单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 539 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2024-May-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06319-x
PMID:38783104
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-04 |
A Spatial Transcriptomics Browser for Discovering Gene Expression Landscapes across Microscopic Tissue Sections
2024-May-13, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46050284
PMID:38785552
|
研究论文 | 本研究开发了一个空间转录组浏览器，以便在微观组织切片中发现基因表达图景 | 该工具应用了自组织映射(SOM)机器学习方法来分析空间转录组数据，生成每个点的基因表达景观 | 文章未提及具体的样本量和该工具的局限性 | 研究空间转录组技术在细胞生态系统组织和相互作用知识挖掘中的应用 | 主要研究内容为单基因表达、功能基因集表达以及细胞间相互作用的空间模式 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组 | 自组织映射(SOM) | 图像 | 使用了小鼠脑组织和黑色素瘤的相关组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-08-05 |
Deciphering infected cell types, hub gene networks and cell-cell communication in infectious bronchitis virus via single-cell RNA sequencing
2024-May, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012232
PMID:38743760
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序系统性研究感染性支气管炎病毒对细胞类型和细胞间通讯的影响 | 首次系统性鉴定了特定细胞类型中表达的组织特异性分子标志物和相应的基因网络 | 未提及样本数量的具体细节及其在研究中的影响 | 探讨感染性支气管炎病毒在小鸡中的致病机制及其对免疫反应的影响 | 研究感染性支气管炎病毒感染后的肾脏、法氏囊和气管组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-08-05 |
Integrating phylogenies into single-cell RNA sequencing analysis allows comparisons across species, genes, and cells
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002633
PMID:38787797
|
研究论文 | 本文探讨了将系统发育整合到单细胞RNA测序分析中的应用，以比较物种、基因和细胞之间的联系 | 提出了将系统发育方法整合进scRNA-seq分析中，以克服物种间比较的挑战并加强基因和细胞演化假设的验证 | NA | 实现跨物种、基因和细胞的比较，揭示细胞基因表达与细胞功能演化之间的联系 | 单细胞RNA测序数据及其在不同物种和细胞中的比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 系统发育树 | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-08-05 |
Cardiopulmonary progenitors facilitate cardiac repair via exosomal transfer of miR-27b-3p targeting the SIK1-CREB1 axis
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13593
PMID:38185757
|
研究论文 | 这篇文章探讨了心肺前体细胞在心脏修复中的作用，特别是通过外泌体转移miR-27b-3p靶向SIK1-CREB1轴来促进心脏修复 | 该研究首次揭示心肺前体细胞通过外泌体转移miR-27b-3p促进心脏修复的机制 | 研究只在小鼠模型中进行，临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证 | 研究心肺前体细胞在缺血性心脏疾病中修复受损心脏的机制 | 本研究对象为小鼠胚胎衍生的心肺前体细胞 | 数字病理学 | 缺血性心脏病 | scRNA-seq, miRNA-seq, RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 细胞, RNA | 使用E9.5小鼠胚胎获取心肺前体细胞，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-08-04 |
Multiregional transcriptomics identifies congruent consensus subtypes with prognostic value beyond tumor heterogeneity of colorectal cancer
2024-May-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48706-2
PMID:38773143
|
研究论文 | 研究多区域转录组学在结直肠癌中的预后价值及其对肿瘤异质性的影响 | 首次通过多区域转录组学探究了结直肠癌中的凝聚共识分型及其预后能力 | 该研究仅基于单个医院的样本，可能限制了结果的广泛适用性 | 评估转录组异质性对结直肠癌预后的影响及其分类能力 | 对来自692名患者的1093个肿瘤样本进行研究，包括98个原发肿瘤和35对原发-转移样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 1093个肿瘤样本，来自692名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-08-04 |
A comparative study on the dose-effect of low-dose radiation based on microdosimetric analysis and single-cell sequencing technology
2024-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62501-5
PMID:38773212
|
研究论文 | 本研究探讨了低剂量辐射对BEAS-2B细胞系的潜在机制 | 使用微剂量分析和单细胞测序技术，提供了选择对低剂量辐射反应敏感生物标志物的新视角 | 研究中的数值不确定性可能影响微剂量与基因表达的相关性 | 深入探索低剂量辐射诱发的生物机制 | BEAS-2B细胞系及其对低剂量辐射的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 蒙特卡罗模型 | 细胞能量分布和基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of KLF family reveals KLF6 as a promising prognostic and immune biomarker in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-May-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03369-3
