the cellular specialization of predation in raptorial protists
2024-May-07, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01904-2
PMID:38715037
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研究论文 | 本研究探讨了捕食原生动物的细胞特化的基因组机制 | 首次揭示了Haptoria纤毛虫在毒素生成和释放中的基因重复与表达特征 | 对毒素形成和释放的遗传过程的理解仍然有限 | 研究Haptoria纤毛虫的捕食策略及其细胞结构 | 七个Haptoria纤毛虫物种 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | 七个Haptoria纤毛虫物种 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-08-05 |
Single-cell senescence identification reveals senescence heterogeneity, trajectory, and modulators
2024-May-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.03.009
PMID:38604170
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研究论文 | 本文介绍了一种机器学习程序SenCID,用于准确识别衰老细胞 | SenCID能够识别不同的衰老身份,并重建衰老轨迹,揭示了衰老调节因子的层级结构 | 未提及具体的限制 | 研究细胞衰老及其异质性 | 602个样本来自52个衰老转录组数据集 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | 转录组测序 | 机器学习模型 | 文本数据 | 602个样本,涉及30种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-08-04 |
Catalytic Nanodots-Driven Pyroptosis Suppression in Nucleus Pulposus for Antioxidant Intervention of Intervertebral Disc Degeneration
2024-May, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202313248
PMID:38299823
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研究论文 | 本研究开发了碳化锰纳米点(MCDs)作为抗氧化剂,以抑制髓核细胞的焦亡,从而有效缓解椎间盘退变。 | 该研究首次使用碳化锰纳米点作为ROS清除催化生物材料,展示了其在抑制焦亡和缓解椎间盘退变中的优越效果。 | 该研究的局限性可能包括小鼠模型的适用性和长期效果需进一步验证。 | 研究的目的是开发一种新的抗氧化干预措施,以抑制椎间盘退变中的焦亡。 | 研究对象为椎间盘退变相关的髓核细胞。 | 数字病理 | 椎间盘退变 | 催化干预 | 小鼠模型 | 生物材料和生物化学数据 | 使用了多种小鼠样本进行体内评估 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-08-05 |
Identification of a novel ADCC-related gene signature for predicting the prognosis and therapy response in lung adenocarcinoma
2024-May, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01871-y
PMID:38507067
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研究论文 | 该研究识别了一种新的ADCC相关基因特征,预测肺腺癌的预后和治疗反应 | 首次系统编制ADCC相关基因创建预后标志,并展示了其在多组患者中的有效性 | 可能未对所有潜在的ADCC相关基因进行全面考察,且外部验证需要进一步研究 | 旨在通过ADCC相关基因特征提高肺腺癌患者的预后预测和治疗反应评估 | 包括1564例肺腺癌患者以及其他多种癌症类型的总共5000多名患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 机器学习 | 集成机器学习方法 | 基因组数据、单细胞数据 | 1564名肺腺癌患者,2057名非小细胞肺癌患者,以及5000多名其他癌症患者 | NA | NA | NA | NA |