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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Specific photoreceptor cell fate pathways are differentially altered in NR2E3-associated diseases
2024-05, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106463
PMID:38485095
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析NR2E3基因突变对视网膜光感受器细胞命运分化的影响 | 发现了一种先前未报道的锥细胞通路,可产生同时表达锥细胞和视杆细胞相关基因的杂交锥细胞 | 研究仅使用小鼠模型,未直接验证人类患者样本 | 解析NR2E3基因在视杆细胞和锥细胞转录网络中的精确功能 | 野生型和两种不同Nr2e3突变小鼠模型的视网膜组织 | 单细胞基因组学 | 视网膜营养不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和两种Nr2e3突变小鼠模型的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
MAPPING ALZHEIMER'S DISEASE PSEUDO-PROGRESSION WITH MULTIMODAL BIOMARKER TRAJECTORY EMBEDDINGS
2024-May, Proceedings. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging
DOI:10.1109/isbi56570.2024.10635249
PMID:39371469
|
研究论文 | 本研究提出了一种利用多模态生物标志物轨迹嵌入来映射阿尔茨海默病伪进展的新方法 | 将单细胞转录组学领域的PHATE和Slingshot机器学习方法应用于神经退行性疾病的多模态生物标志物数据分析 | 研究依赖于ADNI数据集,可能需要更多样化的数据验证方法的普适性 | 开发更精确的阿尔茨海默病进展建模和早期诊断方法 | 阿尔茨海默病患者的纵向多模态生物标志物数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | PHATE, Slingshot, 轨迹嵌入 | PHATE, Slingshot | 医学影像, 多模态生物标志物数据 | ADNI数据集中的多个疾病阶段个体 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Identification of four mitochondria-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2024-05-16, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00623-1
PMID:38755528
|
研究论文 | 基于RNA测序技术鉴定脓毒症中四个线粒体相关基因 | 首次通过整合RNA测序数据和线粒体基因数据库,识别出与脓毒症预后相关的四个线粒体基因(FIS1, FKBP8, GLRX5, GUK1),并通过单细胞测序明确其在免疫细胞中的分布 | 样本量较小(脓毒症20例,SIRS 12例),需更大规模研究验证 | 阐明脓毒症免疫机制并为临床治疗提供新思路 | 脓毒症和全身炎症反应综合征(SIRS)患者外周血细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | RNA测序数据,单细胞测序数据 | 脓毒症20例,SIRS 12例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞测序平台 |
| 24 | 2025-10-06 |
Characterizing dysregulations via cell-cell communications in Alzheimer's brains using single-cell transcriptomes
2024-05-13, BMC neuroscience
IF:2.4Q3
DOI:10.1186/s12868-024-00867-y
PMID:38741048
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研究论文 | 利用单细胞转录组数据研究阿尔茨海默病大脑中细胞间通讯的失调特征 | 首次在大规模单核RNA测序数据上系统分析AD大脑中细胞间通讯网络的扰动,揭示细胞类型特异性信号传导失调机制 | 基于公开数据的二次分析,受原始数据质量和样本来源限制 | 研究阿尔茨海默病大脑中细胞间通讯网络的异常变化 | 人类前额叶皮层单核RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | 细胞通讯网络分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Single-cell, single-nucleus, and spatial transcriptomics characterization of the immunological landscape in the healthy and PSC human liver
2024-05, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.12.023
PMID:38199298
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研究论文 | 本研究通过单细胞、单核和空间转录组学技术,全面表征了健康人和原发性硬化性胆管炎患者肝脏的免疫景观 | 首次结合单细胞RNA测序、单核RNA测序和空间转录组学技术,系统构建了PSC肝脏的细胞图谱,并发现胆管细胞样肝细胞群体和髓系细胞耗竭样表型 | 样本量相对有限,主要关注晚期PSC病变,缺乏早期疾病阶段的分析 | 构建原发性硬化性胆管炎肝脏的全面细胞图谱,揭示疾病发病机制 | 人类肝脏组织(10例PSC患者、24例神经性死亡供体肝脏、3例PBC患者) | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 空间定位数据, 蛋白质功能数据 | 47,156个细胞和23,000个细胞核(PSC),107,542个细胞(健康对照),18,240个细胞和20,202个细胞核(PBC) | 10x Genomics, Nanostring | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium, Nanostring GeoMx DSP | 10x Visium空间转录组技术, Nanostring GeoMx数字空间分析技术 |
