单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 558 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-05 |
A Gold Standard-Derived Modular Barcoding Approach to Cancer Transcriptomics
2024-May-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16101886
PMID:38791964
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研究论文 | 本文提出了一种灵活条形码的癌症转录组学方法，将癌症特异性基因表达模块组合成便于管理的信息。 | 创新点在于采用高质量金标准导出的模块捕捉与特定癌症类型相关的功能性基因，提供了快速有效的假设生成和测试方式 | 本研究的局限性在于未提供与不同癌症类型之间更广泛的数据对比 | 研究目的在于简化癌症转录组信息，以便于更广泛的研究和临床应用 | 研究对象为癌症类型特异性的基因表达模块 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 362 | 2024-08-05 |
Deciphering the Genetic Links between Psychological Stress, Autophagy, and Dermatological Health: Insights from Bioinformatics, Single-Cell Analysis, and Machine Learning in Psoriasis and Anxiety Disorders
2024-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105387
PMID:38791423
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研究论文 | 本研究探讨了心理压力、自噬相关基因与皮肤健康之间的关系，特别关注银屑病与焦虑障碍的共病机制 | 揭示了银屑病与焦虑障碍之间可能存在的共享生物机制及其潜在生物标志物 | 样本数据来源于GEO数据库，未具体提及样本的多样性和数据的全面性 | 探索银屑病与焦虑障碍之间的共病机制 | 银屑病与焦虑障碍相关的数据和基因 | 机器学习 | 银屑病 | 单细胞RNA测序分析 | 机器学习算法 | 基因数据 | 未具体提及样本数量 |
| 363 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomic Analysis Identifies Epithelium-Macrophage Crosstalk in Endometriotic Lesions
2024-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.23.586434
PMID:38798560
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研究论文 | 本研究旨在揭示子宫内膜异位病变中的细胞特异性基因表达变化及其相互作用 | 研究提出了上皮细胞在驱动病变炎症中扮演的新角色，并发现了补体3在病变病理生物学中的新作用 | 研究主要针对表浅腹膜子宫内膜异位病变，可能未涵盖所有类型的子宫内膜异位症 | 探索子宫内膜异位症的发病机制及细胞间相互作用 | 对比患者匹配的异位内膜和相应病变中的细胞类型特异性的基因表达 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 364 | 2024-08-04 |
Special Issue "Cancer Immunotherapy: Tumor Microenvironment, Biomarker Discovery and Immune Resistance"
2024-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105113
PMID:38791152
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研究论文 | 该特刊汇集了癌症免疫治疗领域的最新研究成果和进展 | 介绍了新型药物开发和机制理解的最新进展 | 未提及具体的研究限制 | 推动对癌症免疫治疗领域新的理解和技术应用 | 癌症免疫治疗相关的肿瘤微环境、生物标志物和免疫耐受性 | 数字病理学 | 癌症 | 人工智能，机器学习，单细胞测序，空间分析 | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-04 |
Spotless, a reproducible pipeline for benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics
2024-May-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88431
PMID:38787371
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研究论文 | 本文介绍了一个可重复的管道，用于基准测试空间转录组学中的细胞类型去卷积方法 | 开发了一个模拟引擎生成银标准，并比较了11种去卷积方法的性能 | 在细胞类型极为丰富或稀少的数据集中，所有方法的性能显著下降 | 研究空间转录组学中细胞类型的去卷积技术的有效性 | 基于63个银标准、3个金标准和2个案例研究进行评估 | 数字病理学 | 肝脏疾病与黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 简单回归模型 | 转录组数据 | 63个银标准和2个案例研究 |
| 366 | 2024-08-05 |
Single-Cell Gene-Regulatory Networks of Advanced Symptomatic Atherosclerosis
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323184
PMID:38639096
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研究论文 | 本研究探讨了在动脉粥样硬化进展过程中单细胞基因表达模式的临床和病理生理相关性 | 首次通过整合高基因丰度的单细胞亚群与冠状动脉疾病基因调控网络，确认GRN39在促进晚期、症状性动脉粥样硬化中的关键作用 | 对单细胞转录组数据的详细理解仍然不足，且临床适用性需要进一步验证 | 揭示动脉粥样硬化发病机制的细胞遗传调控网络 | 在Ldlr-/-Apob100/100小鼠模型和人类样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 16588个单细胞和600名冠状动脉疾病患者的基因组数据 |
| 367 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics analysis of non-small cell lung cancer
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48700-8
