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当前共找到 539 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-12-13 |
scDAPP: a comprehensive single-cell transcriptomics analysis pipeline optimized for cross-group comparison
2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.06.592708
PMID:38766089
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scDAPP的单细胞转录组学分析管道，旨在优化跨组比较分析 | scDAPP是一个基于R的工作流程，自动化了许多预处理步骤，使用经过基准测试的软件，并生成全面的中间数据和最终结果，适用于单细胞或核转录组数据的比较分析 | NA | 开发一个自动化和标准化的数据处理和分析管道，以应对单细胞转录组学数据复杂实验设计的需求 | 单细胞或核转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-12-06 |
Learning Consistency and Specificity of Cells From Single-Cell Multi-Omic Data
2024-05, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3370868
PMID:38709615
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研究论文 | 提出了一种基于自表示学习的多组学数据整合聚类算法sLMIC，用于整合单细胞表观基因组和转录组数据，提取细胞的一致性和特异性特征 | 提出了sLMIC算法，通过构建多层网络去除组学数据的异质性，并利用低秩和互斥约束分离细胞的自表示特征，明确表征组学数据的一致性和多样性 | 未提及 | 解决单细胞多组学数据整合分析中的异质性、复杂耦合和可解释性问题 | 单细胞表观基因组和转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞DNA甲基化测序、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | 自表示学习模型 | 多组学数据 | 13个来自不同生物体和组织的多组学单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-12-02 |
The prognostic genes model of breast cancer drug resistance based on single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis
2024-May-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-024-01372-6
PMID:38795164
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研究论文 | 本文通过转录组数据分析和单细胞测序，识别并验证了与乳腺癌药物抗性相关的预后基因，并构建了一个基于这些基因的预后模型 | 本文创新性地结合了转录组分析和单细胞测序数据，识别出与乳腺癌药物抗性相关的预后基因，并构建了一个新的预后模型 | 本文的局限性在于仅在细胞系中验证了部分基因，未来需要在更多临床样本中进一步验证 | 研究目的是识别与乳腺癌药物抗性相关的预后基因，并构建一个预测乳腺癌预后的模型 | 研究对象是乳腺癌及其药物抗性相关的预后基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 细胞系和乳腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-12-01 |
Strategies for arterial graft optimization at the single-cell level
2024-05, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00464-6
PMID:39195932
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研究论文 | 通过分析不同动脉移植物的单细胞转录组，提出基于内乳动脉（ITA）的桡动脉（RA）和胃网膜右动脉（RGA）优化策略 | 首次通过单细胞转录组分析不同动脉移植物的细胞特征，并提出优化策略 | 研究仅限于细胞水平，未涉及临床试验验证 | 优化冠状动脉搭桥术中使用的动脉移植物 | 内乳动脉（ITA）、桡动脉（RA）和胃网膜右动脉（RGA） | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 不同动脉移植物的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-11-29 |
Cell type-specific gene expression dynamics during human brain maturation
2024-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.29.560114
PMID:37808657
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研究论文 | 研究了人类大脑发育过程中基因表达的动态变化，特别是细胞类型特异性的表达模式 | 使用单核RNA测序（snRNA-seq）和空间转录组学技术，构建了一个包含75种细胞亚型的儿童和成人联合图谱，揭示了大脑成熟过程中基因和通路的变化 | NA | 探讨人类大脑发育过程中基因表达的动态变化，特别是细胞类型特异性的表达模式 | 人类大脑的时间叶组织，包括非洲裔样本 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq），空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 包括儿童和成人的时间叶组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-11-26 |
Prognostic value and potential mechanism of cellular senescence and tumor microenvironment in hepatocellular carcinoma: Insights from bulk transcriptomics and single-cell sequencing analysis
2024-May, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24121
PMID:38189188
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研究论文 | 研究了细胞衰老和肿瘤微环境在肝细胞癌中的预后价值和潜在机制 | 开发了CellAge和TME评分，作为肝细胞癌的独立预后因素和免疫治疗预测因子 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨细胞衰老和肿瘤微环境在肝细胞癌中的预后价值和机制 | 肝细胞癌患者的细胞衰老和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 368个肝细胞癌样本和64个GSE116174数据集样本，以及18个GSE149614数据集中的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-11-24 |
Bulk and single cells transcriptomes with experimental validation identify USP18 as a novel glioma prognosis and proliferation indicator
2024-May, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2024.12517
PMID:38596661
