单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 540 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-05 |
Non-apoptotic regulatory cell death scoring system to predict the clinical outcome and drug choices in breast cancer
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31342
PMID:38813233
|
研究论文 | 本研究提出了一种新型的非凋亡调节细胞死亡评分系统，用于预测乳腺癌的临床结果和药物选择 | 提出了一个与非凋亡调节细胞死亡相关的新风险特征，有望成为乳腺癌的潜在预后标记 | 未提及具体的局限性 | 研究非凋亡调节细胞死亡在乳腺癌中的作用及其预后价值 | 乳腺癌患者的RNA序列和临床数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA测序 | Lasso回归、随机森林、XGBoost | 基因表达数据 | 从TCGA数据库和GEO数据库使用的样本数量未具体说明 |
| 342 | 2024-08-05 |
GHSR in a subset of GABA neurons controls food deprivation-induced hyperphagia in male mice
2024-May-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae061
PMID:38815068
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研究论文 | 本研究探讨了生长激素分泌素受体（GHSR）在特定GABA神经元中对食物剥夺引起的贪食的调控作用 | 确定了GHSR主要作用于下丘脑弓形核中的非AgRP GABA神经元子集 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不适用于其他物种或更广泛的生理条件 | 验证GHSR在特定GABA神经元中的表达是否足以介导其对进食的影响 | 选择性表达GHSR的特定GABA神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 涉及多个基因型小鼠 |
| 343 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell sequencing and bulk RNA-seq to identify and develop a prognostic signature related to colorectal cancer stem cells
2024-05-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62913-3
PMID:38806611
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序与传统RNA测序相结合，识别并开发与结直肠癌干细胞相关的预后标记。 | 首次提出基于结直肠癌干细胞相关基因的预后风险模型，并鉴定关键基因RPS17作为潜在的预后标记和治疗靶点。 | 目前尚无临床可用的基于CRCSC相关基因的预后标记。 | 研究结直肠癌干细胞在肿瘤转移、复发和化疗耐药中的作用，并开发相关的预后标记。 | 本研究对象为结直肠癌相关干细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因数据 | 使用TCGA和GEO数据库的数据进行分析，样本数量未具体列出 |
| 344 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the evolution of the immune landscape during perihematomal edema progression after intracerebral hemorrhage
2024-May-28, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03113-8
PMID:38807233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑出血后周围血肿水肿的免疫环境演变。 | 首次在单细胞水平上全面描绘了人类周围血肿水肿组织中的多样免疫细胞群体。 | 研究仅限于9名患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性。 | 目标是表征人类周围血肿水肿组织中免疫细胞群体的转录组特征。 | 9名基底节脑出血患者的周围血肿水肿组织样本。 | 数字病理学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 9名患者的周围血肿水肿组织样本 |
| 345 | 2024-08-05 |
GLI1+ Cells Contribute to Vascular Remodeling in Pulmonary Hypertension
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323736
PMID:38639105
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研究论文 | 这篇文章探讨了GLI1+细胞在肺动脉高压中对血管重塑的贡献 | 阐明了GLI1+细胞作为肺动脉高压中血管平滑肌细胞的新来源，并探索了其信号通路的潜在治疗作用 | 尚未完全阐明GLI1+细胞在动态血管重塑过程中的具体机制 | 研究GLI1+细胞在肺动脉高压中的作用及其在血管重塑中的重要性 | 主要研究GLI1+细胞在肺动脉高压小鼠模型中的表型和功能 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 使用了GLI1Cre-ERT2; tdTomatoflox小鼠进行实验分析 |
| 346 | 2024-08-04 |
Analysis of synthetic cellular barcodes in the genome and transcriptome with BARtab and bartools
2024-May-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100763
PMID:38670101
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研究论文 | 本文介绍了一种用于细胞条形码分析的工具BARtab和bartools | 提出了一个综合的端到端细胞条形码分析工具包，包含多个功能以简化数据提取和分析 | 未提及具体的局限性 | 研究细胞条形码在基因组和转录组中的应用 | 针对细胞条形码的网络状况进行分析，包含人群水平、单细胞和空间转录组实验 | 数字病理学 | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | 多个示例样本，包括大样本、单细胞及空间转录组实验 |
| 347 | 2024-08-04 |
Semaglutide ameliorates obesity-induced cardiac inflammation and oxidative stress mediated via reduction of neutrophil Cxcl2, S100a8, and S100a9 expression
2024-May, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-023-04784-2
PMID:37318712
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研究论文 | 本研究探讨了塞马鲁肽在肥胖导致的心脏炎症和氧化压力中的作用。 | 揭示了塞马鲁肽通过降低中性粒细胞Cxcl2、S100a8和S100a9表达来减轻肥胖引起的心脏炎症和氧化压力的新机制。 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理情况。 | 探究肥胖引起的心肌损伤机制及塞马鲁肽的心脏保护影响。 | 肥胖小鼠模型及其心脏组织和血清中的炎症和氧化压力水平。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 血清和心脏组织样本 | 肥胖小鼠模型 |
| 348 | 2024-08-04 |
Immune rebalancing at the maternal-fetal interface of maternal SARS-CoV-2 infection during early pregnancy
2024-May-28, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae006
PMID:38441496
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研究论文 | 该研究分析了早期妊娠中母体SARS-CoV-2感染对母胎界面的影響。 | 发现了早期妊娠中母体感染SARS-CoV-2引起的免疫应答和代谢变化，以及随后建立的新动态平衡。 | 目前对早期妊娠SARS-CoV-2感染对母胎界面的影响仍然了解不足。 | 探讨母体SARS-CoV-2感染对母胎界面的影响及其机制。 | 分析了感染SARS-CoV-2的胎盘样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和代谢组学 | NA | 胎盘样本 | NA |
| 349 | 2024-08-05 |
CCR5-overexpressing mesenchymal stem cells protect against experimental autoimmune uveitis: insights from single-cell transcriptome analysis
2024-May-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03134-3
PMID:38802924
|
研究论文 | 研究CCR5过表达的间充质干细胞在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的保护作用 | 本研究首次显示CCR5在间充质干细胞中过表达可以增强其归巢能力并改善其免疫调节效果，从而预防实验性自身免疫性葡萄膜炎 | 本研究主要基于小鼠模型，临床应用效果和机制仍需进一步验证 | 探讨自身免疫性葡萄膜炎的病理机制及基于间充质干细胞的治疗策略 | 小鼠模型以经典的实验性自身免疫性葡萄膜炎为研究对象 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | scRNA-seq, RNA-seq | NA | RNA序列 | 小鼠模型 |
| 350 | 2024-08-05 |
Deciphering bat influenza H18N11 infection dynamics in male Jamaican fruit bats on a single-cell level
2024-May-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48934-6
PMID:38802391
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自热带果蝠感染的流感病毒H18N11的免疫反应动态 | 首次在单细胞水平上解析了果蝠对流感病毒H18N11的免疫反应 | 研究仅限于雄性牙买加果蝠，可能无法代表其他性别或种群的反应 | 深入了解果蝠对病毒感染的免疫反应 | 雄性牙买加果蝠及其感染的流感病毒H18N11 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 雄性牙买加果蝠若干个体的单细胞样本 |
| 351 | 2024-08-05 |
Integrative analysis indicates the potential values of ANKRD53 in stomach adenocarcinoma
2024-May-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01054-5
PMID:38801557
|
研究论文 | 本研究通过整合分析探讨了ANKRD53在胃腺癌中的潜在价值 | 提出ANKRD53作为胃腺癌的独立预测生物标志物，并与其他临床病理参数结合创建预后列线图 | 未提及 | 研究ANKRD53在胃腺癌中的作用及其预后潜力 | 胃腺癌样本及相关细胞系 | 数字病理 | 胃癌 | RNA-seq和scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | STAD样本与正常样本的比较 |
| 352 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of tumor-associated macrophages and M2 macrophages in CRC: unraveling molecular heterogeneity and developing a novel risk signature
2024-May-27, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01881-z
PMID:38802881
|
研究论文 | 本研究探讨与结直肠癌相关的肿瘤相关巨噬细胞和M2巨噬细胞的分子异质性 | 开发了一种新的与TAM-M2相关的风险签名并发现了新的生物标志物 | 未提及局限性 | 发掘与结直肠癌中TAM-M2巨噬细胞相关的新生物标志物 | 研究对象为结直肠癌中的肿瘤相关巨噬细胞和M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序和传统RNA测序 | LASSO Cox模型 | 基因表达数据 | 涉及377个与TAM-M2相关的基因 |
| 353 | 2024-08-05 |
Deciphering anoikis resistance and identifying prognostic biomarkers in clear cell renal cell carcinoma epithelial cells
2024-05-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62978-0
PMID:38802480
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研究论文 | 本研究针对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的预后和管理挑战进行探讨 | 通过开发新的风险预后模型，识别了与抗坏死相关的关键预后基因，并整合了临床参数进行预测 | 研究的样本规模相对较小，仅涉及七名ccRCC患者 | 研究的目的是揭示ccRCC中的坏死抵抗机制，并识别预后生物标志物 | 研究对象为透明细胞肾细胞癌的上皮细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO和多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 七名ccRCC患者的样本 |
| 354 | 2024-08-05 |
Sustained neurotrophic factor cotreatment enhances donor and host retinal ganglion cell survival in mice
2024-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.07.583961
PMID:38558999
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研究论文 | 本文探讨了神经生长因子的联合治疗如何增强小鼠捐赠者和宿主视网膜神经节细胞的存活 | 首次提出通过使用缓释BDNF和GDNF以改善视网膜微环境，从而增加视网膜神经节细胞存活和功能 | 研究中主要采用小鼠模型，可能无法完全反映人类的生理和病理情况 | 探讨神经生长因子在视网膜神经节细胞移植中的应用潜力 | 研究对象为视网膜神经节细胞及其成长的微环境 | 数字病理 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 数据集 | 涉及人类胎儿视网膜的单细胞RNA测序数据集 |
| 355 | 2024-08-05 |
Comprehensive data mining reveals RTK/RAS signaling pathway as a promoter of prostate cancer lineage plasticity through transcription factors and CNV
2024-05-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62256-z
PMID:38778150
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研究论文 | 本研究揭示了RTK/RAS信号通路通过转录因子和CNV促进前列腺癌谱系可塑性 | 探索了RTK/RAS信号通路与前列腺癌谱系可塑性之间的综合联系，发现了多个新的相关基因 | 对RTK/RAS信号通路与谱系可塑性之间复杂调控网络的探索仍然有限 | 调查RTK/RAS信号通路在前列腺癌谱系可塑性中的作用 | 涉及前列腺癌细胞及其谱系可塑性的多组学数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多组学分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及前列腺癌细胞的多组学数据 |
| 356 | 2024-08-05 |
Interleukin-1 receptor accessory protein blockade limits the development of atherosclerosis and reduces plaque inflammation
2024-May-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae046
PMID:38563353
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research paper | 研究IL1RAP在动脉粥样硬化中的作用 | 开发了一种新型的抗IL1RAP阻断抗体并应用于小鼠模型中 | 本研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨IL1RAP在动脉粥样硬化中的信号传导作用 | 高胆固醇饮食喂养的ApoE缺陷小鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | ApoE缺陷小鼠和人类动脉粥样硬化斑块 |
| 357 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Dynamic Populations of Vascular Cells in Neointimal Hyperplasia
2024-May-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2905173
PMID:38812305
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了新生内膜增生中血管细胞的动态群体。 | 揭示了新生内膜增生中血管细胞的高度异质性，并识别了14个细胞簇和7种细胞类型，重点关注了特定的亚群体。 | 本研究主要基于小鼠模型，可能不能完全代表人类疾病的复杂性。 | 研究新生内膜增生中血管细胞的异质性及其相互作用。 | 小鼠模型中的血管细胞，特别是内皮细胞、血管平滑肌细胞和成纤维细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的左侧颈动脉与右侧颈动脉对照 |
| 358 | 2024-08-05 |
Bioinformatics Analysis Reveals Prognostic Significance of the Macrophage Marker Gene Signature in Gastric Adenocarcinoma
2024-May-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2905172
PMID:38812299
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研究论文 | 本文分析了巨噬细胞标记基因特征在胃腺癌中的预后意义 | 研究构建了一个基于巨噬细胞标记基因特征的风险评分模型，以预测胃腺癌患者的预后 | NA | 评估巨噬细胞标记基因特征在胃腺癌患者预后中的作用 | 胃腺癌患者的个体临床数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，RNA-seq | 风险评分模型，列线图模型 | 基因表达数据 | NA |
| 359 | 2024-08-04 |
Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals Heterogeneity of Early Pig Skin Development and a Subpopulation with Hair Placode Formation
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306703
PMID:38561967
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研究论文 | 本文通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了早期猪皮肤发育的异质性和毛发小丘形成的亚群体 | 首次描述了胚胎皮肤的空间时间转录组图谱，为研究皮肤相关疾病提供了重要资源 | 尚未建立完整的跨物种比较，且对皮肤细胞的相对代表性分析仍需更多研究 | 了解早期猪皮肤发育及其与人类皮肤疾病的关系 | 正常和无毛猪胎儿的皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤相关疾病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 皮肤样本 | 四个发育阶段的正常和无毛胎猪皮肤样本 |
| 360 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial analysis reveals MUC1-mediated cellular crosstalk in mucinous colorectal adenocarcinoma
2024-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1701
PMID:38778448
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研究论文 | 本研究整合了单细胞RNA测序和空间转录组数据，以系统性描述粘液性结直肠腺癌的肿瘤微环境 | 研究揭示了MUC1介导的细胞间相互作用，为粘液性结直肠腺癌的治疗提供了新的机制信息 | 研究的病理特征模糊，治疗方法仍然面临挑战 | 深入理解粘液性结直肠腺癌的细胞水平转录动态，以开发专门的治疗策略 | 研究对象包括粘液性结直肠腺癌的肿瘤细胞、间质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 三维生物打印技术 | RNA数据 | 涉及的样本数量和类型未明确指出 |