PMID:38782901
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研究论文 | 本研究分析了非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学 | 揭示了肿瘤中巨噬细胞的转录重编程现象，并建立了肿瘤相关巨噬细胞的高分辨率分子图谱 | 为基于特定样本数量的观察，可能无法普遍适用于所有患者或癌症亚型 | 解密非小细胞肺癌肿瘤微环境中免疫细胞的多样性及其功能 | 来自25名未接受治疗的腺癌和鳞状细胞癌患者的约900,000个细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 细胞转录组数据 | 25名患者，约900,000个细胞 |
| 368 | 2024-08-05 |
Metabolic pathway-based subtypes associate glycan biosynthesis and treatment response in head and neck cancer
2024-May-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00602-0
PMID:38783045
|
研究论文 | 本研究介绍了一种基于代谢通路的头颈癌分类，强调了富含糖类代谢的MPS1亚型的治疗挑战性 | 创新之处在于定义了代谢通路基础的亚型，并揭示了其与治疗反应之间的关联 | 缺乏对临床结果的全面分析以及可能的样本量不足 | 研究头颈鳞状细胞癌的代谢异质性及其对临床结果的影响 | 四个独立临床队列中的头颈鳞状细胞癌转录组数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个独立的临床队列 |
| 369 | 2024-08-05 |
In-depth organic mass cytometry reveals differential contents of 3-hydroxybutanoic acid at the single-cell level
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48865-2
PMID:38782922
|
研究论文 | 本文建立了一种深入的单细胞代谢组学平台，以揭示3-羟基丁酸在单细胞水平上的差异性含量 | 首次展示了MCF-7细胞内3-羟基丁酸水平的细致亚型分析 | 尚未提及该技术在其他细胞类型或生物体中的应用效果 | 旨在通过单细胞代谢组学探讨癌症细胞在氧化应激下的异质性 | 研究对象为MCF-7细胞及其3-羟基丁酸的代谢特征 | 数字病理学 | 癌症 | 有机质谱细胞术 | NA | 代谢数据 | 单细胞，约600种代谢物 |
| 370 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2024-May-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06319-x
PMID:38783104
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-04 |
Adhesion G Protein-Coupled Receptor Gpr126 (Adgrg6) Expression Profiling in Diseased Mouse, Rat, and Human Kidneys
2024-May-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100874
PMID:38786096
|
研究论文 | 本文揭示了G蛋白偶联受体Gpr126在小鼠、大鼠和人类肾脏疾病中的表达情况 | 首次系统性分析了Gpr126在不同肾脏疾病中的表达变化 | 未明确Gpr126在肾病中的具体功能 | 探讨Gpr126在肾脏疾病中的表达模式及其潜在的治疗靶点 | 小鼠、大鼠和人类的肾脏样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RT-PCR、RNAscope | NA | mRNA | 纳入小鼠、大鼠和人类，具体样本量未明确 |
| 372 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Unveils Dynamic Immune Cell Responses during Haemonchus contortus Infection
2024-May-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100842
PMID:38786064
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研究论文 | 本研究监测了山羊在Haemonchus contortus感染期间外周血单核细胞中的动态免疫细胞反应 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了宿主PBMCs在H. contortus感染中细胞类型特异机制的转录组特征 | 研究仅使用了四只山羊，样本量较小，可能影响结果的普适性 | 揭示H. contortus感染中宿主免疫细胞反应的转录组特征 | 四只Boer山羊，包括两只感染H. contortus的山羊和两只健康对照山羊 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四只Boer山羊 |
| 373 | 2024-08-04 |
A Spatial Transcriptomics Browser for Discovering Gene Expression Landscapes across Microscopic Tissue Sections
2024-May-13, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46050284
PMID:38785552
|
研究论文 | 本研究开发了一个空间转录组浏览器，以便在微观组织切片中发现基因表达图景 | 该工具应用了自组织映射(SOM)机器学习方法来分析空间转录组数据，生成每个点的基因表达景观 | 文章未提及具体的样本量和该工具的局限性 | 研究空间转录组技术在细胞生态系统组织和相互作用知识挖掘中的应用 | 主要研究内容为单基因表达、功能基因集表达以及细胞间相互作用的空间模式 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组 | 自组织映射(SOM) | 图像 | 使用了小鼠脑组织和黑色素瘤的相关组织样本 |
| 374 | 2024-08-05 |
Deciphering infected cell types, hub gene networks and cell-cell communication in infectious bronchitis virus via single-cell RNA sequencing
2024-May, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012232
PMID:38743760
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序系统性研究感染性支气管炎病毒对细胞类型和细胞间通讯的影响 | 首次系统性鉴定了特定细胞类型中表达的组织特异性分子标志物和相应的基因网络 | 未提及样本数量的具体细节及其在研究中的影响 | 探讨感染性支气管炎病毒在小鸡中的致病机制及其对免疫反应的影响 | 研究感染性支气管炎病毒感染后的肾脏、法氏囊和气管组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 375 | 2024-08-05 |
Integrating phylogenies into single-cell RNA sequencing analysis allows comparisons across species, genes, and cells
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002633
PMID:38787797
|
研究论文 | 本文探讨了将系统发育整合到单细胞RNA测序分析中的应用，以比较物种、基因和细胞之间的联系 | 提出了将系统发育方法整合进scRNA-seq分析中，以克服物种间比较的挑战并加强基因和细胞演化假设的验证 | NA | 实现跨物种、基因和细胞的比较，揭示细胞基因表达与细胞功能演化之间的联系 | 单细胞RNA测序数据及其在不同物种和细胞中的比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 系统发育树 | RNA序列 | NA |
| 376 | 2024-08-05 |
Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders
2024-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1699
PMID:38783408
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研究论文 | 这项研究展示了HIV感染患者肠道粘膜免疫细胞的转录组特征 | 研究发现免疫非应答者在肠道浆细胞的比例低于免疫应答者，并探讨了记忆B细胞和滤泡B细胞向浆细胞转化的障碍 | 样本数量有限，只有少数免疫非应答者被纳入研究 | 探讨HIV感染患者中的肠道粘膜免疫细胞在免疫恢复中的作用 | 研究对象包括HIV阴性对照、免疫应答者和免疫非应答者 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据及免疫细胞分析数据 | 54,475个免疫细胞来自五个HIV阴性对照、九个免疫应答者和三个免疫非应答者 |
| 377 | 2024-08-05 |
Single Cell Analysis of Human Colonoids Exposed to Uranium-Bearing Dust
2024-May, Environmental health perspectives
IF:10.1Q1
DOI:10.1289/EHP13855
PMID:38771937
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研究论文 | 本文探讨了人类大肠细胞在铀尘暴露下的分子和细胞变化。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了铀尘暴露对结肠上皮细胞的转录组变化和谱系分化的影响 | 仅使用了来自三名生物学上不同供体的人类大肠细胞，样本量相对较小 | 研究铀尘暴露对结肠的分子和细胞变化 | 人类大肠细胞，特别是分泌谱系细胞和内分泌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自三名生物学上不同供体的人类大肠细胞 |
| 378 | 2024-08-05 |
Cardiopulmonary progenitors facilitate cardiac repair via exosomal transfer of miR-27b-3p targeting the SIK1-CREB1 axis
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13593
PMID:38185757
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研究论文 | 这篇文章探讨了心肺前体细胞在心脏修复中的作用，特别是通过外泌体转移miR-27b-3p靶向SIK1-CREB1轴来促进心脏修复 | 该研究首次揭示心肺前体细胞通过外泌体转移miR-27b-3p促进心脏修复的机制 | 研究只在小鼠模型中进行，临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证 | 研究心肺前体细胞在缺血性心脏疾病中修复受损心脏的机制 | 本研究对象为小鼠胚胎衍生的心肺前体细胞 | 数字病理学 | 缺血性心脏病 | scRNA-seq, miRNA-seq, RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 细胞, RNA | 使用E9.5小鼠胚胎获取心肺前体细胞，具体样本数量未提及 |
| 379 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals the metastasis-associated immune signature of hepatocellular carcinoma
2024-May, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.1264
PMID:38780041
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞癌中的转移相关免疫特征 | 识别出CCR7+树突状细胞的新簇，并确认其在转移性HCC中的表达特征和功能阻滞 | 仅基于细胞转录组数据，未包括其他可能影响免疫微环境的因素 | 探讨肝细胞癌中的转移相关免疫特征 | 肝细胞癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同阶段的HCC患者 |
| 380 | 2024-08-04 |
Multiregional transcriptomics identifies congruent consensus subtypes with prognostic value beyond tumor heterogeneity of colorectal cancer
2024-May-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48706-2
PMID:38773143
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研究论文 | 研究多区域转录组学在结直肠癌中的预后价值及其对肿瘤异质性的影响 | 首次通过多区域转录组学探究了结直肠癌中的凝聚共识分型及其预后能力 | 该研究仅基于单个医院的样本，可能限制了结果的广泛适用性 | 评估转录组异质性对结直肠癌预后的影响及其分类能力 | 对来自692名患者的1093个肿瘤样本进行研究，包括98个原发肿瘤和35对原发-转移样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 1093个肿瘤样本，来自692名患者 |