单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 540 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-04 |
Special Issue "Cancer Immunotherapy: Tumor Microenvironment, Biomarker Discovery and Immune Resistance"
2024-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105113
PMID:38791152
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研究论文 | 该特刊汇集了癌症免疫治疗领域的最新研究成果和进展 | 介绍了新型药物开发和机制理解的最新进展 | 未提及具体的研究限制 | 推动对癌症免疫治疗领域新的理解和技术应用 | 癌症免疫治疗相关的肿瘤微环境、生物标志物和免疫耐受性 | 数字病理学 | 癌症 | 人工智能，机器学习，单细胞测序，空间分析 | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-04 |
Spotless, a reproducible pipeline for benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics
2024-May-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88431
PMID:38787371
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研究论文 | 本文介绍了一个可重复的管道，用于基准测试空间转录组学中的细胞类型去卷积方法 | 开发了一个模拟引擎生成银标准，并比较了11种去卷积方法的性能 | 在细胞类型极为丰富或稀少的数据集中，所有方法的性能显著下降 | 研究空间转录组学中细胞类型的去卷积技术的有效性 | 基于63个银标准、3个金标准和2个案例研究进行评估 | 数字病理学 | 肝脏疾病与黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 简单回归模型 | 转录组数据 | 63个银标准和2个案例研究 |
| 383 | 2024-08-05 |
Single-Cell Gene-Regulatory Networks of Advanced Symptomatic Atherosclerosis
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323184
PMID:38639096
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研究论文 | 本研究探讨了在动脉粥样硬化进展过程中单细胞基因表达模式的临床和病理生理相关性 | 首次通过整合高基因丰度的单细胞亚群与冠状动脉疾病基因调控网络，确认GRN39在促进晚期、症状性动脉粥样硬化中的关键作用 | 对单细胞转录组数据的详细理解仍然不足，且临床适用性需要进一步验证 | 揭示动脉粥样硬化发病机制的细胞遗传调控网络 | 在Ldlr-/-Apob100/100小鼠模型和人类样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 16588个单细胞和600名冠状动脉疾病患者的基因组数据 |
| 384 | 2024-08-05 |
Metabolic pathway-based subtypes associate glycan biosynthesis and treatment response in head and neck cancer
2024-May-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00602-0
PMID:38783045
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于代谢通路的头颈癌分类，强调了富含糖类代谢的MPS1亚型的治疗挑战性 | 创新之处在于定义了代谢通路基础的亚型，并揭示了其与治疗反应之间的关联 | 缺乏对临床结果的全面分析以及可能的样本量不足 | 研究头颈鳞状细胞癌的代谢异质性及其对临床结果的影响 | 四个独立临床队列中的头颈鳞状细胞癌转录组数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个独立的临床队列 |
| 385 | 2024-08-05 |
In-depth organic mass cytometry reveals differential contents of 3-hydroxybutanoic acid at the single-cell level
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48865-2
PMID:38782922
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研究论文 | 本文建立了一种深入的单细胞代谢组学平台，以揭示3-羟基丁酸在单细胞水平上的差异性含量 | 首次展示了MCF-7细胞内3-羟基丁酸水平的细致亚型分析 | 尚未提及该技术在其他细胞类型或生物体中的应用效果 | 旨在通过单细胞代谢组学探讨癌症细胞在氧化应激下的异质性 | 研究对象为MCF-7细胞及其3-羟基丁酸的代谢特征 | 数字病理学 | 癌症 | 有机质谱细胞术 | NA | 代谢数据 | 单细胞，约600种代谢物 |
| 386 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2024-May-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06319-x
PMID:38783104
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-04 |
A Spatial Transcriptomics Browser for Discovering Gene Expression Landscapes across Microscopic Tissue Sections
2024-May-13, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46050284
PMID:38785552
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研究论文 | 本研究开发了一个空间转录组浏览器，以便在微观组织切片中发现基因表达图景 | 该工具应用了自组织映射(SOM)机器学习方法来分析空间转录组数据，生成每个点的基因表达景观 | 文章未提及具体的样本量和该工具的局限性 | 研究空间转录组技术在细胞生态系统组织和相互作用知识挖掘中的应用 | 主要研究内容为单基因表达、功能基因集表达以及细胞间相互作用的空间模式 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组 | 自组织映射(SOM) | 图像 | 使用了小鼠脑组织和黑色素瘤的相关组织样本 |
| 388 | 2024-08-05 |
Deciphering infected cell types, hub gene networks and cell-cell communication in infectious bronchitis virus via single-cell RNA sequencing
