单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 540 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-05 |
Chemoradiotherapy-induced ACKR2+ tumor cells drive CD8+ T cell senescence and cervical cancer recurrence
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101550
PMID:38723624
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研究论文 | 该文章探讨了化学放疗（CCRT）后宫颈癌复发的机制，发现ACKR2+肿瘤细胞在驱动CD8+ T细胞衰老中的作用 | 创新点在于识别出了一种特定的CCRT耐药性ACKR2+肿瘤细胞亚群，以及其在CD8+ T细胞衰老与肿瘤复发中的作用 | 本研究的局限性在于主要依赖回顾性分析，可能存在选择偏倚 | 研究化学放疗后宫颈癌复发的机制及预测指标 | 研究对象为宫颈癌患者的肿瘤组织样本，特别关注化学放疗前后的变化 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 302 | 2024-08-05 |
IL-7-primed bystander CD8 tumor-infiltrating lymphocytes optimize the antitumor efficacy of T cell engager immunotherapy
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101567
PMID:38744277
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研究论文 | 本研究探讨了Fc融合IL-7如何优化T细胞接合物免疫疗法的抗肿瘤效果 | 发现rhIL-7-hyFc能显著增加肿瘤浸润的非反应性旁观者CD8 T细胞，这些细胞在特定的T细胞接合物的作用下可转化为具有肿瘤杀伤能力的细胞 | 本研究主要集中在固体肿瘤中CD8 T细胞的变化，可能未涵盖其他类型肿瘤或免疫细胞的作用 | 探讨如何通过IL-7增强T细胞接合物免疫疗法在固体肿瘤中的效果 | 研究目的是分析IL-7对肿瘤浸润CD8 T细胞的影响及其在免疫疗法中的应用 | NA | 肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 多种固体肿瘤中的CD8肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 303 | 2024-08-04 |
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-May-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01838-9
PMID:38811552
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研究论文 | 本文展示了靶向BCL9/BCL9L通过促进常规1型树突细胞的激活和肿瘤渗透来增强抗原呈递的效果 | 发明了一种新的抑制剂hsBCL9，表明其在抑制肿瘤生长和促进抗肿瘤CD8 T细胞反应方面的有效性 | 对BCL9/BCL9L在肿瘤中是否损害抗原呈递的机制仍未完全理解 | 研究BCL9/BCL9L在抗肿瘤免疫中的作用及其对抗原呈递的影响 | 探讨BCL9/BCL9L的靶向对常规1型树突细胞的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 药理抑制及单细胞转录组学分析 | NA | 细胞分析数据 | 使用Bcl9/Bcl9l敲除小鼠和野生型小鼠进行比较分析 |
| 304 | 2024-08-04 |
Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-May-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48282-5
PMID:38729950
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研究论文 | 本研究介绍了一种成本效益高的疾病建模方法，结合了混合的肿瘤类器官和单细胞RNA测序技术 | 提出了一种计算方法Vireo-bulk，有效分解混合RNA-seq数据，并揭示了供体iPSC系在巨噬细胞分化过程中的异质性 | 研究中未提及具体样本量和其他潜在的实验限制 | 旨在通过混合的bulk和单细胞RNA测序技术提高疾病建模的成本效益 | 以同源诱导多能干细胞分化的类器官为研究对象，探索疾病机制 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA |
| 305 | 2024-08-05 |
Investigation of ENO2 as a promising novel marker for the progression of colorectal cancer with microsatellite instability-high
2024-May-09, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12332-4
PMID:38724951
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研究论文 | 本研究探讨了ENO2作为微卫星不稳定高（MSI-H）结直肠癌进展的潜在新标志物。 | 该研究首次揭示了ENO2在MSI-H结直肠癌中的中心基因作用，并建立了基于ENO2的预后预测模型。 | 该研究仅基于单细胞RNA测序数据，临床验证可能需要更多样本与多中心数据支持。 | 探索微卫星不稳定高结直肠癌的代谢转录组相关亚型并识别预后生物标志物。 | 微卫星不稳定高结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 306 | 2024-08-04 |
A Clustering Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Automatic Weighting Penalty and Low-Rank Representation
2024 May-Jun, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3362472
PMID:38319777
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研究论文 | 本文提出了一种基于自动加权惩罚和低秩表示的单细胞RNA-Seq数据聚类方法 | 引入加权距离约束并结合相似性约束，提出JAGLRR聚类方法，提高了特征贡献的评估 | 未提及具体的局限性 | 改善现有单细胞RNA-Seq数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 数据集 | 8个真实数据集和模拟数据集 |
| 307 | 2024-08-05 |
LPCAT2 inhibits colorectal cancer progression via the PRMT1/SLC7A11 axis
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-02996-4
PMID:38605214