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，结合实验验证，揭示了USP18作为胶质瘤预后和增殖的新指标 | 首次揭示了USP18在胶质瘤中的上调与不良预后相关，并影响患者对免疫治疗的反应 | 研究仅限于U251和U87MG ATCC细胞系，未涵盖所有胶质瘤细胞类型 | 探讨USP18在胶质瘤中的作用及其对预后和增殖的影响 | 胶质瘤细胞和患者的预后及增殖情况 | 数字病理学 | 脑癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | U251和U87MG ATCC细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-11-17 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal metastasis mechanism and microenvironment remodeling of lymph node in osteosarcoma
2024-05-17, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03319-w
PMID:38755647
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研究论文 | 研究揭示了骨肉瘤淋巴结转移的分子机制及其对淋巴结微环境的改造 | 发现了新的ETS2/IBSP信号轴可能促进淋巴结转移，并阐明了骨肉瘤细胞如何影响淋巴结微环境 | NA | 揭示骨肉瘤淋巴结转移的机制及其对微环境的改造 | 骨肉瘤的淋巴结转移及其微环境改造 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、生物信息学、体外实验、免疫组化 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 18个样本，包含117,964个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-11-10 |
Contribution of VEGF-B-Induced Endocardial Endothelial Cell Lineage in Physiological Versus Pathological Cardiac Hypertrophy
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324136
PMID:38655691
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研究论文 | 研究VEGF-B诱导的心内膜内皮细胞谱系在生理性和病理性心脏肥大中的作用 | 首次探讨了自分泌和旁分泌VEGF-B表达在转基因和基因转导小鼠中的心脏效应，揭示了VEGF-B诱导的特定心内膜来源内皮细胞群体的扩展及其在生理性和病理性心脏肥大中的不同作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探讨VEGF-B在心脏肥大中的作用及其对心脏功能的潜在影响 | VEGF-B诱导的心内膜内皮细胞谱系及其在生理性和病理性心脏肥大中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 转基因小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-11-08 |
Pan-cancer analysis of CDKN2A alterations identifies a subset of gastric cancer with a cold tumor immune microenvironment
2024-05-31, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00615-7
PMID:38822443
|
研究论文 | 研究探讨了CDKN2A突变和缺失与泛癌种中免疫检查点抑制剂治疗反应及总体生存期的关联 | 发现CDKN2A突变和缺失与免疫检查点抑制剂治疗反应及总体生存期的关联，并揭示了CDKN2A突变和缺失对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究样本主要来自四个队列，可能存在样本偏倚；未详细探讨CDKN2A突变和缺失的具体机制 | 确定CDKN2A突变和缺失与泛癌种中总体生存期及免疫检查点抑制剂治疗反应的关联 | CDKN2A突变和缺失在泛癌种中的作用及其对免疫检查点抑制剂治疗反应的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 肿瘤测序 | NA | 基因组数据 | 45,000名肿瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-11-04 |
Momordicine-I Suppresses Head and Neck Cancer Growth by Reprogrammimg Immunosuppressive Effect of the Tumor-Infiltrating Macrophages and B Lymphocytes
2024-May-02, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0718
PMID:38315993
|
研究论文 | 研究了Momordicine-I通过重编程肿瘤浸润巨噬细胞和B淋巴细胞的免疫抑制效应来抑制头颈癌生长的机制 | 揭示了Momordicine-I通过调节肿瘤微环境中免疫细胞的分子表达，特别是通过抑制Sfln4和Cxcl3的表达，来抑制头颈癌生长的机制 | 研究主要在免疫功能正常的鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨Momordicine-I抑制头颈癌生长的机制，特别是在肿瘤微环境中的作用 | 头颈癌、肿瘤浸润巨噬细胞、B淋巴细胞 | NA | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了两种免疫功能正常的鼠模型，分别使用MOC2和SCC VII细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-11-02 |
Identification of restrictive molecules involved in oncolytic virotherapy using genome-wide CRISPR screening
2024-05-23, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01554-5
PMID:38783389
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选技术，识别出限制溶瘤病毒疗法效果的分子，并研究了其在胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌中的应用 | 本文创新性地通过CRISPR筛选技术识别出PARP1作为HSV-1复制的限制因子，并展示了PARP抑制剂与免疫检查点抑制剂联合使用在溶瘤病毒疗法中的协同作用 | NA | 克服溶瘤病毒疗法的固有限制，为三阴性乳腺癌、胶质母细胞瘤和其他恶性肿瘤的临床治疗提供有价值的见解 | 溶瘤病毒疗法在胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌中的应用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | CRISPR筛选 | NA | RNA | 涉及胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌的模型 | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-11-02 |
GRouNdGAN: GRN-guided simulation of single-cell RNA-seq data using causal generative adversarial networks
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48516-6
PMID:38744843
|
研究论文 | 介绍了一种基于基因调控网络（GRN）引导的参考型因果隐式生成模型GRouNdGAN，用于模拟单细胞RNA-seq数据、体内扰动实验和基准测试GRN推断方法 | 通过在其架构中施加用户定义的GRN，GRouNdGAN模拟稳态和瞬态单细胞数据集，其中基因在其调控转录因子（TF）的控制下因果表达 | NA | 开发一种新的生成模型，用于模拟单细胞RNA-seq数据和基准测试基因调控网络推断方法 | 单细胞RNA-seq数据、基因调控网络推断方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 生成对抗网络（GAN） | 基因表达数据 | 六个实验参考数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-11-02 |
Quantifying 3'UTR length from scRNA-seq data reveals changes independent of gene expression
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48254-9
PMID:38744866
|
研究论文 | 本文开发了一种名为scUTRquant的计算流程，用于从单细胞RNA测序数据中快速、准确地同时量化基因和3'UTR异构体的表达 | 首次提出了从单细胞RNA测序数据中量化3'UTR长度的方法，并发现3'UTR长度的变化与基因表达变化广泛且协调，但影响不同的基因 | NA | 研究3'UTR长度在不同细胞类型中的变化及其对基因调控的影响 | 人类和小鼠的200多种初级细胞类型 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 474种细胞类型和2134种扰动 | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-10-30 |
EmptyDropsMultiome discriminates real cells from background in single-cell multiomics assays
2024-05-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03259-x
PMID:38741206
|
研究论文 | 本文开发了一种名为EmptyDropsMultiome的方法，用于区分单细胞多组学测序中的真实细胞和背景 | EmptyDropsMultiome在统计能力和准确性上优于现有的方法，如CellRanger-arc和EmptyDrops | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞多组学测序中真实细胞的识别率 | 单细胞多组学测序中的真实细胞和背景 | 数字病理学 | NA | scATAC-seq和scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-10-27 |
Development of a CD163-Targeted PET Radiotracer That Images Resident Macrophages in Atherosclerosis
2024-May-01, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.123.266910
PMID:38548349
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研究论文 | 开发了一种靶向CD163的PET放射性示踪剂，用于成像动脉粥样硬化中的常驻巨噬细胞 | 首次开发了一种靶向CD163的PET放射性示踪剂，用于非侵入性检测动脉粥样硬化中的常驻巨噬细胞 | 需要在转化研究中进一步验证[Cu]Cu-ICT-01的敏感性和特异性 | 开发一种靶向PET放射性示踪剂，用于成像动脉粥样硬化中的CD163阳性巨噬细胞，并评估CD163作为人类动脉粥样硬化生物标志物的潜力 | CD163阳性巨噬细胞和动脉粥样硬化斑块 | NA | 心血管疾病 | PET成像 | NA | 图像 | 多个小鼠动脉粥样硬化模型和人类颈动脉粥样硬化斑块 | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-10-24 |
Aggressive high-grade NF2 mutant meningiomas downregulate oncogenic YAP signaling via the upregulation of VGLL4 and FAT3/4
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596719
PMID:38854109
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研究论文 | 研究了NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的下调机制 | 发现VGLL4和FAT3/4的上调是高级别NF2突变型脑膜瘤中YAP活性下调的潜在机制 | 研究主要基于体外实验和RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的调控机制 | NF2突变型脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量人类脑膜瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-10-24 |
Single-cell transcriptomics reveals stage- and side-specificity of gene modules in colorectal cancer
2024-May-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4402565/v1
PMID:38826219
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研究论文 | 本研究利用网络理论方法分析结直肠癌（CRC）的单细胞转录组数据，以更好地描述其进展和侧向性 | 本研究首次通过单细胞转录组数据分析，揭示了结直肠癌在不同阶段和侧向的基因模块特异性 | 本研究仅使用了单一数据集，未来需要更多数据集验证结果 | 旨在通过网络理论方法分析结直肠癌的单细胞转录组数据，以更好地理解其发展和进展机制 | 结直肠癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 使用了GEO-GSE178341数据集中的细胞X基因数据 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-10-24 |
Endothelial deletion of p53 generates transitional endothelial cells and improves lung development during neonatal hyperoxia
2024-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.07.593014
PMID:38766251
|
研究论文 | 研究探讨了p53在新生儿高氧环境下对肺发育和内皮细胞类型的影响 | 首次揭示了p53在内皮细胞类型转换中的作用，并展示了内皮特异性p53缺失对高氧环境下血管和肺泡简化的改善效果 | NA | 探讨p53在新生儿高氧环境下对肺发育和内皮细胞类型的影响 | 内皮细胞、肺血管和肺泡 | NA | 肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-10-24 |
Host-derived Interleukin 1α induces an immunosuppressive tumor microenvironment via regulating monocyte-to-macrophage differentiation
2024-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.03.592354
PMID:38746389
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研究论文 | 研究探讨了IL-1α在调节单核细胞向巨噬细胞分化过程中对免疫抑制性肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了IL-1α在调节巨噬细胞分化和活性中的关键作用，并提出其作为乳腺癌治疗潜在靶点的可能性 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨IL-1α在肿瘤微环境中对巨噬细胞分化的调控机制及其对免疫抑制性微环境的影响 | IL-1α、巨噬细胞、肿瘤微环境 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用乳腺癌小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |