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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-05-30
MR1-restricted T cell clonotypes are associated with "resistance" to Mycobacterium tuberculosis infection
2024-May-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨MR1限制性T细胞克隆型与结核分枝杆菌感染抵抗性的关联 首次揭示MR1限制性T细胞克隆型在结核感染抵抗者中富集,并发现其通过TCR依赖方式识别分枝杆菌感染细胞 仅涉及8名捐赠者的样本,且未明确功能验证机制 阐明供体非限制性T细胞(DURTs)与结核感染抵抗性的关系 乌干达结核病例家庭接触者中的抵抗者(RSTRs)和潜伏感染者(LTBIs) 机器学习 结核病 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 8名捐赠者的18,251个MR1T细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于MR1T细胞的转录组分析
22 2026-05-30
High-Frequency Spinal Stimulation Suppresses Microglial Kaiso-P2X7 Receptor Axis-Induced Inflammation to Alleviate Neuropathic Pain in Rats
2024-05, Annals of neurology IF:8.1Q1
研究论文 该文章通过建立临床前脊髓刺激模型,发现高频脊髓刺激可通过抑制小胶质细胞中Kaiso-P2X7受体轴介导的炎症反应,从而缓解大鼠神经病理性疼痛 揭示了10kHz高频脊髓刺激通过调控小胶质细胞Kaiso-P2X7R通路减轻神经炎症的新机制,并证明靶向该通路可增强传统脊髓刺激的治疗效果 研究仅基于大鼠模型,临床转化仍需验证;未深入探讨HF10 SCS对其他类型免疫细胞或长期效应的具体影响 探究高频脊髓刺激缓解神经病理性疼痛的潜在机制,为优化临床脊髓刺激治疗方案提供科学依据 神经病理性疼痛大鼠模型的脊髓背角组织及小胶质细胞 机器学习 神经病理性疼痛 大量RNA测序, 单细胞RNA测序, 慢病毒系统基因操作 NA 测序数据, 行为学数据 神经病理性疼痛大鼠模型样本,未明确具体数量 Illumina 大量RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina测序平台 未提供具体平台配置详情
23 2026-05-29
Perturbed liver gene zonation in a mouse model of non-alcoholic steatohepatitis
2024-05, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 结合空间转录组学、批量RNA测序和原位杂交技术,研究非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型中肝脏基因分区模式的扰动 首次在NASH小鼠模型中系统揭示Wnt信号通路调控的肝脏基因分区扰动,发现Rspo3表达区域从中央静脉周围扩展到门静脉周围,并通过AAV介导的过表达和基因敲除实验验证其因果作用 未观察到Rspo3调控对NASH病理特征(脂肪变性、炎症、纤维化)的影响,可能无法直接解释疾病进展 探究NASH疾病状态下肝脏基因分区及其调控因子的变化机制 非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型(对照与NASH模型小鼠) 计算机视觉, 自然语言处理, 空间转录组学 非酒精性脂肪性肝炎 空间转录组学, 批量RNA测序, 原位杂交, AAV介导的基因调控 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 NA(未在摘要中明确样本数量) NA 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
24 2026-05-28
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-05-01, Development (Cambridge, England)
综述 探讨新技术如何促进细胞类型进化研究,强调发育同源性在识别同源细胞中的重要性,并总结单细胞转录组学在细胞类型进化研究中的最新发现和未来方向 结合基因编辑和单细胞基因组学等技术突破,系统分析细胞类型进化研究的新方法,并特别关注发育同源性对鉴定同源细胞的意义 未涉及实际实验数据或模型验证,仅基于文献综述提出观点,对同源性判断的潜在误区缺乏系统性量化分析 综述细胞类型进化研究的当前进展,指出关键问题和未来探索领域 细胞类型及其进化机制,涵盖多种研究生物体的同源细胞比较 机器学习 NA 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-05-28
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-05-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 通过Fgf18CreER谱系追踪小鼠、单细胞RNA测序等技术,鉴定新生小鼠肺部肌成纤维细胞分化程序及其在肺泡发育中的作用 首次利用Fgf18CreER谱系追踪小鼠结合单细胞RNA测序,揭示新生肺间充质细胞中一个不成熟祖细胞向成熟肌成纤维细胞分化的独特程序,并发现内源性ROSA26位点可作为肌成纤维细胞成熟的敏感报告基因 未详细说明 探究肺泡发育过程中间充质细胞亚型及其分化机制 新生小鼠肺部间充质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, Fgf18CreER谱系追踪, 细胞分选, 原代细胞培养 NA 单细胞转录组数据 新生小鼠(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
26 2026-05-21
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatotoxic analgesic generating AM404 in the midbrain PAG region
2024-05-15, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 该研究开发了一种非肝毒性镇痛药SRP-001,其通过在中脑PAG区域生成AM404发挥镇痛作用,具有与对乙酰氨基酚相当的效果且无肝毒性 首次设计并验证了SRP-001作为非阿片类、非肝毒性镇痛药的分子机制,通过单细胞转录组学揭示其与对乙酰氨基酚共享的疼痛相关基因调控网络 未明确提及研究局限性 开发一种安全的非肝毒性非阿片类镇痛药SRP-001,并验证其在中脑PAG区域的镇痛机制和安全性 SRP-001分子、CD-1小鼠及I期临床试验中的人类受试者 生物信息学 疼痛 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 CD-1小鼠及I期临床试验中的受试者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2026-05-21
Unveiling cell subpopulations in T1D mouse islets using single-cell RNA sequencing
2024-05-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示1型糖尿病小鼠胰岛细胞亚群 通过单细胞RNA测序技术构建了T1D小鼠模型胰岛的全面单细胞图谱,并发现了α和β细胞亚群在T1D进展中的潜在重要作用 主要基于小鼠模型,结果可能需要进一步在人类样本中验证 研究1型糖尿病小鼠胰岛内的细胞异质性及其与发病机制的关系 链脲佐菌素诱导的1型糖尿病小鼠模型胰岛细胞 机器学习和生物信息学 1型糖尿病 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞基因表达数据, 流式细胞术数据 T1D小鼠模型胰岛样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-05-20
TRPV4-Expressing Tissue-Resident Macrophages Regulate the Function of Collecting Lymphatic Vessels via Thromboxane A2 Receptors in Lymphatic Muscle Cells
2024-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该论文揭示了TRPV4通道在集合淋巴管功能调节中的作用,特别是通过表达TRPV4的组织驻留巨噬细胞产生血栓素A2(TXA2)来影响淋巴管平滑肌细胞的收缩功能 首次发现TRPV4通道在淋巴管系统中的作用,并确定其通过组织驻留巨噬细胞释放TXA2,激活淋巴管平滑肌细胞上的TXA2受体,导致淋巴管收缩功能障碍 未提及具体局限性 研究TRPV4通道在集合淋巴管中的表达及其对淋巴管收缩功能的调节机制 小鼠、大鼠和非人灵长类动物的收集淋巴管及其中表达的巨噬细胞 机器学习和单细胞转录组学 淋巴水肿、脂肪水肿 单细胞RNA测序(scRNAseq)、压力肌电图 NA 基因表达数据 从小鼠、大鼠和非人灵长类动物中解剖的完整集合淋巴管样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于生成受控且空间确定的scRNAseq数据
29 2026-05-20
Notch ligands are biomarkers of anti-TNF response in RA patients
2024-05, Angiogenesis IF:9.2Q1
研究论文 研究Notch配体在类风湿关节炎滑膜组织细胞中的表达及其对抗TNF治疗反应的影响 揭示JAG1、DLL4等Notch配体在RA髓系细胞中作为抗TNF治疗反应标志物的潜力,并通过单细胞RNA-seq分析不同细胞亚群的表达变化 未明确Notch配体作为抗TNF反应标志物的具体机制,且样本量和临床验证细节不足 探究Notch通路在RA滑膜组织细胞中的功能意义及其对抗RA治疗反应的影响 RA患者滑膜组织细胞,包括巨噬细胞、成纤维样滑膜细胞和内皮细胞 自然语言处理 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 RA患者样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
30 2026-05-08
Characterizing dysregulations via cell-cell communications in Alzheimer's brains using single-cell transcriptomes
2024-05-13, BMC neuroscience IF:2.4Q3
研究论文 利用单细胞转录组数据表征阿尔茨海默病大脑中细胞间通讯的失调 通过大规模单核RNA测序数据构建高置信度细胞间通讯网络,揭示了阿尔茨海默病中细胞类型特异性信号通路失调,并连接了细胞外风险基因与细胞内风险基因的关联 NA 研究阿尔茨海默病大脑中细胞间通讯的失调及其机制 人类前额叶皮层中的细胞类型(包括兴奋性神经元、抑制性神经元、小胶质细胞、星形胶质细胞等) 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序 NA 基因表达数据 大规模公开数据,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-05-06