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研究论文 | 本研究揭示LPCAT2通过PRMT1/SLC7A11轴抑制结直肠癌的进展 | 发现LPCAT2能够通过调节PRMT1的细胞质定位来影响SLC7A11的表达，从而诱导结直肠癌细胞的铁死亡 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用的可行性尚需进一步验证 | 阐明LPCAT2在结直肠癌细胞中的作用机制及其潜在的治疗靶点 | 人类和小鼠结直肠癌组织中的LPCAT2+和LPCAT2-肿瘤细胞群体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 实验室试验 | 小鼠结肠癌模型 | 生物组织样本 | 人类和小鼠结直肠癌组织中的多个样本 |
| 308 | 2024-08-05 |
Melanocyte stem cells in the skin: Origin, biological characteristics, homeostatic maintenance and therapeutic potential
2024-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1720
PMID:38778457
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综述 | 这篇综述提供了皮肤黑素干细胞的起源、生物特性、稳态维护和治疗潜力的全面概述 | 强调了单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9技术和实践模型在黑素干细胞研究中的重要性 | NA | 提升对黑素干细胞生物特性和微环境调控机制的理解，以改善其在临床应用中的效果 | 皮肤黑素干细胞及其在皮肤疾病中的作用 | 再生医学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序，CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-08-05 |
NGEF is a potential prognostic biomarker and could serve as an indicator for immunotherapy and chemotherapy in lung adenocarcinoma
2024-May-19, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-024-03046-1
PMID:38764064
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研究论文 | 本研究评估了NGEF作为肺腺癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点的有效性 | 揭示了NGEF在肺腺癌中的作用，并指出其与肿瘤阶段、免疫浸润和化疗反应的显著关联 | 未明确指出具体的局限性 | 研究NGEF在肺腺癌中的预后价值和作为治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者的NGEF表达及其与临床特征的关联 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 定量聚合酶链反应, 免疫组化染色, 西方印迹分析 | NA | NA | LUAD样本中基于中位数NGEF表达构建的高低表达组 |
| 310 | 2024-08-05 |
Enhancement of the function of mesenchymal stem cells by using a GMP-grade three-dimensional hypoxic large-scale production system
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30968
PMID:38826705
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研究论文 | 建立了一种GMP级三维缺氧大规模生产系统以增强间充质干细胞（MSCs）的功能 | 提出了一种新型的TDHLSP系统，能够有效提高临床级MSCs的生产并改善其功能特性 | 在CD142表达下调后，3D_Hypo MSCs的增强功能显著下降 | 旨在建立一种大规模生产间充质干细胞的系统，并分析不同培养条件下的生物差异 | 研究目标是探讨在不同培养环境下生成的间充质干细胞的功能表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 2×10^8个间充质干细胞 |
| 311 | 2024-08-05 |
Serum ITIH5 as a novel diagnostic biomarker in cholangiocarcinoma
2024-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16143
PMID:38475675
|
研究论文 | 本研究旨在识别用于胆管癌诊断的独特分泌蛋白ITIH5。 | ITIH5在胆管癌中的特异性上调，且未在大多数其他癌症或良性肝胆疾病中观察到。 | 本研究的样本量及适用范围尚未明确说明。 | 研究的目的是确定胆管癌的特异性诊断生物标志物。 | 研究对象包括胆管癌及与其对比的其他恶性肿瘤、良性肝胆疾病和慢性肝病。 | 数字病理学 | 胆管癌 | RNA测序 | NA | 组织和血清样本 | NA |
| 312 | 2024-08-05 |
Beyond binary: bridging neutrophil diversity to new therapeutic approaches in NSCLC
2024-May, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.010
PMID:38360439
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综述 | 这篇文章总结了肿瘤相关中性粒细胞（TAN）生物学的最新数据和模型，关注在肿瘤内在信号影响下演变的多样性 | 文章通过对不同癌症实体的转录组特征进行分类，提出了一种新的中性粒细胞亚群分类，以超越传统的N1/N2二元分类 | 文章的局限性在于未能提供关于中性粒细胞在抗癌治疗中的具体应用实例 | 研究肿瘤微环境中中性粒细胞的多样性及其对抗癌治疗的影响 | 主要研究非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤微环境中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 313 | 2024-08-04 |
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-May-31, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01840-1
PMID:38816371
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综述 | 本文系统总结了巨噬细胞在心血管疾病中的多样性表型和功能可塑性及其调控机制 | 首次引入了单细胞测序技术的新视角，揭示了巨噬细胞的异质性及其在心血管疾病中的潜在治疗靶点 | 研究主要集中在巨噬细胞的功能和表型塑性，未涉及所有类型心血管疾病的综合分析 | 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的调控机制与治疗靶点 | 心血管疾病中的巨噬细胞及其相关机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-08-04 |
Multi-model analysis of gallbladder cancer reveals the role of OxLDL-absorbing neutrophils in promoting liver invasion
2024-May-31, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00521-7
