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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-04 |
Bi-allelic variants in chromatoid body protein TDRD6 cause spermiogenesis defects and severe oligoasthenoteratozoospermia in humans
2024-May-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109766
PMID:38341271
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研究论文 | 本研究探讨了TDRD6变异与人类不孕症之间的关联。 | 首次识别出五名中国不育男性中的双等位TDRD6变异,并揭示其在精子发生中的关键角色。 | 仅涉及五名患者,样本量较小,结果可能无法普遍适用。 | 研究TDRD6变异与人类精子发生缺陷之间的关系。 | 不孕男性及其变异的TDRD6基因。 | 数字病理学 | 生育障碍 | 全外显子测序,单细胞RNA测序,定量RT-PCR | CRISPR-Cas9系统的小鼠模型 | 基因组数据,RNA数据 | 5名不育男性 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-05 |
Malignant transformation of white sponge nevus: a case report of a novel keratin 4 mutation
2024-May-21, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-024-04300-y
PMID:38773401
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病例报告 | 本文报告了一例白色海绵痣的恶性转化,并识别出KRT4基因的独特突变 | 识别出一种新的KRT4基因插入突变,并提出其可能与白色海绵痣的恶性转化相关 | 仅基于单例病例的观察,缺乏更大样本的验证研究 | 探讨白色海绵痣的恶性转化及其潜在的遗传因素 | 一例70岁男性患者的白色海绵痣病例 | NA | 口腔疾病 | 外显子测序以及单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 1例 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the intra-tumoral heterogeneity and SQSTM1/P62 and Wnt/β-catenin mediated epithelial to mesenchymal transition and stemness of triple-negative breast cancer
2024-May-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114032
PMID:38583856
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性和相关信号通路的角色 | 本研究首次系统分析了SQSTM1/P62和Wnt/β-catenin在三阴性乳腺癌中介导上皮-间质转化及干性中的作用 | 虽然SQSTM1/P62对细胞存活并非至关重要,但其在EMT及干性标志物的分子修饰中的作用仍需进一步验证 | 探讨SQSTM1/P62和Wnt/β-catenin在三阴性乳腺癌进展中的机制 | 三阴性乳腺癌及正常患者来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因和蛋白表达数据 | 三阴性乳腺癌和正常患者来源的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-05 |
FCRL3 expression is upregulated and closely correlates with TIGIT expression in regulatory T cells of patients with systemic lupus erythematosus
2024-May, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350739
PMID:38461541
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研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮患者调节性T细胞中FCRL3和TIGIT的表达关系 | 发现FCRL3在系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞中表达上调,并与TIGIT表达呈正相关 | 未提及具体的样本数量和多样性 | 研究FCRL3和TIGIT在调节性T细胞中的共表达情况 | 系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序与流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-05 |
Novel insights into the protective effects of leonurine against acute kidney injury: Inhibition of ER stress-associated ferroptosis via regulating ATF4/CHOP/ACSL4 pathway
2024-May-25, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2024.111016
PMID:38670420
|
研究论文 | 本研究探讨了药用成分leonurine在急性肾损伤中的保护作用及其机制 | 首次揭示了leonurine通过调节ATF4/CHOP/ASCL4信号通路抑制与内质网应激关联的铁死亡 | 未提及该研究的具体局限性 | 研究leonurine对急性肾损伤的益处及其作用机制 | 急性肾损伤模型中的leonurine的治疗效果 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | NA | NA | 组织学数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-05 |
Benchmarking mapping algorithms for cell-type annotating in mouse brain by integrating single-nucleus RNA-seq and Stereo-seq data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae250
PMID:38796691
|
研究论文 | 本文评估了九种映射算法在小鼠大脑空间转录组数据的细胞类型注释中的应用 | 提出了一种评估映射算法适用性的工作流,能够提高空间数据注释的效率和准确性 | 关于这些算法在Stereo-seq ST数据上的准确性评估仍未解决 | 阐明小鼠大脑区域中空间转录组数据的细胞类型注释问题 | 使用不同分辨率的10个ST数据集和24个伪ST数据集进行算法比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 空间转录组数据 | 10个ST数据集和24个伪ST数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-04 |
A Galectin-9-Driven CD11chigh Decidual Macrophage Subset Suppresses Uterine Vascular Remodeling in Preeclampsia
