单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 544 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-04 |
Exploring the molecular mechanisms and shared gene signatures between celiac disease and ulcerative colitis based on bulk RNA and single-cell sequencing: Experimental verification
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112059
PMID:38615385
|
研究论文 | 本研究探讨了乳糜泻（CeD）和溃疡性结肠炎（UC）之间的分子机制和共享基因特征 | 识别了REG4作为UC和CeD的共享基因，并提出它可能是一个潜在的生物标志物和治疗靶点 | 对疾病病因及免疫病理机制的理解仍不完全 | 进一步阐明UC和CeD之间的关系 | 研究乳糜泻和溃疡性结肠炎的毫无例外的共享基因表达特征 | 数字病理学 | 乳糜泻与溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序与基因表达谱分析 | LASSO分析 | 基因表达数据 | 使用了两个数据库的基因表达数据集，具体样本量未详细说明 |
| 462 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals cell type-specific variation and development in HLA expression of human skin
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112070
PMID:38640716
|
研究论文 | 该研究揭示了人类皮肤中HLA基因表达的细胞类型特异性变化与发育过程 | 首次全面分析了皮肤不同细胞类型中HLA基因表达的变异，特别关注了基质细胞的角色 | 研究中对免疫细胞和基质细胞的比较可能存在偏差，且样本量相对较少 | 该研究旨在揭示皮肤不同细胞类型中HLA表达的特征及其在皮肤发育中的动态变化 | 研究对象为人类皮肤中的多个细胞类型，包括正常成人皮肤、胎儿皮肤及毛囊 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涵盖成人和胎儿皮肤样本，及15、17和22孕周的胎儿皮肤 |
| 463 | 2024-08-04 |
Large-scale deorphanization of Nematostella vectensis neuropeptide G protein-coupled receptors supports the independent expansion of bilaterian and cnidarian peptidergic systems
2024-May-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90674
PMID:38727714
|
研究论文 | 本研究对海葵中的神经肽G蛋白偶联受体进行了大规模去孤儿化，揭示了腔肠动物和双侧动物神经肽系统的独立扩展 | 研究发现了31个受体被特定的神经肽激活，并揭示了腔肠动物中神经肽信号传导的独立扩展 | 没有直接的双侧动物神经肽系统的同源性支持 | 探索腔肠动物中神经肽及其受体的扩展 | 海葵中的神经肽及其G蛋白偶联受体 | NA | NA | 药理学筛选 | NA | 单细胞测序数据 | 64个肽，来自33个前体 |
| 464 | 2024-08-04 |
The role of FERMT2 in the tumor microenvironment and immunotherapy in pan-cancer using comprehensive single-cell and bulk sequencing
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30505
PMID:38726194
|
研究论文 | 该文章探讨了FERMT2在肿瘤微环境及免疫治疗中的作用 | 该研究结合单细胞和大规模测序技术，首次全面分析了FERMT2在不同癌症类型中的免疫特征和预后意义 | 研究的具体方法和样本数量在摘要中未提及，可能影响结果的普适性 | 本研究旨在评估FERMT2在肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 研究对象为在肿瘤微环境中表达FERMT2的不同癌症类型的细胞 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞测序、复合免疫荧光染色 | NA | 组织切片数据 | NA |
| 465 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis for the prognostic and immunological role of CD47: interact with TNFRSF9 inducing CD8 + T cell exhaustion
2024-May-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00951-z
PMID:38720108
|
研究论文 | 本研究探讨了CD47在癌症免疫治疗中的作用及其与CD8+ T细胞耗竭的关系 | 揭示了CD47影响多种癌症类型中CD8+ T细胞耗竭的机制，并提出将CD47和TNFRSF9作为免疫治疗的新靶点 | 未详细讨论CD47在不同癌症微环境中的具体作用机制 | 阐明CD47在癌症免疫微环境中的预后和免疫学相关性 | 本研究对象包括多种癌症类型的患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的患者队列 |
| 466 | 2024-08-05 |
Transcriptomic imputation of genetic risk variants uncovers novel whole-blood biomarkers of Parkinson's disease
2024-May-08, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-024-00698-y
PMID:38719867
|
研究论文 | 本研究探讨了基因表达特征作为帕金森病生物标志物的潜力 | 发现PATL2基因作为临床和前驱性帕金森病的潜在生物标志物 | 未在不同人群中验证结果的广泛性 | 通过转录组插补发现新的全血生物标志物用于帕金森病 | 转录组插补生成的全血基因表达签名 | 数字病理学 | 帕金森病 | RNA测序 | 随机森林分类器 | 基因表达数据 | 1176个帕金森病患者、254个前驱症状患者和860个健康对照 |
| 467 | 2024-08-05 |
Rethinking eco-evo studies of gene expression for non-model organisms in the genomic era
2024-May-09, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17378
PMID:38721834
|
评论 | 本文回顾了基因表达研究中最新的基因组技术对非模式生物的影响 | 提出了长读序列技术和单细胞RNA测序方法在生态基因组学中的应用潜力 | 传统的RNA测序方法无法捕捉稀有细胞群体的表达变化 | 探讨基因组技术如何提高对基因表达变化的理解 | 非模式生物的基因表达和细胞异质性 | 生态基因组学 | NA | 长读测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 468 | 2024-08-04 |
Genomic insights into the cellular specialization of predation in raptorial protists
2024-May-07, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01904-2
PMID:38715037
|
研究论文 | 本研究探讨了捕食原生动物的细胞特化的基因组机制 | 首次揭示了Haptoria纤毛虫在毒素生成和释放中的基因重复与表达特征 | 对毒素形成和释放的遗传过程的理解仍然有限 | 研究Haptoria纤毛虫的捕食策略及其细胞结构 | 七个Haptoria纤毛虫物种 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | 七个Haptoria纤毛虫物种 |
| 469 | 2024-08-05 |
Single-cell senescence identification reveals senescence heterogeneity, trajectory, and modulators
2024-May-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.03.009
PMID:38604170
|
研究论文 | 本文介绍了一种机器学习程序SenCID，用于准确识别衰老细胞 | SenCID能够识别不同的衰老身份，并重建衰老轨迹，揭示了衰老调节因子的层级结构 | 未提及具体的限制 | 研究细胞衰老及其异质性 | 602个样本来自52个衰老转录组数据集 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | 转录组测序 | 机器学习模型 | 文本数据 | 602个样本，涉及30种细胞类型 |
| 470 | 2024-08-04 |
Catalytic Nanodots-Driven Pyroptosis Suppression in Nucleus Pulposus for Antioxidant Intervention of Intervertebral Disc Degeneration
2024-May, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202313248
PMID:38299823
|
研究论文 | 本研究开发了碳化锰纳米点（MCDs）作为抗氧化剂，以抑制髓核细胞的焦亡，从而有效缓解椎间盘退变。 | 该研究首次使用碳化锰纳米点作为ROS清除催化生物材料，展示了其在抑制焦亡和缓解椎间盘退变中的优越效果。 | 该研究的局限性可能包括小鼠模型的适用性和长期效果需进一步验证。 | 研究的目的是开发一种新的抗氧化干预措施，以抑制椎间盘退变中的焦亡。 | 研究对象为椎间盘退变相关的髓核细胞。 | 数字病理 | 椎间盘退变 | 催化干预 | 小鼠模型 | 生物材料和生物化学数据 | 使用了多种小鼠样本进行体内评估 |
| 471 | 2024-08-05 |
Identification of a novel ADCC-related gene signature for predicting the prognosis and therapy response in lung adenocarcinoma
2024-May, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01871-y
PMID:38507067
|
研究论文 | 该研究识别了一种新的ADCC相关基因特征，预测肺腺癌的预后和治疗反应 | 首次系统编制ADCC相关基因创建预后标志，并展示了其在多组患者中的有效性 | 可能未对所有潜在的ADCC相关基因进行全面考察，且外部验证需要进一步研究 | 旨在通过ADCC相关基因特征提高肺腺癌患者的预后预测和治疗反应评估 | 包括1564例肺腺癌患者以及其他多种癌症类型的总共5000多名患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 机器学习 | 集成机器学习方法 | 基因组数据、单细胞数据 | 1564名肺腺癌患者，2057名非小细胞肺癌患者，以及5000多名其他癌症患者 |
| 472 | 2024-08-05 |
The Mas-related G protein-coupled receptor d (Mrgprd) mediates pain hypersensitivity in painful diabetic neuropathy
2024-May-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003120
PMID:38147415
|
研究论文 | 该研究探讨了Mrgprd在糖尿病性神经病痛中的作用。 | 首次揭示了Mrgprd在高脂饮食小鼠模型中的表达增加及其与神经痛相关的机制。 | 研究主要集中在动物模型上，尚未在人类糖尿病性神经病痛患者中验证。 | 阐明糖尿病性神经病痛中DRG神经元的超兴奋性分子机制。 | 高脂饮食小鼠模型中的DRG神经元。 | 数字病理 | 糖尿病性神经病痛 | 单细胞RNA测序和体内钙成像。 | NA | RNA数据和钙成像数据。 | 研究涉及高脂饮食小鼠模型的多个神经元亚群体。 |
| 473 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a signature based on myofibroblastic cancer-associated fibroblast marker genes for predicting prognosis, immune infiltration, and therapeutic response in bladder cancer
2024-May, Investigative and clinical urology
IF:2.5Q2
DOI:10.4111/icu.20230300
PMID:38714517
|
研究论文 | 本研究探讨了用于预测膀胱癌预后、免疫浸润和治疗反应的肌成纤维癌相关成纤维细胞标记基因的特征。 | 本研究构建了一个基于两个基因(COL6A1和MAP1B)的风险特征，为膀胱癌患者提供了新的治疗靶点。 | 本研究在样本选择和数据分析上可能存在一定的局限性，未详细讨论如何克服这些局限。 | 研究目的在于探索膀胱癌患者临床诊断和治疗中的myCAF标记基因生物标志物。 | 研究对象为膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据和临床数据。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因组学 | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据 | NA |
| 474 | 2024-08-05 |
Shared and Compartment-Specific Processes in Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus During Intervertebral Disc Degeneration
