单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 558 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing to explore cancer-associated fibroblasts heterogeneity: "Single" vision for "heterogeneous" environment
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13592
PMID:38158643
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综述 | 本文讨论了癌症相关成纤维细胞的异质性，重点关注单细胞RNA测序技术的应用 | 提出了利用单细胞RNA测序技术整合多模态单细胞平台的新策略，以深入理解CAF的异质性 | 未具体说明在不同肿瘤类型中CAF研究的限制 | 探讨癌症相关成纤维细胞的异质性及其在癌症治疗中的潜在应用 | 癌症相关成纤维细胞的不同亚型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 442 | 2024-08-05 |
IL-24 promotes atopic dermatitis-like inflammation through driving MRSA-induced allergic responses
2024-May-16, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae030
PMID:38752989
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研究论文 | 本研究揭示了IL-24在特应性皮炎（AD）样炎症中的作用，尤其是在MRSA诱导过敏反应中的角色 | 本研究首次通过单细胞RNA测序发现IL-24在MRSA诱导的免疫反应中的重要性，并鉴定其作为AD发展的关键因素 | 未探讨IL-24在其他皮肤疾病中的作用以及其可能的系统性影响 | 研究IL-24在特应性皮炎及其与MRSA相关联的过敏反应中的作用 | 聚焦于角质形成细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因组数据 | 小鼠模型中进行实验 |
| 443 | 2024-08-05 |
The Treatment of Refractory Vitiligo With Autologous Cultured Epithelium Grafting: A Real-World Retrospective Cohort Study
2024-May-14, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szae009
PMID:38513284
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研究论文 | 本研究评估了一种改良自体培养上皮移植技术在治疗难治性白癜风中的效果 | 提出了一种改良的自体培养上皮移植技术，并首次在大规模真实世界患者中应用 | 本研究为回顾性队列研究，可能存在选择偏倚 | 评估自体培养上皮移植在白癜风治疗中的有效性和影响因素 | 726名接受自体培养上皮移植（ACEG）治疗的白癜风患者 | 数字病理学 | 白癜风 | 自体培养上皮移植（ACEG） | 广义线性混合模型 | 临床数据 | 726名白癜风患者 |
| 444 | 2024-08-04 |
Identification of hypoxic macrophages in glioblastoma with therapeutic potential for vasculature normalization
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.013
PMID:38640932
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研究论文 | 本文揭示了缺氧巨噬细胞在神经胶质瘤中对血管正常化的治疗潜力 | 本研究首次通过单细胞转录组学解析缺氧微环境中的肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并提出了针对缺氧巨噬细胞的潜在治疗策略 | 研究主要基于患者样本，可能存在个体差异，且对临床应用的长期效果需进一步验证 | 探索缺氧巨噬细胞在胶质瘤血管正常化中的作用及其潜在治疗价值 | 51名患者的单细胞转录组数据，重点分析缺氧肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 51名患者 |
| 445 | 2024-08-05 |
Identification and verification of a novel signature that combines cuproptosis-related genes with ferroptosis-related genes in osteoarthritis using bioinformatics analysis and experimental validation
2024-May-13, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03328-3
PMID:38741149
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研究论文 | 本研究构建了结合铜死亡相关基因和铁死亡相关基因的新标志基因，以探讨骨关节炎的发病机制。 | 创新点在于首次将铜死亡相关基因与铁死亡相关基因结合起来，形成新的标志基因以用于骨关节炎的研究。 | 研究中使用的数据集可能存在选择偏倚，且实验验证样本量较小，可能影响结果的广泛应用。 | 研究骨关节炎的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点。 | 本研究主要针对骨关节炎的标志基因进行分析和验证。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE82107数据集进行了验证 |
| 446 | 2024-08-05 |
Mapping of mitogen and metabolic sensitivity in organoids defines requirements for human hepatocyte growth
2024-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48550-4
PMID:38740814
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研究论文 | 本文揭示了人类肝细胞在发育和再生中的增长机制，特别是胎儿和成人肝细胞类器官的生长差异 | 通过转录组和表型方法对肝细胞类器官的生长要求进行了特征化，发现了促进成人肝细胞增殖的潜在策略 | 该研究主要集中于类器官的体外生长，缺乏体内验证 | 探讨人类肝细胞在发育和再生过程中的增殖机制 | 研究对象为人类胎儿肝细胞（FH）和成人初级人类肝细胞（PHH） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未提供样本数量的具体信息 |
| 447 | 2024-08-05 |
Tumor cell-intrinsic epigenetic dysregulation shapes cancer-associated fibroblasts heterogeneity to metabolically support pancreatic cancer