Single-cell transcriptomics reveals evolutionary reconfiguration of embryonic cell fate specification in the sea urchin Heliocidaris erythrogramma
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示了海胆物种Heliocidaris erythrogramma在胚胎细胞命运决定过程中的进化重组 利用海胆发育进化中的自然实验,通过比较单细胞RNA测序发育时间序列,揭示了胚胎模式化中广泛的进化变化,包括细胞命运决定和信号中心在空间和时间上的分离 未提及具体局限性 识别发育机制中的进化变化,特别是与生活史转变相关的胚胎模式化改变 海胆物种Heliocidaris erythrogramma及其近缘种(代表衍生和祖先状态) 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个发育时间点的海胆胚胎细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-05-05
Single-cell RNA sequencing to explore cancer-associated fibroblasts heterogeneity: "Single" vision for "heterogeneous" environment
2024-May, Cell proliferation IF:5.9Q2
综述 综述单细胞RNA测序技术在揭示癌症相关成纤维细胞异质性中的应用 从单细胞RNA测序视角系统综述癌症相关成纤维细胞异质性,并探讨多模态单细胞平台整合策略 未提供具体实验验证或定量分析结果 探讨单细胞RNA测序在理解癌症相关成纤维细胞异质性中的应用及临床转化潜力 癌症相关成纤维细胞 机器学习 癌症 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-05-03
Spatial Biology of Breast Cancer
2024-05-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine IF:7.8Q1
综述 该文章综述了空间生物学方法(包括空间转录组学和蛋白质组学)如何促进对乳腺癌进展和治疗的理解,并探讨了新兴多重成像技术的影响 强调了空间生物学方法在揭示乳腺癌空间关系中的创新性应用,以及多重成像技术如何推动该领域未来发展 未明确提及具体局限性,但作为综述,可能依赖于现有研究并缺乏新实验数据 总结空间生物学方法在乳腺癌研究中的贡献,并展望未来研究方向 乳腺癌的空间生物学 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学,蛋白质组学 NA 图像,文本 NA NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
34 2026-04-25
Periportal macrophages protect against commensal-driven liver inflammation
2024-05, Nature IF:50.5Q1
研究论文 揭示了门静脉周围区域富含一种表达Marco的免疫抑制性巨噬细胞,该细胞由肠道微生物群诱导,通过白细胞介素-10和Marco受体抑制炎症,其功能缺失会促进肝脏炎性疾病 首次通过活体成像和区域特异性单细胞转录组学发现门静脉周围区域存在免疫抑制性巨噬细胞,并鉴定出Odoribacteraceae菌科及其后生元isoallolithocholic acid诱导该细胞亚群,阐明了共生菌与肝脏免疫稳态之间的新机制 研究主要基于动物模型和体外验证,缺乏直接的人类临床数据支持 探究肝脏门静脉周围与中央静脉周围区域免疫系统的功能差异及其在炎症调控中的作用机制 肝脏门静脉周围区域富含Marco的免疫抑制性巨噬细胞及其与肠道微生物群的互作关系 免疫学 原发性硬化性胆管炎、非酒精性脂肪性肝炎 活体成像、区域特异性单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型及体外培养细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'基因表达分析平台
35 2026-04-22
Integrating spatial transcriptomics and bulk RNA-seq: predicting gene expression with enhanced resolution through graph attention networks
2024-May-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本研究提出了一种名为STGAT的新方法,利用图注意力网络整合空间转录组学和bulk RNA-seq数据,以预测乳腺癌组织中的基因表达和肿瘤/非肿瘤区域 STGAT首次结合图注意力网络来捕捉spots之间的空间依赖性,从WSI和bulk RNA-seq数据中估计spot级基因表达,并在TCGA数据中验证了其在乳腺癌亚型和分期预测中的优越性 方法依赖于有限的乳腺癌空间转录组学数据进行训练,可能在其他癌症类型或更大规模数据中的泛化能力未充分验证 开发一种从WSI和bulk RNA-seq数据预测spot级基因表达的方法,以弥补大规模癌症研究中空间转录组学数据不足的缺口 乳腺癌组织样本,包括空间转录组学数据集和TCGA项目中的bulk RNA-seq与WSI数据 计算生物学 乳腺癌 空间转录组学,bulk RNA-seq,全切片成像 GAT 图像,基因表达数据 两个乳腺癌空间转录组学数据集和TCGA乳腺癌数据集 NA 空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