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309032
PMID:38403470
|
研究论文 | 本研究揭示了在椎间盘退化过程中，细胞群体的共享与特定过程。 | 该论文首次识别了退化中椎间盘各特定细胞群体的机制与分子，提供了更精确的IDD预防和治疗靶点。 | 具体样本来源及数量在研究中没有详细阐述。 | 研究椎间盘退化中细胞群体如何促使发病与进展。 | 对人类健康与病变椎间盘的环状纤维与髓核进行单细胞RNA测序分析。 | 数字病理学 | 椎间盘退化 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 共计70,000多个细胞样本，其中AF为26,983和19,978个细胞，NP为24,489和20,884个细胞 |
| 475 | 2024-08-05 |
Metaplastic regeneration in the mouse stomach requires a reactive oxygen species pathway
2024-May-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.002
PMID:38521055
|
研究论文 | 本文研究了小鼠胃中的再生转化过程，强调了反应性氧种的重要性 | 通过单细胞RNA测序分析了损伤后小鼠胃中paligenosis机制的高分辨率过程 | 研究主要集中在小鼠模型中的机制，未在其他动物或人类样本中验证 | 探讨反应性氧种在小鼠胃黏膜再生过程中的作用 | 小鼠胃中的成熟胃主细胞和非典型再生细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-08-04 |
Airway injury induces alveolar epithelial and mesenchymal responses mediated by macrophages
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.02.587596
PMID:38617297
|
研究论文 | 急性气道损伤激活局部前体细胞并刺激细胞间相互作用的变化以恢复稳态 | 本研究揭示了气道损伤对远端肺部反应的影响，特别是通过巨噬细胞介导的AT2前体细胞的增殖以及MANC2细胞的动态变化 | 未涉及更广泛的临床应用和长期效应的探讨 | 研究气道急性损伤后的肺组织反应及其细胞间相互作用变化 | 小鼠模型，重点关注气道特异性上皮损伤后的肺泡和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 477 | 2024-08-04 |
Nitrogen sensing and regulatory networks: it's about time and space
2024-May-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae038
PMID:38366121
|
综述 | 本文探讨了植物对氮信号的感知与调控网络的时间和空间维度 | 揭示了氮感知/信号传导的时空系统生物学新方面，特别是在拟南芥模型中的应用 | 主要集中在拟南芥模型上，可能限制结果的普遍适用性 | 研究植物如何在不同细胞类型及长距离上整合氮的响应以确保实时协调 | 主要研究对象为植物，尤其是拟南芥中的氮感知和信号传导机制 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序、轨迹推断、伪时间分析、机器学习 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 478 | 2024-08-04 |
Integrative analyses of bulk and single-cell transcriptomics reveals the infiltration and crosstalk of cancer-associated fibroblasts as a novel predictor for prognosis and microenvironment remodeling in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-May-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05238-z
PMID:38702814
|
研究论文 | 本文揭示了癌症相关成纤维细胞在肝内胆管癌中的浸润和相互作用及其作为预后和微环境重塑的新预测因子的作用 | 本研究首次通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）识别和构建了癌症相关成纤维细胞的浸润生物标志物，并揭示了成纤维细胞与肿瘤细胞之间相互作用的关键角色 | 研究可能存在样本量限制和潜在的模型过拟合问题 | 研究肝内胆管癌中成纤维细胞与肿瘤微环境及其对预后的影响 | 研究对象为肝内胆管癌中的癌症相关成纤维细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组分析 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 转录组数据 | 使用了TCGA-CHOL、GSE89748和107,943 等多个队列的样本 |
| 479 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Identifies NOTCH3-Mediated Interactions between Stromal Cells That Promote Microenvironment Remodeling and Invasion in Lung Adenocarcinoma
2024-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1183
PMID:38335304
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了NOTCH3介导的间质细胞间相互作用在肺腺癌中的作用 | 首次揭示了NOTCH信号在肿瘤微环境重塑和细胞侵袭中的作用 | 尚未明确NOTCH3信号靶向治疗的临床应用前景 | 深入理解肺腺癌中的间质生物学 | 9名未接受治疗的肺腺癌患者的256,379个细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自9名患者的256,379个细胞，包括13,857个间充质细胞 |
| 480 | 2024-08-05 |
919 granules improve postpartum depression through the regulation of abnormal peripheral blood IL-1β
2024-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2024.116623
PMID:38643545
|
研究论文 | 该文探讨919颗粒通过调节异常外周血IL-1β来改善产后抑郁症 | 首次揭示了产后抑郁症患者外周血cDC2和增殖B细胞的比例升高与IL-1β的显著相关性 | 研究中未提及样本的多样性和长期疗效验证 | 研究产后抑郁症的发病机制及919颗粒的治疗效果 | 健康产后女性和产后抑郁症患者的外周血样本 | 数字病理 | 产后抑郁症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 动物模型 | 外周血样本 | 健康产后女性与产后抑郁症患者的外周血样本 |