单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 558 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-05 |
Unraveling Divergent Transcriptomic Profiles: A Comparative Single-Cell RNA Sequencing Study of Epithelium, Gingiva, and Periodontal Ligament Tissues
2024-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115617
PMID:38891804
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序研究牙周组织的转录组特征 | 首次揭示了牙周组织的层次结构和环境因素对细胞组成的影响 | 样本量较小，仅涉及7个组织样本，可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在识别牙周特异性标记以深入了解牙周病理生理 | 主要研究人类牙周韧带、牙龈和上皮组织的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 7个组织样本 |
| 222 | 2024-08-05 |
New Insight into Intestinal Mast Cells Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2024-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115594
PMID:38891782
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综述 | 本综述总结了单细胞转录组学研究如何为肠道肥大细胞的发育及其在健康和疾病中的功能角色提供了见解 | 使用单细胞RNA测序技术揭示的肠道肥大细胞的起源、分化及其表型和功能 | 关于肥大细胞生物学的若干方面尚待澄清 | 探讨肥大细胞的起源、分化及其在不同组织中的功能 | 肠道肥大细胞亚群及其在健康与疾病中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤进展 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 223 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of tumour infiltrating T cells efficiently identifies tumour-specific T cell receptors based on the T cell activation score
2024-May-10, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03710-9
PMID:38727812
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序建立了一种有效的方法来分离肿瘤反应性T细胞受体 | 创新性地结合多个激活和效应分子的表达水平来提高肿瘤特异性TCR的分离效率 | 研究仅包含两名肺腺癌患者，样本量较小 | 旨在识别肿瘤特异性T细胞受体以改善癌症治疗 | 研究对象为肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞和自体肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 2名肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 224 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing unveils a machine learning-based pan-cancer major histocompatibility complex-related signature for predicting immunotherapy efficacy
2024-May-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03714-5
PMID:38714579
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研究论文 | 该文章探讨了主要组织相容性复合体（MHC）在肿瘤免疫治疗中的潜在生物标志物作用，并开发了MHCsig以预测免疫治疗的疗效 | 开发了新的MHCsig，可以有效预测多种肿瘤免疫治疗的益处 | NA | 研究MHC与免疫治疗反应之间的关系 | 免疫治疗患者的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 大量的全癌症数据和临床队列 |
| 225 | 2024-08-05 |
Overexpressing S100A9 ameliorates NK cell dysfunction in estrogen receptor-positive breast cancer
2024-May-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03699-1
PMID:38713229
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研究论文 | 本研究探讨了S100A9在雌激素受体阳性乳腺癌中的作用，改善了自然杀伤细胞的功能 | 首次揭示了S100A9在ER+/HER2-BC中对NK细胞功能的重要调节作用 | 研究主要集中在细胞及分子水平，临床验证和长时间效应尚不明确 | 探索雌激素受体阳性乳腺癌中NK细胞的功能状态及其调节机制 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞系及其对NK细胞的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞mRNA测序, 批量mRNA测序, qPCR, ELISA | NA | 基因表达数据 | 研究中使用了MCF-7, T47D, MDA-MB-468和MDA-MB-231细胞系 |
| 226 | 2024-08-04 |
Blocking OLFM4/galectin-3 axis in placental polymorphonuclear myeloid-derived suppressor cells triggers intestinal inflammation in newborns
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112058
PMID:38613883
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研究论文 | 该研究报告了胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症之间的密切关系 | 首次揭示了OLFM4/凝集素-3轴在胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症之间的重要作用 | 该研究未能探讨ELF（外源性生长因子）对结果的潜在影响 | 研究胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症的关联 | 主要研究胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞及其对子代的新生儿肠道炎症的影响 | 数字病理学 | 新生儿坏死性肠炎 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 包括缺乏Olfm4的小鼠母体和健康小鼠的胎盘样本 |
| 227 | 2024-08-05 |
IFI30 as a key regulator of PDL1 immunotherapy prognosis in breast cancer
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112093
PMID:38669947
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研究论文 | 本研究探讨了IFI30在乳腺癌中的作用及其与PD-L1免疫治疗的预测关系 | 揭示了IFI30在乳腺癌组织中表达上调，并与肿瘤分期和预后显著相关，同时还发现其与免疫相关信号通路的显著关联 | 本研究的具体机制和IFI30与PD-L1轴之间的关系仍不清晰 | 研究IFI30在乳腺癌中的作用及其对PD-L1表达和T细胞浸润的影响 | 乳腺癌组织中的IFI30表达及其与PD-L1的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | RNA，蛋白质 | 通过TCGA和GTEx数据库以及自制的乳腺癌组织微阵列进行分析 |
| 228 | 2024-08-04 |
LoRA-TV: read depth profile-based clustering of tumor cells in single-cell sequencing
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae277
PMID:38877886
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研究论文 | 本研究提出了一种基于单细胞测序数据读深度特征的肿瘤细胞聚类新方法LoRA-TV | LoRA-TV利用低秩优化和鲁棒平滑方法聚合共享的基因组特征，以提高肿瘤细胞聚类性能 | NA | 研究如何通过单细胞测序揭示肿瘤细胞群体的异质性 | 肿瘤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 模拟数据和实际数据 | NA |
| 229 | 2024-08-07 |
scRNA-seq: oh, the joys
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02263-0
PMID:38654084
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-08-04 |
Discrete placental gene expression signatures accompany diabetic disease classifications during pregnancy
2024-May-17, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.05.014
PMID:38763341
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研究论文 | 本研究探讨了妊娠期糖尿病亚型与胎盘基因表达特征之间的关系 | 首次结合高分辨率技术与严格的糖尿病亚型分类，以揭示妊娠期糖尿病的基因表达特征 | 研究中未能考虑临床元数据的影响 | 研究妊娠期糖尿病不同亚型的基因表达特征 | 比较健康对照与GDMA1、GDMA2及2型糖尿病对照的胎盘样本 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | RNA测序（RNA-seq） | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 54个GDMA1、GDMA2和T2DM样本与122个对照样本 |
| 231 | 2024-08-05 |
Therapeutic Inducers of Natural Killer cell Killing (ThINKK): preclinical assessment of safety and efficacy in allogeneic hematopoietic stem cell transplant settings
2024-May-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008435
PMID:38754915
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研究论文 | 该研究评估了自然杀伤（NK）细胞杀伤的治疗诱导剂（ThINKK）在异基因造血干细胞移植中的安全性和有效性 | 本研究首次展示了ThINKK细胞具有产量型I干扰素的特性，并且在异基因T细胞激活能力较低 | 未明确指出研究的限制 | 本研究旨在改善异基因HSCT后早期的移植物抗白血病效应 | 该研究的对象为从造血干细胞扩增和分化而来的ThINKK细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | 人类小鼠异种移植模型 | 细胞数据 | NA |
| 232 | 2024-08-04 |
[Mechanism of Fuzheng Huayu Tablets against hepatic fibrosis based on transcriptome and single-cell sequencing]
2024-May, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究探讨了复正化瘤片(FZHY)在肝纤维化治疗中巨噬细胞极化的作用 | 识别出与肝纤维化巨噬细胞极化相关的26个潜在基因，并筛选出10个核心蛋白 | 未提及具体的局限性 | 研究FZHY在肝纤维化治疗中的机制 | 主要研究肝纤维化相关的巨噬细胞及其极化 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞测序、转录组测序 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 小鼠模型的具体样本数量未提及 |
| 233 | 2024-08-04 |
The 9p21.3 coronary artery disease risk locus drives vascular smooth muscle cells to osteochondrogenic state
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.25.595888
PMID:38853913
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研究论文 | 这篇文章探讨了9p21.3 CAD风险位点如何驱动血管平滑肌细胞转变为骨软骨生成状态 | 本研究揭示了9p21.3风险单倍型促使VSMCs获取具有骨软骨生成特征的新细胞状态，并识别了一组在这一转录程序中至关重要的标志基因 | 在本文中没有提及具体的局限性 | 研究9p21.3风险位点及其在VSMCs中导致疾病倾向状态的作用 | 诱导性多能干细胞源的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | 使用了来自风险和非风险供体的iPSC细胞系 |
| 234 | 2024-08-04 |
Investigating the basis of lineage decisions and developmental trajectories in the dorsal spinal cord through pseudotime analyses
2024-May-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202209
PMID:38804879
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研究论文 | 本研究通过伪时间分析探讨了背侧脊髓内神经元的谱系决策和发育轨迹 | 本研究结合小鼠胚胎干细胞衍生的背侧内神经元单细胞RNA测序图谱和伪时间分析，提供了一种新的资源来研究背侧内神经元的命运特异性 | 本研究主要是基于小鼠模型，可能无法完全适用于其他物种 | 研究背侧内神经元的发育过程和基因表达时机 | 小鼠胚胎干细胞衍生的背侧内神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 235 | 2024-08-04 |
Clustering and visualization of single-cell RNA-seq data using path metrics
2024-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012014
PMID:38809943
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研究论文 | 本研究提出了一种新的单细胞RNA-seq数据分析框架，称为单细胞路径度量分析（scPMP），以改善聚类效果。 | 该文章的创新点在于提出了一种基于功率加权路径度量的新方法，能够更好地保持局部聚类结构和全局数据几何。 | 没有提到具体的研究限制 | 该研究旨在改善单细胞数据分析中的聚类质量和几何保真度。 | 研究对象为单细胞RNA-seq数据，涉及组织和癌症组成的高分辨率表征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 路径度量结合多维缩放 | NA | NA |
| 236 | 2024-08-05 |
Single-cell and single-nucleus RNA-sequencing from paired normal-adenocarcinoma lung samples provide both common and discordant biological insights
2024-May, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011301
PMID:38814983
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研究论文 | 本文比较了配对正常-腺癌肺样本中单细胞RNA测序和单核RNA测序的生物学洞见 | 首次系统比较了scRNA-seq和snRNA-seq在正常和腺癌肺组织样本中的一致性和差异性 | 免疫细胞去除的额外操作影响了细胞活力，并放大了与应激反应相关的转录特征 | 探讨正常肺组织向腺癌组织转变的细胞过渡，以及不同RNA测序技术所捕获的生物信息 | 配对的正常及腺癌人类肺样本 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 细胞转录组 | 160,621个细胞/细胞核 |
| 237 | 2024-08-05 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
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研究论文 | 该文章识别了新生儿肺发育过程中肌成纤维细胞分化程序 | 文章创新性地识别了不同于其他间质细胞类型的肌成纤维细胞分化程序 | 文章未提及具体的实验限制或局限性 | 研究新生儿肺中的间质细胞类型及其发育过程 | 研究对象为新生小鼠肺中的间质细胞亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用Fgf18CreER谱系追踪小鼠线，有多个亚型细胞 |
| 238 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序描述了肾淋巴内皮细胞对急性肾损伤的反应 | 该研究首次描述了肾淋巴内皮细胞的异质性，并揭示了其在急性肾损伤中调节局部免疫反应的分子通路 | 由于肾中淋巴内皮细胞相对稀少，过去的测序工作未能充分表征这些细胞及其对急性肾损伤的响应 | 研究肾淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的基因表达变化及其对未来肾脏健康的影响 | 小鼠的肾淋巴内皮细胞，特别是在静息和顺铂损伤后的状态 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 由多种小鼠肾淋巴内皮细胞群体组成 |
| 239 | 2024-08-04 |
SCSMD: Single Cell Consistent Clustering based on Spectral Matrix Decomposition
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae273
PMID:38855914
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研究论文 | 本文提出了一种基于谱矩阵分解的单细胞一致性聚类方法SCSMD | SCSMD融合了多种聚类方法的优势，以确定最佳聚类方案 | NA | 研究单细胞测序数据分析中的聚类问题 | 真实的scRNA-seq数据集，总共15个数据集 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | scRNA-seq | NA | 数据集 | 15个真实的scRNA-seq数据集 |
| 240 | 2024-08-05 |
CACIMAR: cross-species analysis of cell identities, markers, regulations, and interactions using single-cell RNA sequencing data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae283
PMID:38856169
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研究论文 | 该文章介绍了一种名为CACIMAR的工具，用于通过单细胞RNA测序数据进行跨物种分析 | CACIMAR提供了不同的保守评分来测量细胞类型、调控网络和细胞间相互作用的保守性，这是目前很少有方法能做到的 | 目前尚未提及任何限制 | 开发一种工具以识别跨物种的细胞身份、标记、调控和相互作用 | 研究对象包括小鼠、斑马鱼和小鸡的视网膜再生的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权和模型 | 转录组数据 | 公开可用的多个物种的单细胞RNA测序数据 |