2024-May, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012232
PMID:38743760
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序系统性研究感染性支气管炎病毒对细胞类型和细胞间通讯的影响 | 首次系统性鉴定了特定细胞类型中表达的组织特异性分子标志物和相应的基因网络 | 未提及样本数量的具体细节及其在研究中的影响 | 探讨感染性支气管炎病毒在小鸡中的致病机制及其对免疫反应的影响 | 研究感染性支气管炎病毒感染后的肾脏、法氏囊和气管组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 389 | 2024-08-05 |
Integrating phylogenies into single-cell RNA sequencing analysis allows comparisons across species, genes, and cells
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002633
PMID:38787797
|
研究论文 | 本文探讨了将系统发育整合到单细胞RNA测序分析中的应用，以比较物种、基因和细胞之间的联系 | 提出了将系统发育方法整合进scRNA-seq分析中，以克服物种间比较的挑战并加强基因和细胞演化假设的验证 | NA | 实现跨物种、基因和细胞的比较，揭示细胞基因表达与细胞功能演化之间的联系 | 单细胞RNA测序数据及其在不同物种和细胞中的比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 系统发育树 | RNA序列 | NA |
| 390 | 2024-08-05 |
Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders
2024-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1699
PMID:38783408
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研究论文 | 这项研究展示了HIV感染患者肠道粘膜免疫细胞的转录组特征 | 研究发现免疫非应答者在肠道浆细胞的比例低于免疫应答者，并探讨了记忆B细胞和滤泡B细胞向浆细胞转化的障碍 | 样本数量有限，只有少数免疫非应答者被纳入研究 | 探讨HIV感染患者中的肠道粘膜免疫细胞在免疫恢复中的作用 | 研究对象包括HIV阴性对照、免疫应答者和免疫非应答者 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据及免疫细胞分析数据 | 54,475个免疫细胞来自五个HIV阴性对照、九个免疫应答者和三个免疫非应答者 |
| 391 | 2024-08-05 |
Cardiopulmonary progenitors facilitate cardiac repair via exosomal transfer of miR-27b-3p targeting the SIK1-CREB1 axis
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13593
PMID:38185757
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研究论文 | 这篇文章探讨了心肺前体细胞在心脏修复中的作用，特别是通过外泌体转移miR-27b-3p靶向SIK1-CREB1轴来促进心脏修复 | 该研究首次揭示心肺前体细胞通过外泌体转移miR-27b-3p促进心脏修复的机制 | 研究只在小鼠模型中进行，临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证 | 研究心肺前体细胞在缺血性心脏疾病中修复受损心脏的机制 | 本研究对象为小鼠胚胎衍生的心肺前体细胞 | 数字病理学 | 缺血性心脏病 | scRNA-seq, miRNA-seq, RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 细胞, RNA | 使用E9.5小鼠胚胎获取心肺前体细胞，具体样本数量未提及 |
| 392 | 2024-08-04 |
Multiregional transcriptomics identifies congruent consensus subtypes with prognostic value beyond tumor heterogeneity of colorectal cancer
2024-May-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48706-2
PMID:38773143
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研究论文 | 研究多区域转录组学在结直肠癌中的预后价值及其对肿瘤异质性的影响 | 首次通过多区域转录组学探究了结直肠癌中的凝聚共识分型及其预后能力 | 该研究仅基于单个医院的样本，可能限制了结果的广泛适用性 | 评估转录组异质性对结直肠癌预后的影响及其分类能力 | 对来自692名患者的1093个肿瘤样本进行研究，包括98个原发肿瘤和35对原发-转移样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 1093个肿瘤样本，来自692名患者 |
| 393 | 2024-08-04 |
A comparative study on the dose-effect of low-dose radiation based on microdosimetric analysis and single-cell sequencing technology
2024-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62501-5
PMID:38773212
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研究论文 | 本研究探讨了低剂量辐射对BEAS-2B细胞系的潜在机制 | 使用微剂量分析和单细胞测序技术，提供了选择对低剂量辐射反应敏感生物标志物的新视角 | 研究中的数值不确定性可能影响微剂量与基因表达的相关性 | 深入探索低剂量辐射诱发的生物机制 | BEAS-2B细胞系及其对低剂量辐射的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 蒙特卡罗模型 | 细胞能量分布和基因表达数据 | NA |
| 394 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of KLF family reveals KLF6 as a promising prognostic and immune biomarker in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-May-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03369-3
PMID:38773440
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研究论文 | 本研究全面分析了KLF家族，并揭示KLF6作为胰腺导管腺癌中有前景的预后和免疫生物标志物 | 本研究提出KLF6是胰腺导管腺癌中一个新的诊断生物标志物，并作为潜在治疗靶点 | 未在临床上验证KLF6的作用及其作为生物标志物的应用效果 | 探讨KLF家族基因在胰腺导管腺癌中的生物学功能及其临床意义 | 研究胰腺导管腺癌中的KLF家族基因及其表达模式 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox回归模型 | 转录组数据 | 包含了大量胰腺癌患者的转录组样本 |
