单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 558 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
Chemoradiotherapy-induced ACKR2+ tumor cells drive CD8+ T cell senescence and cervical cancer recurrence
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101550
PMID:38723624
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研究论文 | 该文章探讨了化学放疗（CCRT）后宫颈癌复发的机制，发现ACKR2+肿瘤细胞在驱动CD8+ T细胞衰老中的作用 | 创新点在于识别出了一种特定的CCRT耐药性ACKR2+肿瘤细胞亚群，以及其在CD8+ T细胞衰老与肿瘤复发中的作用 | 本研究的局限性在于主要依赖回顾性分析，可能存在选择偏倚 | 研究化学放疗后宫颈癌复发的机制及预测指标 | 研究对象为宫颈癌患者的肿瘤组织样本，特别关注化学放疗前后的变化 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 262 | 2024-08-05 |
IL-7-primed bystander CD8 tumor-infiltrating lymphocytes optimize the antitumor efficacy of T cell engager immunotherapy
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101567
PMID:38744277
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研究论文 | 本研究探讨了Fc融合IL-7如何优化T细胞接合物免疫疗法的抗肿瘤效果 | 发现rhIL-7-hyFc能显著增加肿瘤浸润的非反应性旁观者CD8 T细胞，这些细胞在特定的T细胞接合物的作用下可转化为具有肿瘤杀伤能力的细胞 | 本研究主要集中在固体肿瘤中CD8 T细胞的变化，可能未涵盖其他类型肿瘤或免疫细胞的作用 | 探讨如何通过IL-7增强T细胞接合物免疫疗法在固体肿瘤中的效果 | 研究目的是分析IL-7对肿瘤浸润CD8 T细胞的影响及其在免疫疗法中的应用 | NA | 肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 多种固体肿瘤中的CD8肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 263 | 2024-08-04 |
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-May-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01838-9
PMID:38811552
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研究论文 | 本文展示了靶向BCL9/BCL9L通过促进常规1型树突细胞的激活和肿瘤渗透来增强抗原呈递的效果 | 发明了一种新的抑制剂hsBCL9，表明其在抑制肿瘤生长和促进抗肿瘤CD8 T细胞反应方面的有效性 | 对BCL9/BCL9L在肿瘤中是否损害抗原呈递的机制仍未完全理解 | 研究BCL9/BCL9L在抗肿瘤免疫中的作用及其对抗原呈递的影响 | 探讨BCL9/BCL9L的靶向对常规1型树突细胞的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 药理抑制及单细胞转录组学分析 | NA | 细胞分析数据 | 使用Bcl9/Bcl9l敲除小鼠和野生型小鼠进行比较分析 |
| 264 | 2024-08-05 |
Sympathetic hyperinnervation drives abdominal aortic aneurysm development by promoting vascular smooth muscle cell phenotypic switching
2024-May-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.028
PMID:38821358
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研究论文 | 这项研究探讨了交感神经过度支配在腹主动脉瘤（AAA）发展中的作用和相关机制 | 文章首次揭示了由骨吸收样细胞分泌的Sema4D通过促进血管平滑肌细胞表型转换，驱动交感神经过度支配加速AAA进展的新机制 | 研究主要集中在小鼠模型和AAA患者中，缺乏其他类型样本的验证 | 本研究旨在探讨交感神经过度支配在促进AAA发展中的作用及其机制 | 研究对象包括小鼠模型和AAA患者样本 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | Western blot和免疫组化染色，转录组和功能研究，单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用小鼠模型和AAA患者样本，样本具体数量未提供 |
| 265 | 2024-08-04 |
Inferring B Cell Phylogenies from Paired H and L Chain BCR Sequences with Dowser
2024-May-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300851
PMID:38557795
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研究论文 | 这项研究探讨了如何利用配对的重链和轻链BCR序列构建B细胞的系统发育树 | 首次将配对的重链和轻链序列结合以提高系统发育树的准确性和重现性 | 当某些轻链缺失时，许多系统发育方法估计的分支长度存在显著偏差 | 研究如何利用配对的H链和L链序列来构建B细胞的系统发育树 | 配对的重链和轻链BCR序列 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 最大似然法 | 基因序列 | NA |
| 266 | 2024-08-04 |
Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-May-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48282-5
PMID:38729950
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研究论文 | 本研究介绍了一种成本效益高的疾病建模方法，结合了混合的肿瘤类器官和单细胞RNA测序技术 | 提出了一种计算方法Vireo-bulk，有效分解混合RNA-seq数据，并揭示了供体iPSC系在巨噬细胞分化过程中的异质性 | 研究中未提及具体样本量和其他潜在的实验限制 | 旨在通过混合的bulk和单细胞RNA测序技术提高疾病建模的成本效益 | 以同源诱导多能干细胞分化的类器官为研究对象，探索疾病机制 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA |
| 267 | 2024-08-05 |
Investigation of ENO2 as a promising novel marker for the progression of colorectal cancer with microsatellite instability-high
2024-May-09, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12332-4
PMID:38724951
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研究论文 | 本研究探讨了ENO2作为微卫星不稳定高（MSI-H）结直肠癌进展的潜在新标志物。 | 该研究首次揭示了ENO2在MSI-H结直肠癌中的中心基因作用，并建立了基于ENO2的预后预测模型。 | 该研究仅基于单细胞RNA测序数据，临床验证可能需要更多样本与多中心数据支持。 | 探索微卫星不稳定高结直肠癌的代谢转录组相关亚型并识别预后生物标志物。 | 微卫星不稳定高结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 268 | 2024-08-04 |
A Clustering Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Automatic Weighting Penalty and Low-Rank Representation
2024 May-Jun, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3362472
PMID:38319777
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研究论文 | 本文提出了一种基于自动加权惩罚和低秩表示的单细胞RNA-Seq数据聚类方法 | 引入加权距离约束并结合相似性约束，提出JAGLRR聚类方法，提高了特征贡献的评估 | 未提及具体的局限性 | 改善现有单细胞RNA-Seq数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 数据集 | 8个真实数据集和模拟数据集 |
| 269 | 2024-08-05 |
LPCAT2 inhibits colorectal cancer progression via the PRMT1/SLC7A11 axis
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-02996-4
PMID:38605214
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研究论文 | 本研究揭示LPCAT2通过PRMT1/SLC7A11轴抑制结直肠癌的进展 | 发现LPCAT2能够通过调节PRMT1的细胞质定位来影响SLC7A11的表达，从而诱导结直肠癌细胞的铁死亡 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用的可行性尚需进一步验证 | 阐明LPCAT2在结直肠癌细胞中的作用机制及其潜在的治疗靶点 | 人类和小鼠结直肠癌组织中的LPCAT2+和LPCAT2-肿瘤细胞群体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 实验室试验 | 小鼠结肠癌模型 | 生物组织样本 | 人类和小鼠结直肠癌组织中的多个样本 |
| 270 | 2024-08-05 |
Melanocyte stem cells in the skin: Origin, biological characteristics, homeostatic maintenance and therapeutic potential
2024-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1720
PMID:38778457
|
综述 | 这篇综述提供了皮肤黑素干细胞的起源、生物特性、稳态维护和治疗潜力的全面概述 | 强调了单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9技术和实践模型在黑素干细胞研究中的重要性 | NA | 提升对黑素干细胞生物特性和微环境调控机制的理解，以改善其在临床应用中的效果 | 皮肤黑素干细胞及其在皮肤疾病中的作用 | 再生医学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序，CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-08-05 |
NGEF is a potential prognostic biomarker and could serve as an indicator for immunotherapy and chemotherapy in lung adenocarcinoma
2024-May-19, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-024-03046-1
PMID:38764064
|
研究论文 | 本研究评估了NGEF作为肺腺癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点的有效性 | 揭示了NGEF在肺腺癌中的作用，并指出其与肿瘤阶段、免疫浸润和化疗反应的显著关联 | 未明确指出具体的局限性 | 研究NGEF在肺腺癌中的预后价值和作为治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者的NGEF表达及其与临床特征的关联 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 定量聚合酶链反应, 免疫组化染色, 西方印迹分析 | NA | NA | LUAD样本中基于中位数NGEF表达构建的高低表达组 |
| 272 | 2024-08-05 |
TCL1A-expressing B cells are critical for tertiary lymphoid structure formation and the prognosis of oral squamous cell carcinoma
2024-May-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05292-7
PMID:38764038
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研究论文 | 本研究揭示了B细胞中TCL1A表达在胚中心结构形成和口腔鳞状细胞癌(OSCC)预后中的作用 | TCL1A被识别为OSCC免疫治疗的新靶点，强调了其在B细胞增殖和抗原呈递能力中的作用 | 尚未明确B细胞在OSCC治疗中的全部角色 | 探讨TCL1A在口腔鳞状细胞癌预后和B细胞功能中的作用 | 口腔鳞状细胞癌患者的B细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序、组织微阵列、复合免疫组化 | NA | 组织样本 | 包括146个临床样本和359个OSCC样本 |
| 273 | 2024-08-05 |
Targeting SCD triggers lipotoxicity of cancer cells and enhances anti-tumor immunity in breast cancer brain metastasis mouse models
2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.06.592766
PMID:38766019
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研究论文 | 本研究验证了抑制SCD对乳腺癌脑转移的小鼠模型中癌细胞和免疫细胞的影响 | 本研究首次展示了SCD抑制剂可以增强抗肿瘤免疫并减少乳腺癌脑转移的肿瘤生长 | 本研究的局限性在于仅在小鼠模型中进行，尚需在临床试验中验证 | 本研究旨在评估抑制SCD对乳腺癌脑转移的影响 | 本研究对象为乳腺癌细胞以及小鼠模型中的脑转移 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 脂质组学、qPCR、Western blot、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | NA | 使用了乳腺癌细胞和相关的小鼠模型 |
| 274 | 2024-08-04 |
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200884
PMID:38722217
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研究论文 | 这篇文章探讨了细胞类型进化过程中的新发现和挑战 | 文章创新性在于强调了发育本体论在细胞类型同源性中的重要性，并提出了单细胞转录组学的应用 | 文章未提及具体的研究限制 | 本研究旨在深入理解动物进化中细胞类型的演变 | 研究对象为不同研究生物的细胞类型及其同源性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 275 | 2024-08-05 |
Enhancement of the function of mesenchymal stem cells by using a GMP-grade three-dimensional hypoxic large-scale production system
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30968
PMID:38826705
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研究论文 | 建立了一种GMP级三维缺氧大规模生产系统以增强间充质干细胞（MSCs）的功能 | 提出了一种新型的TDHLSP系统，能够有效提高临床级MSCs的生产并改善其功能特性 | 在CD142表达下调后，3D_Hypo MSCs的增强功能显著下降 | 旨在建立一种大规模生产间充质干细胞的系统，并分析不同培养条件下的生物差异 | 研究目标是探讨在不同培养环境下生成的间充质干细胞的功能表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 2×10^8个间充质干细胞 |
| 276 | 2024-08-05 |
Targeting ARNT attenuates chemoresistance through destabilizing p38α-MAPK signaling in glioblastoma
2024-May-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06735-1
PMID:38806469
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研究论文 | 本研究探讨了芳香烃受体核转运蛋白(ARNT)在胶质母细胞瘤(GBM)发病机制中的功能意义 | 发现ARNT作为GBM的致癌驱动因子，并且通过干扰p38α-MAPK信号通路来降低化疗耐药性 | 本研究未提及样本规模或临床试验数据的应用，可能限制了结果的普遍性 | 研究ARNT在胶质母细胞瘤的发病机制中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞系及其相关的分子机制 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，基因沉默技术 (lentiviral shRNAs) | NA | 公共数据集，RNA序列数据 | NA |
| 277 | 2024-08-05 |
Serum ITIH5 as a novel diagnostic biomarker in cholangiocarcinoma
2024-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16143
PMID:38475675
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研究论文 | 本研究旨在识别用于胆管癌诊断的独特分泌蛋白ITIH5。 | ITIH5在胆管癌中的特异性上调，且未在大多数其他癌症或良性肝胆疾病中观察到。 | 本研究的样本量及适用范围尚未明确说明。 | 研究的目的是确定胆管癌的特异性诊断生物标志物。 | 研究对象包括胆管癌及与其对比的其他恶性肿瘤、良性肝胆疾病和慢性肝病。 | 数字病理学 | 胆管癌 | RNA测序 | NA | 组织和血清样本 | NA |
| 278 | 2024-08-05 |
Interleukin 21 Drives a Hypermetabolic State and CD4+ T-Cell-Associated Pathogenicity in Chronic Intestinal Inflammation
2024-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.01.026
PMID:38266738
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研究论文 | 本研究探讨了IL21在慢性肠道炎症中驱动Tregs代谢异常及其相关性。 | 首次揭示了IL21通过代谢重组影响Tregs的炎症反应，从而调节肠道稳态。 | 研究主要依赖于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究IL21在慢性肠道炎症中对Tregs代谢及其功能的影响。 | 人类Tregs以及小鼠模型中的CD4+ T细胞。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序，质谱细胞分析，粤角程分析 | 小鼠模型 | 基因组数据，代谢组学数据 | 使用了人类和小鼠的生物样本 |
| 279 | 2024-08-05 |
Beyond binary: bridging neutrophil diversity to new therapeutic approaches in NSCLC
2024-May, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.010
PMID:38360439
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综述 | 这篇文章总结了肿瘤相关中性粒细胞（TAN）生物学的最新数据和模型，关注在肿瘤内在信号影响下演变的多样性 | 文章通过对不同癌症实体的转录组特征进行分类，提出了一种新的中性粒细胞亚群分类，以超越传统的N1/N2二元分类 | 文章的局限性在于未能提供关于中性粒细胞在抗癌治疗中的具体应用实例 | 研究肿瘤微环境中中性粒细胞的多样性及其对抗癌治疗的影响 | 主要研究非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤微环境中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 280 | 2024-08-05 |
The heterogeneity of tumour-associated macrophages contributes to the clinical outcomes and indications for immune checkpoint blockade in colorectal cancer patients
2024-May, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152805
PMID:38669865
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌患者临床结果和免疫检查点抑制治疗中的作用 | 研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞的异质性与患者预后及免疫疗法反应之间的关系 | 研究仅基于60名结直肠癌患者的数据，样本量相对较小 | 了解肿瘤相关巨噬细胞的异质性如何影响结直肠癌的临床结果和免疫治疗指征 | 结直肠癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 60名结直肠癌患者 |