单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 543 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-05 |
Thioredoxin is a metabolic rheostat controlling regulatory B cells
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01798-w
PMID:38553615
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研究论文 | 本研究揭示了硫氧还蛋白在调节性B细胞分化和功能中的角色 | 首次揭示了硫氧还蛋白通过调节线粒体电子运输和活性氧水平影响调节性B细胞的分化与功能 | 研究主要集中于系统性红斑狼疮患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 探索调节性B细胞分化和功能的代谢需求 | 研究调节性B细胞的代谢过程及其在系统性红斑狼疮中的作用 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-04 |
IGF2BP3 promotes glutamine metabolism of endometriosis by interacting with UCA1 to enhances the mRNA stability of GLS1
2024-May-17, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00834-7
PMID:38760723
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研究论文 | 本研究探讨了IGF2BP3在内膜异位症中的作用及其分子机制。 | 首次揭示了IGF2BP3与UCA1相互作用并增强GLS1 mRNA稳定性对谷氨酰胺代谢的影响。 | 该研究主要在体外和小动物模型中进行，可能无法完全反映人类病理特征。 | 研究IGF2BP3对内膜异位症发生和发展的影响及其分子机制。 | 内异症相关的间质细胞及其谷氨酰胺代谢的相关过程。 | 数字病理学 | 内膜异位症 | RNA免疫沉淀、RNA拉下实验、荧光原位杂交、单细胞空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 异位内膜病变与正常内膜组织的比较分析 |
| 403 | 2024-08-04 |
Identification of four mitochondria-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2024-May-16, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00623-1
PMID:38755528
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研究论文 | 本研究旨在识别与脓毒症相关的线粒体基因并进行分析 | 首次发现四个与脓毒症生存负相关的线粒体基因，提供了脓毒症免疫机制的新见解 | 样本量较小，仅涉及20例脓毒症和12例系统性炎症反应综合征 | 阐明脓毒症患者的线粒体基因机制并为临床治疗提供新思路 | 脓毒症患者和系统性炎症反应综合征患者的外周血细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 32个患者（20例脓毒症，12例SIRS） |
| 404 | 2024-08-05 |
Four centrosome-related genes to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with colon cancer
2024-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i5.1908
PMID:38764831
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研究论文 | 本研究探索了中心体相关基因在结肠癌中的作用。 | 构建了一个由四个基因组成的中心体相关预后特征，能够准确预测结肠癌患者的预后。 | 未详细说明研究的限制因素。 | 研究中心体相关基因在结肠癌中的作用及其对预后的预测能力。 | 结肠癌患者及其相关的中心体相关基因。 | 生物信息学 | 结肠癌 | 生物信息学分析 | Cox回归模型 | 基因组数据 | 726个中心体相关基因 |
| 405 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-sequencing data reveal molecular subtypes based on lactylation-related genes and prognosis and therapeutic response in glioma
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30726
PMID:38765164
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸化在胶质瘤中的作用，建立了基于乳酸化相关基因的分子亚型和预后模型 | 首次结合单细胞和散装RNA测序数据，识别出基于乳酸化相关基因的胶质瘤分子亚型及其预后关联 | 本研究的数据主要来源于公共数据库，可能存在样本偏差及外部验证缺乏的问题 | 研究乳酸化在胶质瘤中的作用，识别分子亚型及其预后意义 | 胶质瘤患者，重点关注乳酸化相关基因的表达与生存预测 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 无监督聚类 | 基因表达数据 | NA |
| 406 | 2024-08-05 |
Identifying the miRNA-gene networks contributes to exploring paravertebral muscle degeneration's underlying pathogenesis and therapy strategy
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30517
PMID:38765163
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研究论文 | 本研究探讨了与脊椎旁肌肉退化相关的miRNA-基因网络及其潜在病理机制和治疗策略 | 通过构建miRNA-基因网络，揭示了脊椎旁肌肉退化的病理过程，提供了新的诊断和治疗方法 | 尚未详尽说明miRNA-mRNA之间具体的调控机制 | 探索脊椎旁肌肉退化的病理机制与治疗策略 | 聚焦于脊椎旁肌肉退化与低背痛的关系 | 数字病理学 | 低背痛 | RNA测序(RNA-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及多个免疫细胞及76个差异表达基因和106个差异表达miRNA |
| 407 | 2024-08-04 |
A spatiotemporal atlas of cholestatic injury and repair in mice
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01687-w
PMID:38627596
