单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202405-202405] [清除筛选条件]
当前共找到 539 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2025-10-05
Interleukin-1 receptor accessory protein blockade limits the development of atherosclerosis and reduces plaque inflammation
2024-05-07, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 研究通过新型抗IL1RAP阻断抗体探究其在动脉粥样硬化中的作用机制 首次使用非消耗性IL1RAP阻断抗体研究动脉粥样硬化,发现其能减少斑块大小和炎症细胞积累 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 探究IL1RAP在动脉粥样硬化发展中的作用及其治疗潜力 载脂蛋白E缺陷小鼠和人类动脉粥样硬化斑块样本 心血管疾病研究 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序,流式细胞术,组织学分析,体外细胞实验 动物疾病模型 基因表达数据,细胞计数数据,组织图像数据 未明确具体样本数量,使用Apoe-/-小鼠模型和人类斑块样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2025-10-05
Cardiac and perivascular myofibroblasts, matrifibrocytes, and immune fibrocytes in hypertension; commonalities and differences with other cardiovascular diseases
2024-05-07, Cardiovascular research IF:10.2Q1
综述 探讨高血压中心脏和血管周围成纤维细胞亚群的分类、调控机制及其在心血管纤维化中的作用 提出成纤维细胞亚群(肌成纤维细胞、基质纤维细胞和免疫纤维细胞)在反应性纤维化中的新型作用机制 分子机制尚未完全明确,主要依赖实验模型推导 阐明高血压相关心血管纤维化的细胞分子机制 心脏和血管周围成纤维细胞亚群 心血管病理学 心血管疾病 谱系追踪,单细胞RNA测序 NA 实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
23 2025-10-06
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-May-03, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 开发了一种用于骨组织空间转录组学分析的方法,能够有效处理新鲜骨组织和存档样本 解决了硬组织样本在空间转录组学分析中的技术难题,特别是骨组织的脱钙处理与RNA保存的平衡 方法主要针对骨组织,对其他硬组织的适用性需要进一步验证 开发适用于骨组织的空间转录组学分析方法 骨组织样本,包括新鲜骨组织和组织库中的存档样本 空间转录组学 骨肉瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据,组织形态学数据 骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本 NA 空间转录组学 NA NA
24 2025-10-06
Integrating single-cell and spatial analysis reveals MUC1-mediated cellular crosstalk in mucinous colorectal adenocarcinoma
2024-05, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,系统分析黏液性结直肠腺癌的肿瘤微环境,揭示MUC1介导的细胞间相互作用机制 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析MCA肿瘤微环境,发现MUC1+肿瘤细胞与ZEB1+内皮细胞的关键相互作用 研究样本量有限,需要更大规模队列验证发现 深入理解黏液性结直肠腺癌肿瘤微环境的细胞间相互作用机制 黏液性结直肠腺癌患者组织样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 三维生物打印, 免疫荧光染色 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
25 2025-10-06
Melanocyte stem cells in the skin: Origin, biological characteristics, homeostatic maintenance and therapeutic potential
2024-05, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
综述 本文全面概述皮肤黑色素细胞干细胞的起源、生物学特性、稳态维持及治疗潜力 重点强调单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9技术和实用模型在黑色素细胞干细胞研究中的重要意义 NA 探讨黑色素细胞干细胞在皮肤组织稳态维持和疾病治疗中的潜在应用价值 哺乳动物毛囊、表皮或汗腺中的黑色素细胞干细胞 再生医学 皮肤色素障碍疾病 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9技术 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2025-10-06
Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders
2024-05, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析HIV感染者肠道黏膜免疫细胞,揭示免疫无应答者B细胞向浆细胞分化存在缺陷 首次在单细胞水平描绘HIV感染者肠道黏膜免疫细胞图谱,发现免疫无应答者滤泡/记忆B细胞向浆细胞分化存在障碍 样本量较小(仅17名参与者),需要更大规模研究验证 探究HIV感染者肠道黏膜免疫细胞在免疫恢复中的作用机制 HIV感染者肠道黏膜免疫细胞 单细胞生物学 HIV感染 单细胞RNA测序,免疫组化,16S rRNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,微生物组数据,流式细胞数据 17名参与者(5名HIV阴性对照,9名免疫应答者,3名免疫无应答者),54,475个免疫细胞 NA 单细胞RNA测序,16S rRNA测序 NA NA
27 2025-10-06
Transcriptomic and Proteomic Characterization of the Immune Response to Elective Spinal Reconstructive Surgery: Impact of Aging and Comparison with Traumatic Injury Response
2024-May-01, Journal of the American College of Surgeons IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过转录组学和蛋白质组学方法,比较了择期脊柱重建手术与创伤性损伤的免疫反应差异,并分析了年龄对免疫反应的影响 首次系统比较择期大手术与多发伤患者的免疫反应时序和细胞特征差异,揭示年龄对手术免疫反应的特异性影响 样本量较小(老年组5例,年轻组6例,创伤组8例),可能影响统计效力 探究择期脊柱重建手术与创伤性损伤的免疫应激反应差异及年龄因素的影响 接受择期脊柱重建手术的患者(分为老年组和年轻组)和匹配的创伤患者 免疫学 脊柱疾病 转录组测序,蛋白质组分析,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞数据 19例患者(手术组11例,创伤组8例) SomaLogic, O-link 单细胞RNA测序,蛋白质组分析 NA 双平台蛋白质组分析(SomaLogic和O-link),细胞转录组和表位测序索引
28 2025-10-06
Specific photoreceptor cell fate pathways are differentially altered in NR2E3-associated diseases
2024-05, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析NR2E3基因突变对视网膜光感受器细胞命运分化的影响 发现了一种先前未报道的锥细胞通路,可产生同时表达锥细胞和视杆细胞相关基因的杂交锥细胞 研究仅使用小鼠模型,未直接验证人类患者样本 解析NR2E3基因在视杆细胞和锥细胞转录网络中的精确功能 野生型和两种不同Nr2e3突变小鼠模型的视网膜组织 单细胞基因组学 视网膜营养不良 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 野生型和两种Nr2e3突变小鼠模型的视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
29 2025-10-06
MAPPING ALZHEIMER'S DISEASE PSEUDO-PROGRESSION WITH MULTIMODAL BIOMARKER TRAJECTORY EMBEDDINGS
2024-May, Proceedings. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging
研究论文 本研究提出了一种利用多模态生物标志物轨迹嵌入来映射阿尔茨海默病伪进展的新方法 将单细胞转录组学领域的PHATE和Slingshot机器学习方法应用于神经退行性疾病的多模态生物标志物数据分析 研究依赖于ADNI数据集,可能需要更多样化的数据验证方法的普适性 开发更精确的阿尔茨海默病进展建模和早期诊断方法 阿尔茨海默病患者的纵向多模态生物标志物数据 机器学习 阿尔茨海默病 PHATE, Slingshot, 轨迹嵌入 PHATE, Slingshot 医学影像, 多模态生物标志物数据 ADNI数据集中的多个疾病阶段个体 NA NA NA NA
30 2025-10-06
Identification of four mitochondria-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2024-05-16, BMC immunology IF:2.9Q3
研究论文 基于RNA测序技术鉴定脓毒症中四个线粒体相关基因 首次通过整合RNA测序数据和线粒体基因数据库,识别出与脓毒症预后相关的四个线粒体基因(FIS1, FKBP8, GLRX5, GUK1),并通过单细胞测序明确其在免疫细胞中的分布 样本量较小(脓毒症20例,SIRS 12例),需更大规模研究验证 阐明脓毒症免疫机制并为临床治疗提供新思路 脓毒症和全身炎症反应综合征(SIRS)患者外周血细胞 生物信息学 脓毒症 RNA测序,单细胞RNA测序,生物信息学分析 NA RNA测序数据,单细胞测序数据 脓毒症20例,SIRS 12例 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x单细胞测序平台
31 2025-10-06