| 26 | 2025-10-06 |
Beyond binary: bridging neutrophil diversity to new therapeutic approaches in NSCLC
2024-05, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.010
PMID:38360439
|
综述 | 本文总结了非小细胞肺癌中肿瘤相关中性粒细胞的异质性研究,并提出超越传统N1/N2二分法的新分类框架 | 通过整合不同癌症实体的转录组数据,建立了具有明确表型特征的中性粒细胞亚群分类体系,突破了传统的二元分类模式 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证,分类体系需要进一步实验确认 | 探索中性粒细胞在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的异质性及其治疗应用潜力 | 肿瘤相关中性粒细胞(TANs) | 单细胞生物学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analyses Offer Insights into the Different Remodeling Programs of Arteries and Veins
2024-05-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100793
PMID:38786017
|
研究论文 | 通过单细胞分析比较人类外周动脉和静脉的细胞组成差异,揭示血管重塑机制 | 首次在单细胞水平系统对比动脉和静脉的细胞图谱,发现静脉成纤维细胞在胶原产生和血管重塑中的独特作用 | 样本量相对有限(30例器官捐献者),主要关注上肢血管 | 探究动脉和静脉在闭塞性疾病和损伤反应中差异的生物学基础 | 人类外周动脉(肱动脉)和静脉(贵要静脉/头静脉) | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术, 组织学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据, 组织图像 | 30例器官捐献者的动脉和静脉样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of tumor-associated macrophages and M2 macrophages in CRC: unraveling molecular heterogeneity and developing a novel risk signature
2024-05-27, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01881-z
PMID:38802881
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据,开发了结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞和M2巨噬细胞的新型风险标志物 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据识别TAM-M2巨噬细胞相关基因,并构建了预后风险标志物TAMM2RS | 需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 发现结直肠癌中TAM-M2巨噬细胞相关的新型生物标志物并解析分子异质性 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, WGCNA, LASSO Cox分析, qPCR | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
scRNA+TCR+BCR-seq revealed the proportions and gene expression patterns of dual receptor T and B lymphocytes in NPC and NLH
2024-05-21, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.149820
PMID:38547605
|
研究论文 | 通过单细胞多组学测序揭示鼻咽癌和鼻咽淋巴增生中双受体淋巴细胞的组成、克隆扩增及基因表达特征 | 首次在鼻咽癌和鼻咽淋巴增生中发现双受体淋巴细胞的存在,并证实其克隆扩增及谱系特征 | 样本量较小(7例NPC和3例NLH),需要更大规模研究验证 | 探究肿瘤微环境中双受体淋巴细胞的生物学特性和功能 | 鼻咽癌患者和鼻咽淋巴增生患者的淋巴细胞 | 单细胞组学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,TCR测序,BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据,免疫受体序列数据 | 7例鼻咽癌患者和3例鼻咽淋巴增生患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞免疫组库测序 | NA | scRNA+TCR+BCR-seq技术 |
| 30 | 2025-10-06 |
Identification of sepsis-associated mitochondrial genes through RNA and single-cell sequencing approaches
2024-05-03, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01891-x
PMID:38702721
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞测序方法识别与脓毒症相关的线粒体基因 | 整合高通量测序与生物信息学分析,首次发现COX7B和NDUFA4两个线粒体基因与脓毒症预后密切相关 | 样本量较小(20例脓毒症患者和10例健康对照),单细胞测序样本仅5例 | 识别脓毒症相关的线粒体生物标志物以提高诊断和预后准确性 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | RNA测序数据, 单细胞测序数据 | 30例(20例脓毒症+10例健康对照)用于RNA-seq,5例用于单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Notch ligands are biomarkers of anti-TNF response in RA patients
2024-May, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09897-2
PMID:37796367
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研究论文 | 本研究探讨Notch配体在类风湿关节炎滑膜组织中的表达特征及其作为抗TNF治疗反应生物标志物的潜力 | 首次发现RA骨髓Notch配体可作为抗TNF治疗反应的标志物,并揭示其在FLS和内皮细胞中的转激活作用 | 研究样本量未明确说明,且主要基于转录组分析,缺乏蛋白质水平验证 | 阐明Notch通路在RA滑膜组织细胞中的功能意义及RA治疗对其表达的影响 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织细胞,包括巨噬细胞、成纤维样滑膜细胞和内皮细胞 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,形态学研究,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Immune Landscape of CD4+ T Cells in Coronary Culprit Plaques With Acute Coronary Syndrome in Humans-Brief Report
2024-05, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320409
PMID:38572648
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性冠脉综合征患者冠状动脉斑块中CD4+ T细胞的免疫景观特征 | 首次在单细胞水平揭示了ACS患者冠状动脉斑块中CD4+ T细胞的特性,发现了中央记忆CD4+ T细胞在ACS斑块中的比例升高及其分化轨迹 | 样本量较小(7例患者),仅分析了冠状动脉斑块中的免疫细胞 | 表征ACS患者冠状动脉斑块中T细胞的单细胞水平特征,评估T细胞克隆扩增,寻找预防ACS的治疗靶点 | 急性冠脉综合征和慢性冠脉综合征患者的冠状动脉斑块样本 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 7例患者(4例慢性冠脉综合征,3例急性冠脉综合征)的冠状动脉斑块样本,另加3例ACS斑块样本用于TCR分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 |
| 33 | 2025-10-06 |
Developmental regulation of primitive erythropoiesis
2024-05-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000806
PMID:38415349
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综述 | 本文综述原始红细胞生成的最新研究进展,重点关注其胚胎起源、物种特异性发育调控差异以及终末分化的分子和代谢通路 | 结合单细胞转录组学和先进谱系追踪技术揭示原始红细胞起源,发现转录延伸调控因子和表观遗传修饰剂DOT1L的非经典功能,揭示磷酸戊糖途径等关键代谢通路的激活 | 基于小鼠模型和罕见人类胚胎样本的研究,人类样本数量有限且存在物种差异 | 解析原始红细胞生成的发育调控机制,为体外生成治疗性红细胞提供理论基础 | 小鼠胚胎和人类早期胚胎中的原始红细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学,谱系追踪,代谢组学,蛋白质组学 | NA | 转录组数据,表观遗传数据,代谢数据 | 未明确样本数量,使用小鼠胚胎和罕见人类胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Unraveling molecular advancements in chordoma tumorigenesis and treatment response: a review of scientific discoveries and clinical implications
2024-05, Neurosurgical focus
IF:3.3Q1
DOI:10.3171/2024.2.FOCUS2417
PMID:38691860
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综述 | 本文系统回顾了脊索瘤分子发病机制的科学发现及其临床治疗意义 | 整合单细胞转录组分析、空间转录组学和游离DNA等新兴技术,揭示脊索瘤异质性分子通路 | NA | 总结脊索瘤分子发病机制的最新进展及其对神经外科治疗的增强作用 | 脊索瘤肿瘤发生机制与治疗反应 | 数字病理 | 脊索瘤 | 单细胞转录组分析, 空间转录组学, 游离DNA分析, 基因组学, 转录组学, 表观基因组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Exploring the potential relationship between short sleep risks and cognitive function from the perspective of inflammatory biomarkers and cellular pathways: Insights from population-based and mice studies
2024-05, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14783
PMID:38797980
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研究论文 | 通过人群和动物研究探讨短睡眠风险与认知功能的关系及其炎症机制 | 结合人群流行病学数据与单细胞转录组学分析,揭示短睡眠通过炎症通路影响认知功能的细胞机制 | 观察性研究设计无法确定因果关系,小鼠模型结果向人类外推需谨慎 | 研究短睡眠对认知功能的影响及其分子机制 | 美国NHANES人群数据(2011-2014)和实验小鼠 | 生物医学研究 | 认知功能障碍 | 生物信息学分析, 单细胞转录组测序, GO和KEGG富集分析 | NA | 血液检测数据, 认知测试数据, 基因表达数据 | NHANES人群数据(2011-2014)和小鼠实验数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | NA | GSE137665单细胞转录组数据集 |
| 36 | 2025-10-06 |
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-05-31, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01840-1
PMID:38816371
|
综述 | 系统总结巨噬细胞在心血管疾病中的表型多样性、功能可塑性及其调控机制,并探讨单细胞测序技术带来的新见解 | 整合单细胞测序技术揭示的巨噬细胞异质性和细胞互作机制,聚焦不同心血管疾病背景下炎症与纤维化的关系 | 主要基于现有文献总结,缺乏原始实验数据验证 | 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的分子机制和潜在治疗靶点 | 巨噬细胞在心血管疾病中的表型和功能 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-05-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01838-9
PMID:38811552
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研究论文 | 本研究揭示靶向BCL9/BCL9L通过促进cDC1树突状细胞活化和肿瘤浸润来增强抗原呈递 | 首次阐明BCL9/BCL9L通过XCL1-XCR1轴和NF-κB/IRF1信号通路调控cDC1功能的新机制 | 未明确BCL9/BCL9L在其它免疫细胞亚群中的作用 | 探究靶向BCL9/BCL9L对肿瘤抗原呈递和抗肿瘤免疫的影响 | 常规1型树突状细胞(cDC1)、CD8 T细胞、肿瘤微环境 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组测序、基因敲除、药理学抑制 | NA | 基因表达数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Integrated Single-cell Multiomic Analysis of HIV Latency Reversal Reveals Novel Regulators of Viral Reactivation
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae003
PMID:38902848
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学分析揭示HIV潜伏逆转的新调控因子 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术同时分析潜伏感染细胞的转录组和表观基因组特征,并利用机器学习预测病毒再激活 | 研究仅针对CD4+ T细胞,未涉及其他潜在HIV潜伏库细胞类型 | 揭示HIV潜伏逆转的分子机制和新型调控因子 | 约125,000个潜伏感染的原代CD4+ T细胞 | 单细胞多组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 约125,000个原代CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Young glial progenitor cells competitively replace aged and diseased human glia in the adult chimeric mouse brain
2024-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01798-5
PMID:37460676
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研究论文 | 本研究通过移植年轻健康的人类胶质祖细胞成功替代成年嵌合小鼠大脑中的衰老和病变胶质细胞 | 首次发现年轻健康胶质祖细胞在成年大脑中具有竞争优势,能够通过YAP1/MYC/E2F信号通路取代衰老和病变胶质细胞 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床环境中验证 | 探究健康胶质细胞是否能在成年前脑中竞争取代病变人类胶质细胞 | 人类胶质祖细胞和亨廷顿病模型小鼠 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 嵌合小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Discovery and characterization of dietary antigens in oral tolerance
2024-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.26.593976
PMID:38853977
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研究论文 | 本研究通过鉴定玉米、小麦和大豆特异性T细胞受体,揭示了植物源性食物中引发口服耐受的关键抗原表位及其功能特性 | 首次系统性地鉴定并表征了玉米、小麦和大豆中引发口服耐受的T细胞表位,发现这些表位均来源于抗降解的种子贮藏蛋白 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;仅针对三种主要谷物进行研究 | 探索植物源性食物中引发口服免疫耐受的抗原表位及其免疫学机制 | 小鼠T细胞受体、玉米、小麦和大豆中的抗原表位、肠道调节性T细胞 | 免疫学 | 食物过敏 | 表达克隆、MHC四聚体技术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质序列数据 | NA | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |