单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 539 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-04 |
Sequential drug treatment targeting cell cycle and cell fate regulatory programs blocks non-genetic cancer evolution in acute lymphoblastic leukemia
2024-05-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03260-4
PMID:38822412
|
研究论文 | 本研究探讨了G2/M检查点抑制在急性淋巴细胞白血病中的作用 | 揭示了WEE1靶向疗法与细胞命运决策调控回路之间的关系 | 需要进一步研究以验证不同患者群体中的疗效和反应 | 更好地理解药物效果与癌细胞状态多样性之间的机制 | 针对KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病细胞 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA-seq和ATAC-seq | NA | 生物学细胞数据 | RS4;11细胞系和KMT2A::AFF1重排细胞 |
| 242 | 2024-08-04 |
Potential marker genes for chronic obstructive pulmonary disease revealed based on single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2024-05-23, Aging
DOI:10.18632/aging.205849
PMID:38787375
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和孟德尔随机化分析，识别了慢性阻塞性肺疾病（COPD）的潜在标记基因 | 通过单细胞测序和孟德尔随机化分析揭示了与COPD相关的四个关键基因，提供了新的预防和治疗COPD的见解 | 提供的抽象中未提及具体的局限性 | 研究COPD的病理机制，识别相关关键基因 | 重点研究与COPD相关的免疫细胞标记基因 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和孟德尔随机化分析 | NA | 基因组数据 | 使用了来自UK Biobank数据库的独立队列（ukb-b-16751）进行分析 |
| 243 | 2024-08-04 |
Inflammation-based lung adenocarcinoma molecular subtype identification and construction of an inflammation-related signature with bulk and single-cell RNA-seq data
2024-05-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205840
PMID:38771142
|
研究论文 | 本文研究了炎症在肺腺癌分子亚型识别中的作用，并构建了与炎症相关的特征 | 首次识别了炎症低（INF-low）和炎症高（INF-high）两种主要的肺腺癌亚型，并提出了一个以炎症为中心的预测模型 | 未详细阐明炎症反应中的所有分子划分 | 研究炎症对肺腺癌治疗效果和预后的影响 | 肺腺癌的炎症亚型及其临床病理特征 | 数字病理 | 肺癌 | RNA-seq | NA | 生物样本数据 | NA |
| 244 | 2024-08-05 |
Prediction of prognosis and immunotherapy efficacy based on metabolic landscape in lung adenocarcinoma by bulk, single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization analyses
2024-05-20, Aging
DOI:10.18632/aging.205838
PMID:38771130
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研究论文 | 本研究评估了肺腺癌中代谢途径与免疫治疗疗效和预后的关系 | 建立了代谢途径对偶评分模型(MPPS)，并识别出与MPPS相关的七个基因，揭示C1QTNF6在肿瘤微环境中的作用 | 尚不能全面分析代谢重编程与免疫治疗效果之间的所有关系 | 探讨代谢景观在肺腺癌预后及免疫治疗中的作用 | 针对TCGA-LUAD数据库中84条代谢路径进行评估及分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序和转录组分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用TCGA-LUAD数据库中的样本进行分析 |
| 245 | 2024-08-07 |
Retraction Note: Renal enhanced CT images reveal the tandem mechanism between tumor cells and immunocytes based on bulk/single-cell RNA sequencing
2024-May-15, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01385-0
PMID:38744724
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-08-05 |
Single-cell BCR and transcriptome analysis reveals peripheral immune signatures in patients with thyroid-associated ophthalmopathy
2024-05-09, Aging
DOI:10.18632/aging.205814
PMID:38728262
|
研究论文 | 本研究分析了甲状腺相关眼病患者外周免疫特征的单细胞BCR和转录组。 | 首次在单细胞水平上揭示了甲状腺相关眼病活动期的免疫细胞再配置和分子调控机制。 | 研究的对象主要集中在TAO患者和健康人的外周血，可能未能全面反映疾病的复杂性。 | 探讨甲状腺相关眼病的发病机制，为未来治疗提供新思路。 | 以甲状腺相关眼病患者和健康人为研究对象，分析他们的免疫成分。 | 数字病理学 | 甲状腺相关眼病 | 单细胞RNA测序和B细胞受体分析 | NA | 基因组数据 | 涉及多个甲状腺相关眼病患者和健康个体的外周血样本 |
| 247 | 2024-08-04 |
Sphingolipids in prostate cancer prognosis: integrating single-cell and bulk sequencing
2024-05-06, Aging
DOI:10.18632/aging.205803
PMID:38713159
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研究论文 | 本研究整合了单细胞和整体转录组数据，探讨了鞘脂代谢在前列腺癌预后中的作用 | 构建了一种以鞘脂代谢为重点的五基因预后模型，能够有效区分高风险和低风险患者 | 未提供样本规模和数据来源的详细信息 | 探讨鞘脂代谢在前列腺癌的诊断和治疗中的作用 | 前列腺癌患者的单细胞和整体转录组数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、整体转录组测序 | Cox回归和LASSO回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 248 | 2024-08-05 |
Single-cell 3D genome structure reveals distinct human pluripotent states
2024-05-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03268-w
PMID:38741214
|
研究论文 | 研究揭示了人类多能性胚胎干细胞的三维基因组结构与其多能状态之间的关系 | 首次通过单细胞高分辨率3D基因组结构分析展示了不同多能状态的特征性基因组重塑 | 未深入探讨多能性状态的调控机制和其他潜在的外部影响因素 | 探讨多能性胚胎干细胞的转录特征及其与基因组结构的关系 | 人类多能性胚胎干细胞(hESCs)在不同多能性状态下的特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，三维基因组结构分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 249 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling Reveals the Impact of Genetic Alterations on the Differentiation of Inflammation-Induced Murine Colon Tumors
2024-May-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16112040
PMID:38893159
|
研究论文 | 该研究揭示了基因突变如何影响炎症诱导的鼠类结肠肿瘤细胞分化 | 本研究首次明确了在炎症诱导的结肠肿瘤中，BLM和MSH2KO突变对肿瘤细胞分化的不同影响 | 研究主要基于鼠类模型，可能无法完全代表人类结肠癌的复杂性 | 探讨基因突变对炎症诱导的结肠肿瘤细胞分化的影响 | 以炎症诱导的鼠类结肠肿瘤为研究对象 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种突变的鼠类肿瘤样本 |
| 250 | 2024-08-05 |
M2 Macrophages Guide Periosteal Stromal Cell Recruitment and Initiate Bone Injury Regeneration
2024-May-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12061205
PMID:38927412
|
研究论文 | 这项研究创建了猪颅骨膜的详细细胞图谱，强调了细胞动态与相互作用在颅骨损伤修复中的重要性 | 该研究揭示了M2巨噬细胞在骨膜免疫反应调节和骨再生过程中的关键作用 | 研究仅限于猪颅骨膜，结果的广泛适用性需要进一步验证 | 探讨骨膜在骨损伤修复中的作用 | 猪颅骨膜 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 251 | 2024-08-05 |
scPLAN: a hierarchical computational framework for single transcriptomics data annotation, integration and cell-type label refinement
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae305
PMID:38935069
|
研究论文 | scPLAN是一个用于单细胞RNA测序数据分析的层次计算框架 | scPLAN通过层次细胞类型树对未标记的scRNA-seq数据进行注释，系统性识别潜在的新细胞类型 | 现有的整合方法无法整合不同标注深度的数据集，也未能利用更复杂注释的数据集或新生物发现来提升旧数据的标注 | 提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释和整合精确度 | 未标记的scRNA-seq数据和已有标注的数据集 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 层次模型 | 转录组数据 | NA |
| 252 | 2024-08-05 |
Transcriptomic Analyses Reveal the Effects of Walnut Kernel Cake on Adipose Deposition in Pigs
2024-May-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060667
PMID:38927603
|
研究论文 | 该研究探讨了核桃仁饼对猪脂肪沉积的影响及其潜在的饲料替代价值 | 首次揭示了核桃仁饼在促进猪脂肪沉积和改善肉质方面的应用潜力 | 对核桃仁饼在猪饲料中的应用研究尚处于起步阶段，缺乏大规模的临床试验数据 | 旨在评估核桃仁饼作为猪饲料中的蛋白质替代品的效果 | 以大迪庆藏猪为研究对象 | 数字病理学 | NA | 转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 大迪庆藏猪的样本数量未明确提及 |
| 253 | 2024-08-04 |
Single-Nucleus RNA-Seq Reveals Spermatogonial Stem Cell Developmental Pattern in Shaziling Pigs
2024-May-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060607
PMID:38927011
|
研究论文 | 本文探讨了Shaziling猪睾丸内精原干细胞的发育模式 | 首次利用单细胞转录组技术生成了Shaziling猪睾丸发育的细胞图谱，并识别了新的标记基因 | 本研究仅涵盖了特定的猪种和有限的发展阶段 | 旨在揭示Shaziling猪精原干细胞的发育模式，以促进其繁育 | 研究对象为Shaziling猪的精原干细胞和睾丸组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 82,027个单细胞，来自9个Shaziling猪睾丸 |
| 254 | 2024-08-05 |
Activation of CD14+ Monocytes via the IFN-γ Signaling Pathway Is Associated with Immune-Related Adverse Events in Hepatocellular Carcinoma Patients Receiving PD-1 Inhibition Combination Therapy
2024-May-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12061140
PMID:38927347
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研究论文 | 研究探讨了HCC患者接受PD-1抑制联合治疗后，CD14+单核细胞通过IFN-γ信号通路激活与免疫相关不良事件之间的关系 | 首次揭示了在PD-1抑制联合治疗中，IFN-γ信号通路诱导的单核细胞激活是HCC患者发生免疫相关不良事件的重要机制 | 该研究的样本量较小，仅包含71名HCC患者，可能影响结果的普遍适用性 | 探明HCC患者在PD-1抑制联合治疗中免疫相关不良事件的机制 | 71名接受PD-1抑制联合治疗的肝癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, Olink蛋白组学 | NA | 血液样本 | 71名HCC患者 |
| 255 | 2024-08-05 |
Cystatin M/E ameliorates bone resorption through increasing osteoclastic cell estrogen influx
2024-May-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4313179/v1
PMID:38766009
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研究论文 | 本研究评估了Cystatin M/E在减缓骨吸收过程中的作用，特别是在多发性骨髓瘤模型中。 | 本研究首次显示Cystatin M/E能够增加骨吸收前体细胞的雌激素浓度，并抑制其成熟。 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床转化需要更多的人体数据支持。 | 探讨Cystatin M/E如何通过改善雌激素受体的表达来减少骨质流失。 | 使用多发性骨髓瘤及卵巢切除小鼠模型进行实验。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 蛋白质和mRNA数组 | 包含多发性骨髓瘤及卵巢切除小鼠模型的实验样本 |
| 256 | 2024-08-04 |
Unraveling molecular advancements in chordoma tumorigenesis and treatment response: a review of scientific discoveries and clinical implications
2024-05, Neurosurgical focus
IF:3.3Q1
DOI:10.3171/2024.2.FOCUS2417
PMID:38691860
|
综述 | 本文回顾了脊索瘤的分子进展及其治疗反应的科学发现和临床意义 | 提供了对脊索瘤分子机制的深入了解，并探讨了新的治疗方法和技术 | 目前很少有系统治疗显示出显著的有效性，且脊索瘤在多模式治疗后仍倾向复发 | 研究脊索瘤的分子发病机制及其在治疗中的临床应用 | 脊索瘤及其分子特征和治疗反应 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞转录组分析、空间转录组学、游离DNA分析 | NA | 转录组、基因组 | NA |
| 257 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Technology in Ruminant Livestock: Challenges and Opportunities
2024-May-27, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46060316
PMID:38920988
|
评论 | 该文综述了单细胞测序技术在反刍动物中的应用及其面临的挑战和机遇 | 探讨了反刍动物中特有的单细胞组学技术，以及对细胞和分子机制深入理解的潜力 | 面临精准标注独特细胞群体和细胞在组织内空间分辨率等挑战 | 旨在提高对健康和高产反刍动物所需特征的理解 | 关注牛、羊和山羊的细胞多样性及免疫细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 已经探讨的动物种类包括牛、羊和山羊 |
| 258 | 2024-08-05 |
CASi: A framework for cross-timepoint analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-05-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-58566-x
PMID:38724550
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研究论文 | 本研究开发了CASi，一个用于多时间点单细胞RNA测序数据分析的综合框架 | 提出了一个新的框架，专门用于分析多时间点的单细胞RNA测序数据，并提供多种分析功能 | 尚未在其他类型的单细胞数据集上进行广泛验证 | 旨在改善多时间点的单细胞RNA测序数据分析 | 关注单细胞层面基因表达差异研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 通过综合模拟研究与真实的多时间点单细胞数据集进行验证 |
| 259 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Reveals MYOF-Enriched Monocyte/Macrophage Subcluster as a Favorable Prognostic Factor in Sepsis
2024-05, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300673
PMID:38456367
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了脓毒症中MYOF富集的单核细胞/巨噬细胞亚簇作为有利预后因素 | 该研究首次展示了MYOF基因在脓毒症中的重要性，并揭示了其与生存结果的相关性 | 该研究的限制未被明确提及 | 探讨脓毒症中免疫细胞景观及其与预后的关系 | 单细胞RNA测序得到的脓毒症患者免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究中未明确样本数量 |
| 260 | 2024-08-05 |
Fibroblast Diversity and Epigenetic Regulation in Cardiac Fibrosis
2024-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25116004
PMID:38892192
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综述 | 本文探讨了心脏纤维化中成纤维细胞的多样性和表观遗传调控机制 | 强调了表观遗传调控在心脏纤维化发病机制中的关键作用，尤其是针对DNA甲基转移酶和组蛋白去乙酰化酶的靶向治疗潜力 | 研究主要集中在分子和细胞机制的探索上，具体的临床验证和应用尚需进一步研究 | 旨在阐明心脏纤维化中成纤维细胞的多样性及其激活过程的调控机制 | 研究对象为心脏成纤维细胞及其在心脏纤维化中的作用 | 心血管疾病 | 心脏纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA |