单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 539 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-05 |
Bioinformatic Analysis of Gene Expression Related to Sialic Acid Biosynthesis in Patients With Medulloblastoma
2024-May, Cureus
DOI:10.7759/cureus.59997
PMID:38854216
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨与小脑胶质瘤患者中唾液酸代谢相关的基因表达。 | 首次在小脑胶质瘤中揭示了唾液酸代谢相关基因的异常表达及其与整体生存率的关联。 | 本研究依赖于公开数据库，需进一步实验验证其结果。 | 探讨唾液酸相关基因在小脑胶质瘤患者中的表达及其对生存率的影响。 | 小脑胶质瘤患者的基因表达及其与唾液酸代谢的关系。 | 数字病理学 | 小脑胶质瘤 | RNA-seq | Cox回归模型 | 文本 | 包含来自不同分子亚组的大量小脑胶质瘤样本 |
| 302 | 2024-08-05 |
Fourteen years of cellular deconvolution: methodology, applications, technical evaluation and outstanding challenges
2024-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae267
PMID:38619038
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综述 | 本文提供了关于53种细胞去卷积方法的全面综述 | 本文通过对53种方法进行基准测试，填补了细胞去卷积方法选择的空白 | 缺乏足够的文档和性能评估，使得生命科学家难以选择合适的方法 | 研究细胞去卷积方法及其在生物医学研究中的应用 | 对53种细胞去卷积方法的技术评估和应用现状进行综述 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA数据 | 63名个体的30种组织中283种细胞类型 |
| 303 | 2024-08-04 |
Single-cell metabolomics in rare disease: From technology to disease
2024-May-31, Intractable & rare diseases research
IF:1.1Q2
DOI:10.5582/irdr.2023.01073
PMID:38836176
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研究论文 | 该文章探讨了单细胞代谢组学在稀有疾病中的应用和潜力 | 文章创新性地提出单细胞代谢组学能够彻底改变稀有疾病的诊断、治疗和管理策略 | 文章未具体说明现有研究的局限性 | 推动稀有疾病的准确和快速诊断，并促进治疗药物的发展 | 稀有疾病，特别是代谢类稀有疾病 | 数字病理学 | 稀有疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-08-05 |
CD47, a novel YAP target gene, contributes to hepatic stellate cell activation and liver fibrosis induced by high-fat diet
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31621
PMID:38831842
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研究论文 | 本研究探讨了CD47在高脂饮食诱导的肝星状细胞活化和肝纤维化中的作用 | 本研究首次揭示了CD47作为YAP的转录靶点，在高脂饮食条件下促进肝星状细胞活化的机制 | 关于CD47在肝星状细胞中的具体调控机制仍不完全明了 | 研究CD47在肝星状细胞活化及肝纤维化中的角色及其调控机制 | 小鼠肝星状细胞及其在高脂饮食条件下的行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 305 | 2024-08-04 |
Harnessing TME depicted by histological images to improve cancer prognosis through a deep learning system
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101536
PMID:38697103
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研究论文 | 本研究提供了一种强大的深度学习系统，通过组织学图像增强肿瘤微环境(TME)信息以改善癌症预后 | 提出了整合图像和图形深度学习的模型(IGI-DL)，并开发了基于TME的癌症预后预测模型 | 研究未涉及空间转录组学(ST)的临床可用性限制 | 改善癌症预后，尤其是在没有ST数据的患者中 | 使用组织学图像来预测癌症预后和TME | 数字病理学 | 乳腺癌和结直肠癌 | 深度学习 | IGI-DL模型 | 组织学图像 | 使用The Cancer Genome Atlas的乳腺癌和结直肠癌队列，以及外部的Molecular and Cellular Oncology结直肠癌队列 |
| 306 | 2024-08-04 |
Targeting PDGF signaling of cancer-associated fibroblasts blocks feedback activation of HIF-1α and tumor progression of clear cell ovarian cancer
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101532
PMID:38670097
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研究论文 | 该研究探讨了与卵巢透明细胞癌相关的癌症相关成纤维细胞的PDGF信号通路。 | 该研究揭示了在卵巢透明细胞癌中的化疗抗性机制，并提出了针对CAFs的治疗策略。 | 该研究主要基于体外和小鼠模型，临床相关性仍需进一步验证。 | 研究卵巢透明细胞癌的化疗抗性机制及潜在的治疗方法。 | 卵巢透明细胞癌患者的手术标本及其相关的癌症相关成纤维细胞。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞分析和空间转录组学 | NA | 显微镜图像 | 手术标本分析及共培养实验 |
| 307 | 2024-08-05 |
A comprehensive single-cell breast tumor atlas defines epithelial and immune heterogeneity and interactions predicting anti-PD-1 therapy response
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101511
PMID:38614094
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研究论文 | 我们展示了一个包含236,363个细胞的初级乳腺肿瘤微环境单细胞RNA测序综合图谱 | 首次通过InteractPrint方法揭示了肿瘤上皮细胞与免疫细胞的相互作用，并能够预测抗PD-1治疗的反应 | 在这项研究中没有提到样本的时间顺序或长期效果的评估 | 目标是分析乳腺肿瘤微环境中免疫和肿瘤上皮细胞的异质性 | 本研究的对象包括来自119个活检样本的肿瘤微环境中的免疫细胞和癌上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | InteractPrint | 细胞数据 | 119个活检样本 |
| 308 | 2024-08-05 |
Monocyte bioenergetics: An immunometabolic perspective in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101564
PMID:38733988
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研究论文 | 本文揭示了代谢功能障碍相关脂肪肝炎患者外周单核细胞的生物能量特征 | 首次指出在代谢功能障碍相关脂肪肝炎中，外周单核细胞表现出特定的高糖酵解和线粒体呼吸特征 | 研究主要基于小鼠模型，临床适用性可能受限 | 探讨单核细胞的生物能量特征在代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的作用 | 代谢功能障碍相关脂肪肝炎患者的外周单核细胞 | 免疫代谢 | 代谢功能障碍相关脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 309 | 2024-08-05 |
Chemoradiotherapy-induced ACKR2+ tumor cells drive CD8+ T cell senescence and cervical cancer recurrence
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101550
PMID:38723624
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研究论文 | 该文章探讨了化学放疗（CCRT）后宫颈癌复发的机制，发现ACKR2+肿瘤细胞在驱动CD8+ T细胞衰老中的作用 | 创新点在于识别出了一种特定的CCRT耐药性ACKR2+肿瘤细胞亚群，以及其在CD8+ T细胞衰老与肿瘤复发中的作用 | 本研究的局限性在于主要依赖回顾性分析，可能存在选择偏倚 | 研究化学放疗后宫颈癌复发的机制及预测指标 | 研究对象为宫颈癌患者的肿瘤组织样本，特别关注化学放疗前后的变化 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 310 | 2024-08-05 |
IL-7-primed bystander CD8 tumor-infiltrating lymphocytes optimize the antitumor efficacy of T cell engager immunotherapy
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101567
PMID:38744277
|
研究论文 | 本研究探讨了Fc融合IL-7如何优化T细胞接合物免疫疗法的抗肿瘤效果 | 发现rhIL-7-hyFc能显著增加肿瘤浸润的非反应性旁观者CD8 T细胞，这些细胞在特定的T细胞接合物的作用下可转化为具有肿瘤杀伤能力的细胞 | 本研究主要集中在固体肿瘤中CD8 T细胞的变化，可能未涵盖其他类型肿瘤或免疫细胞的作用 | 探讨如何通过IL-7增强T细胞接合物免疫疗法在固体肿瘤中的效果 | 研究目的是分析IL-7对肿瘤浸润CD8 T细胞的影响及其在免疫疗法中的应用 | NA | 肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 多种固体肿瘤中的CD8肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 311 | 2024-08-04 |
Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-May-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48282-5
PMID:38729950
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研究论文 | 本研究介绍了一种成本效益高的疾病建模方法，结合了混合的肿瘤类器官和单细胞RNA测序技术 | 提出了一种计算方法Vireo-bulk，有效分解混合RNA-seq数据，并揭示了供体iPSC系在巨噬细胞分化过程中的异质性 | 研究中未提及具体样本量和其他潜在的实验限制 | 旨在通过混合的bulk和单细胞RNA测序技术提高疾病建模的成本效益 | 以同源诱导多能干细胞分化的类器官为研究对象，探索疾病机制 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA |
| 312 | 2024-08-05 |
Investigation of ENO2 as a promising novel marker for the progression of colorectal cancer with microsatellite instability-high
2024-May-09, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12332-4
PMID:38724951
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研究论文 | 本研究探讨了ENO2作为微卫星不稳定高（MSI-H）结直肠癌进展的潜在新标志物。 | 该研究首次揭示了ENO2在MSI-H结直肠癌中的中心基因作用，并建立了基于ENO2的预后预测模型。 | 该研究仅基于单细胞RNA测序数据，临床验证可能需要更多样本与多中心数据支持。 | 探索微卫星不稳定高结直肠癌的代谢转录组相关亚型并识别预后生物标志物。 | 微卫星不稳定高结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 313 | 2024-08-04 |
A Clustering Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Automatic Weighting Penalty and Low-Rank Representation
2024 May-Jun, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3362472
PMID:38319777
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研究论文 | 本文提出了一种基于自动加权惩罚和低秩表示的单细胞RNA-Seq数据聚类方法 | 引入加权距离约束并结合相似性约束，提出JAGLRR聚类方法，提高了特征贡献的评估 | 未提及具体的局限性 | 改善现有单细胞RNA-Seq数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 数据集 | 8个真实数据集和模拟数据集 |
| 314 | 2024-08-05 |
LPCAT2 inhibits colorectal cancer progression via the PRMT1/SLC7A11 axis
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-02996-4
PMID:38605214
