单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
441	2024-08-05	The Treatment of Refractory Vitiligo With Autologous Cultured Epithelium Grafting: A Real-World Retrospective Cohort Study 2024-May-14, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1093/stcltm/szae009 PMID:38513284	研究论文	本研究评估了一种改良自体培养上皮移植技术在治疗难治性白癜风中的效果	提出了一种改良的自体培养上皮移植技术，并首次在大规模真实世界患者中应用	本研究为回顾性队列研究，可能存在选择偏倚	评估自体培养上皮移植在白癜风治疗中的有效性和影响因素	726名接受自体培养上皮移植（ACEG）治疗的白癜风患者	数字病理学	白癜风	自体培养上皮移植（ACEG）	广义线性混合模型	临床数据	726名白癜风患者
442	2024-08-04	Identification of hypoxic macrophages in glioblastoma with therapeutic potential for vasculature normalization 2024-May-13, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.013 PMID:38640932	研究论文	本文揭示了缺氧巨噬细胞在神经胶质瘤中对血管正常化的治疗潜力	本研究首次通过单细胞转录组学解析缺氧微环境中的肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并提出了针对缺氧巨噬细胞的潜在治疗策略	研究主要基于患者样本，可能存在个体差异，且对临床应用的长期效果需进一步验证	探索缺氧巨噬细胞在胶质瘤血管正常化中的作用及其潜在治疗价值	51名患者的单细胞转录组数据，重点分析缺氧肿瘤相关巨噬细胞	数字病理学	神经胶质瘤	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	51名患者
443	2024-08-05	Identification and verification of a novel signature that combines cuproptosis-related genes with ferroptosis-related genes in osteoarthritis using bioinformatics analysis and experimental validation 2024-May-13, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-024-03328-3 PMID:38741149	研究论文	本研究构建了结合铜死亡相关基因和铁死亡相关基因的新标志基因，以探讨骨关节炎的发病机制。	创新点在于首次将铜死亡相关基因与铁死亡相关基因结合起来，形成新的标志基因以用于骨关节炎的研究。	研究中使用的数据集可能存在选择偏倚，且实验验证样本量较小，可能影响结果的广泛应用。	研究骨关节炎的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点。	本研究主要针对骨关节炎的标志基因进行分析和验证。	数字病理学	骨关节炎	生物信息学分析	NA	基因表达数据	使用GSE82107数据集进行了验证
444	2024-08-05	Mapping of mitogen and metabolic sensitivity in organoids defines requirements for human hepatocyte growth 2024-May-13, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48550-4 PMID:38740814	研究论文	本文揭示了人类肝细胞在发育和再生中的增长机制，特别是胎儿和成人肝细胞类器官的生长差异	通过转录组和表型方法对肝细胞类器官的生长要求进行了特征化，发现了促进成人肝细胞增殖的潜在策略	该研究主要集中于类器官的体外生长，缺乏体内验证	探讨人类肝细胞在发育和再生过程中的增殖机制	研究对象为人类胎儿肝细胞（FH）和成人初级人类肝细胞（PHH）	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	未提供样本数量的具体信息
445	2024-08-05	Tumor cell-intrinsic epigenetic dysregulation shapes cancer-associated fibroblasts heterogeneity to metabolically support pancreatic cancer 2024-May-13, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.005 PMID:38579725	研究论文	本文揭示了肿瘤细胞内源性表观遗传失调如何影响与癌症相关的成纤维细胞的异质性，并通过提供脂质支持胰腺癌的代谢。	本研究首次揭示SETD2缺失如何通过调节H3K27Ac增强BMP2信号通路，导致成纤维细胞向脂肪丰富表型分化，从而促进肿瘤进展。	研究未深入探讨其他可能影响成纤维细胞异质性的因素，仅集中于肿瘤细胞的表观遗传失调。	研究旨在探讨胰腺导管腺癌微环境中成纤维细胞异质性的起源和功能。	研究对象为SETD2缺失胰腺肿瘤中的成纤维细胞亚群。	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	SETD2缺失的胰腺肿瘤样本中识别出的成纤维细胞亚群
446	2024-08-05	Integrated single-cell and bulk RNA-Seq analysis enhances prognostic accuracy of PD-1/PD-L1 immunotherapy response in lung adenocarcinoma through necroptotic anoikis gene signatures 2024-05-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-61629-8 PMID:38740918	研究论文	本研究通过整合单细胞与整体RNA测序分析，提升了对肺腺癌PD-1/PD-L1免疫疗法反应的预后准确性	提出了与凋亡相关的基因特征HMR、FAM83A和KRT6A，增强了预测肺腺癌患者对免疫治疗反应的能力	承认数据集的回顾性性质及样本规模需要更大	本研究旨在提高肺腺癌患者在PD-1/PD-L1免疫治疗中的预后评估准确性	研究对象是肺腺癌患者及其相关基因	数字病理学	肺癌	RNA测序	NA	RNA数据	使用了GSE50081、IMvigor210和GSE78220数据集进行验证