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研究论文 | 本研究生成了小鼠胆汁淤积损伤和修复过程中的高分辨率时空基因表达图谱 | 结合空间增强分辨率组学测序和单细胞转录组学，揭示了胆管细胞驱动信号在损伤-修复反应中的关键作用 | 没有明确提到本研究的具体局限性 | 探索胆汁淤积损伤中细胞动态和分子机制，以期为胆道疾病的发展提供治疗途径 | 小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 空间增强分辨率组学测序，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中进行的实验，具体样本数量未给出 |
| 408 | 2024-08-05 |
Single-cell mtDNA dynamics in tumors is driven by coregulation of nuclear and mitochondrial genomes
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01724-8
PMID:38741018
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研究论文 | 这篇文章探讨了肿瘤中细胞间线粒体DNA (mtDNA) 副本数量和基因型的变化及其表型和演化后果 | 采用无扩增的单细胞全基因组测序技术，揭示了mtDNA和nuDNA之间的共同调控关系 | 研究主要集中于细胞系和患者衍生的异种移植模型，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究肿瘤中mtDNA副本数量的变异及其与细胞大小的关系 | 从来自永生细胞系、患者衍生异种移植和原发人类肿瘤的72,275个单细胞中进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞全基因组测序（DLP+） | NA | 基因组数据 | 72,275个单细胞 |
| 409 | 2024-08-04 |
High-throughput mechanical phenotyping and transcriptomics of single cells
2024-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48088-5
PMID:38760380
|
研究论文 | 本文描述了一种基于电穿孔的细胞表面张力和转录组学的方法ELASTomics | ELASTomics结合了细胞机械表征与转录组筛选，提供了前所未有的单细胞分辨率 | NA | 研究细胞表面机械特性与转录调控的关系 | 癌细胞系及来自小鼠造血祖细胞的细胞谱系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 电穿孔 | NA | 转录组数据 | 多个癌细胞系 |
| 410 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic landscape and the microenvironment of normal adjacent tissues in hypopharyngeal carcinoma
2024-May-17, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10321-2
PMID:38760729
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研究论文 | 本文探讨了低咽癌正常邻近组织的单细胞转录组特征及其微环境 | 研究揭示了低咽癌正常邻近组织中不同细胞的转录组信息和肿瘤微环境的影响 | 对疾病样本的异质性和转录组特征的全面评估尚待深入探索 | 研究低咽癌正常邻近组织的单细胞转录组特点 | 低咽癌患者的正常邻近组织中的细胞 | 数字病理学 | 低咽癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 来自五名捐献者的39,315个高质量细胞 |
| 411 | 2024-08-05 |
Single cell RNA sequencing reveals immunomodulatory mechanism of stem cell factor and granulocyte colony-stimulating factor treatment in the brains of aged APP/PS1 mice
2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.09.593359
PMID:38766064
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研究论文 | 这项研究探讨了干细胞因子和粒细胞集落刺激因子治疗对老年APP/PS1小鼠大脑中免疫调节机制的影响 | 首次通过转录组学方法揭示SCF和G-CSF组合增强老年APP/PS1小鼠大脑修复的机制 | 未详细讨论其他可能影响结果的外部因素 | 研究SCF+G-CSF治疗如何改变老年APP/PS1小鼠大脑中小胶质细胞和单核/巨噬细胞的功能 | 28个月大的APP/PS1小鼠大脑中的CD11b小胶质细胞和单核/巨噬细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 通过流式细胞术识别的大量CD11b小胶质细胞和单核/巨噬细胞 |
| 412 | 2024-08-05 |
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable genes from spatial transcriptomic data
2024-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.06.592851
PMID:38765956
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研究论文 | 介绍了一种名为scBSP的工具，该工具用于从空间转录组数据中识别空间可变基因 | scBSP通过稀疏矩阵操作显著提高了计算效率，能够在短时间内处理大规模空间转录组数据 | NA | 提高从空间转录组数据中识别空间可变基因的效率和准确性 | 空间转录组数据中的空间可变基因 | 数字病理学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 基因表达数据 | 处理了19,950个基因在181,367个点上的数据 |
| 413 | 2024-08-04 |
Unraveling the genetic architecture of blood unfolded p-53 among non-demented elderlies: novel candidate genes for early Alzheimer's disease
2024-May-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10363-6
PMID:38702606
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研究论文 | 本文探讨了与血液U-p53相关的遗传变异，以识别早期阿尔茨海默病相关的新基因。 | 首次通过GWAS研究血液U-p53，揭示了与早期阿尔茨海默病相关的新基因座和通路。 | 样本仅限于健康和轻度认知受损个体，可能限制了结果的广泛适用性。 | 旨在识别血液U-p53相关的遗传变异，以促进早期阿尔茨海默病的诊断。 | 研究对象为484名来自ADNI队列的健康与轻度认知受损个体。 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 基因组关联研究（GWAS） | NA | 血液数据 | 484名健康和轻度认知受损个体 |
| 414 | 2024-08-05 |
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-May-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66850
PMID:38767376
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研究论文 | 本文描述了一种处理新鲜骨组织样本以生成空间转录组学数据的方法 | 提出了一种新方法，通过去钙处理保持组织形态学细节，成功生成高质量的空间转录组数据 | 该方法对硬组织的应用仍然面临挑战，可能不是所有硬组织样本均适用 | 研究空间转录组学在骨组织分析中的应用 | 新鲜获得的骨组织样本和来自组织库的甲醇包埋样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 来自骨肉瘤的原发肿瘤和肺转移样本的组织库样本 |
| 415 | 2024-08-04 |
Loss of function of male-specific lethal 3 (Msl3) does not affect spermatogenesis in rodents
2024-May, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.669
PMID:37847071
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研究论文 | 这篇文章探讨了Msl3在啮齿动物中的功能及其对精子发生的影响 | 首次展示Msl3在啮齿动物的精子发生过程中没有显著作用 | 研究局限于小鼠模型，可能不适用于其他哺乳动物 | 研究Msl3基因在哺乳动物减数分裂中的角色 | 小鼠作为模型生物来研究Msl3的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了新生成的Msl3条件性敲除小鼠进行研究 |
| 416 | 2024-08-05 |
Molecular mechanism of radiation tolerance in lung adenocarcinoma cells using single-cell RNA sequencing
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18378
PMID:38760895
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研究论文 | 本文探讨了肺腺癌细胞对放射治疗耐受性的分子机制。 | 识别了与放射耐受性相关的两个细胞亚群，并探讨了其基因突变的初步情况。 | 研究主要依赖公共数据库的数据，可能存在数据偏差。 | 探索肺腺癌放射耐受性的分子机制，以改善临床治疗效果。 | 聚焦于肺腺癌细胞及其亚群体对放射治疗的反应。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用多个公共数据库中的单细胞数据 |
| 417 | 2024-08-07 |
PRPF19 could serve as a prognostic biomarker for patients with bladder cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-May, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.01.064
PMID:38245411
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-08-04 |
Cis-regulatory control of transcriptional timing and noise in response to estrogen
2024-May-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100542
PMID:38663407
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研究论文 | 该研究探讨了顺式调控元件在雌激素响应中的转录时间和噪音控制 | 首次结合使用单细胞RNA测序和机器学习方法，揭示了活跃增强子与基因转录时间和噪音之间的关系 | 对调控特性的综合理解仍不完全，可能需更深入的机制研究 | 研究雌激素对转录水平、时间动态和转录噪音的影响 | 单细胞RNA-seq技术下的雌激素处理细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 419 | 2024-08-05 |
Unified cross-modality integration and analysis of T cell receptors and T cell transcriptomes by low-resource-aware representation learning
2024-May-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100553
PMID:38688285
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研究论文 | 提出了UniTCR，一个新的低资源感知的多模态表示学习框架，用于统一跨模态集成。 | 该框架设计了双模态对比学习模块和单模态保留模块，有效地将每种模态嵌入共同的潜在空间。 | 未提及具体的限制条件 | 研究T细胞异质性，通过跨模态数据的整合推动免疫学研究。 | 研究对象为T细胞受体和T细胞转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和T细胞受体测序(TCR-seq) | 对比学习 | 多模态数据 | 多个配对的scRNA-seq/TCR-seq数据集 |
| 420 | 2024-08-04 |
Cell-mediated cytotoxicity within CSF and brain parenchyma in spinal muscular atrophy unaltered by nusinersen treatment
2024-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48195-3
PMID:38750052
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研究论文 | 这篇文章探讨了在脊髓性肌萎缩症(SMA)中细胞介导的细胞毒性及首个抗体nusinersen治疗的影响 | 该研究首次通过单细胞转录组学揭示了SMA患者脑脊液中的NK细胞和CD8+ T细胞扩张以及与疾病相关的细胞毒性特征 | 样本数量较小，且未能在nusinersen治疗后观察到具体的免疫反应变化 | 本研究旨在探索脊髓性肌萎缩症中的局部免疫反应及其对nusinersen治疗的影响 | 研究对象包括SMA患者和对照组的脑脊液样本 | 自然语言处理 | 脊髓性肌萎缩症 | 单细胞转录组学，多重免疫组织化学 | NA | 脑脊液样本 | SMA: N = 9 对照组: N = 9 |