2024-May-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了CD11chigh胎盘巨噬细胞亚群在先兆子痫的形成中抑制子宫血管重塑的作用 | 发现了一个独特的CD11chigh dMφ亚群,其通过抑制子宫螺旋动脉重塑发挥作用,并阐明了其与胎盘来源的galectin-9的关系 | 临床实验证据需要进一步验证以确认galectin-9作为预测先兆子痫的生物标志物的有效性 | 探讨CD11chigh dMφ在先兆子痫中的作用及其潜在机制 | 研究对象包括孕妇和小鼠模型,以及相关的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 条件性基因敲除小鼠和一种新的先兆子痫小鼠模型 | 生物样本 | 多个独立的先兆子痫小鼠模型以及一项回顾性先兆子痫队列研究 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-04 |
LINC00330/CCL2 axis-mediated ESCC TAM reprogramming affects tumor progression
2024-May-20, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-024-00592-8
PMID:38769475
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研究论文 | 本研究探讨了LINC00330/CCL2轴介导的肿瘤相关巨噬细胞(TAM)重编程在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 揭示了LINC00330通过破坏CCL2/CCR2轴和其下游信号通路来抑制ESCC进展的新机制 | 在研究中未提及样本容量和具体的实验设计限制 | 研究LINC00330在ESCC进展中对TAM重编程的影响 | 食管鳞状细胞癌相关的长期非编码RNA和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 转录组测序 | NA | 临床样本和单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-04 |
Improving replicability in single-cell RNA-Seq cell type discovery with Dune
2024-May-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05814-6
PMID:38789920
|
研究论文 | 本文提出了一种新方法Dune,用于优化单细胞RNA-Seq中细胞类型发现的簇分辨率和可重复性之间的权衡 | Dune通过迭代合并簇来最大化不同分区之间的一致性,改善了集群分析的稳健性 | 本文未提及具体限制因素 | 旨在提高单细胞转录组测序中细胞分类的可靠性和再现性 | 涉及单细胞RNA-Seq数据集中的细胞类型分类 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用来自不同平台的多个数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-05 |
Identifying potential drug targets for keloid: A Mendelian randomization study
2024-May-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.04.023
PMID:38797322
|
研究论文 | 本文识别了瘢痕疙瘩的潜在药物靶点 | 通过孟德尔随机化研究发现七种潜在的药物靶点,特别强调了NTM的临床相关性 | 本研究可能受限于样本量和数据库的可用性 | 识别瘢痕疙瘩的药物靶点以改进治疗效果 | 靶向瘢痕疙瘩的七种蛋白质 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 孟德尔随机化分析 | NA | 蛋白质数据, scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-04 |
The Identification of RPL4 as a Hub Gene Associated with Goat Litter Size via Weighted Gene Co-Expression Network Analysis
2024-May-15, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14101470
PMID:38791687
|
研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析识别出与山羊窝重相关的枢纽基因RPL4 | 揭示了RPL4基因在山羊生育能力中的重要作用,为评估山羊窝重提供了生物标志物 | 未提及样本的地理分布和环境影响因素 | 探索与山羊生殖性能相关的标志基因 | 山羊卵母细胞中的基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 卵母细胞数据集GSE136005来自GEO数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-04 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatotoxic analgesic generating AM404 in the midbrain PAG region
2024-05-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61791-z
PMID:38750093
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研究论文 | 本文开发了一种无肝毒性的非阿片类小分子SRP-001,能够有效管理疼痛且安全性高 | SRP-001不会产生肝毒性代谢物,且在高剂量下保护肝脏紧密连接的完整性 | 研究主要集中在小鼠模型上,临床应用仍需进一步验证 | 研究一种新的非肝毒性镇痛药SRP-001及其机制 | CD-1小鼠及其对SRP-001和ApAP的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 生物医学数据 | CD-1小鼠,具体样本量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-05 |
Identifying Key Regulatory Genes in Drug Resistance Acquisition: Modeling Pseudotime Trajectories of Breast Cancer Single-Cell Transcriptome
2024-May-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16101884
PMID:38791962
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研究论文 | 本文提出了一种结合数学建模和伪时间分析的方法,以研究乳腺癌单细胞转录组中的药物耐药性关键调控基因 | 创新点在于使用时间序列scRNA-seq数据和单基因数学模型,识别了约560-680个表现多稳定表达状态的基因 | 对分子系统层面动态细胞转变的理解仍然有限 | 研究药物耐药性获得的关键调控基因 | MCF-7乳腺癌细胞系在他莫昔芬处理下的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 单基因数学模型 | 基因表达数据 | 6000个基因的多个亚群体 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-05 |
A Gold Standard-Derived Modular Barcoding Approach to Cancer Transcriptomics
2024-May-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16101886
PMID:38791964
|
研究论文 | 本文提出了一种灵活条形码的癌症转录组学方法,将癌症特异性基因表达模块组合成便于管理的信息。 | 创新点在于采用高质量金标准导出的模块捕捉与特定癌症类型相关的功能性基因,提供了快速有效的假设生成和测试方式 | 本研究的局限性在于未提供与不同癌症类型之间更广泛的数据对比 | 研究目的在于简化癌症转录组信息,以便于更广泛的研究和临床应用 | 研究对象为癌症类型特异性的基因表达模块 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-05 |
Deciphering the Genetic Links between Psychological Stress, Autophagy, and Dermatological Health: Insights from Bioinformatics, Single-Cell Analysis, and Machine Learning in Psoriasis and Anxiety Disorders
2024-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105387
PMID:38791423
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研究论文 | 本研究探讨了心理压力、自噬相关基因与皮肤健康之间的关系,特别关注银屑病与焦虑障碍的共病机制 | 揭示了银屑病与焦虑障碍之间可能存在的共享生物机制及其潜在生物标志物 | 样本数据来源于GEO数据库,未具体提及样本的多样性和数据的全面性 | 探索银屑病与焦虑障碍之间的共病机制 | 银屑病与焦虑障碍相关的数据和基因 | 机器学习 | 银屑病 | 单细胞RNA测序分析 | 机器学习算法 | 基因数据 | 未具体提及样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-04 |
Special Issue "Cancer Immunotherapy: Tumor Microenvironment, Biomarker Discovery and Immune Resistance"
2024-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105113
PMID:38791152
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研究论文 | 该特刊汇集了癌症免疫治疗领域的最新研究成果和进展 | 介绍了新型药物开发和机制理解的最新进展 | 未提及具体的研究限制 | 推动对癌症免疫治疗领域新的理解和技术应用 | 癌症免疫治疗相关的肿瘤微环境、生物标志物和免疫耐受性 | 数字病理学 | 癌症 | 人工智能,机器学习,单细胞测序,空间分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-04 |
Spotless, a reproducible pipeline for benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics
2024-May-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88431
PMID:38787371
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研究论文 | 本文介绍了一个可重复的管道,用于基准测试空间转录组学中的细胞类型去卷积方法 | 开发了一个模拟引擎生成银标准,并比较了11种去卷积方法的性能 | 在细胞类型极为丰富或稀少的数据集中,所有方法的性能显著下降 | 研究空间转录组学中细胞类型的去卷积技术的有效性 | 基于63个银标准、3个金标准和2个案例研究进行评估 | 数字病理学 | 肝脏疾病与黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 简单回归模型 | 转录组数据 | 63个银标准和2个案例研究 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-05 |
Single-Cell Gene-Regulatory Networks of Advanced Symptomatic Atherosclerosis
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323184
PMID:38639096
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研究论文 | 本研究探讨了在动脉粥样硬化进展过程中单细胞基因表达模式的临床和病理生理相关性 | 首次通过整合高基因丰度的单细胞亚群与冠状动脉疾病基因调控网络,确认GRN39在促进晚期、症状性动脉粥样硬化中的关键作用 | 对单细胞转录组数据的详细理解仍然不足,且临床适用性需要进一步验证 | 揭示动脉粥样硬化发病机制的细胞遗传调控网络 | 在Ldlr-/-Apob100/100小鼠模型和人类样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 16588个单细胞和600名冠状动脉疾病患者的基因组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-05 |
Metabolic pathway-based subtypes associate glycan biosynthesis and treatment response in head and neck cancer
2024-May-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00602-0
PMID:38783045
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于代谢通路的头颈癌分类,强调了富含糖类代谢的MPS1亚型的治疗挑战性 | 创新之处在于定义了代谢通路基础的亚型,并揭示了其与治疗反应之间的关联 | 缺乏对临床结果的全面分析以及可能的样本量不足 | 研究头颈鳞状细胞癌的代谢异质性及其对临床结果的影响 | 四个独立临床队列中的头颈鳞状细胞癌转录组数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个独立的临床队列 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-05 |
In-depth organic mass cytometry reveals differential contents of 3-hydroxybutanoic acid at the single-cell level
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48865-2
PMID:38782922
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研究论文 | 本文建立了一种深入的单细胞代谢组学平台,以揭示3-羟基丁酸在单细胞水平上的差异性含量 | 首次展示了MCF-7细胞内3-羟基丁酸水平的细致亚型分析 | 尚未提及该技术在其他细胞类型或生物体中的应用效果 | 旨在通过单细胞代谢组学探讨癌症细胞在氧化应激下的异质性 | 研究对象为MCF-7细胞及其3-羟基丁酸的代谢特征 | 数字病理学 | 癌症 | 有机质谱细胞术 | NA | 代谢数据 | 单细胞,约600种代谢物 | NA | NA | NA | NA |