447	2024-08-04	Single nucleus and spatial transcriptomic profiling of healthy human hamstring tendon 2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202300601RRR PMID:38742770	研究论文	本研究确定了健康人类腘绳肌肌腱中所有细胞类型的转录组和位置	首次在健康腘绳肌肌腱中识别了12种不同的细胞类型，包括先前未报告的不同骨骼肌细胞类型、卫星细胞、脂肪细胞和未知的神经系统细胞	研究只集中于四名健康供体，样本量有限	探讨健康腘绳肌肌腱的分子和细胞基础	四名健康供体的腘绳肌肌腱细胞	数字病理学	NA	单核RNA测序	NA	转录组数据	四名健康供体的10,533个细胞核
448	2024-08-04	Tracking in situ checkpoint inhibitor-bound target T cells in patients with checkpoint-induced colitis 2024-May-13, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.010 PMID:38744246	研究论文	本文通过多模态单细胞和亚细胞空间转录组学跟踪了与检查点抑制剂结合的目标T细胞。	本研究揭示了检查点抑制剂诱导的结肠炎中T细胞的特定信号和转录梯度，并识别了因果通路。	NA	探讨和追踪检查点抑制剂诱导的T细胞在肠道组织中的行为。	主要研究与检查点抑制剂结合的CD4和CD8 T细胞。	数字病理学	NA	空间转录组学	NA	单细胞转录组数据	NA
449	2024-08-05	Foxp2 deficiency impairs reproduction by modulating the hypothalamic-pituitary-gonadal axis in zebrafish† 2024-May-09, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioae019 PMID:38288660	研究论文	本研究探讨了Foxp2在斑马鱼生殖中的作用	揭示了Foxp2在脊椎动物生殖调节中的新角色	研究主要集中在斑马鱼模型上，可能无法完全推广到其他物种	研究Foxp2在斑马鱼生殖中的功能	Foxp2缺失的斑马鱼模型	数字病理学	NA	RNA-seq	NA	转录组数据	成年雄性和雌性斑马鱼
450	2024-08-04	Loss of PBX1 function in Leydig cells causes testicular dysgenesis and male sterility 2024-May-09, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-024-05249-5 PMID:38724675	研究论文	本文研究了PBX1在莱迪格细胞分化和睾酮产生中的作用	发现PBX1是小鼠莱迪格细胞分化和睾酮产生的主要调控因子	研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类	探讨PBX1在莱迪格细胞功能和生育中的作用	小鼠的莱迪格细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	小鼠
451	2024-08-05	Identification of Novel Regulators of Leaf Senescence Using a Deep Learning Model 2024-May-05, Plants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/plants13091276 PMID:38732491	研究论文	本文开发了DEGRN深度学习模型，以识别叶片衰老的调节因子	提出了一种创新的深度学习模型DEGRN，能够通过整合丰富的表达数据解析基因相互作用	对基因调控的研究仍专注于有限的实例，许多相互作用尚未全面探索	研究基因调控网络，特别是叶片衰老过程中的调节因子	621个转录因子和13739个非转录因子基因的交互作用	机器学习	NA	RNA-Seq	深度学习模型	表达数据	大量数据，包括bulk RNA-Seq和scRNA-Seq数据
452	2024-08-04	Time-course RNAseq data of murine AB1 mesothelioma and Renca renal cancer following immune checkpoint therapy 2024-May-03, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-024-03294-0 PMID:38702329	研究论文	本研究提供了小鼠AB1间皮瘤和Renca肾癌在免疫检查点治疗下的RNA测序数据	本研究通过时间序列RNA测序和单细胞测序技术，首次全面表征了免疫微环境中转录事件及其对ICB响应的重要性	该研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类肿瘤的复杂性	本研究旨在通过RNA测序数据，揭示免疫检查点治疗对肿瘤微环境转录特征的影响	研究对象包括小鼠模型的AB1间皮瘤和Renca肾细胞癌	数字病理学	肾癌	RNA测序	NA	RNAseq数据	144个肿瘤样本和12个单细胞样本
453	2024-08-04	New genetic insights into immunotherapy outcomes in gastric cancer via single-cell RNA sequencing and random forest model 2024-May-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-024-03684-8 PMID:38693422	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序及随机森林模型，探索胃癌免疫治疗结果的新遗传学见解	使用单细胞测序识别基因并开发随机森林模型来预测胃癌患者的免疫治疗敏感性	该研究的具体样本数量及相应的临床数据未详细说明	旨在识别胃癌患者对免疫治疗的敏感性新生物标志物	胃癌患者的基因表达及其与免疫治疗敏感性的相关性	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	随机森林模型	基因表达数据	NA
454	2024-08-04	Neuroinflammation generated by HIV-infected microglia promotes dysfunction and death of neurons in human brain organoids 2024-May, PNAS nexus IF:2.2Q1 DOI:10.1093/pnasnexus/pgae179 PMID:38737767	研究论文	本文研究了HIV感染的微胶质细胞如何促进神经元功能障碍和死亡的机制	提出HIV感染导致微胶质细胞产生的炎症反应可扩展到多个未感染的旁观者细胞，最终影响神经元功能	本研究主要依赖于体外模型，尚需在更复杂的生物系统中验证结果	探讨HIV感染微胶质细胞后，神经炎症与神经元功能障碍之间的关联	使用人类诱导多能干细胞来源的脑类器官模型进行研究	数字病理学	HIV相关神经认知障碍	单细胞RNA测序	脑类器官模型	基因表达数据	使用了两种不同的脑类器官模型（大脑和脉络丛类器官）
455	2024-08-05	Characterization of Th17 tissue-resident memory cells in non-inflamed intestinal tissue of Crohn's disease patients 2024-May, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.jaut.2024.103206 PMID:38554656	研究论文	本文研究了克罗恩病患者小肠中Th17组织驻留记忆细胞的特征及其与免疫细胞的相互作用	首次详细描述了克罗恩病小肠中Th17 Trm细胞的转录组特征及其功能特性	样本量相对较小，仅包括七名克罗恩病患者和四名对照患者	探索克罗恩病患者的小肠中Th17 Trm细胞的特征及其在疾病中的作用	七名克罗恩病患者及四名溃疡性结肠炎患者作为对照	数字病理学	克罗恩病	单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序	NA	组织样本	七名克罗恩病患者和四名溃疡性结肠炎患者的组织样本
456	2024-08-04	A time-resolved multi-omics atlas of transcriptional regulation in response to high-altitude hypoxia across whole-body tissues 2024-May-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48261-w PMID:38730227	研究论文	本研究探讨了高海拔缺氧对整体生理调节的转录调控机制	通过生成多组学数据，揭示了不同组织对缺氧的转录响应及调控基因	研究主要基于绵羊模型，可能不完全适用于其他物种	澄清高海拔缺氧适应过程中的遗传机制	使用绵羊作为模型动物研究多组织的转录变化	数字病理学	NA	全基因组测序，RNA-Seq，ATAC-Seq，单细胞RNA-Seq	NA	基因组数据，转录组数据，表型数据	20个生物指标的表型数据
457	2024-08-05	Single-cell transcriptomic analysis of decidual immune cell landscape in the occurrence of adverse pregnancy outcomes induced by Toxoplasma gondii infection 2024-May-10, Parasites & vectors IF:3.0Q1 DOI:10.1186/s13071-024-06266-w PMID:38730500	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序分析了Toxoplasma gondii感染下的母体-胎儿微环境中蜕膜免疫细胞的变化	首次揭示了在T. gondii感染后蜕膜免疫细胞中一些未知分子的变化	尚未探讨感染的具体机制和细胞间相互作用	研究T. gondii感染对母体-胎儿微环境中的蜕膜免疫细胞的影响	人类蜕膜免疫细胞	数字病理学	孕产相关疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
458	2024-08-05	An atlas of spider development at single-cell resolution provides new insights into arthropod embryogenesis 2024-May-10, EvoDevo IF:4.1Q1 DOI:10.1186/s13227-024-00224-4 PMID:38730509	研究论文	本研究创建了一个蛛形纲动物发育单细胞解析图谱，为节肢动物胚胎发生提供新见解	首次对家蜘蛛的胚胎进行单细胞RNA测序，识别了20个细胞簇及其基因表达特征	尚未探讨所有基因的功能，可能无法全面反映细胞的所有命运	研究蜘蛛胚胎的细胞组成及其基因表达	常见家蜘蛛Parasteatoda tepidariorum的胚胎	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	18500个细胞
459	2024-08-05	Single-cell analysis defines highly specific leukemia-induced neutrophils and links MMP8 expression to recruitment of tumor associated neutrophils during FGFR1 driven leukemogenesis 2024-May-10, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1 DOI:10.1186/s40164-024-00514-6 PMID:38730491	研究论文	该文章定义了特异性的白血病诱导中性粒细胞，并将MMP8表达与肿瘤相关中性粒细胞的招募联系起来	研究识别出基于独特基因表达谱的特定白血病响应中性粒细胞亚群，并探讨了MMP基因上调在中性粒细胞发育中的重要作用	缺乏对其他可能影响中性粒细胞表现的因素的分析	研究FGFR1驱动的白血病发病过程中免疫细胞组成的变化	小鼠模型中的白血病相关中性粒细胞	数字病理学	白血病	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	基因表达数据	NA
460	2024-08-04	Multimodal cortical neuronal cell type classification 2024-May, Pflugers Archiv : European journal of physiology DOI:10.1007/s00424-024-02923-2 PMID:38376567	研究论文	本文总结了近年来对皮层神经元细胞类型分类的新见解	提出可靠的皮层细胞类型并进行了分类，包括兴奋性和抑制性神经元的不同亚群	尚未明确哪些转录组细胞类型会转化为真实的细胞类型	深入理解皮层神经元细胞类型及其功能	兴奋性（谷氨酸能）和抑制性（GABA能）神经元	神经科学	NA	单细胞转录组学	NA	NA	NA