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研究论文 | 本研究揭示LPCAT2通过PRMT1/SLC7A11轴抑制结直肠癌的进展 | 发现LPCAT2能够通过调节PRMT1的细胞质定位来影响SLC7A11的表达，从而诱导结直肠癌细胞的铁死亡 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用的可行性尚需进一步验证 | 阐明LPCAT2在结直肠癌细胞中的作用机制及其潜在的治疗靶点 | 人类和小鼠结直肠癌组织中的LPCAT2+和LPCAT2-肿瘤细胞群体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 实验室试验 | 小鼠结肠癌模型 | 生物组织样本 | 人类和小鼠结直肠癌组织中的多个样本 |
| 315 | 2024-08-05 |
NGEF is a potential prognostic biomarker and could serve as an indicator for immunotherapy and chemotherapy in lung adenocarcinoma
2024-May-19, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-024-03046-1
PMID:38764064
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研究论文 | 本研究评估了NGEF作为肺腺癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点的有效性 | 揭示了NGEF在肺腺癌中的作用，并指出其与肿瘤阶段、免疫浸润和化疗反应的显著关联 | 未明确指出具体的局限性 | 研究NGEF在肺腺癌中的预后价值和作为治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者的NGEF表达及其与临床特征的关联 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 定量聚合酶链反应, 免疫组化染色, 西方印迹分析 | NA | NA | LUAD样本中基于中位数NGEF表达构建的高低表达组 |
| 316 | 2024-08-05 |
Enhancement of the function of mesenchymal stem cells by using a GMP-grade three-dimensional hypoxic large-scale production system
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30968
PMID:38826705
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研究论文 | 建立了一种GMP级三维缺氧大规模生产系统以增强间充质干细胞（MSCs）的功能 | 提出了一种新型的TDHLSP系统，能够有效提高临床级MSCs的生产并改善其功能特性 | 在CD142表达下调后，3D_Hypo MSCs的增强功能显著下降 | 旨在建立一种大规模生产间充质干细胞的系统，并分析不同培养条件下的生物差异 | 研究目标是探讨在不同培养环境下生成的间充质干细胞的功能表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 2×10^8个间充质干细胞 |
| 317 | 2024-08-05 |
Serum ITIH5 as a novel diagnostic biomarker in cholangiocarcinoma
2024-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16143
PMID:38475675
|
研究论文 | 本研究旨在识别用于胆管癌诊断的独特分泌蛋白ITIH5。 | ITIH5在胆管癌中的特异性上调，且未在大多数其他癌症或良性肝胆疾病中观察到。 | 本研究的样本量及适用范围尚未明确说明。 | 研究的目的是确定胆管癌的特异性诊断生物标志物。 | 研究对象包括胆管癌及与其对比的其他恶性肿瘤、良性肝胆疾病和慢性肝病。 | 数字病理学 | 胆管癌 | RNA测序 | NA | 组织和血清样本 | NA |
| 318 | 2024-08-05 |
Beyond binary: bridging neutrophil diversity to new therapeutic approaches in NSCLC
2024-May, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.010
PMID:38360439
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综述 | 这篇文章总结了肿瘤相关中性粒细胞（TAN）生物学的最新数据和模型，关注在肿瘤内在信号影响下演变的多样性 | 文章通过对不同癌症实体的转录组特征进行分类，提出了一种新的中性粒细胞亚群分类，以超越传统的N1/N2二元分类 | 文章的局限性在于未能提供关于中性粒细胞在抗癌治疗中的具体应用实例 | 研究肿瘤微环境中中性粒细胞的多样性及其对抗癌治疗的影响 | 主要研究非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤微环境中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 319 | 2024-08-04 |
Multi-model analysis of gallbladder cancer reveals the role of OxLDL-absorbing neutrophils in promoting liver invasion
2024-May-31, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00521-7
PMID:38822440
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研究论文 | 本研究分析了胆囊癌及其免疫抑制的肿瘤微环境，突出显示了中性粒细胞在促进肝脏入侵中的作用 | 本研究识别了一种能够通过OLR1吸收oxLDL的促肿瘤中性粒细胞亚群，揭示了其独特的代谢特性和促进肿瘤侵袭的潜力 | 研究的限制在于未深入探讨不同阶段胆囊癌的细胞间相互作用及其机制 | 研究胆囊癌肿瘤微环境中特定中性粒细胞的作用及其对肝脏入侵的影响 | 主要研究对象为胆囊癌（GBC）中的中性粒细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组学 (ST), 蛋白组学, 多重免疫组化 (mIHC) | NA | NA | 多种肿瘤阶段的胆囊癌样本 |
| 320 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Myocardial Fibrosis Mechanism of Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity
2024-May-31, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-302
PMID:38749755
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了多柔比星诱导心肌纤维化的机制 | 首次明确了多柔比星诱导心肌纤维化的细胞和分子介导因素，并发现了可以作为治疗靶点的Ctsb | 主要研究集中在小鼠模型上，可能在临床应用中存在差异 | 探索多柔比星诱导的心脏毒性和心肌纤维化机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 正常和多柔比星诱导慢性心脏毒性的鼠模型心脏组织中的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |