单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 543 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-08-04 |
Tracking in situ checkpoint inhibitor-bound target T cells in patients with checkpoint-induced colitis
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.010
PMID:38744246
|
研究论文 | 本文通过多模态单细胞和亚细胞空间转录组学跟踪了与检查点抑制剂结合的目标T细胞。 | 本研究揭示了检查点抑制剂诱导的结肠炎中T细胞的特定信号和转录梯度，并识别了因果通路。 | NA | 探讨和追踪检查点抑制剂诱导的T细胞在肠道组织中的行为。 | 主要研究与检查点抑制剂结合的CD4和CD8 T细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 442 | 2024-08-05 |
Foxp2 deficiency impairs reproduction by modulating the hypothalamic-pituitary-gonadal axis in zebrafish†
2024-May-09, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae019
PMID:38288660
|
研究论文 | 本研究探讨了Foxp2在斑马鱼生殖中的作用 | 揭示了Foxp2在脊椎动物生殖调节中的新角色 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能无法完全推广到其他物种 | 研究Foxp2在斑马鱼生殖中的功能 | Foxp2缺失的斑马鱼模型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌性斑马鱼 |
| 443 | 2024-08-04 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591541
PMID:38746119
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序分析了不同的CAR信号对T细胞功能的影响 | 揭示了独特的信号特征与特定ICD架构之间的关系，促进了液体肿瘤中持久性和疗效的理解 | 本研究对实体肿瘤信号的影响理解不足 | 解码CAR信号设计原则，并优化未来的ICD架构 | 专注于不同ICD架构的T细胞在单细胞层面上的表现 | 数字病理学 | 液体肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 444 | 2024-08-05 |
Transcript and protein signatures derived from shared molecular interactions across cancers are associated with mortality
2024-May-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05268-7
PMID:38734658
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研究论文 | 本文旨在通过识别多种实体癌症中的共同细胞间相互作用，评估其与癌症死亡率的关联 | 本研究首次构建了一个共享的多细胞肿瘤模型，并且从中提取了与多个癌症相关的基因特征 | 研究主要基于已提供的数据集，缺乏对其他癌症类型的广泛验证 | 改进癌症治疗策略和预后评估 | 来自乳腺癌、结肠癌、肝癌、肺癌和卵巢癌的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 共享多细胞肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 两个大型独立队列共包含9185个肿瘤样本和727个对照样本，及10384个癌症患者和5063个对照样本 |
| 445 | 2024-08-04 |
Loss of PBX1 function in Leydig cells causes testicular dysgenesis and male sterility
2024-May-09, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05249-5
PMID:38724675
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研究论文 | 本文研究了PBX1在莱迪格细胞分化和睾酮产生中的作用 | 发现PBX1是小鼠莱迪格细胞分化和睾酮产生的主要调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨PBX1在莱迪格细胞功能和生育中的作用 | 小鼠的莱迪格细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠 |
| 446 | 2024-08-05 |
Identification of Novel Regulators of Leaf Senescence Using a Deep Learning Model
2024-May-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13091276
PMID:38732491
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研究论文 | 本文开发了DEGRN深度学习模型，以识别叶片衰老的调节因子 | 提出了一种创新的深度学习模型DEGRN，能够通过整合丰富的表达数据解析基因相互作用 | 对基因调控的研究仍专注于有限的实例，许多相互作用尚未全面探索 | 研究基因调控网络，特别是叶片衰老过程中的调节因子 | 621个转录因子和13739个非转录因子基因的交互作用 | 机器学习 | NA | RNA-Seq | 深度学习模型 | 表达数据 | 大量数据，包括bulk RNA-Seq和scRNA-Seq数据 |
| 447 | 2024-08-04 |
Time-course RNAseq data of murine AB1 mesothelioma and Renca renal cancer following immune checkpoint therapy
2024-May-03, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03294-0
PMID:38702329
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研究论文 | 本研究提供了小鼠AB1间皮瘤和Renca肾癌在免疫检查点治疗下的RNA测序数据 | 本研究通过时间序列RNA测序和单细胞测序技术，首次全面表征了免疫微环境中转录事件及其对ICB响应的重要性 | 该研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类肿瘤的复杂性 | 本研究旨在通过RNA测序数据，揭示免疫检查点治疗对肿瘤微环境转录特征的影响 | 研究对象包括小鼠模型的AB1间皮瘤和Renca肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | RNAseq数据 | 144个肿瘤样本和12个单细胞样本 |
| 448 | 2024-08-04 |
New genetic insights into immunotherapy outcomes in gastric cancer via single-cell RNA sequencing and random forest model
2024-May-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03684-8
PMID:38693422
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序及随机森林模型，探索胃癌免疫治疗结果的新遗传学见解 | 使用单细胞测序识别基因并开发随机森林模型来预测胃癌患者的免疫治疗敏感性 | 该研究的具体样本数量及相应的临床数据未详细说明 | 旨在识别胃癌患者对免疫治疗的敏感性新生物标志物 | 胃癌患者的基因表达及其与免疫治疗敏感性的相关性 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机森林模型 | 基因表达数据 | NA |
| 449 | 2024-08-04 |
Neuroinflammation generated by HIV-infected microglia promotes dysfunction and death of neurons in human brain organoids
2024-May, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgae179
PMID:38737767
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研究论文 | 本文研究了HIV感染的微胶质细胞如何促进神经元功能障碍和死亡的机制 | 提出HIV感染导致微胶质细胞产生的炎症反应可扩展到多个未感染的旁观者细胞，最终影响神经元功能 | 本研究主要依赖于体外模型，尚需在更复杂的生物系统中验证结果 | 探讨HIV感染微胶质细胞后，神经炎症与神经元功能障碍之间的关联 | 使用人类诱导多能干细胞来源的脑类器官模型进行研究 | 数字病理学 | HIV相关神经认知障碍 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | 使用了两种不同的脑类器官模型（大脑和脉络丛类器官） |
| 450 | 2024-08-05 |
Characterization of Th17 tissue-resident memory cells in non-inflamed intestinal tissue of Crohn's disease patients
2024-May, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103206
PMID:38554656
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研究论文 | 本文研究了克罗恩病患者小肠中Th17组织驻留记忆细胞的特征及其与免疫细胞的相互作用 | 首次详细描述了克罗恩病小肠中Th17 Trm细胞的转录组特征及其功能特性 | 样本量相对较小，仅包括七名克罗恩病患者和四名对照患者 | 探索克罗恩病患者的小肠中Th17 Trm细胞的特征及其在疾病中的作用 | 七名克罗恩病患者及四名溃疡性结肠炎患者作为对照 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序 | NA | 组织样本 | 七名克罗恩病患者和四名溃疡性结肠炎患者的组织样本 |
| 451 | 2024-08-04 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics reveals tumor heterogeneity and intercellular networks in colorectal cancer
2024-May-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06598-6
PMID:38729966
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研究论文 | 本研究整合了空间转录组学和单细胞 RNA 测序，以揭示结直肠癌中的肿瘤异质性和细胞间网络 | 通过结合单细胞 RNA 测序与空间转录组测定，深入理解了肿瘤微环境中不同细胞组分之间的相互作用 | 该研究仅分析了来自三个结直肠癌肿瘤-正常-血液对的样本，可能限制了结果的普遍性 | 研究结直肠癌肿瘤微环境中的细胞相互作用及其异质性 | 分析来自三个结直肠癌患者的41,700个细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq 和空间转录组学 | NA | 单细胞数据 | 41,700个细胞 |
| 452 | 2024-08-04 |
A time-resolved multi-omics atlas of transcriptional regulation in response to high-altitude hypoxia across whole-body tissues
2024-May-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48261-w
PMID:38730227
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研究论文 | 本研究探讨了高海拔缺氧对整体生理调节的转录调控机制 | 通过生成多组学数据，揭示了不同组织对缺氧的转录响应及调控基因 | 研究主要基于绵羊模型，可能不完全适用于其他物种 | 澄清高海拔缺氧适应过程中的遗传机制 | 使用绵羊作为模型动物研究多组织的转录变化 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序，RNA-Seq，ATAC-Seq，单细胞RNA-Seq | NA | 基因组数据，转录组数据，表型数据 | 20个生物指标的表型数据 |
| 453 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis of decidual immune cell landscape in the occurrence of adverse pregnancy outcomes induced by Toxoplasma gondii infection
2024-May-10, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-024-06266-w
PMID:38730500
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了Toxoplasma gondii感染下的母体-胎儿微环境中蜕膜免疫细胞的变化 | 首次揭示了在T. gondii感染后蜕膜免疫细胞中一些未知分子的变化 | 尚未探讨感染的具体机制和细胞间相互作用 | 研究T. gondii感染对母体-胎儿微环境中的蜕膜免疫细胞的影响 | 人类蜕膜免疫细胞 | 数字病理学 | 孕产相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 454 | 2024-08-05 |
Choline metabolism reprogramming mediates an immunosuppressive microenvironment in non-small cell lung cancer (NSCLC) by promoting tumor-associated macrophage functional polarization and endothelial cell proliferation
2024-May-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05242-3
PMID:38730286
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研究论文 | 本文研究了胆碱代谢重编程如何通过促进肿瘤相关巨噬细胞功能极化和内皮细胞增殖介导非小细胞肺癌(NCLC)的免疫抑制微环境 | 发现胆碱酯酶作为晚期NSCLC的预后标志物，并开发了基于胆碱代谢相关基因的预后特征，揭示其与免疫抑制微环境的关系 | 研究中未完全阐明胆碱酯酶与肿瘤免疫微环境及免疫疗法反应和抗性的确切机制 | 探讨胆碱代谢与非小细胞肺癌肿瘤免疫微环境的关系及其在免疫疗法中的潜在作用 | 277名接受一线免疫疗法的晚期非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq，Cox回归分析 | 风险模型 | 生物医学数据 | 277名晚期非小细胞肺癌患者 |
| 455 | 2024-08-05 |
An atlas of spider development at single-cell resolution provides new insights into arthropod embryogenesis
2024-May-10, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-024-00224-4
PMID:38730509
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研究论文 | 本研究创建了一个蛛形纲动物发育单细胞解析图谱，为节肢动物胚胎发生提供新见解 | 首次对家蜘蛛的胚胎进行单细胞RNA测序，识别了20个细胞簇及其基因表达特征 | 尚未探讨所有基因的功能，可能无法全面反映细胞的所有命运 | 研究蜘蛛胚胎的细胞组成及其基因表达 | 常见家蜘蛛Parasteatoda tepidariorum的胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18500个细胞 |
| 456 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis defines highly specific leukemia-induced neutrophils and links MMP8 expression to recruitment of tumor associated neutrophils during FGFR1 driven leukemogenesis
2024-May-10, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00514-6
PMID:38730491
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研究论文 | 该文章定义了特异性的白血病诱导中性粒细胞，并将MMP8表达与肿瘤相关中性粒细胞的招募联系起来 | 研究识别出基于独特基因表达谱的特定白血病响应中性粒细胞亚群，并探讨了MMP基因上调在中性粒细胞发育中的重要作用 | 缺乏对其他可能影响中性粒细胞表现的因素的分析 | 研究FGFR1驱动的白血病发病过程中免疫细胞组成的变化 | 小鼠模型中的白血病相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 457 | 2024-08-04 |
Multimodal cortical neuronal cell type classification
2024-May, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-024-02923-2
PMID:38376567
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研究论文 | 本文总结了近年来对皮层神经元细胞类型分类的新见解 | 提出可靠的皮层细胞类型并进行了分类，包括兴奋性和抑制性神经元的不同亚群 | 尚未明确哪些转录组细胞类型会转化为真实的细胞类型 | 深入理解皮层神经元细胞类型及其功能 | 兴奋性（谷氨酸能）和抑制性（GABA能）神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-08-04 |
YBX1 promotes stemness and cisplatin insensitivity in intrahepatic cholangiocarcinoma via the AKT/β-catenin axis
2024-May, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3689
PMID:38676365
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研究论文 | 本研究探讨了YBX1在肝内胆管癌中的角色及其对干性和顺铂耐药性的影响 | 该研究揭示了YBX1通过调节AKT/β-β-catenin通路促进肝内胆管癌的干性和顺铂耐受性，为改善肝内胆管癌预后提供了新的潜在治疗靶点 | 未提及该研究的具体限制 | 研究YBX1在肝内胆管癌中的作用及其机制 | 肝内胆管癌细胞和临床样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | RNA-seq，肿瘤球和克隆形成实验 | NA | 临床样本，转录组数据 | 三个RNA-seq数据集和多个临床样本 |
| 459 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single cell-RNA sequencing and Mendelian randomization identifies lactate dehydrogenase B as a target of melatonin in ischemic stroke
2024-05, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14741
PMID:38702940
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析确定乳酸脱氢酶B作为缺血性中风的靶标 | 研究首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化结合，发现LDHB在缺血性中风中的新作用 | 尚未在大规模样本中验证LDHB作为生物标志物的临床应用 | 探索不同基因表达对缺血性中风的因果作用 | 研究确定的2339个在10个细胞群中表达不同的基因 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据 | 10个细胞群中的2339个基因 |
| 460 | 2024-08-04 |
Exploring the molecular mechanisms and shared gene signatures between celiac disease and ulcerative colitis based on bulk RNA and single-cell sequencing: Experimental verification
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112059
PMID:38615385
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研究论文 | 本研究探讨了乳糜泻（CeD）和溃疡性结肠炎（UC）之间的分子机制和共享基因特征 | 识别了REG4作为UC和CeD的共享基因，并提出它可能是一个潜在的生物标志物和治疗靶点 | 对疾病病因及免疫病理机制的理解仍不完全 | 进一步阐明UC和CeD之间的关系 | 研究乳糜泻和溃疡性结肠炎的毫无例外的共享基因表达特征 | 数字病理学 | 乳糜泻与溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序与基因表达谱分析 | LASSO分析 | 基因表达数据 | 使用了两个数据库的基因表达数据集，具体样本量未详细说明 |