PMID:38773440
|
研究论文 | 本研究全面分析了KLF家族，并揭示KLF6作为胰腺导管腺癌中有前景的预后和免疫生物标志物 | 本研究提出KLF6是胰腺导管腺癌中一个新的诊断生物标志物，并作为潜在治疗靶点 | 未在临床上验证KLF6的作用及其作为生物标志物的应用效果 | 探讨KLF家族基因在胰腺导管腺癌中的生物学功能及其临床意义 | 研究胰腺导管腺癌中的KLF家族基因及其表达模式 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox回归模型 | 转录组数据 | 包含了大量胰腺癌患者的转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-08-05 |
Dynamic changes in B cell subpopulations in response to triple-negative breast cancer development
2024-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60243-y
PMID:38773133
|
研究论文 | 本文探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）发展过程中B细胞亚群的动态变化 | 本研究揭示了LAG-3 + B细胞在三阴性乳腺癌中的潜在良好预后意义，并提出其可能成为靶向治疗的新方向 | 需要更多研究来揭示这些细胞的机制路径，并在更大、更多样化的患者群体中验证其预后价值 | 研究B细胞在三阴性乳腺癌发展过程中的响应变化及其预后关联 | 使用小鼠模型探讨B细胞在肿瘤相关淋巴结中的反应 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 研究涉及TNBC患者的转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-08-05 |
Tenascin C as a novel zinc finger protein 750 target regulating the immunogenicity via DNA damage in lung squamous cell carcinoma
2024-May-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12285-8
PMID:38711034
|
研究论文 | 本研究揭示了锌指蛋白750（ZNF750）通过调节tenascin C（TNC）在肺鳞状细胞癌中的免疫原性和DNA损伤修复机制 | 首次提出ZNF750-TNC轴在肺鳞状细胞癌中的作用，以及其对免疫原性和DNA损伤修复的影响 | 尚未在临床环境中验证研究结果 | 探讨ZNF750-TNC轴在肺鳞状细胞癌中对DNA损伤修复和免疫原性的调节作用 | 研究对象为肺鳞状细胞癌中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | 肺鳞状细胞癌样本的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-08-04 |
scmFormer Integrates Large-Scale Single-Cell Proteomics and Transcriptomics Data by Multi-Task Transformer
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307835
PMID:38483032
|
研究论文 | 提出了一种新的单细胞多模态/多任务变换器 scmFormer，以整合单细胞蛋白组学与其他组学数据 | scmFormer 通过系统基准测试展示了在整合大规模单细胞多模态数据和异质多批次配对多组学数据方面的优势 | NA | 研究旨在填补整合单细胞蛋白组学和其他组学数据的现有空白 | 主要研究对象为大规模单细胞多组学数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞 RNA 测序 | 变换器 | 细胞数据 | 超过 148 万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-08-05 |
Specific lineage transition of tumor-associated macrophages elicits immune evasion of ascitic tumor cells in gastric cancer with peritoneal metastasis
2024-05, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-024-01486-6
PMID:38460015
|
研究论文 | 本研究系统评估了腹水中与肿瘤相关的巨噬细胞的特定谱系转变以及其对胃癌伴腹膜转移的免疫逃逸的影响 | 首次识别了来自PM-GC患者腹水中的CTShigh到C1Qhigh巨噬细胞的免疫抑制转变 | 本研究的局限性在于样本数量和来源的多样性可能影响结果的普遍性 | 旨在探讨腹水中肿瘤微环境在胃癌伴腹膜转移中的免疫抑制作用及其导致治疗失败的机制 | 研究对象为51名PM-GC患者的63个腹水样本和43个外周血样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 生物样本 | 51名PM-GC患者的63个腹水样本和43个外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-08-04 |
Multiomics integration reveals NETosis heterogeneity and TLR2 as a prognostic biomarker in pancreatic cancer
2024-May-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00586-x
PMID:38769374
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中NETosis的异质性及TLR2作为预后生物标志物的作用 | 通过单细胞RNA测序、空间RNA测序和多组学方法，建立了多组学预后模型，并确认了TLR2在患者预后中的重要性 | 研究的样本可能存在选择偏差，且标志物的适用性需要进一步验证 | 探讨胰腺癌微环境中NETosis的异质性及其预后相关因素 | 该研究对象为胰腺导管腺癌患者的肿瘤微环境及其免疫细胞特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序, 多组学分析 | NA | 数据集 | 使用了已发表的数据集和内部患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-08-04 |
Bio-nanoparticles loaded with synovial-derived exosomes ameliorate osteoarthritis progression by modifying the oxidative microenvironment
2024-May-20, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02538-w
PMID:38769545
|
研究论文 | 本研究旨在开发一种负载SOD3富集外泌体的水凝胶微球，以保护软骨并为骨关节炎治疗引入新的有效方法 | 首次使用S-EXOs负载的水凝胶微球对软骨进行保护，并提出了一种创新的骨关节炎治疗方案 | 本研究未对长时间使用S-EXOs的潜在副作用进行详细评估 | 研究S-EXOs在骨关节炎中的保护机制及其治疗潜力 | 聚焦于软骨细胞和外泌体（EXOs）在骨关节炎中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, PCR, 西方印迹, 免疫荧光 | NA | 细胞, 组织 | 4247个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-08-04 |
Reference-free inferring of transcriptomic events in cancer cells on single-cell data
2024-May-20, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12331-5
PMID:38769480
|
研究论文 | 本文研究了在单细胞数据上无参考文献地推断癌细胞转录组事件的方式 | 提出了一种不依赖参考的k-mer分解方法，以更详细地识别致病变异 | 没有针对特定的参考基因组进行分析，可能会忽略一些特定变异 | 探讨癌细胞的转录组变异及其与肿瘤相关事件的关系 | 食管癌和胶质母细胞瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 食管癌，胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 涉及食管癌和胶质母细胞瘤患者的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-08-05 |
Integrating single-cell RNA-sequencing and bulk RNA-sequencing data to explore the role of mitophagy-related genes in prostate cancer
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30766
PMID:38774081
|
研究论文 | 本文通过综合分析前列腺癌样本的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，探讨线粒体自噬相关基因在前列腺癌中的作用 | 创新点在于建立了前列腺癌亚型和预后模型，并识别了与线粒体自噬相关的预后基因 | 研究受限于所使用的数据来源，仅基于公开数据库的样本进行分析 | 研究前列腺癌中线粒体自噬相关基因的作用及其对预后的影响 | 前列腺癌样本及其对照组样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个前列腺癌样本和对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-08-05 |
Circulating hematopoietic stem/progenitor cell subsets contribute to human hematopoietic homeostasis
2024-May-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022666
PMID:38446574
|
研究论文 | 这项研究揭示了循环造血干/祖细胞亚群在维持人类造血稳态中的作用。 | 创新点在于通过结合单细胞转录组测序和功能分析，深入了解了人类循环造血干/祖细胞亚群的生物特性及其与骨髓相应群体的关系。 | 本研究未详细探讨特定疾病情况下cHSPCs的行为及其临床应用。 | 研究的目的是揭示循环造血干/祖细胞在维持人类造血稳态中的作用及其特征。 | 研究对象为人类循环造血干/祖细胞及其在不同生理状态下的表现。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 涉及患者的临床试验数据，具体样本量未在摘要中提供 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-08-05 |
Targeting dysregulated phago-/auto-lysosomes in Sertoli cells to ameliorate late-onset hypogonadism
2024-May, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00614-2
PMID:38649614
|
研究论文 | 该文章探讨了Sertoli细胞在晚发性性腺功能减退症中的功能及其潜在治疗策略 | 首次揭示了老化Sertoli细胞中吞噬体/自噬体功能失调的机制以及其在晚发性性腺功能减退症中的作用 | 尚未完全理解年龄相关睾丸功能障碍的所有机制 | 研究Sertoli细胞在晚发性性腺功能减退症中的角色，寻找可能的治疗方法 | 人类睾丸组织及其Sertoli细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 人类睾丸组织样本和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-08-04 |
Transcriptomic profiling and regulatory pathways of cardiac resident macrophages in aging
2024-May-20, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05235-x
PMID:38763956
|
研究论文 | 本研究探讨了衰老对心脏常驻巨噬细胞的转录组特征及其调控通路 | 揭示了衰老过程中心脏常驻巨噬细胞亚群的功能差异，特别是 CCR2 巨噬细胞在炎症反应中的作用 | 仅使用了老鼠模型，结果可能不适用于人类 | 探究衰老对心脏常驻巨噬细胞的影响及其与心血管疾病的关系 | 老龄小鼠的心脏常驻巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | Smart-Seq | NA | 基因表达数据 | 20 个月大的老鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-08-05 |
Decoding the complexity of delayed wound healing following Enterococcus faecalis infection
2024-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95113
PMID:38767331
|
研究论文 | 本文研究了肠球菌感染后延迟伤口愈合的复杂性 | 通过单细胞RNA测序创建了感染伤口的综合单细胞图谱，揭示了感染时细胞和转录组的独特变化 | 该研究主要依赖于小鼠模型，可能限制了对人类伤口愈合的直接适用性 | 探讨肠球菌感染对伤口愈合过程的影响和分子机制 | 对比感染与未感染的伤口，分析超过23000个细胞的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞转录组数据 | 超过23000个细胞 | NA | NA | NA | NA |