本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-04 |
Circadian Rhythm Disruption in Hepatocellular Carcinoma Investigated by Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-May-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115748
PMID:38891936
|
研究论文 | 本研究通过整合分析大规模和单细胞RNA测序数据,探讨了肝细胞癌中的生物钟节律失调 | 首次结合大规模RNA转录组分析和单细胞测序,确定与生物钟节律失调相关的基因的表达变化 | 具体的细胞和分子机制尚不清楚 | 研究生物钟节律失调在肝细胞癌发生中的作用及其相关基因 | 肝细胞癌患者的CRD相关基因表达 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Metabolic Changes in Epithelial Glycosphingolipids and Establishes a Prognostic Risk Model for Pancreatic Cancer
2024-May-24, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics14111094
PMID:38893622
|
研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序分析揭示了胰腺癌中上皮糖鞘脂代谢的变化,并建立了预后风险模型 | 首次将上皮糖鞘脂代谢与胰腺癌的预后联系起来,建立了基于六基因的预后模型 | 该研究的样本量及其外部验证的数据库可能限制了结果的广泛适用性 | 探索胰腺癌中糖鞘脂代谢的变化及其与患者预后的关系 | 胰腺腺癌组织中的上皮细胞及其代谢特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞代谢数据 | 胰腺癌患者的单细胞测序数据,具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-05 |
Unraveling Divergent Transcriptomic Profiles: A Comparative Single-Cell RNA Sequencing Study of Epithelium, Gingiva, and Periodontal Ligament Tissues
2024-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115617
PMID:38891804
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序研究牙周组织的转录组特征 | 首次揭示了牙周组织的层次结构和环境因素对细胞组成的影响 | 样本量较小,仅涉及7个组织样本,可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在识别牙周特异性标记以深入了解牙周病理生理 | 主要研究人类牙周韧带、牙龈和上皮组织的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 7个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-05 |
New Insight into Intestinal Mast Cells Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2024-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115594
PMID:38891782
|
综述 | 本综述总结了单细胞转录组学研究如何为肠道肥大细胞的发育及其在健康和疾病中的功能角色提供了见解 | 使用单细胞RNA测序技术揭示的肠道肥大细胞的起源、分化及其表型和功能 | 关于肥大细胞生物学的若干方面尚待澄清 | 探讨肥大细胞的起源、分化及其在不同组织中的功能 | 肠道肥大细胞亚群及其在健康与疾病中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤进展 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of tumour infiltrating T cells efficiently identifies tumour-specific T cell receptors based on the T cell activation score
2024-May-10, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03710-9
PMID:38727812
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序建立了一种有效的方法来分离肿瘤反应性T细胞受体 | 创新性地结合多个激活和效应分子的表达水平来提高肿瘤特异性TCR的分离效率 | 研究仅包含两名肺腺癌患者,样本量较小 | 旨在识别肿瘤特异性T细胞受体以改善癌症治疗 | 研究对象为肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞和自体肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 2名肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing unveils a machine learning-based pan-cancer major histocompatibility complex-related signature for predicting immunotherapy efficacy
2024-May-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03714-5
PMID:38714579
|
研究论文 | 该文章探讨了主要组织相容性复合体(MHC)在肿瘤免疫治疗中的潜在生物标志物作用,并开发了MHCsig以预测免疫治疗的疗效 | 开发了新的MHCsig,可以有效预测多种肿瘤免疫治疗的益处 | NA | 研究MHC与免疫治疗反应之间的关系 | 免疫治疗患者的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 大量的全癌症数据和临床队列 | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-08-05 |
Overexpressing S100A9 ameliorates NK cell dysfunction in estrogen receptor-positive breast cancer
2024-May-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03699-1
PMID:38713229
|
研究论文 | 本研究探讨了S100A9在雌激素受体阳性乳腺癌中的作用,改善了自然杀伤细胞的功能 | 首次揭示了S100A9在ER+/HER2-BC中对NK细胞功能的重要调节作用 | 研究主要集中在细胞及分子水平,临床验证和长时间效应尚不明确 | 探索雌激素受体阳性乳腺癌中NK细胞的功能状态及其调节机制 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞系及其对NK细胞的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞mRNA测序, 批量mRNA测序, qPCR, ELISA | NA | 基因表达数据 | 研究中使用了MCF-7, T47D, MDA-MB-468和MDA-MB-231细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-04 |
Blocking OLFM4/galectin-3 axis in placental polymorphonuclear myeloid-derived suppressor cells triggers intestinal inflammation in newborns
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112058
PMID:38613883
|
研究论文 | 该研究报告了胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症之间的密切关系 | 首次揭示了OLFM4/凝集素-3轴在胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症之间的重要作用 | 该研究未能探讨ELF(外源性生长因子)对结果的潜在影响 | 研究胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症的关联 | 主要研究胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞及其对子代的新生儿肠道炎症的影响 | 数字病理学 | 新生儿坏死性肠炎 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 包括缺乏Olfm4的小鼠母体和健康小鼠的胎盘样本 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-08-05 |
IFI30 as a key regulator of PDL1 immunotherapy prognosis in breast cancer
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112093
PMID:38669947
|
研究论文 | 本研究探讨了IFI30在乳腺癌中的作用及其与PD-L1免疫治疗的预测关系 | 揭示了IFI30在乳腺癌组织中表达上调,并与肿瘤分期和预后显著相关,同时还发现其与免疫相关信号通路的显著关联 | 本研究的具体机制和IFI30与PD-L1轴之间的关系仍不清晰 | 研究IFI30在乳腺癌中的作用及其对PD-L1表达和T细胞浸润的影响 | 乳腺癌组织中的IFI30表达及其与PD-L1的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | RNA,蛋白质 | 通过TCGA和GTEx数据库以及自制的乳腺癌组织微阵列进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-07 |
scRNA-seq: oh, the joys
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02263-0
PMID:38654084
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-08-05 |
Therapeutic Inducers of Natural Killer cell Killing (ThINKK): preclinical assessment of safety and efficacy in allogeneic hematopoietic stem cell transplant settings
2024-May-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008435
PMID:38754915
|
研究论文 | 该研究评估了自然杀伤(NK)细胞杀伤的治疗诱导剂(ThINKK)在异基因造血干细胞移植中的安全性和有效性 | 本研究首次展示了ThINKK细胞具有产量型I干扰素的特性,并且在异基因T细胞激活能力较低 | 未明确指出研究的限制 | 本研究旨在改善异基因HSCT后早期的移植物抗白血病效应 | 该研究的对象为从造血干细胞扩增和分化而来的ThINKK细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | 人类小鼠异种移植模型 | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-04 |
[Mechanism of Fuzheng Huayu Tablets against hepatic fibrosis based on transcriptome and single-cell sequencing]
2024-May, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 本研究探讨了复正化瘤片(FZHY)在肝纤维化治疗中巨噬细胞极化的作用 | 识别出与肝纤维化巨噬细胞极化相关的26个潜在基因,并筛选出10个核心蛋白 | 未提及具体的局限性 | 研究FZHY在肝纤维化治疗中的机制 | 主要研究肝纤维化相关的巨噬细胞及其极化 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞测序、转录组测序 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 小鼠模型的具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-04 |
The 9p21.3 coronary artery disease risk locus drives vascular smooth muscle cells to osteochondrogenic state
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.25.595888
PMID:38853913
|
研究论文 | 这篇文章探讨了9p21.3 CAD风险位点如何驱动血管平滑肌细胞转变为骨软骨生成状态 | 本研究揭示了9p21.3风险单倍型促使VSMCs获取具有骨软骨生成特征的新细胞状态,并识别了一组在这一转录程序中至关重要的标志基因 | 在本文中没有提及具体的局限性 | 研究9p21.3风险位点及其在VSMCs中导致疾病倾向状态的作用 | 诱导性多能干细胞源的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | 使用了来自风险和非风险供体的iPSC细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-05 |
Single-cell and single-nucleus RNA-sequencing from paired normal-adenocarcinoma lung samples provide both common and discordant biological insights
2024-May, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011301
PMID:38814983
|
研究论文 | 本文比较了配对正常-腺癌肺样本中单细胞RNA测序和单核RNA测序的生物学洞见 | 首次系统比较了scRNA-seq和snRNA-seq在正常和腺癌肺组织样本中的一致性和差异性 | 免疫细胞去除的额外操作影响了细胞活力,并放大了与应激反应相关的转录特征 | 探讨正常肺组织向腺癌组织转变的细胞过渡,以及不同RNA测序技术所捕获的生物信息 | 配对的正常及腺癌人类肺样本 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 细胞转录组 | 160,621个细胞/细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-04 |
High-density generation of spatial transcriptomics with STAGE
2024-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae294
PMID:38647109
|
研究论文 | 本文开发了一种名为STAGE的空间位置监督自编码生成器,用于生成高密度的空间转录组数据 | STAGE使用定制的自监督编码器学习基因表达的连续模式,从而能够生成高分辨率的基因表达,并提高空间转录组数据的质量 | 尚未提及关于STAGE的适用范围或者可能存在的局限性 | 研究旨在改善空间转录组技术中数据分辨率和质量的不足 | 研究对象是空间转录组数据集和基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 自编码生成器 | 自编码器 | 转录组数据 | 四个空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-08-04 |
Structural, Functional, and Genetic Changes Surrounding Electrodes Implanted in the Brain
2024-05-07, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00057
PMID:38630432
|
研究论文 | 该文章研究植入电极周围的结构、功能和基因变化,旨在改善可植入神经技术的设计 | 创新点在于开发了新的'设备切片'技术,捕捉慢性植入电极与活体大鼠脑组织的相互作用,并揭示了电极周围组织重塑的新观察结果 | 尚需进一步的信息有效链接生物反应与设备设计的特定方面 | 探讨设备与组织整合的基本科学原理,以改善可植入神经技术的设计 | 研究植入电极周围细胞的结构、功能和基因变化 | 数字病理 | NA | 单细胞电生理学,双光子成像,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,细胞电生理数据 | 使用活体大鼠脑组织进行研究,具体样本大小未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-05 |
Identification of a novel prognostic signature based on vitamin metabolism clustering-related genes in lung adenocarcinoma
2024-May-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-245
PMID:38854940
|
研究论文 | 本研究建立了一个基于维生素代谢相关基因的肺腺癌预后模型 | 首次探索了维生素代谢在肺腺癌中的作用,并建立了一个预后签名 | 未提及样本的多样性和验证该模型在其他人群中的效果 | 旨在识别与肺腺癌相关的维生素代谢差异表达基因 | 研究对象为肺腺癌患者及其维生素代谢模式 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了TCGA-LUAD、GSE68465和GSE72094的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-05 |
Contribution of crosstalk of mesothelial and tumoral epithelial cells in pleural metastasis of lung cancer
2024-May-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-118
PMID:38854934
|
研究论文 | 本文探讨了胸膜转移中间皮细胞与肿瘤上皮细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序系统性调查了不同细胞类型及其在肺癌胸膜转移中的相互作用 | 缺乏对所有可能相关细胞类型全面的探讨和分析 | 研究中间皮细胞与恶性肿瘤细胞在肺癌胸膜转移中的相互作用及其机制 | 肺癌患者的中间皮细胞和肿瘤上皮细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 包括5个来自正常、非恶性疾病及肺癌患者的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-08-05 |
Prognostic impact and immunotherapeutic implications of NETosis-related prognostic model in clear cell renal cell carcinoma
2024-May-27, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05761-y
PMID:38801430
|
研究论文 | 本文构建了一个与坏死性凋亡相关的预后模型,以探讨其在透明细胞肾细胞癌中的影响 | 提出了一个新的与坏死性凋亡相关的预后标识符,并探讨了其在免疫特征和肿瘤突变负担等方面的作用 | 研究的外部验证和算法应用的多样性可能影响结果的广泛适用性 | 研究坏死性凋亡对透明细胞肾细胞癌预后和免疫治疗的影响 | 透明细胞肾细胞癌患者及其相关细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 实时定量PCR(RT-qPCR)、单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了ccRCC组织样本和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-05 |
Machine learning identifies the role of SMAD6 in the prognosis and drug susceptibility in bladder cancer
2024-May-20, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05798-z
PMID:38767747
|
研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌的两种新亚型,并确定了SMAD6作为一个有前景的治疗靶点 | 首次识别SMAD6在膀胱癌预后和药物敏感性中的作用,并发现膀胱癌的两种新亚型 | 尚未在临床试验中验证SMAD6作为治疗靶点的实际效果 | 预测膀胱癌的预后并识别新疗法的精确治疗靶点 | TGF-β信号通路相关基因及其在膀胱癌样本中的表达 | 机器学习 | 膀胱癌 | 无监督聚类分析 | 机器学习分类器 | 转录组数据 | TCGA-BLCA样本 | NA | NA | NA | NA |