PMID:38822440
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研究论文 | 本研究分析了胆囊癌及其免疫抑制的肿瘤微环境，突出显示了中性粒细胞在促进肝脏入侵中的作用 | 本研究识别了一种能够通过OLR1吸收oxLDL的促肿瘤中性粒细胞亚群，揭示了其独特的代谢特性和促进肿瘤侵袭的潜力 | 研究的限制在于未深入探讨不同阶段胆囊癌的细胞间相互作用及其机制 | 研究胆囊癌肿瘤微环境中特定中性粒细胞的作用及其对肝脏入侵的影响 | 主要研究对象为胆囊癌（GBC）中的中性粒细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组学 (ST), 蛋白组学, 多重免疫组化 (mIHC) | NA | NA | 多种肿瘤阶段的胆囊癌样本 |
| 315 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Myocardial Fibrosis Mechanism of Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity
2024-May-31, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-302
PMID:38749755
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了多柔比星诱导心肌纤维化的机制 | 首次明确了多柔比星诱导心肌纤维化的细胞和分子介导因素，并发现了可以作为治疗靶点的Ctsb | 主要研究集中在小鼠模型上，可能在临床应用中存在差异 | 探索多柔比星诱导的心脏毒性和心肌纤维化机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 正常和多柔比星诱导慢性心脏毒性的鼠模型心脏组织中的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 316 | 2024-08-05 |
Proteomic analysis of pleomorphic dermal sarcoma reveals a fibroblastic cell of origin and distinct immune evasion mechanisms
2024-05-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62927-x
PMID:38822058
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析发现多形性皮肤肉瘤的细胞来源和独特的免疫逃逸机制 | 首次识别出多形性皮肤肉瘤的潜在细胞来源及其免疫逃逸机制 | 样本数量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨多形性皮肤肉瘤的细胞起源及其免疫逃逸途径 | 分析健康皮肤、恶性黑色素瘤、鳞状细胞癌和多形性皮肤肉瘤的样本 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 质谱 | NA | 蛋白质数据、单细胞测序数据 | 分析了20个正常皮肤样本、27个恶性黑色素瘤样本、20个鳞状细胞癌样本和24个多形性皮肤肉瘤样本 |
| 317 | 2024-08-04 |
Direct comparison of mass cytometry and single-cell RNA sequencing of human peripheral blood mononuclear cells
2024-May-30, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03399-6
PMID:38816402
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研究论文 | 本文直接比较了人类外周血单核细胞的质谱细胞术和单细胞RNA测序 | 通过整合质谱细胞术和单细胞RNA测序的数据，提供了细胞类型特征的高分辨率分析 | 缺乏合适的金标准数据集用于评估新单细胞分析工具的有效性 | 探讨转录组学和蛋白质组学之间的关系 | 人类外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，质谱细胞术，流式细胞术 | NA | RNA，蛋白质 | 人类外周血单核细胞的分样本 |
| 318 | 2024-08-05 |
Neoantigen-specific stimulation of tumor-infiltrating lymphocytes enables effective TCR isolation and expansion while preserving stem-like memory phenotypes
2024-May-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008645
PMID:38816232
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研究论文 | 本研究探讨了针对新抗原特异性刺激肿瘤浸润淋巴细胞的效果。 | 开发了一种名为'NeoExpand'的体外刺激方法，能够选择性扩展新抗原反应性的TIL，改善其表型和功能。 | 研究样本仅限于具有p53或RAS突变的25名患者，可能影响结果的普遍适用性。 | 探讨如何优化新抗原反应性肿瘤浸润淋巴细胞的扩展和分离。 | 25名来自肺癌患者的肿瘤样本中的肿瘤浸润淋巴细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 体外刺激 | NA | 样本 | 25个TIL样本 |
| 319 | 2024-08-04 |
Multi-modal domain adaptation for revealing spatial functional landscape from spatially resolved transcriptomics
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae257
PMID:38819253
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研究论文 | 提出了一种用于空间转录组学的多模态领域适应方法stMDA，以揭示空间功能格局 | stMDA整合了基因表达和其他模态的信息，提供了高效的空间聚类和变异分析 | 该研究可能在特定条件下仍面临数据稀疏性的挑战 | 该研究旨在提高空间转录组数据的分析能力 | 主要研究对象为空间转录组学数据及其多模态信息 | 数字病理学 | 癌症组织 | 多模态无监督领域适应 | 多种神经网络架构 | 基因表达数据和其他模态数据 | 涉及多种平台和物种的多样本数据 |
| 320 | 2024-08-04 |
3D reconstruction of a gastrulating human embryo
2024-May-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.041
PMID:38657603
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研究论文 | 本研究建立了一个人类胚胎的三维模型，以理解早期人类发育，特别是在胚胎发生的重塑阶段。 | 通过高分辨率空间转录组分析，从自然胚胎获得了宝贵的参考数据集，填补了该领域的空白。 | 该研究主要依赖于来自单一样本的空间转录组数据，可能限制了结果的普适性。 | 探讨人类胚胎发育中重要阶段的细胞谱系和组织模式。 | 该研究对象是来自完整卡内基阶段8的人类胚胎的62个横截面。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 三维模型 | 基因表达数据 | 62个横截面 |