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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-05 |
CCR5-overexpressing mesenchymal stem cells protect against experimental autoimmune uveitis: insights from single-cell transcriptome analysis
2024-May-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03134-3
PMID:38802924
|
研究论文 | 研究CCR5过表达的间充质干细胞在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的保护作用 | 本研究首次显示CCR5在间充质干细胞中过表达可以增强其归巢能力并改善其免疫调节效果,从而预防实验性自身免疫性葡萄膜炎 | 本研究主要基于小鼠模型,临床应用效果和机制仍需进一步验证 | 探讨自身免疫性葡萄膜炎的病理机制及基于间充质干细胞的治疗策略 | 小鼠模型以经典的实验性自身免疫性葡萄膜炎为研究对象 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | scRNA-seq, RNA-seq | NA | RNA序列 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-05 |
Deciphering bat influenza H18N11 infection dynamics in male Jamaican fruit bats on a single-cell level
2024-May-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48934-6
PMID:38802391
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自热带果蝠感染的流感病毒H18N11的免疫反应动态 | 首次在单细胞水平上解析了果蝠对流感病毒H18N11的免疫反应 | 研究仅限于雄性牙买加果蝠,可能无法代表其他性别或种群的反应 | 深入了解果蝠对病毒感染的免疫反应 | 雄性牙买加果蝠及其感染的流感病毒H18N11 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 雄性牙买加果蝠若干个体的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-05 |
Integrative analysis indicates the potential values of ANKRD53 in stomach adenocarcinoma
2024-May-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01054-5
PMID:38801557
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研究论文 | 本研究通过整合分析探讨了ANKRD53在胃腺癌中的潜在价值 | 提出ANKRD53作为胃腺癌的独立预测生物标志物,并与其他临床病理参数结合创建预后列线图 | 未提及 | 研究ANKRD53在胃腺癌中的作用及其预后潜力 | 胃腺癌样本及相关细胞系 | 数字病理 | 胃癌 | RNA-seq和scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | STAD样本与正常样本的比较 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-05 |
Deciphering anoikis resistance and identifying prognostic biomarkers in clear cell renal cell carcinoma epithelial cells
2024-05-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62978-0
PMID:38802480
|
研究论文 | 本研究针对透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的预后和管理挑战进行探讨 | 通过开发新的风险预后模型,识别了与抗坏死相关的关键预后基因,并整合了临床参数进行预测 | 研究的样本规模相对较小,仅涉及七名ccRCC患者 | 研究的目的是揭示ccRCC中的坏死抵抗机制,并识别预后生物标志物 | 研究对象为透明细胞肾细胞癌的上皮细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO和多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 七名ccRCC患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-05 |
Sustained neurotrophic factor cotreatment enhances donor and host retinal ganglion cell survival in mice
2024-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.07.583961
PMID:38558999
|
研究论文 | 本文探讨了神经生长因子的联合治疗如何增强小鼠捐赠者和宿主视网膜神经节细胞的存活 | 首次提出通过使用缓释BDNF和GDNF以改善视网膜微环境,从而增加视网膜神经节细胞存活和功能 | 研究中主要采用小鼠模型,可能无法完全反映人类的生理和病理情况 | 探讨神经生长因子在视网膜神经节细胞移植中的应用潜力 | 研究对象为视网膜神经节细胞及其成长的微环境 | 数字病理 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 数据集 | 涉及人类胎儿视网膜的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-05 |
Comprehensive data mining reveals RTK/RAS signaling pathway as a promoter of prostate cancer lineage plasticity through transcription factors and CNV
2024-05-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62256-z
PMID:38778150
|
研究论文 | 本研究揭示了RTK/RAS信号通路通过转录因子和CNV促进前列腺癌谱系可塑性 | 探索了RTK/RAS信号通路与前列腺癌谱系可塑性之间的综合联系,发现了多个新的相关基因 | 对RTK/RAS信号通路与谱系可塑性之间复杂调控网络的探索仍然有限 | 调查RTK/RAS信号通路在前列腺癌谱系可塑性中的作用 | 涉及前列腺癌细胞及其谱系可塑性的多组学数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多组学分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及前列腺癌细胞的多组学数据 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Dynamic Populations of Vascular Cells in Neointimal Hyperplasia
2024-May-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2905173
PMID:38812305
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了新生内膜增生中血管细胞的动态群体。 | 揭示了新生内膜增生中血管细胞的高度异质性,并识别了14个细胞簇和7种细胞类型,重点关注了特定的亚群体。 | 本研究主要基于小鼠模型,可能不能完全代表人类疾病的复杂性。 | 研究新生内膜增生中血管细胞的异质性及其相互作用。 | 小鼠模型中的血管细胞,特别是内皮细胞、血管平滑肌细胞和成纤维细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的左侧颈动脉与右侧颈动脉对照 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-05 |
Bioinformatics Analysis Reveals Prognostic Significance of the Macrophage Marker Gene Signature in Gastric Adenocarcinoma
2024-May-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2905172
PMID:38812299
|
研究论文 | 本文分析了巨噬细胞标记基因特征在胃腺癌中的预后意义 | 研究构建了一个基于巨噬细胞标记基因特征的风险评分模型,以预测胃腺癌患者的预后 | NA | 评估巨噬细胞标记基因特征在胃腺癌患者预后中的作用 | 胃腺癌患者的个体临床数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,RNA-seq | 风险评分模型,列线图模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell RNA sequencing reveal the contribution of laminin γ2 -CD44 to the immune resistance in lymphocyte-infiltrated squamous lung cancer subtype
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31299
PMID:38803944
|
研究论文 | 本文分析了LUSC中间质微环境的异质性及其导致免疫耐受的分子机制 | 识别了LUSC中一种淋巴细胞浸润亚型CS3,以及LAMC2和CD44的共同高表达与免疫耐受的关系 | 本研究为回顾性分析,可能受到样本选择偏差的影响 | 旨在探讨导致LUSC患者免疫耐受的特征和分子机制,以改善免疫疗法的效果 | 包含513个LUSC样本的RNA测序数据及其单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 513个LUSC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomic brain imaging reveals the effects of immunomodulation therapy on specific regional brain cells in a mouse dementia model
2024-May-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10434-8
PMID:38796425
|
研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析了免疫调节治疗对小鼠痴呆模型中大脑特定区域细胞的影响 | 开发了一个适用于条形码空间转录组学的分析工作流,并提供了名为STquantool的定制分析管道 | 未提及具体的样本大小和实验限制 | 研究免疫调节治疗在阿尔茨海默病中的有效性及其对大脑细胞的影响 | 小鼠阿尔茨海默病模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 10x Genomics Visium | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-05 |
irGSEA: the integration of single-cell rank-based gene set enrichment analysis
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae243
PMID:38801700
|
研究论文 | irGSEA是一个R包,用于评估不同基因集评分方法在单细胞RNA测序数据中的结果。 | 该包整合了六种基于基因表达排名的评分方法,并使用稳健的排名聚合算法汇总结果。 | 未提及具体的限制 | 评估多种基因集评分方法在单细胞RNA测序数据的表现。 | 单细胞RNA测序数据中的基因集评分方法。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 表达矩阵 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-04 |
Bi-allelic variants in chromatoid body protein TDRD6 cause spermiogenesis defects and severe oligoasthenoteratozoospermia in humans
2024-May-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109766
PMID:38341271
|
研究论文 | 本研究探讨了TDRD6变异与人类不孕症之间的关联。 | 首次识别出五名中国不育男性中的双等位TDRD6变异,并揭示其在精子发生中的关键角色。 | 仅涉及五名患者,样本量较小,结果可能无法普遍适用。 | 研究TDRD6变异与人类精子发生缺陷之间的关系。 | 不孕男性及其变异的TDRD6基因。 | 数字病理学 | 生育障碍 | 全外显子测序,单细胞RNA测序,定量RT-PCR | CRISPR-Cas9系统的小鼠模型 | 基因组数据,RNA数据 | 5名不育男性 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-05 |
Malignant transformation of white sponge nevus: a case report of a novel keratin 4 mutation
2024-May-21, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-024-04300-y
PMID:38773401
|
病例报告 | 本文报告了一例白色海绵痣的恶性转化,并识别出KRT4基因的独特突变 | 识别出一种新的KRT4基因插入突变,并提出其可能与白色海绵痣的恶性转化相关 | 仅基于单例病例的观察,缺乏更大样本的验证研究 | 探讨白色海绵痣的恶性转化及其潜在的遗传因素 | 一例70岁男性患者的白色海绵痣病例 | NA | 口腔疾病 | 外显子测序以及单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 1例 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the intra-tumoral heterogeneity and SQSTM1/P62 and Wnt/β-catenin mediated epithelial to mesenchymal transition and stemness of triple-negative breast cancer
2024-May-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114032
PMID:38583856
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性和相关信号通路的角色 | 本研究首次系统分析了SQSTM1/P62和Wnt/β-catenin在三阴性乳腺癌中介导上皮-间质转化及干性中的作用 | 虽然SQSTM1/P62对细胞存活并非至关重要,但其在EMT及干性标志物的分子修饰中的作用仍需进一步验证 | 探讨SQSTM1/P62和Wnt/β-catenin在三阴性乳腺癌进展中的机制 | 三阴性乳腺癌及正常患者来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因和蛋白表达数据 | 三阴性乳腺癌和正常患者来源的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-05 |
FCRL3 expression is upregulated and closely correlates with TIGIT expression in regulatory T cells of patients with systemic lupus erythematosus
2024-May, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350739
PMID:38461541
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研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮患者调节性T细胞中FCRL3和TIGIT的表达关系 | 发现FCRL3在系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞中表达上调,并与TIGIT表达呈正相关 | 未提及具体的样本数量和多样性 | 研究FCRL3和TIGIT在调节性T细胞中的共表达情况 | 系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序与流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-05 |
Novel insights into the protective effects of leonurine against acute kidney injury: Inhibition of ER stress-associated ferroptosis via regulating ATF4/CHOP/ACSL4 pathway
2024-May-25, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2024.111016
PMID:38670420
|
研究论文 | 本研究探讨了药用成分leonurine在急性肾损伤中的保护作用及其机制 | 首次揭示了leonurine通过调节ATF4/CHOP/ASCL4信号通路抑制与内质网应激关联的铁死亡 | 未提及该研究的具体局限性 | 研究leonurine对急性肾损伤的益处及其作用机制 | 急性肾损伤模型中的leonurine的治疗效果 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | NA | NA | 组织学数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-05 |
Benchmarking mapping algorithms for cell-type annotating in mouse brain by integrating single-nucleus RNA-seq and Stereo-seq data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae250
PMID:38796691
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研究论文 | 本文评估了九种映射算法在小鼠大脑空间转录组数据的细胞类型注释中的应用 | 提出了一种评估映射算法适用性的工作流,能够提高空间数据注释的效率和准确性 | 关于这些算法在Stereo-seq ST数据上的准确性评估仍未解决 | 阐明小鼠大脑区域中空间转录组数据的细胞类型注释问题 | 使用不同分辨率的10个ST数据集和24个伪ST数据集进行算法比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 空间转录组数据 | 10个ST数据集和24个伪ST数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-04 |
A Galectin-9-Driven CD11chigh Decidual Macrophage Subset Suppresses Uterine Vascular Remodeling in Preeclampsia
2024-May-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了CD11chigh胎盘巨噬细胞亚群在先兆子痫的形成中抑制子宫血管重塑的作用 | 发现了一个独特的CD11chigh dMφ亚群,其通过抑制子宫螺旋动脉重塑发挥作用,并阐明了其与胎盘来源的galectin-9的关系 | 临床实验证据需要进一步验证以确认galectin-9作为预测先兆子痫的生物标志物的有效性 | 探讨CD11chigh dMφ在先兆子痫中的作用及其潜在机制 | 研究对象包括孕妇和小鼠模型,以及相关的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 条件性基因敲除小鼠和一种新的先兆子痫小鼠模型 | 生物样本 | 多个独立的先兆子痫小鼠模型以及一项回顾性先兆子痫队列研究 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-04 |
LINC00330/CCL2 axis-mediated ESCC TAM reprogramming affects tumor progression
2024-May-20, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-024-00592-8
PMID:38769475
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研究论文 | 本研究探讨了LINC00330/CCL2轴介导的肿瘤相关巨噬细胞(TAM)重编程在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 揭示了LINC00330通过破坏CCL2/CCR2轴和其下游信号通路来抑制ESCC进展的新机制 | 在研究中未提及样本容量和具体的实验设计限制 | 研究LINC00330在ESCC进展中对TAM重编程的影响 | 食管鳞状细胞癌相关的长期非编码RNA和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 转录组测序 | NA | 临床样本和单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-04 |
Improving replicability in single-cell RNA-Seq cell type discovery with Dune
2024-May-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05814-6
PMID:38789920
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研究论文 | 本文提出了一种新方法Dune,用于优化单细胞RNA-Seq中细胞类型发现的簇分辨率和可重复性之间的权衡 | Dune通过迭代合并簇来最大化不同分区之间的一致性,改善了集群分析的稳健性 | 本文未提及具体限制因素 | 旨在提高单细胞转录组测序中细胞分类的可靠性和再现性 | 涉及单细胞RNA-Seq数据集中的细胞类型分类 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用来自不同平台的多个数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |