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当前共找到 539 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-08-04 |
Exploring the immune escape mechanisms in gastric cancer patients based on the deep AI algorithms and single-cell sequencing analysis
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18379
PMID:38752750
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研究论文 | 本研究旨在开发胃癌患者的预后模型，并探讨免疫逃逸机制 | 通过深度机器学习和单细胞测序分析，利用101种算法构建了预测模型，并识别了潜在靶向药物 | 尚未提及具体的研究限制 | 提升胃癌患者的临床管理和个性化治疗 | 胃癌患者及其免疫逃逸机制 | 计算机视觉 | 胃癌 | 单细胞测序分析 | 深度机器学习 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2024-08-05 |
Single-cell atlas reveals the immunosuppressive microenvironment and Treg cells landscapes in recurrent Glioblastoma
2024-May, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00740-4
PMID:38429367
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研究论文 | 本研究揭示了复发性胶质母细胞瘤的免疫抑制性微环境及调节性T细胞的分布 | 首次在单细胞水平上分析复发性胶质母细胞瘤与脑脊液的免疫微环境，并发现S100A9作为潜在生物标志物 | 样本量较小，仅包含来自两名患者的四个临床样本 | 揭示复发性胶质母细胞瘤的免疫微环境及潜在脑脊液生物标志物 | 复发性胶质母细胞瘤与非恶性脑肿瘤患者的临床样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床样本 | 四个临床样本，来自两名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-08-04 |
Reconstructing developmental trajectories using latent dynamical systems and time-resolved transcriptomics
2024-May-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.04.004
PMID:38754365
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研究论文 | 本文提出了一种新框架，以克服单细胞转录组学在研究细胞命运决策动态性方面的挑战 | 引入了sci-FATE2优化的代谢标记方法和两个阶段的动态建模框架VelvetVAE和VelvetSDE，显著提高了数据质量和动态建模能力 | 目前的方法在时间分辨率和数据质量方面仍存在一定限制 | 研究细胞在发育过程中的命运决策动态性 | 45,000个分化成神经管身份的胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | 代谢标记 | 变分自编码器(VAE)和神经随机微分方程(nSDE) | 转录组数据 | 45,000个胚胎干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 444 | 2024-08-04 |
Single-Cell Multi-Omics Map of Cell Type-Specific Mechanistic Drivers of Multiple Sclerosis Lesions
2024-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200213
PMID:38564686
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研究论文 | 该文章探讨了多发性硬化损伤的细胞类型特异性机制驱动因素 | 首次使用单细胞多组学技术揭示了多发性硬化特异性少突胶质细胞遗传特征及其与铁摄取信号的关联 | 研究样本数量较少，仅涉及6名多发性硬化患者和3名非神经病对照 | 研究多发性硬化中的细胞动态及其在病变中的作用 | 使用来自6名渐进性多发性硬化患者的脑白质损伤样本 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单核RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 9个病变样本和3个对照样本来自6名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 445 | 2024-08-04 |
Characterization of the Nucleus Pulposus Progenitor Cells via Spatial Transcriptomics
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303752
PMID:38311573
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研究论文 | 本研究建立了椎间盘的空间转录组图谱，探讨了核髓细胞前体细胞的特征 | 首次生成了小鼠椎间盘的空间转录组图谱，为骨生物学提供了公共资源 | 由于核髓来源细胞的脆弱性，传统转录组方法的应用受限 | 研究核髓细胞前体细胞的分化序列及其相关标记 | 小鼠模型中的核髓细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 446 | 2024-08-04 |
Integration Analysis of Single-Cell Multi-Omics Reveals Prostate Cancer Heterogeneity
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305724
PMID:38483933
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研究论文 | 该研究揭示了前列腺癌微环境中细胞异质性及其与疾病进展的相互作用 | 整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和ATAC序列分析，详细描绘了前列腺癌的细胞多样性 | 尚未完全理解肿瘤与基质细胞之间的异质性形成机制 | 研究前列腺癌的细胞异质性及其在微环境中的相互作用 | 来自前列腺癌患者及健康对照者的单细胞样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、ATAC序列分析 | 机器学习 | 细胞数据 | 多名前列腺癌患者及健康对照者的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-08-05 |
Generation of complex bone marrow organoids from human induced pluripotent stem cells
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02172-2
PMID:38374263
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研究论文 | 本文展示了一种从人类诱导多能干细胞生成复杂骨髓类器官的方法 | 创新之处在于生成了模拟人类骨髓微环境的复杂三维骨髓类器官 | 没有提到具体的局限性 | 研究与人类骨髓微环境相关的造血发展和疾病 | 从人类诱导多能干细胞生成的骨髓类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了从人类诱导多能干细胞生成的骨髓类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-08-05 |
sciCSR infers B cell state transition and predicts class-switch recombination dynamics using single-cell transcriptomic data
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02060-1
PMID:37932398
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研究论文 | 本文介绍了sciCSR，一个分析B细胞类转变和动态的计算管道 | sciCSR能够利用单细胞RNA测序数据分析类转变事件，并构建马尔可夫状态模型推断CSR的动态和方向 | 未提及具体限制 | 分析B细胞成熟过程中类转变重组的动态 | 采用单细胞RNA测序数据，研究B细胞的类转变和动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 马尔可夫状态模型 | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing to explore cancer-associated fibroblasts heterogeneity: "Single" vision for "heterogeneous" environment
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13592
PMID:38158643
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综述 | 本文讨论了癌症相关成纤维细胞的异质性，重点关注单细胞RNA测序技术的应用 | 提出了利用单细胞RNA测序技术整合多模态单细胞平台的新策略，以深入理解CAF的异质性 | 未具体说明在不同肿瘤类型中CAF研究的限制 | 探讨癌症相关成纤维细胞的异质性及其在癌症治疗中的潜在应用 | 癌症相关成纤维细胞的不同亚型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2024-08-05 |
The Treatment of Refractory Vitiligo With Autologous Cultured Epithelium Grafting: A Real-World Retrospective Cohort Study
2024-May-14, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szae009
PMID:38513284
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研究论文 | 本研究评估了一种改良自体培养上皮移植技术在治疗难治性白癜风中的效果 | 提出了一种改良的自体培养上皮移植技术，并首次在大规模真实世界患者中应用 | 本研究为回顾性队列研究，可能存在选择偏倚 | 评估自体培养上皮移植在白癜风治疗中的有效性和影响因素 | 726名接受自体培养上皮移植（ACEG）治疗的白癜风患者 | 数字病理学 | 白癜风 | 自体培养上皮移植（ACEG） | 广义线性混合模型 | 临床数据 | 726名白癜风患者 | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2024-08-04 |
Identification of hypoxic macrophages in glioblastoma with therapeutic potential for vasculature normalization
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.013
PMID:38640932
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研究论文 | 本文揭示了缺氧巨噬细胞在神经胶质瘤中对血管正常化的治疗潜力 | 本研究首次通过单细胞转录组学解析缺氧微环境中的肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并提出了针对缺氧巨噬细胞的潜在治疗策略 | 研究主要基于患者样本，可能存在个体差异，且对临床应用的长期效果需进一步验证 | 探索缺氧巨噬细胞在胶质瘤血管正常化中的作用及其潜在治疗价值 | 51名患者的单细胞转录组数据，重点分析缺氧肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 51名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2024-08-05 |
Identification and verification of a novel signature that combines cuproptosis-related genes with ferroptosis-related genes in osteoarthritis using bioinformatics analysis and experimental validation
2024-May-13, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03328-3
PMID:38741149
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研究论文 | 本研究构建了结合铜死亡相关基因和铁死亡相关基因的新标志基因，以探讨骨关节炎的发病机制。 | 创新点在于首次将铜死亡相关基因与铁死亡相关基因结合起来，形成新的标志基因以用于骨关节炎的研究。 | 研究中使用的数据集可能存在选择偏倚，且实验验证样本量较小，可能影响结果的广泛应用。 | 研究骨关节炎的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点。 | 本研究主要针对骨关节炎的标志基因进行分析和验证。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE82107数据集进行了验证 | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2024-08-05 |
Mapping of mitogen and metabolic sensitivity in organoids defines requirements for human hepatocyte growth
2024-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48550-4
PMID:38740814
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研究论文 | 本文揭示了人类肝细胞在发育和再生中的增长机制，特别是胎儿和成人肝细胞类器官的生长差异 | 通过转录组和表型方法对肝细胞类器官的生长要求进行了特征化，发现了促进成人肝细胞增殖的潜在策略 | 该研究主要集中于类器官的体外生长，缺乏体内验证 | 探讨人类肝细胞在发育和再生过程中的增殖机制 | 研究对象为人类胎儿肝细胞（FH）和成人初级人类肝细胞（PHH） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未提供样本数量的具体信息 | NA | NA | NA | NA |
| 454 | 2024-08-05 |
Tumor cell-intrinsic epigenetic dysregulation shapes cancer-associated fibroblasts heterogeneity to metabolically support pancreatic cancer
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.005
PMID:38579725
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤细胞内源性表观遗传失调如何影响与癌症相关的成纤维细胞的异质性，并通过提供脂质支持胰腺癌的代谢。 | 本研究首次揭示SETD2缺失如何通过调节H3K27Ac增强BMP2信号通路，导致成纤维细胞向脂肪丰富表型分化，从而促进肿瘤进展。 | 研究未深入探讨其他可能影响成纤维细胞异质性的因素，仅集中于肿瘤细胞的表观遗传失调。 | 研究旨在探讨胰腺导管腺癌微环境中成纤维细胞异质性的起源和功能。 | 研究对象为SETD2缺失胰腺肿瘤中的成纤维细胞亚群。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | SETD2缺失的胰腺肿瘤样本中识别出的成纤维细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-Seq analysis enhances prognostic accuracy of PD-1/PD-L1 immunotherapy response in lung adenocarcinoma through necroptotic anoikis gene signatures
2024-05-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61629-8
PMID:38740918
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞与整体RNA测序分析，提升了对肺腺癌PD-1/PD-L1免疫疗法反应的预后准确性 | 提出了与凋亡相关的基因特征HMR、FAM83A和KRT6A，增强了预测肺腺癌患者对免疫治疗反应的能力 | 承认数据集的回顾性性质及样本规模需要更大 | 本研究旨在提高肺腺癌患者在PD-1/PD-L1免疫治疗中的预后评估准确性 | 研究对象是肺腺癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了GSE50081、IMvigor210和GSE78220数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 456 | 2024-08-04 |
Single nucleus and spatial transcriptomic profiling of healthy human hamstring tendon
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202300601RRR
PMID:38742770
|
研究论文 | 本研究确定了健康人类腘绳肌肌腱中所有细胞类型的转录组和位置 | 首次在健康腘绳肌肌腱中识别了12种不同的细胞类型，包括先前未报告的不同骨骼肌细胞类型、卫星细胞、脂肪细胞和未知的神经系统细胞 | 研究只集中于四名健康供体，样本量有限 | 探讨健康腘绳肌肌腱的分子和细胞基础 | 四名健康供体的腘绳肌肌腱细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四名健康供体的10,533个细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-08-04 |
Tracking in situ checkpoint inhibitor-bound target T cells in patients with checkpoint-induced colitis
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.010
PMID:38744246
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞和亚细胞空间转录组学跟踪了与检查点抑制剂结合的目标T细胞。 | 本研究揭示了检查点抑制剂诱导的结肠炎中T细胞的特定信号和转录梯度，并识别了因果通路。 | NA | 探讨和追踪检查点抑制剂诱导的T细胞在肠道组织中的行为。 | 主要研究与检查点抑制剂结合的CD4和CD8 T细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-08-05 |
Foxp2 deficiency impairs reproduction by modulating the hypothalamic-pituitary-gonadal axis in zebrafish†
2024-May-09, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae019
PMID:38288660
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研究论文 | 本研究探讨了Foxp2在斑马鱼生殖中的作用 | 揭示了Foxp2在脊椎动物生殖调节中的新角色 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能无法完全推广到其他物种 | 研究Foxp2在斑马鱼生殖中的功能 | Foxp2缺失的斑马鱼模型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌性斑马鱼 | NA | NA | NA | NA |
| 459 | 2024-08-04 |
Loss of PBX1 function in Leydig cells causes testicular dysgenesis and male sterility
2024-May-09, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05249-5
PMID:38724675
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研究论文 | 本文研究了PBX1在莱迪格细胞分化和睾酮产生中的作用 | 发现PBX1是小鼠莱迪格细胞分化和睾酮产生的主要调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨PBX1在莱迪格细胞功能和生育中的作用 | 小鼠的莱迪格细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2024-08-05 |
Identification of Novel Regulators of Leaf Senescence Using a Deep Learning Model
2024-May-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13091276
PMID:38732491
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研究论文 | 本文开发了DEGRN深度学习模型，以识别叶片衰老的调节因子 | 提出了一种创新的深度学习模型DEGRN，能够通过整合丰富的表达数据解析基因相互作用 | 对基因调控的研究仍专注于有限的实例，许多相互作用尚未全面探索 | 研究基因调控网络，特别是叶片衰老过程中的调节因子 | 621个转录因子和13739个非转录因子基因的交互作用 | 机器学习 | NA | RNA-Seq | 深度学习模型 | 表达数据 | 大量数据，包括bulk RNA-Seq和scRNA-Seq数据 | NA | NA | NA | NA |