36 2026-04-14
Single-Nucleus RNA-Seq Reveals Spermatogonial Stem Cell Developmental Pattern in Shaziling Pigs
2024-05-21, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了沙子岭猪睾丸中精原干细胞(SSCs)的发育模式 首次在沙子岭猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸组织细胞发育图谱,并识别了调控SSCs自我更新和维持的潜在标记基因及信号通路 研究样本仅来自沙子岭猪,可能限制了结果的普适性;且未进行功能验证实验 探究沙子岭猪睾丸发育,特别是精原干细胞的发育模式 沙子岭猪睾丸组织 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 NA 单细胞转录组数据,图像数据 来自9只沙子岭猪睾丸的82,027个单细胞,覆盖三个关键出生后发育阶段 NA 单细胞RNA-seq NA NA
37 2026-04-09
A human neural crest model reveals the developmental impact of neuroblastoma-associated chromosomal aberrations
2024-May-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用人类胚胎干细胞分化模型,结合单细胞转录组和表观组分析,探索了神经母细胞瘤中染色体17q/1q增益对神经嵴细胞发育的影响 首次建立了人类神经嵴模型,系统评估了神经母细胞瘤相关染色体畸变在发育过程中的作用,揭示了拷贝数变异与MYCN过表达协同促进肿瘤发生的机制 模型基于体外分化系统,可能无法完全模拟体内肿瘤发生的复杂微环境 探究胚胎肿瘤中拷贝数变异如何影响发育过程并驱动肿瘤发生 人类胚胎干细胞分化的神经嵴细胞及其交感肾上腺衍生物 发育生物学与肿瘤学 神经母细胞瘤 单细胞转录组测序,单细胞表观组分析 人类胚胎干细胞分化模型 单细胞转录组数据,表观组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞表观组学 NA NA
38 2026-04-07
STAT3 protects hematopoietic stem cells by preventing activation of a deleterious autocrine type-I interferon response
2024-05, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究通过混合骨髓嵌合小鼠模型,揭示了STAT3通过抑制有害的自分泌I型干扰素反应来保护造血干细胞功能 开发了可避免系统性炎症的混合骨髓嵌合小鼠模型,首次证明STAT3通过抑制自分泌I型干扰素反应维持造血干细胞功能 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类造血干细胞中验证;嵌合模型可能无法完全模拟生理状态 探究STAT3在造血干细胞中的内在调控机制及其对干细胞功能的影响 造血干细胞和祖细胞(HSPCs),特别是Lin⁻c-kit⁺Sca-1⁺骨髓细胞 血液学与干细胞生物学 血液系统疾病 单细胞RNA测序,骨髓移植实验,免疫荧光染色 混合骨髓嵌合小鼠模型 单细胞转录组数据,表型数据 未明确具体样本数量,使用嵌合小鼠模型进行研究 NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2026-04-04
Single-cell RNA sequencing of mutant whole mouse embryos: from the epiblast to the end of gastrulation
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文设计了一种稳健的流程,用于对E6.5至E8阶段的小鼠胚胎进行单细胞和细胞核分析,以研究突变胚胎在胚胎发育过程中的细胞景观 开发了一种针对突变小鼠胚胎的单细胞RNA测序方法,克服了基因分型、定时妊娠和细胞数量少等技术限制,提高了在胚胎发育阶段进行单细胞分析的可行性 方法主要针对小鼠胚胎,可能不直接适用于其他物种或更晚期的发育阶段,且依赖于优化的育种和基因分型流程 研究突变如何影响胚胎发育过程中的细胞景观和基因表达动态 小鼠胚胎,特别是从E6.5到E8阶段的突变胚胎 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 微滴式单细胞分析
40 2026-04-03
A novel sorting method for the enrichment of early human spermatocytes from clinical biopsies
2024-05, F&S science
研究论文 本研究开发了一种利用荧光激活细胞分选技术富集人类睾丸活检样本中早期精母细胞的新方法 首次通过生物信息学分析鉴定出早期精母细胞特异性表面标志物TSP50,并成功应用于临床活检样本的细胞分选富集 研究样本量较小(仅3名参与者),且仅限于梗阻性无精子症患者,结果可能需要更大样本验证 开发从人类睾丸活检样本中富集早期精母细胞的方法,以促进减数分裂起始阶段生殖细胞的靶向研究 人类睾丸活检组织中的早期精母细胞 生殖医学 男性不育症 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据、免疫染色图像 3名30-40岁梗阻性无精子症男性的睾丸活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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