| 395 | 2024-08-05 |
Dynamic changes in B cell subpopulations in response to triple-negative breast cancer development
2024-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60243-y
PMID:38773133
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研究论文 | 本文探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）发展过程中B细胞亚群的动态变化 | 本研究揭示了LAG-3 + B细胞在三阴性乳腺癌中的潜在良好预后意义，并提出其可能成为靶向治疗的新方向 | 需要更多研究来揭示这些细胞的机制路径，并在更大、更多样化的患者群体中验证其预后价值 | 研究B细胞在三阴性乳腺癌发展过程中的响应变化及其预后关联 | 使用小鼠模型探讨B细胞在肿瘤相关淋巴结中的反应 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 研究涉及TNBC患者的转录组数据 |
| 396 | 2024-08-05 |
Tenascin C as a novel zinc finger protein 750 target regulating the immunogenicity via DNA damage in lung squamous cell carcinoma
2024-May-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12285-8
PMID:38711034
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研究论文 | 本研究揭示了锌指蛋白750（ZNF750）通过调节tenascin C（TNC）在肺鳞状细胞癌中的免疫原性和DNA损伤修复机制 | 首次提出ZNF750-TNC轴在肺鳞状细胞癌中的作用，以及其对免疫原性和DNA损伤修复的影响 | 尚未在临床环境中验证研究结果 | 探讨ZNF750-TNC轴在肺鳞状细胞癌中对DNA损伤修复和免疫原性的调节作用 | 研究对象为肺鳞状细胞癌中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | 肺鳞状细胞癌样本的单细胞测序数据 |
| 397 | 2024-08-04 |
scmFormer Integrates Large-Scale Single-Cell Proteomics and Transcriptomics Data by Multi-Task Transformer
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307835
PMID:38483032
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研究论文 | 提出了一种新的单细胞多模态/多任务变换器 scmFormer，以整合单细胞蛋白组学与其他组学数据 | scmFormer 通过系统基准测试展示了在整合大规模单细胞多模态数据和异质多批次配对多组学数据方面的优势 | NA | 研究旨在填补整合单细胞蛋白组学和其他组学数据的现有空白 | 主要研究对象为大规模单细胞多组学数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞 RNA 测序 | 变换器 | 细胞数据 | 超过 148 万个细胞 |
| 398 | 2024-08-05 |
Specific lineage transition of tumor-associated macrophages elicits immune evasion of ascitic tumor cells in gastric cancer with peritoneal metastasis
2024-05, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-024-01486-6
PMID:38460015
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研究论文 | 本研究系统评估了腹水中与肿瘤相关的巨噬细胞的特定谱系转变以及其对胃癌伴腹膜转移的免疫逃逸的影响 | 首次识别了来自PM-GC患者腹水中的CTShigh到C1Qhigh巨噬细胞的免疫抑制转变 | 本研究的局限性在于样本数量和来源的多样性可能影响结果的普遍性 | 旨在探讨腹水中肿瘤微环境在胃癌伴腹膜转移中的免疫抑制作用及其导致治疗失败的机制 | 研究对象为51名PM-GC患者的63个腹水样本和43个外周血样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 生物样本 | 51名PM-GC患者的63个腹水样本和43个外周血样本 |
| 399 | 2024-08-04 |
Multiomics integration reveals NETosis heterogeneity and TLR2 as a prognostic biomarker in pancreatic cancer
2024-May-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00586-x
PMID:38769374
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中NETosis的异质性及TLR2作为预后生物标志物的作用 | 通过单细胞RNA测序、空间RNA测序和多组学方法，建立了多组学预后模型，并确认了TLR2在患者预后中的重要性 | 研究的样本可能存在选择偏差，且标志物的适用性需要进一步验证 | 探讨胰腺癌微环境中NETosis的异质性及其预后相关因素 | 该研究对象为胰腺导管腺癌患者的肿瘤微环境及其免疫细胞特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序, 多组学分析 | NA | 数据集 | 使用了已发表的数据集和内部患者队列 |
| 400 | 2024-08-04 |
Bio-nanoparticles loaded with synovial-derived exosomes ameliorate osteoarthritis progression by modifying the oxidative microenvironment
2024-May-20, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02538-w
PMID:38769545
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研究论文 | 本研究旨在开发一种负载SOD3富集外泌体的水凝胶微球，以保护软骨并为骨关节炎治疗引入新的有效方法 | 首次使用S-EXOs负载的水凝胶微球对软骨进行保护，并提出了一种创新的骨关节炎治疗方案 | 本研究未对长时间使用S-EXOs的潜在副作用进行详细评估 | 研究S-EXOs在骨关节炎中的保护机制及其治疗潜力 | 聚焦于软骨细胞和外泌体（EXOs）在骨关节炎中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, PCR, 西方印迹, 免疫荧光 | NA | 细胞, 组织 | 4247个细胞 |