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.005
PMID:38579725
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤细胞内源性表观遗传失调如何影响与癌症相关的成纤维细胞的异质性，并通过提供脂质支持胰腺癌的代谢。 | 本研究首次揭示SETD2缺失如何通过调节H3K27Ac增强BMP2信号通路，导致成纤维细胞向脂肪丰富表型分化，从而促进肿瘤进展。 | 研究未深入探讨其他可能影响成纤维细胞异质性的因素，仅集中于肿瘤细胞的表观遗传失调。 | 研究旨在探讨胰腺导管腺癌微环境中成纤维细胞异质性的起源和功能。 | 研究对象为SETD2缺失胰腺肿瘤中的成纤维细胞亚群。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | SETD2缺失的胰腺肿瘤样本中识别出的成纤维细胞亚群 |
| 448 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-Seq analysis enhances prognostic accuracy of PD-1/PD-L1 immunotherapy response in lung adenocarcinoma through necroptotic anoikis gene signatures
2024-05-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61629-8
PMID:38740918
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞与整体RNA测序分析，提升了对肺腺癌PD-1/PD-L1免疫疗法反应的预后准确性 | 提出了与凋亡相关的基因特征HMR、FAM83A和KRT6A，增强了预测肺腺癌患者对免疫治疗反应的能力 | 承认数据集的回顾性性质及样本规模需要更大 | 本研究旨在提高肺腺癌患者在PD-1/PD-L1免疫治疗中的预后评估准确性 | 研究对象是肺腺癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了GSE50081、IMvigor210和GSE78220数据集进行验证 |
| 449 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals aberrant sphingolipid metabolism in non-small cell lung cancer impacts tumor-associated macrophages and stimulates angiogenesis via macrophage inhibitory factor signaling
2024-May, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15283
PMID:38587042
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌中异常的鞘脂代谢如何影响肿瘤相关巨噬细胞并通过巨噬细胞抑制因子信号刺激血管生成 | 研究首次探讨了鞘脂在肿瘤微环境中的作用，特别是在巨噬细胞极化和血管生成中的影响 | 未详细讨论鞘脂代谢对其他免疫细胞的影响 | 研究鞘脂代谢在非小细胞肺癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 主要研究巨噬细胞及其与癌细胞之间的相互作用 | 数字病理 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 利用了多个公开的scRNA-seq数据集 |
| 450 | 2024-08-04 |
Immune cell-related prognostic risk model and tumor immune environment modulation in esophageal carcinoma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2024-May, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15301
PMID:38587029
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研究论文 | 本文探讨了免疫细胞在食管癌肿瘤免疫微环境中的角色，并建立了预后风险模型 | 利用单细胞测序，识别和表征免疫细胞亚群，构建独立的预后模型 | 未提及 | 研究食管癌患者的肿瘤免疫微环境和预后模型 | 食管癌患者的免疫细胞特征 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | NA |
| 451 | 2024-08-04 |
Single nucleus and spatial transcriptomic profiling of healthy human hamstring tendon
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202300601RRR
PMID:38742770
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研究论文 | 本研究确定了健康人类腘绳肌肌腱中所有细胞类型的转录组和位置 | 首次在健康腘绳肌肌腱中识别了12种不同的细胞类型，包括先前未报告的不同骨骼肌细胞类型、卫星细胞、脂肪细胞和未知的神经系统细胞 | 研究只集中于四名健康供体，样本量有限 | 探讨健康腘绳肌肌腱的分子和细胞基础 | 四名健康供体的腘绳肌肌腱细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四名健康供体的10,533个细胞核 |
| 452 | 2024-08-04 |
Tracking in situ checkpoint inhibitor-bound target T cells in patients with checkpoint-induced colitis
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.010
PMID:38744246
|
研究论文 | 本文通过多模态单细胞和亚细胞空间转录组学跟踪了与检查点抑制剂结合的目标T细胞。 | 本研究揭示了检查点抑制剂诱导的结肠炎中T细胞的特定信号和转录梯度，并识别了因果通路。 | NA | 探讨和追踪检查点抑制剂诱导的T细胞在肠道组织中的行为。 | 主要研究与检查点抑制剂结合的CD4和CD8 T细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 453 | 2024-08-05 |
Foxp2 deficiency impairs reproduction by modulating the hypothalamic-pituitary-gonadal axis in zebrafish†
2024-May-09, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae019
PMID:38288660
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研究论文 | 本研究探讨了Foxp2在斑马鱼生殖中的作用 | 揭示了Foxp2在脊椎动物生殖调节中的新角色 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能无法完全推广到其他物种 | 研究Foxp2在斑马鱼生殖中的功能 | Foxp2缺失的斑马鱼模型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌性斑马鱼 |
| 454 | 2024-08-05 |
Villus myofibroblasts are developmental and adult progenitors of mammalian gut lymphatic musculature
2024-May-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.005
PMID:38537630
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研究论文 | 本研究揭示了肠道绒毛平滑肌的发育及维持机制 | 该研究首次识别了小鼠肠道中的亚上皮成纤维细胞祖先，并揭示了它们如何分化成成熟的平滑肌纤维 | 该研究可能局限于小鼠模型，结果在其他动物模型中的适用性尚未验证 | 研究肠道绒毛平滑肌的发育过程及其在成年期的维持机制 | 小鼠肠道中的成纤维细胞和肌纤维 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-08-04 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591541
PMID:38746119
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序分析了不同的CAR信号对T细胞功能的影响 | 揭示了独特的信号特征与特定ICD架构之间的关系，促进了液体肿瘤中持久性和疗效的理解 | 本研究对实体肿瘤信号的影响理解不足 | 解码CAR信号设计原则，并优化未来的ICD架构 | 专注于不同ICD架构的T细胞在单细胞层面上的表现 | 数字病理学 | 液体肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 456 | 2024-08-05 |
Transcript and protein signatures derived from shared molecular interactions across cancers are associated with mortality
2024-May-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05268-7
PMID:38734658
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研究论文 | 本文旨在通过识别多种实体癌症中的共同细胞间相互作用，评估其与癌症死亡率的关联 | 本研究首次构建了一个共享的多细胞肿瘤模型，并且从中提取了与多个癌症相关的基因特征 | 研究主要基于已提供的数据集，缺乏对其他癌症类型的广泛验证 | 改进癌症治疗策略和预后评估 | 来自乳腺癌、结肠癌、肝癌、肺癌和卵巢癌的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 共享多细胞肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 两个大型独立队列共包含9185个肿瘤样本和727个对照样本，及10384个癌症患者和5063个对照样本 |
| 457 | 2024-08-04 |
Loss of PBX1 function in Leydig cells causes testicular dysgenesis and male sterility
2024-May-09, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05249-5
PMID:38724675
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研究论文 | 本文研究了PBX1在莱迪格细胞分化和睾酮产生中的作用 | 发现PBX1是小鼠莱迪格细胞分化和睾酮产生的主要调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨PBX1在莱迪格细胞功能和生育中的作用 | 小鼠的莱迪格细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠 |
| 458 | 2024-08-05 |
Identification of Novel Regulators of Leaf Senescence Using a Deep Learning Model
2024-May-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13091276
PMID:38732491
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研究论文 | 本文开发了DEGRN深度学习模型，以识别叶片衰老的调节因子 | 提出了一种创新的深度学习模型DEGRN，能够通过整合丰富的表达数据解析基因相互作用 | 对基因调控的研究仍专注于有限的实例，许多相互作用尚未全面探索 | 研究基因调控网络，特别是叶片衰老过程中的调节因子 | 621个转录因子和13739个非转录因子基因的交互作用 | 机器学习 | NA | RNA-Seq | 深度学习模型 | 表达数据 | 大量数据，包括bulk RNA-Seq和scRNA-Seq数据 |
| 459 | 2024-08-04 |
Time-course RNAseq data of murine AB1 mesothelioma and Renca renal cancer following immune checkpoint therapy
2024-May-03, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03294-0
PMID:38702329
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研究论文 | 本研究提供了小鼠AB1间皮瘤和Renca肾癌在免疫检查点治疗下的RNA测序数据 | 本研究通过时间序列RNA测序和单细胞测序技术，首次全面表征了免疫微环境中转录事件及其对ICB响应的重要性 | 该研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类肿瘤的复杂性 | 本研究旨在通过RNA测序数据，揭示免疫检查点治疗对肿瘤微环境转录特征的影响 | 研究对象包括小鼠模型的AB1间皮瘤和Renca肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | RNAseq数据 | 144个肿瘤样本和12个单细胞样本 |
| 460 | 2024-08-04 |
New genetic insights into immunotherapy outcomes in gastric cancer via single-cell RNA sequencing and random forest model
2024-May-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03684-8
PMID:38693422
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序及随机森林模型，探索胃癌免疫治疗结果的新遗传学见解 | 使用单细胞测序识别基因并开发随机森林模型来预测胃癌患者的免疫治疗敏感性 | 该研究的具体样本数量及相应的临床数据未详细说明 | 旨在识别胃癌患者对免疫治疗的敏感性新生物标志物 | 胃癌患者的基因表达及其与免疫治疗敏感性的相关性 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机森林模型 | 基因表达数据 | NA |