Characterizing dysregulations via cell-cell communications in Alzheimer's brains using single-cell transcriptomes
2024-05-13, BMC neuroscience IF:2.4Q3
研究论文 利用单细胞转录组数据研究阿尔茨海默病大脑中细胞间通讯的失调特征 首次在大规模单核RNA测序数据上系统分析AD大脑中细胞间通讯网络的扰动,揭示细胞类型特异性信号传导失调机制 基于公开数据的二次分析,受原始数据质量和样本来源限制 研究阿尔茨海默病大脑中细胞间通讯网络的异常变化 人类前额叶皮层单核RNA测序数据 生物信息学 阿尔茨海默病 单核RNA测序 细胞通讯网络分析 单细胞转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
32 2025-10-06
Single-cell, single-nucleus, and spatial transcriptomics characterization of the immunological landscape in the healthy and PSC human liver
2024-05, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞、单核和空间转录组学技术,全面表征了健康人和原发性硬化性胆管炎患者肝脏的免疫景观 首次结合单细胞RNA测序、单核RNA测序和空间转录组学技术,系统构建了PSC肝脏的细胞图谱,并发现胆管细胞样肝细胞群体和髓系细胞耗竭样表型 样本量相对有限,主要关注晚期PSC病变,缺乏早期疾病阶段的分析 构建原发性硬化性胆管炎肝脏的全面细胞图谱,揭示疾病发病机制 人类肝脏组织(10例PSC患者、24例神经性死亡供体肝脏、3例PBC患者) 数字病理学 原发性硬化性胆管炎 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 NA 转录组数据, 空间定位数据, 蛋白质功能数据 47,156个细胞和23,000个细胞核(PSC),107,542个细胞(健康对照),18,240个细胞和20,202个细胞核(PBC) 10x Genomics, Nanostring 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Visium, Nanostring GeoMx DSP 10x Visium空间转录组技术, Nanostring GeoMx数字空间分析技术
33 2025-10-06
Beyond binary: bridging neutrophil diversity to new therapeutic approaches in NSCLC
2024-05, Trends in cancer IF:14.3Q1
综述 本文总结了非小细胞肺癌中肿瘤相关中性粒细胞的异质性研究,并提出超越传统N1/N2二分法的新分类框架 通过整合不同癌症实体的转录组数据,建立了具有明确表型特征的中性粒细胞亚群分类体系,突破了传统的二元分类模式 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证,分类体系需要进一步实验确认 探索中性粒细胞在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的异质性及其治疗应用潜力 肿瘤相关中性粒细胞(TANs) 单细胞生物学 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2025-10-06
Single-Cell Analyses Offer Insights into the Different Remodeling Programs of Arteries and Veins
2024-05-07, Cells IF:5.1Q2
研究论文 通过单细胞分析比较人类外周动脉和静脉的细胞组成差异,揭示血管重塑机制 首次在单细胞水平系统对比动脉和静脉的细胞图谱,发现静脉成纤维细胞在胶原产生和血管重塑中的独特作用 样本量相对有限(30例器官捐献者),主要关注上肢血管 探究动脉和静脉在闭塞性疾病和损伤反应中差异的生物学基础 人类外周动脉(肱动脉)和静脉(贵要静脉/头静脉) 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术, 组织学 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据, 组织图像 30例器官捐献者的动脉和静脉样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
35 2025-10-06
Integrated analysis of tumor-associated macrophages and M2 macrophages in CRC: unraveling molecular heterogeneity and developing a novel risk signature
2024-05-27, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据,开发了结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞和M2巨噬细胞的新型风险标志物 首次结合单细胞和批量RNA测序数据识别TAM-M2巨噬细胞相关基因,并构建了预后风险标志物TAMM2RS 需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 发现结直肠癌中TAM-M2巨噬细胞相关的新型生物标志物并解析分子异质性 结直肠癌患者样本 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, WGCNA, LASSO Cox分析, qPCR LASSO Cox回归模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq NA NA
36 2025-10-06
scRNA+TCR+BCR-seq revealed the proportions and gene expression patterns of dual receptor T and B lymphocytes in NPC and NLH
2024-05-21, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞多组学测序揭示鼻咽癌和鼻咽淋巴增生中双受体淋巴细胞的组成、克隆扩增及基因表达特征 首次在鼻咽癌和鼻咽淋巴增生中发现双受体淋巴细胞的存在,并证实其克隆扩增及谱系特征 样本量较小(7例NPC和3例NLH),需要更大规模研究验证 探究肿瘤微环境中双受体淋巴细胞的生物学特性和功能 鼻咽癌患者和鼻咽淋巴增生患者的淋巴细胞 单细胞组学 鼻咽癌 单细胞RNA测序,TCR测序,BCR测序 NA 单细胞转录组数据,免疫受体序列数据 7例鼻咽癌患者和3例鼻咽淋巴增生患者 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞免疫组库测序 NA scRNA+TCR+BCR-seq技术
37 2025-10-06
Identification of sepsis-associated mitochondrial genes through RNA and single-cell sequencing approaches
2024-05-03, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过RNA测序和单细胞测序方法识别与脓毒症相关的线粒体基因 整合高通量测序与生物信息学分析,首次发现COX7B和NDUFA4两个线粒体基因与脓毒症预后密切相关 样本量较小(20例脓毒症患者和10例健康对照),单细胞测序样本仅5例 识别脓毒症相关的线粒体生物标志物以提高诊断和预后准确性 脓毒症患者和健康志愿者的外周血样本 生物信息学 脓毒症 RNA测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 NA RNA测序数据, 单细胞测序数据 30例(20例脓毒症+10例健康对照)用于RNA-seq,5例用于单细胞测序 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
38 2025-10-06
Notch ligands are biomarkers of anti-TNF response in RA patients
2024-May, Angiogenesis IF:9.2Q1
研究论文 本研究探讨Notch配体在类风湿关节炎滑膜组织中的表达特征及其作为抗TNF治疗反应生物标志物的潜力 首次发现RA骨髓Notch配体可作为抗TNF治疗反应的标志物,并揭示其在FLS和内皮细胞中的转激活作用 研究样本量未明确说明,且主要基于转录组分析,缺乏蛋白质水平验证 阐明Notch通路在RA滑膜组织细胞中的功能意义及RA治疗对其表达的影响 类风湿关节炎患者的滑膜组织细胞,包括巨噬细胞、成纤维样滑膜细胞和内皮细胞 单细胞生物学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序,形态学研究,转录组分析 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2025-10-06
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Immune Landscape of CD4+ T Cells in Coronary Culprit Plaques With Acute Coronary Syndrome in Humans-Brief Report
2024-05, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性冠脉综合征患者冠状动脉斑块中CD4+ T细胞的免疫景观特征 首次在单细胞水平揭示了ACS患者冠状动脉斑块中CD4+ T细胞的特性,发现了中央记忆CD4+ T细胞在ACS斑块中的比例升高及其分化轨迹 样本量较小(7例患者),仅分析了冠状动脉斑块中的免疫细胞 表征ACS患者冠状动脉斑块中T细胞的单细胞水平特征,评估T细胞克隆扩增,寻找预防ACS的治疗靶点 急性冠脉综合征和慢性冠脉综合征患者的冠状动脉斑块样本 单细胞测序 心血管疾病 单细胞RNA测序,T细胞受体谱分析 NA 单细胞转录组数据,TCR序列数据 7例患者(4例慢性冠脉综合征,3例急性冠脉综合征)的冠状动脉斑块样本,另加3例ACS斑块样本用于TCR分析 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x单细胞RNA测序平台
40 2025-10-06
Developmental regulation of primitive erythropoiesis
2024-05-01, Current opinion in hematology IF:3.1Q2
综述 本文综述原始红细胞生成的最新研究进展,重点关注其胚胎起源、物种特异性发育调控差异以及终末分化的分子和代谢通路 结合单细胞转录组学和先进谱系追踪技术揭示原始红细胞起源,发现转录延伸调控因子和表观遗传修饰剂DOT1L的非经典功能,揭示磷酸戊糖途径等关键代谢通路的激活 基于小鼠模型和罕见人类胚胎样本的研究,人类样本数量有限且存在物种差异 解析原始红细胞生成的发育调控机制,为体外生成治疗性红细胞提供理论基础 小鼠胚胎和人类早期胚胎中的原始红细胞 发育生物学 NA 单细胞转录组学,谱系追踪,代谢组学,蛋白质组学 NA 转录组数据,表观遗传数据,代谢数据 未明确样本数量,使用小鼠胚胎和罕见人类胚胎样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部